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影响多重PCR扩增效果的因素 被引量:131
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作者 黄银花 胡晓湘 +4 位作者 徐慰倬 高宇 冯继东 孙汉 李宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期65-68,共4页
不同循环参数、PCR缓冲液及反应体积的对比实验表明,循环参数中退火温度和时间、延伸时间及PCR缓冲液的成分影响多重PCR的扩增效果,而反应体积、循环次数对其扩增效果影响较小。
关键词 多重PCR 扩增效果 循环效果 PCR缓冲液 反应体积
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多重PCR检测奶牛乳腺炎金黄色葡萄球菌、无乳链球菌、停乳链球菌和酵母菌方法的建立与应用 被引量:40
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作者 马保臣 秦卓明 +2 位作者 蔡玉梅 董玉兰 柴同杰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1202-1208,共7页
参照GenBank发表的序列,在金黄色葡萄球菌、无乳链球菌和停乳链球菌16S rRNA与23S rRNA之间的区域设计了3对引物,参照念珠菌和隐球菌的18S rRNA的序列设计1对引物,建立了检测金黄色葡萄球菌、无乳链球菌、停乳链球菌和酵母真菌4种乳腺... 参照GenBank发表的序列,在金黄色葡萄球菌、无乳链球菌和停乳链球菌16S rRNA与23S rRNA之间的区域设计了3对引物,参照念珠菌和隐球菌的18S rRNA的序列设计1对引物,建立了检测金黄色葡萄球菌、无乳链球菌、停乳链球菌和酵母真菌4种乳腺炎主要致病菌的多重PCR方法。参照Skladny的方法制备模拟了细菌感染临床标本。结果表明:本试验建立的多重PCR方法具有较好的特异性,多重PCR方法检测乳样中的金黄色葡萄球菌的细菌最小浓度为104CFU/mL,检测无乳链球菌、停乳链球菌和酵母真菌的细菌最小浓度分别为102CFU/mL、103CFU/mL和103CFU/mL。通过对采自临床型乳腺炎(46个)和隐性乳腺炎(167个)动物共计213个乳样分别用传统细菌学培养法和多重PCR方法进行检测,多重PCR对金黄色葡萄球菌和酵母真菌的检测具有更高的检出率(P<0.01),但该方法对无乳链球菌和停乳链球菌的检出率与培养法差异不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 多重PCR 乳腺炎 金黄色葡萄球菌 无乳链球菌 停乳链球菌 酵母真菌
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转基因白桦外源基因的多重PCR快速检测 被引量:8
3
作者 詹亚光 苏涛 +1 位作者 韩梅 孙冬 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期480-485,共6页
根据转化的载体序列上T-DNA中的目的基因bt,选择性筛选标记基因nptⅡ和报告基因gus设计三对特异性引物,PCR产物片断大小分别为247bp、449bp、668bp,应用多重PCR(muti-plex-PCR)的方法同步检测18株转基因白桦中三个基因的整合状况;用阳... 根据转化的载体序列上T-DNA中的目的基因bt,选择性筛选标记基因nptⅡ和报告基因gus设计三对特异性引物,PCR产物片断大小分别为247bp、449bp、668bp,应用多重PCR(muti-plex-PCR)的方法同步检测18株转基因白桦中三个基因的整合状况;用阳性对照为模板,对单重PCR(simplex-PCR)和多重PCR的各项指标进行比较。结果表明多重PCR检测多个外源基因在敏感性方面与单重PCR相比并没有减弱,而且略有提高;对18株样品的多重PCR同步检测无假阳性出现,结果准确,同时在操作中具有减少污染,缩短时间和节约成本等优点。因此,在对转基因白桦的外源基因的定期检测中,多重PCR是一种非常有效而便捷的方法,可以为转基因的拷贝数,T-DNA旁侧序列特征等转基因整合特性方面的研究提供数据。 展开更多
关键词 白桦 外源基因 T-DNA 多重PCR
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对中国农业大学鸡资源群进行基因组扫描的初步分析 被引量:5
4
作者 胡晓湘 黄银花 +12 位作者 高宇 杜志强 冯继东 徐慰倬 邓学梅 张莹 樊宝良 赵志辉 刘兆良 杨宁 金宁一 吴常信 李宁 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第12期1101-1106,共6页
利用PCR结合荧光半自动检测技术对中国农业大学鸡资源家系的 1个包括 4 4 0个个体的 3代群体进行了大规模基因组扫描 ,分析了 5 5个微卫星标记位点。经家系分析表明 ,这些位点都符合孟德尔共显性遗传规律 ,其杂合度在 0~ 0 86之间 ,其... 利用PCR结合荧光半自动检测技术对中国农业大学鸡资源家系的 1个包括 4 4 0个个体的 3代群体进行了大规模基因组扫描 ,分析了 5 5个微卫星标记位点。经家系分析表明 ,这些位点都符合孟德尔共显性遗传规律 ,其杂合度在 0~ 0 86之间 ,其中 72 %的位点的杂合度 >0 6 0 ;多态信息含量在 0~ 0 88之间 ,73%的位点的PIC >0 5 0。A系和C系群体在 5 5个位点中的绝大多数位点上存在非共有等位基因 ,两个品系在大多数位点的等位基因和等位基因频率差异显著 (P <0 0 5 ) ,许多位点差异达到极显著水平 (P <0 0 1) ;C系显示出更高的群体整齐度。利用 5 5个微卫星位点的等位基因频率 ,计算出A系和C系的奈氏群体间相似系数I和标准遗传距离D分别为0 10 0 2和 0 892 8。 展开更多
关键词 微卫星标记 基因组扫描 多重PCR
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多重PCR在肿瘤遗传标志分子流行病学研究中的应用 被引量:8
5
作者 胡毅玲 王声湧 +2 位作者 池桂波 郭畅 廖倚萍 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期412-413,共2页
目的 为开展肿瘤易感性遗传标志的分子流行病学研究提供快捷经济的方法。方法 取研究对象的抗凝血 ,用低渗溶血法提取白细胞中的DNA进行GSTM1、GSTT1和CYP1A1基因型的PCR检测。通过PCR的优化策略建立多重PCR的方案。结果 发现引物的... 目的 为开展肿瘤易感性遗传标志的分子流行病学研究提供快捷经济的方法。方法 取研究对象的抗凝血 ,用低渗溶血法提取白细胞中的DNA进行GSTM1、GSTT1和CYP1A1基因型的PCR检测。通过PCR的优化策略建立多重PCR的方案。结果 发现引物的特异性、无同源性以及不同的引物复性温度要接近这 3个因素 ,是确保在同一复性温度下不同引物均能扩增成功的必要条件。在引物浓度相同的情况下 ,长扩增子比短扩增子扩增产量高。本实验的最佳的Mg2 +和dNTP浓度分别是 2 0mmol/L和 0 2 5mmol/L。延伸时间也是影响扩增产量的重要原因。在最佳的Mg2 +和dNTP浓度范围内可通过延长延伸时间来提高扩增产量。结论 多重PCR虽然较单一的PCR节省时间 ,降低成本 ,更易于开展大样本的分子流行病学研究 ,但是必须特别注意优化反应体系中的主要成分和反应条件 。 展开更多
关键词 多重PCR 基因多态性 肿瘤遗传标志 分子流行病学
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基于WDM技术光传送网的生存性分析 被引量:4
6
作者 罗启彬 邱昆 张宏斌 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第4期335-339,共5页
研究了基于波长路由的WDM光传送网结构中的生存性问题,并从降低WDM光网络的成本、充分利用网络有限资源出发,提出了一种基于自愈环+网状网的WDM光传送网的自愈方案。该方案能根据业务和故障的具体情况,动态地分配网络的光纤及波长资... 研究了基于波长路由的WDM光传送网结构中的生存性问题,并从降低WDM光网络的成本、充分利用网络有限资源出发,提出了一种基于自愈环+网状网的WDM光传送网的自愈方案。该方案能根据业务和故障的具体情况,动态地分配网络的光纤及波长资源,增强了WDM光网络的灵活性和生存能力。且该方案构架于WDM光层之上,可根据节点对间业务的不同要求,分别采用不同的自愈保护方案,以满足不同用户业务对自愈性能的实时要求。 展开更多
关键词 光传送网 波分复用 生存性分析 光纤通信
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多重PCR检测对虾白斑综合症病毒和传染性皮下组织坏死病毒 被引量:4
7
作者 杨卫帆 易小平 《水产科学》 CAS 北大核心 2006年第12期649-651,共3页
采用对虾白斑综合症病毒和传染性皮下组织坏死病毒的特异引物,在一个PCR反应中同时扩增到大小分别为271 bp和356 bp的病毒特异片段,多重PCR条件优化后可从最少100 fg级病毒DNA模板中定性检测出此两种病毒。
关键词 多重PCR 白斑综合症病毒 传染性皮下组织坏死病毒
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儿童脊肌萎缩症的基因诊断 被引量:4
8
作者 孙婧婧 杨永臣 +5 位作者 陆燕芬 许全梅 王超 成鸿毅 魏东 奚佳铭 《海南医学》 CAS 2019年第4期413-416,共4页
目的对临床诊断疑似为脊肌萎缩症(SMA)的患儿进行运动神经元生存基因(SMN)缺失分析,通过基因诊断对SMA进行确诊。方法收集2015年1月至2016年12月上海市儿童医院新生儿科及神经内科就诊的疑似SMA患儿29例,患儿就诊年龄11 d~14岁。采用... 目的对临床诊断疑似为脊肌萎缩症(SMA)的患儿进行运动神经元生存基因(SMN)缺失分析,通过基因诊断对SMA进行确诊。方法收集2015年1月至2016年12月上海市儿童医院新生儿科及神经内科就诊的疑似SMA患儿29例,患儿就诊年龄11 d~14岁。采用多重连接探针扩增(MLPA)技术对上述患儿外周血DNA样本进行基因诊断。结果 15例存在SMA致病突变,疑似患儿的SMA基因诊断率为51.7%(15/29)。其中8例为SMN1基因外显子7和外显子8纯合缺失;3例为SMN1基因外显子7和外显子8纯合缺失,SMN2基因外显子7拷贝数增加;4例为SMN1基因外显子7纯合缺失,外显子8杂合缺失。另外14例存在不直接致病的突变。按照SMA国际诊断标准,15例确诊患者中Ⅰ型5例,Ⅱ型5例,Ⅲ型5例,均占33.3%。其中Ⅰ型的5例患儿均为SMN1基因外显子7、8纯合缺失,仅有1例存在SMN2基因外显子7拷贝的轻度增加。结论 MLPA技术灵敏度较高,可作为SMA疑似患者首选的诊断方法,为SMA的明确诊断提供依据。 展开更多
关键词 脊肌萎缩症 运动神经元生存基因 多重连接探针扩增 基因诊断
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多光谱可见光通信信道串扰分析 被引量:2
9
作者 崔璐 唐义 +2 位作者 朱庆炜 骆加彬 胡珊珊 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第9期112-119,共8页
在可见光通信领域,通过波分复用技术可以增加信道个数,从而提高系统通信容量.然而发光二极管(LED)的辐射光谱具有一定线宽,当信道个数增加,信道间隔将变小,尽管有滤光片的通道选择,但LED的辐射光谱会出现重叠从而产生信道串扰.本文基于... 在可见光通信领域,通过波分复用技术可以增加信道个数,从而提高系统通信容量.然而发光二极管(LED)的辐射光谱具有一定线宽,当信道个数增加,信道间隔将变小,尽管有滤光片的通道选择,但LED的辐射光谱会出现重叠从而产生信道串扰.本文基于LED光谱重叠现象分析了多光谱波分复用可见光通信系统的信道串扰问题.首先结合LED的物理机制和实际LED的光谱形状对其光谱进行建模;然后根据光谱重叠现象和可见光通信信道推导出信道串扰公式;最后利用不同中心波长的LED在两通道可见光通信系统中验证了信道串扰公式的正确性.仿真和实验结果表明,当两信道的信道间隔大于28 nm时,两信道之间的信道串扰不超过-13.6 d B.对多光谱波分复用可见光通信系统的信道串扰分析对未来可见光通信增加信道数量有一定指导作用. 展开更多
关键词 可见光通信 波分复用 光谱重叠 信道串扰
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牛布鲁菌与牛分枝杆菌双重PCR方法的建立及应用 被引量:1
10
作者 潘文 王波 +3 位作者 薛红 赵明秋 琚春梅 陈金顶 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期100-103,107,共5页
根据GenBank中已发表的流产布鲁菌种特异的omp25基因序列及牛分枝杆菌特异保守的16S rRNA加工蛋白rimM基因序列设计了2对特异性引物,通过对PCR条件的优化,建立了快速鉴别检测牛布鲁菌Brucella abortus和牛分枝杆菌Mycobacterium bovis... 根据GenBank中已发表的流产布鲁菌种特异的omp25基因序列及牛分枝杆菌特异保守的16S rRNA加工蛋白rimM基因序列设计了2对特异性引物,通过对PCR条件的优化,建立了快速鉴别检测牛布鲁菌Brucella abortus和牛分枝杆菌Mycobacterium bovis的双重PCR方法.对建立的方法进行特异性和敏感性试验,结果显示,在牛布鲁菌和牛分枝杆菌中分别扩增出448、269 bp的特异性目的条带,作为对照的大肠杆菌Escherichia coli、沙门菌Salmo-nella typhimurium、八叠球菌Sarcina lutea、金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus、巴氏杆菌Pasteurella multocida、军团菌Legionella pneumophila、枯草杆菌Bacillus subtilis及溶血性链球菌Streptococcus pneumonia均未扩增出任何条带.牛布鲁菌和牛分枝杆菌的DNA最低检出量均为10 pg;牛奶样品中人工污染的牛布鲁菌和牛分枝杆菌的检测敏感性分别为7.9×103CFU/mL、3 ng/mL. 展开更多
关键词 牛布鲁菌 牛分枝杆菌 双重PCR 快速鉴别检测
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PSTN可视电话中V.80协议的研究与实现 被引量:1
11
作者 喻占武 李锐 胡瑞敏 《武汉大学学报(信息科学版)》 EI CSCD 北大核心 2002年第1期17-22,共6页
介绍了PSTN可视电话和V .80协议的基本原理 ,针对甚低带宽的PSTN线路特点 ,实现了一种有效的同步传输控制模型 ,改进了H .32 4可视电话的性能 ,实现了与其他符合H .32 4国际标准的可视电话的良好互通性。
关键词 PSTN可视电话 V.80协议 数据复用 同步传输
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光纤甲烷传感复用系统的研究 被引量:3
12
作者 付华 陈宝石 《大气与环境光学学报》 CAS 2008年第1期52-56,共5页
基于甲烷气体在近红外波段对光的吸收机理,提出一种新安全型光纤甲烷传感器系统。系统以ELED作为宽带入射光源,利用甲烷在光纤低损耗窗口波段的吸收特性,利用波分复用技术和直角棱镜吸收池,并采用提高波长检测精度的DMF(数字匹配滤波器... 基于甲烷气体在近红外波段对光的吸收机理,提出一种新安全型光纤甲烷传感器系统。系统以ELED作为宽带入射光源,利用甲烷在光纤低损耗窗口波段的吸收特性,利用波分复用技术和直角棱镜吸收池,并采用提高波长检测精度的DMF(数字匹配滤波器)对微弱信号进行处理,使得系统的灵敏度达到120 ppm。实验研究表明,此系统的稳定性和检测精度还需进一步提高。 展开更多
关键词 波分复用技术 甲烷 光纤传感器 DMF 吸收池
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二重RT-FCR同时测定HGV与HCV RNA方法学研究 被引量:2
13
作者 张冬雷 王惠民 +1 位作者 徐芳芹 崔之础 《交通医学》 1998年第1期3-4,共2页
本文对二重RT-PCR同时测定HGV与HCV RNA的反应条件进行了最佳化研究,发现在用于HGV扩增的三组引物中,NS5b区的L与S二组引物较5'NCR区的N组引物有更高的检测敏感度(P<0.01)。不同的样本贮存对HGV与HCV RNA检测结果影响较大,将逆... 本文对二重RT-PCR同时测定HGV与HCV RNA的反应条件进行了最佳化研究,发现在用于HGV扩增的三组引物中,NS5b区的L与S二组引物较5'NCR区的N组引物有更高的检测敏感度(P<0.01)。不同的样本贮存对HGV与HCV RNA检测结果影响较大,将逆转录与第一次扩增分开进行可使测定敏感度提高约100倍。本法在同一反应体系中可同时检测HGV与HCV RNA,减轻了实验人员的操作强度,可降低测定费用近50%。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 庚型肝炎病毒 多重PCR RNA
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D3S1358、D21S11和FGA复合扩增系统的研究
14
作者 范晶 许杨 +2 位作者 熊勇华 胡娜 杨辉 《生物技术》 CAS CSCD 2003年第4期11-12,共2页
目的 :研究D3S135 8、D2 1S11和FGA3个STR基因座复合扩增的最佳体系。方法 :设计正交实验优化复合扩增最佳反应条件 ,然后采用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离显带技术检测扩增片段。结果 :获得复合扩增条件各反应因素较为满意的参数。
关键词 D3S1358 D21S11 FGA 复合扩增系统 基因座 中国人 DNA数据库 显带 检测
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抗虫转基因欧洲黑杨多重PCR技术检测体系构建
15
作者 刘海涛 周静 +2 位作者 张川红 冯锦霞 郑勇奇 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2011年第3期334-339,共6页
根据抗虫转基因欧洲黑杨中的CaMV35S启动子、NOS终止子、NPTⅡ标记基因以及Bt目的基因序列,设计合成了相应引物,采用单重PCR和多重PCR技术对启动子、终止子、选择标记基因以及目的基因等多个外源基因进行检测,并对各引物的退火温度及引... 根据抗虫转基因欧洲黑杨中的CaMV35S启动子、NOS终止子、NPTⅡ标记基因以及Bt目的基因序列,设计合成了相应引物,采用单重PCR和多重PCR技术对启动子、终止子、选择标记基因以及目的基因等多个外源基因进行检测,并对各引物的退火温度及引物之间的浓度配比进行优化,建立了适用于抗虫转基因欧洲黑杨检测的Bt、NPTⅡ和NOS基因的三重PCR分析的技术体系。结果表明:当各组引物的终浓度配比为1.0∶0.5∶0.5,退火温度为59℃时,所建立的三重PCR检测体系能够有效地检测出抗虫转基因欧洲黑杨中的转基因成分,实现了对抗虫转基因欧洲黑杨的快速、高效、准确的鉴定。 展开更多
关键词 抗虫转基因 欧洲黑杨 多重PCR检测 外源基因
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液晶显示器的多极驱动方式
16
作者 付慧生 张启华 《工业仪表与自动化装置》 1993年第3期3-7,共5页
本文阐述了液晶显示器(LCD)的主要技术特性与驱动方法,重点论述了LCD的多极驱动方式,并结合一种以三极方式驱动LCD的单片4(1/2)位A/D转换器。
关键词 液晶显示器 直接驱动 多极驱动
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Utilization of Pyrosequencing to Monitor the Microbiome Dynamics of Probiotic Treated Poultry (<i>Gallus gallus domesticus</i>) during Downstream Poultry Processing
17
作者 Vamsy Priya Guttala Enrique G. Medrano +1 位作者 Joey Bray Beatrice Clack 《Agricultural Sciences》 2017年第7期675-691,共17页
Antibiotic growth promoters that have been historically employed to control pathogens and increase the rate of animal development for human consumption are currently banned in many countries. Probiotics have been prop... Antibiotic growth promoters that have been historically employed to control pathogens and increase the rate of animal development for human consumption are currently banned in many countries. Probiotics have been proposed as an alternative to control pathogenic bacteria. Traditional culture methods typically used to monitor probiotic effects on pathogens possess significant limitations such as a lack in sensitivity to detect fastidious and non-culturable bacteria, and are both time consuming and costly. Here, we tested next generation pyrosequencing technology as a streamline and economical method to monitor the effects of a probiotic on microbial communities in juvenile poultry (Gallus gallus domesticus) after exposure to several microbiological challenges and litter conditions. Seven days and repeated again at 39 days following hatching, chicks were challenged with either Salmonella enterica serovar Enteritidis, Campylobacter jejuni, or no bacteria in the presence of, or without a probiotic (i.e., Bacillus subtilis) added to the feed. Three days following each of two challenges (i.e., days 10 and 42, respectively) the microbiome distributions of the poultry caecum were characterized based on 16S rDNA analysis. Generated PCR products were analyzed by automated identification of the samples after pooling, multiplexing and sequencing. A bioinformatics pipeline was then employed to identify microbial distributions at the phylum and genus level for the treatments. In conclusion, our results demonstrated that pyrosequencing technology is a rapid, efficient and cost-effective method to monitor the effects of probiotics on the microbiome of poultry propagated in an agricultural setting. 展开更多
关键词 POULTRY Production PROBIOTICS PYROSEQUENCING mutiplex IDENTIFIER (MID) Microbiota
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SIGNAL CONSTELLATIONS DESIGN FOR DIFFERENTIAL UNITARY SPACE-TIME IN MIMO-OFDM SYSTEM OVER FREQUENCY-SELECTIVE FADING CHANNELS
18
作者 Chen Jing Zhu Qi 《Journal of Electronics(China)》 2008年第3期300-304,共5页
In this paper, the design of signal constellations parameters is studied for Differential Unitary Space-Time Modulation (DUSTM) based on the design criterion of maximizing the diversity product. Further, noninteger se... In this paper, the design of signal constellations parameters is studied for Differential Unitary Space-Time Modulation (DUSTM) based on the design criterion of maximizing the diversity product. Further, noninteger searching method for the signal constellation parameters design is proposed in order to get better codes. Experimental results show that under the different Doppler spread and data transmission rate, the proposed design performs better than the previous design using integer parameters in Multiple Input Multiple Output Orthogonal Frequency Division Multiplexing (MIMO-OFDM) system over frequency-selective fading channels. 展开更多
关键词 Differential Unitary Space-Time Modulation (DUSTM) Diversity product Signal constellations Multiple Input Multiple Output (MIMO) Orthogonal Frequency Division mutiplexing (OFDM)
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