OC-116基因第1外显子多态性对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响 被引量：4

1

作者 吴磊 谭光辉 +3 位作者 李杰章 覃媛钰 张依裕 田琴 《河南农业科学》 北大核心 2020年第5期143-148,共6页

为探讨OC-116基因第1外显子多态性对鸡蛋壳品质的影响,试验以长顺绿壳蛋鸡为材料,采用PCR产物直接测序法对OC-116基因第1外显子区域进行单核苷酸多态性(SNP)筛查,利用一般线性模型分析多态位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的遗传效应。结果显... 为探讨OC-116基因第1外显子多态性对鸡蛋壳品质的影响,试验以长顺绿壳蛋鸡为材料,采用PCR产物直接测序法对OC-116基因第1外显子区域进行单核苷酸多态性(SNP)筛查,利用一般线性模型分析多态位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的遗传效应。结果显示,在OC-116基因第1外显子共检测到2个中度多态且完全连锁的SNP位点,分别为g.45667632 T>C和g.45667671 G>A,均产生3种基因型。通过卡方(χ2)检验发现,2个SNPs基因型分布均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),共存在2种单倍型和3种双倍型。基因型CC、AA和双倍型H2H2在蛋质量上显著高于基因型TT、GG和双倍型H1H1(P<0.05),基因型TT、GG和双倍型H1H1在蛋形指数上显著高于基因型CT、AG和双倍型H1H2(P<0.05),基因型CT、AG和双倍型H1H2在蛋壳强度上显著高于基因型TT、GG和双倍型H1H1(P<0.05)。综上,基因型CC、AA和双倍型H2H2是改善蛋壳品质的有利基因型和双倍型,揭示g.45667632 T>C位点和g.45667671 G>A位点可作为蛋壳性状选择的标记性位点。 展开更多

关键词 长顺绿壳蛋鸡 oc-116基因 外显子 蛋壳品质 SNP

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鸡蛋壳Ovocleidin-116(OC-116)研究进展 被引量：11

2

作者 杨凌霄 刘长国 《中国家禽》 北大核心 2015年第22期38-40,共3页

Ovoeleidin—116（OC-116）是一种与生物钙化紧密关联的古老蛋白质，也是鸡蛋壳钙化层、表面有机层的主要构成组分。在蛋壳钙化层中存在两种OC～116形式：发生糖胺聚糖修饰的蛋白多糖（180～200ku）和不携带糖胺聚糖的糖蛋白（116～120k... Ovoeleidin—116（OC-116）是一种与生物钙化紧密关联的古老蛋白质，也是鸡蛋壳钙化层、表面有机层的主要构成组分。在蛋壳钙化层中存在两种OC～116形式：发生糖胺聚糖修饰的蛋白多糖（180～200ku）和不携带糖胺聚糖的糖蛋白（116～120ku）。单核苷酸多态（SNP）研究表明，OC—116与鸡蛋的蛋形指数、蛋壳厚度以及蛋壳强度密切相关。体内及体外研究表明，OC-116能够调控方解石晶体的生长与形态，从而对蛋壳的形成、质地以及强度有重要影响。另外，OC-116能够显著影响蛋壳表面有机层的沉积，可能是鸡蛋防御微生物侵染的关键因素。总之，OC-116是鸡蛋壳中一个重要的基质组分。 展开更多

关键词 Ovocleidin-116(oc-116) 鸡蛋壳 生物钙化 微生物侵染

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蛋鸡OC-116基因的克隆和序列分析 被引量：1

3

作者 王淑红 王利 刘长国 《家禽科学》 2014年第3期9-13,共5页

参考原鸡(G.gallus)OC-116编码基因序列(登录号:NM_204569.1)设计3对引物,特异性地从仙居鸡子宫组织中克隆OC-116编码基因的N端、中段和C端,测序鉴定后通过酶切连接获得家鸡OC-116的全长编码基因。根据本研究的测序结果,初步发现突变概... 参考原鸡(G.gallus)OC-116编码基因序列(登录号:NM_204569.1)设计3对引物,特异性地从仙居鸡子宫组织中克隆OC-116编码基因的N端、中段和C端,测序鉴定后通过酶切连接获得家鸡OC-116的全长编码基因。根据本研究的测序结果,初步发现突变概率较高的碱基有:第1233位(A→G)、1336位(C→G)、1358位(T→G)、1391位(T→G)、1491位(T→G)、1754位(G→T)、1841位(T→C)、1843位(C→T)、1983位(C→T)和2057位(T→C);其中第1358,1754,1841,1983和2057位的碱基突变均为同义突变,第1233、1336、1391、1491和1843位是错义突变。而且突变碱基主要属于T:G颠换类型,其次是T:C转换类型。另外根据同源性分析,家鸡的OC-116编码基因在进化过程中很保守。总之,本研究已经从仙居鸡子宫组织中克隆到OC-116编码基因,为进一步研究该基因的功能奠定基础。 展开更多

关键词 oc-116编码基因 克隆 序列分析 突变位点

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山麻鸭OC-116基因克隆、生物信息学及组织表达谱分析 被引量：1

4

作者 张迎燕 刘亚楠 +4 位作者 郑定黔 田若宁 徐丽 李昂 吴旭 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2022年第4期131-135,共5页

实验旨在探究OC-116(Ovocleidin-116)基因在山麻鸭蛋壳形成过程中的作用,应用SMART-RACE技术克隆获得了长度为2129 bp的山麻鸭OC-116基因cDNA全长序列,运用生物信息学软件对该基因和蛋白的特征进行分析,结果显示:该基因编码蛋白的分子式... 实验旨在探究OC-116(Ovocleidin-116)基因在山麻鸭蛋壳形成过程中的作用,应用SMART-RACE技术克隆获得了长度为2129 bp的山麻鸭OC-116基因cDNA全长序列,运用生物信息学软件对该基因和蛋白的特征进行分析,结果显示:该基因编码蛋白的分子式为C2710H4331N865O927S12,属于不稳定蛋白,其编码的蛋白中甘氨酸(16.5%)、丙氨酸(11%)、丝氨酸(10.2%)含量较高。蛋白的二级结构中,α螺旋(Hh)占比0.47%、β折叠(Ee)占比17.64%、无规卷曲(Cc)占比81.89%,且包含肽信号,不含跨膜结构;系统进化树显示山麻鸭与绿头鸭、黑天鹅和棕硬尾鸭的亲缘关系最近;在mRNA的水平上,OC-116基因在山麻鸭14种组织中均有不同程度的表达,其中在垂体、子宫部和峡部中的表达量极显著高于其他组织。子宫部和峡部分别是蛋壳矿化形成和蛋壳膜形成部位,表明OC-116基因在山麻鸭蛋壳的形成过程中扮演着重要的角色。 展开更多

关键词 山麻鸭 oc-116基因 基因克隆 生物信息学 组织表达谱

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OC-116基因表达载体构建及其对鸡子宫上皮细胞Ca^(2+)浓度和脂质指标的影响 被引量：1

5

作者 廖朝美 吴磊 +3 位作者 游敏芳 谭光辉 李杰章 张依裕 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第8期160-164,共5页

本研究旨在探究OC-116基因过表达对长顺绿壳蛋鸡子宫上皮细胞Ca^(2+)浓度和脂质指标的影响。构建pcDNA3.1(+)+OC-116+Flag表达载体并转染至分离培养的鸡子宫上皮细胞中,通过Flag标签检测试剂盒检测OC-116基因的过表达量,用Fluo-3/AM钙... 本研究旨在探究OC-116基因过表达对长顺绿壳蛋鸡子宫上皮细胞Ca^(2+)浓度和脂质指标的影响。构建pcDNA3.1(+)+OC-116+Flag表达载体并转染至分离培养的鸡子宫上皮细胞中,通过Flag标签检测试剂盒检测OC-116基因的过表达量,用Fluo-3/AM钙离子荧光标记法检测Ca^(2+)浓度,用脂质指标试剂盒检测细胞内的脂质含量。结果显示:OC-116基因过表达量与Ca^(2+)呈显著正相关,与高密度脂蛋白胆固醇(HDL)呈极显著正相关,与总胆固醇(TCHO)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL)呈显著负相关;Ca^(2+)与HDL呈极显著正相关,LDL与HDL呈极显著负相关。本研究结果揭示了OC-116基因能调控鸡子宫上皮细胞的Ca^(2+)浓度和脂质的代谢,为深入阐释鸡子宫上皮细胞中钙和脂质的分泌路径提供理论基础。 展开更多

关键词 oc-116基因 载体构建 长顺绿壳蛋鸡 子宫上皮细胞 CA^(2+) 脂质指标

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FBXW7基因点突变对结直肠癌HCT-116细胞的增殖、迁移、侵袭和抗凋亡能力的影响 被引量：3

6

作者 张百川 程勇 +2 位作者 王祥峰 唐康 王五艺 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期263-269,共7页

目的:探讨FBXW7基因点突变对结直肠癌细胞株HCT-116增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响。方法:通过构建FBXW7基因野生型及突变型过表达的重组载体,并将其转染HCT-116细胞,应用Western blotting检测转染后FBXW7蛋白表达情况。CCK-8检测细胞增... 目的:探讨FBXW7基因点突变对结直肠癌细胞株HCT-116增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响。方法:通过构建FBXW7基因野生型及突变型过表达的重组载体,并将其转染HCT-116细胞,应用Western blotting检测转染后FBXW7蛋白表达情况。CCK-8检测细胞增殖能力,平板细胞克隆形成实验(HTCA)检测肿瘤细胞克隆形成能力,流式细胞术检测细胞凋亡情况,划痕及Transwell细胞迁移实验检测细胞迁移和侵袭能力。结果:转染野生型FBXW7基因的HCT-116细胞中FBXW7蛋白表达水平高于对照组(转染突变型FBXW7基因的HCT-116细胞)、阴性对照组(转染空质粒载体p EZ-M90的HCT-116细胞)及空白对照组(未进行任何特殊处理的HCT-116细胞)(均P<0.05)。转染野生型FBXW7的HCT-116细胞的增殖、克隆形成、迁移和侵袭能力相较于其余各组均显著下降(均P<0.05),且细胞凋亡率显著升高(P<0.05)。结论:FBXW7基因点突变可使其蛋白表达水平降低,从而促进结直肠癌HCT-116细胞的增殖、迁移和侵袭,并抑制其凋亡。 展开更多

关键词 FBXW7基因 基因突变 结直肠癌 HCT-116细胞 泛素蛋白酶体系统

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羊口疮病毒安徽株116基因的生物信息学分析及原核表达 被引量：1

7

作者 王勇 张学琪 +4 位作者 白彩霞 刘自敏 胡凯 胡子慧 孙裴 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2020年第6期894-900,共7页

为了对羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)安徽株116基因进行生物信息学分析及原核表达。以ORFVAH-F10株为模板PCR扩增116基因,使用生物信息学软件预测该基因编码蛋白的结构与功能。同时将扩增产物克隆至pET-32a(+)原核表达载体,经BamH I及Eco... 为了对羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)安徽株116基因进行生物信息学分析及原核表达。以ORFVAH-F10株为模板PCR扩增116基因,使用生物信息学软件预测该基因编码蛋白的结构与功能。同时将扩增产物克隆至pET-32a(+)原核表达载体,经BamH I及EcoR I双酶切鉴定后进行测序,构建pET-32a(+)-116重组质粒。转化至大肠杆菌Rosetta(DE3)进行IPTG诱导,纯化蛋白后免疫BALB/c雌性小鼠制备多克隆抗体。测序结果显示,ORFV116基因全长561 bp,编码186个氨基酸。生物信息学分析结果显示:该蛋白分子量约为20.33 kDa,为不稳定亲水性蛋白;无信号肽、保守结构域及跨膜结构域;含有2个N糖基化位点和42个磷酸化位点;二级结构以无规则卷曲为主,分别为延伸链(5.91%)、α-螺旋(14.52%)与无规则卷曲(79.57%);预测该蛋白含有20个可能的B细胞优势抗原表位与4个CTL细胞表位。SDS-PAGE及Western-blot结果显示,ORFV116蛋白大小约为51 kDa,主要以可溶形式表达且具有良好的反应原性。 展开更多

关键词 羊口疮病毒 116基因 生物信息学分析 原核表达

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1例新的β地中海贫血稀有突变IVS-Ⅰ-116(T→G) 被引量：2

8

作者 宋春林 范菊花 郭晓玲 《中国当代医药》 2010年第2期106-107,共2页

目的:报道1例稀有β地中海贫血(β地贫)基因突变IVS-Ⅰ-116(T→G)。方法:根据血常规指数和血红蛋白电泳对婚检和产检患者筛查地中海贫血,对可疑β地中海贫血患者采用基因扩增反向点杂交法检测常见17个位点突变。对于未发现常见突变者采... 目的:报道1例稀有β地中海贫血(β地贫)基因突变IVS-Ⅰ-116(T→G)。方法:根据血常规指数和血红蛋白电泳对婚检和产检患者筛查地中海贫血,对可疑β地中海贫血患者采用基因扩增反向点杂交法检测常见17个位点突变。对于未发现常见突变者采用基因测序。结果:患者携带一种中国人少见的β地中海贫血基因突变IVS-Ⅰ-116(T→G)。结论:β地中海贫血基因IVS-Ⅰ-116(T→G)突变的报道丰富了中国人β地中海贫血突变谱,对于指导婚检、产检、遗传咨询具有重要价值。 展开更多

关键词 地中海贫血 基因突变 β球蛋白 IVS-Ⅰ-116

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奥沙利铂联合NK4基因对大肠癌HCT116细胞凋亡的影响 被引量：1

9

作者 祖丹丹 李美宁 +3 位作者 张悦红 张栋 弓韬 常冰梅 《中国医药指南》 2013年第28期317-318,321,共3页

目的观察奥沙利铂联合NK4基因对HCT116细胞增殖、凋亡的影响。方法使用Effectene转染试剂,将pcDNA3.1-NK4质粒转染至大肠癌HCT116细胞中,常规条件下培养24h。不同奥沙利铂药物浓度处理HCT116细胞,CCK-8法测定细胞的OD值,分析在不同奥沙... 目的观察奥沙利铂联合NK4基因对HCT116细胞增殖、凋亡的影响。方法使用Effectene转染试剂,将pcDNA3.1-NK4质粒转染至大肠癌HCT116细胞中,常规条件下培养24h。不同奥沙利铂药物浓度处理HCT116细胞,CCK-8法测定细胞的OD值,分析在不同奥沙利铂药物浓度下对HCT116细胞毒性的影响;检测奥沙利铂最低药物浓度联合NK4基因对HCT116细胞凋亡的影响。结果当奥沙利铂药物浓度为12.5μg/mL时,显著抑制细胞的增殖;奥沙利铂(12.5μg/mL)联合NK4基因处理组与奥沙利铂处理组比较,显著诱导HCT116细胞的凋亡,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论与奥沙利铂组相比,奥沙利铂联合NK4基因后HCT116细胞的凋亡率显著升高。 展开更多

关键词 奥沙利铂 NK4基因 HCT116细胞 凋亡

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长顺绿壳蛋鸡OC–116基因变异对蛋壳品质的影响

10

作者 吴磊 覃媛钰 +2 位作者 谭光辉 李杰章 张依裕 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期636-640,共5页

以长顺绿壳蛋鸡为试验对象,采用PCR产物直接测序法,对OC-116基因g.45670562—g.45670994和g.45669431—g.45670163区域进行单核苷酸多态性筛查;运用一般线性模型,分析多态位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的遗传效应。结果显示:OC-116基因存... 以长顺绿壳蛋鸡为试验对象,采用PCR产物直接测序法,对OC-116基因g.45670562—g.45670994和g.45669431—g.45670163区域进行单核苷酸多态性筛查;运用一般线性模型,分析多态位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的遗传效应。结果显示:OC-116基因存在4个SNP位点,分别为位于第2外显子上的g.45668081 G>T、第3外显子上的g.45669143 T>C、第3内含子上的g.45669061 A>G和g.45669101 T>A,g.45668081 G>T和g.45669143 T>C为同义突变,4个SNP位点均表现为中度多态;卡方(χ2)检验表明,4个SNP位点的基因型分布均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);关联性分析结果表明,g.45669061 A>G位点的AA和AG基因型的蛋壳厚度显著高于GG基因型的(P<0.05),g.45669143 T>C位点的TT和CT基因型的蛋壳强度和蛋壳厚度显著高于CC基因型的(P<0.05),揭示g.45669061 A>G和g.45669143 T>C位点可作为蛋壳性状选择的标记性位点。 展开更多

关键词 长顺绿壳蛋鸡 oc-116基因 单核苷酸多态性 蛋壳品质

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SOX4靶向miR-17对结肠癌细胞HCT-116生物学行为的影响

11

作者 张纲 刘楠 +4 位作者 王国强 王伟 武雪亮 郑海平 张玉国 《诊断病理学杂志》 2024年第11期1072-1078,共7页

目的探讨性别决定区Y框蛋白4(SOX4)及miR-17在结直肠癌中的表达及对HCT-116细胞生物学行为的作用。方法收集2020年3月至2022年1月在河北北方学院一附院和张家口市第一医院的27例结直肠癌患者组织标本并检测SOX4及miR-17的表达水平,并分... 目的探讨性别决定区Y框蛋白4(SOX4)及miR-17在结直肠癌中的表达及对HCT-116细胞生物学行为的作用。方法收集2020年3月至2022年1月在河北北方学院一附院和张家口市第一医院的27例结直肠癌患者组织标本并检测SOX4及miR-17的表达水平,并分析与临床病理特征的关系。利用慢病毒转染技术干预HCT-116细胞的SOX4及miR-17表达。检测各组细胞中SOX4和miR-17的表达及细胞增殖、侵袭、迁移能力、细胞活性变化和相关蛋白表达。结果与正常组织比较,结直肠癌组织中SOX4表达水平升高。SOX4及miR-17在结直肠癌组织中的表达呈正相关(r=0.724,P<0.001),SOX4和miR-17的表达和病理分期、淋巴结转移、肝转移情况相关,差异有统计学意义(P<0.05),而与肿瘤的大小、分化程度无相关(P>0.05)。SOX4模拟组细胞增殖能力、迁移能力及细胞活性显著高于对照组及SOX4抑制剂组(P<0.05)。SOX4抑制剂组与对照组相比迁移及增殖相关蛋白表达差异有统计学意义(P<0.05)。结论SOX4在结直肠癌组织中表达上调,SOX4的表达可促进结肠癌细胞增殖、迁移和侵袭能力,miR-17可能是其下游调控靶点。 展开更多

关键词 结直肠癌 性别决定区Y框蛋白4 miR-17基因簇 人结肠癌HCT-116细胞 增殖 侵袭

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鸡OC-116基因编码区真核表达载体的筛选及其Real-time PCR检测体系的优化

12

作者 王利 王淑红 刘长国 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2014年第11期26-31,共6页

实验旨在比较鸡OC-116基因编码区在不同载体上的表达差异,筛选表达量相对较高的重组质粒,同时优化OC-116基因编码区的Real-timePCR体系;制备OC116-GFP、OC116-pcDNA、OC116(M1)-pcDNA和OC116(M1)-GFP4种质粒,分别转染CHO细胞,瞬时表达... 实验旨在比较鸡OC-116基因编码区在不同载体上的表达差异,筛选表达量相对较高的重组质粒,同时优化OC-116基因编码区的Real-timePCR体系;制备OC116-GFP、OC116-pcDNA、OC116(M1)-pcDNA和OC116(M1)-GFP4种质粒,分别转染CHO细胞,瞬时表达后制备cDNA、提取总蛋白;然后优化OC-116基因编码区的Real-time PCR体系,并分别通过Real-time PCR、Western blotting鉴定表达水平相对更高的重组质粒。结果表明:优化PCR产物中GC碱基的分布可以排除Real-time PCR反应中熔解曲线双峰问题;更换其他实验空间可以有效解决Real-time PCR反应中的疑似气溶胶污染;pcDNA3.1/myc-His(-)A表达载体诱导OC-116基因编码区翻译表达的能力比pEGFP-N1强;在两类真核表达质粒中,Kozak序列的引入均能明显增强OC-116基因编码区的转录以及翻译水平。结果提示,Real-time PCR反应中双峰熔解曲线以及气溶胶污染可以通过引物设计、更换实验环境进行解决;携带Kozak序列的OC-116(M1)-pcDNA重组质粒目标基因转录、翻译表达水平相对更高,可用于后续研究。 展开更多

关键词 oc-116 Real-time PCR 熔解曲线 气溶胶 Kozak 鸡

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ICU鲍氏不动杆菌分离株β-内酰胺酶基因研究 被引量：1

13

作者 汪一萍 陈国忠 +4 位作者 应建飞 俞燕红 贺明阳 安敏飞 周成杰 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第19期2524-2528,共5页

目的了解分离自ICU的鲍氏不动杆菌(ABA)β-内酰胺类耐药基因存在状况,探讨ABA多药耐药机制。方法收集20株分离自2007年10月-2008年7月ICU患者临床标本的ABA,采用纸片扩散法测定32种抗菌药物的敏感性;采用三维试验检测ESBLs、AmpC酶、金... 目的了解分离自ICU的鲍氏不动杆菌(ABA)β-内酰胺类耐药基因存在状况,探讨ABA多药耐药机制。方法收集20株分离自2007年10月-2008年7月ICU患者临床标本的ABA,采用纸片扩散法测定32种抗菌药物的敏感性;采用三维试验检测ESBLs、AmpC酶、金属β-内酰胺酶存在情况;采用PCR法检测β-内酰胺酶、金属β-内酰胺酶、碳青酶烯和AmpC酶等21种基因。结果20株ABA TEM阳性20株(100%),OXA-23群阳性10株(50%),ADC阳性15株(75%),其余基因均阴性;>50%菌株同时携带TEMβ-内酰胺酶、OXA-23群碳青酶烯酶和ADC AmpC酶3种基因;TEM阳性、OXA-23群阳性、ADC阳性各取1株测序,经比对分别为TEM-116型、OXA-73型、ADC-25型。结论ABA以携带TEM、OXA-23、ADC 3种β-内酰胺酶基因为主,且多数以上分离株同时携带TEMβ-内酰胺酶、OXA-23群碳青酶烯酶和ADC AmpC酶3种基因,因此显示ICU分离ABA菌株对β-内酰胺类药呈高度耐药性。 展开更多

关键词 鲍氏不动杆菌 Β-内酰胺酶 超广谱Β-内酰胺酶 金属Β-内酰胺酶 AMPC酶 TEM-116型 OXA-73型

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TOTAL CONTENTS-VOLUME 116 ,2003

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《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2003年第12期1959-1981,共23页

关键词 TOTAL CONTENTS-VOLUME 116 2003 gene

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