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草地早熟禾PpNAC83基因克隆与生物信息学分析
1
作者
KOMAL Tariq
甄琪
+3 位作者
王安琪
尤学
金一锋
陈阳
《齐齐哈尔大学学报(自然科学版)》
2025年第4期69-76,83,共9页
草地早熟禾是一种高质量冷季型草坪草,但在生长过程中易受多种非生物因素的影响。NAC转录因子家族在植物面对非生物胁迫的响应中起重要作用。目前对于草地早熟禾的研究尚不深入,为初步探索NAC基因家族介导植物非生物胁迫响应过程的分子...
草地早熟禾是一种高质量冷季型草坪草,但在生长过程中易受多种非生物因素的影响。NAC转录因子家族在植物面对非生物胁迫的响应中起重要作用。目前对于草地早熟禾的研究尚不深入,为初步探索NAC基因家族介导植物非生物胁迫响应过程的分子机制,选取草地早熟禾“午夜Ⅱ号”为实验材料,克隆草地早熟禾Pp NAC83基因,并利用NCBI等网站对编码的氨基酸序列进行同源比对和信号肽预测生物信息学分析。结果表明,草地早熟禾Pp NAC83基因序列全长1 361 bp,包含完整的ORF 726 bp,编码241个氨基酸,具有典型的NAM superfamily结构域。该蛋白质分子式为C1131H1806N346O339S12,分子量为26.05 k D,等电点为9.67。分析发现NAC83属于不稳定亲水性蛋白,且草地早熟禾NAC83与黑麦草NAC83(XP_047092032.1)的同源性最高。启动子预测分析结果表明,包含TATC-box和LTR顺式作用元件。
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关键词
草地早熟禾
基因克隆
nac83
转录因子
在线阅读
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职称材料
柑橘抗逆基因NAC83的克隆与表达分析
被引量:
12
2
作者
郭文芳
刘德春
+4 位作者
杨莉
庄霞
张涓涓
王书胜
刘勇
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期445-454,共10页
以柚[Citrus maxima(Burm.)Merr.]、枳[Poncirus trifoliata(L.)Raf.]和柠檬[C.limon(L.)Burm.f.]实生苗为试材,使用电子克隆和RT-PCR的方法从中克隆到3个新的NAC蛋白基因,分别命名为CmNAC83、PtNAC83和ClNAC83;并用qRT-PCR技术检测了...
以柚[Citrus maxima(Burm.)Merr.]、枳[Poncirus trifoliata(L.)Raf.]和柠檬[C.limon(L.)Burm.f.]实生苗为试材,使用电子克隆和RT-PCR的方法从中克隆到3个新的NAC蛋白基因,分别命名为CmNAC83、PtNAC83和ClNAC83;并用qRT-PCR技术检测了该基因在ABA、干旱、低温和高盐胁迫处理下的时空表达。结果显示:CmNAC83、PtNAC83和ClNAC83的cDNA序列全长均为841 bp,都含有750 bp的开放阅读框(ORF),编码249个氨基酸;推测其蛋白分子质量分别为24.18、28.00和28.15 kD,等电点分别是9.02、9.31和9.30,且均含有NAC家族的N端保守结构域;系统进化树分析表明,该3个蛋白均属于SENU5亚族,与苹果NAC22亲缘关系较近。实时定量qRT-PCR分析显示,NAC83基因能被ABA、干旱、低温和高盐胁迫诱导表达,且在不同的柑橘种类中存在表达差异。可见柚CmNAC83、枳PtNAC83和柠檬ClNAC83是NAC基因家族的成员,可能在柑橘响应非生物胁迫的过程中起了重要作用。
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关键词
柚
枳
柠檬
nac83
基因克隆
基因表达
原文传递
题名
草地早熟禾PpNAC83基因克隆与生物信息学分析
1
作者
KOMAL Tariq
甄琪
王安琪
尤学
金一锋
陈阳
机构
齐齐哈尔大学生命科学与农林学院
出处
《齐齐哈尔大学学报(自然科学版)》
2025年第4期69-76,83,共9页
基金
国家自然科学基金(31701958)
黑龙江省基本科研业务费项目(145109518)
齐齐哈尔大学学位与研究生教育教学改革研究项目(QUZLTSJG2023014)。
文摘
草地早熟禾是一种高质量冷季型草坪草,但在生长过程中易受多种非生物因素的影响。NAC转录因子家族在植物面对非生物胁迫的响应中起重要作用。目前对于草地早熟禾的研究尚不深入,为初步探索NAC基因家族介导植物非生物胁迫响应过程的分子机制,选取草地早熟禾“午夜Ⅱ号”为实验材料,克隆草地早熟禾Pp NAC83基因,并利用NCBI等网站对编码的氨基酸序列进行同源比对和信号肽预测生物信息学分析。结果表明,草地早熟禾Pp NAC83基因序列全长1 361 bp,包含完整的ORF 726 bp,编码241个氨基酸,具有典型的NAM superfamily结构域。该蛋白质分子式为C1131H1806N346O339S12,分子量为26.05 k D,等电点为9.67。分析发现NAC83属于不稳定亲水性蛋白,且草地早熟禾NAC83与黑麦草NAC83(XP_047092032.1)的同源性最高。启动子预测分析结果表明,包含TATC-box和LTR顺式作用元件。
关键词
草地早熟禾
基因克隆
nac83
转录因子
Keywords
kentucky bluegrass
gene cloning
nac83
transcription factor
分类号
S812 [农业科学—草业科学]
在线阅读
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职称材料
题名
柑橘抗逆基因NAC83的克隆与表达分析
被引量:
12
2
作者
郭文芳
刘德春
杨莉
庄霞
张涓涓
王书胜
刘勇
机构
江西农业大学农学院
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期445-454,共10页
基金
国家自然科学基金(地区科学基金)项目(31260468)
江西省青年自然科学基金项目(20114BAB214006)
+2 种基金
江西省自然科学基金项目(20142BAB204008)
江西省教育厅科技计划项目(GJJ14292)
江西农业大学科学研究基金项目(CX201101)
文摘
以柚[Citrus maxima(Burm.)Merr.]、枳[Poncirus trifoliata(L.)Raf.]和柠檬[C.limon(L.)Burm.f.]实生苗为试材,使用电子克隆和RT-PCR的方法从中克隆到3个新的NAC蛋白基因,分别命名为CmNAC83、PtNAC83和ClNAC83;并用qRT-PCR技术检测了该基因在ABA、干旱、低温和高盐胁迫处理下的时空表达。结果显示:CmNAC83、PtNAC83和ClNAC83的cDNA序列全长均为841 bp,都含有750 bp的开放阅读框(ORF),编码249个氨基酸;推测其蛋白分子质量分别为24.18、28.00和28.15 kD,等电点分别是9.02、9.31和9.30,且均含有NAC家族的N端保守结构域;系统进化树分析表明,该3个蛋白均属于SENU5亚族,与苹果NAC22亲缘关系较近。实时定量qRT-PCR分析显示,NAC83基因能被ABA、干旱、低温和高盐胁迫诱导表达,且在不同的柑橘种类中存在表达差异。可见柚CmNAC83、枳PtNAC83和柠檬ClNAC83是NAC基因家族的成员,可能在柑橘响应非生物胁迫的过程中起了重要作用。
关键词
柚
枳
柠檬
nac83
基因克隆
基因表达
Keywords
pomelo
trifoliate orange
lemon
nac83
cloning
expression analysis
分类号
S666 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草地早熟禾PpNAC83基因克隆与生物信息学分析
KOMAL Tariq
甄琪
王安琪
尤学
金一锋
陈阳
《齐齐哈尔大学学报(自然科学版)》
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
柑橘抗逆基因NAC83的克隆与表达分析
郭文芳
刘德春
杨莉
庄霞
张涓涓
王书胜
刘勇
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
12
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