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基于TCGA数据库和临床样本分析ONECUT1在胃癌中的表达及其临床预后意义
1
作者 陈玉琳 林树祥 《齐齐哈尔医学院学报》 2026年第5期410-415,共6页
目的探讨转录因子ONECUT1在胃癌组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法基于TCGA数据库分析ONECUT1在泛癌及胃腺癌中的表达及其与临床特征的相关性;收集2017年1月—2021年9月在本院行根治性切除术的312例胃癌患者石蜡组织标... 目的探讨转录因子ONECUT1在胃癌组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法基于TCGA数据库分析ONECUT1在泛癌及胃腺癌中的表达及其与临床特征的相关性;收集2017年1月—2021年9月在本院行根治性切除术的312例胃癌患者石蜡组织标本,采用免疫组化法检测ONECUT1蛋白表达,分析其与临床病理参数的关系;通过LASSO回归筛选变量并进行多因素Cox回归分析,评估ONECUT1对总生存期(OS)的独立预后价值。结果TCGA分析显示,ONECUT1在胃腺癌等多种肿瘤中表达上调,与晚期分期和淋巴结转移相关(P均<0.05)。临床样本验证表明,ONECUT1在胃癌组织中的阳性表达率(40.06%)高于癌旁组织(11.54%,P<0.05),且其表达与较高的病理分期和脉管癌栓存在关联(P均<0.05)。多因素Cox分析证实,ONECUT1高表达是OS的独立危险因素。ONECUT1阳性患者的5年生存率低于阴性患者(37.4%vs 64.2%,P<0.05)。结论ONECUT1在胃癌中呈高表达,与肿瘤进展和不良预后密切相关,有望成为潜在的预后生物标志物。 展开更多
关键词 胃癌 onecut1 TCGA数据库 预后 生物标志物
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地方鸡ONECUT1基因的序列变异分析
2
作者 朱丽莉 李冬光 +3 位作者 綦世金 陶宇航 韩雪 伍革民 《贵州农业科学》 CAS 2019年第11期80-83,共4页
为探明ONECUT1基因在贵州地方鸡品种中的作用,分析ONECUTl基因在5个地方鸡品种的序列差异性,设计4对引物,筛选多态位点,采用DNAMAN进行序列变异分析。结果表明:4个多态位点均位于内含子上,分别是16 369位(C→A),16 517位(C→T),16 587... 为探明ONECUT1基因在贵州地方鸡品种中的作用,分析ONECUTl基因在5个地方鸡品种的序列差异性,设计4对引物,筛选多态位点,采用DNAMAN进行序列变异分析。结果表明:4个多态位点均位于内含子上,分别是16 369位(C→A),16 517位(C→T),16 587位(C→G)和16 639位(C→T)。16 517位置仅长顺绿壳蛋鸡为碱基C,而瑶山鸡、赤水乌骨鸡、水西乌骨鸡和广西乌骨鸡在该位置为碱基T;瑶山鸡和赤水乌骨鸡在16 587位置和16 639位置检测出多态性,长顺绿壳蛋鸡、水西乌骨鸡和广西乌骨鸡则与数据库参照序列一致。 展开更多
关键词 地方鸡 onecut1基因 基因序列
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ONECUT1重组质粒构建及其对细胞应激相关基因表达的影响
3
作者 余绪明 余世荣 +2 位作者 张晓燕 石金敏 王佳 《山东医药》 CAS 2018年第5期32-34,共3页
目的构建ONECUT1重组质粒,并探讨其重组对细胞应激相关基因表达的影响。方法用重组DNA技术及RT-PCR法体外构建人源ONECUT1-pc DNA3.1(-)表达质粒,并测序。将培养好的U251细胞随机分为转染组、空载组,分别转染ONECUT1重组质粒及空载质粒... 目的构建ONECUT1重组质粒,并探讨其重组对细胞应激相关基因表达的影响。方法用重组DNA技术及RT-PCR法体外构建人源ONECUT1-pc DNA3.1(-)表达质粒,并测序。将培养好的U251细胞随机分为转染组、空载组,分别转染ONECUT1重组质粒及空载质粒。采用qRT-PCR法检测两组细胞内线粒体抗氧化应激相关基因(SOD1、CAT、GPX1、PRDX1、SIRT1、NQO1、Gc Lm、Gc Lc、NRF2、KEAP1、PARK7)及内质网应激相关基因(MANF、PERK、IRE1α、ATF6)的表达。结果电泳结果显示,在DNA Marker 1 000~1 500 bp出现单带,即为插入的全部CDS序列,1 398 bp,测序证实质粒构建成功。与空载组比较,转染组线粒体抗氧化应激相关基因CAT、PRDX1、SIRT1、NQO1、Gc Lm、Gc Lc、PARK7表达上调(P均<0.05),SOD1、GPX1、NRF2、KEAP1表达差异无统计学意义(P均>0.05)。与空载组比较,转染组内质网应激相关基因MANF、IRE1α、PERK、ATF6表达差异无统计学意义(P均>0.05)。结论成功构建ONECUT1重组质粒,ONECUT1可使细胞内部分抗氧化应激相关基因表达上调,但对内质网应激相关基因的表达无影响。 展开更多
关键词 同源域蛋白 onecut1基因 氧化应激 内质网应激
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光照对贵州黄鸡ONECUT 1基因在不同产蛋期各组织中表达的影响
4
作者 朱丽莉 杨波 +5 位作者 田维荣 李亮 李成军 李冬光 伍革民 张福平 《贵州农业科学》 CAS 2023年第11期49-54,共6页
【目的】分析光照对蛋鸡不同组织和不同产蛋时期ONECUT1基因的差异表达,探讨该基因对鸡产蛋性能的影响,为深入开展光照对鸡繁殖性能分子机理的研究奠定基础。【方法】选取贵州黄鸡体重相近的10周龄母鸡216只,在半舍饲养殖条件下(舍饲+... 【目的】分析光照对蛋鸡不同组织和不同产蛋时期ONECUT1基因的差异表达,探讨该基因对鸡产蛋性能的影响,为深入开展光照对鸡繁殖性能分子机理的研究奠定基础。【方法】选取贵州黄鸡体重相近的10周龄母鸡216只,在半舍饲养殖条件下(舍饲+运动场)随机分为自然光照组和早晚各增光1 h组,140日龄、200日龄、480日龄屠宰各4只,采集垂体、下丘脑、视网膜、输卵管和卵巢等组织,利用qRT-PCR技术检测ONECUT1基因的差异表达。【结果】ONECUT1基因在肌肉组织中表达量最高,输卵管、卵巢次之,肝脏最低。在垂体、下丘脑和卵巢组织中,ONECUT 1基因在产蛋高峰期(200日龄)的表达量显著高于开产日期(140日龄)和产蛋后期(480日龄)。垂体组织中200日龄的增光组显著高于自然光照组,输卵管中140日龄的自然光照组显著低于增光组。【结论】ONECUT1基因的表达具有时空特性,并受光照调节,与鸡产蛋性能有关。 展开更多
关键词 蛋鸡 贵州黄鸡 光照周期 onecut1基因 差异表达
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