茄子PARMS反应体系的建立与优化 被引量：3

1

作者 肖熙鸥 赵秋芳 +3 位作者 林文秋 欧雄常 冯恩友 莫定鸣 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第18期6074-6079,共6页

本研究基于茄子自交系WT和L6-5重测序数据设计SNP特异引物,通过对反应体积、DNA用量和引物浓度等参数进行优化,建立了茄子PARMS(Penta-primer amplification re-fractory mutation system)SNP分型体系。研究结果表明最佳反应体系为6μL... 本研究基于茄子自交系WT和L6-5重测序数据设计SNP特异引物,通过对反应体积、DNA用量和引物浓度等参数进行优化,建立了茄子PARMS(Penta-primer amplification re-fractory mutation system)SNP分型体系。研究结果表明最佳反应体系为6μL,其中1μL DNA模板(10~100 ng/μL),3μL PARMS mix(2×),0.45μL引物混合物(100μmol/L),1.55μL ddH2O。利用WT和L6-5的F2群体验证该体系的稳定性,获得了较好的SNP分型结果。本研究建立的PARMS-SNP分型体系,为开展茄子种质资源遗传多样性分析、基因定位、指纹图谱构建和分子标记辅助选择等提供了技术支持。 展开更多

关键词 茄子 SNP parms 反应体系优化

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高透射深宽截止双通带荧光滤光片设计与PARMS镀制 被引量：3

2

作者 赵帅锋 吕少波 +4 位作者 王瑞生 姜超 胡雯雯 李明华 穆佳丽 《真空》 CAS 2018年第2期10-13,共4页

以Nb_2O_5和SiO_2为光学镀膜材料设计了可见光区双通带BP561nm&BP687nm超多层膜系干涉滤光片。采用直接光控和速率控制混合的膜厚监控方案,制造工艺采用OMS Simulator设计并模拟镀膜过程,模拟膜厚误差优于±0.1%,并在PARMS镀膜... 以Nb_2O_5和SiO_2为光学镀膜材料设计了可见光区双通带BP561nm&BP687nm超多层膜系干涉滤光片。采用直接光控和速率控制混合的膜厚监控方案,制造工艺采用OMS Simulator设计并模拟镀膜过程,模拟膜厚误差优于±0.1%,并在PARMS镀膜机上进行镀制。制造光谱结果:双通带滤光片波长定位精度均小于±2nm,峰值透过率高于95%,截止区300-950nm背景优于OD6,完全满足荧光检测的成像需求。 展开更多

关键词 parms 直接光控 双通带滤光片

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基于PARMS技术的绿豆抗叶斑病基因 VrTAF5 分子标记的开发 被引量：4

3

作者 李灵慧 吴然然 +4 位作者 陈景斌 崔晓艳 袁星星 朱月林 陈新 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第6期1386-1392,共7页

叶斑病是绿豆生产上主要的真菌性病害,利用抗性品种是防治该病害最经济、安全、有效的途径。为筛选抗病资源,根据抗性基因VrTAF5的突变位点,利用五引物扩增受阻突变体系(Penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)... 叶斑病是绿豆生产上主要的真菌性病害,利用抗性品种是防治该病害最经济、安全、有效的途径。为筛选抗病资源,根据抗性基因VrTAF5的突变位点,利用五引物扩增受阻突变体系(Penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)开发分子标记。并利用抗病性具有差异的164份绿豆资源对所开发的分子标记的可靠性进行检验和评价。结果表明,VrTAF5-1517分子标记在7个分子标记中的检出率最高,基因分型为AA、AC、CC,可以有效区分基因碱基序列的SNP差异。根据叶斑病抗性评价结果,该标记对抗病材料的选择效率为75.00%、感病材料的选择效率为93.42%。VrTAF5-1517分子标记对抗病资源中检出抗病基因型的比例、对高感和感病资源中检出感病基因型比例均为100%,说明本研究开发的分子标记可用于绿豆抗叶斑病分子标记辅助育种。 展开更多

关键词 绿豆 叶斑病 VrTAF5基因 SNP分子标记 parms技术

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基于PARMS技术的稻瘟病抗性基因分子标记研究及其在江苏太湖稻区的应用 被引量：5

4

作者 宋云生 曹鹏辉 +5 位作者 于雅洁 乔中英 朱勇良 谢裕林 袁彩勇 董明辉 《江西农业学报》 CAS 2023年第8期23-28,35,共7页

以江苏太湖稻区的206份水稻育种高代稳定材料为研究对象,基于PARMS技术开发并应用了针对抗稻瘟病基因(Pi2、Pib、Pita、Pik)的分子标记,通过对水稻材料的基因型进行鉴定,分析了稻瘟病抗性基因在太湖稻区的分布情况,并进一步探讨了抗性... 以江苏太湖稻区的206份水稻育种高代稳定材料为研究对象,基于PARMS技术开发并应用了针对抗稻瘟病基因(Pi2、Pib、Pita、Pik)的分子标记,通过对水稻材料的基因型进行鉴定,分析了稻瘟病抗性基因在太湖稻区的分布情况,并进一步探讨了抗性基因与田间诱发穗颈瘟抗病性表现的关系。结果表明,抗性基因Pib、Pita和Pik在供试材料中分布广泛,检出率分别为98.06%、85.44%和40.29%,而Pi2基因的检出率则较低,仅为26.70%。在抗性基因组合中,以“Pib+Pita”组合材料最多,占比84.47%;3个基因组合中以“Pib+Pita+Pik”的材料最多,占比34.47%。由田间抗病性鉴定结果可知,多基因聚合对稻瘟病的抵抗力明显增强,同时存在2个基因“Pib+Pita”的中抗级别以上材料48份,存在3个基因“Pi2+Pita+Pik”的中抗级别以上材料47份。相关性分析表明,Pib和Pik基因与穗颈瘟的抗性呈(极)显著正相关,而Pi2和Pita基因的相关性不显著。本研究结果对于制定江苏太湖地区更有效的稻瘟病防治策略,以及进一步研究抗病品种选育具有重要的理论意义和较大的应用价值。 展开更多

关键词 parms技术 稻瘟病 抗性基因 分子标记 太湖稻区

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基于PARMS标记辅助选择鲜食玉米高叶酸种质 被引量：4

5

作者 赵桐 何欢 +4 位作者 周德龙 孟令聪 卢实 赵仁贵 王薪淇 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第23期7834-7840,共7页

提升鲜食玉米叶酸含量是营养强化育种的重要课题之一。为高效创制高叶酸鲜食玉米新种质,本研究根据叶酸代谢关键基因ZmGFT1的目标变异位点,设计基于碱煮法DNA提取的3对PARMS标记并对应用效果进行评估。结果表明,三对引物识别基因型与测... 提升鲜食玉米叶酸含量是营养强化育种的重要课题之一。为高效创制高叶酸鲜食玉米新种质,本研究根据叶酸代谢关键基因ZmGFT1的目标变异位点,设计基于碱煮法DNA提取的3对PARMS标记并对应用效果进行评估。结果表明,三对引物识别基因型与测序结果一致,引物2无法识别杂合基因型,引物1识别率高、针对性强、效果最好;通过PARMS识别到的GGG基因型材料平均叶酸含量显著高于GAA、CAA两种基因型。该方法为未来鲜食玉米营养强化育种及高通量分子标记辅助选择育种提供实用手段。 展开更多

关键词 高叶酸 鲜食玉米 parms 分子标记

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水稻抽穗期调控基因Hd6的PARMS标记开发与利用 被引量：4

6

作者 彭永彬 杜晨阳 +4 位作者 郑崇珂 周晋军 孙伟 和亚男 谢先芝 《山东农业科学》 北大核心 2022年第8期1-6,共6页

水稻抽穗期调控基因Hd6有Hd6^(Nip)和Hd6^(Kasa)两个等位基因型,其中有功能的Hd6^(Kasa)型在长日照条件下抑制抽穗,可有效应用于水稻育种工作。为提高Hd6的选择效率,本研究根据水稻品种‘Kasalath’与‘日本晴’在Hd6第436位密码子上的... 水稻抽穗期调控基因Hd6有Hd6^(Nip)和Hd6^(Kasa)两个等位基因型,其中有功能的Hd6^(Kasa)型在长日照条件下抑制抽穗,可有效应用于水稻育种工作。为提高Hd6的选择效率,本研究根据水稻品种‘Kasalath’与‘日本晴’在Hd6第436位密码子上的A/T变异,基于五引物扩增受阻突变体系(penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)标记技术原理,开发了特异性PARMS标记Hd6^(Kasa)-PARMS,并利用该标记对‘蜀恢498’与‘苏秀867’的回交BC_(2)F_(2)群体进行Hd6等位基因的分型,成功分出Hd6^(Nip)型、Hd6^(Kasa)型及对应的杂合型,经进一步测序验证,基因分型的准确度达到100%;对基因分型与抽穗期表型的相关性进行Pearson相关分析,相关系数为0.858,达到极显著相关水平。综上,利用该标记可快速有效鉴定出水稻抽穗期调控基因Hd6的等位基因分型,从杂交后代群体中分离出携带Hd6^(Kasa)基因型的单株,对提高育种效率、促进水稻生育期的遗传改良具有重要应用价值。 展开更多

关键词 水稻 抽穗期 Hd6 parms标记 等位基因分型

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PARMS在水稻基因编辑后代基因分型中的应用研究 被引量：5

7

作者 律文堂 尹静静 +4 位作者 阴筱 徐国鑫 吴小宾 李效尊 吴修 《山东农业科学》 2019年第10期8-13,共6页

基因编辑技术为植物基因功能研究和作物遗传改良提供了有效途径。目前基因编辑植株基因分型多采用PCR/RE法、PAGE检测法、Sanger测序法等手段,但这些方法存在操作复杂、耗时长或成本高等问题。PARMS技术(penta-primer amplification ref... 基因编辑技术为植物基因功能研究和作物遗传改良提供了有效途径。目前基因编辑植株基因分型多采用PCR/RE法、PAGE检测法、Sanger测序法等手段,但这些方法存在操作复杂、耗时长或成本高等问题。PARMS技术(penta-primer amplification refractory mutation system,五引物扩增受阻突变体系)是最新开发出的基于荧光检测的SNP基因分型方法,具有操作简便、耗时短、成本低的优势。本研究利用PARMS技术对水稻CRISPR/Cas9基因编辑植株进行了基因分型,鉴定结果与PAGE检测和Sanger测序法一致,证明PARMS技术可用于水稻基因编辑植株后代基因分型,也为其它作物基因编辑后代基因分型技术选择提供了参考。 展开更多

关键词 水稻 基因编辑 基因分型 五引物扩增受阻突变体系(parms)

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基于PARMS技术的结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB分子标记的开发 被引量：1

8

作者 刘晓慧 祖向阳 +4 位作者 王珍珍 赵朋超 高蕾 赵战勤 薛云 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期2503-2512,共10页

文中旨在建立结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB的荧光分子标记,为分子药物敏感性试验提供简便、可靠的基因分型检测方法。对比分析利福平耐药菌株rpoB基因531、526、516、511、513等氨基酸位点的基因突变与敏感菌株中等位基因的序列差异... 文中旨在建立结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB的荧光分子标记,为分子药物敏感性试验提供简便、可靠的基因分型检测方法。对比分析利福平耐药菌株rpoB基因531、526、516、511、513等氨基酸位点的基因突变与敏感菌株中等位基因的序列差异,结合PARMS技术(Penta-primer amplification refractory mutation system),建立rpoB基因的荧光分子标记。利用其对104例结核分枝杆菌临床分离株进行检测,经Sanger测序验证,正确率100%。并采用比例法药敏试验对这104份样本进行了利福平耐药性鉴定,与分子标记结果相符率为94.23%。结果表明,分子标记有较强可靠性,能检出表型药敏无法测出的低浓度耐药样本(511/533单位点突变)。建立的11组荧光分子标记能覆盖92%–96%的利福平耐药菌株rpoB基因突变类型,为快速检测结核分枝杆菌利福平耐药提供新思路。 展开更多

关键词 结核分枝杆菌 利福平耐药 RPOB基因 parms技术 比例法药敏

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菠萝PARMS反应体系的建立 被引量：1

9

作者 高云飞 林文秋 +4 位作者 吴青松 张秀梅 孙伟生 刘胜辉 姚艳丽 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第2期225-232,共8页

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)广泛分布在植物的基因组中,具有丰富的DNA变异形式。基于单核苷酸多态性开发的标记被认为是极具应用前景的分子标记。五引物扩增受阻突变体系(Penta-primer amplification re-fracto... 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)广泛分布在植物的基因组中,具有丰富的DNA变异形式。基于单核苷酸多态性开发的标记被认为是极具应用前景的分子标记。五引物扩增受阻突变体系(Penta-primer amplification re-fractory mutation system,PARMS)是一种基于单核苷酸多态性的新型基因分型技术,具有通量高、准确性高、成本低和耗时短等优点。因此,建立高效、简便可行的PARMS分型技术对菠萝种质资源的鉴定、基因定位的开展以及分子辅助选择育种体系的建立具有重要意义。本研究以3份表型差异显著的菠萝种质资源为材料,基于130份菠萝种质资源的重测序数据分析结果,设计特异引物SNP31。结果显示,SNP31可将菠萝种质资源进行较好地分型,可用于后续反应体系的优化。为了建立适用于菠萝的PARMS-SNP分型体系,对PARMS的反应体积、引物浓度、DNA的提取方法和DNA浓度等参数进行优化。研究结果表明,反应体积、引物浓度以及DNA的浓度均能影响基因型信号点的荧光信号值。在较大或较小的反应体积下基因型信号点的荧光信号值均降低,最适的反应体积为6μL。随着引物和DNA浓度的增加,基因型信号点的荧光信号值增加,最佳的引物和DNA浓度分别为100μmol/L和25 ng/μL。此外,不同基因组DNA的提取方法均能对3份种质实现较好的PARMS-SNP分型。因此,PARMS-SNP分型体系的最佳反应体系为:反应总体积6μL,DNA(25 ng)1μL,PARMS mix 3μL,Primer mix(100μmol/L)0.45μL,ddH2O 1.55μL。利用65份菠萝种质资源验证该体系的准确性和稳定性,获得了较好的PARMS-SNP分型结果。本研究建立的PARMS-SNP分型体系为开展菠萝种质资源遗传多样性分析、遗传图谱的构建、基因定位及分子标记辅助选择提供基础。 展开更多

关键词 菠萝 SNP parms 反应体系

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PARMS分子标记检测方法在番茄种质资源鉴定中的应用 被引量：4

10

作者 石雪燕 李涛 +6 位作者 王虹云 张瑞清 曹守军 张丽莉 姚建刚 刘佳凤 黄代峰 《农业与技术》 2023年第17期25-29,共5页

本研究利用分子标记检测技术对134份番茄材料进行黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-1、Ty-2、Ty-3,叶霉病抗病基因Cf-9,颈腐根腐病抗病基因Frl等5个抗病基因标记进行检测,并通过田间调查进行验证,以对PARMS检测方法在番茄育种材料中的应用进行... 本研究利用分子标记检测技术对134份番茄材料进行黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-1、Ty-2、Ty-3,叶霉病抗病基因Cf-9,颈腐根腐病抗病基因Frl等5个抗病基因标记进行检测,并通过田间调查进行验证,以对PARMS检测方法在番茄育种材料中的应用进行综合评价。结果表明,应用PARMS方法,操作便捷,准确率在95%以上,适于大批量样本检测。 展开更多

关键词 parms 分子标记 种质资源 抗性鉴定

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杧果PARMS反应体系的建立与优化

11

作者 刘静萍 肖熙鸥 +5 位作者 周开兵 柳凤 张国辉 普金安 张翠英 沐云松 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第21期7071-7077,共7页

五引物扩增受阻突变体系(penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)是基于PCR反应的最新基因分型技术,构建杧果PARMS分型体系对杧果种质资源分类和品种选育均有重要意义。本研究以杧果基因组DNA为模板,对PARMS体... 五引物扩增受阻突变体系(penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)是基于PCR反应的最新基因分型技术,构建杧果PARMS分型体系对杧果种质资源分类和品种选育均有重要意义。本研究以杧果基因组DNA为模板,对PARMS体系的反应体积、引物浓度、DNA浓度进行调整优化,以期建立最佳的杧果PARMS分型反应体系,同时利用48份杧果种质对优化体系进行了验证。结果表明:杧果PARMS分型反应体系的最佳体积为4μL:包含2μL 2×PARMS Master Mix,1μL DNA模板(稀释100倍),0.28μL特异性扩增引物混合物(100μmo L/L),0.72μL dd H_2O。从可靠性和稳定性可以看出,优化的反应体系可将48份杧果种质资源显著分型。该反应体系的建立可在遗传多样性分析、指纹图谱构建、分子标记辅助育种等多领域对杧果展开研究。 展开更多

关键词 杧果(Mangifera indica L.) SNP parms 体系建立

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优质多抗樱桃番茄亲本资源筛选

12

作者 王珊珊 王晨瑜 +3 位作者 杨超沙 蔡晓艺 尹伟平 尹庆珍 《新疆农业科学》 北大核心 2025年第5期1139-1150,共12页

【目的】综合评价樱桃番茄高代自交系,筛选优质、多抗的亲本材料,为樱桃番茄育种提供种质资源。【方法】以42份樱桃番茄品种高代自交系为材料,采用因子分析法分析和评价12个性状(果实横径、果实纵径、果肉厚、单果重、可溶性固形物、总... 【目的】综合评价樱桃番茄高代自交系,筛选优质、多抗的亲本材料,为樱桃番茄育种提供种质资源。【方法】以42份樱桃番茄品种高代自交系为材料,采用因子分析法分析和评价12个性状(果实横径、果实纵径、果肉厚、单果重、可溶性固形物、总酸、固酸比、可溶性糖、果糖、蔗糖、苹果酸和VC含量),并采用PARMS方法检测其抗性基因。【结果】综合排名前三名依次是599号、596号和601号,三个番茄材料果实果形均好,可溶性固形物、可溶性糖、果糖、VC含量较高,抗性相对较差,可作为优质樱桃番茄亲本资源。580号综合排名第4,品质较好,且含有5个抗性基因,可作为优质多抗樱桃番茄亲本资源。531号品质综合排名为24,但其抗性基因较多,含有6个纯抗基因,可利用其较好的抗性进行抗病樱桃番茄的育种。【结论】筛选出优质樱桃番茄3份,优质抗病樱桃番茄材料1份,抗病樱桃番茄1份,可作为培育不同类型的樱桃番茄亲本资源。 展开更多

关键词 樱桃番茄 高代自交系 因子分析 综合评价 parms

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5个抗稻瘟病基因在南繁水稻育种材料中的分布及组合特征

13

作者 喻俊杰 孙统庆 +6 位作者 杨柳 陈斌 邵培珺 吴连勇 沈琨仑 陈永梅 许明 《安徽农业科学》 2025年第18期118-120,129,共4页

[目的]明确江苏省南繁水稻育种材料中抗稻瘟病基因的分布情况。[方法]利用五引物扩增受阻突变体系(PARMS)检测技术对11963份南繁水稻育种材料中Pi5、Pi9、Pia、Pigm、Pita抗稻瘟病基因分布情况进行检测分析。[结果]单份水稻材料携带的... [目的]明确江苏省南繁水稻育种材料中抗稻瘟病基因的分布情况。[方法]利用五引物扩增受阻突变体系(PARMS)检测技术对11963份南繁水稻育种材料中Pi5、Pi9、Pia、Pigm、Pita抗稻瘟病基因分布情况进行检测分析。[结果]单份水稻材料携带的抗稻瘟病基因数目为0~4个,其中携带1个抗病基因的材料最多(49.09%),携带4个基因材料最少(0.07%)。5个抗稻瘟病基因在育种材料中分布频率存在较大差异,为0.88%~47.74%,其中Pita基因出现频率最高(47.74%),其余依次为Pi5(18.26%)、Pia(17.45%)、Pigm(14.19%),Pi9基因出现频率最低(0.88%)。11963份水稻材料中共有抗稻瘟病基因组合22个,在2个及以上基因组合类型中,以携带Pita+Pia基因组合材料最多(959份),其次是Pita+Pi5(690份)。[结论]明确了江苏南繁水稻育种材料的抗稻瘟病基因分布情况,这将为进一步利用育种材料中稻瘟病抗性基因选育广谱抗病品种提供理论参考。 展开更多

关键词 水稻 抗稻瘟病基因 parms技术 抗病育种

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江苏太湖地区粳稻稻瘟病抗性基因(Pi2、Pita、Pib)的分布及抗病效应 被引量：4

14

作者 于雅洁 曹鹏辉 +6 位作者 宋云生 陈飞 乔中英 董明辉 朱勇良 谢裕林 袁彩勇 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期769-776,共8页

为分析稻瘟病抗性基因Pi2、Pita、Pib在江苏太湖地区粳稻稻瘟病抗性育种中的作用,利用五引物扩增受阻突变体系(PARMS)检测技术,检测水稻稻瘟病抗性基因Pi2、Pita、Pib在江苏太湖地区农业科学研究所筛选培育的799份高世代稳定试验材料中... 为分析稻瘟病抗性基因Pi2、Pita、Pib在江苏太湖地区粳稻稻瘟病抗性育种中的作用,利用五引物扩增受阻突变体系(PARMS)检测技术,检测水稻稻瘟病抗性基因Pi2、Pita、Pib在江苏太湖地区农业科学研究所筛选培育的799份高世代稳定试验材料中的分布情况,并结合穗颈瘟人工接种鉴定结果分析基因型与抗性的关系。结果表明,在799份供试水稻品种中,以抗性基因Pib的分布频率最高,抗性基因Pita的分布频率也相对较高,抗性基因Pi2分布频率较低,多数材料携带2个抗性基因;在抗性基因组合中,Pita+Pib组合检出率较高,为44.81%(358/799)。田间抗病性鉴定结果表明,当供试材料中只存在单一抗病基因时,中抗级别以上材料占比为33.60%(86/256),当供试材料中存在复合基因型时,中抗级别以上材料占比为61.02%(299/490),表明抗性基因共存可以有效增强植株对稻瘟病的抗性。本研究结果为江苏太湖地区粳稻稻瘟病抗性基因聚合育种的选择提供了理论支持。 展开更多

关键词 稻瘟病 parms技术 抗性基因 抗病育种

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113份樱桃番茄分离单株抗病基因检测及品质鉴定

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作者 王珊珊 王晨瑜 +3 位作者 郄丽娟 尹伟平 杨超沙 尹庆珍 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期54-64,共11页

为了筛选多抗、优质樱桃番茄亲本资源,本研究采用PARMS检测技术对44个樱桃番茄品种,113份樱桃番茄分离单株进行17个抗性基因检测。结果表明:113份樱桃番茄分离单株中,含有叶霉病抗性基因Cf-5的材料最多,占80.6%;而含有枯萎病抗性基因I-... 为了筛选多抗、优质樱桃番茄亲本资源,本研究采用PARMS检测技术对44个樱桃番茄品种,113份樱桃番茄分离单株进行17个抗性基因检测。结果表明:113份樱桃番茄分离单株中,含有叶霉病抗性基因Cf-5的材料最多,占80.6%;而含有枯萎病抗性基因I-3的材料占2.7%,资源较为稀缺。对单一材料含有的抗性个数汇总发现706-1含有13个抗性基因,637-7、649-8含有12个抗性基因。含6个以上抗性基因的材料共67份,多抗樱桃番茄材料较为丰富。根据抗性检测结果,筛选出25份纯抗樱桃番茄材料进行可溶性固形物含量(TSS)等的测定。其中643-2的TSS含量最高为8.91%,固酸比10.72,含有7个纯抗基因;647-5的TSS为7.65%,可溶性酸含量较高,含有7个纯抗基因,为本研究筛选的较好的优质多抗亲本资源;706-3、648-6、717-4的TSS较低,分别含有8、9、7个纯抗基因,可利用其较好的抗性进行多抗樱桃番茄的育种研究,本研究筛选的资源为多抗优质樱桃番茄的选育提供丰富的基础。 展开更多

关键词 樱桃番茄 抗病基因检测 parms 亲本资源

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水稻赤霉素代谢基因OsGA2ox4的两种检测方法比较

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作者 顾巧美 郑国利 王攀 《中国种业》 2024年第4期108-112,共5页

针对水稻赤霉素代谢基因OsGA2ox4,利用PARMS试剂盒及基于PCR引物3'末端核苷酸双脱氧修饰两种检测方法,对236份水稻材料进行基因型检测,两种检测方法结果符合率为93.18%,均可以通过SNP分型对水稻赤霉素代谢基因OsGA2ox4进行基因型鉴... 针对水稻赤霉素代谢基因OsGA2ox4,利用PARMS试剂盒及基于PCR引物3'末端核苷酸双脱氧修饰两种检测方法,对236份水稻材料进行基因型检测,两种检测方法结果符合率为93.18%,均可以通过SNP分型对水稻赤霉素代谢基因OsGA2ox4进行基因型鉴定。对两种方法的优缺点具体说明,并且提供这两种方法的选择或使用条件,可以为SNP检测技术的进一步研究及两种方法在水稻其他基因SNP分型中的应用提供参考。 展开更多

关键词 水稻 赤霉素 parms 核苷酸双脱氧修饰 单核苷酸多态性

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水稻油脂组分含量主效基因qPAL6分子标记的开发 被引量：1

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作者 夏明元 杜雪树 +2 位作者 李进波 万丙良 戚华雄 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第7期2262-2268,共7页

水稻油脂组分含量是影响水稻食味品质的重要因素之一。开发水稻油脂组分含量主效基因qPAL6的分型检测方法并开展分子标记辅助选择,是改良水稻油脂组分含量及培育优良食味品质品种的有效途径。本研究利用qPAL6位点的序列差异,开发了qPAL... 水稻油脂组分含量是影响水稻食味品质的重要因素之一。开发水稻油脂组分含量主效基因qPAL6的分型检测方法并开展分子标记辅助选择,是改良水稻油脂组分含量及培育优良食味品质品种的有效途径。本研究利用qPAL6位点的序列差异,开发了qPAL6基因的功能性InDel(Insertion/Deletion)标记PAL6M2;同时基于PARMS技术(Penta-primer amplification refractory mutation system,五引物扩增受阻突变体),开发了qPAL6基因内的荧光分子标记PM-PAL6。利用分子标记PAL6M2和PM-PAL6对96份水稻材料进行分析,结果表明,2个分子标记均可用于水稻qPAL6位点基因型检测。该研究为水稻油脂组分含量分子标记辅助育种提供了实用可靠的基因分型技术。 展开更多

关键词 水稻 油脂组分含量 INDEL标记 parms技术 荧光分子标记

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八十一份番茄种质资源的六种病害抗病基因检测 被引量：9

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作者 杨超沙 王珊珊 +3 位作者 尹伟平 王国华 张立永 尹庆珍 《北方园艺》 CAS 北大核心 2022年第20期1-9,共9页

以课题组选育的81份大果番茄自交系为试材,利用PARMS技术对黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-1、Ty-2、Ty-3/3a,根结线虫病抗病基因Mi-1.2、冠状根腐病抗病基因Frl、叶霉病抗病基因Cf-5、Cf-9、晚疫病抗病基因Ph-3、灰叶斑病抗病基因Sm进行了检... 以课题组选育的81份大果番茄自交系为试材,利用PARMS技术对黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-1、Ty-2、Ty-3/3a,根结线虫病抗病基因Mi-1.2、冠状根腐病抗病基因Frl、叶霉病抗病基因Cf-5、Cf-9、晚疫病抗病基因Ph-3、灰叶斑病抗病基因Sm进行了检测,分析了目前这些材料中多抗基因的种类及分布,以期为聚合育种提供参考依据。结果表明:81份番茄材料中,含黄化曲叶病毒病抗病基因(Ty-1或Ty-2)、叶霉病抗病基因(Cf-5或Cf-9)、灰叶斑病抗病基因、根结线虫病抗病基因的材料较多,分别为76、68、66、65份;含4个抗病基因的材料最多,共31份。结合田间表现,最终筛选出3个含有6个抗病基因的纯合材料463、杂合材料398、354,及含有5个抗病基因的材料409、470、479、480。下一步将对筛选出的材料进行纯化,为选育多抗优质番茄新品种奠定基础。 展开更多

关键词 番茄 抗病基因 parms 聚合育种

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一种基于虚拟受体模型的定量构效关系研究方法 被引量：2

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作者 陈红明 周家驹 +1 位作者 谢桂荣 任天瑞 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1997年第7期626-631,共6页

提出了一种可用于定量构效关系研究的PARM（PseudoAtomicReceptorMode）算法．算法中定义了一套虚拟受体原子，并利用遗传算法构造了一系列虚拟受体模型．这些模型具有高的受体－配体相互作用能和生物活性间的相关性，并能预报未知分子... 提出了一种可用于定量构效关系研究的PARM（PseudoAtomicReceptorMode）算法．算法中定义了一套虚拟受体原子，并利用遗传算法构造了一系列虚拟受体模型．这些模型具有高的受体－配体相互作用能和生物活性间的相关性，并能预报未知分子的生物活性．应用此算法对钾离子通道开放剂体系进行了QSAR研究． 展开更多

关键词 虚拟受体模型 遗传算法 构效关系 PARM算法

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87份水稻材料中抗稻瘟病基因的分子检测 被引量：12

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作者 刘军化 黄成志 +4 位作者 蒋静玥 吕直文 刘忠贤 蔡钟亚 雷树凡 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第9期2030-2037,共8页

【目的】探明9个抗稻瘟病基因Pi1、Pib、Pi2、Pi5、Pi9、Pita、Pigm、Pik、Pik-m在水稻材料中的分布情况,分析不同基因型的稻瘟病田间抗性水平。【方法】选择万州区甘宁镇、恩施市白果乡和湄潭县兴隆镇3个稻瘟病抗性鉴定基地,通过调查... 【目的】探明9个抗稻瘟病基因Pi1、Pib、Pi2、Pi5、Pi9、Pita、Pigm、Pik、Pik-m在水稻材料中的分布情况,分析不同基因型的稻瘟病田间抗性水平。【方法】选择万州区甘宁镇、恩施市白果乡和湄潭县兴隆镇3个稻瘟病抗性鉴定基地,通过调查基地内水稻叶瘟和穗颈瘟的田间发病情况,筛选出抗病等级在中抗及以上的材料87份,以白果乡基地为取材点,选取供试材料的剑叶,提取DNA,利用PARMS SNP分型原理,检测9个抗稻瘟病基因在87份水稻材料中的分布情况。【结果】3个试验点的水稻材料叶瘟发病较轻,仅湄潭点有27.59%的材料表现为中感,其余材料均表现为中抗及以上;穗颈瘟发病相对较重,其中湄潭点发病最重,全部材料为中感及以上,有的甚至丧失了抗性,恩施点次之,有21.84%的材料表现为中感,万州点最轻,全部材料表现为中抗及以上。9个抗稻瘟病基因的分布情况:含Pi1基因的材料有4份;含Pib基因的材料有53份,其中杂合基因的材料5份;含Pi2基因的材料有47份,其中杂合基因的材料9份;含Pi5基因的材料有72份,其中杂合基因的材料5份;Pi9和Pik基因0份;含Pita基因的材料有36份,其中杂合基因的材料8份;含Pigm基因的材料有14份,其中杂合基因的材料3份;含Pik-m基因的材料有21份。在所测定的9个抗稻瘟病基因中只有10份水稻材料为单基因分布,多数材料至少有2个聚合基因分布,最多的含有5个聚合基因,还有2份材料中未检测到这些基因。【结论】综合稻瘟病田间抗性鉴定和抗稻瘟病基因检测结果,明确了单一稻瘟病抗性基因和聚合基因的抗性都在减弱,因此,挖掘抗稻瘟病能力强的新基因、新材料是选育抗稻瘟病新品种的有效途径。 展开更多

关键词 水稻 稻瘟病 叶瘟 穗颈瘟 抗性基因 parms基因检测

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