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大豆和苜蓿基因置换比较分析
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作者 高昕彤 王佳琪 +3 位作者 张晓敏 张岩 李晓楠 张岚 《河北师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第6期602-610,共9页
植物基因组的多倍化事件会使其产生大量的重复基因,为基因置换的发生提供了机会.采用比较基因组学和系统发育分析方法,在大豆、野生大豆、南苜蓿、花苜蓿、紫花苜蓿和蒺藜苜蓿基因组中,推断重复基因间发生的基因置换事件.结果表明,在豆... 植物基因组的多倍化事件会使其产生大量的重复基因,为基因置换的发生提供了机会.采用比较基因组学和系统发育分析方法,在大豆、野生大豆、南苜蓿、花苜蓿、紫花苜蓿和蒺藜苜蓿基因组中,推断重复基因间发生的基因置换事件.结果表明,在豆科共同四倍体事件(legume-common tetraploid, LCT)后,2种大豆基因组中受到基因置换影响的重复基因有4 001~4 659对(37.61%~38.37%),4种苜蓿基因组中受到基因置换影响的重复基因有1 512~5 567对(10.71%~47.41%);对置换基因在染色体上的位置进行分析,发现基因置换的发生与基因在染色体上的位置没有明显的相关性;基因置换会使重复基因的表达模式更相似;不同物种间具有特定功能的基因倾向于发生基因置换.基因置换可能会促进豆科植物的根瘤固氮能力. 展开更多
关键词 大豆 苜蓿 基因置换 NLP(nin-like Protein)基因家族
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ROC曲线评价可溶性Lox-1、高敏肌钙蛋白Ⅰ联合检测对急性冠脉综合征的诊断价值 被引量:5
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作者 李丹 刘春雷 +4 位作者 何家艳 邴岩 高娇 陈兴明 敬华 《标记免疫分析与临床》 CAS 2013年第1期1-4,共4页
目的应用ROC曲线探讨可溶性Lox-1(sLox-1)、高敏肌钙蛋白I(hs-TnI)单独或联合检测对急性冠脉综合征的诊断价值。方法冠状动脉造影(CAG)确诊的冠心病患者119例(ACS组78例、SA P组41例);NCHD组41例。分别用ELISA,生化免疫分析仪和化学免... 目的应用ROC曲线探讨可溶性Lox-1(sLox-1)、高敏肌钙蛋白I(hs-TnI)单独或联合检测对急性冠脉综合征的诊断价值。方法冠状动脉造影(CAG)确诊的冠心病患者119例(ACS组78例、SA P组41例);NCHD组41例。分别用ELISA,生化免疫分析仪和化学免疫发光仪检测血浆sLox-1、hs-TnI、肌红蛋白、普通肌钙蛋白和CKMB浓度。绘制ROC曲线,用曲线下面积(AUC)等诊断效能参数评价sLox-1和hs-TnI对ACS的诊断价值。结果 sLox-1诊断ACS的AUC为0.934,hs-TnI的AUC为0.918。"sLox-1+hs-TnI"联合检测的AUC为0.974,敏感性为95.1%,特异性为96.2%,高于sLox-1或hs-TnI单独检测及"TnI+Myo+CKMB"联合检测。结论 sLox-1和hs-TnI联合检测可以较好的互补作用,对ACS的诊断具有较高的特异性和敏感性,且高于"TnI+Myo+CKMB"联合检测。 展开更多
关键词 急性冠脉综合征 可溶性凝集素样低密度脂蛋白受体-1 高敏肌钙蛋白Ⅰ 心肌标志物
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枳NLP转录因子响应干旱胁迫并与NRE顺式作用元件互作 被引量:4
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作者 曹雄军 卢晓鹏 +2 位作者 熊江 李静 谢深喜 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第17期3370-3378,共9页
【目的】探讨枳氮素含量在干旱条件下的变化,以及氮代谢途径枳亚硝酸还原酶基因(NiR)和NLP转录因子的响应表达,分析确定枳NLP转录因子与NiR启动子区域硝酸盐响应顺式作用元件(nitrate-responsive cis-element,NRE)位点绑定互作。【方法... 【目的】探讨枳氮素含量在干旱条件下的变化,以及氮代谢途径枳亚硝酸还原酶基因(NiR)和NLP转录因子的响应表达,分析确定枳NLP转录因子与NiR启动子区域硝酸盐响应顺式作用元件(nitrate-responsive cis-element,NRE)位点绑定互作。【方法】以一年生的砧木枳为试验材料,进行干旱处理直至植株叶片开始萎蔫,并设置对照。利用凯氏定氮仪检测干旱条件下枳叶片和侧根的全氮含量,并同步利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和2-ΔΔCT法分析PtNiR、PtNLP2、PtNLP4、PtNLP7及PtNLP8在枳叶片和侧根的表达情况。通过基因克隆并检索与比对分析,获取PtNiR启动子区域的硝酸盐响应顺式作用元件序列,之后利用同源克隆方法构建用于酵母单杂交的pHIS2-4×NRE和p GADT7-Rec-NLP载体,将构建的pHIS2-4×NRE和p GADT7-Rec-NLP载体质粒共同转化到酵母菌株Y187中,在氨基酸缺失培养基(SD/-Trp/-Leu,以及SD/-His/-Trp/-Leu/+120 mmol·L^(-1) 3-氨基三唑)上30℃恒温培养3—5 d,观察酵母的生长情况,以确定枳NLP转录因子(PtNLP2、PtNLP4、PtNLP7及PtNLP8)与NRE的互作关系。【结果】受干旱的影响,枳叶片全氮含量表现出先升高再下降的趋势,而侧根中全氮含量则显著下降;在对照中,枳叶片和侧根全氮含量均显著上升。RT-qPCR分析表明,PtNiR的表达水平在叶片中先上调然后再显著下调,而在侧根中则随着干旱程度的增加显著下调;PtNLP2、PtNLP4及PtNLP7在枳叶片和侧根中的表达也均呈现不同程度的先上调然后再受到抑制的规律,而PtNLP8在枳叶片和侧根中的表达则在一定程度上受到干旱抑制。通过克隆测序分析,在枳NiR启动子区域-196至-154的位置发现了疑似NRE。酵母单杂交分析表明,转化pHIS2-4×NRE-HIS3载体和p GADT7-Rec-NLP载体的Y187酵母在对照培养基(-Trp/-Leu)和含有120 mmol·L^(-1) 3-氨基三唑的三缺培养基(-His/-Trp/-Leu)上均能正常生长。【结论】枳侧根中的全氮含量受干旱的影响而显著下降,以对照为参比,枳侧根和叶片中的全氮含量均随着干旱时间的延长而相对减少。氮代谢途径的枳NiR和NLP转录因子在叶片和侧根中的表达对干旱有不同程度的响应。PtNLP2、PtNLP4、PtNLP7及PtNLP8转录因子均能与PtNiR启动子中的硝酸盐响应顺式作用元件(NRE)位点绑定互作,从而激活下游基因的表达。 展开更多
关键词 NLP转录因子 干旱胁迫 硝酸盐响应顺式作用元件 绑定
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An incoherent feed-forward loop coordinates nitrate uptake and tillering in wheat
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作者 Weiya Xu Yongming Chen +15 位作者 Yanxiao Niu Bin Liu Dejie Du Xining Ning Tong Huan Yilan Zhou Wensheng Ke Lingfeng Miao Weilong Guo Mingming Xin Yingyin Yao Huiru Peng Mingshan You Zhongfu Ni Qixin Sun Jiewen Xing 《Molecular Plant》 2025年第11期1881-1900,共20页
Nitrogen fertilization has increased wheat yields since the Green Revolution,but these gains have plateaued.Excessive nitrogen application reduces nitrogen use efficiency by promoting nonproductive tillers,and balanci... Nitrogen fertilization has increased wheat yields since the Green Revolution,but these gains have plateaued.Excessive nitrogen application reduces nitrogen use efficiency by promoting nonproductive tillers,and balancing nitrogen uptake with tillering in wheat remains a challenge.Here,we demonstrate that TaNLP3 is a master regulator of nitrate signaling that,together with the SWl/SNF complex,regulates chromatin accessibility to fine-tune nitrate uptake and tiller formation through a temporal transcriptional cascade.In short-term nitrate signaling,TaNLP3 activates the expression of primary nitrate response genes,including TaNRT2.1,to promote nitrate uptake.In long-term nitrate signaling,TaLBD38 is induced by TaNLP3 and represses TaNRT2.1,limiting nitrate uptake and promoting tillering by inhibiting TaCKX4/5,negative modulators of tillering.Furthermore,we identified elite haplotypes of TaNLP3-3B,TaLBD38-4A,andTaNRT2.1-6B4 that enable higher yields under equivalent nitrogen supply.Taken together,our findings reveal the dynamic coordination between nitrate uptake and tillering under fluctuating nitrogen conditions,offering valuable resources for breeding wheat varieties with improved nitrogen use efficiency and productivity. 展开更多
关键词 WHEAT nin-like protein nitrate uptake tiller formation
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Arabidopsis NLP7 improves nitrogen use efficiency and yield in cotton
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作者 JAN Sami Ullah LIAQAT Ayesha +7 位作者 ZHU Yonghong LI Jing ZHANG Huangyang ABDALLA Mohnad WU Jie XIANG Chengbin WU Shenjie ALFATIH Alamin 《Journal of Cotton Research》 2022年第1期12-21,共10页
Background:Nitrogen(N)is a required macronutrient for cotton growth and productivity.Excessive N fertilizers are applied in agriculture for crop yield maximization,which also generates environmental pollution.Improvin... Background:Nitrogen(N)is a required macronutrient for cotton growth and productivity.Excessive N fertilizers are applied in agriculture for crop yield maximization,which also generates environmental pollution.Improving crop N use efficiency(NUE)is the most economical and desirable way of reducing fertilizer application and environmental pollution.NUE has been an important issue in cotton.So far there is no report on cotton NUE improvement via transgenic approach.Nin-like proteins(NLP)are transcription factors regulating NUE.We previously demonstrated that At NLP7 improved NUE and biomass when overexpressed in Arabidopsis.However,it is not known whether At NLP7 can be used to improve NUE in crops.Results:To test the feasibility,we expressed At NLP7 in cotton and evaluated NUE and yield of the transgenic cotton in the field.Transgenic cotton showed improved NUE and yield under both low and high N conditions.In addition,plant biomass,amount of absorbed N,N contents,activities of N-assimilating enzymes,and the expression of N-related marker genes were significantly increased in transgenic cotton compared with the wild type control,suggesting that At NLP7 enhances NUE in cotton.Conclusion:Together,our results demonstrate that At NLP7 is a promising candidate to improve NUE and yield in cotton. 展开更多
关键词 Nitrogen Nitrogen metabolism Nitrogen use efficiency(NUE) nin-like protein(NLP) AtNLP7 Cotton(Gossypium hirsutum)
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