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芒和南荻NAC29基因的克隆及其编码产物的结构预测
1
作者
王永顺
万婷
+2 位作者
李遥
李蒙
陈智勇
《分子植物育种》
北大核心
2025年第16期5325-5331,共7页
NAC家族是一类处于植物次生壁建成的调控网络顶层,在进化上具有保守性的转录因子。本研究从芒(Miscanthus sinensis)、南荻(M.lutarioriparius)中克隆了NAC基因家族成员,分别命名为MsNAC29和MlNAC29。利用ORF Finder、blastp软件对序列...
NAC家族是一类处于植物次生壁建成的调控网络顶层,在进化上具有保守性的转录因子。本研究从芒(Miscanthus sinensis)、南荻(M.lutarioriparius)中克隆了NAC基因家族成员,分别命名为MsNAC29和MlNAC29。利用ORF Finder、blastp软件对序列进行分析后发现,芒MsNAC29基因编码区长1272 bp,编码423个氨基酸,南荻MlNAC29基因编码区长1278 bp,编码425个氨基酸;经MEGA软件分析同源序列,分别构建了MsNAC29、MlNAC29编码产物的系统进化树,显示其编码的蛋白与玉米(Zea mays)和高粱(Sorghum bicolor)亲缘关系最近。利用ProtParam tool软件分析可得,Ms NAC29转录因子有18个磷酸化位点,MlNAC29转录因子有23个磷酸化位点;二者均为不稳定蛋白,具有保守结构域,均无跨膜结构和信号肽序列;α-螺旋和无规卷曲是两者二级结构的主要组成元件。本研究为验证芒和南荻NAC29基因功能提供了理论依据,为未来提高芒草等纤维素作物的产量以及木质纤维素利用率提供有益信息。
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关键词
芒
南荻
次生壁建成调控
nac29
系统进化
原文传递
题名
芒和南荻NAC29基因的克隆及其编码产物的结构预测
1
作者
王永顺
万婷
李遥
李蒙
陈智勇
机构
湖南农业大学生物科学技术学院
湖南农业大学
出处
《分子植物育种》
北大核心
2025年第16期5325-5331,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(31471557)
国家自然科学基金青年项目(32000260)
湖湘高层次人才聚集工程项目(2019RS1051)共同资助。
文摘
NAC家族是一类处于植物次生壁建成的调控网络顶层,在进化上具有保守性的转录因子。本研究从芒(Miscanthus sinensis)、南荻(M.lutarioriparius)中克隆了NAC基因家族成员,分别命名为MsNAC29和MlNAC29。利用ORF Finder、blastp软件对序列进行分析后发现,芒MsNAC29基因编码区长1272 bp,编码423个氨基酸,南荻MlNAC29基因编码区长1278 bp,编码425个氨基酸;经MEGA软件分析同源序列,分别构建了MsNAC29、MlNAC29编码产物的系统进化树,显示其编码的蛋白与玉米(Zea mays)和高粱(Sorghum bicolor)亲缘关系最近。利用ProtParam tool软件分析可得,Ms NAC29转录因子有18个磷酸化位点,MlNAC29转录因子有23个磷酸化位点;二者均为不稳定蛋白,具有保守结构域,均无跨膜结构和信号肽序列;α-螺旋和无规卷曲是两者二级结构的主要组成元件。本研究为验证芒和南荻NAC29基因功能提供了理论依据,为未来提高芒草等纤维素作物的产量以及木质纤维素利用率提供有益信息。
关键词
芒
南荻
次生壁建成调控
nac29
系统进化
Keywords
Miscanthus sinensis
M.lutarioriparius
Secondary wall built and regulated
nac29
Systematic evolution
分类号
S543 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
芒和南荻NAC29基因的克隆及其编码产物的结构预测
王永顺
万婷
李遥
李蒙
陈智勇
《分子植物育种》
北大核心
2025
0
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