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NAT10作为肝癌潜在生物学标志物的生物信息学分析
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作者 王丹 姜可伊 +1 位作者 付松波 孙悦 《医学研究杂志》 2025年第3期47-53,共7页
目的探讨NAT10在肝癌中的临床意义与潜在作用机制。方法基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)获得的50例正常和374例肿瘤样本,采用R 4.2.1处理所获数据。结果NAT10在肿瘤样本中的表达显著高于正常样本(P<0.001)。与NAT1... 目的探讨NAT10在肝癌中的临床意义与潜在作用机制。方法基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)获得的50例正常和374例肿瘤样本,采用R 4.2.1处理所获数据。结果NAT10在肿瘤样本中的表达显著高于正常样本(P<0.001)。与NAT10低表达患者比较,NAT10高表达患者预后较差(P<0.001)。Logistic回归分析结果表明,NAT10高表达与肝癌患者临床预后不良因素相关,NAT10高表达患者更易于进展到晚期。基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)结果显示,NAT10高表达样本中,异生物质代谢、凝血、脂肪酸代谢等相关基因特征均有差异富集。蛋白互作分析结果显示,NAT10可能与IGF2、SST、MUC2、CHGA、AGR2等基因存在相互作用。结论NAT10在肝癌中高表达,且表达水平与肝癌的临床特征及患者生存率存在相关性。NAT10可能是一种潜在的肝癌预后生物学标志物。 展开更多
关键词 nat10 肝癌 预后不良 生物学标志物
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结直肠癌中NAT10与上皮-间质转化的关系 被引量:2
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作者 刘英竹 程先硕 +3 位作者 蔡昕怡 罗含 江凡 张丽娟 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期742-745,共4页
目的探讨结直肠癌中N-乙酰基转移酶10(N-acetyltransferase 10,NAT10)与上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的关系及临床意义。方法采用免疫组化MaxVision 3HRP法分别检测NAT10及EMT相关蛋白E-cadherin、β-catenin... 目的探讨结直肠癌中N-乙酰基转移酶10(N-acetyltransferase 10,NAT10)与上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的关系及临床意义。方法采用免疫组化MaxVision 3HRP法分别检测NAT10及EMT相关蛋白E-cadherin、β-catenin、vimentin在95例结直肠癌癌组织及30例癌旁组织中的表达,分析NAT10与EMT相关蛋白表达的相关性,及NAT10与结直肠癌临床病理特征的关系。结果结直肠癌组织中NAT10的阳性率[70.5%(67/95)]高于癌旁组织[10%(3/30)]。结直肠癌组织中E-cadherin的阳性率[56.8%(54/95)]低于癌旁组织[96.7%(29/30)](P<0.001),β-catenin的阳性率[74.7%(71/95)]高于癌旁组织[0(0/30)](P<0.001),viminten的阳性率[35.8%(34/95)]高于癌旁组织[0(0/30)](P<0.001)。结直肠癌组织中NAT10与E-cadherin表达呈负相关(r=-0.392,P<0.001),NAT10与β-catenin表达呈正相关(r=0.333,P<0.001),NAT10与viminten表达呈正相关(r=0.325,P<0.001)。NAT10表达与肿瘤分化程度、淋巴结转移、浸润深度及pTNM分期相关(P<0.05)。结论结直肠癌组织中NAT10表达增高,且与癌组织中EMT相关蛋白表达存在正相关性,NAT10可能促进结直肠癌中EMT的发生从而使肿瘤转移。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 nat10 上皮-间质转化 免疫组织化学
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结直肠癌患者癌组织DPD和CISD2及NAT10表达与预后的相关性 被引量:2
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作者 李达 石三保 张成 《中华实用诊断与治疗杂志》 2023年第8期797-801,共5页
目的观察结直肠癌患者癌组织DPD、CISD2、NAT10表达变化,探讨其与结直肠癌患者预后的相关性。方法2016年1月—2017年1月中国人民解放军北部战区总医院诊治结直肠癌患者143例,均行手术治疗,术后采用5-氟尿嘧啶化疗。记录患者临床分期、... 目的观察结直肠癌患者癌组织DPD、CISD2、NAT10表达变化,探讨其与结直肠癌患者预后的相关性。方法2016年1月—2017年1月中国人民解放军北部战区总医院诊治结直肠癌患者143例,均行手术治疗,术后采用5-氟尿嘧啶化疗。记录患者临床分期、远处转移情况等临床病理资料,采用免疫组织化学法检测手术切除的结直肠癌及癌旁组织DPD、CISD2、NAT10表达情况,分析癌组织DPD、CISD2、NAT10表达与结直肠癌患者临床病理特征的关系。随访5年,根据生存情况将143例患者分为预后良好组101例和预后不良组42例,比较2组临床病理特征及癌组织DPD、CISD2、NAT10阳性表达率;采用多因素Cox回归分析结直肠癌患者预后不良的影响因素;采用相加模型分析结直肠癌组织CISD2、NAT10表达对DPD表达的交互作用。结果结直肠癌组织DPD、CISD2、NAT10阳性表达率(56.64%、51.75%、53.15%)均高于癌旁组织(18.88%、28.67%、26.57%)(P<0.05)。癌组织DPD、CISD2、NAT10阳性表达的结直肠癌患者临床分期Ⅲ期(64.20%、64.86%、61.84%)、有远处转移(22.22%、29.73%、26.32%)比率分别高于癌组织DPD、CISD2、NAT10阴性表达者(38.71%、9.68%,40.58%、2.90%,43.28%、5.97%)(P<0.05),分化程度、淋巴结转移、神经及脉管侵犯比率与癌组织DPD、CISD2、NAT10阴性表达者比较差异均无统计学意义(P>0.05)。预后不良组低分化、临床分期Ⅲ期、有远处转移比率(76.19%、85.71%、52.38%)及癌组织DPD、CISD2、NAT10阳性表达率(80.95%、78.57%、88.10%)均高于预后良好组(41.58%、39.60%、1.98%、46.53%、40.59%、38.61%)(P<0.05),淋巴结转移、神经及脉管侵犯比率与预后良好组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。癌组织DPD阳性(HR=2.987,95%CI:1.658~4.068,P<0.001)、CISD2阳性(HR=2.574,95%CI:1.245~3.874,P<0.001)、NAT10阳性(HR=3.175,95%CI:2.547~3.957,P<0.001)是结直肠癌患者预后不良的影响因素。结直肠癌组织CISD2、NAT10对DPD阳性存在正向交互作用(RERI=4.254,95%CI:3.251~5.064;AP=0.435,95%CI:0.329~0.516;SI=1.940,95%CI:1.755~2.313);CISD2、NAT10均为阳性时DPD阳性的风险是二者均为阴性时的9.778倍(OR=9.778,95%CI:7.029~11.283,P<0.001)。结论癌组织CISD2、NAT10、DPD阳性表达的结直肠癌患者预后不良,CISD2、NAT10表达对DPD阳性表达存在正向交互作用,可能与促进肿瘤上皮-间质转化及5-氟尿嘧啶耐药有关。 展开更多
关键词 结直肠癌 DPD CISD2 nat10 上皮-间质转化 5-氟尿嘧啶 耐药
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Nat10调控精子发生:生殖生物学研究中的新表观转录组学研究前沿
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作者 史庆华 《科学通报》 北大核心 2025年第13期1851-1852,共2页
精子发生是男性生育力的核心,其维持依赖于精原细胞自我更新与分化之间的微妙平衡,由遗传和表观遗传网络协同调控.近年来,研究表明,RNA分子碱基上的表观修饰是生殖细胞发育的重要调控因素,然而,过去对于mRNA修饰的研究主要集中于丰度较... 精子发生是男性生育力的核心,其维持依赖于精原细胞自我更新与分化之间的微妙平衡,由遗传和表观遗传网络协同调控.近年来,研究表明,RNA分子碱基上的表观修饰是生殖细胞发育的重要调控因素,然而,过去对于mRNA修饰的研究主要集中于丰度较高的m6A修饰上,关于其他RNA修饰的生理功能与调控机制尚未完全阐明[1~4]. 展开更多
关键词 表观转录组学 精子发生 生殖生物学 nat10
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NAT10 inhibition alleviates astrocyte autophagy by impeding ac4C acetylation of Timp1 mRNA in ischemic stroke
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作者 Li Yang Xiaotong Li +13 位作者 Yaxuan Zhao Hao Chen Can Wang Angrong Wu Xintong Guo Yue Huang Qihui Wang Lingyun Hao Xiaowen Li Ying Ji Jin Ban Guangtian Wang Junli Cao Zhiqiang Pan 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 2025年第5期2575-2592,共18页
Although a single nucleotide polymorphism for N-acetyltransferase 10(NAT10)has been identified in patients with early-onset stroke,the role of NAT10 in ischemic injury and the related underlying mechanisms remains elu... Although a single nucleotide polymorphism for N-acetyltransferase 10(NAT10)has been identified in patients with early-onset stroke,the role of NAT10 in ischemic injury and the related underlying mechanisms remains elusive.Here,we provide evidence that NAT10,the only known RNA N4-acetylcytidine(ac4C)modification“writer”,is increased in the damaged cortex of patients with acute ischemic stroke and the peri-infarct cortex of mice subjected to photothrombotic(PT)stroke.Pharmacological inhibition of NAT10 with remodelin on Days 3–7 post-stroke or astrocytic depletion of NAT10 via targeted virus attenuates ischemia-induced infarction and improves functional recovery in PT mice.Mechanistically,NAT10 enhances ac4C acetylation of the inflammatory cytokine tissue inhibitor of metalloproteinase 1(Timp1)mRNA transcript,which increases TIMP1 expression and results in the accumulation of microtubule-associated protein 1 light chain 3(LC3)and progression of astrocyte autophagy.These findings demonstrate that NAT10 regulates astrocyte autophagy by targeting Timp1 ac4C after stroke.This study highlights the critical role of ac4C in the regulation of astrocyte autophagy and proposes a promising strategy to improve post-stroke outcomes via NAT10 inhibition. 展开更多
关键词 Ischemic stroke ac4C NAT 10 TIMP1 NEUROPROTECTION Functional recovery ASTROCYTE AUTOPHAGY
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NAT10 promotes cell proliferation by acetylating CEP170 mRNA to enhance translation efficiency in multiple myeloma 被引量:5
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作者 Rongfang Wei Xing Cui +9 位作者 Jie Min Zigen Lin Yanyan Zhou Mengjie Guo Xiaojuan An Hao Liu Siegfried Janz Chunyan Gu Hongbo Wang Ye Yang 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2022年第8期3313-3325,共13页
Multiple myeloma(MM) is still an incurable hematologic malignancy, which is eagerly to the discovery of novel therapeutic targets and methods. N-acetyltransferase 10(NAT10) is the first reported regulator of mRNA acet... Multiple myeloma(MM) is still an incurable hematologic malignancy, which is eagerly to the discovery of novel therapeutic targets and methods. N-acetyltransferase 10(NAT10) is the first reported regulator of mRNA acetylation that is activated in many cancers. However, the function of NAT10 in MM remains unclear. We found significant upregulation of NAT10 in MM patients compared to normal plasma cells, which was also highly correlated with MM poor outcome. Further enforced NAT10 expression promoted MM growth in vitro and in vivo, while knockdown of NAT10 reversed those effects. The correlation analysis of acetylated RNA immunoprecipitation sequencing(ac RIP-seq) and ribosome profiling sequencing(Ribo-seq) combined with RIP-PCR tests identified centrosomal protein 170(CEP170) as an important downstream target of NAT10. Interfering CEP170 expression in NAT10-OE cells attenuated the acceleration of cellular growth caused by elevated NAT10. Moreover,CEP170 overexpression promoted cellular proliferation and chromosomal instability(CIN) in MM.Intriguingly, remodelin, a selective NAT10 inhibitor, suppressed MM cellular growth, induced cellular apoptosis in vitro and prolonged the survival of 5TMM3VT mice in vivo. Collectively, our data indicate that NAT10 acetylates CEP170 mRNA to enhance CEP170 translation efficiency, which suggests that NAT10 may serve as a promising therapeutic target in MM. 展开更多
关键词 Multiple myeloma Target nat10 ACETYLATION CEP170 Chromosomal instability TRANSLATION Remodelin
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N-乙酰基转移酶10通过催化赖氨酸残基和胞嘧啶碱基的乙酰化修饰在多种生物学过程和疾病中发挥作用
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作者 周锐 隋亚奇 赵文会 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期160-169,共10页
N-乙酰基转移酶10(N-acetyltransferase 10,NAT10)是一种具有乙酰基转移酶活性的核仁蛋白质,可催化蛋白质赖氨酸残基和RNA胞嘧啶碱基的乙酰化修饰。近年来,大量研究表明,这些乙酰化修饰在端粒酶活性调节、细胞基本且核心功能的调节、细... N-乙酰基转移酶10(N-acetyltransferase 10,NAT10)是一种具有乙酰基转移酶活性的核仁蛋白质,可催化蛋白质赖氨酸残基和RNA胞嘧啶碱基的乙酰化修饰。近年来,大量研究表明,这些乙酰化修饰在端粒酶活性调节、细胞基本且核心功能的调节、细胞胁迫响应、DNA损伤修复、细胞周期调控、核糖体RNA的生物学合成、mRNA稳定性及翻译效率的调节等多种生命活动中发挥重要作用,并且与人类癌症、Hutchinson-Gilford早衰综合症(Hutchinson-Gilford premature aging syndrome,HGPS)的发生、发展和预后密切相关。然而,关于NAT10的研究仍存在一些局限性,例如NAT10完整的结构以及这些结构对其功能的影响仍未知,由NAT10调控的细胞基本功能也尚不清楚,并且NAT10对人类癌症和HGPS发展的具体影响机制也待阐明。本文从NAT10的结构、酶活性、生物学功能及其在疾病中的作用进行了综述,并提出了目前研究的局限性,展望了未来的研究方向,以期为NAT10的相关研究提供参考。 展开更多
关键词 N-乙酰基转移酶10 乙酰化修饰 rRNA生物学合成 mRNA稳定性及翻译效率调节 Hutchinson-Gilford早衰综合症
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Fus依赖ac4C修饰调控促进宫颈癌细胞增殖
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作者 金泽源 李咏梅 《天津医科大学学报》 2023年第1期15-20,共6页
目的:探讨Fus RNA结合蛋白(Fus)影响宫颈癌细胞增殖的机制。方法:通过MTT实验观察Fus对宫颈癌细胞HeLa增殖的影响;采用RT-qPCR和Western印迹观察人N-乙酰转移酶10(NAT10)对Fus表达的影响;利用RNA免疫沉淀实验(RIP)检测Fus mRNA的富集情... 目的:探讨Fus RNA结合蛋白(Fus)影响宫颈癌细胞增殖的机制。方法:通过MTT实验观察Fus对宫颈癌细胞HeLa增殖的影响;采用RT-qPCR和Western印迹观察人N-乙酰转移酶10(NAT10)对Fus表达的影响;利用RNA免疫沉淀实验(RIP)检测Fus mRNA的富集情况;通过RNA稳定性实验观察NAT10对Fus mRNA稳定性的影响;基于生物信息学软件PACES预测Fus mRNA上的ac4C修饰位点,构建含有Fus mRNA上ac4C修饰位点的野生型和突变型的EGFP报告质粒,利用EGFP-reporter实验和乙酰化RIP(ac4C-RIP)确定Fus mRNA上发生ac4C修饰位点;最后通过挽救实验观察NAT10介导Fus对宫颈癌细胞增殖的影响。结果:Fus促进宫颈癌HeLa细胞增殖(tFus=14.06,tsh R-Fus=5.74,均P<0.05);Fus蛋白和mRNA的表达水平随NAT10表达增加而增加(tNAT10=10.71,tsh R-NAT10-1=13.17,tsh R-NAT10-2=7.65,均P<0.05);RIP实验结果提示Fus mRNA与NAT10蛋白间存在相互作用(t=4.20,P<0.05),且NAT10过表达细胞中Fus mRNA具有较高ac4C修饰水平(t=30.62,P<0.05);另外,相对于载体对照细胞,NAT10过表达细胞中Fus mRNA的稳定性增高(P<0.01);发现Fus mRNA的925~939序列中的胞嘧啶为ac4C修饰位点;挽救实验结果显示NAT10介导Fus促进宫颈癌细胞的增殖(t=9.67、6.71,P<0.05)。结论:Fus mRNA被NAT10催化发生ac4C修饰,Fus表达水平被上调,继而促进宫颈癌细胞的增殖。 展开更多
关键词 宫颈癌 ac4C FUS nat10
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乙酰转移酶10通过介导盘状蛋白结构域受体1 mRNA的ac4C乙酰化修饰促进宫颈癌细胞的恶性行为 被引量:3
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作者 张雪 汤华 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期603-613,共11页
乙酰转移酶10(N-acetyltransferase 10,NAT10)是mRNA乙酰化修饰的关键酶,通过介导ac4C乙酰化修饰(N4-acetylcytidine,ac4C)调控靶基因的表达并调控多种癌症的生物学功能,但NAT10对宫颈癌(cervical cancer,CC)细胞的调控却少有报道。本... 乙酰转移酶10(N-acetyltransferase 10,NAT10)是mRNA乙酰化修饰的关键酶,通过介导ac4C乙酰化修饰(N4-acetylcytidine,ac4C)调控靶基因的表达并调控多种癌症的生物学功能,但NAT10对宫颈癌(cervical cancer,CC)细胞的调控却少有报道。本研究拟探讨NAT10对宫颈癌细胞恶性行为的影响。首先,通过数据库分析发现NAT10高表达与宫颈癌病人预后不良相关。MTT实验和集落形成结果显示,过表达NAT10增加了宫颈癌细胞的生长活性(P<0.05)和增殖能力(P<0.001);Transwell迁移和侵袭结果表明,过表达NAT10提高了宫颈癌细胞的迁移(P<0.01)和侵袭(P<0.05)能力;Western免疫印迹结果显示,过表达NAT10使间皮细胞标志物波形蛋白(vimentin)上调,使上皮细胞标志物E-钙黏着蛋白(E-cadherin)下降。并且,生物信息学分析显示,盘状蛋白结构域受体1(discoidin domain receptor 1,DDR1)可能是NAT10的下游靶基因,RNA结合蛋白免疫沉淀结果表明,NAT10可以直接结合DDR1的mRNA(P<0.05),Western免疫印迹和RT-qPCR的结果表明,过表达NAT10使DDR1蛋白质水平和mRNA水平明显上调(P<0.05)。此外,RNA乙酰化免疫沉淀结果表明,过表达NAT10增加了DDR1 mRNA的乙酰化水平(P<0.001),并且EGFP报告系统进一步确定了NAT10识别DDR1 mRNA的乙酰化位点。mRNA半衰期的结果显示,NAT10可提高DDR1 mRNA的稳定性(P<0.05)。综上所述,NAT10促进宫颈癌细胞的生长、增殖活性以及迁移侵袭能力,其机制是通过对DDR1 mRNA进行乙酰化修饰延长其mRNA的稳定性,这可能为mRNA乙酰化修饰对宫颈癌发生发展的分子机制提供新的见解。 展开更多
关键词 乙酰转移酶10 盘状蛋白结构域受体1 ac4C乙酰化修饰 宫颈癌 迁移 侵袭
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N-acetyltransferase 10 promotes colon cancer progression by inhibiting ferroptosis through N4-acetylation and stabilization of ferroptosis suppressor protein 1 (FSP1) mRNA 被引量:23
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作者 Xiao Zheng Qi Wang +6 位作者 You Zhou Dachuan Zhang Yiting Geng Wenwei Hu Changping Wu Yufang Shi Jingting Jiang 《Cancer Communications》 SCIE 2022年第12期1347-1366,共20页
Background:N-acetyltransferase 10(NAT10)is the only enzyme known tomediate the N4-acetylcytidine(ac4C)modification of mRNA and is crucial formRNA stability and translation efficiency.However,its role in cancer develop... Background:N-acetyltransferase 10(NAT10)is the only enzyme known tomediate the N4-acetylcytidine(ac4C)modification of mRNA and is crucial formRNA stability and translation efficiency.However,its role in cancer development and prognosis has not yet been explored.This study aimed to examine the possible role of NAT10 in colon cancer.Methods:The expression levels ofNAT10were evaluated by immunohistochemical analyses with a colon cancer tissue microarray,and its prognostic value in patients was further analyzed.Quantitative real-time polymerase chain reaction(qRT-PCR)and Western blotting were performed to analyze NAT10 expression in harvested colon cancer tissues and cell lines.Stable NAT10-knockdown and NAT10-overexpressing colon cancer cell lines were constructed using lentivirus.The biological functions of NAT10 in colon cancer cell lines were analyzed in vitro by Cell Counting Kit-8(CCK-8),wound healing,Transwell,cell cycle,and ferroptosis assays.Xenograft models were used to analyze the effect of NAT10 on the tumorigenesis and metastasis of colon cancer cells in vivo.Dot blotting,acetylated RNA immunoprecipitation-qPCR,and RNA stability analyses were performed to explore the mechanism by which NAT10 functions in colon cancer progression.Results:NAT10 was upregulated in colon cancer tissues and various colon cancer cell lines.This increased NAT10 expression was associated with shorter patient survival.Knockdown of NAT10 in two colon cancer cell lines(HT-29 and LoVo)impaired the proliferation,migration,invasion,tumor formation and metastasis of these cells,whereas overexpression of NAT10 promoted these abilities.Further analysis revealed that NAT10 exerted a strong effect on the mRNA stability and expression of ferroptosis suppressor protein 1(FSP1)in HT-29 and LoVo cells.In these cells,FSP1 mRNA was found to be modified by ac4C acetylation,and this epigenetic modification was associated with the inhibition of ferroptosis.Conclusions:Our study revealed that NAT10 plays a critical role in colon cancer development by affecting FSP1 mRNA stability and ferroptosis,suggesting that NAT10 could be a novel prognostic and therapeutic target in colon cancer. 展开更多
关键词 Colon cancer N-acetyltransferase 10(nat10) N4-acetylcytidine(ac4C) Ferroptosis suppressor protein 1(FSP1) Ferroptosis mRNA stability RNA acetylation
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