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含有外周血游离DNA保存液的血细胞提取基因组DNA行NGS检测的可行性分析
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作者 黄伟业 黄建江 许洁 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第9期1245-1248,共4页
目的探讨外周血游离DNA保存液对血细胞基因组DNA(genome DNA,gDNA)提取及其行NGS检测的影响。方法选取37例血样,比较A组(血浆分离后剩余血细胞,保存于含外周血游离DNA保存液管中)与B组(配对的EDTA抗凝管保存的外周血)的gDNA在不同保存时... 目的探讨外周血游离DNA保存液对血细胞基因组DNA(genome DNA,gDNA)提取及其行NGS检测的影响。方法选取37例血样,比较A组(血浆分离后剩余血细胞,保存于含外周血游离DNA保存液管中)与B组(配对的EDTA抗凝管保存的外周血)的gDNA在不同保存时间(2 h与7天室温)提取质量差异,采用同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)的NGS检测提取gDNA,应用配对t检验分析数据。结果两组样本在2 h和7天室温保存后,核酸质量均符合NGS检测要求,HRR基因胚系检测结果一致,保存时间延长会升高DNA降解风险。结论采用含有外周血游离DNA保存液的采血管进行采血,可确保血浆分离后剩余血细胞提取的gDNA质量满足HRR基因NGS实验的质控要求。 展开更多
关键词 DNA提取 基因组DNA 外周血 ngs
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肺部感染病原体识别中的NGS与传统方法比较
2
作者 高佳乐 常小红 《临床医学进展》 2025年第9期636-644,共9页
肺部感染在免疫缺陷及老年患者中病死率高。传统检测方法存在周期长(48~72小时)、敏感性低、苛养菌检出困难及诊断窗口期等局限,导致治疗延误。高通量测序技术(next-generation sequencing, NGS)通过无偏倚检测总核酸,实现细菌、病毒、... 肺部感染在免疫缺陷及老年患者中病死率高。传统检测方法存在周期长(48~72小时)、敏感性低、苛养菌检出困难及诊断窗口期等局限,导致治疗延误。高通量测序技术(next-generation sequencing, NGS)通过无偏倚检测总核酸,实现细菌、病毒、真菌和寄生虫同步识别,使病原体检出率提升20%~30%,对混合感染、罕见病原体及抗生素预处理样本优势显著,检测时效缩至24~48小时。其敏感性优于传统方法,但低生物量样本仍受宿主核酸干扰;特异性依赖严格生物信息学分析,需结合临床区分致病菌与定植菌。该技术使病毒检出率提升28%,显著提高免疫抑制患者罕见病原识别能力;耐药基因检测灵敏度优于传统测序,但存在同源病毒分型误差及成本高昂问题。NGS通过快速精准诊断优化临床决策:提前指导靶向治疗使重症患者28天生存率提升30%,并推动抗生素精准使用。临床应用仍面临宿主核酸干扰、15%耐药基因沉默现象、成本高及标准化缺失等挑战。未来发展需采用分层诊断策略(高危患者首选宏基因组测序),推动CRISPR等多技术融合,依托医保政策支持协同价值。开发超低量测序、动态耐药库及解读系统,将促进该技术成为感染性疾病精准诊疗核心工具。 展开更多
关键词 肺部感染 ngs 病原体识别
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Exploring the utility of a NGS multigene panel to predict BCG response in patients with non-muscle invasive bladder cancer
3
作者 BELARDINILLI FRANCESCA MICHELA DE MEO +10 位作者 FRANCESCO DEL GIUDICE CARLO MARIA SCORNAJENGHI PAOLA GAZZANIGA ETTORE DE BERARDINIS LUCA MARINO FABIO MASSIMO MAGLIOCCA BENJAMIN INBEH CHUNG JANŁASZKIEWICZ VALENTINA MAGRI GIUSEPPE GIANNINI CHIARA NICOLAZZO 《Oncology Research》 2025年第3期723-731,共9页
Objectives:Intravesical Bacillus Calmette-Guérin(BCG)therapy is a gold standard for patients with high-risk non-muscle invasive bladder cancer(NMIBC).Although a long-lasting therapeutic response is observed in mo... Objectives:Intravesical Bacillus Calmette-Guérin(BCG)therapy is a gold standard for patients with high-risk non-muscle invasive bladder cancer(NMIBC).Although a long-lasting therapeutic response is observed in most patients,BCG failure occurs in 30%–50%of patients and a progression to muscle-invasive disease is found in 10%–15%.Therefore,predicting high-risk patients who might not benefit from BCG treatment is critical.The purpose of this study was to identify,whether the presence of specific oncogenic mutations might be indicative of BCG treatment response.Methods:Nineteen high-grade NMIBC patients who received intravesical BCG were retrospectively enrolled and divided into“responders”and“non-responders”groups.Tissue samples from transurethral resection of bladder cancer were performed before starting therapy and were examined using a multigene sequencing panel.Results:Mutations in TP53,FGFR3,PIK3CA,KRAS,CTNNB1,ALK and DDR2 genes were detected.TP53 and FGFR3 were found to be the most frequently mutated genes in our cohort(31.6%and 26.3%,respectively),followed by PIK3CA(15.8%).In the BCG-responsive patient group,90%of samples were found to have mutated genes,with almost 50%of them showing mutations in tyrosine kinase receptors and CTNNB1 genes.On the other hand,in the BCG-unresponsive group,we found mutations in 44.4%of samples,mainly in TP53 gene.Conclusions:Our findings suggest that a Next-Generation Sequencing(NGS)multigene panel is useful in predicting BCG response in patients with NMIBC. 展开更多
关键词 Non-muscle invasive bladder cancer(NMIBC) Bacillus Calmette-Guerin(BCG) MACROPINOCYTOSIS Molecular profile Next-generation sequencing(ngs)
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基于NGS数据的拷贝数变异检测技术
4
作者 张航 《科技创业月刊》 2025年第S2期113-115,共3页
拷贝数变异是基因组中常见变异类型,拷贝数的增加或减少与多种疾病相关,因此对拷贝数变异的检测对多种疾病的诊断、治疗和预后判断具有重要价值。基于二代测序技术的拷贝数变异可以仅通过数据分析的同时获得样本点变异和拷贝数变异情况... 拷贝数变异是基因组中常见变异类型,拷贝数的增加或减少与多种疾病相关,因此对拷贝数变异的检测对多种疾病的诊断、治疗和预后判断具有重要价值。基于二代测序技术的拷贝数变异可以仅通过数据分析的同时获得样本点变异和拷贝数变异情况,在成本上有具有明显优势。二代测序数据可以通过基于reads深度、基于双末端映射、基于拆分reads、基于从头拼接等不同原理对拷贝数变异进行分析。目前业内使用的主流方法为基于reads深度的拷贝数变异分析,随着技术进步,逐渐发展出针对测序深度、CG含量等因素的矫正方法,针对高度同源区域的处理方法,并融合多种不同算法对拷贝数变异进行分析。随着基于二代测序数据的拷贝数变异分析方法的进步,该技术也被越来越多的应用于实践之中。 展开更多
关键词 二代测序 拷贝数变异 ngs数据
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NGS资料在老地层中的应用 被引量:3
5
作者 王宣龙 张德峰 张福来 《测井技术》 CAS CSCD 北大核心 1997年第4期280-283,共4页
王宣龙,张德峰,张福来.NGS资料在老地层中的应用.测井技术,1997,21(4):280~283自然伽马能谱(NGS)测井作为一种特殊的测井方法,在研究老地层的一些地质问题上具有一定的实用性。以埕北30井和胜海古2... 王宣龙,张德峰,张福来.NGS资料在老地层中的应用.测井技术,1997,21(4):280~283自然伽马能谱(NGS)测井作为一种特殊的测井方法,在研究老地层的一些地质问题上具有一定的实用性。以埕北30井和胜海古2井为例,运用自然伽马能谱测井资料,采用交会图等技术,评价下古生界碳酸盐岩地层的沉积环境、粘土矿物的类型。 展开更多
关键词 ngs测井 老油气层 沉积环境 生油岩评价
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下一代测序(NGS)技术的发展及在肿瘤研究的应用 被引量:40
6
作者 邵向阳 徐伟文 《分子诊断与治疗杂志》 2016年第5期289-296,共8页
下一代测序(next-generation sequencing,NGS)由于高灵敏度、高通量、高度自动化等特性,近年来在疾病的研究和诊断治疗中越来越多地被应用。下一代测序技术的发展为肿瘤分子生物学的研究提供了新的手段。本文就下一代测序技术的种类、... 下一代测序(next-generation sequencing,NGS)由于高灵敏度、高通量、高度自动化等特性,近年来在疾病的研究和诊断治疗中越来越多地被应用。下一代测序技术的发展为肿瘤分子生物学的研究提供了新的手段。本文就下一代测序技术的种类、特点、发展趋势及其在肿瘤研究中的应用作简要的综述。 展开更多
关键词 下一代测序(ngs) 肿瘤 精准医疗
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NGS在HLA基因分型中的应用 被引量:5
7
作者 邹义洲 郭靖 《中国输血杂志》 CAS 北大核心 2015年第10期1211-1213,共3页
本文旨在介绍下一代测序(NGS)方法的原理,使用流程及现阶段存在的问题,强调这种方法在对人类白细胞抗原(HLA)基因分析中的应用,及其推广的价值。
关键词 下一代测序(ngs) 人类白细胞抗原(HLA) 基因测序/分型 高通量筛选
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NGS分析教学实操平台的开发与应用 被引量:1
8
作者 王晶 刘旭 +1 位作者 段荦 程杉 《医学教育管理》 2022年第5期536-541,共6页
随着测序技术的发展和成本的大幅降低,数据大量累积,对测序数据的生物信息学分析需求持续增加。DNA测序和RNA测序基础分析逐渐形成了通用的标准化规范,同时,随着个人计算机运算能力的提升,使得过去许多专业的数据分析已向用户自助操作... 随着测序技术的发展和成本的大幅降低,数据大量累积,对测序数据的生物信息学分析需求持续增加。DNA测序和RNA测序基础分析逐渐形成了通用的标准化规范,同时,随着个人计算机运算能力的提升,使得过去许多专业的数据分析已向用户自助操作转变。为解决在医学院校教学中,常用二代测序(NGS)数据分析中所遇到软硬件门槛,及相关专业基础较薄弱等问题,为高通量测序数据分析课程的实操环节专门开发的、具有图形界面的、全Window环境的软件平台BIONEO,在实际测试和运行中获得了良好的教学效果及反馈评价。该系统不仅为解决生物信息学实验教学中的常见问题提供了一个有效的解决方案,还可以使学生在完成有效和良好体验培训的同时,直接利用本软件提供的环境尝试解决一些科研实践中的具体操作问题。 展开更多
关键词 ngs测序数据分析 生物信息学 软件开发 实验课教学 教学改革 医学遗传学
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VLBI MK3数据库格式到NGS格式的转换 被引量:1
9
作者 王广利 《中国科学院上海天文台年刊》 1996年第17期332-337,共6页
本文通过对MK3数据库的结构分析以及与NGS格式文件的比较,描述了从MK3数据库格式转化到NGS格式的格式转换程序DB2NGS的开发思想,并给出了一个示范结果。通过在微机上的KVLBI软件的运行证明了转换是成功的。
关键词 甚长基线干涉测量 天文数据库 程序设计 ngs格式转换
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基于RNA-based NGS检测非小细胞肺癌融合基因临床实践中国专家共识 被引量:19
10
作者 中国初级卫生保健基金会肿瘤精准诊疗专业委员会 中国抗癌协会肿瘤精准治疗专业委员会 +7 位作者 中国抗癌协会肿瘤病理专委会肺癌学组 钟华 韩宝惠 林冬梅 周清华 宋勇 周晓燕 周清 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期801-812,共12页
基于RNA水平的二代测序(RNA-based next-generation sequencing, RNA-based NGS)技术已被非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)临床实践指南和专家共识推荐为融合基因的检测方法之一。NSCLC可用药靶点主要包括基因突变和融... 基于RNA水平的二代测序(RNA-based next-generation sequencing, RNA-based NGS)技术已被非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)临床实践指南和专家共识推荐为融合基因的检测方法之一。NSCLC可用药靶点主要包括基因突变和融合,用于评估靶向治疗可行性的基因突变和融合基因检测均不可或缺。目前,基于DNA水平的NGS(DNA-based NGS)结合RNA-based NGS一次性同步检测基因突变和融合的技术已部分应用于临床实践。然而,RNA-based NGS检测融合基因的应用时机、应用场景和质控方面在我国仍缺乏规范和标准。本共识将进一步明确RNA-based NGS在融合基因检测中的应用时机、应用场景和质控,并给予指导性建议,推动RNA-based NGS在NSCLC临床诊疗中的应用,使患者能够最大程度地从融合基因检测中获益。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 融合基因 RNA-based ngs 靶向治疗 专家共识
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Meetings
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《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2006年第1期160-160,共1页
MAJOR MEETINGS COMING UPDigestive Disease Week107th Annual Meeting of AGA,The AmericanGastroenterology AssociationMay 20-25,2006Loas Angeles Converntion Center,Californiawww.ddw.
关键词 ngs Meetings
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The experience of professor YIN Ke-jing in the treatment of abdominal distension after abdominal surgery with warming-needle moxibustion at Gōngsūn(公孙 SP 4) 被引量:2
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作者 符奇飞 段碧锋 +9 位作者 张倩 李敏 刘继华 张保平 寇久社 张润宁 丁天红 安国松 张鸿 殷克敬 《World Journal of Acupuncture-Moxibustion》 CSCD 2017年第2期74-76,共3页
Objective To introduce the experience of professor YIN Ke-jing,a national senior and famous doctor of traditional Chinese medicine,in treatment of abdominal distension after abdominal surgery with warming-needle moxib... Objective To introduce the experience of professor YIN Ke-jing,a national senior and famous doctor of traditional Chinese medicine,in treatment of abdominal distension after abdominal surgery with warming-needle moxibustion at Gōngsūn(公孙 SP 4).Methods Bilateral SP 4 were selected,and warming-needle moxibustion was adopted.The treatment was conducted for twice a day,and treatment for 3 days was considered as 1 course of treatment.The efficacy was evaluated after 2 courses.Results The total effective rate was 96.9% of the 32 patients after treatment and observation for 2 courses.Conclusion This therapeutic method was easy and simple with less acupoints selected and rapid onset of effect.With definite clinical efficacy,this method was worthy of being popularized. 展开更多
关键词 ngsūn(公孙 SP 4) warming-needle moxibustion abdominal distension after abdominal surgery
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基于NGS技术及PD-1/PD-L1检测对同时性多原发肺癌的诊断价值初探 被引量:4
13
作者 谢春莹 蔡河源 +2 位作者 饶冰玉 雷艺炎 罗红鹤 《热带医学杂志》 CAS 2020年第10期1267-1271,F0003,共6页
目的基于二代基因测序(NGS)技术及程序性死亡受体-1/程序性死亡受体配体-1(PD-1/PD-L1)检测对同时性多原发肺癌(sMPLC)组织的基因分子特征进行分析及分子诊断进行探索。方法收集2018年7月至2019年11月于中山大学附属第一医院胸外科确诊... 目的基于二代基因测序(NGS)技术及程序性死亡受体-1/程序性死亡受体配体-1(PD-1/PD-L1)检测对同时性多原发肺癌(sMPLC)组织的基因分子特征进行分析及分子诊断进行探索。方法收集2018年7月至2019年11月于中山大学附属第一医院胸外科确诊为同时性多原发肺癌患者组织标本及临床资料,通过NGS及免疫组化Elivision法检测sMPLC中PD-1和PD-L1蛋白的表达,分析其基因突变情况及PD-1/PD-L1蛋白表达情况。结果PD-1在sMPLC组织中阳性表达率为92.9%(13/14),PD-L1在sMPLC组织中阳性表达率为85.7%(12/14)。同一患者不同病灶之间表达不一致率为71.5%。在sMPLC肿瘤细胞中PD-1蛋白表达量与在细胞间质中的淋巴细胞中PD-1蛋白表达量差异有统计学意义(P=0.01),突变频率最高的基因为表皮生长因子受体(EGFR)基因,频率83.3%(10/12)。以21外显子EGFR L858R频率最高(7/10),sMPLC驱动基因突变均合并有伴随突变,同一患者的不同病灶之间有存在相同的伴随突变均为单核苷酸位点突变(SNV),未发现拷贝数变异(CNA)和基因重排或基因融合的共同伴随突变。sMPLC病灶中肿瘤突变负荷(TMB)值差异有统计学意义(P=0.02),且PD-L1在sMPLC组织中的表达量与TMB值呈正相关(r=0.609,P=0.036)。结论基于大panel的NGS测序及PD-1和PD-L1的检测,对于同时性多原发肺癌的诊断及后续的靶向及免疫治疗的评估有着一定的临床参考意义。 展开更多
关键词 同时性多原发肺癌 二代基因测序(ngs) PD-1 PD-L1
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斑马鱼ngs基因突变对骨骼发育的影响 被引量:1
14
作者 董乐 佟广香 +5 位作者 闫婷 杨笑星 孙志鹏 徐欢 唐国盘 匡友谊 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1403-1415,共13页
脊索颗粒表面(notochord granular surface,ngs)基因是维持脊椎动物脊索正常发育和稳定的必需基因,然而却在镜鲤(Cyprinus carpio)肌间刺和椎骨组织中显著表达,暗示其可能与肌间刺和椎骨的发育有关。为探索ngs基因对肌间刺和主轴骨骼发... 脊索颗粒表面(notochord granular surface,ngs)基因是维持脊椎动物脊索正常发育和稳定的必需基因,然而却在镜鲤(Cyprinus carpio)肌间刺和椎骨组织中显著表达,暗示其可能与肌间刺和椎骨的发育有关。为探索ngs基因对肌间刺和主轴骨骼发育的影响,本研究以斑马鱼(Danio rerio)为实验对象,首先采用RNA荧光原位杂交(RNA fluorescence in situ hybridization,RNA-FISH)证实了ngs基因与成骨细胞标志性基因sp7在肌间刺和椎骨组织中共表达。其次利用CRISPR/Cas9构建了ngs基因突变体,胚胎发育观察显示ngs基因突变导致斑马鱼脊索发育异常,72 hpf(hours post fertilization,受精后小时数)的ngs^(-/-)胚胎体长显著低于野生型胚胎的体长(P<2.22×10^(-16));90 dph(days post hatching,孵化后天数)的突变体骨骼染色表明ngs^(-/-)椎骨异常融合,肌间刺数量显著少于野生型的(P<0.05)。进一步采用RT-qPCR分析了12个骨骼发育相关基因在5个胚胎时期(12 hpf体节期、24 hpf咽囊期、36 hpf原基-25期、48 hpf孵化期和72 hpf早幼期)和90 dph成鱼组织(骨骼和肌肉)中的表达。结果表明,突变体中BMP和SMAD家族相关基因和成骨细胞标志基因的表达量在胚胎发育后期显著下调(P<0.05),但12个基因在突变体和野生型成鱼骨骼组织中的表达量无明显差异(P>0.05)。在90 dph成鱼肌肉组织中,除bmp2b、smad5和runx2b在ngs^(-/-)中的表达量显著低于野生型的(P<0.05)外,其他基因的表达量无显著差异。综上,ngs基因突变导致了脊索发育异常,进而致使椎骨发育畸形,生长发育减缓,同时造成了肌间刺数量的减少;基因表达分析结果表明,ngs基因突变可能在胚胎期通过影响BMP信号通路相关基因的表达使胚胎成骨作用减弱,椎骨发育异常,而在胚后发育阶段可能通过影响肌肉中bmp2b、smad5和runx2b基因的表达从而影响肌间刺的数量。 展开更多
关键词 斑马鱼 ngs RNA-荧光原位杂交 CRISPR/Cas9 骨骼发育 肌间刺
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南方NGS200应用实践中的若干问题
15
作者 李玉宝 《四川测绘》 2004年第1期39-41,共3页
对南方NGS200在工程控制测量领域应用实践中的一些问题作了阐述,提出了一些见解和措施。
关键词 工程控制测量 南方ngs200单频静态GPS接收机 GPS网型 抗干扰试验
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基于NGS方法构建人类STR、SNP联合检测体系及其性能研究 被引量:2
16
作者 聂昊 申君毅 +10 位作者 郑立 郭茂平 李梦 王蓉 吴轩 陈浩东 张凯凯 李琛 胡欢 郭晋荣 杨瑞琴 《中国法医学杂志》 CSCD 2023年第2期161-165,共5页
目的 使用NGS方法构建人类STR和SNP遗传标记联合检测体系,并对体系性能做出评价。方法 通过两轮PCR方法构建了同时检测78个STR和233个SNP的测序文库,通过覆盖度和均衡性评价了panel体系,并且开发新的侧翼检测和分型方法从灵敏度、准确... 目的 使用NGS方法构建人类STR和SNP遗传标记联合检测体系,并对体系性能做出评价。方法 通过两轮PCR方法构建了同时检测78个STR和233个SNP的测序文库,通过覆盖度和均衡性评价了panel体系,并且开发新的侧翼检测和分型方法从灵敏度、准确性、适用PCR机型、种属特异性、检材类型、模拟降解检材、混合样本区分、批量样本的表现等方面对体系的效能进行了研究。结果 该体系表现较高覆盖度和准确性。新的分析方法,使得在真实检材样本中和CE的一致率超过99.6%。本体系适用广泛的PCR机型和多种检材类型;SNP灵敏度可达到0.1 ng,STR在投入量为0.5 ng时,检出率依然可以达到93.3%;非人物种的干扰几乎为0;能够有效的区分低频率的混合样本(低于1:19)。结论 上述结果表明该体系具有较好的性能,可用于法庭科学实际案件或数据库建设的检测。 展开更多
关键词 法医遗传 高通量测序ngs STR SNP 效能验证 法医学应用
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NGS检测乙型肝炎病毒耐药基因突变情况及其临床意义 被引量:2
17
作者 王创俊 王庆 +1 位作者 曹治家 杨学习 《分子诊断与治疗杂志》 2017年第1期28-32,共5页
目的检测乙型肝炎患者的HBV YMDD突变情况,探究下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)检测HBV耐药基因突变的可行性及患者性别与其YMDD突变的相关性,并为临床用药提供参考。方法运用NGS测序技术对收集的100例临床样本进行HBV ... 目的检测乙型肝炎患者的HBV YMDD突变情况,探究下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)检测HBV耐药基因突变的可行性及患者性别与其YMDD突变的相关性,并为临床用药提供参考。方法运用NGS测序技术对收集的100例临床样本进行HBV YMDD突变的检测,并与临床检测金标准Sanger测序法的测序结果进行比对。结果运用NGS检测100例HBV样本,其中YMDD野生型88例,HBV YMDD耐药基因突变12例,与Sanger测序法的测序结果完全相符。结论本研究结果显示,NGS技术可用于HBV耐药基因突变检测,患者性别与HBV耐药突变无明显相关性。 展开更多
关键词 ngs HBV 耐药基因突变
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基于NGS技术的仔猪腹泻病毒检测
18
作者 罗文涛 何启盖 +2 位作者 陈芳洲 李静 周杰珑 《西南林业大学学报(自然科学)》 CAS 北大核心 2018年第4期112-118,共7页
为探究四川某猪场反复暴发仔猪腹泻的原因,利用下一代测序技术(NGS)对该猪场的仔猪肠道样品进行检测,结合常规PCR、测序方法进行验证分析。结果表明:该猪场存在猪流行性腹泻病毒PEDV,通过对该场PEDV S1基因的进化树分析,发现该PEDV毒株... 为探究四川某猪场反复暴发仔猪腹泻的原因,利用下一代测序技术(NGS)对该猪场的仔猪肠道样品进行检测,结合常规PCR、测序方法进行验证分析。结果表明:该猪场存在猪流行性腹泻病毒PEDV,通过对该场PEDV S1基因的进化树分析,发现该PEDV毒株属于独立的一个分支;同时还在该场病料中检测到猪圆环病毒3型(PCV3),该猪场腹泻问题可能是由于新型PEDV毒株和PCV3毒株混合感染导致。 展开更多
关键词 ngs 腹泻 病毒 PEDV PCV3
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气管镜联合肺泡灌洗液NGS检查在肺部感染的早期诊断及治疗中的应用 被引量:1
19
作者 毛静 陈国萍 《智慧健康》 2024年第7期164-167,共4页
目的 探讨气管镜联合肺泡灌洗液NGS检查在肺部感染的早期诊断及治疗中的应用。方法 选取2022年1月—2023年6月本院收治的75例肺部感染患者作为研究对象,随机将患者分为对照组与观察组,对照组(37例)采用气管镜检查,观察组(38例)采用气管... 目的 探讨气管镜联合肺泡灌洗液NGS检查在肺部感染的早期诊断及治疗中的应用。方法 选取2022年1月—2023年6月本院收治的75例肺部感染患者作为研究对象,随机将患者分为对照组与观察组,对照组(37例)采用气管镜检查,观察组(38例)采用气管镜联合肺泡灌洗液NGS检查,比较两种检查方法的诊断准确度,并观察两组患者的临床症状消失时间及炎症因子水平。结果 气管镜联合肺泡灌洗液NGS检测的诊断准确度高于气管镜检测;观察组的发热消失时间、咳嗽消失时间、咯痰消失时间、肺部啰音消失时间、住院时间显著低于对照组(P<0.05)。治疗前,两组的WBC、CRP、PCT水平相比无显著差异(P>0.05);治疗后,观察组患者的WBC、CRP、PCT水平显著低于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 气管镜联合肺泡灌洗液NGS检测在肺部感染的早期诊断中具有较高的准确度,能够缩短患者的临床症状消失时间和住院时间,并有助于更快速有效地降低炎症因子水平。 展开更多
关键词 气管镜 肺泡灌洗液ngs 肺部感染 早期诊断
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基于NGS的宏基因组学在微生物病原体鉴定中的应用 被引量:8
20
作者 刘悦 朱小亚 蒋析文 《热带医学杂志》 CAS 2019年第11期1446-1449,共4页
病原微生物广泛存在于自然环境,常对人类和动物的健康带来极大的伤害。传统病原微生物的鉴定方法主要基于微生物纯化培养和分离,但绝大多数微生物为非培养微生物,而目前应用较为广泛的免疫学方法和PCR技术等每次检测样品数量少且只能检... 病原微生物广泛存在于自然环境,常对人类和动物的健康带来极大的伤害。传统病原微生物的鉴定方法主要基于微生物纯化培养和分离,但绝大多数微生物为非培养微生物,而目前应用较为广泛的免疫学方法和PCR技术等每次检测样品数量少且只能检测已知病原体。宏基因组学技术以某特定环境中的微生物群体为研究对象,在非培养型微生物的鉴定中极具优势。下一代测序技术(NGS)的迅速发展极大的促进了宏基因组学的发展及应用,使得该技术迅速而又广泛的应用于各种环境微生物的研究中,并已渗透到医药、农业、生物技术等多个领域。宏基因组学在微生物病原体鉴定研究方面具有巨大的潜力和优势,本文就近几年基于NGS的宏基因组学在病原微生物鉴定相关研究进行概述。 展开更多
关键词 病原微生物 宏基因组学 ngs
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