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血清FGF-21、AMH及NRP-1联合预测体外受精-胚胎移植术后孕6周胎停育的模型构建与验证
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作者 张宏威 王楠 +3 位作者 石国西 翟俊英 钮红丽 王颖 《实用医学杂志》 北大核心 2025年第22期3480-3489,共10页
目的探讨移植前血清成纤维细胞生长因子21(FGF-21)、抗苗勒管激素(AMH)及神经纤毛蛋白-1(NRP-1)在体外受精-胚胎移植(IVF-ET)术后孕6周胎停育中的预测价值,并基于血清生化指标构建早期预测模型。方法本研究采用前瞻性设计,连续纳入2022... 目的探讨移植前血清成纤维细胞生长因子21(FGF-21)、抗苗勒管激素(AMH)及神经纤毛蛋白-1(NRP-1)在体外受精-胚胎移植(IVF-ET)术后孕6周胎停育中的预测价值,并基于血清生化指标构建早期预测模型。方法本研究采用前瞻性设计,连续纳入2022年9月至2024年9月期间在医院接受IVF-ET助孕并确诊为临床妊娠的322例患者,按7∶3比例将患者分为建模集(n=225)和验证集(n=97)。根据孕6周超声结果将建模集患者分为胎停组(n=59)与持续妊娠组(n=166)。采集患者基础临床资料及移植前血清FGF-21、AMH、NRP-1水平,采用多因素logistic回归分析筛选胎停育的独立影响因素,并构建预测模型。通过ROC曲线、Hosmer-Lemeshow拟合优度检验及Bootstrap重抽样方法对建模集和验证集模型的判别力、拟合度及稳定性进行评估。结果单因素分析显示,FSH/LH比值、窦卵泡数及获卵数与孕6周胎停育显著相关(P<0.001)。胎停组患者移植前血清FGF-21水平明显升高,而AMH和NRP-1水平显著降低(P<0.001)。Logistic回归分析结果显示,在控制年龄、BMI等与生殖结局相关的已知混杂因素后,FSH/LH<1.8(OR=1.629,P=0.002)及移植前FGF-21水平升高(OR=1.338,P=0.002)仍是胎停育的独立危险因素,而移植前AMH(OR=0.741,P=0.010)及NRP-1水平(OR=0.874,P=0.007)较高则为保护因素。分层分析显示,在FSH/LH≥1.8的患者中,FGF-21水平显著升高,而AMH及NRP-1水平均显著降低(P<0.001)。交互作用分析提示,FSH/LH比值对3项指标与胎停育风险的关联均具有显著调节作用(P交互<0.05)。在FSH/LH较高的亚组中,FGF-21的风险效应增强,AMH及NRP-1的保护效应亦更显著。本研究构建的建模集和验证集联合预测模型C-index值分别为0.869(95%CI:0.826~0.926)和0.835(95%CI:0.811~0.907),其预测IVT-ET术后孕6周胎停育的AUC为0.934(建模集)和0.909(验证集)均显著优于单一指标(FGF-21、AMH、NRP-1的AUC分别为0.867、0.881、0.853)(Z=2.024、1.831,P<0.001),且DCA曲线提示该模型在0.1~0.4的阈值范围内均提供正向临床净收益,应用价值较高。结论移植前血清FGF-21升高、AMH及NRP-1降低与IVF-ET术后孕6周胎停育密切相关。本研究构建的联合预测模型表现出良好的准确性与稳定性,具备较高的临床应用价值。 展开更多
关键词 成纤维细胞生长因子21 抗苗勒管激素 神经纤毛蛋白-1 体外受精-胚胎移植 胎停育 预测模型
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NRP-1靶向分子探针助力乳腺癌诊断的最新进展及展望
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作者 蔡舒玥 谢佺 +3 位作者 周雨萱 刘清竹 邱玲 林建国 《中国癌症杂志》 北大核心 2025年第2期249-254,共6页
乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤,其中三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)具有高度侵袭性与转移性,近年其发病率逐步上升并呈年轻化趋势。随着对乳腺癌分子机制的深入研究,神经毡蛋白-1(neuropilin-1,NRP-1)作为一种... 乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤,其中三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)具有高度侵袭性与转移性,近年其发病率逐步上升并呈年轻化趋势。随着对乳腺癌分子机制的深入研究,神经毡蛋白-1(neuropilin-1,NRP-1)作为一种跨膜蛋白,被证实与乳腺癌特别是TNBC的转移及患者预后密切相关,已经成为乳腺癌诊断和治疗的潜在靶点。利用核医学、光学及多模态等成像技术可以无创、实时、精准地检测NRP-1的表达和分布,对于乳腺癌的早期诊断、分期以及治疗和疗效监测具有重要的指导意义。核医学探针将放射性核素(如^(68)Ga、^(99m)Tc等)与特定的靶向配体结合,从而特异性靶向肿瘤细胞或组织,并通过正电子发射体层成像(positron emission tomography,PET)或单光子发射计算机体层成像(single photon emission computed tomography,SPECT)实现对乳腺癌的灵敏特异性诊断。随着医学影像及各交叉学科的发展,靶向NRP-1的多模态分子探针[^(68)Ga]Ga-NODAGA-K(Cy5)DKPPR将PET的高灵敏度和近红外荧光(near-infrared fluorescence,NIRF)的高分辨率优势相结合,实现乳腺癌术前精确诊断并在术中提供实时荧光导航,有助于更准确地识别和切除肿瘤。本文对NRP-1靶向分子探针在乳腺癌诊断中的优缺点进行系统比较,并阐述各类探针在乳腺癌诊疗领域的适用范围及最新研究进展,以期为乳腺癌靶向分子探针的研发及临床应用提供参考。 展开更多
关键词 乳腺癌 神经毡蛋白-1 肿瘤诊断 分子成像 分子探针
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钼靶X线摄片联合MRI检查及血清NRP-1水平诊断乳腺癌的临床价值研究 被引量:1
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作者 左玮玮 刘一航 《影像科学与光化学》 2025年第5期103-109,共7页
目的:探讨钼靶X线摄片联合磁共振成像(MRI)检查及血清神经纤毛蛋白-1(neuropilin-1,NRP-1)水平在乳腺癌诊断中的联合应用价值。方法:回顾性分析210例疑似乳腺癌患者的临床数据,通过临床病理结果分为乳腺癌组(n=142)和良性组(n=68)。检... 目的:探讨钼靶X线摄片联合磁共振成像(MRI)检查及血清神经纤毛蛋白-1(neuropilin-1,NRP-1)水平在乳腺癌诊断中的联合应用价值。方法:回顾性分析210例疑似乳腺癌患者的临床数据,通过临床病理结果分为乳腺癌组(n=142)和良性组(n=68)。检测了所有患者的血清NRP-1水平,并进行了钼靶X线摄片和MRI检查。采用受试者操作特征(ROC)曲线评估各检测方法的诊断效能,并使用相关系数分析血清NRP-1水平与影像学检查的相关性。结果:乳腺癌组的NRP-1水平显著高于良性组(P<0.05);联合检测乳腺癌的完全符合率、灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值均显著高于钼靶X线摄片、NRP-1水平单一检测(P<0.05),联合检测的完全符合率、灵敏度、阴性预测值均显著高于MRI单一检测;ROC曲线分析显示,联合检测的AUC值为0.957,显著高于单一检测(P<0.05)。结论:钼靶X线摄片、MRI及血清NRP-1水平在乳腺癌诊断中均有一定价值,且联合检测可显著提高诊断效能,对乳腺癌的早期诊断具有重要意义。 展开更多
关键词 乳腺癌 钼靶X线摄片 磁共振成像 神经纤毛蛋白-1 诊断价值
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miR-217调控NRP1对胃癌细胞奥沙利铂耐药能力的影响
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作者 周颖 许琦华 +2 位作者 廖冰灵 常玲 张旗林 《生物技术》 CAS 2024年第6期728-734,共7页
[目的]探索miR-217与NRP1在奥沙利铂耐药性胃癌细胞中的作用机制。[方法]将MGC803/L-OHP细胞分为4组:miR NC组、miR-217 mimic组、si NC组与si NRP1组。通过实时荧光定量PCR实验和蛋白免疫印迹实验检测耐药和非耐药细胞中miR-217和NRP1... [目的]探索miR-217与NRP1在奥沙利铂耐药性胃癌细胞中的作用机制。[方法]将MGC803/L-OHP细胞分为4组:miR NC组、miR-217 mimic组、si NC组与si NRP1组。通过实时荧光定量PCR实验和蛋白免疫印迹实验检测耐药和非耐药细胞中miR-217和NRP1的表达水平;通过MTT实验分析MGC803/L-OHP细胞的增殖能力;通过Transwell实验分析MGC803/L-OHP细胞的转移活性;通过流式细胞术分析MGC803/L-OHP细胞的凋亡率;通过荧光素酶报告基因实验分析MGC803/L-OHP细胞中miR-217与NRP1的靶向关系。[结果]上调miR-217或抑制NRP1能够抑制非耐药MGC803细胞生长。与MGC803细胞比较,MGC803/L-OHP细胞中的miR-217表达水平降低(0.79±0.08 vs 0.21±0.02;P<0.05),NRP1表达水平增加(0.41±0.09 vs 0.78±0.12;P<0.05)。与miR NC组比较,miR-217 mimic组的MGC803/L-OHP细胞的增殖活性降低、侵袭能力降低、凋亡率增加(2.37±0.23 vs 25.38±5.12;P<0.05)。与si NC组比较,si NRP1组的MGC803/L-OHP细胞的增殖活性降低、侵袭能力降低、凋亡率增加(4.67±0.83 vs 26.17±7.19;P<0.05)。荧光素酶活性测定显示,和miR NC组比较,在NRP1-WT组中转染miR-217 mimic后荧光素酶活性显著降低(0.87±0.03 vs 0.26±0.02;P<0.05)。[结论]在奥沙利铂耐药性胃癌细胞中,miR-217低表达而NRP1高表达,并且miR-217能够靶向抑制NRP1的表达。通过上调miR-217或抑制NRP1的表达能够减弱胃癌细胞对奥沙利铂的耐药性。 展开更多
关键词 miR-217 nrp1 奥沙利铂 胃癌 耐药 侵袭 MGC803 凋亡
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对比分析FLOT方案与FOLFOX方案治疗中晚期胃癌的近远期疗效及对血清肿瘤标志物和NRP-2的影响 被引量:3
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作者 许英艺 许丽贞 +2 位作者 卢伟 林智才 邱国钦 《现代生物医学进展》 CAS 2024年第16期3108-3112,3195,共6页
目的:对比研究FLOT方案与FOLFOX方案治疗中晚期胃癌(GC)的近远期疗效及对血清肿瘤标志物和NRP-2的影响。方法:选入我院2020年3月~2022年2月收治的82例中晚期GC患者,根据化疗方法不同分为FLOT组和FOLFOX组,各41例。比较两组的近远期疗效... 目的:对比研究FLOT方案与FOLFOX方案治疗中晚期胃癌(GC)的近远期疗效及对血清肿瘤标志物和NRP-2的影响。方法:选入我院2020年3月~2022年2月收治的82例中晚期GC患者,根据化疗方法不同分为FLOT组和FOLFOX组,各41例。比较两组的近远期疗效、血清肿瘤标志物和NRP-2水平;随访至2023年11月,记录两组患者生存状态并绘制Kaplan-Meier生存曲线。结果:FLOT组客观有效率显著高于FOLFOX组(85.37%vs.65.85%,P<0.05)。FLOT组治疗后血清癌胚抗原[(12.77±1.85)ng/m L vs.(20.69±2.58)ng/mL]、糖类抗原19-9[(20.46±5.20)U/m L vs.(29.41±8.04)U/m L]、糖类抗原125[(14.90±5.61)U/m L vs.(20.72±6.23)ng/mL]和NRP-2[(13.01±2.11)ng/mL vs.(15.23±2.25)ng/mL]水平均显著低于FOLFOX组,PFS[12.900(95%CI:12.183~13.617)个月vs.9.600(95%CI:8.471~10.729)个月]和OS[28.103(95%CI:25.209~30.996)个月vs.20.799(95%CI:18.482~23.115)个月]显著长于FOLFOX组(P<0.05)。两组疾病控制率和毒副反应发生率无显著差异(P>0.05)。结论:FLOT方案和FOLFOX方案均是中晚期GC的有效化疗方案,安全性一致,但前者在提高客观有效率、降低血清肿瘤标志物和NRP-2水平、延长生存期方面更具优势。 展开更多
关键词 中晚期胃癌 FLOT方案 FOLFOX方案 近远期疗效 血清肿瘤标志物 nrp-2
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大肠癌组织中NRP-2、NRP-1的表达及其与肿瘤淋巴结转移的相关性研究 被引量:12
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作者 徐卫国 王宇鹏 +7 位作者 孙红 王刚 陈源水 董洪超 苗娜 宋旭东 王瑞敏 刘和亮 《重庆医学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期382-384,387,共4页
目的检测大肠癌组织中NRP-2、NRP-1的表达情况,探讨NRP-2、NRP-1的表达与大肠癌淋巴结转移的关系,以期揭示NRP-2与NRP-1在大肠癌发生和发展过程中的作用。方法采用免疫组化法检测55例大肠癌患者大肠癌组织、癌旁组织中NRP-2、NRP-1的表... 目的检测大肠癌组织中NRP-2、NRP-1的表达情况,探讨NRP-2、NRP-1的表达与大肠癌淋巴结转移的关系,以期揭示NRP-2与NRP-1在大肠癌发生和发展过程中的作用。方法采用免疫组化法检测55例大肠癌患者大肠癌组织、癌旁组织中NRP-2、NRP-1的表达情况,并分析NRP-2、NRP-1的表达与大肠癌淋巴结转移的相关性。结果 (1)大肠癌组织中NRP-2的阳性表达率为81.8%,癌旁组织中的阳性表达率为14.5%,差异有统计学意义(χ2=58.49,P<0.01);大肠癌组织中NRP-2高表达组的淋巴结转移阳性例数显著多于NRP-2低表达组(χ2=10.69,P<0.01)。(2)大肠癌组织中NRP-1的阳性表达率为70.9%,癌旁组织中的阳性表达率为25.5%,差异有统计学意义(χ2=22.76,P<0.01);大肠癌组织中NRP-1高表达组的淋巴结转移阳性例数显著多于NRP-1低表达组(χ2=7.73,P<0.01)。(3)大肠癌组织中NRP-2、NRP-1均为高表达的患者淋巴结转移率显著高于均为低表达者(χ2=10.76,P<0.01)。结论 NRP-2、NRP-1的表达可能与大肠癌的发生和发展密切相关,并且可能有协同作用。 展开更多
关键词 大肠肿瘤 nrp 2 nrp-1 淋巴结转移
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Nrp1、Nrp2及SEMA3F在口腔癌组织及TCa、ACC细胞系中的表达及其可能的作用 被引量:11
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作者 陈洁 张红闯 +2 位作者 宋晓萌 叶金海 吴煜农 《口腔医学》 CAS 2009年第5期235-238,共4页
目的研究SEMA3F及其受体Nrp1和Nrp2在口腔癌组织和细胞(ACC2,ACCM和TCa)中的表达情况,并推测其在口腔癌生成中的可能意义。方法应用RT-PCR和Western bloting以及免疫组化法检测SEMA3F、Nrp1及Nrp2在口腔癌(ACC2,ACCMand TCa)组织和细胞... 目的研究SEMA3F及其受体Nrp1和Nrp2在口腔癌组织和细胞(ACC2,ACCM和TCa)中的表达情况,并推测其在口腔癌生成中的可能意义。方法应用RT-PCR和Western bloting以及免疫组化法检测SEMA3F、Nrp1及Nrp2在口腔癌(ACC2,ACCMand TCa)组织和细胞中的表达情况。结果在所有口腔癌组织和癌细胞中均可检测到Nrp1和Nrp2的表达,但Nrp2相对表达较弱。Western bolting、RT-PCR提示Nrp1呈高表达,Nrp2及SEMA3F均表达较低。在免疫组织化学中显示癌及癌周组织中Nrp1均呈高表达,且癌巢中的表达明显高于癌间隙组织,Nrp2及SEMA3F呈较弱表达。结论提示在肿瘤的发展进程中,Nrp1可能对肿瘤本身的发生,增殖及肿瘤的血管生成均可能起到了重要的作用。 展开更多
关键词 口腔肿瘤 SEMA3F nrp1 nrp2
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超声检测老年前列腺癌患者血流分级与术后组织中NRP1和NRP2的关系 被引量:1
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作者 林诗彬 吴晶晶 郑恩海 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第18期4558-4559,共2页
临床常通过血清学中前列腺特异抗原(PSA)等肿瘤相关标志物的检测以早期发现肿瘤,但由于其特异性差,使其在临床中的应用并不理想。研究显示前列腺癌发生中血管生成相对于正常组织来说明显增多。临床上观察血流最简便而无创的是彩色... 临床常通过血清学中前列腺特异抗原(PSA)等肿瘤相关标志物的检测以早期发现肿瘤,但由于其特异性差,使其在临床中的应用并不理想。研究显示前列腺癌发生中血管生成相对于正常组织来说明显增多。临床上观察血流最简便而无创的是彩色多普勒超声检测血流分级。神经纤毛蛋白(NRP)1和NRP2是内皮细胞表面的一种受体,其对肿瘤的进展和血管形成均有促进作用。在超声检测中的血流分级提示器官内的血液流量,由于超声检测的无创性,早期通过超声将血流分级与肿瘤组织中的NRP1和NRP2联系起来,可能对早期判断肿瘤的生物学行为有一定意义。本文关注血流分级与术后组织中NRP1和NRP2的关联性。 展开更多
关键词 前列腺癌 超声检测 血流分级 nrp1 nrp2 免疫组织化学技术
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抗人NRP1单克隆抗体的活性鉴定及初步应用 被引量:8
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作者 倪二茹 曾凡伟 +4 位作者 王生育 曹畅 吕莎 张海鹏 颜江华 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期651-655,共5页
目的鉴定抗人神经菌毛素1(neuropilin1,NRP1)单克隆抗体的生物活性并利用该抗体检测常见肿瘤细胞株NRP1蛋白的表达情况。方法腹水法制备4株抗NRP1单克隆抗体并用rProtein A亲和柱纯化抗体,间接ELISA检测4株抗体的滴度水平,Western blot... 目的鉴定抗人神经菌毛素1(neuropilin1,NRP1)单克隆抗体的生物活性并利用该抗体检测常见肿瘤细胞株NRP1蛋白的表达情况。方法腹水法制备4株抗NRP1单克隆抗体并用rProtein A亲和柱纯化抗体,间接ELISA检测4株抗体的滴度水平,Western blot分析4株抗体结合NRP1蛋白的特异性,流式细胞术分析4株抗体结合NRP1蛋白的亲和力,共聚焦免疫荧光实验进一步验证抗体结合NRP1蛋白的能力;细胞免疫组织化学染色检测14株肿瘤细胞表达NRP1蛋白的情况。结果 4株抗体均能特异结合NRP1蛋白,其中A6结合NRP1能力最强,能结合在表达NRP1蛋白的细胞膜表面。细胞免疫组织化学染色结果显示NRP1在HepG2、C6、HEK293、BEL-7402、MDA-MB-453呈高水平表达,在U87、MGC803、MCF7、MDA-MB-231中表达水平相对较弱,而在U251、BGC823、H6、HT-29的表达介于两者之间,在SMMC-7721细胞中未检测到表达。结论 4株抗NRP1单克隆抗体均能特异结合NRP1蛋白,多种肿瘤细胞株均不同程度表达NRP1蛋白,为进一步探讨NRP1蛋白与肿瘤发生发展的关系奠定了基础。 展开更多
关键词 nrp1 单克隆抗体 特异性 nrp1的表达 免疫细胞化学染色
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分离自黑茶的散囊菌属真菌中的NRPS基因的检测和分布 被引量:9
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作者 王晗 王永 +1 位作者 纪燕玲 王志伟 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期464-475,共12页
【目的】检测源自黑茶的散囊菌属分离菌株中的NRPS基因,推测它们相应的次级代谢产物合成能力,并考察了基于NRPS基因分布特征进行散囊菌属真菌遗传多样性分析的可能性。【方法】运用IQS法提取来自湖南、四川和湖北等地黑茶样品的14株散囊... 【目的】检测源自黑茶的散囊菌属分离菌株中的NRPS基因,推测它们相应的次级代谢产物合成能力,并考察了基于NRPS基因分布特征进行散囊菌属真菌遗传多样性分析的可能性。【方法】运用IQS法提取来自湖南、四川和湖北等地黑茶样品的14株散囊菌(Eurotium spp.)菌株的总DNA,利用特异性引物对菌株中11种NRPS基因片段进行PCR检测和序列分析,并结合UPGMA法分析了NRPS基因的分布。【结果】各菌株分别含有4 10个NRPS基因片段。NRPS7、CPS1基因在所有菌株中都可以检测到,而NRPS2、NRPS6基因则仅在个别菌株中检测到;其它NRPS基因的分布则呈现出多样性。来自同一块砖茶的菌株Fw-30813-7、Fw-30813-4、Fw-30813-1和Fw-30925-5之间,NRPS1、NRPS2、NRPS3、NRPS4和NRPS8五个基因的分布存在差异,显示出黑茶内散囊菌的遗传多样性。来自湖南白沙溪茶厂的茯砖样品的菌株Fa-20719-3不含有NRPS5和NRPS8基因;而从湖南益阳茶厂茯砖茶7个分离菌株中均含有这两种基因。不同地点加工出来的黑茶样品中的散囊菌菌株之间存在一些明显的遗传差异。【结论】首次从我国黑茶中的散囊菌属分离菌株中检测到NRPS基因,并推测了NRPS产物的多样性,展示了其多样化分布特征,提示NRPS基因的分析有可能成为衡量散囊菌遗传多样性的另一个尺度。 展开更多
关键词 黑茶 散囊菌属 nrpS基因 分布特征
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胃癌中VEGF、NRP1和干细胞标志物CD44的表达及相关性 被引量:12
11
作者 杨家佳 张琳 +3 位作者 郑茂金 王庆苓 徐玉婷 柳红 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期124-127,131,共5页
目的探讨VEGF、NRP1和干细胞标志物CD44在胃癌组织中的表达及三者间的相关性。方法应用高通量组织芯片技术和免疫组化SP法检测72例胃癌和52例正常胃组织中VEGF、NRP1和CD44蛋白的表达,并分析三者之间的相关性以及与胃癌临床病理特征的... 目的探讨VEGF、NRP1和干细胞标志物CD44在胃癌组织中的表达及三者间的相关性。方法应用高通量组织芯片技术和免疫组化SP法检测72例胃癌和52例正常胃组织中VEGF、NRP1和CD44蛋白的表达,并分析三者之间的相关性以及与胃癌临床病理特征的关系。结果 (1)胃癌组织中VEGF、NRP1和CD44蛋白阳性率分别为76.4%、66.7%、83.3%,三者在胃癌组织中的表达显著高于正常胃组织,差异均具有统计学意义(P均<0.01)。(2)VEGF、NRP1蛋白表达与胃癌浸润深度、淋巴结转移、临床分期有关(P均<0.05);CD44表达与Lauren分型、分化程度、淋巴结转移、临床分期有关(P均<0.05)。(3)胃癌组织中VEGF、NRP1和CD44蛋白的表达均呈正相关(rs=0.578,rs=0.278,rs=0.316,P均<0.05)。结论 VEGF、NRP1和干细胞标志物CD44在胃癌中均呈高表达,且与胃癌的恶性生物学行为密切相关。VEGF与NRP1之间可能存在协同作用,二者均与干细胞标志物CD44的表达密切相关,其具体机制有待进一步研究。 展开更多
关键词 胃肿瘤 VEGF nrp1 CD44 组织芯片
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海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组新颖PKS和NRPS基因簇的发掘 被引量:5
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作者 房耀维 刘姝 +5 位作者 王淑军 吕明生 焦豫良 陈国强 潘建梅 牛军 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期48-57,共10页
利用基因组发掘技术,从海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组序列中发掘新颖PKS和NRPS基因簇,并初步预测基因簇对应产物,为新颖聚酮化合物的发现,基因簇的异源表达和利用组合生物合成技术对化合物结构进行改造提供信息。... 利用基因组发掘技术,从海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组序列中发掘新颖PKS和NRPS基因簇,并初步预测基因簇对应产物,为新颖聚酮化合物的发现,基因簇的异源表达和利用组合生物合成技术对化合物结构进行改造提供信息。在利用anti SMASH对S.arenicola CNS 205和S.arenicola CNP193次级代谢产物基因簇进行预测,并经过NRPS-PKS knowledgebase验证的基础上,以S.arenicola CNS 205基因簇为对照,初步选择新颖基因簇;进一步用NCBI Blast和Nap Dos分析判断基因簇的新颖性后获得3个新颖基因簇:基因簇7,基因簇10和基因簇20。结合anti SMASH对基因簇核心结构的预测和与已知功能同源性基因簇,NCBI Blast比对的同源序列,以及Nap Dos对个基因簇中KS domain和C domain的进化分析等信息,初步表明基因簇7和基因簇20的对应产物分别为烯二炔类和有半胱氨酸及其他氨基酸参与合成的肽类化合物。由于基因簇10得到的信息较少,不能预测其代谢产物。 展开更多
关键词 基因簇发掘 新颖PKS基因簇 新颖nrpS基因簇 产物预测
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siRNA靶向NRP-1基因沉默经Wnt、ROS及TGF-β1途径抑制宫颈癌细胞增殖 被引量:10
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作者 李慧敏 王晓霞 +3 位作者 武美丽 金莉娅 苗丽娟 孙礼 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1626-1631,共6页
目的:探讨RNA干扰神经纤毛蛋白1(NRP-1)基因对宫颈癌细胞凋亡、ROS水平及免疫分子表达的影响。方法:以人正常宫颈细胞Ect1/E6E7为对照细胞,Western blot检测宫颈癌Hela、Ca Ski、Si Ha、HCC94细胞NRP-1的蛋白表达;通过Lipofectamine^(TM... 目的:探讨RNA干扰神经纤毛蛋白1(NRP-1)基因对宫颈癌细胞凋亡、ROS水平及免疫分子表达的影响。方法:以人正常宫颈细胞Ect1/E6E7为对照细胞,Western blot检测宫颈癌Hela、Ca Ski、Si Ha、HCC94细胞NRP-1的蛋白表达;通过Lipofectamine^(TM)2000将NRP-1-siRNA瞬时转染Ca Ski细胞,并设置阴性对照组(NC-siRNA)和空白对照组(Control组),转染48 h后,CCK8法检测各组细胞活力;流式细胞仪检测各组细胞凋亡率及ROS含量; Western blot检测免疫抑制因子TGF-β1及Wnt信号通路相关蛋白Wnt1、β-catenin、Survivin和Cyclin D1的蛋白表达。结果:宫颈癌细胞中NRP-1的表达均显著高于在Ect1/E6E7细胞中的表达(P<0. 05);转染NRP-1-siRNA的Ca Ski细胞NRP-1的蛋白表达显著低于对照组(P<0. 05);与对照组比较,NRP-1-siRNA组细胞活力显著降低,细胞凋亡率及ROS含量均显著升高,TGF-β1、Wnt1、β-catenin、Survivin和Cyclin D1的蛋白表达均显著降低(P<0. 05)。结论:抑制宫颈癌中NRP-1基因表达可降低癌细胞活力,诱导细胞凋亡,降低免疫抑制分子TGF-β1表达,其机制与提高细胞ROS水平和下调Wnt信号通路有关。 展开更多
关键词 nrp-1基因 宫颈癌 凋亡 ROS水平 免疫
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结肠癌组织NRP2的表达与淋巴结转移的关系 被引量:9
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作者 周琪 梁后杰 +5 位作者 阎晓初 彭秋平 周进明 吴峰 龙艺 刘以淑 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2009年第9期797-802,共6页
目的:探讨结肠癌组织中NRP2的表达在淋巴管生成和转移中的作用。方法:采用免疫组化法、RT-PCR法检测结肠癌组织中NRP2和VEGF-C的表达,以及结肠癌组织淋巴管的免疫组化标记和微淋巴管密度(MLD)计数。结果:结肠癌组织周围区域(48.8±2... 目的:探讨结肠癌组织中NRP2的表达在淋巴管生成和转移中的作用。方法:采用免疫组化法、RT-PCR法检测结肠癌组织中NRP2和VEGF-C的表达,以及结肠癌组织淋巴管的免疫组化标记和微淋巴管密度(MLD)计数。结果:结肠癌组织周围区域(48.8±23.5)、表浅区域(24.6±10.1)和肿瘤中心(11.3±7.7)MLD存在显著差异(P<0.05);结肠癌组织NRP2的mRNA水平为0.87±0.26,高于正常组织0.38±0.12,转移组的mRNA水平为1.12±0.25,也高于非转移组的0.76±0.19(P<0.01)。NRP2表达定位于结肠癌细胞浆和部分淋巴管内皮细胞浆,阳性率为34.8%;其表达与肿瘤边缘及标记部位MLD呈正相关(r=0.432,P<0.01),并与肿瘤的淋巴结转移、分化程度、Dukes分期和浸润深度相关(P<0.05),与VEGF-C的表达亦呈正相关(r=0.606,P=0.001)。结论:NRP2表达可能对结肠癌局部淋巴管生成及淋巴结转移起到重要的作用。 展开更多
关键词 nrp2 VEGF-C 淋巴管生成 转移
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哈茨木霉基因组中NRPS基因多样性的生物信息学分析 被引量:5
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作者 原晓龙 赵能 +3 位作者 陈剑 王娟 杨宇明 王毅 《西部林业科学》 CAS 2017年第4期7-12,17,共7页
为了解哈茨木霉中非核糖体肽的生物合成,本文通过本地BLAST、结构域分析结合抗生素和次生代谢产物分析软件(antiSMASH)、天然产物结构域查找软件(NaPDoS)等次生代谢产物生物合成基因分析工具对哈茨木霉基因组中的非核糖体肽合成酶NRPS... 为了解哈茨木霉中非核糖体肽的生物合成,本文通过本地BLAST、结构域分析结合抗生素和次生代谢产物分析软件(antiSMASH)、天然产物结构域查找软件(NaPDoS)等次生代谢产物生物合成基因分析工具对哈茨木霉基因组中的非核糖体肽合成酶NRPS基因进行分析,通过本地BLAST获得42个可能具有NRPS基因的重叠群(contig),开放阅读框及结构域分析显示具A-T-C(A为腺苷酰化结构域、T为肽酰基载体蛋白结构域,又称为PCP结构域、C为缩合结构域)3个结构域的蛋白序列有21条;antiSMASH分析结果显示其基因组中合成NRPs的基因簇有10个;NaPDoS和聚类分析结果表明哈茨木霉中的NRPS基因催化合成的NRPs包括铁载体类、毒素类、抗生素类及一些未知化合物。 展开更多
关键词 哈茨木霉 基因组发掘 nrpS基因多样性 生物信息学分析
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NRP-1在胃癌组织及细胞系中的表达及临床意义 被引量:9
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作者 张立 张迪 +5 位作者 周培华 王孝珑 王炜 陈南征 李孝彬 孙学军 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期82-86,共5页
目的研究神经纤毛蛋白1(NRP-1)在胃癌组织的表达,探讨其与胃癌发生、发展及临床病理因素的关系及可能的临床意义。方法应用免疫组织化学染色检测180例胃癌患者的胃癌组织及癌旁组织标本NRP-1表达,用免疫印迹方法检测胃癌组织及不同分化... 目的研究神经纤毛蛋白1(NRP-1)在胃癌组织的表达,探讨其与胃癌发生、发展及临床病理因素的关系及可能的临床意义。方法应用免疫组织化学染色检测180例胃癌患者的胃癌组织及癌旁组织标本NRP-1表达,用免疫印迹方法检测胃癌组织及不同分化程度的胃癌细胞NRP-1表达,K-M生存曲线和多因素回归模型用于分析胃癌预后。结果胃癌组织中NRP-1表达水平明显高于癌旁组织(P<0.001),胃癌组织中NRP-1高表达与肿瘤分化程度、淋巴结转移、AJCC分期、T分期呈正相关(P<0.05)。多因素生存分析表明高表达NRP-1是胃癌患者总生存期的独立预后因子。结论过表达NRP-1可能在胃癌进展中发挥着重要作用,过表达NRP-1可作为生物标志物预测胃癌患者的不良预后。 展开更多
关键词 神经纤毛蛋白-1(nrp-1) 胃癌 免疫组织化学 免疫印迹 生存曲线 多因素回归模型
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NRP2表达抑制对结肠癌细胞LoVo移植瘤淋巴管生成和转移的影响 被引量:6
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作者 周琪 梁后杰 +5 位作者 阎晓初 彭秋平 周进明 吴峰 高俊勇 刘以淑 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2009年第6期481-486,共6页
目的:探讨抑制Neuropilins-2(NRP2)基因表达对结肠癌淋巴管生成和转移的影响。方法:采用RNA干扰(RNAi)下调结肠癌LoVo细胞株NRP2表达,接种NRP2 RNAi的LoVo细胞株于裸鼠,建立裸鼠结肠癌结肠原位移植瘤模型,分别观察移植后4、6、8和12周... 目的:探讨抑制Neuropilins-2(NRP2)基因表达对结肠癌淋巴管生成和转移的影响。方法:采用RNA干扰(RNAi)下调结肠癌LoVo细胞株NRP2表达,接种NRP2 RNAi的LoVo细胞株于裸鼠,建立裸鼠结肠癌结肠原位移植瘤模型,分别观察移植后4、6、8和12周裸鼠结肠原位移植瘤淋巴管生成以及转移的情况。结果:成功建立结肠癌裸鼠原位移植瘤动物模型。下调结肠癌LoVo细胞株NRP2表达能显著降低裸鼠结肠原位移植瘤的淋巴管密度以及远处转移。结论:抑制NRP2表达可以抑制结肠癌的淋巴管生成和转移,它将是一个潜在的肿瘤治疗靶点。 展开更多
关键词 nrp2 RNA干扰 移植瘤 淋巴管生成 转移
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长松萝中非核糖体肽合成酶NRPS基因克隆与鉴定 被引量:3
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作者 原晓龙 陈剑 +3 位作者 张传光 毕玮 王娟 王毅 《西部林业科学》 CAS 2016年第1期14-20,24,共8页
非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(Us NRPS),并对得到的Us NRPS进行生物信息学分析、... 非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(Us NRPS),并对得到的Us NRPS进行生物信息学分析、分子系统进化分析及基因表达分析。结果表明:在地衣型真菌中,非核糖体肽在长松萝中为首次发现,BLAST比对表明其为NRPS基因的A结构域,生物信息学分析显示Us NRPS蛋白是一种非分泌蛋白,位于细胞质基质中;分子进化分析显示Us NRPS与埃默森蓝状菌(Rasamsonia emersonii)的NRPS基因的A结构域蛋白聚为一类;RT-PCR分析表明:2%肌醇、10%甘露醇、2%山梨醇、2%葡萄糖、10%葡萄糖、0.2%谷氨酰胺、1%甘氨酸、0.2%丙氨酸能够诱导NRPS基因的轻微表达,2%、10%蔗糖和果糖均能诱导NRPS基因的强烈表达;0.2%、1%的天冬氨酸均抑制NRPS基因的诱导表达。 展开更多
关键词 长松萝 nrpS 基因克隆 生物信息学分析 分子系统进化分析 诱导表达
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NRP2及miR-486-5p在胃癌中的表达及临床意义 被引量:4
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作者 连海峰 李明 +3 位作者 刘成霞 贾兴芳 李丹 吴小翎 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期362-366,共5页
目的:检测神经纤毛蛋白-2(neuropilin-2,NRP2)和mi R-486-5p在胃癌组织中的表达,探讨其与胃癌淋巴结转移的关系。方法:收集65例胃癌组织及其配对癌旁正常粘膜组织,免疫组织化学法检测组织中NRP2的表达,real-time PCR检测mi RNA-486-5p... 目的:检测神经纤毛蛋白-2(neuropilin-2,NRP2)和mi R-486-5p在胃癌组织中的表达,探讨其与胃癌淋巴结转移的关系。方法:收集65例胃癌组织及其配对癌旁正常粘膜组织,免疫组织化学法检测组织中NRP2的表达,real-time PCR检测mi RNA-486-5p的表达,免疫组织化学法检测D2-40标记的微淋巴管密度(microlymphatic density,MLD),统计分析NRP2、mi R-486-5p的表达与MLD相关性。结果:免疫组化提示NRP2在肿瘤中表达增高(78.5%vs.29.2%,χ2=16.046,P=0.000),且与淋巴结转移密切相关(χ2=7.222,P=0.007)。real-time PCR结果显示肿瘤组织mi R-486-5p表达明显下调(0.39±0.16 vs.1.00±0.06,P=0.000),NRP2的表达水平与MLD呈正相关(r=0.384,P=0.015),mi R-486-5p的表达水平与MLD呈负相关(r=-0.755,P=0.000)。结论:NRP2和mi R-486-5p与胃癌发生发展密切相关,有望成为胃癌治疗的新靶点。 展开更多
关键词 胃癌 nrp2 miR-486-5p 微淋巴管密度
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PKS-NRPS数据库的研究进展 被引量:8
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作者 姚琳 郭东林 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2009年第16期280-283,共4页
非核糖体多肽合成酶(NRPS)和聚酮合成酶(PKS)是调控次级代谢物聚酮类物质和非核糖体多肽合成的关键酶。据推测,至少有1000种聚酮/多肽化合物已经被发现,理论分析表明超过10亿的化合物能被合成。目前,国外通过高通量筛选、计算机预测-文... 非核糖体多肽合成酶(NRPS)和聚酮合成酶(PKS)是调控次级代谢物聚酮类物质和非核糖体多肽合成的关键酶。据推测,至少有1000种聚酮/多肽化合物已经被发现,理论分析表明超过10亿的化合物能被合成。目前,国外通过高通量筛选、计算机预测-文献挖掘等方法,获得了大批量的PKS/NRPS基因及化合物结构,并由此构建和开发了一些PKS/NRPS数据库和软件,作者分析了这些数据库包括Norine、NRPS-PKS、ASMPKS和软件Cluscan、Clusean的相关信息及并概述了这些数据库及软件的应用。 展开更多
关键词 PKS nrpS 数据库 生物信息学
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