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鸽NDRG3基因全长cDNA克隆、序列特征及组织表达分析
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作者 李芳君 樊家生 +8 位作者 段颖 兰美玉 张浪 陈岩 温泉 冉明霞 刘兴廷 冯春刚 陆阳清 《中国畜禽种业》 2025年第12期41-51,共11页
该试验采用RACE技术克隆银王鸽NDRG3基因全长cDNA并对其进行生物信息学分析;通过qRT-PCR探究NDRG3基因在90日龄银王鸽心脏、肺脏、脾脏、肾脏、胸肌及肝脏组织中的表达模式。结果显示:鸽NDRG3基因全长cDNA序列2575 bp,包含115 bp的5'... 该试验采用RACE技术克隆银王鸽NDRG3基因全长cDNA并对其进行生物信息学分析;通过qRT-PCR探究NDRG3基因在90日龄银王鸽心脏、肺脏、脾脏、肾脏、胸肌及肝脏组织中的表达模式。结果显示:鸽NDRG3基因全长cDNA序列2575 bp,包含115 bp的5'端非翻译区(5'Untranslated Region,5'UTR),1335 bp的3'UTR和1125 bp的编码区(CDS),共编码374个氨基酸。蛋白质二级结构分析结果显示,鸽NDRG3蛋白由α螺旋、β折叠和无规卷曲3种类型组成,占比分别为37.43%、9.09%和53.48%。序列比对分析结果显示,鸽NDRG3基因编码的氨基酸序列与其他动物的同源性超过75%,表明该基因在进化过程中具有高度保守性。qRT-PCR结果显示,鸽NDRG3基因在心脏、肺脏、脾脏、肾脏、胸肌及肝脏组织中均有表达,肺脏NDRG3基因mRNA相对表达量显著高于其他组织(P<0.05)。该研究成功克隆银王鸽NDRG3基因全长cDNA序列,该基因进化保守,且在心脏、肺脏、脾脏、肾脏、胸肌及肝脏组织中均有表达。 展开更多
关键词 ndrg3基因 基因克隆 序列特征分析 组织表达模式
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虚拟筛选竞争性抑制NDRG3与L-Lactate结合的小分子研究 被引量:5
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作者 曹洪玉 吴艳华 +2 位作者 周兴智 郑学仿 蒋革 《华南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2018年第3期58-64,共7页
竞争性抑制NDRG3(N-myc Downstream Regulated Gene 3)蛋白与L-Lactate结合可有效阻遏NDRG3介导的低氧反应.文中通过同源模建技术构建NDRG3蛋白的三维结构,并将L-Lactate对接到NDRG3蛋白的潜在活性位点中,发现L-Lactate主要通过与Asn133... 竞争性抑制NDRG3(N-myc Downstream Regulated Gene 3)蛋白与L-Lactate结合可有效阻遏NDRG3介导的低氧反应.文中通过同源模建技术构建NDRG3蛋白的三维结构,并将L-Lactate对接到NDRG3蛋白的潜在活性位点中,发现L-Lactate主要通过与Asn133、Ala162、His163、His164、Ser235、Pro236及Ala237等氨基酸相互作用结合于NDRG3.对近3 000个化合物进行虚拟筛选,选择4种竞争性抑制最强的化合物作为参考分子分析相互作用关系.结果发现:部分化合物和不同氨基酸能够通过不同的作用力与NDRG3蛋白结合,占据NDRG3蛋白的活性位点,从而竞争性抑制L-Lactate与NDRG3蛋白结合.例如,它们能够与Lys139、Asp143、His163、Arg203产生静电作用;它们与His163形成π-π堆积作用;它们与Phe165、Ala237等产生疏水作用;它们与Asn133、Asp135、Gly140、Arg203、Ser235、Ala237等形成氢键作用.以上数据表明:这些化合物可能成为阻遏NDRG3介导的低氧反应及靶向治疗低氧诱导疾病的候选药物. 展开更多
关键词 ndrg3 L-LACTATE 竞争性抑制剂 同源模建 分子对接 虚拟筛选
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NDRG3表达对前列腺癌细胞生长及抗药性的促进作用 被引量:3
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作者 王伟群 李玉华 +3 位作者 洪爱真 林标扬 李扬 李润生 《生殖与避孕》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期391-395,共5页
目的:探讨NDRG3在人体前列腺细胞中的表达及外生性NDRG3对前列腺癌细胞的致癌潜能。方法:将NDRG3表达质粒稳定转染人类PC3前列腺癌细胞株,用一个NDRG3稳定表达亚克隆与做为对照的亲代和空质粒转染的PC3细胞,通过RT-PCR技术检测NDRG3基... 目的:探讨NDRG3在人体前列腺细胞中的表达及外生性NDRG3对前列腺癌细胞的致癌潜能。方法:将NDRG3表达质粒稳定转染人类PC3前列腺癌细胞株,用一个NDRG3稳定表达亚克隆与做为对照的亲代和空质粒转染的PC3细胞,通过RT-PCR技术检测NDRG3基因在不同PC3人体前列腺细胞株中的表达情况。结果:NDRG3蛋白在2种前列腺癌细胞(PC3和DU145)和一种永生化前列腺间质细胞(WPMY-1)中都有表达,外源性的NDRG3能够显著地促进PC3细胞的增长率;NDRG3表达抑制美伐他汀引起的细胞凋亡。结论:NDRG3具有肿瘤促进功能并在前列腺癌的发生、发展中起一定作用。 展开更多
关键词 ndrg3 前列腺癌
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人NDRG3 cDNA的克隆与表达 被引量:1
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作者 张健 陈苏宁 +1 位作者 药立波 刘新平 《生物技术》 CAS CSCD 2006年第5期1-3,共3页
目的:为了获得NDRG3(N-Myc downstream regulated gene3)的cDNA,以成人脑组织为模板。方法:由特异性的引物通过RT—PCR方法扩增人NDRG3的编码基因,大小约为1.1 kb。将此基因插入PMD 18-T载体中,并进行酶切鉴定和序列测定。然后,将测... 目的:为了获得NDRG3(N-Myc downstream regulated gene3)的cDNA,以成人脑组织为模板。方法:由特异性的引物通过RT—PCR方法扩增人NDRG3的编码基因,大小约为1.1 kb。将此基因插入PMD 18-T载体中,并进行酶切鉴定和序列测定。然后,将测序正确的片段亚克隆人原核表达载体pPROEX-HTb表达载体中,转化DH5α感受态细胞,并在LB培养基中获得高效表达。结果:这表明成功地进行了人NDRG3的克隆和表达,为进一步研究NDRG3的功能奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 ndrg3 N-MYC PCR 融合表达
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胃癌组织中NDRG3的表达及其与预后的关系 被引量:2
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作者 黄俊刚 赵克勤 王健生 《现代肿瘤医学》 CAS 2018年第21期3445-3448,共4页
目的:探讨N-myc下游调控基因家族(N-myc downstream-regulated gene,NDRG) 3在胃癌组织中的表达情况及其与胃癌患者预后的关系。方法:应用免疫组化染色研究NDRG3在胃癌组织中的表达,并分析其与胃癌患者预后的关系。结果:NDRG3主要表达... 目的:探讨N-myc下游调控基因家族(N-myc downstream-regulated gene,NDRG) 3在胃癌组织中的表达情况及其与胃癌患者预后的关系。方法:应用免疫组化染色研究NDRG3在胃癌组织中的表达,并分析其与胃癌患者预后的关系。结果:NDRG3主要表达在细胞质中,在细胞核中也有少量表达。在60例胃癌组织中,42例高表达,阳性率为70%,明显高于癌旁组织。临床病理资料分析显示NDRG3表达与胃癌的淋巴结转移相关(P <0. 05),且NDRG3高表达患者较低表达患者预后差(P <0. 05)。结论:NDRG3在胃癌组织中较癌旁组织高表达,且其表达水平与胃癌淋巴结转移及患者预后相关,提示NDRG3与胃癌转移机制密切相关,为胃癌诊治提供了新的思路。 展开更多
关键词 ndrg3 胃癌 转移 预后
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NDRG3对卵巢癌SKOV3细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响及机制研究 被引量:2
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作者 杜文升 程健祥 +3 位作者 王光慧 庄子 杨帆 陆晓媛 《徐州医科大学学报》 CAS 2022年第7期508-513,共6页
目的探讨NDRG3对卵巢癌SKOV3细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响及其相关机制。方法利用TCGA、GEPIA数据库分析NDRG3在卵巢癌中的表达情况及其表达和预后的关系。通过Western blot和RT-qPCR实验检测NDRG3在卵巢癌组织和正常卵巢组织中的表... 目的探讨NDRG3对卵巢癌SKOV3细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响及其相关机制。方法利用TCGA、GEPIA数据库分析NDRG3在卵巢癌中的表达情况及其表达和预后的关系。通过Western blot和RT-qPCR实验检测NDRG3在卵巢癌组织和正常卵巢组织中的表达差异。利用慢病毒介导的shRNA下调SKOV3细胞中NDRG3的表达,并通过Western blot实验检测下调效果。采用集落形成实验、CCK-8实验、划痕实验和Transwell实验检测下调NDRG3的表达对SKOV3细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。Western blot检测NDRG3对MMP-2、MMP-9和N-cadherin表达水平的影响。结果卵巢癌组织中NDRG3的表达高于正常卵巢组织。下调NDRG3表达后,卵巢癌SKOV3细胞增殖、迁移和侵袭能力明显降低(P<0.05),MMP-2、MMP-9和N-cadherin蛋白的表达水平明显降低(P<0.05)。结论NDRG3在卵巢癌组织中呈高表达;下调NDRG3的表达能够抑制卵巢癌SKOV3细胞的增殖、迁移和侵袭能力。 展开更多
关键词 卵巢癌 ndrg3 增殖 迁移 侵袭
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Thermosensitive injectable hydrogel loaded with hypoxia-induced exosomes maintains chondrocyte phenotype through NDRG3-mediated hypoxic response
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作者 Xiongbo Song Liling Gu +5 位作者 Qiming Yang Jiarui Wu Junrong Chen Xiaobin Tian Li Sun Long Chen 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2023年第8期227-231,共5页
Current clinical treatments cannot effectively delay the progression of osteoarthritis(OA).Consequently,joint replacement surgery is required for late-stage OA when patients cannot tolerate pain and joint dysfunction.... Current clinical treatments cannot effectively delay the progression of osteoarthritis(OA).Consequently,joint replacement surgery is required for late-stage OA when patients cannot tolerate pain and joint dysfunction.Therefore,the prevention of OA progression in the early and middle stages is an urgent clinical problem.In a previous study,we demonstrated that NDRG3-mediated hypoxic response might be closely related to the development and progression of OA.In this study,an injectable thermosensitive hydrogel was established by cross-linking Pluronic F-127 and hyaluronic acid(HA)for the sustained release of hypoxia-induced exosomes(HExos)derived from adipose-derived mesenchymal stem cells.We demonstrated that for OA at the early and middle stages,the HExos-loaded HP hydrogel could maintain the chondrocyte phenotype by enhancing chondrocyte autophagy,reducing chondrocyte apoptosis,and promoting chondrocyte activity and proliferation through the NDRG3-mediated hypoxic response.This novel composite hydrogel,which could activate the NDRG3-mediated hypoxic response,may provide new ideas and a theoretical basis for the treatment of early-and mid-stage OA. 展开更多
关键词 OSTEOARTHRITIS Injectable thermosensitive hydrogel EXOSOMES Hypoxic response ndrg3
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Study on NDRG3 in Mesenchyma of Prostate
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作者 Wei-qun WANG Yu-hua LI +4 位作者 Ai-zhen HONG Biao-yang LIN Xiao-feng JIA Yang LI Run-sheng LI 《Journal of Reproduction and Contraception》 CAS 2008年第3期129-136,共8页
Objective To study expression of NDRG3 in prostatic mesenchyma and effect of exogenous NDRG3 on prostatic stromal cells. Methods Immunohistochemical analysis was used to check expression of NDRG3 in prostate mesnenchy... Objective To study expression of NDRG3 in prostatic mesenchyma and effect of exogenous NDRG3 on prostatic stromal cells. Methods Immunohistochemical analysis was used to check expression of NDRG3 in prostate mesnenchyma. The WPMY-1 prostate immortalized mesenchyma cell line was stably-transfected with a NDRG3 gene expression vector. The NDRG3-stable transfected WPMY-1 sublines were studied along with parental and empty vector transfected WPMY-1 cells as controls. RT-PCR technology was applied to identity downstream gene expression under regulation of NDRG3 expression.Results Expression of DNRG3 was observed in prostate cancer mesenchyma, over-expression of NDRG3 in WPMY-1 cell up-regulated expression of chemotatic factors-CXCL3 and CXCL5. Conclusion Expression of stromal NDRG3 in prostate cancer specimens is significantly higher than that in benign prostatic hypertrophy (BPH) sample. There is a remarkable difference between the two groups of samples, NDRG3 may be related to angiogenesis in prostatic mesenchyma. 展开更多
关键词 ndrg3 PROSTATE mesenchyma
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祛寒逐风合剂调控NDRG2/JAK2/STAT3信号通路对类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞增殖和凋亡的影响 被引量:1
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作者 苏小军 朱文菊 +7 位作者 郭影 王欢 何倩 张志明 田雪梅 沈海丽 马骏 包强 《中国中医药信息杂志》 2025年第7期119-126,共8页
目的基于NDRG2/JAK2/STAT3信号通路探讨祛寒逐风合剂对类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(RA-FLS)增殖和凋亡的影响及作用机制。方法体外培养RA-FLS,将细胞分为:(1)空白血清组、甲氨蝶呤组和祛寒逐风合剂低、中、高剂量组;(2)空白血清组、AG... 目的基于NDRG2/JAK2/STAT3信号通路探讨祛寒逐风合剂对类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(RA-FLS)增殖和凋亡的影响及作用机制。方法体外培养RA-FLS,将细胞分为:(1)空白血清组、甲氨蝶呤组和祛寒逐风合剂低、中、高剂量组;(2)空白血清组、AG490组和祛寒逐风合剂低、中、高剂量组。采用不同浓度含药血清干预细胞,CCK-8法检测细胞增殖,流式细胞术检测细胞凋亡,RT-qPCR检测细胞Bax、Bcl-2、Caspace-3、Caspace-9、N-myc下游调控基因2(NDRG2)、Janus激酶2(JAK2)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)m RNA表达,Western blot检测细胞Bax、Bcl-2、Caspace-3、Caspace-9、NDRG2、JAK2、STAT3、p-JAK2、p-STAT3蛋白表达。结果与空白血清组比较,甲氨蝶呤组和祛寒逐风合剂各剂量组细胞存活率明显降低(P<0.01),细胞凋亡率明显升高(P<0.01),Bax、Caspase-9 mRNA和蛋白表达明显升高(P<0.05,P<0.01),Bcl-2 mRNA和蛋白表达明显降低(P<0.01),甲氨蝶呤组和祛寒逐风合剂中、高剂量组Caspase-3 mRNA和蛋白表达明显升高(P<0.01);与空白血清组比较,祛寒逐风合剂各剂量组NDRG2 mRNA和蛋白表达明显升高(P<0.05,P<0.01),AG490组和祛寒逐风合剂中、高剂量组JAK2、STAT3 mRNA和蛋白表达明显降低(P<0.05,P<0.01),p-JAK2、p-STAT3蛋白表达明显降低(P<0.01)。结论祛寒逐风合剂可通过调节NDRG2/JAK2/STAT3信号通路活性调控RA-FLS增殖和凋亡,发挥治疗类风湿关节炎的作用。 展开更多
关键词 祛寒逐风合剂 NDRG2/JAK2/STAT3信号通路 类风湿关节炎 成纤维样滑膜细胞
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Stool DNA methylation assays in colorectal cancer screening 被引量:9
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作者 Tanya Kadiyska Alexander Nossikoff 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2015年第35期10057-10061,共5页
Colorectal cancer(CRC) is fourth most common cancer in men and third in women worldwide. Developing a diagnostic panel of sensitive and specific biomarkers for the early detection of CRC is recognised as to be crucial... Colorectal cancer(CRC) is fourth most common cancer in men and third in women worldwide. Developing a diagnostic panel of sensitive and specific biomarkers for the early detection of CRC is recognised as to be crucial for early initial diagnosis, which in turn leads to better long term survival. Most of the research on novel potential CRC biomarkers in the last 2 decades has been focussed on stool DNA analysis. In this paper, we describe the recent advances in non-invasive CRC screening and more specifically in molecular assays for aberrantly methylated BMP3 and NDRG4 promoter regions. In several research papers these markers showed superior rates for sensitivity and specificity in comparison to previously described assays. These tests detected the majority of adenomas ≥ 1 cm in size and the detection rates progressively increased with larger adenomas. The methylation status of the BMP3 and NDRG4 promoters demonstrated effective detection of neoplasms at all sites throughout the colon and was not affected by common clinical variables. Recently, a multitarget stool DNA test consisting of molecular assays for aberrantly methylated BMP3 and NDRG4 promoter regions, mutant KRAS and immunochemical assay for human haemoglobin has been made commercially available and is currently reimbursed in the United States. Although this is the most sensitive noninvasive CRC screening test, there is the need for further research in several areas- establishment of the best timeframe for repeated DNA stool testing; validation of the results in populations outside of North America; usefulness for surveillance and prognosis of patients; cost-effectiveness of DNA stool testing in real-life populations. 展开更多
关键词 COLORECTAL cancer SCREENING PROGRAMS BMP3 NDRG4 PR
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