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菊花CmOMT基因家族的鉴定及分析 被引量:2
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作者 杨丹 陈竹荫 +2 位作者 陈莎 王智民 朱晶晶 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第19期5166-5180,共15页
菊花富含羟基黄酮和甲氧基黄酮,由于甲氧基黄酮具有更好的生理活性和药理作用,因此菊花中甲氧基黄酮(OMFs)的生物合成途径解析具有重要的理论和经济价值。为了更好地促进菊花OMFs生物合成途径的解析,该研究基于菊花全基因组数据,采用生... 菊花富含羟基黄酮和甲氧基黄酮,由于甲氧基黄酮具有更好的生理活性和药理作用,因此菊花中甲氧基黄酮(OMFs)的生物合成途径解析具有重要的理论和经济价值。为了更好地促进菊花OMFs生物合成途径的解析,该研究基于菊花全基因组数据,采用生物信息学的方法对菊花CmOMT基因家族进行了系统分析。结果表明从菊花基因组数据库中共鉴定出123个CmOMT基因,编码112~541个氨基酸,等电点为4.92~7.59,相对分子质量为12651.69~61300.23,除CmOMT50外,其余122个蛋白均表现为酸性且其中79个蛋白为亲水蛋白。CmOMT基因主要分布在细胞质且定位分布并不均匀。KEGG分析共富集到7个通路,包括新陈代谢、苯丙素类生物合成、类异黄酮生物合成等;基因本体(GO)富集结果显示,123个CmOMT基因共注释到42个类别,分子功能主要包括O-甲基转移酶活性、S-腺苷甲硫氨酸依赖性甲基转移酶活性等,生物过程主要包括甲基化、类黄酮代谢过程等。通过启动子分析预测,菊花CmOMT家族能响应光、干旱、低温、茉莉酸甲酯、脱落酸等多种胁迫,并有参与类黄酮生物合成基因调控的MYB结合位点。通过对菊花CmOMT基因家族的分析,为菊花OMFs的生物合成途径解析和后续候选基因的挖掘及功能验证提供了参考。 展开更多
关键词 菊花 氧甲基转移酶(omt) 生物信息学 功能分析 基因家族 甲氧基黄酮
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莲NnOMT和NnNMT基因家族的鉴定与分析 被引量:1
2
作者 陈竹荫 俞越童 +2 位作者 郝晨阳 刘鸣茹 陈莎 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期152-160,共9页
目的:莲苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径的解析具有重要的理论和经济价值,为了更好地促进莲BIAs生物合成途径的解析,本研究对莲氧甲基转移酶(NnOMT)、莲氮甲基转移酶(NnNMT)基因家族进行鉴定和生物信息学分析。方法:在莲全基因组... 目的:莲苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径的解析具有重要的理论和经济价值,为了更好地促进莲BIAs生物合成途径的解析,本研究对莲氧甲基转移酶(NnOMT)、莲氮甲基转移酶(NnNMT)基因家族进行鉴定和生物信息学分析。方法:在莲全基因组的基础上,利用UniPort、美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对莲NnOMT、NnNMT基因家族进行鉴定,分析其理化性质及亚细胞定位。利用TBtools、MEME、MEGA 11.0、FigTree 1.4.4等工具对前期鉴定出的NnOMT、NnNMT基因的系统发育、序列特征、基因结构、功能注释、顺式作用元件等进行分析。结果:共鉴定出61个莲NnOMT、NnNMT基因,编码的氨基酸数目介于168~580 aa,等电点范围为4.76~9.16,相对分子质量为18699.52~64934.53 Da,大部分表现为酸性且多为亲水蛋白,含有10个保守基序;京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析共富集到12个通路,包括新陈代谢、异喹啉生物碱生物合成、苯丙烷的生物合成等;基因本体(GO)富集结果可视化显示,61个莲NnOMT、NnNMT基因共注释到32个类别,其中包括16项分子功能,如谷氨酸合成酶还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)活性、外肽酶活性,以及16项生物过程,如四氯化碳代谢过程、厌氧四氯化碳代谢过程、对外源生物刺激的反应。在莲NnOMT、NnNMT基因的启动子区存在多种顺式作用元件,主要为启动子和增强子区响应元件、光响应和茉莉酸甲酯响应元件。结论:该研究基于莲的基因组数据对61个莲NnOMT、NnNMT基因进行了全面的生物信息学分析,为莲NnOMT、NnNMT基因家族的基因结构和功能研究奠定了基础,并为莲BIAs的生物合成途径解析提供了参考。 展开更多
关键词 氧甲基转移酶(omt) 氮甲基转移酶(NMT) 生物信息学 功能分析 基因家族 异喹啉生物碱
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湖北白猪导入OMT/PGH基因的整合、表达和遗传 被引量:27
3
作者 魏庆信 樊俊华 +4 位作者 陈东宝 李绍章 胡宏宇 华文君 王翀 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1993年第6期606-611,共6页
以湖北白猪为实验材料,显微注射OMT/PGH基因(绵羊启动子和猪生长激素的融合基因)于1125枚1~4细胞期的早期胚胎核内,共产仔167头,产仔率14.8%。Dot(斑点杂交)和Southern blot(印迹转膜杂交)检测,29头阳性,阳性率17.9%。通过传代进行转... 以湖北白猪为实验材料,显微注射OMT/PGH基因(绵羊启动子和猪生长激素的融合基因)于1125枚1~4细胞期的早期胚胎核内,共产仔167头,产仔率14.8%。Dot(斑点杂交)和Southern blot(印迹转膜杂交)检测,29头阳性,阳性率17.9%。通过传代进行转基因的遗传分析。G_0×G_0的配种组合,产仔63头,其中阳性20头,阳性率31.7%;G_0×非转基因猪的组合,产仔66头,其中阳性10头,阳性率15.2%。对11头G_0猪血清用放射免疫法测定的结果,其生长激素的浓度相当于对照组的2.03~6.70倍。16头G_0猪180日龄的生长速度比同窝对照提高11.8%;11头G_1猪比同窝对照提高14.8%,饲料转化率提高10%,瘦肉率有提高的趋势。 展开更多
关键词 omt/PGH 基因 表达 遗传
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赤桉木质素合成途径OMT基因家族的原核表达与纯化研究 被引量:3
4
作者 谷振军 章怀云 +4 位作者 张党权 何含杰 陈丽莉 彭宽 陈容 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期24-27,60,共5页
双子叶植物的木质素主要由愈创木基单体和紫丁香基木质素单体聚合形成,这两种单体的比例对造纸过程中木质素去除难易程度具有重要的影响。植物OMT基因家族的CCoAOMT和COMT基因是木质素合成途径的关键酶基因,可调控植物体内木质素单体的... 双子叶植物的木质素主要由愈创木基单体和紫丁香基木质素单体聚合形成,这两种单体的比例对造纸过程中木质素去除难易程度具有重要的影响。植物OMT基因家族的CCoAOMT和COMT基因是木质素合成途径的关键酶基因,可调控植物体内木质素单体的比例与含量。本文以所克隆的赤桉COMT、CCoAOMT1、CCoAOMT2三个基因的cDNA为模板,分别构建pET-32a的原核表达质粒,并优化在大肠杆菌BL21(λDE3)中的表达体系。结果显示,在加入0.4 mmol IPTG诱导表达后,COMT、CCoAOMT1、CCoAOMT2的原核表达质粒分别在4 h、2 h和3 h后达到可溶性重组蛋白表达峰值。通过渗透休克纯化方法,可在原核表达菌株的周质空间提纯CCoAOMT1和CCoAOMT2重组蛋白,在原核表达菌株的细胞质中可提纯COMT重组蛋白。 展开更多
关键词 赤桉 木质素合成 omt基因家族 原核表达
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OMT对高交感活性诱导大鼠心室肥厚的保护作用 被引量:2
5
作者 王恒 吉杨丹 +4 位作者 唐慧敏 覃建锋 梁子聪 胡先运 孟铁宏 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2022年第13期3240-3243,共4页
目的研究氧化苦参碱(OMT)对高交感活性诱导大鼠实验性心室肥厚的改善作用。方法SD大鼠随机分为对照组、模型组、OMT高、低剂量组、普萘洛尔组,各组于造模前1 w开始灌胃给药,除对照组外,其余各组均连续腹腔注射去甲肾上腺素(NE)15 d复制... 目的研究氧化苦参碱(OMT)对高交感活性诱导大鼠实验性心室肥厚的改善作用。方法SD大鼠随机分为对照组、模型组、OMT高、低剂量组、普萘洛尔组,各组于造模前1 w开始灌胃给药,除对照组外,其余各组均连续腹腔注射去甲肾上腺素(NE)15 d复制实验性心肌损伤模型,造模结束后检测大鼠血压指标、取材检测心室重构参数及羟脯胺酸含量,qRT-PCR法检测Notch-1信号变化。结果OMT能够改善大鼠血压变化,降低心室重构参数及羟脯胺酸含量,改善Notch-1信号变化。结论OMT对高交感活性诱导的实验性心肌肥厚有显著的改善作用,可能与降低Notch-1信号的mRNA表达有关。 展开更多
关键词 omt 高交感活性 心肌肥厚 Notch-1信号
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OMT在企业物流分析中的应用 被引量:2
6
作者 赵曦滨 王卫东 邢桂芬 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2000年第3期165-168,共4页
文章介绍了面向对象的模型化技术(OMT)的基本概念,分析了它的实现过程,即对象模型、动态模型、和过程模型的建立,并以一个具体的实例说明其在企业物流分析中的应用。
关键词 管理信息系统 面向对象 omt 物流分析 企业
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基于OMT技术的简历收集与就业跟踪系统设计与实现 被引量:2
7
作者 石彦芳 石建国 周檬 《煤炭技术》 CAS 北大核心 2010年第3期235-237,共3页
基于OMT对象建模技术的系统构建过程更直观、开发人员易沟通,各开发阶段使用统一的概念模型,减少了相互转换带来的错误和冗余。本研究提出了基于OMT对象建模技术构建一个软件系统,用ASP.NET实现了模型的全部功能,并对其中的关键技术进... 基于OMT对象建模技术的系统构建过程更直观、开发人员易沟通,各开发阶段使用统一的概念模型,减少了相互转换带来的错误和冗余。本研究提出了基于OMT对象建模技术构建一个软件系统,用ASP.NET实现了模型的全部功能,并对其中的关键技术进行了讨论,通过实证分析,证实了本次研究的可行性。 展开更多
关键词 omt 建模技术 简历收集 就业跟踪
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茶树CCoAOMT基因克隆及启动子的结构分析 被引量:2
8
作者 林海燕 罗勇 +5 位作者 陈丝 禹双双 曾泽媛 刘仲华 王坤波 黄建安 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1804-1813,共10页
茶树咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)是甲基化EGCG生物合成的一种重要酶,为探明CCoAOMT基因的表达调控规律,进一步解析甲基化EGCG生物合成的调控机制。本研究采用同源克隆法获得了茶树CCoAOMT的cDNA全长序列,采用染色体步移技术(Geno... 茶树咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)是甲基化EGCG生物合成的一种重要酶,为探明CCoAOMT基因的表达调控规律,进一步解析甲基化EGCG生物合成的调控机制。本研究采用同源克隆法获得了茶树CCoAOMT的cDNA全长序列,采用染色体步移技术(Genome walking)获得了该基因的启动子序列,并对其序列进行了生物信息学分析。结果表明,CCo AOMT全长cDNA为1 000 bp,其中开放阅读框长735 bp,编码245个氨基酸,含有caffeoyl-CoA O-methyltransferase和SAM功能结构域;进一步分离得到CCoAOMT基因上游调控序列1 624 bp,发现其含启动子核心元件TATA-box、CAAT-box及5'UTR Py-rich stretch (高水平转录顺式作用元件)、MYB (干旱诱导时的MYB结合位点)、G-box、GAG-motif、GATA-motif、GT1-motif、Sp1 (光响应元件)、CGTCA-motif、TGACG-motif (茉莉酸甲酯响应元件)等重要顺式作用元件。由结果推测,CCoAOMT基因在转录水平受各类转录因子的调控,该结论为进一步研究CCoAOMT基因的转录调控机制提供了理论指导。 展开更多
关键词 茶树 CCOAomt 基因克隆 启动子
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OMT/PGH基因导入湖北白猪后的整合与表达 被引量:4
9
作者 魏庆信 樊俊华 +2 位作者 李绍章 刘静平 胡宏宇 《湖北农业科学》 1992年第1期29-32,共4页
以湖北白猪为实验材料,采用显微注射和猪精子做载体两种方法导入OMT/PGH基因,共产仔161头。取仔猪耳、尾组织,用斑点杂交和Southern杂文检测,判定25头整合。显微注射法的转基因效率为2.96%,精子载体法的转基因效率为4%。用放射免疫法... 以湖北白猪为实验材料,采用显微注射和猪精子做载体两种方法导入OMT/PGH基因,共产仔161头。取仔猪耳、尾组织,用斑点杂交和Southern杂文检测,判定25头整合。显微注射法的转基因效率为2.96%,精子载体法的转基因效率为4%。用放射免疫法测定外周血清,在非诱导状态下,有11头转基因猪生长激素的浓度为对照组的2.03~6.7倍,其2~5月龄的生长速度平均提高15.23%。当饲料中Zn离子的含量达到1670ppm时,转基因猪的生长速度显著加快。 展开更多
关键词 湖北白猪 繁殖 omt/PGH基因
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面向对象的OMT建模技术的应用 被引量:1
10
作者 李鸣 徐宏哲 +1 位作者 陈文萍 黄涛 《西北大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第6期507-509,共3页
通过一个生产质量监造系统具体地介绍了面向对象的建模过程,即如何对一个实际系统进行分析,建立对象模型、动态模型及功能模型,然后优化设计。
关键词 建模 对象模型 动态模型 功能模型 面向对象 omt
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C波段宽带OMT设计分析 被引量:5
11
作者 王垒 杨国栋 +1 位作者 耿丹阳 张志华 《无线电工程》 2011年第8期38-40,共3页
随着天线技术的发展,对信道带宽提出了更高的要求。为了扩大网络带宽,论述了一种C波段宽频带正交模转换器(OMT),介绍并分析其工作原理。与普通正交模变换器相比,这种宽OMT采用了新型的连接结构,不仅展宽了频带,同时能得到优良的隔离特... 随着天线技术的发展,对信道带宽提出了更高的要求。为了扩大网络带宽,论述了一种C波段宽频带正交模转换器(OMT),介绍并分析其工作原理。与普通正交模变换器相比,这种宽OMT采用了新型的连接结构,不仅展宽了频带,同时能得到优良的隔离特性与驻波特性。应用HFSS对这种新结构OMT进行仿真计算,能得到理想的结果,在43%的工作带宽内表现出良好的特性。以此为参考制造了实物,对其进行实际测试,符合仿真的结果。 展开更多
关键词 omt 正交连接器 C波段 宽频带
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OMT方法在信息系统分析中的应用研究 被引量:3
12
作者 杨怡光 杨连嘉 +1 位作者 王湛 王玲 《计算机与数字工程》 2001年第4期23-28,共6页
本文简单介绍了OMT方法学的建模方法,并应用这种技术解决了某企业人力资源管理信息系统中的工资奖金管理子系统建模与设计问题,通过所建立的模型在实际项目中成功地实现,充分体现了OMT方法的实用性、灵活性和完整性。
关键词 omt 函数模型 面向对象 人力资源 管理信息系统 企业
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文献数据库系统开发新思路——面向对象建模技术(OMT) 被引量:4
13
作者 徐彬荣 《情报杂志》 CSSCI 北大核心 2003年第2期2-4,共3页
OMT不仅仅是一种编程技术 ,而是一种通过模型来思考问题的方法 ,这些模型都是围绕着真实世界的概念建立的。OMT方法提供了一组面向对象的概念及图形符号 ,然后利用这些概念及符号来分析需求、设计系统、实现目标 ,它适应于整个软件的开... OMT不仅仅是一种编程技术 ,而是一种通过模型来思考问题的方法 ,这些模型都是围绕着真实世界的概念建立的。OMT方法提供了一组面向对象的概念及图形符号 ,然后利用这些概念及符号来分析需求、设计系统、实现目标 ,它适应于整个软件的开发过程。 展开更多
关键词 面向对象建模技术 omt 软件开发 数据库 建模技术
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基于OMT的师资培训管理系统分析 被引量:3
14
作者 王又军 《企业技术开发》 2008年第11期57-59,共3页
文章以职成教师资培训管理系统课题为背景,通过对系统功能的分析,给出了其基于OMT技术的概念模型,并描述了教学任务分配表和课程表生成两个过程的交互图。
关键词 师资培训 概念模型 omt
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基于OMT的从模糊E-R图到面向对象模糊数据模型的转换算法研究
15
作者 赵波 陶跃华 王泳 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2003年第15期74-76,118,共4页
论文将模糊数学与面向对象建模技术(OMT)相结合,提出了针对问题领域中模糊信息的模糊对象图建模方式。并通过模糊对象图实现了模糊E-R图到面向对象模糊数据模型的转换。
关键词 omt 模糊对象 E-R图 模糊数据模型
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茶树甲基化EGCG生物合成相关OMTs基因的鉴定及表达
16
作者 罗勇 温贝贝 +4 位作者 陈燕 曹桂萍 雷淑敏 李群 王坤波 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期26-33,共8页
茶树O-甲基转移酶(OMT)可催化甲基化EGCG的生物合成.为进一步获得甲基化EGCG生物合成的关键OMT基因,以不同甲基化EGCG含量的茶树品种金观音(JGY)、金牡丹(JMD)和福鼎大白(FD)为试验材料,基于茶树基因组和转录组数据,通过生物信息学方法... 茶树O-甲基转移酶(OMT)可催化甲基化EGCG的生物合成.为进一步获得甲基化EGCG生物合成的关键OMT基因,以不同甲基化EGCG含量的茶树品种金观音(JGY)、金牡丹(JMD)和福鼎大白(FD)为试验材料,基于茶树基因组和转录组数据,通过生物信息学方法,对筛选获得的OMTs基因进行染色体定位、基因结构特征、编码蛋白特性和系统进化关系分析,同时采用实时荧光定量PCR验证茶树OMTs在不同茶树品种的相对表达水平.结果显示,共鉴定出5个在金观音与福鼎大白以及金牡丹与福鼎大白比较组合中显著上调表达的OMT基因,其编码序列(CDS)全长和编码氨基酸的数目分别在528-1122 bp和175-373 aa之间,命名为CsOMT1-CsOMT5.系统发育树分析显示,茶树OMT蛋白分别与已知的咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶、咖啡酸O-甲基转移酶、黄腐酚4-O-甲基转移酶和类黄酮3′,5′-甲基转移酶等具有较近的亲缘关系.基因结构分析结果显示,结构相似的OMTs成员多聚在同一个分支,这些结果与系统发育分析的结果一致.转录组结果表明,5个OMTs基因在富含甲基化EGCG的金观音和金牡丹中具有较高转录水平;实时荧光定量PCR表达分析显示,除OMT2之外,其余4个OMTs基因在3个茶树品种的相对表达水平差异显著,总体表现为在福鼎大白中表达量较低,而在金观音和金牡丹中相对表达水平显著上升.上述研究表明鉴定获得的CsOMT1、CsOMT3、CsOMT4和CsOMT5可能参与甲基化EGCG的生物合成,结果可为茶树甲基化EGCG生物合成的调控机制研究奠定理论基础. 展开更多
关键词 茶树 甲基化EGCG omt基因 转录组 定量表达
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OMT方法在采购供应管理信息系统中的应用
17
作者 李向东 范玉青 +2 位作者 王运巧 于勇 刘志存 《制造业自动化》 2003年第11期21-24,共4页
简要介绍运用对象模型方法对采购管理信息系统进行分析、建模的对象化映射实现。利用面向对象技术,可以避免过去面向功能思想在分析系统时的各种缺点,使系统结构更加合理,方便开发维护。结合企业采购业务实例,分析论述了3种模型的建立。
关键词 企业 物资采购 管理信息系统 omt方法 对象模型方法 面向对象 链接 关联
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基于OMT理论的创新型企业市场机会分析
18
作者 迟英庆 冷蓓蓓 陈霞 《商业经济研究》 北大核心 2015年第24期117-118,共2页
以创新为主导的市场环境中,市场机会分析是企业赢得市场和提升竞争力的有力武器,然而目前创新型企业的市场机会分析缺乏有效的理论指导。本文提出OMT理论模型,为创新型企业分析、识别、利用市场机会提供有效方法,同时以技术和知识创新... 以创新为主导的市场环境中,市场机会分析是企业赢得市场和提升竞争力的有力武器,然而目前创新型企业的市场机会分析缺乏有效的理论指导。本文提出OMT理论模型,为创新型企业分析、识别、利用市场机会提供有效方法,同时以技术和知识创新为主导的小米公司进行实证研究,探讨该模型具体应用情况。 展开更多
关键词 omt理论 创新型企业 市场机会
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面向对象方法OOSA,OOA,OMT的比较研究 被引量:1
19
作者 雷战波 许倩钰 《电脑技术信息》 1999年第8期32-34,共3页
本文进一步概括了面向对象的思想实质。接着从基本术语,开发过程及其文档、建模角度、应用特性等方面对三大流行方法OOSA、OOA、OMT进行分析比较,又归纳和总结了六种主要的面向对象方法的特点。
关键词 面向对象 OOSA OOA omt omt 软件开发
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基于OMT的快速原型法及其在决策支持系统开发中的应用
20
作者 孙龙清 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期72-76,共5页
结合决策支持系统——最低限制价格计算系统 PRCSYS0 1的研究和开发过程 ,探讨了以 OMT(Ob-ject Modeling Technique)方法作指导 ,将系统界面的开发与系统内部功能的开发分离 ,快速开发用户驱动需求分析原型系统的方法。
关键词 决策支持系统 面向对象 omt 原型系统 快速原型法
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