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深圳市H5N6、H7N9流感病毒NA-UTR序列特征
1
作者
李茜
陈燕慈
+5 位作者
彭博
王昕
武伟华
刘慧
郑青
房师松
《热带医学杂志》
CAS
2018年第6期721-724,共4页
目的分析深圳市H5N6、H7N9流感病毒神经氨酸酶(NA)基因非翻译区(UTR)的分子特性,为进一步探究NA基因与流感病毒转录复制及包装之间的关系奠定理论基础。方法使用MEGA 7.0、DNAstar7.1.0等生物信息分析软件对全球和深圳H5N6、H7N9流感病...
目的分析深圳市H5N6、H7N9流感病毒神经氨酸酶(NA)基因非翻译区(UTR)的分子特性,为进一步探究NA基因与流感病毒转录复制及包装之间的关系奠定理论基础。方法使用MEGA 7.0、DNAstar7.1.0等生物信息分析软件对全球和深圳H5N6、H7N9流感病毒NA的UTR进行核苷酸序列同源性分析及基因多态性分析。结果 2014-2015年深圳市H5N6病毒与其他HXN6病毒株比较,NA-3′端核苷酸同源性为95.1%~100.0%,H5N6-NA 3′-UTR高度保守;5′端UTR核苷酸同源性为89.7%~100.0%,H5N6-NA 5′-UTR主要在第23、27、29及33位发生突变。8株2013-2014年深圳市H7N9病毒与其他HXN9流感病毒株比较,NA-5′端UTR核苷酸同源性为93.3%~100.0%,其在第4、6及23位发生突变。结论深圳市人感染H5N6及H7N9病毒NA-UTR的保守区具有高度同源性,其可变区具有基因多态性。
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关键词
H5N6流感病毒
H7N9流感病毒
na-utr
同源性
多态性
原文传递
题名
深圳市H5N6、H7N9流感病毒NA-UTR序列特征
1
作者
李茜
陈燕慈
彭博
王昕
武伟华
刘慧
郑青
房师松
机构
暨南大学药学院
深圳市疾病预防控制中心
出处
《热带医学杂志》
CAS
2018年第6期721-724,共4页
基金
深圳市科创委基础研究项目(JCYJ20170306160244540)
文摘
目的分析深圳市H5N6、H7N9流感病毒神经氨酸酶(NA)基因非翻译区(UTR)的分子特性,为进一步探究NA基因与流感病毒转录复制及包装之间的关系奠定理论基础。方法使用MEGA 7.0、DNAstar7.1.0等生物信息分析软件对全球和深圳H5N6、H7N9流感病毒NA的UTR进行核苷酸序列同源性分析及基因多态性分析。结果 2014-2015年深圳市H5N6病毒与其他HXN6病毒株比较,NA-3′端核苷酸同源性为95.1%~100.0%,H5N6-NA 3′-UTR高度保守;5′端UTR核苷酸同源性为89.7%~100.0%,H5N6-NA 5′-UTR主要在第23、27、29及33位发生突变。8株2013-2014年深圳市H7N9病毒与其他HXN9流感病毒株比较,NA-5′端UTR核苷酸同源性为93.3%~100.0%,其在第4、6及23位发生突变。结论深圳市人感染H5N6及H7N9病毒NA-UTR的保守区具有高度同源性,其可变区具有基因多态性。
关键词
H5N6流感病毒
H7N9流感病毒
na-utr
同源性
多态性
Keywords
HSN6 influenza virus
H7N9 influenza virus
na-utr
Homology
Polymorphism
分类号
R511 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
深圳市H5N6、H7N9流感病毒NA-UTR序列特征
李茜
陈燕慈
彭博
王昕
武伟华
刘慧
郑青
房师松
《热带医学杂志》
CAS
2018
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