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尼可霉素(Nikkomycins)多组分结构及其生物合成相关基因的研究进展 被引量:2
1
作者 陈蔚 谭华荣 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期548-550,共3页
尼可霉素是一种新的抗真菌抗生素 ,在分离到的 2 0多种活性单组分中 ,X、Z、I、J为主要生物活性组分。本文介绍了尼可霉素的结构 。
关键词 尼可霉素 结构 生物活性 生物合成基因 抗生素
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Cloning, sequencing and function of sanA, a gene involved in nikkomycin biosynthesis of Streptomyces ansochromogenes 被引量:3
2
作者 贾君永 李文利 +2 位作者 陈蔚 聂丽平 谭华荣 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2000年第1期30-38,共9页
Several genetically stable mutants blocked in nikkomycin biosynthesis were obtained after the slightly germinated spores of Streptomyces ansochromogenes, a nikkomycin producer, were treated with ultra violet radiation... Several genetically stable mutants blocked in nikkomycin biosynthesis were obtained after the slightly germinated spores of Streptomyces ansochromogenes, a nikkomycin producer, were treated with ultra violet radiation. One of the mutants is the same in morpholotical differentiation as the wild type strain and is designated as NBB19. A DMA library was constructed using plasmid plJ702 as cloning vector, NBB19 as cloning recipient. A 6 kb DNA fragment which can genetically complement NBB19 was cloned when screening the library for antifungal activity. Sequence analysis showed that the 3 kb Bgl II-Sal I fragment contains one complete ORF (ORF1) and one partial ORF (ORF2). ORF1 is designated as sanA. sanA is 1 365 bp, encoding a protein consisting of 454 amino acid residues. Database searching indicated that sanA is homologous to the hypothetical methyltransferase in Pyrococcus horikoshli with 25% identities and 41% positives. Disruptant of sanA lost the ability to synthesize nikkomycin. It indicated that sanA is a novel gene which is essential for nikkomycin biosynthesis. 展开更多
关键词 STREPTOMYCES nikkomycin BIOSYNTHESIS GENE COMPLEMENTARY cloning.
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Cloning, sequencing and function of sanB, a gene related to nikkomycin biosynthesis of Streptomyces ansochromogenes
3
作者 LI Wenli JIA Junyong +2 位作者 TAN Huarong HU Yongsong WANG Zhongyan 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2000年第23期2158-2162,共5页
A 6.0 kb DNA fragment related to nikkomycin biosynthesis was cloned from nikkomycin-producing Streptomyces ansochromogenes 7100. Sequence analysis showed that the 1.9 kb Tth111 I fragment, a part of the 6.0 kb DNA fra... A 6.0 kb DNA fragment related to nikkomycin biosynthesis was cloned from nikkomycin-producing Streptomyces ansochromogenes 7100. Sequence analysis showed that the 1.9 kb Tth111 I fragment, a part of the 6.0 kb DNA fragment, contains one complete ORF designated sanB (GenBank accession No. AF224501), which is composed of 1740 bp encoding a protein consisting of 580 amino acid residues. Its start codon is GTG at 100 bp position and stop codon is TGA at 1840-bp position. Database searching indicated that the deduced protein of sanB is homologous to the histidinol-phosphate aminotransferase in Streptomyces coelicolor with 31% identities and 47% positives. Gene disruption was performed to study the function of sanB. It was found that disruptants of sanB lost the ability to synthesize nikkomycin, which reveals that sanB is a novel gene essential for nikkomycin biosynthesis. 展开更多
关键词 STREPTOMYCES ansochromogenes nikkomycin BIOSYNTHESIS GENE function.
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圈卷产色链霉菌分化及其特性的研究 被引量:5
4
作者 谭华荣 吴畏 +5 位作者 田宇清 杨海花 宋幼新 董可宁 黄喜平 宋大康 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1994年第5期398-402,共5页
链霉菌分化的分子生物学研究是一个饶有兴趣并富有挑战性的世界前沿研究课题.在原核生物的分化研究中,主要以枯草杆菌(Bacillus subtilis)作为模式系统,但枯草杆菌的生命周期尤其是分化过程远比链霉菌简单,不象链霉菌有基质菌丝、气生... 链霉菌分化的分子生物学研究是一个饶有兴趣并富有挑战性的世界前沿研究课题.在原核生物的分化研究中,主要以枯草杆菌(Bacillus subtilis)作为模式系统,但枯草杆菌的生命周期尤其是分化过程远比链霉菌简单,不象链霉菌有基质菌丝、气生菌丝、菌丝螺旋和孢子分隔那样的发育分化过程[1].在真核生物中也有分化研究的报道,如构巢曲霉、酵母等.由于真核生物的基因结构比原核生物复杂得多,弄清分化中基因调控的关系就更加困难.因此,选用链霉菌作分化研究的材料有其独一无二的优越性.国际上有关链霉菌的分子生物学研究,近年来主要以链霉菌的抗生素生物合成基因和链霉菌的分化基因两个大的方面作为研究的热点和主攻方向,并展开了一些开拓性的研究. 展开更多
关键词 圈卷产色 链霉菌 分化 特性
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NIKKO霉素产生菌的空间生物学效应研究 被引量:16
5
作者 骆爱群 高春宵 +2 位作者 宋幼新 谭华荣 刘志恒 《航天医学与医学工程》 CAS CSCD 1998年第6期411-414,共4页
为了探讨NIKKO霉素产生菌圈状链霉菌等菌株的空间生物学效应,在返回式卫星上进行了搭载试验。结果表明,有些菌株受空间环境因子的作用其生物学功能性状发生明显变化,其中NIKKO霉素产生菌的抗生素效价提高13%~18%,... 为了探讨NIKKO霉素产生菌圈状链霉菌等菌株的空间生物学效应,在返回式卫星上进行了搭载试验。结果表明,有些菌株受空间环境因子的作用其生物学功能性状发生明显变化,其中NIKKO霉素产生菌的抗生素效价提高13%~18%,NIKKO霉素X组分和Z组分亦有所提高。这种变化与形态发育分化表征有相关性。 展开更多
关键词 NIKKO霉素 航天生物学 链霉菌 生物效应
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圈卷产色链霉菌尼可霉素生物合成基因——sanH和sanI的研究 被引量:4
6
作者 陈蔚 田宇清 +1 位作者 杨海花 谭华荣 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期598-604,共7页
通过反向遗传学方法克隆到圈卷产色链霉菌尼可霉素生物合成基因簇中约 7 0kb的DNA片段。该片段除含有尼可霉素生物合成基因sanF外 ,对sanF上游约 2 2kb的BglⅡDNA片段进行序列测定及分析表明 ,还含有两个完整的开放阅读框 (ORF)。ORF1... 通过反向遗传学方法克隆到圈卷产色链霉菌尼可霉素生物合成基因簇中约 7 0kb的DNA片段。该片段除含有尼可霉素生物合成基因sanF外 ,对sanF上游约 2 2kb的BglⅡDNA片段进行序列测定及分析表明 ,还含有两个完整的开放阅读框 (ORF)。ORF1由 1 2 33个核苷酸组成 ,ORF2由 1 95个核苷酸组成 ,它们分别编码由 41 0个氨基酸残基和 64个氨基酸残基组成的蛋白质 ,依次命名为sanH和sanI。蛋白序列数据库比较结果表明 ,SanH和SanI与浅灰链霉菌 (Streptomycesgriseolus)中共转录的细胞色素P450 (cytochromeP450 )和铁氧还蛋白 (ferredoxin)有较高的同源性 ,一致性分别为 46%和 56% ,相似性分别为 62 %和70 %。基因功能研究表明 ,sanH基因的破坏虽不影响圈卷产色链霉菌产生的尼可霉素的生物活性 ,但该基因可能参与了尼可霉素羟基化反应的生物合成。 展开更多
关键词 圈卷产色链霉菌 尼可霉素生物合成基因 sanH
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圈卷产色链霉菌尼可霉素生物合成基因—sanL的结构与功能 被引量:2
7
作者 聂丽平 张集慧 谭华荣 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期59-64,共6页
利用染色体步移策略 ,以尼可霉素生物合成相关的基因片段为探针 ,从圈卷产色链霉菌中克隆到了一个大约 1 0kb的DNA片段。序列分析表明此片段中除含有sanK外 ,在sanK的上游还有一个完整开放阅读框———sanL。sanL与sanK的转录方向相同 ... 利用染色体步移策略 ,以尼可霉素生物合成相关的基因片段为探针 ,从圈卷产色链霉菌中克隆到了一个大约 1 0kb的DNA片段。序列分析表明此片段中除含有sanK外 ,在sanK的上游还有一个完整开放阅读框———sanL。sanL与sanK的转录方向相同 ,具有 1 2 81个核苷酸 ,起始密码子为 345位的ATG ,终止密码子为 1 62 3位的TGA。利用Blastx程序进行的分析揭示 ,此基因可能编码一个赖氨酸 2 氨基转移酶。基因功能研究表明 ,该基因是圈卷产色链霉菌尼可霉素生物合成所必需的。 展开更多
关键词 圈卷产色链霉菌 尼可霉素 生物合成 赖氨酸-2-氨基转移酶 抗生素
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圈卷产色链霉菌尼可霉素生物合成基因──sanJ的克隆及功能研究 被引量:1
8
作者 聂丽平 田宇清 谭华荣 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第2期188-195,共8页
以尼可霉素生物合成相关的基因片段为探针,从圈卷产色链霉菌cosmid基因文库中筛选到1个大约7.5kb的DNA片 段,将此DNA片段克隆到载体pBluescripM13-的Kpn I位点,得到了重组质粒pNL2200。对pNL2200中外源DNA片段进行了一系列的亚克隆... 以尼可霉素生物合成相关的基因片段为探针,从圈卷产色链霉菌cosmid基因文库中筛选到1个大约7.5kb的DNA片 段,将此DNA片段克隆到载体pBluescripM13-的Kpn I位点,得到了重组质粒pNL2200。对pNL2200中外源DNA片段进行了一系列的亚克隆及部分核苷酸序列分析,结果表明,2.3kb的Sal I-BamH DNA片段中含有1个完整的开放阅读框,起始密码子为271位的GTG,终止密码子为1954位的TGA,该基因的大小为1 686bp,编码1个大小为561个氨基酸的蛋白质产物。利用blastx程序在蛋白质数据库中进行同源比较,结果揭示此基因产物与腺苷酸形成酶超家族的连接酶有44%的一致性。此外,该基因的破坏导致圈卷产色链霉菌尼可霉素生物合成能力的丧失,证明它是尼可霉素生物合成所必需的,命名其为sanJ。 展开更多
关键词 圈卷产色链霉菌 尼可霉素 生命合成 腺苷酸形成酶 基因 克隆
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圈卷产色链霉菌尼可霉素生物合成基因-sanK的克隆及功能研究 被引量:1
9
作者 聂丽平 李文利 谭华荣 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期667-670,共4页
利用染色体步移策略 ,以尼可霉素生物合成相关的基因片段为探针 ,从圈卷产色链霉菌中克隆到了一个大约 10kb的DNA片段。对其中 1 8kb的PvuII SacII片段进行了序列分析 ,结果表明 :此片段中含有一个具有1170个核苷酸的完整开放阅读框 ,... 利用染色体步移策略 ,以尼可霉素生物合成相关的基因片段为探针 ,从圈卷产色链霉菌中克隆到了一个大约 10kb的DNA片段。对其中 1 8kb的PvuII SacII片段进行了序列分析 ,结果表明 :此片段中含有一个具有1170个核苷酸的完整开放阅读框 ,起始密码子为 44 7位的ATG ,终止密码子为 16 14位的TGA ,推测其编码一个389个氨基酸的蛋白质产物。利用BLASTX程序进行的分析揭示 ,此基因编码一个肌氨酸单体氧化酶。基因功能研究结果表明 ,此基因与圈卷产色链霉菌尼可霉素生物合成直接相关 ,命名为sanK。 展开更多
关键词 圈卷产色链霉菌 尼可霉素 生物合成
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Tn4560在圈卷产色链霉菌中的转座及其在尼可霉素生物合成相关基因克隆中的应用
10
作者 曾洪梅 谭华荣 李季伦 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期11-18,共8页
采用常规转化方法用来自天蓝色链霉菌J1 5 0 1的质粒pUC1 1 6 9(pMT6 6 0∷Tn45 5 6∷vph)多次转化尼可霉素产生菌圈卷产色链霉菌野生型 71 0 0的原生质体 ,均未得到转化子。采用限制性热衰减法于 5 0℃ ,3 0min溶菌制备 71 0 0的原生质... 采用常规转化方法用来自天蓝色链霉菌J1 5 0 1的质粒pUC1 1 6 9(pMT6 6 0∷Tn45 5 6∷vph)多次转化尼可霉素产生菌圈卷产色链霉菌野生型 71 0 0的原生质体 ,均未得到转化子。采用限制性热衰减法于 5 0℃ ,3 0min溶菌制备 71 0 0的原生质体 ,获得了转化子 ,但转化频率极低 ,只有 0 4个转化子 μgDNA。用来自 71 0 0的pUC1 1 6 9再转化不含pUC1 1 6 9的 71 0 0原生质体 ,转化频率提高 1 0 3 ~ 1 0 4 倍。于 3 9℃ ,MM Vio条件下培养携带有pUC1 1 6 9的 71 0 0孢子 ,Tn45 6 0发生转座 ,筛选到 40 6 8个转座菌落 ,并从中得到 8株尼可霉素阻断突变株 ;对这 8株突变株的总DNA进行Southern杂交分析表明 ,Tn45 6 0至少在 4个不同的位点插入到 71 0 0的染色体上。用实验室已获得的与尼可霉素生物合成有关的 3 0kbDNA片段为探针和经不同酶切的 8株突变株的总DNA进行Southern杂交 ,结果表明 ,除阻断突变株Nik5有杂交信号且杂交信号大小均同野生型 71 0 0外 ,其余 7株突变株均无任何杂交信号。HPLC分析表明 ,8株突变株在产生尼可霉素方面可分为两种类型 ,Nik5为 1种类型 ,其余 7株为另一种类型。初步推测这 7株突变株基因组DNA与尼可霉素生物合成有关的部分发生了大片断的缺失。以Tn45 6 0为探针 ,构建Nik5的部分? 展开更多
关键词 圈卷产色链霉菌 Tn4560 转座突变 尼可霉素 生物合成基因 基因克隆
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Chitin synthase:A potential agricultural and therapeutic target
11
作者 Ying Ye Ze-Wei Guan +1 位作者 Xiao-Lei Zhu Guang-Fu Yang 《Advanced Agrochem》 2022年第2期87-88,共2页
Chitin synthase(CHS)is a potential agricultural and therapeutic target.Recently,the crystal structures of CHS from Phytophthora sojae(PsChs1)and Candida albicans(CaChs2)were reported.Here,we highlight the achievements... Chitin synthase(CHS)is a potential agricultural and therapeutic target.Recently,the crystal structures of CHS from Phytophthora sojae(PsChs1)and Candida albicans(CaChs2)were reported.Here,we highlight the achievements of PsChs1 and CaChs2,which would give some clues for design new inhibitor targeted upon CHS. 展开更多
关键词 CHITIN Chitin synthase nikkomycin Z Membrane protein UDP
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新型抗真菌抗生素尼可霉素Z高产菌株的育种 被引量:3
12
作者 陈姣 张勇军 陈华 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期659-662,共4页
目的以唐德链霉菌Streptomyces tendae ATCC 31160为原始菌株,通过选育获得高产突变株,并研究高产菌株的工业化发酵工艺。方法根据尼可霉素Z的生物合成途径,通过离子束注入方法,选育对关键中间产物2-吡啶-甲醛(PA)和3-甲基天冬氨酸的结... 目的以唐德链霉菌Streptomyces tendae ATCC 31160为原始菌株,通过选育获得高产突变株,并研究高产菌株的工业化发酵工艺。方法根据尼可霉素Z的生物合成途径,通过离子束注入方法,选育对关键中间产物2-吡啶-甲醛(PA)和3-甲基天冬氨酸的结构类似物S-(2-氨基乙基)-L-半胱氨酸(AEC)具有耐受性的突变菌株,使突变菌株的代谢能够朝着产物NIK合成的方向。结果最终筛选到一支高产突变菌株,其抗生素产量达到3000mg/L,较出发菌株提高150倍以上。在此基础上,建立了小试发酵工艺路线。结论高产突变株的筛选和发酵工艺的确定为该项目产业化奠定了基础。 展开更多
关键词 几丁质合成酶抑制剂 抗真菌药物 尼可霉素Z 高产菌株 育种
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浓度梯度法筛选华光霉素高产突变株
13
作者 冀伟 马玉荣 舒薇 《河北师范大学学报(自然科学版)》 CAS 1997年第1期89-91,共3页
用华光霉素梯度平皿将华光霉素产生菌进行自然分离,结果表明:梯度法和常规法两种培养基上选出的菌株初筛平均效价分别为106.6%和100%;在常规法中初筛效价比出发菌株高30%以上的菌株为0,而在梯度法中有4株菌达到或超... 用华光霉素梯度平皿将华光霉素产生菌进行自然分离,结果表明:梯度法和常规法两种培养基上选出的菌株初筛平均效价分别为106.6%和100%;在常规法中初筛效价比出发菌株高30%以上的菌株为0,而在梯度法中有4株菌达到或超过这一水平。实验证明:用华光霉素梯度平皿分离不仅使效价的正变频率高于常规分离。 展开更多
关键词 华光霉素 筛选 微生物 浓度梯度法 抗生素
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唐德链霉菌产尼可霉素Z的菌种生长特性及发酵液预处理条件优化
14
作者 聂玲燕 廖永康 邹渊博 《国外医药(抗生素分册)》 CAS 2022年第4期288-291,I0001,共5页
目的 以唐德链霉菌为生产菌株,进行微生物发酵生产尼可霉素Z,研究该菌种生长特性和发酵料液预处理条件。方法 通过微生物发酵培养,摸索菌种生长和发酵特性。对发酵料液进行不同pH调节,采用不同溶剂进行萃取,得到发酵液预处理条件,并通... 目的 以唐德链霉菌为生产菌株,进行微生物发酵生产尼可霉素Z,研究该菌种生长特性和发酵料液预处理条件。方法 通过微生物发酵培养,摸索菌种生长和发酵特性。对发酵料液进行不同pH调节,采用不同溶剂进行萃取,得到发酵液预处理条件,并通过高效液相色谱法进行含量检测。结果 唐德链霉菌单菌落平板以采用无微量元素的ISP2培养基,平板pH控制在7.0~7.5,种子培养控制在30 h为宜,前体尿嘧啶和乙酰胺能促进发酵产素。可用草酸或盐酸将发酵料液pH控制在2.0左右,用20%~50%甲醇溶液可完全萃取发酵液中的尼可霉素。结论 通过对唐德链霉菌的菌种生长特性研究,以及对其发酵产尼可霉素发酵液预处理条件的摸索为尼可霉素Z产业化大生产奠定了基础。。 展开更多
关键词 尼可霉素Z 唐德链霉菌 发酵 预处理
暂未订购
尼可霉素生物合成基因簇的改造及其异源表达 被引量:3
15
作者 王璐 杜德尧 +4 位作者 李金娥 田宇清 刘浩 牛国清 谭华荣 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期707-718,共12页
【目的】异源表达尼可霉素生物合成基因簇,为尼可霉素核苷和肽基缩合机制研究以及尼可霉素与其它核苷类抗生素的组合生物合成奠定基础。【方法】以含有尼可霉素生物合成基因簇的pNIK为出发质粒,通过PCR-targeting的方法,将基因簇中san G... 【目的】异源表达尼可霉素生物合成基因簇,为尼可霉素核苷和肽基缩合机制研究以及尼可霉素与其它核苷类抗生素的组合生物合成奠定基础。【方法】以含有尼可霉素生物合成基因簇的pNIK为出发质粒,通过PCR-targeting的方法,将基因簇中san G和san F的启动子替换为组成型hrd B启动子,构建重组质粒pNIKm。通过接合转移的方法分别将pNIK和pNIKm导入天蓝色链霉菌M1146中,获得异源表达菌株M1146-NIK和M1146-NIKm,并通过RT-PCR检测基因簇的表达情况。最后通过抗菌活性实验和产物的分离鉴定,比较M1146-NIK和M1146-NIKm的抗菌活性和尼可霉素的产生情况。【结果】pNIK和pNIKm在异源宿主天蓝色链霉菌M1146成功表达;M1146-NIK和M1146-NIKm均有明显的抗菌活性;M1146-NIK和M1146-NIKm均能产生少量的尼可霉素X、Z和假尼可霉素Z;M1146-NIK大量积累尿苷,而M1146-NIKm大量积累尿苷、核糖基-4-甲酰-4-咪唑-2-酮和吡啶同型苏氨酸。【结论】尼可霉素生物合成基因簇成功异源表达,并分离鉴定了尼可霉素产物及其生物合成中间体。本研究将为尼可霉素核苷和肽基缩合的酶学机制研究以及尼可霉素与其它核苷类抗生素组合合成新型杂合抗生素提供理论依据和指导。 展开更多
关键词 圈卷产色链霉菌 尼可霉素 生物合成基因簇 异源表达 抗菌活性 产物鉴定
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圈卷产色链霉菌san7324和san7324L基因阻断对形态分化和尼可霉素产生的影响
16
作者 孙军 李敬敬 +3 位作者 李月 王川 蔡原 谭华荣 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期235-246,共12页
【目的】圈卷产色链霉菌全局性调控基因wblA阻断突变后,尼可霉素不再产生。RNA-seq和转录分析表明san7324基因在野生型菌株中可以正常转录,而在wblA阻断突变株(ΔwblA)中不能转录,为此本文旨在揭示san7324与尼可霉素产生的关系。【方法... 【目的】圈卷产色链霉菌全局性调控基因wblA阻断突变后,尼可霉素不再产生。RNA-seq和转录分析表明san7324基因在野生型菌株中可以正常转录,而在wblA阻断突变株(ΔwblA)中不能转录,为此本文旨在揭示san7324与尼可霉素产生的关系。【方法】利用同源双交换策略对san7324进行基因阻断,而后通过基因遗传回补及对尼可霉素生物合成相关基因的转录分析等方法研究san7324的功能。【结果】在相同培养条件下,阻断突变株Δsan7324与野生型菌株相比失去了合成尼可霉素的能力。我们通过同源比对发现圈卷产色链霉菌中还存在一个与san7324同源的基因san7324L,该基因的阻断导致尼可霉素产量降低。当san7324和san7324L两个基因同时被阻断后,得到的突变株Δsan7324-san7324L生长稀疏而且不能正常发育分化形成灰色表型的孢子或孢子链,只能形成白色表型的气生菌丝,同时也丧失了合成尼可霉素的能力。当这两个基因(san7324-san7324L)回补双突变株后,则恢复了野生型的表型(能形成孢子链并恢复尼可霉素的产生)。进一步的研究初步表明san7324和san7324L的阻断主要影响了尼可霉素生物合成基因簇中途径特异性调控基因sanG的转录水平,从而影响圈卷产色链霉菌的发育分化和尼可霉素的产生。【结论】该结果为链霉菌形态分化与生理代谢关系的研究提供了更多的证据,同时为多效调控基因wblA作用机制的阐明奠定了基础。 展开更多
关键词 圈卷产色链霉菌 基因阻断 形态分化 尼可霉素
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