期刊导航
期刊开放获取
vip
退出
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式:
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
NKChemSQL——针对MySQL的化学信息学扩展
被引量:
2
1
作者
鹿涛
乔园园
+1 位作者
申泮文
车云霞
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第10期1358-1362,共5页
化学数据库是进行化学信息学研究的重要资源,分子属性与指纹计算、分子结构格式转换、分子相似度匹配、精确匹配和子结构匹配以及分子结构图片导出等,都是必需的基本服务内容。应用广泛的数据库系统MySQL却缺乏这些功能,难以满足化学信...
化学数据库是进行化学信息学研究的重要资源,分子属性与指纹计算、分子结构格式转换、分子相似度匹配、精确匹配和子结构匹配以及分子结构图片导出等,都是必需的基本服务内容。应用广泛的数据库系统MySQL却缺乏这些功能,难以满足化学信息处理、网站开发等开发的需求。NKChemSQL是自行编制的MySQL扩展库,通过对开源软件OpenBabel的功能进行包装,以SQL语言的格式完成相应操作。NKChemSQL具有良好的运行表现,经过对含26万余条分子结构信息的NCI数据库进行的测试,全结构匹配只需不到1秒而子结构匹配达300个结构/秒,相似度匹配则达1万个结构/秒。NKChemSQL为开发化学信息学软件和网站提供了非常便利的新方式。
展开更多
关键词
开源软件
结构匹配
分子指纹
MYSQL
openbabel
原文传递
题名
NKChemSQL——针对MySQL的化学信息学扩展
被引量:
2
1
作者
鹿涛
乔园园
申泮文
车云霞
机构
南开大学化学学院
出处
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第10期1358-1362,共5页
文摘
化学数据库是进行化学信息学研究的重要资源,分子属性与指纹计算、分子结构格式转换、分子相似度匹配、精确匹配和子结构匹配以及分子结构图片导出等,都是必需的基本服务内容。应用广泛的数据库系统MySQL却缺乏这些功能,难以满足化学信息处理、网站开发等开发的需求。NKChemSQL是自行编制的MySQL扩展库,通过对开源软件OpenBabel的功能进行包装,以SQL语言的格式完成相应操作。NKChemSQL具有良好的运行表现,经过对含26万余条分子结构信息的NCI数据库进行的测试,全结构匹配只需不到1秒而子结构匹配达300个结构/秒,相似度匹配则达1万个结构/秒。NKChemSQL为开发化学信息学软件和网站提供了非常便利的新方式。
关键词
开源软件
结构匹配
分子指纹
MYSQL
openbabel
Keywords
open source, structure search, molecular fingerprints, MySQL,
openbabel
分类号
O6-39 [理学—化学]
TP311.13 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
NKChemSQL——针对MySQL的化学信息学扩展
鹿涛
乔园园
申泮文
车云霞
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2009
2
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部