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题名濒危植物新绒苔叶绿体基因组特征及系统发育位置分析
被引量：2
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作者
朱梦飞
胡迎峰
师雪芹
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机构
安徽师范大学生命科学学院
安徽师范大学生物环境与生态安全安徽省高校省级重点实验室
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出处
《浙江农林大学学报》
北大核心
2025年第1期55-63,共9页
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基金
安徽省自然科学基金资助项目(1608085MC61)。
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文摘
【目的】新绒苔Neotrichocolea bissetii为东亚特有植物,被世界自然保护联盟(IUCN)列为易危植物。阐明新绒苔叶绿体基因组结构特征及系统进化地位,可为新绒苔的物种鉴定、资源保护和系统进化提供理论参考。【方法】以野外采集的新绒苔为材料,进行DNA提取、测序和组装,分析叶绿体基因组结构、重复序列、密码子偏好性,并结合其余18种苔藓植物叶绿体基因组序列构建系统发育关系。【结果】新绒苔叶绿体全基因组序列全长为118 423 bp,包括1对反向重复区(IR,9 031 bp)、1个大单拷贝区(LSC,80 837 bp)和1个小单拷贝区(SSC,19 524 bp);包含79个蛋白质编码基因,8个核糖体RNA (rRNA)和36个转移RNA (tRNA)。新绒苔叶绿体全基因组中共检测到56个简单重复序列(SSR),大部分为AT/AT二核苷酸序列。密码子偏好性分析表明其密码子偏好以A/U结尾。除了少数可变区域外,新绒苔叶绿体基因组的IR边界区域非常保守。系统发育树表明该种与囊绒苔Trichocoleopsis sacculata亲缘关系最密切,两者隶属于新绒苔科。【结论】新绒苔叶绿体基因组为典型的四分体结构,基因组相对保守。系统发育树分析表明新绒苔与囊绒苔聚合成同一分支结构。
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关键词
新绒苔
叶绿体基因组
特征分析
系统发育
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Keywords
neotrichocolea bissetii
chloroplast genome
characteristic analysis
phylogenetic
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分类号
Q75
[生物学—分子生物学]
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