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肠道源和口唇源羊口疮病毒ORF128基因的比较分析
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作者 樊月圆 刘泽武 +6 位作者 袁嘉芮 张瑞雪 陈媛媛 周冬雪 段宁 四朗玉珍 富国文 《动物医学进展》 北大核心 2025年第7期1-10,共10页
分析羊口疮病毒(ORFV)肠道源和口唇源锚蛋白ORF128基因和蛋白的差异,为进一步研究该病毒的致病机制奠定基础。对肠道源和口唇源ORFV的ORF128基因PCR扩增后克隆测序,用生物信息学软件对其序列及编码蛋白的二级结构、磷酸化位点和跨膜结... 分析羊口疮病毒(ORFV)肠道源和口唇源锚蛋白ORF128基因和蛋白的差异,为进一步研究该病毒的致病机制奠定基础。对肠道源和口唇源ORFV的ORF128基因PCR扩增后克隆测序,用生物信息学软件对其序列及编码蛋白的二级结构、磷酸化位点和跨膜结构域进行预测和分析。结果表明,肠道源和口唇源ORFV的ORF128基因长度均为1506 bp,编码501个氨基酸;肠道源和口唇源ORF128基因核苷酸序列同源性为98.30%,氨基酸序列同源性为98.40%,存在8个氨基酸突变。氨基酸组成显示,肠道源和口唇源ORF128蛋白丙氨酸含量最高。蛋白质理化性质分析显示,口唇源ORF128蛋白不稳定系数为38.72,提示该蛋白可能为稳定蛋白;肠道源ORF128蛋白不稳定系数为41.33,提示该蛋白可能为不稳定蛋白。蛋白质磷酸化位点分析显示,口唇源ORF128蛋白含有33个潜在的磷酸化位点,肠道源ORF128蛋白含有35个潜在的磷酸化位点。说明ORFV肠道源和口唇源的ORF128基因存在差异,结果可为进一步研究羊口疮病毒致病机制提供参考。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 orf128基因 克隆 生物信息学分析
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鸡痘病毒ORF127蛋白间接ELISA抗体检测方法的建立与应用
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作者 华炯钢 朱寅初 +6 位作者 叶加林 张存 陈柳 倪征 付媛 霍苏馨 云涛 《浙江农业学报》 北大核心 2025年第10期2057-2065,共9页
为建立快速、准确的鸡痘病毒(fowlpox virus,FPV)抗体检测方法,将FPV ORF127基因的抗原表位区域克隆于pET-28a(+)原核表达载体,诱导表达并纯化获得FPV ORF127截短蛋白,以纯化的蛋白作为包被抗原,通过优化各反应条件,建立检测FPV抗体的间... 为建立快速、准确的鸡痘病毒(fowlpox virus,FPV)抗体检测方法,将FPV ORF127基因的抗原表位区域克隆于pET-28a(+)原核表达载体,诱导表达并纯化获得FPV ORF127截短蛋白,以纯化的蛋白作为包被抗原,通过优化各反应条件,建立检测FPV抗体的间接ELISA方法,经特异性、敏感性、重复性等试验和临床血清样本检测进行系统验证。结果显示,间接ELISA检测FPV抗体的最佳反应条件为:包被抗原质量浓度为10μg·mL^(-1),待检血清稀释度为1∶100,酶标二抗稀释度为1∶25000;特异性试验结果显示,除FPV阳性血清呈阳性反应外,与其他6种病毒(新城疫病毒、H9亚型禽流感病毒、鸡传染性法氏囊病毒、鸡传染性喉气管炎病毒、禽腺病毒4型、火鸡疱疹病毒)的阳性血清均无交叉反应;敏感性结果显示,FPV阳性血清稀释800倍后检测结果仍为阳性;批内、批间重复试验结果显示,批内变异系数为1.81%~7.07%,批间变异系数为2.12%~7.16%,均小于10%。临床血清样品检测结果显示,180份血清样本总阳性率为79.4%(143/180)。上述结果表明,本研究建立的间接ELISA方法特异性强、敏感性高、重复性和稳定性好,可为免疫鸡群FPV抗体水平监测和FPV流行病学调查提供技术支撑。 展开更多
关键词 鸡痘病毒 orf127蛋白 间接ELISA 抗体
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ORF1p通过调控AJUBA表达促进食管鳞状细胞癌细胞增殖和侵袭的研究
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作者 杨帆 黎江洋 +5 位作者 代晓燕 肖何 彭杨 童雪玲 戴楠 李梦侠 《陆军军医大学学报》 北大核心 2025年第13期1429-1443,共15页
目的探讨长散在核元件-1(long interspersed nuclear element-1,LINE-1)编码的开放阅读框1蛋白(open reading frame 1 protein,ORF1p)对食管鳞状细胞癌细胞(以下简称食管鳞癌细胞)增殖、迁移及侵袭的影响及其潜在分子机制。方法①Wester... 目的探讨长散在核元件-1(long interspersed nuclear element-1,LINE-1)编码的开放阅读框1蛋白(open reading frame 1 protein,ORF1p)对食管鳞状细胞癌细胞(以下简称食管鳞癌细胞)增殖、迁移及侵袭的影响及其潜在分子机制。方法①Western blot实验检测ORF1p在食管正常鳞状上皮细胞和食管鳞癌细胞中的表达差异。②免疫组化实验检测ORF1p在食管鳞状细胞癌和配对正常组织中的表达情况。③细胞水平敲低及过表达ORF1p,细胞功能实验研究ORF1p对食管鳞癌细胞恶性生物学行为的影响。④裸鼠成瘤实验验证ORF1p对食管鳞癌细胞体内成瘤的影响。⑤转录组测序分析结合细胞功能回复实验,筛选受ORF1p调控的下游靶点。结果①Western blot实验显示ORF1p在食管鳞癌细胞中均高于正常食管鳞状上皮细胞(P<0.05)。②免疫组化染色实验证实ORF1p在食管鳞状细胞癌组织中明显上调(P<0.0001)。③细胞功能实验及裸鼠成瘤实验显示,ORF1p明显促进食管鳞癌细胞的增殖、迁移、侵袭和体内成瘤能力(P<0.05)。④细胞功能回复实验证实ORF1p通过调控AJUBA表达促进食管鳞癌细胞增殖、迁移和侵袭(P<0.05)。结论ORF1p在食管鳞状细胞癌中显著上调,ORF1p通过调控AJUBA表达促进食管鳞癌细胞增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 LINE-1 orf1p 食管鳞癌细胞 增殖 AJUBA
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牛结节性皮肤病病毒ORF005基因缺失重组病毒的构建及生物学特性分析
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作者 王浩 刘聪 +5 位作者 贾笑冉 温渊 廖凯 汤芳 戴建君 薛峰 《畜牧与兽医》 北大核心 2025年第12期83-91,共9页
旨在通过构建牛结节性皮肤病病毒(lumpy skin disease virus,LSDV)ORF005基因缺失重组病毒,分析其复制能力和对宿主先天性免疫的影响,为LSDV ORF005基因功能的研究奠定基础。本研究利用增强绿色荧光蛋白(EGFP)表达盒替代选取的ORF005基... 旨在通过构建牛结节性皮肤病病毒(lumpy skin disease virus,LSDV)ORF005基因缺失重组病毒,分析其复制能力和对宿主先天性免疫的影响,为LSDV ORF005基因功能的研究奠定基础。本研究利用增强绿色荧光蛋白(EGFP)表达盒替代选取的ORF005基因,扩增其上下游病毒同源臂序列,通过同源重组连接至线性化pUC57载体中,构建基因缺失转移载体pLSDV-ΔORF005-EGFP质粒,将转移载体质粒转染至非洲绿猴肾细胞(Vero)细胞,随后感染LSDV,使LSDV病毒基因组与转移载体质粒发生同源重组,利用多次药物压力筛选、挑取单克隆绿色荧光病变进行筛选和纯化以获得缺失ORF005基因的LSDV重组病毒株,并分析其生物学特性和感染后对宿主先天性免疫的影响。结果:成功构建出缺失ORF005基因的重组病毒LSDVΔORF005-EGFP,该重组病毒在8代细胞传代中能稳定表达EGFP。病毒生长曲线表明,ORF005基因的缺失削弱了LSDV在牛肾细胞(MDBK)细胞中的复制能力(P<0.05)。对比LSDV野毒株,感染该ORF005基因缺失重组病毒增强了MDBK细胞中白细胞介素1b(IL-1b)、肿瘤坏死因子(TNF)、干扰素刺激基因15(ISG15)和抗黏液病毒1蛋白(Mx1)基因的转录水平(P<0.05)。综上,本研究成功构建了ORF005基因缺失的LSDV重组病毒株,为解析LSDV ORF005基因的功能和LSDV基因缺失候选疫苗的奠定基础。 展开更多
关键词 牛结节性皮肤病病毒 orf005基因 重组病毒 先天免疫
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猪圆环病毒2d基因型ORF2基因重组猪伪狂犬病病毒的免疫原性
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作者 焦显芹 王涛 +3 位作者 田润博 马世杰 闫志浩 陈红英 《中国兽医学报》 北大核心 2025年第10期2118-2125,共8页
为研发同时预防和控制猪圆环病毒2d基因型(PCV2d)和猪伪狂犬病病毒(PRV)的疫苗,将PCV2dORF2基因克隆到含有绿色荧光蛋白(EGFP)基因的PRV转移质粒pG中BamHⅠ位点,获得重组质粒pG-PCV2d-EGFP。运用转染试剂ZLip2000将其与PRV变异株3基因... 为研发同时预防和控制猪圆环病毒2d基因型(PCV2d)和猪伪狂犬病病毒(PRV)的疫苗,将PCV2dORF2基因克隆到含有绿色荧光蛋白(EGFP)基因的PRV转移质粒pG中BamHⅠ位点,获得重组质粒pG-PCV2d-EGFP。运用转染试剂ZLip2000将其与PRV变异株3基因缺失毒株gE^(-)/g^(-)/TK^(-)PRV NY DNA转入ST细胞中,经绿色荧光蚀斑纯化,得到表达EGFP的重组病毒rPRV-PCV2d-EGFP。采用CRISPR/Cas9基因双敲除质粒敲除重组病毒中EGFP基因,经蚀斑纯化,拯救出不表达EGFP的重组病毒rPRV-PCV2d。重组病毒rPRV-PCV2d与亲本株gE^(-)/g^(-)/TK^(-)PRV NY具有相近的遗传稳定性,且能够表达PCV2d衣壳(Cap)蛋白。在6周龄小鼠免疫试验中,与商品化PCV2灭活疫苗相比,rPRV-PCV2d刺激小鼠机体诱导了更高的PCV2特异性抗体,且用PCV2d强毒株攻毒后,rPRV-PCV2d显著降低了小鼠心脏、肝脏、脾脏等组织中PCV2d载量。此外,rPRV-PCV2d在小鼠体内激发PRV特异性免疫应答,并能阻止PRV强毒对小鼠的侵袭。表明rPRV-PCV2d具有良好的免疫原性。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2d基因型 猪伪狂犬病病毒 活载体疫苗 orf2基因
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2020-2023年福建省猪繁殖与呼吸综合征病毒分子流行病学调查及ORF5基因变异分析 被引量:1
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作者 黄文琳 于慧 +5 位作者 蓝欣 杨圆 陈洪博 范克伟 魏春华 刘建奎 《动物医学进展》 北大核心 2025年第5期9-16,共8页
为了研究2020-2023年福建省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行和变异规律,采用荧光定量RT-PCR方法,对福建不同地区收集的240份疑似PRRSV的组织样品和血清进行PRRSV-1和PRRSV-2检测,对阳性样品采用RT-PCR方法扩增PRRSV ORF5基因,应用... 为了研究2020-2023年福建省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行和变异规律,采用荧光定量RT-PCR方法,对福建不同地区收集的240份疑似PRRSV的组织样品和血清进行PRRSV-1和PRRSV-2检测,对阳性样品采用RT-PCR方法扩增PRRSV ORF5基因,应用分子生物学软件进行同源性和遗传变异分析。结果显示,福建省PRRSV总体阳性率为18.8%(45/240),其中PRRSV-2的阳性率为16.3%(39/240),PRRSV-1的阳性率为2.5%(6/240)。经RT-PCR成功扩增35个PRRSV-2 ORF5基因和3个PRRSV-1 ORF5基因。序列比对分析表明,35个PRRSV-2 ORF5基因核苷酸同源性为81.3%~99.8%,与代表毒株VR2332、NADC30、NADC34、QYYZ和JXA1的核苷酸同源性为80.9%~99.3%。3个PRRSV-1 ORF5基因核苷酸同源性为82.8%~98.5%,与代表毒株LV、Amervac PRRS、FJQEU14、FJEU13等的核苷酸序列同源性为81.5%~99.7%。遗传进化分析表明,福建省PRRSV-2可分为Lineage1、Lineage3和Lineage8,其中Lineage1占比最高,为68.6%(24/35,18株为NADC30-like毒株,6株为NADC34-like毒株),PRRSV-1均属于SubtypeⅠ。氨基酸分析表明,PRRSV-1 GP5蛋白氨基酸变异主要集中于信号肽区域(aa 1-33)和2个胞外域(aa 33-67和aa 89-109);PRRSV-2 GP5蛋白氨基酸变异主要集中于信号肽区域(aa 1-25)、aa 27-36区域和抗原表位C(aa 52-62)。综上表明,PRRSV-1和PRRSV-2同时在福建省流行,NADC30-like PRRSV-2为优势流行毒株且呈现遗传多样性,NADC34-like PRRSV-2和PRRSV-1可能已在福建省潜在流行。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 orf5基因 序列分析 遗传进化分析 NADC34
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广西南宁猪繁殖与呼吸综合征病毒流行毒株ORF5和NSP2基因的遗传变异分析 被引量:2
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作者 李瑞雪 李承辉 +6 位作者 陈俭 李健 南世发 王瑛春 卢德章 肖书奇 殷玉鹏 《病毒学报》 北大核心 2025年第1期173-183,共11页
本文旨在监测广西南宁猪场猪繁殖与呼吸综合征病病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行情况。采集2022年广西壮族自治区南宁市4个不同规模化猪场的9322份血清样品、1348份睾丸液、402份精液样品、308... 本文旨在监测广西南宁猪场猪繁殖与呼吸综合征病病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行情况。采集2022年广西壮族自治区南宁市4个不同规模化猪场的9322份血清样品、1348份睾丸液、402份精液样品、3083份唾液样品和787份环境样品,使用qRT-PCR方法对样品中的病原进行检测,同时扩增PRRSV阳性样品的ORF5和NSP2基因;测序后利用DNAStar软件进行遗传进化分析、氨基酸序列比对分析,并对ORF5基因的N-糖基化位点进行预测。从PRRSV阳性样品中成功获得23条ORF5基因序列和18条NSP2基因序列,基于ORF5基因遗传进化分析属于PRRSV美洲型,其中NADC30-like毒株13株,NADC34-like毒株9株,VR2332-Like毒株1株。对ORF5氨基酸进行多序列比对显示,23株毒株无插入或缺失,但都存在位点突变。基于NSP2基因遗传进化分析显示为PRRSV美洲型,对NSP2氨基酸进行多序列比对显示,18株PRRSV存在1+19个氨基酸的缺失,与NADC30毒株NSP2氨基酸对应位置缺失模式一致。结果表明,该地区猪场主要流行NADC30-Like和NADC34-Like毒株,PRRSV不同流行毒株存在一定的遗传差异,本研究为广西PRRS防控和疫苗选用提供了科学依据。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸障碍综合征 orf5 NSP2 遗传进化分析
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2022—2023年广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5和Nsp2基因的遗传变异分析 被引量:1
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作者 彭家为 李康 +5 位作者 张歆明 吴寿堂 王爽云 刘燕玲 张乐宜 宋长绪 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2025年第4期86-94,102,共10页
为了初步了解我国广东省猪场中猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行特点和遗传变异情况,试验于2022年2月份——2023年10月份采集广东省11个地区(广州市、肇庆市、河源市、江门市... 为了初步了解我国广东省猪场中猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行特点和遗传变异情况,试验于2022年2月份——2023年10月份采集广东省11个地区(广州市、肇庆市、河源市、江门市、茂名市、云浮市、韶关市、清远市、珠海市、湛江市、汕头市)27家猪场共241份疑似患猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)病猪的肺脏组织和血液样本并采用RT-PCR方法进行PRRSV检测,根据检测结果选取不同地区猪场的10份阳性样本病毒核酸对ORF5和Nsp2基因进行测序及序列遗传变异分析。结果表明:241份肺脏组织和血液样本的总阳性率为21.99%;不同地区阳性率在9.90%~42.86%之间,其中阳性率最高的地区为广州市,最低的地区为云浮市;肺脏组织样本阳性率为14.28%,血液样本阳性率为24.32%。从基于PRRSV ORF5基因构建的遗传进化树中可见,选取的10株PRRSV毒株中有1株(GDZH)位于以JXA1和CH-1a为代表的Lineage8.7亚群分支上,有5株(GDJM、GDKP、GDHY、GDMM、GDST)位于以NADC30为代表的Lineage1亚群分支上,有4株(GDGZ、GDGZ-2、GDZJ、GDGY)位于Lineage3亚群分支上。选取的10株PRRSV毒株ORF5基因之间的核苷酸序列相似性为80.1%~99.3%,其中GDGZ、GDZJ、GDGY和GDGZ-2的ORF5基因与Lineage3亚群毒株QYYZ(登录号为JQ308798.1)的核苷酸序列相似性最高,分别为90.2%、89.4%、93.7%、90.0%;GDJM、GDKP、GDHY、GDST和GDMM的ORF5基因与Lineage1亚群毒株NADC30(登录号为MH500776.1)的核苷酸序列相似性最高,分别为91.0%、92.2%、90.8%、85.7%、91.7%,GDZH的ORF5基因与Lineage8.7亚群高致病性毒株JXA1(登录号为EF11244.5)的核苷酸序列相似性最高,为96.2%。从基于PRRSV Nsp2基因构建的遗传进化树中可见,选取的10株PRRSV毒株中有5株(GDZH、GDGZ、GDGZ-2、GDZJ、GDGY)位于以JXA1和CH-1a为代表的Lineage8.7亚群分支上,有5株(GDJM、GDHY、GDST、GDMM、GDKP)位于以NADC30为代表的Lineage1亚群分支上。选取的10株PRRSV毒株Nsp2基因之间的核苷酸序列相似性为31.6%~96.6%。其中GDZH、GDGZ、GDGZ-2、GDZJ和GDGY的Nsp2基因与Lineage8.7亚群高致病性毒株JXA1(登录号为EF11244.5)的核苷酸序列相似性最高,分别为97.1%、98.1%、96.8%、91.3%、94.2%,GDJM、GDKP、GDST、GDMM、GDHY的Nsp2基因与Lineage1亚群毒株NADC30(登录号为MH500776.1)的核苷酸序列相似性最高,分别为67.6%、83.6%、82.2%、82.8%、80.3%。说明广东省猪场中流行的PRRSV毒株呈现多样性,Lineage3、Lineage1和Lineage8.7为主要流行的亚群。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 orf5基因 NSP2基因 遗传变异 广东省
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高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒强弱毒ORF1a、ORF1b、ORF2-ORF7片段互换嵌合病毒的构建及其生物学特性的分析 被引量:3
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作者 姜一峰 周艳君 +5 位作者 王亚欣 朱建平 徐彦召 童武 虞凌雪 童光志 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期1-5,共5页
为研究高致病性猪繁殖和呼吸综合征病毒(HP-PRRSV)强弱毒之间毒力差异的分子基础,本实验分别以HP-PRRSV强毒HuN-F5株及其传代致弱的疫苗病毒株HuN4-F112为亲本病毒,利用反向遗传操作技术分别将ORF1a、ORF1b或ORF2-7编码序列在强弱毒之... 为研究高致病性猪繁殖和呼吸综合征病毒(HP-PRRSV)强弱毒之间毒力差异的分子基础,本实验分别以HP-PRRSV强毒HuN-F5株及其传代致弱的疫苗病毒株HuN4-F112为亲本病毒,利用反向遗传操作技术分别将ORF1a、ORF1b或ORF2-7编码序列在强弱毒之间互换。将6种含有不同嵌合基因的全长病毒基因组的重组质粒体外转录后转染BHK-21细胞,然后在Marc-145细胞中传代,拯救的重组病毒经RT-PCR、测序和免疫荧光鉴定,并分别命名为rHuN4-F5-ORF1a、rHuN4-F5-ORF1b、rHuN4-F5-ORF2-7(以强毒为骨架)和rHuN4-F112-ORF1a、rHuN4-F112-ORF1b、rHuN4-F112-ORF2-7(以弱毒为骨架)。进一步测定这些病毒在Marc-145上的生长曲线,结果显示:以强毒为骨架的嵌合病毒rHuN4-F5-ORF1a生长滴度显著高于亲本强毒rHuN4-F5,而以弱毒为骨架的嵌合病毒rHuN4-F112-ORF1a在细胞上的生长滴度低于其亲本弱毒rHuN4-F112,其他片段替换对病毒在细胞上的生长没有明显影响。本实验结果提示ORF1a对于PRRSV在体外细胞培养上的生长调节起重要作用。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 嵌合病毒 orf1a orf1b orf2-7
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山羊痘病毒疫苗株ORF31/ORF117/ORF72编码蛋白的原核表达及抗原性分析 被引量:2
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作者 邵佳 闫丰超 +4 位作者 窦永喜 朱学亮 王秋霞 骆学农 许立华 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期930-935,共6页
为了研究羊痘病毒蛋白的功能,将羊痘病毒的DNA结合核衣壳蛋白(ORF31)、融合蛋白(ORF117)、蛋白磷酸酶(ORF72)3个基因分别克隆至pET-30a(+)原核表达载体后,转化大肠杆菌细胞。重组表达菌经IPTG诱导后进行SDS-PAGE电泳,结果显示3个重组蛋... 为了研究羊痘病毒蛋白的功能,将羊痘病毒的DNA结合核衣壳蛋白(ORF31)、融合蛋白(ORF117)、蛋白磷酸酶(ORF72)3个基因分别克隆至pET-30a(+)原核表达载体后,转化大肠杆菌细胞。重组表达菌经IPTG诱导后进行SDS-PAGE电泳,结果显示3个重组蛋白均在原核细胞中获得表达,且大部分以包涵体形式存在,ORF117和ORF72蛋白有少量可溶性蛋白。表达产物经镍柱纯化后进行Western-blot分析,ORF72蛋白能与山羊痘阳性血清反应,证明ORF72蛋白具有免疫反应原性,另外2种蛋白则无反应原性。 展开更多
关键词 山羊痘病毒 DNA结合核衣壳蛋白(orf31) 融合蛋白(orf117) 蛋白磷酸酶(orf72) 原核表达 抗原性分析
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山东PRRSV流行株ORF5、ORF6、ORF7基因序列的分子特征 被引量:1
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作者 李俊 徐绍建 +3 位作者 时建立 吴家强 温建新 王金宝 《家畜生态学报》 2009年第4期76-80,共5页
采用RT-PCR技术对2001-2007年分离自山东地区10株(ShanDong-3、SD-JN、SD-ZQ、SD1、SD2、SD3、SD4、SD5、SD6和SD7)猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)进行ORF5、ORF6和ORF7基因的扩增、克隆和测序,与已知序列的毒株的相应片段进行同源... 采用RT-PCR技术对2001-2007年分离自山东地区10株(ShanDong-3、SD-JN、SD-ZQ、SD1、SD2、SD3、SD4、SD5、SD6和SD7)猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)进行ORF5、ORF6和ORF7基因的扩增、克隆和测序,与已知序列的毒株的相应片段进行同源性分析比较,并对其分子特征进行分析。结果表明:该10株病毒仍属北美洲型,其中2001-2002年分离的SD1株、SD2株和2006年分离的SD6株核苷酸序列之间的ORF5、ORF6、ORF7同源性分别为99.2%,99.8%,100%,均与北美洲原型代表株(VR-2332株)和疫苗毒MLVRe-spPRRS Repro USA遗传距离较近,同属一大分支;2006-2007年分离的PRRSV ShanDong-3、SD-JN、SD-ZQ、SD3,SD4,SD5,SD7分离株ORF5、ORF6、ORF7同源性分别为97.8%-100%,99.4%-99.8%,99.2%-99.7%,均与国内96年Ch-1a和2002年HB-1株及2006年分离鉴定的国内高致病性分离株(JXA1、Shanghai、HEB1)同属一个大的分支。首次证实目前山东省同时存在高致病性PRRSV和传统PRRSV,并且有由传统PRRSV向高致病性PRRSV演化的趋势。 展开更多
关键词 PRRSV 高致病性PRRSV orf5 orf6 orf7 克隆 分子特征
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天津地区猪繁殖与呼吸综合征病毒流行毒株ORF5基因的克隆及遗传变异分析 被引量:1
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作者 李文忠 荣新利 +4 位作者 刘野 吴庆东 张乐 孙英峰 于海 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第2期156-164,共9页
为了解天津地区猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)的流行和遗传变异情况,收集2021-2022年天津地区养殖场209份临床疑似发病猪的组织进行检测及ORF5遗传变异分析。结果显示:PRRSV阳性样品总检出率为37.3%(78/209),并从阳性样本中选择15... 为了解天津地区猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)的流行和遗传变异情况,收集2021-2022年天津地区养殖场209份临床疑似发病猪的组织进行检测及ORF5遗传变异分析。结果显示:PRRSV阳性样品总检出率为37.3%(78/209),并从阳性样本中选择15个不同地区来源具有代表性样品进行ORF5基因克隆序列。序列及遗传进化分析显示:该15株PRRSV毒株均属于美洲型,其中8条PRRSV毒株的ORF5基因与以HuN4为代表的类HP-PRRSV毒株同源性较高,核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性分别为89.4%~97.3%和80.6%~95.5%,而与NADC30、VR2332、NADC34等毒株的同源性较低,分别为77.1%~87.1%和77.1%~86.6%;6条PRRSV毒株的ORF5基因与以NADC30为代表的类NADC30毒株同源性最高,核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性分别为91.9%-92.7%和91.5%-93.0%,而与HuN4、VR2332、NADC34等毒株的同源性较低,分别为83.6%-87.8%和79.6%~86.6%;1条PRRSV毒株的ORF5基因与以NADC34为代表的类NADC34毒株同源性最高,核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性为96.4%和95.5%,而与NADC30、HuN4、VR2332等毒株的同源性为86.7%~89.9%和86.6%~92.0%。结果表明,2021-2022年天津地区以类HP-PRRSV、类NADC30 PRRSV为主要流行毒株,同时出现类NADC34毒株的流行,存在明显的遗传多样性。研究结果可为天津地区PRRS的防控提供理论依据。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒 orf5基因 序列分析 遗传变异 同源性分析
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大黄鱼虹彩病毒ORF 121R蛋白的表达及亚细胞定位
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作者 吴彩霞 刘晓东 +6 位作者 池洪树 谢岸桦 陈秀霞 许斌福 郑在予 潘滢 龚晖 《福建农业学报》 北大核心 2025年第6期577-584,共8页
【目的】解析大黄鱼虹彩病毒(large yellow croaker iridovirus,LYCIV)开放阅读框(Open reading frame,ORF)121R蛋白的免疫原性与亚细胞定位,探究其在病毒致病机制中的潜在作用。【方法】以LYCIV ORF121R蛋白为研究对象,通过生物信息学... 【目的】解析大黄鱼虹彩病毒(large yellow croaker iridovirus,LYCIV)开放阅读框(Open reading frame,ORF)121R蛋白的免疫原性与亚细胞定位,探究其在病毒致病机制中的潜在作用。【方法】以LYCIV ORF121R蛋白为研究对象,通过生物信息学分析手段,进行同源蛋白之间的序列对比,并预测其亚细胞定位;将目的基因通过同源重组方法分别克隆至pET32a及pEGFP-N1载体中,构建重组质粒ORF 121R-His和ORF 121R-EGFP;诱导表达并纯化ORF121R-His重组蛋白,将其免疫小鼠制备多克隆抗体,并通过ELISA、Western-blotting和细胞间接免疫荧光等手段评估抗体效价及特异性;以ORF 121R-EGFP质粒转染EPC细胞后,利用激光共聚焦显微镜观察ORF121R-EGFP的亚细胞定位。【结果】LYCIV ORF 121R蛋白与传染性脾肾坏死病毒(Infectious spleen and kidney necrosis virus,ISKNV)中具有高免疫原性的ORF 117R蛋白氨基酸序列一致性为79.96%,且预测定位于细胞质。orf121R全长1377 bp,将其分别克隆至pET32a及pEGFP-N1载体中,成功构建重组质粒ORF 121R-His和ORF 121REGFP。经亲和纯化获得可溶性ORF 121R-His重组蛋白,其分子量为72.6 kDa,用该重组蛋白制备的多克隆抗体效价为1∶128000,可特异性识别天然病毒蛋白;ORF 121R-EGFP在鲤上皮瘤(Epithelioma papulosum cyprini,EPC)细胞中呈现胞质特异性分布,荧光信号均匀富集于核周区域。【结论】LYCIV ORF 121R主要定位于细胞质中,该蛋白良好的免疫原性与特异性,使其成为潜在的疫苗候选抗原和诊断靶标,为开发针对LYCIV的特异性防控策略提供了新的可能性。 展开更多
关键词 大黄鱼虹彩病毒 orf 121R蛋白 蛋白表达 亚细胞定位
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广西柳州市猪圆环病2型病原检测及ORF2基因序列遗传变异分析
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作者 王翠 廖海珍 +11 位作者 卢军 吴先华 刘文波 覃艳然 许宗丽 李宇 黄小武 严斯刚 李志源 韦祖樟 欧阳康 韦正吉 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第5期172-181,共10页
为了解广西柳州地区猪圆环病毒2型(PCV2)的流行病学特点及遗传变异情况,对柳州地区PCV2进行流行病学调查和系统发育分析,以期为柳州地区PCV2的防控提供一定的参考。通过实时荧光PCR(qPCR)对2020—2022年柳州地区屠宰场的989份健康猪和... 为了解广西柳州地区猪圆环病毒2型(PCV2)的流行病学特点及遗传变异情况,对柳州地区PCV2进行流行病学调查和系统发育分析,以期为柳州地区PCV2的防控提供一定的参考。通过实时荧光PCR(qPCR)对2020—2022年柳州地区屠宰场的989份健康猪和规模猪场或散养猪场的608份患病猪的脾脏、肺脏、肝脏和淋巴结等进行PCV2检测,在此基础上,通过聚合酶链反应随机扩增其中28份阳性样品的Cap蛋白基因(ORF2),测序并进行系统发育分析。结果显示:柳州地区PCV2阳性率约为50.47%(806/1597);对获得的28株PCV2的ORF2基因进行系统发育分析,结果显示3株属于PCV2a亚型(10.71%),6株属于PCV2b亚型(21.43%),19株属于PCV2d亚型(67.86%),这说明目前PCV2d亚型是柳州市PCV2流行的主要优势亚型。本试验丰富了PCV2 ORF2基因库信息,同时为柳州地区PCV2分子流行病学研究和防控提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 orf2 遗传变异
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牛结节性皮肤病病毒ORF002蛋白原核表达及间接ELISA抗体检测方法的建立
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作者 张亚岭 景伟 +7 位作者 赵妍 何小兵 房永祥 苏洋 李小明 张慧 景志忠 陈国华 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第11期5817-5825,共9页
本研究旨在建立一种基于牛结节性皮肤病病毒(LSDV)ORF002蛋白的间接ELISA抗体检测方法。通过构建重组质粒pET-30a(+)-ORF002并诱导表达,获得相对分子质量约为13 ku的蛋白,以SDS-PAGE和Western blot验证后的ORF002蛋白为包被抗原,建立LSD... 本研究旨在建立一种基于牛结节性皮肤病病毒(LSDV)ORF002蛋白的间接ELISA抗体检测方法。通过构建重组质粒pET-30a(+)-ORF002并诱导表达,获得相对分子质量约为13 ku的蛋白,以SDS-PAGE和Western blot验证后的ORF002蛋白为包被抗原,建立LSDV间接ELISA抗体检测方法并进行条件优化。优化后的间接ELISA条件为:抗原包被浓度2.5μg·mL^(-1),血清稀释度1∶100,二抗稀释度1∶120000。结果判定标准为待检样品OD_(450 nm)值≥标准阳性值×20.34%为阳性,反之为阴性。重复性试验变异系数<10%,与多种病毒阳性血清无交叉反应。该方法具有良好的敏感性、特异性及重复性,适用于LSD感染临床血清样品检测和疫苗免疫效果评价。 展开更多
关键词 牛结节性皮肤病 orf002 原核表达 间接ELISA
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山羊痘病毒锚蛋白ORF141.2对NF-κB信号通路的调控作用研究
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作者 杨云凤 常慧慧 +7 位作者 冯秋媛 田峥 邵晓龙 罗逸青 郭小腊 陈国华 景志忠 陈轶霞 《病毒学报》 北大核心 2025年第4期1045-1055,共11页
痘病毒编码多种能够操控宿主先天免疫反应的蛋白。研究表明,鼠痘病毒编码的锚蛋白通过与Skp1互作抑制NF-κB通路。山羊痘病毒编码的锚蛋白ORF141.2与鼠痘病毒编码的锚蛋白存在类似的结构,其对NF-κB信号通路的调控作用还未见报道。为了... 痘病毒编码多种能够操控宿主先天免疫反应的蛋白。研究表明,鼠痘病毒编码的锚蛋白通过与Skp1互作抑制NF-κB通路。山羊痘病毒编码的锚蛋白ORF141.2与鼠痘病毒编码的锚蛋白存在类似的结构,其对NF-κB信号通路的调控作用还未见报道。为了明确ORF141.2对NF-κB信号通路的调控作用,本研究采用双荧光素酶报告系统检测了ORF141.2对NF-κB转录活性的影响;通过Western bloting技术和间接免疫荧光试验检测了ORF141.2对NF-κB通路关键因子的影响及ORF141.2与Skp1的共定位情况;最后采用Co-IP技术验证了ORF141.2与Skp1是否互作。结果表明,锚蛋白ORF141.2可以抑制NF-κB的转录活性;锚蛋白ORF141.2不影响IKKα和IκBα的磷酸化,但阻止p-IκBα的降解和p65的入核;锚蛋白ORF141.2与Skp1共定位于细胞质中,存在互作关系。锚蛋白ORF141.2通过与Skp1互作调控p-IκBα的降解和p65的入核,从而调控NF-κB信号通路。 展开更多
关键词 山羊痘病毒 锚蛋白 orf141.2 NF-ΚB Skp1
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基于ORF2蛋白的山羊星状病毒抗体间接ELISA检测方法的建立与应用
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作者 于皓同 马永杰 +4 位作者 王凯茸 丁雨欣 张淑霞 张琪 许信刚 《动物医学进展》 北大核心 2025年第3期17-22,共6页
为了建立山羊星状病毒(Caprine astrovirus)的血清抗体检测方法,从经RT-PCR检测星状病毒阳性的腹泻羊粪便中克隆山羊星状病毒ORF2基因并构建表达载体,用原核表达技术制备重组ORF2蛋白,重组蛋白纯化复性后作为包被抗原,建立山羊星状病毒... 为了建立山羊星状病毒(Caprine astrovirus)的血清抗体检测方法,从经RT-PCR检测星状病毒阳性的腹泻羊粪便中克隆山羊星状病毒ORF2基因并构建表达载体,用原核表达技术制备重组ORF2蛋白,重组蛋白纯化复性后作为包被抗原,建立山羊星状病毒血清抗体间接ELISA检测方法,并对临床收集的山羊血清样本进行检测。结果显示,ORF2重组蛋白大小为42 ku,Western blot证明其具有良好的反应原性;ELISA检测方法最佳工作条件为6μg/mL抗原包被酶标板,一抗血清稀释倍数为1∶100,酶标二抗稀释倍数为1∶5000,阴阳临界值为0.327。用该方法对山羊流产衣原体、立克次体、山羊支原体山羊肺炎亚种及伪结核棒状杆菌的阳性血清进行检测,结果均为阴性;当阳性血清稀释至1024倍时检测结果仍为山羊星状病毒抗体阳性;批内、批间变异系数均小于10%。用该方法对陕西省部分羊场收集到的288份血清样本进行检测,山羊星状病毒抗体阳性率为59.03%。建立了一种检测山羊星状病毒抗体的间接ELISA检测方法,为山羊星状病毒感染的诊断和流行病学调查提供了技术支持。 展开更多
关键词 山羊星状病毒 orf2蛋白 原核表达 间接酶联免疫吸附试验
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C12orf65基因变异致联合氧化磷酸化缺陷症7型1例并文献复习
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作者 陈晓轶 朱永杰 +4 位作者 邓劼 马燕丽 索军芳 王媛 马远宁 《中国当代儿科杂志》 北大核心 2025年第2期205-211,共7页
目的探讨C12orf65基因变异相关联合氧化磷酸化缺陷症7型(combined oxidative phosphorylation deficiency type 7,COXPD7)的临床特征及基因变异特点,提高对该病的认识。方法以郑州大学附属儿童医院神经内科2021年诊断的1例COXPD7患儿及... 目的探讨C12orf65基因变异相关联合氧化磷酸化缺陷症7型(combined oxidative phosphorylation deficiency type 7,COXPD7)的临床特征及基因变异特点,提高对该病的认识。方法以郑州大学附属儿童医院神经内科2021年诊断的1例COXPD7患儿及文献报道的10例患者为研究对象,对其基因型和临床表型进行分析。结果共纳入11例COXPD7患者,均为C12orf65基因变异,9例为纯合变异,2例为复合杂合变异。起病年龄为生后1 d至2岁,临床均表现为视神经萎缩、智力运动发育落后,8例存在眼外肌麻痹,5例存在痉挛性瘫痪。头颅磁共振成像检查示11例均存在视神经萎缩,10例有脑干异常信号,3例脑干磁共振波谱分析成像可见乳酸峰。结论C12orf65基因相关的COXPD7为纯合或复合杂合变异所致,其主要临床表现为视神经萎缩和智力运动发育落后,部分患者存在痉挛性瘫痪、眼外肌麻痹,头颅影像学可见双侧基底节、脑干对称性异常信号,脑干磁共振波谱分析成像可见乳酸峰。 展开更多
关键词 联合氧化磷酸化缺陷症7型 LEIGH综合征 C12orf65基因 线粒体病 儿童
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LSDV-ORF143基因缺失重组病毒毒株的构建及其生物学特性分析
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作者 李家琪 柯群华 +6 位作者 黄伟涛 任善会 姚凯慎 李苗苗 马小琴 孙跃峰 殷相平 《病毒学报》 北大核心 2025年第4期1056-1066,共11页
牛结节性皮肤病病毒(Lumpy skin disease virus,LSDV)引起的牛结节性皮肤病(Lumpy skin disease,LSD)是一种牛全身性感染疫病,对养牛产业的健康发展造成了严重威胁。本研究旨在通过构建缺失ORF143基因重组LSDV毒株,并进行其生物学特性分... 牛结节性皮肤病病毒(Lumpy skin disease virus,LSDV)引起的牛结节性皮肤病(Lumpy skin disease,LSD)是一种牛全身性感染疫病,对养牛产业的健康发展造成了严重威胁。本研究旨在通过构建缺失ORF143基因重组LSDV毒株,并进行其生物学特性分析,为LSDV致弱毒株的筛选及弱毒疫苗研发提供候选毒株。首先,利用同源重组技术,构建pUC19T-LSDV-ΔORF143-EGFP转移载体,再将此转移载体转染至Vero细胞并感染LSDV,利用有限稀释与单细胞亚克隆方法筛选出纯合的以增强型绿色荧光蛋白(EGFP)为标识物的ORF143基因缺失重组LSDV(rLSDV-ΔORF143-EGFP)。对该重组病毒的生长曲线、滴度和遗传稳定性等进行分析。PCR扩增与重组病毒测序结果表明该rLSDV-ΔORF143-EGFP毒株已纯化成功,且至少20代内可稳定遗传;生长曲线结果表明该重组毒株增殖能力低于野生型LSDV毒株(LSDV-WT)。本研究成功构建并纯化出重组病毒rLSDV-ΔORF143-EGFP,为LSDV弱毒疫苗研究提供候选毒株,为LSD新型疫苗研究提供理论基础。 展开更多
关键词 牛结节性皮肤病病毒 orf143基因 重组病毒 生物学特性
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2019年~2023年我国PRRSV ORF5基因遗传变异和密码子使用偏好性分析
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作者 翁成桢 李鸿喜 +6 位作者 黄欣欣 章蓓雯 唐歆 曹翀 唐静晖 李晓冰 陈洪博 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第3期221-230,共10页
为了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行情况、遗传演化特征和密码子使用偏好性等,本研究从GenBank中下载2019年~2023年我国1194条PRRSV ORF5基因,采用MEGA6.0中的NJ法对上述ORF5基因和国内外26条PRRSV参考株ORF5基因构建进化... 为了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行情况、遗传演化特征和密码子使用偏好性等,本研究从GenBank中下载2019年~2023年我国1194条PRRSV ORF5基因,采用MEGA6.0中的NJ法对上述ORF5基因和国内外26条PRRSV参考株ORF5基因构建进化树鉴定PRRSV的基因型。通过MEGA6.0中K2P模型计算相同及不同基因型PRRSV ORF5(后仅称为ORF5基因)基因核苷酸和氨基酸序列的遗传距离。采用DnaSP v5软件分析不同基因型ORF5基因的平均差异位点数、核苷酸多态性、交换频率和基因间遗传变异等分析ORF5基因的迁移。采用RDP4和SimPlot分析不同基因型ORF5基因的重组事件。采用CodonW分析不同基因型ORF5基因编码区的碱基组成,评估该基因编码区密码子使用的偏好性及影响因素。基因型鉴定结果显示,2019年~2023年我国谱系L1 PRRSV占比最高为70.4%,谱系L5最少为3.3%,基因Ⅰ型中的1亚型为2.3%。遗传距离计算结果显示,我国流行的基因Ⅱ型谱系L1、L3内ORF5基因核苷酸和氨基酸序列的遗传距离均大于其他谱系与基因Ⅰ型,且不同基因型ORF5基因核苷酸和氨基酸序列的遗传距离均大于相同基因型。迁移分析结果显示,不同基因型间ORF5基因的遗传分化程度大,但交换及传递频率较低,其中谱系L1、L3 ORF5基因比其他谱系的遗传多样性更广泛,更易发生变异。重组分析结果显示,共检测到7个发生重组的ORF5基因,且均为谱系L1、L3和L8之间的重组。密码子使用偏好性结果显示,同义密码子第3位碱基A3s含量在不同基因型ORF5基因间均最低,C3s含量在不同基因型ORF5基因间均最高。谱系L5和L8 ORF5基因的GC含量均高于50%,谱系L1、L3和1亚型ORF5基因的GC含量均低于50%,相对同义密码子使用度RSCU分析结果显示,不同基因型ORF5基因高表达密码子第3位以G/C为主,低表达密码子第3位以A/U为主;密码子偏好性的影响因素分析结果显示,不同基因型ORF5基因编码区的有效密码子数ENC在58~61(ENC>40),且均在ENC曲线上。上述结果表明,表明不同基因型ORF5基因间同义密码子第3位碱基偏好于C,很少偏好于A,且ORF5基因密码子偏好于GC,其密码子偏好性仅受突变压力影响,且使用偏好性较低。本研究为我国的PRRSV的流行病学调查和PRRS的防控提供参考依据。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 orf5 基因重组 遗传多样性 密码子
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