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水稻OsCAT2的Crispr/cas敲除植株的全基因表达谱分析
1
作者
王联红
刘家林
+11 位作者
欧阳林娟
傅军如
贺浩华
朱昌兰
彭小松
贺晓鹏
陈小荣
边建民
徐杰
孙晓棠
周大虎
胡丽芳
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期5640-5646,共7页
为了进一步了解水稻过氧化氢酶基因OsCAT2的分子机制及其调控网络,本研究以野生型及OsCAT2基因的Crispr/cas转基因敲除植株为材料进行基因芯片分析。通过差异基因的筛选共获得5483个差异表达基因,其中3248个上调表达,2235个下调表达。通...
为了进一步了解水稻过氧化氢酶基因OsCAT2的分子机制及其调控网络,本研究以野生型及OsCAT2基因的Crispr/cas转基因敲除植株为材料进行基因芯片分析。通过差异基因的筛选共获得5483个差异表达基因,其中3248个上调表达,2235个下调表达。通过GO功能注释发现,差异基因在二价金属离子运输、锌-Ⅱ离子运输、次生代谢产物生物合成过程和二价无机阳离子转运代谢途径中显著富集;通过KEGG通路分析发现,差异基因在次生代谢产物的生物合成、植物-病原互作、光合作用、氰基氨基酸代谢和类黄酮生物合成途径中显著富集。进一步分析发现,差异表达基因中还包括一系列与植株分蘖数及抗性相关的基因。该研究为深入探讨水稻过氧化氢酶基因OsCAT2的作用机制提供了理论参考。
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关键词
水稻
过氧化氢酶
oscat2
差异基因
原文传递
题名
水稻OsCAT2的Crispr/cas敲除植株的全基因表达谱分析
1
作者
王联红
刘家林
欧阳林娟
傅军如
贺浩华
朱昌兰
彭小松
贺晓鹏
陈小荣
边建民
徐杰
孙晓棠
周大虎
胡丽芳
机构
江西农业大学
江西省超级稻工程技术研究中心
双季稻现代化生产协同中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期5640-5646,共7页
基金
国家自然科学基金(32060455)
江西省自然科学基金(20202BAB205007)共同资助。
文摘
为了进一步了解水稻过氧化氢酶基因OsCAT2的分子机制及其调控网络,本研究以野生型及OsCAT2基因的Crispr/cas转基因敲除植株为材料进行基因芯片分析。通过差异基因的筛选共获得5483个差异表达基因,其中3248个上调表达,2235个下调表达。通过GO功能注释发现,差异基因在二价金属离子运输、锌-Ⅱ离子运输、次生代谢产物生物合成过程和二价无机阳离子转运代谢途径中显著富集;通过KEGG通路分析发现,差异基因在次生代谢产物的生物合成、植物-病原互作、光合作用、氰基氨基酸代谢和类黄酮生物合成途径中显著富集。进一步分析发现,差异表达基因中还包括一系列与植株分蘖数及抗性相关的基因。该研究为深入探讨水稻过氧化氢酶基因OsCAT2的作用机制提供了理论参考。
关键词
水稻
过氧化氢酶
oscat2
差异基因
Keywords
Rice
Catalase
oscat2
Differentially expressed genes
分类号
S511 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻OsCAT2的Crispr/cas敲除植株的全基因表达谱分析
王联红
刘家林
欧阳林娟
傅军如
贺浩华
朱昌兰
彭小松
贺晓鹏
陈小荣
边建民
徐杰
孙晓棠
周大虎
胡丽芳
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
原文传递
已选择
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