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OsNAC022 Controls Tiller Number Through Mediating CCA1 Expression in Rice
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作者 ZHAI Rongrong LI Zhen +7 位作者 XIANG Yuanyuan XU Qun ZHANG Mengchen YANG Yaolong WEI Xinghua WANG Shu YE Shenghai FENG Yue 《Rice science》 2025年第4期445-448,I0001-I0010,共14页
Tiller number is a crucial agronomic trait for achieving high yield in rice.NAC proteins play critical roles in regulating plant growth and development.However,the role of NAC transcription factors in regulating tille... Tiller number is a crucial agronomic trait for achieving high yield in rice.NAC proteins play critical roles in regulating plant growth and development.However,the role of NAC transcription factors in regulating tiller number remains poorly understood.In this study,we isolated a rice NAC gene,OsNAC022,which is conserved in cereal crops and functions as a transcriptional activator.To investigate the role of this gene in rice,we used CRISPR/Cas9 technology to generate a homozygous mutant named CR-osnac022,which exhibited increased tiller number. 展开更多
关键词 transcriptional activatorto generate homozygous mutant nac geneosnac which nac transcription factors agronomic trait CRISPR Cas nac transcription factors tiller number
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小麦耐盐相关NAC转录因子的生物信息与表达分析
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作者 王伟伟 罗政辉 +6 位作者 邹景伟 张玉杰 钮力亚 王志 王奉芝 赵振杰 于亮 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第3期287-299,共13页
NAC转录因子对植物抗逆境胁迫具有重要作用。为了解小麦耐盐相关NAC转录因子的生物学信息,对耐盐品种沧麦6005和盐敏感品种科农9204进行转录组测序,筛选耐盐相关NAC转录因子,并对其进行生物信息学分析;对供试材料进行盐胁迫处理,提取根... NAC转录因子对植物抗逆境胁迫具有重要作用。为了解小麦耐盐相关NAC转录因子的生物学信息,对耐盐品种沧麦6005和盐敏感品种科农9204进行转录组测序,筛选耐盐相关NAC转录因子,并对其进行生物信息学分析;对供试材料进行盐胁迫处理,提取根部分生组织RNA,反转录为cDNA,对重点候选基因进行qRT-PCR分析。结果表明,共筛选出28个耐盐相关NAC转录因子,其中10个的等电点呈碱性,其余等电点呈酸性,且均为亲水性蛋白;亚细胞定位主要定位在细胞核;蛋白质二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。经共线性分析,小麦和水稻的NAC转录因子含有多对共线性关系,表明小麦与水稻亲缘关系较近。NAC转录因子启动子区域含有多种与激素响应和逆境胁迫诱导相关顺式作用元件,其中TaNAC24含有顺式调控元件结合位点最多,共有51个。盐胁迫处理后,9个重要基因中,4个基因表达量显著上调,5个基因表达量显著下调,与转录组测序结果一致,这些基因可能介导了小麦的抗盐性。 展开更多
关键词 小麦 盐胁迫 nac 转录因子 生物信息学分析
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桃NAC4基因的克隆与表达分析
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作者 郭正兵 韩柏明 +1 位作者 李静 彭斌 《分子植物育种》 北大核心 2025年第7期2172-2179,共8页
NAC(NAM,ATAF1/2和CUC2)转录因子是植物特有的大蛋白家族,在植物发育和胁迫响应过程中发挥重要作用。本研究使用RT-PCR技术在‘新白花’桃(Prunus persica L.Batsch)果实中分离克隆获得PpNAC4基因,利用生物信息分析软件对PpNAC4进行基... NAC(NAM,ATAF1/2和CUC2)转录因子是植物特有的大蛋白家族,在植物发育和胁迫响应过程中发挥重要作用。本研究使用RT-PCR技术在‘新白花’桃(Prunus persica L.Batsch)果实中分离克隆获得PpNAC4基因,利用生物信息分析软件对PpNAC4进行基因结构及蛋白质理化性质分析。结果表明,PpNAC4共编码352个氨基酸,N端含有一个NAM保守结构域,属于NAC转录因子家族。PpNAC4蛋白为亲水性不稳定蛋白,无跨膜结构域,二级结构以无规卷曲为主。系统进化分析表明,PpNAC4在进化过程中较为保守,与同属的甜樱桃、梅花和扁桃亲缘关系比较近。RT-qPCR分析结果表明PpNAC4可能参与果实成熟。烟草亚细胞定位结果表明PpNAC4定位在细胞核。酵母激活活性结果表明PpNAC4具有转录激活活性。为进一步完善桃果实成熟调控网络提供理论依据。 展开更多
关键词 nac 基因克隆 表达分析 成熟
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蚕豆NAC转录因子家族鉴定分析及抗叶斑病基因筛选
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作者 卞晓春 王凡 +3 位作者 刘陈玮 徐仁超 陆红臣 吴春芳 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第9期1683-1695,共13页
NAC转录因子在植物生长发育及逆境胁迫响应中具有重要作用。为明确蚕豆(Vicia faba L.)NAC转录因子的功能,本研究利用生物信息学方法从蚕豆基因组数据库中鉴定蚕豆NAC家族基因成员,分析其基因结构、启动子顺式作用元件、染色体分布以及... NAC转录因子在植物生长发育及逆境胁迫响应中具有重要作用。为明确蚕豆(Vicia faba L.)NAC转录因子的功能,本研究利用生物信息学方法从蚕豆基因组数据库中鉴定蚕豆NAC家族基因成员,分析其基因结构、启动子顺式作用元件、染色体分布以及编码蛋白质的理化性质等,结合造成蚕豆叶斑病的病原菌链格孢菌(Alternaria alternata)侵染的蚕豆转录组数据筛选与抗病相关的候选基因。结果表明,蚕豆NAC转录因子基因家族共有77个成员,不均匀分布于6条染色体上,其编码的蛋白质大小介于133 aa至665 aa之间;VfNAC蛋白分为16个亚家族,均含有NAM保守结构域,均定位于细胞核。VfNAC基因启动子上包含光响应元件、激素响应元件、干旱响应元件等多种顺式作用元件。转录组测序结果显示,链格孢菌侵染后蚕豆中有33个VfNAC基因差异表达,筛选出4个差异表达显著的基因作为关键抗病候选基因进一步研究。本研究为蚕豆NAC转录因子后续的生物学功能解析及抗病分子机制研究提供了参考。 展开更多
关键词 蚕豆 nac转录因子 链格孢菌 抗病基因
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基于全长转录组的白蜡树NAC基因家族的鉴定与密码子偏好性分析
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作者 孙晓春 黄文静 李会容 《中国野生植物资源》 2025年第10期36-44,共9页
目的:对白蜡树(Fraxinus chinensis Roxb.)NAC基因家族进行鉴定与系统生物信息学分析,并探究其密码子偏好性与影响因素。方法:基于白蜡树全长转录组数据对NAC基因家族进行鉴定,并对其理化性质、系统发育、保守基序、表达模式、密码子偏... 目的:对白蜡树(Fraxinus chinensis Roxb.)NAC基因家族进行鉴定与系统生物信息学分析,并探究其密码子偏好性与影响因素。方法:基于白蜡树全长转录组数据对NAC基因家族进行鉴定,并对其理化性质、系统发育、保守基序、表达模式、密码子偏好性进行分析。结果:共鉴定得到35个NAC转录因子,编码氨基酸序列长度为224~617 aa,理论等电点4.43~9.20,不稳定系数28.80~56.64,脂肪系数51.99~80.23,均定位到细胞核;二代转录组数据中筛选到的14个NAC基因在叶片和枝皮中具有显著差异表达。密码子偏好性分析结果为白蜡树NAC基因家族偏好使用以A/U结尾的密码子,ENC值在45.06~59.88之间,平均值为54.18,表明密码子的偏好性较弱;最优密码子为AGG、GCA、UCA和UAU;中性绘图分析与ENC-plot分析结果表明影响其密码子偏好性的主要因素是自然选择。结论:研究结果为后续对白蜡树NAC基因家族的功能和作用机制的深入研究提供科学依据。 展开更多
关键词 白蜡树 nac转录因子 生物信息学 密码子偏好性
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基于转录组的北乌头、芍药种子休眠NAC家族成员鉴定与分析 被引量:1
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作者 乌兰图雅 路景诗 +3 位作者 贾俊英 侯伟峰 潮乐蒙 张晓明 《种子》 北大核心 2025年第4期43-53,共11页
运用生物信息学方法对北乌头、芍药种子在低温层积下基于转录组数据的NAC基因家族进行鉴定,共鉴定出33个AKNAC和37个PLNAC家族基因。结果表明,AKNAC、PLNAC氨基酸数量分别为85~661个、80~654个;分子量分别为10.13~67.69 kD、9.38~73.87 ... 运用生物信息学方法对北乌头、芍药种子在低温层积下基于转录组数据的NAC基因家族进行鉴定,共鉴定出33个AKNAC和37个PLNAC家族基因。结果表明,AKNAC、PLNAC氨基酸数量分别为85~661个、80~654个;分子量分别为10.13~67.69 kD、9.38~73.87 kD;等电点分别为4.74~9.84、4.78~10.05;不稳定系数分别为23.13~57.46、22.91~57.53;脂溶指数分别为53.96~90.14、30.05~82.00;亲水系数分别为-0.909~0.014、-1.245~-0.072,均属亲水性蛋白。多数蛋白定位于细胞核中,NAC家族成员存在一定相似性,进化树结果显示,Motif、Domain、NAC序列结构存在一定相似性。北乌头、芍药不同NAC家族成员层积期间相对表达量、不同阶段变化趋势都有所不同,部分NAC家族成员在低温期间上调表达量,体现NAC响应非生物胁迫的特征,并且部分表达量变化趋势相似的家族成员被聚类在一起,体现结构与功能的相适应性。 展开更多
关键词 nac基因家族 北乌头 芍药 生物信息学分析
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基于WGCNA鉴定大豆抗大豆花叶病毒NAC转录因子及其诱导表达分析
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作者 牛景萍 赵婧 +5 位作者 郭茜 王书宏 赵晋忠 杜维俊 殷丛丛 岳爱琴 《生物技术通报》 北大核心 2025年第7期95-105,共11页
【目的】挖掘大豆抗大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV)病相关的核心转录因子(transcription factors,TFs),为深入解析大豆抗病分子机制和创制抗病品种提供理论依据。【方法】以大豆抗病材料X149和感病材料X97受大豆花叶病毒株系S... 【目的】挖掘大豆抗大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV)病相关的核心转录因子(transcription factors,TFs),为深入解析大豆抗病分子机制和创制抗病品种提供理论依据。【方法】以大豆抗病材料X149和感病材料X97受大豆花叶病毒株系SC15诱导后的转录组数据为基础,利用PlantTFDB v 5.0数据库从转录组中预测全基因组转录因子基因;基于差异表达转录因子基因,通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)获得抗病转录因子相关模块和抗病核心转录因子;采用String 12.0预测转录因子互作蛋白;利用RT-qPCR分析转录因子受激素(ETH、SA、MeJA和ABA)诱导表达情况。【结果】全基因组含有转录因子的基因有3170个,其中1727个属于差异表达基因;WGCNA分析表明1727个基因被划分为6个转录因子基因共表达模块,其中brown模块和turquoise模块与X149抗性显著相关,2个模块中转录因子基因间连通度最高的核心转录因子为turquoise模块中NAC转录因子GmNAC030基因,turquoise模块中与GmNAC030具有相似表达的NAC转录因子基因有GmNAC043、GmNAC085、GmNAC092和GmNAC101;互作蛋白预测表明,GmNAC030、GmNAC043和GmNAC092互作蛋白均为转录因子,且仅有互作蛋白Glyma.02g131700(bZIP1)、Glyma.16g164800(AP2-EREBP)和Glyma.08G118200(WRKY48)位于模块中。RT-qPCR分析表明GmNAC030主要受MeJA诱导,另外4个NAC转录因子基因主要受MeJA和ETH诱导。【结论】5个NAC转录因子基因GmNAC030、GmNAC043、GmNAC085、GmNAC092和GmNAC101的表达与大豆抗SMV相关且受外源激素MeJA和ETH的诱导。 展开更多
关键词 大豆 大豆花叶病毒 加权共表达网络分析 nac转录因子 表达分析
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半夏PtNAC48基因克隆与表达分析
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作者 苏传栋 纪明芳 +4 位作者 王振 朱艳芳 薛涛 伯晨 薛建平 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第4期218-224,共7页
根据半夏三代转录组数据,利用PCR技术克隆PtNAC48基因,并对其进行生物信息学分析;利用qRT-PCR技术检测该基因在半夏根、块茎、叶柄、叶片4个组织部位和15%PEG 4000模拟干旱胁迫处理下不同时间段的基因表达变化,以探究干旱胁迫下PtNAC48... 根据半夏三代转录组数据,利用PCR技术克隆PtNAC48基因,并对其进行生物信息学分析;利用qRT-PCR技术检测该基因在半夏根、块茎、叶柄、叶片4个组织部位和15%PEG 4000模拟干旱胁迫处理下不同时间段的基因表达变化,以探究干旱胁迫下PtNAC48的功能与作用,为后续研究该基因响应半夏干旱胁迫的分子机制奠定基础。结果表明,成功克隆PtNAC48基因,基因编码区全长1086 bp,编码361个氨基酸,含有NAC转录因子典型NAM保守结构域;亚细胞定位预测其定位在细胞核中,PtNAC48是亲水性蛋白,无信号肽与跨膜结构,存在糖基化和磷酸化位点。序列比对和进化分析表明,PtNAC48和其他物种已报道的NAC蛋白有相似的保守序列,与玉米ZmNAC071亲缘关系最近。qRT-PCR技术检测结果显示,PtNAC48基因在半夏的叶柄中表达量最高,在根中最低,模拟干旱处理下该基因表达量随处理时间逐渐升高,胁迫24 h时表达量最高,随后呈下降趋势;转录激活试验证明PtNAC48蛋白不具有转录自激活活性。PtNAC48基因受干旱胁迫诱导表达,推测该基因在响应半夏干旱胁迫中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 半夏 nac转录因子 基因克隆 生物信息学 干旱胁迫 表达分析 转录激活
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秋茄KoNAC 25基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
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作者 杨党 蒋文骏 +3 位作者 王永峰 王建强 董超 杜照奎 《广西植物》 北大核心 2025年第9期1592-1606,共15页
NAC转录因子在植物中广泛存在且为植物所特有,在调节植物生长发育、激素信号转导和逆境胁迫响应等方面发挥着重要作用。前期工作中,从红树植物秋茄(Kandelia obovata)基因组中鉴定到1个受低温诱导的NAC基因KoNAC 25(GenBank登录号PP8604... NAC转录因子在植物中广泛存在且为植物所特有,在调节植物生长发育、激素信号转导和逆境胁迫响应等方面发挥着重要作用。前期工作中,从红树植物秋茄(Kandelia obovata)基因组中鉴定到1个受低温诱导的NAC基因KoNAC 25(GenBank登录号PP860407)。为探究KoNAC 25基因是否参与秋茄盐胁迫响应,该研究通过RT-PCR技术从秋茄叶片cDNA中克隆KoNAC 25基因,并对其进行序列特征、系统进化、亚细胞定位及基因表达分析。结果表明:(1)秋茄KoNAC 25基因的开放阅读框(ORF)全长为858 bp,共编码285个氨基酸,分子量为32.9 kDa,理论等电点为8.53。KoNAC25为亲水性蛋白,不含信号肽且无跨膜结构。(2)序列同源比对显示,KoNAC25蛋白N端具有1个NAM超家族结构域,由5个保守的亚结构域构成,属于NAM亚家族成员。(3)系统进化树表明,秋茄KoNAC25转录因子与大戟科的蓖麻(Ricinus communis)、木薯(Manihot esculenta)和橡胶树(Hevea brasiliensis)等植物亲缘关系较近。(4)亚细胞定位试验证实,KoNAC25蛋白定位于细胞核。(5)qRT-PCR分析结果表明,KoNAC 25基因在叶中表达量显著高于花中,同时该基因能够被盐(NaCl)和脱落酸(ABA)诱导表达上调,分别在处理12 h和6 h时达到峰值。综上认为,KoNAC 25参与了秋茄盐胁迫响应的相关调控,该结果为进一步研究秋茄KoNAC 25基因在盐胁迫下的功能及其表达调控机理提供了参考。 展开更多
关键词 秋茄 nac 25基因 基因克隆 亚细胞定位 表达模式
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紫花苜蓿MsNAC053基因克隆及其对非生物胁迫的响应分析
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作者 邹苇鹏 刘怡 +5 位作者 翟佳兴 周思懿 宫祉祎 岑慧芳 朱慧森 许涛 《草业学报》 北大核心 2025年第9期121-133,共13页
NAC(NAM、ATAF1/2、CUC1/2)转录因子是植物特有的转录因子,在调控植物生长发育、激素信号转导及胁迫响应等过程中发挥重要作用。紫花苜蓿是世界范围内重要的豆科牧草之一,营养丰富,品质优良。为探究紫花苜蓿NAC053基因功能,利用SnapGene... NAC(NAM、ATAF1/2、CUC1/2)转录因子是植物特有的转录因子,在调控植物生长发育、激素信号转导及胁迫响应等过程中发挥重要作用。紫花苜蓿是世界范围内重要的豆科牧草之一,营养丰富,品质优良。为探究紫花苜蓿NAC053基因功能,利用SnapGene及NCBI设计特异性引物并利用PCR技术克隆MsNAC053基因,利用生物信息学软件分析其蛋白质理化性质、二级结构和亚细胞定位情况等,并使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析MsNAC053基因在紫花苜蓿不同组织中的表达模式及对不同非生物胁迫的响应情况,利用农杆菌介导法将DNA酶切及连接构建的亚细胞定位载体导入烟草叶片进行亚细胞定位。结果表明:MsNAC053基因编码区全长903 bp,编码300个氨基酸,其蛋白相对分子量为34.62 kDa,脂溶指数为73.82,理论等电点为7.05,平均亲水性为-0.604,不稳定系数为47.28,为不稳定的亲水性蛋白,不具备跨膜结构,具有响应冷胁迫及脱落酸等的顺式作用元件。亚细胞定位结果显示其定位于细胞核中,系统进化树和氨基酸序列分析表明MsNAC053与蒺藜苜蓿、长柔毛野豌豆等豆科植物亲缘关系较近。qRT-PCR结果表明,MsNAC053基因表达具有组织特异性,在幼叶中表达量最高,在子叶中表达量最低;干旱、盐及脱落酸(ABA)处理均能诱导MsNAC053基因的表达,表明MsNAC053基因参与紫花苜蓿应对干旱、盐胁迫响应。本研究为紫花苜蓿抗逆分子育种提供了理论依据及候选基因。 展开更多
关键词 紫花苜蓿 nac转录因子 基因克隆 表达分析 非生物胁迫
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杉木次生壁发育调控转录因子基因ClNAC40的生物学功能
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作者 刘明彤 庄和必 +5 位作者 王紫彤 石帅宾 刘晓娟 林二培 胡现铬 黄华宏 《林业科学》 北大核心 2025年第2期131-141,共11页
【目的】在挖掘杉木次生壁发育相关NAC调控因子基础上,分析其生物信息学特征、表达模式,以及在拟南芥中过表达的作用,以期为杉木次生壁发育分子机制解析和分子辅助育种提供重要参考价值。【方法】基于杉木不同器官和组织的转录组测序数... 【目的】在挖掘杉木次生壁发育相关NAC调控因子基础上,分析其生物信息学特征、表达模式,以及在拟南芥中过表达的作用,以期为杉木次生壁发育分子机制解析和分子辅助育种提供重要参考价值。【方法】基于杉木不同器官和组织的转录组测序数据,通过共表达网络分析(WGCNA)筛选与木质化相关的NAC基因,克隆其全长序列,进行序列比对和系统进化树分析;利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)分析其在不同组织和应压木形成中的表达模式;构建NAC基因过表达重组载体,利用花序侵染法获得转基因拟南芥,并进行转基因植株花序茎横切面染色观察和木质素合成相关基因的表达分析。【结果】分离得到1个杉木NAC基因(ClNAC40),其cDNA序列长度为1556 bp,开放阅读框(ORF)为1344 bp,编码447个氨基酸。获得ClNAC40基因组序列共3430 bp,由6个外显子和5个内含子组成。进化树分析发现ClNAC40与已报道的次生发育相关NAC转录因子聚为一类。ClNAC40基因在木质部(XY)优势表达,而在根(RT)、雌球花(FC)、雄球花(MC)和皮层(BK)中的表达量相对较低;同时,在茎中表达呈现随木质化程度升高而递增趋势,在木质化茎(S3)中的表达量是未木质化茎(S1)的3.2倍。在应压木诱导形成过程中,ClNAC40在应压木中的表达量呈上升趋势,斜放处理30天和60天时的表达水平均显著高于直立木(对照)。在拟南芥中过表达Cl NAC40导致花序茎的高度和直径均明显增加;花序茎横切面经间苯三酚染色,显色较野生型深且染色区域占比更大,表明木质素沉积更多。RT-qPCR分析结果表明,ClNAC40过表达显著提高了拟南芥木质素合成途径关键酶基因的表达。【结论】杉木ClNAC40基因通过激活木质素生物合成相关酶基因表达,参与调控次生壁的发育。 展开更多
关键词 杉木 nac转录因子 基因功能 次生壁发育
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基于PFC-NAc-VTA神经环路代谢组学探讨疏肝和胃汤的抗抑郁作用机制
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作者 屈鑫月 胡俊杰 +4 位作者 李娟 章敏 周贤 刘松林 陈新 《中国药房》 北大核心 2025年第10期1172-1178,共7页
目的基于前额叶皮层(PFC)-伏隔核(NAc)-腹侧被盖区(VTA)神经环路代谢组学探讨疏肝和胃汤(SGHWT)的抗抑郁作用机制。方法将雄性SD大鼠随机分为空白组,模型组,SGHWT低、中、高剂量组[3.67、7.34、14.68 g/(kg·d),以生药量计]以及氟... 目的基于前额叶皮层(PFC)-伏隔核(NAc)-腹侧被盖区(VTA)神经环路代谢组学探讨疏肝和胃汤(SGHWT)的抗抑郁作用机制。方法将雄性SD大鼠随机分为空白组,模型组,SGHWT低、中、高剂量组[3.67、7.34、14.68 g/(kg·d),以生药量计]以及氟西汀组[1.58 mg/(kg·d),阳性对照],每组12只。除空白组外,其余各组大鼠均采用慢性不可预知温和应激结合单笼饲养的方式构建抑郁模型,并于造模同时灌胃相应药液或生理盐水,每天1次,持续6周。末次给药后,检测各组大鼠的体重、糖水偏好率、总移动距离、穿越中心次数和不动时间。收集空白组、模型组、SGHWT中剂量组、氟西汀组大鼠的脑组织PFC、NAc、VTA区样本,观察其组织形态学特征,进行非靶向代谢组学分析(氟西汀组除外)并验证。结果与模型组相比,各药物组大鼠3个脑区细胞溶解、结构受损等病理损伤均明显改善,其体重、糖水偏好率、总移动距离、穿越中心次数均显著升高或延长(P<0.05),不动时间均显著缩短(P<0.05);非靶向代谢组学结果显示,共鉴定出78个内源性差异代谢物,PFC、NAc、VTA区分别有40、35、24个,主要涉及氨基酸、脂质、鞘脂代谢等;代谢通路富集分析结果显示,SGHWT主要通过鞘脂代谢,丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢,不饱和脂肪酸的生物合成3条代谢通路对抑郁大鼠的神经环路产生影响,且以丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢通路为主;验证实验结果显示,SGHWT可显著升高大鼠NAc区蛋白激酶B(Akt)、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)的磷酸化水平,显著下调N-甲基-D-天冬氨酸受体1(NMDAR1)蛋白的表达。结论SGHWT可显著改善模型大鼠的抑郁样行为,减轻其PFC-NAc-VTA神经环路组织的病理损伤,上述作用可能与抑制NMDAR1蛋白表达、激活Akt/mTOR信号通路有关。 展开更多
关键词 疏肝和胃汤 抑郁 非靶向代谢组学 PFC-nac-VTA神经环路 NMDAR1/Akt/mTOR信号通路
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基于LDLR/MEK/ERK信号通路探讨加减薯蓣丸调控VTA-NAc环路髓鞘改善血管性痴呆小鼠抑郁行为的作用机制
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作者 景松 谭子虎 杨琼 《中国中药杂志》 北大核心 2025年第16期4555-4563,共9页
探讨加减薯蓣丸对血管性痴呆(vascular dementia,VaD)小鼠抑郁行为的作用及可能机制。3月龄雄性C57BL/6小鼠72只,分为假手术组,模型组,加减薯蓣丸低、中、高剂量组,氟西汀组。除假手术组外,其余5组小鼠采用双侧颈总动脉狭窄术结合慢性... 探讨加减薯蓣丸对血管性痴呆(vascular dementia,VaD)小鼠抑郁行为的作用及可能机制。3月龄雄性C57BL/6小鼠72只,分为假手术组,模型组,加减薯蓣丸低、中、高剂量组,氟西汀组。除假手术组外,其余5组小鼠采用双侧颈总动脉狭窄术结合慢性不可预测刺激。糖水偏好实验、悬尾实验检测抑郁行为,激光散斑成像检测脑血流量,蛋白免疫印迹检测小鼠中脑腹侧被盖区(ventral tegmental area,VTA)和伏隔核(nucleus accumbens,NAc)脑区的低密度脂蛋白受体(low density lipoprotein receptor,LDLR)、丝裂原活化蛋白激酶激酶(mitogen-activated protein kinase kinase,MEK)、磷酸化(p)-MEK、细胞外信号调节激酶(extracellular signal-regulated kinase,ERK)、p-ERK蛋白表达,免疫荧光法检测VTA和NAc脑区髓鞘碱性蛋白(myelin basic protein,MBP)荧光表达水平,固蓝染色观察小鼠VTA和NAc的髓鞘形态,透射电镜观察小鼠VTA和NAc髓鞘微观结构。抑郁相关的行为学实验表明,与假手术组相比,模型组小鼠悬尾实验不动时间显著增加(P<0.01),糖水偏好率显著降低(P<0.01);加减薯蓣丸干预后,小鼠悬尾实验不动时间显著缩短(P<0.01),糖水偏好率显著增加(P<0.01)。激光散斑成像结果显示,与假手术组同时间比较,模型组小鼠脑血流量显著下降(P<0.01);与模型组相比,加减薯蓣丸中、高剂量组小鼠脑血流量显著增加(P<0.01)。蛋白免疫印迹实验表明,与假手术组相比,模型组小鼠VTA和NAc脑区中LDLR、p-MEK/MEK、p-ERK/ERK水平显著下降(P<0.01);加减薯蓣丸中、高剂量能显著逆转这一趋势(P<0.01)。免疫荧光实验表明,与假手术组相比,模型组小鼠VTA和NAc脑区中MBP荧光强度显著降低(P<0.01);进一步分析VTA脑区的MBP荧光强度,与模型组相比,加减薯蓣丸中、高剂量组荧光强度显著升高(P<0.01);在NAc脑区加减薯蓣丸各剂量组MBP荧光强度有不同程度的增加(P<0.01)。固蓝染色实验表明,与假手术组相比,模型组小鼠染色着色程度变浅,髓鞘纤维排列变得较为疏松,这一现象提示模型组小鼠存在显著的脱髓鞘病变;但在中、高剂量加减薯蓣丸干预下,VTA与NAc脑区染色程度及髓鞘结构得到改善。透射电镜结果显示,假手术组VTA和NAc髓鞘完整且致密;模型组存在广泛的髓鞘丢失,髓鞘出现变性、崩解;给予加减薯蓣丸干预后,小鼠VTA和NAc的髓鞘丢失程度减轻,有髓鞘包绕组织的比例变大。综上,加减薯蓣丸改善VaD小鼠抑郁样行为的机制可能为上调LDLR/MEK/ERK信号通路促进VTA-NAc环路髓鞘再生。 展开更多
关键词 血管性痴呆(VaD) 抑郁行为 加减薯蓣丸 LDLR/MEK/ERK VTA-nac 髓鞘
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盐胁迫下细叶百合酵母文库构建及LpNAC14互作蛋白筛选
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作者 刘同非 李徐斐 +1 位作者 车海涛 张彦妮 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第1期32-41,共10页
本研究旨在探索细叶百合NAC转录因子LpNAC14应答盐胁迫的信号通路,分析其互作蛋白,奠定相关基因功能研究基础。利用盐胁迫下细叶百合的叶片和根,通过Gateway法构建了酵母双杂交cDNA文库,使用2个无自激活活性的LpNAC14基因片段构建诱饵载... 本研究旨在探索细叶百合NAC转录因子LpNAC14应答盐胁迫的信号通路,分析其互作蛋白,奠定相关基因功能研究基础。利用盐胁迫下细叶百合的叶片和根,通过Gateway法构建了酵母双杂交cDNA文库,使用2个无自激活活性的LpNAC14基因片段构建诱饵载体,分别与文库质粒共转化筛选互作蛋白,对筛选到的结果进行回转验证和GO富集分析,选取其中一个转录因子LpDi19-2与LpNAC14进行BiFC验证。结果表明,构建细叶百合酵母文库容量1.12×10^(7) CFU,重组率100%,插入片段平均长度1 000 bp以上。文库共转化初步筛选到19个与LpNAC14互作的蛋白。BiFC验证LpDi19-2与LpNAC14体内互作。研究表明盐胁迫下细叶百合酵母文库质量较高,符合筛选标准,筛选结果可靠性较高,为探究LpNAC14响应盐胁迫机制提供新方向。 展开更多
关键词 细叶百合 cDNA文库 nac转录因子 盐胁迫 BIFC
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李PsNAC基因家族鉴定及其在空腔褐变果实中的表达模式分析
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作者 邓红红 彭超 +7 位作者 梁茜 张子扬 刘俊伟 李斌奇 魏鸣康 王雪颖 李刘敏 陈发兴 《果树学报》 北大核心 2025年第1期48-62,共15页
【目的】NAC转录因子广泛参与植物生长发育和应对逆境胁迫过程,被认为是植物次生细胞壁生物合成转录调控的一级开关。鉴定李PsNAC转录因子家族,探索其与皇冠李果实空腔褐变的关系。【方法】采用生物信息学方法,分析李PsNAC家族成员、理... 【目的】NAC转录因子广泛参与植物生长发育和应对逆境胁迫过程,被认为是植物次生细胞壁生物合成转录调控的一级开关。鉴定李PsNAC转录因子家族,探索其与皇冠李果实空腔褐变的关系。【方法】采用生物信息学方法,分析李PsNAC家族成员、理化性质、系统发育和基因结构等,并通过qRT-PCR技术,分析PsNACs在空腔褐变皇冠李果实中的表达模式。【结果】李PsNACs包含115个成员,不均匀地分布在8条染色体上,可分为17个亚族,与植物次生细胞壁合成相关的OsNAC003和OsNAC7亚族分别含6和10个PsNACs。PsNACs启动子区域含有丰富的激素响应元件和MYB结合位点。10个PsNACs在皇冠李空腔褐变果实中的表达量均高于非空腔褐变果实。【结论】本结果为研究PsNAC家族成员与皇冠李果实空腔褐变的具体关联性奠定了重要基础。 展开更多
关键词 皇冠李 nac转录因子 基因家族 空腔褐变 基因表达量
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鳄梨中干旱与低温胁迫相关NAC转录因子的表达分析
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作者 罗玛妮娅 王毅 +5 位作者 张璋 原晓龙 王丽娟 冯发玉 徐令文 郑元 《分子植物育种》 北大核心 2025年第5期1488-1502,共15页
NAC转录因子是植物转录因子家族中的重要成员之一,对植物生长发育和非生物胁迫响应具有重要作用。本研究通过本地BLAST与鳄梨基因组比对分析获得72个鳄梨NAC(PaNAC)转录因子,利用二代转录组测序获得鳄梨干旱和低温胁迫转录组数据,对其... NAC转录因子是植物转录因子家族中的重要成员之一,对植物生长发育和非生物胁迫响应具有重要作用。本研究通过本地BLAST与鳄梨基因组比对分析获得72个鳄梨NAC(PaNAC)转录因子,利用二代转录组测序获得鳄梨干旱和低温胁迫转录组数据,对其蛋白理化性质、系统进化树及基因表达谱分析,并对干旱和低温胁迫相关基因进行RT-qPCR验证。转录组分析结果表明,在干旱胁迫下有56个PaNACs表达,低温胁迫下共有53个PaNACs表达。系统进化树结果表明,PaNAC25和参与干旱胁迫的拟南芥ANAC019、ANAC055和ANAC072聚为1支,Pa NAC10、Pa NAC50和PaNAC51分别与刚毛柽柳ThNAC24、茶树CsNAC17、水稻Os NAC022聚为1支。RT-qPCR结果显示,鳄梨NAC转录因子中PaNAC10、PaNAC25、PaNAC50和PaNAC51参与干旱胁迫响应,Pa NAC35和Pa NAC69参与低温胁迫响应。本研究结果为进一步探究鳄梨NAC转录因子家族生物学特性及基因功能奠定基础,为揭示NAC基因参与非生物胁迫调控提供科学依据。 展开更多
关键词 鳄梨(Persea americana) nac转录因子 转录组分析 干旱 低温胁迫
原文传递
白麻NAC基因家族全基因组鉴定及其干旱胁迫下表达分析
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作者 谢文龙 王彦芹 《干旱地区农业研究》 北大核心 2025年第2期54-65,共12页
基于白麻基因组数据,在白麻全基因组范围内鉴定了53个NAC基因家族成员,并对其染色体分布、系统发育、基因和蛋白结构、蛋白理化性质与功能、顺式作用元件进行预测分析,并结合干旱胁迫下的转录组数据分析NAC基因的表达。结果显示,白麻的A... 基于白麻基因组数据,在白麻全基因组范围内鉴定了53个NAC基因家族成员,并对其染色体分布、系统发育、基因和蛋白结构、蛋白理化性质与功能、顺式作用元件进行预测分析,并结合干旱胁迫下的转录组数据分析NAC基因的表达。结果显示,白麻的ApNAC基因家族分布在10条染色体中,包括7对片段复制形成的共线性基因对和2对串联重复基因对。53个ApNAC家族成员可以分为15个亚家族,每个成员都含有5个以上的保守基序,同一个亚家族成员有着相似的基因结构。白麻NAC蛋白属于亲水性蛋白,亚细胞定位结果显示其以转录因子的形式发挥功能,并富集在DNA特异性结合功能以及木质部、叶片和细胞壁的发育调节功能中。启动子区域的顺式作用元件分析表明,ApNAC基因家族与脱落酸、干旱胁迫以及光响应调控相关。在30%PEG-6000诱导的干旱胁迫下,26个ApNAC成员在不同阶段发生差异表达,其中21个基因整体上调,5个基因下调。 展开更多
关键词 白麻 nac基因家族 干旱胁迫 基因差异表达
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小麦NAC转录因子的生物学功能研究进展
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作者 陈昕钰 朱玉 +4 位作者 丁媛 王可丹 陈思 胡天宇 熊飞 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第11期1510-1520,共11页
NAC(NAM/ATAF/CUC)转录因子是一个大型的植物特异性转录因子家族,由高度保守的N端和多变的C端组成,参与多种生物学过程并调控植物的各种性状。本文总结了近年来小麦NAC转录因子的研究进展,系统概述了其在小麦生长发育和环境适应中的生... NAC(NAM/ATAF/CUC)转录因子是一个大型的植物特异性转录因子家族,由高度保守的N端和多变的C端组成,参与多种生物学过程并调控植物的各种性状。本文总结了近年来小麦NAC转录因子的研究进展,系统概述了其在小麦生长发育和环境适应中的生物学功能,主要涉及根系生长、叶片衰老、籽粒发育以及生物和非生物胁迫响应等方面,以期丰富NAC转录因子的调控网络,为小麦的产量和品质改良以及分子育种提供理论依据。 展开更多
关键词 小麦 nac转录因子 生长发育 胁迫响应
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芒和南荻NAC29基因的克隆及其编码产物的结构预测
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作者 王永顺 万婷 +2 位作者 李遥 李蒙 陈智勇 《分子植物育种》 北大核心 2025年第16期5325-5331,共7页
NAC家族是一类处于植物次生壁建成的调控网络顶层,在进化上具有保守性的转录因子。本研究从芒(Miscanthus sinensis)、南荻(M.lutarioriparius)中克隆了NAC基因家族成员,分别命名为MsNAC29和MlNAC29。利用ORF Finder、blastp软件对序列... NAC家族是一类处于植物次生壁建成的调控网络顶层,在进化上具有保守性的转录因子。本研究从芒(Miscanthus sinensis)、南荻(M.lutarioriparius)中克隆了NAC基因家族成员,分别命名为MsNAC29和MlNAC29。利用ORF Finder、blastp软件对序列进行分析后发现,芒MsNAC29基因编码区长1272 bp,编码423个氨基酸,南荻MlNAC29基因编码区长1278 bp,编码425个氨基酸;经MEGA软件分析同源序列,分别构建了MsNAC29、MlNAC29编码产物的系统进化树,显示其编码的蛋白与玉米(Zea mays)和高粱(Sorghum bicolor)亲缘关系最近。利用ProtParam tool软件分析可得,Ms NAC29转录因子有18个磷酸化位点,MlNAC29转录因子有23个磷酸化位点;二者均为不稳定蛋白,具有保守结构域,均无跨膜结构和信号肽序列;α-螺旋和无规卷曲是两者二级结构的主要组成元件。本研究为验证芒和南荻NAC29基因功能提供了理论依据,为未来提高芒草等纤维素作物的产量以及木质纤维素利用率提供有益信息。 展开更多
关键词 南荻 次生壁建成调控 nac29 系统进化
原文传递
草地早熟禾PpNAC83基因克隆与生物信息学分析
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作者 KOMAL Tariq 甄琪 +3 位作者 王安琪 尤学 金一锋 陈阳 《齐齐哈尔大学学报(自然科学版)》 2025年第4期69-76,83,共9页
草地早熟禾是一种高质量冷季型草坪草,但在生长过程中易受多种非生物因素的影响。NAC转录因子家族在植物面对非生物胁迫的响应中起重要作用。目前对于草地早熟禾的研究尚不深入,为初步探索NAC基因家族介导植物非生物胁迫响应过程的分子... 草地早熟禾是一种高质量冷季型草坪草,但在生长过程中易受多种非生物因素的影响。NAC转录因子家族在植物面对非生物胁迫的响应中起重要作用。目前对于草地早熟禾的研究尚不深入,为初步探索NAC基因家族介导植物非生物胁迫响应过程的分子机制,选取草地早熟禾“午夜Ⅱ号”为实验材料,克隆草地早熟禾Pp NAC83基因,并利用NCBI等网站对编码的氨基酸序列进行同源比对和信号肽预测生物信息学分析。结果表明,草地早熟禾Pp NAC83基因序列全长1 361 bp,包含完整的ORF 726 bp,编码241个氨基酸,具有典型的NAM superfamily结构域。该蛋白质分子式为C1131H1806N346O339S12,分子量为26.05 k D,等电点为9.67。分析发现NAC83属于不稳定亲水性蛋白,且草地早熟禾NAC83与黑麦草NAC83(XP_047092032.1)的同源性最高。启动子预测分析结果表明,包含TATC-box和LTR顺式作用元件。 展开更多
关键词 草地早熟禾 基因克隆 nac83 转录因子
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