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圈养野生动物源产气荚膜梭菌分离株的MLST分型及毒力基因分析
1
作者 徐春忠 徐锋 王建 《野生动物学报》 北大核心 2025年第3期674-680,共7页
为了解上海地区动物园流行的产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)的ST型,探讨其可能的遗传进化关系和潜在致病性,通过细菌基因组框架图测序对10株产气荚膜梭菌进行回顾性研究,对菌株MLST分型和致病性进行分析。结果显示:10株菌均为A... 为了解上海地区动物园流行的产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)的ST型,探讨其可能的遗传进化关系和潜在致病性,通过细菌基因组框架图测序对10株产气荚膜梭菌进行回顾性研究,对菌株MLST分型和致病性进行分析。结果显示:10株菌均为A型产气荚膜梭菌,分属于6个新的ST型,并携带有大量的毒力基因,包括plc(α毒素)、pfoA(θ毒素)等16种主要的毒力因子,以及hlyⅢ、hlyB等22种可能来源于其他菌属的毒力基因。研究发现,动物园的产气荚膜梭菌以A型为主,但存在遗传多样性、宿主多样性等特点,同时携带大量的毒力因子对人和动物均存在较大的风险。 展开更多
关键词 动物园 产气荚膜梭菌 多位点序列分型 致病性
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多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用 被引量：13
2
作者 刘祥 许彦梅 +6 位作者 王斌 邓建平 肖波 孙松松 周阳 熊衍文 王红 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1033-1036,共4页
目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等... 目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。 展开更多
关键词 多位点序列分型技术(mlst) 艾伯特埃希菌 新病原
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社区和医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MLST联合SCCmec基因分型及耐药性比较 被引量：14
3
作者 纪冰 王凤霞 +6 位作者 赵红梅 孙吉花 王涛 刘永云 李娜 孟玮 张玉梅 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期52-55,共4页
目的了解社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)和医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(HAMRSA)分离株的耐药性及遗传背景。方法对CA-MRSA和HA-MRSA进行多位点序列分型(MLST)检测,应用多重聚合酶链式反应(PCR)技术对CA-MRSA和HA-... 目的了解社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)和医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(HAMRSA)分离株的耐药性及遗传背景。方法对CA-MRSA和HA-MRSA进行多位点序列分型(MLST)检测,应用多重聚合酶链式反应(PCR)技术对CA-MRSA和HA-MRSA进行SCCmec基因分型;采用Walk WAY96PLUS PC33药敏板联合K-B纸片扩散法检测CA-MRSA和HA-MRSA抗菌药物敏感性。结果 63株HA-MRSA共检测出2个基因型,4株CA-MRSA共检测出4个基因型,二者遗传背景完全不同。HA-MRSA对红霉素、克林霉素、四环素、庆大霉素、左氧氟沙星和环丙沙星耐药率显著高于CAMRSA(均P<0.05)。结论滨州医学院附属医院CA-MRSA和HA-MRSA分型及主要流行株存在差异,CA-MSSA药物敏感性明显高于HA-MRSA;MLST联合SCCmec基因分型方法是MRSA分子流行病学分析的有效方法。 展开更多
关键词 社区获得性 医院获得性 金黄色葡萄球菌 多位点序列分型 葡萄球菌mec盒式染色体
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利用MLST技术对浙江省大肠杆菌O157的分子流行病学研究 被引量：7
4
作者 叶菊莲 占利 +3 位作者 梅玲玲 罗芸 姚苹苹 姜理平 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期901-904,共4页
目的对浙江省2005-2010年大肠杆菌O157分离株进行分子分型研究,了解菌株间的遗传进化关系,为浙江省大肠杆菌O157监测及爆发疫情的控制提供基础。方法选择Pasteur大肠杆菌多位点序列分型(Multilocus SequenceTyping,MLST)方案,对大肠杆菌... 目的对浙江省2005-2010年大肠杆菌O157分离株进行分子分型研究,了解菌株间的遗传进化关系,为浙江省大肠杆菌O157监测及爆发疫情的控制提供基础。方法选择Pasteur大肠杆菌多位点序列分型(Multilocus SequenceTyping,MLST)方案,对大肠杆菌O157分离株及882364菌株进行MLST分型,确定菌株序列型(Sequence type,ST);采用DNAsp、eBURST、START2等软件进行分析。结果 30株菌中,27株O157∶H7菌株具备相同序列型(ST-284),占90%(27/30),其他3株菌序列型分别为ST-367、ST-125、ST-296。8个管家基因核苷酸多态性(Pi)范围为0.00119(polB)～0.00648(uidA),putP基因多态性位点比例最高(4.6%),trpA基因多态性位点比例最低(0.4%)。进化分析结果显示,这些序列型分别属于Group 1及Group 11群。结论浙江省动物源性大肠杆菌O157∶H7的主要序列型为ST-284,与江苏省病人株882364(ST-296)具有同一个进化祖先,提示应加强浙江省大肠杆菌O157病原学监测。 展开更多
关键词 大肠杆菌O157 多位点序列分型(mlst) 管家基因 分子流行病学
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两株炭疽芽胞杆菌MLST新序列型(ST) 被引量：6
5
作者 左庭婷 李岩伟 +2 位作者 韩雪莲 何君 端青 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期120-123,共4页
【目的】2株炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)17003-14和17003-32的多位点序列分型(Multilocussequence typing,MLST)研究。【方法】选取B.anthracis基因组7个常见管家基因位点glpF、gmk、ilvD、pta、pur、pycA和tpi进行PCR扩增、测序,... 【目的】2株炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)17003-14和17003-32的多位点序列分型(Multilocussequence typing,MLST)研究。【方法】选取B.anthracis基因组7个常见管家基因位点glpF、gmk、ilvD、pta、pur、pycA和tpi进行PCR扩增、测序,与MLST数据库中的等位基因序列进行比对,确定菌株的序列型(sequence type,ST)。【结果】B.anthracis 17003-14和17003-32的等位基因编号分别为113、31、1、43、1、53、7和113、31、1、43、1、53、37,比对结果显示这2株细菌的等位基因编号组合未见报道。【结论】17003-14和17003-32为新ST菌株,已被MLST数据库确认,注册号(pubMLST id)分别为id-1053和id-1054。 展开更多
关键词 炭疽芽胞杆菌 多位点序列分型 序列型 基因分型
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动物源肺炎克雷伯菌耐药性及MLST分析 被引量：16
6
作者 杨帆 魏纪东 +1 位作者 李敏 赵永新 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期776-780,共5页
为了解本地区动物源肺炎克雷伯菌耐药性及分子流行病学特征,本研究收集分离于4种动物的肺炎克雷伯菌67株,采用K-B纸片扩散法和肉汤稀释法测定其对15种常用抗生素的敏感性,并采用多位点序列分型技术（MLST）对所有菌株进行分子遗传学分析... 为了解本地区动物源肺炎克雷伯菌耐药性及分子流行病学特征,本研究收集分离于4种动物的肺炎克雷伯菌67株,采用K-B纸片扩散法和肉汤稀释法测定其对15种常用抗生素的敏感性,并采用多位点序列分型技术（MLST）对所有菌株进行分子遗传学分析;同时利用e BURST软件对多位点序列分型结果进行分析。药敏结果显示,67株动物源肺炎克雷伯菌对15株常用抗生素的耐药率为2.99%-61.19%,多重耐药菌株占40.3%,不同来源的菌株耐药性存在明显差异。MLST分析表明,全部菌株共分成17个ST型,其中鸡源菌株有5个（ST235、ST37、ST2019、ST2021、ST726）、猪源菌株有6个（ST258、ST11、ST270、ST106、ST1863、ST263）、兔源菌株有4个（ST17、ST148、ST60、ST168）、犬源菌株有3个（ST11、ST65、ST74）,其中ST11为猪源菌株和犬源菌株共有的类型。结果表明肺炎克雷伯菌在不同动物中的流行表现一定的分子差异,对常用抗生素的耐药呈现多重耐药的趋势。本研究将肺炎克雷伯菌的耐药表型与MLST分子型结合进行调查研究,揭示二者间关系,为进一步开展肺炎克雷伯菌分子流行病学研究、防控耐药菌株的暴发流行提供依据。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 动物 耐药性 多位点序列分型
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辽宁省市售禽肉中沙门氏菌的污染状况及其MLST分型与耐药性分析 被引量：10
7
作者 于淼 耿英芝 +2 位作者 张铭琰 刘海霞 张眉眉 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2486-2493,共8页
【背景】沙门氏菌(Salmonella)是重要的人畜共患病原菌,可通过禽类及其产品传播给人类,对人类健康造成威胁。了解市售禽肉中沙门氏菌病原学特征及耐药情况,对公共卫生具有重要意义。【目的】了解2022年辽宁省市售禽肉中沙门氏菌的污染... 【背景】沙门氏菌(Salmonella)是重要的人畜共患病原菌,可通过禽类及其产品传播给人类,对人类健康造成威胁。了解市售禽肉中沙门氏菌病原学特征及耐药情况,对公共卫生具有重要意义。【目的】了解2022年辽宁省市售禽肉中沙门氏菌的污染状况、血清型分布、药物敏感性及分子流行特征情况,探讨不同血清型与多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、耐药性之间的关系。【方法】依据GB4789.4―2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》检验方法对收集的样品进行检测及生化实验鉴定,采用玻片凝集法进行血清学实验,用微量肉汤法对菌株进行药物敏感性试验,使用BioNumerics7.6软件对药敏结果、MLST分型结果进行分析。【结果】53株沙门氏菌包含11种血清型,以肠炎沙门氏菌(Salmonella enteritidis)为主。药物敏感性分析中,沙门氏菌对萘啶酸(nalidixic acid,NAL)的耐药率最高,为92.5%(49/53),共发现有25种多重耐药谱,总耐药率为66.0%(35/53),在耐药基因分析中,四环素类耐药基因tetC携带率最高为45.3%(24/53)。根据7种管家基因的序列沙门氏菌被分为10个ST型别和1个未分型型别。【结论】辽宁省市售禽肉沙门氏菌的污染率较为严重,血清型多样化,整体耐药水平较高,多重耐药情况严重,应加强对禽类规范化养殖。 展开更多
关键词 禽肉 沙门氏菌 mlst 耐药性 耐药基因
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新疆食源性单增李斯特菌MLST分型及耐药性分析 被引量：10
8
作者 康立超 钱晶 +6 位作者 杜冬冬 王国红 刘玉霞 殷月兰 黄新 张星星 罗瑞峰 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2021年第15期6255-6261,共7页
目的研究新疆食源性单增李斯特菌分型和耐药情况。方法将62株食源性和1株羔羊脑炎分离株进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)及耐药性实验。结果 63株单增李斯特菌分为20个ST型, 16个克隆群(clonal complex groups, C... 目的研究新疆食源性单增李斯特菌分型和耐药情况。方法将62株食源性和1株羔羊脑炎分离株进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)及耐药性实验。结果 63株单增李斯特菌分为20个ST型, 16个克隆群(clonal complex groups, CC),其中68.25%(43/63)属于谱系Ⅱ,其余属于谱系Ⅰ。优势ST型是ST8、ST9、ST121、ST87和ST378,优势CC群是CC8、CC9、CC1和CC121。对苄青霉素(penicillin, P)、氨苄西林(ampicillin, AM)、苯唑西林(oxacillin, OX1) 3种抗生素耐药率达100%;对庆大霉素(gentamicin, GM)、莫西沙星(moxifloxacin,MXF)、红霉素(erythromycin,E)、奎奴普丁/达福普丁(quinupristin,QDA)、利奈唑胺(linezolid, LNZ)、万古霉素(vancomycin, VA)、替加环素(tigecycline, TGC)、利福平(rifampin, RA)和诱导性克林霉素耐性(induced clindamycin resistance, ICR) 9种抗生素敏感率达100%;对呋喃妥因(furadantin, FT)耐药率61.90%(39/63),其中ST7、ST8、ST101、ST155和ST515对此次的3-4类药物表现出多重耐药性。结论新疆单增李斯特菌分子型别呈多样性,耐药谱变宽,存在较大的食品安全风险。 展开更多
关键词 新疆 单增李斯特菌 多位点序列分型 耐药性
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进出口食品中不同血清型沙门氏菌PFGE和MLST分型比较研究 被引量：24
9
作者 刘慧玲 万志刚 +6 位作者 洪小柳 谢丹妮 黄李华 赵芳 薛峰 蒋源 吕敬章 《食品安全质量检测学报》 CAS 2014年第11期3454-3461,共8页
目的通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)两种方法对进出口食品中不同血清型沙门氏菌的分辨力和应用价值进行了比较研究。方法采用PFGE和MLST两种方法对进出口食品中分离得到的鼠伤寒及肠炎两种血清型共30株沙门氏菌进行分... 目的通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)两种方法对进出口食品中不同血清型沙门氏菌的分辨力和应用价值进行了比较研究。方法采用PFGE和MLST两种方法对进出口食品中分离得到的鼠伤寒及肠炎两种血清型共30株沙门氏菌进行分型研究。结果两种血清型共30株沙门氏菌经PFGE分型可得到23种型别,DI值为0.9563;鼠伤寒和肠炎两种血清型菌分别经PFGE分型,DI值分别为1.000和0.9048。MLST对30株沙门氏菌分型得到4种ST型,DI值为0.5793;鼠伤寒和肠炎两种血清型菌分别经MLST分型,DI值分别为0.2571和0.1333。结论 在分辨力方面,PFGE更适合于同一沙门氏菌血清型的分型,MLST则适合于不同沙门氏菌血清型间的分型。MLST在替代、补充血清型分型方面有潜在的优势,PFGE在溯源研究方面更胜一筹。 展开更多
关键词 食品 鼠伤寒沙门氏菌 肠炎沙门氏菌 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MLST联合SCCmec基因分型与耐药性分析 被引量：6
10
作者 纪冰 王凯凯 +4 位作者 赵红梅 董艳 孟玮 邢敏 孙吉花 《中国现代医学杂志》 CAS 2018年第10期32-36,共5页
目的了解滨州医学院附属医院MRSA菌株多位点序列分型(MLST)联合SCCmec基因型分布和各种基因型的耐药特征。方法采用聚合酶链反应(PCR)对MRSA菌株进行MLST联合SCCmec基因分型;采用Walk WAY96PLUS PC33药敏板检测MRSA抗菌药物敏感性。结果... 目的了解滨州医学院附属医院MRSA菌株多位点序列分型(MLST)联合SCCmec基因型分布和各种基因型的耐药特征。方法采用聚合酶链反应(PCR)对MRSA菌株进行MLST联合SCCmec基因分型;采用Walk WAY96PLUS PC33药敏板检测MRSA抗菌药物敏感性。结果 SCCmec基因分型结果以Ⅲ型为主(63/67株,占94.03%),MLST分型共检测出6种基因型:ST88、ST121、ST221、ST82、ST239及ST399,其中以ST239(61/67,91.04%)为主,耐药性分析显示SCCmecⅢ型MRSA菌株表现为多重耐药。结论ST239-MRSA-SCCmecⅢ型菌株为鲁北地区MRSA主要流行菌株,该型菌株对多种抗生素呈多重耐药;MLST联合SCCmec基因分型方法是MRSA遗传背景研究简便快速的方法。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 多位点序列分型 葡萄球菌mec盒式染色体 耐药
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利用MLST技术探讨不同地区致病性耐药鸡源大肠杆菌的遗传进化关系 被引量：9
11
作者 王龙光 姜雯 +7 位作者 逄春华 胡学远 赵思俊 王娟 黄秀梅 盖文燕 刘焕奇 曲志娜 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1680-1686,1692,共8页
选取来自山东等10省698株鸡源大肠杆菌为研究对象,分别利用PCR、微量肉汤稀释法、MLST技术方法进行系统进化群分群、耐药表型检测、分子分型,并采用Bio Numerics v4.0软件和SPSS20.0软件进行数据处理分析。结果显示,低致病群B_1群为48.8... 选取来自山东等10省698株鸡源大肠杆菌为研究对象,分别利用PCR、微量肉汤稀释法、MLST技术方法进行系统进化群分群、耐药表型检测、分子分型,并采用Bio Numerics v4.0软件和SPSS20.0软件进行数据处理分析。结果显示,低致病群B_1群为48.85%(341/698)和非致病群A群24.64%(172/698)分布较多,高致病群D群20.20%(141/698)和B_2群为6.31%(44/698)。鸡源大肠杆菌耐药严重,12种药物的耐药率约在50%以上。B_2和D群菌株对8种抗菌药的耐药率高于A和B_1群菌株,其中对庆大霉素、大观霉素、头孢噻呋、氨苄西林和奥格门丁5种药物极显著性差异(P<0.01),对氟苯尼考和复方新诺明显著性差异(P<0.05)。135株高致病菌株经MLST分型得到48个ST型,ST117(12株)和ST354(12株)最多,其次是ST115(8株),ST2309(8株),ST10型(7株),ST69(6株),ST1011(5株),ST1158(5株)。有29个ST型各1株,18株菌株未分出序列型。不同地区大肠杆菌ST型分布存在差异,ST69和ST354型分布最为广泛(4个省),其次是ST115、ST117和ST2309型(3个省),ST10、ST48、ST57、ST362、ST371、ST1011和ST1158(2个省),其余36个ST型菌株仅在1个省市有检出。135株菌株分为35个聚类簇,其中23个聚类簇的遗传相似性在40%以下,但有6个聚类簇菌株间的遗传相似性均在80%以上。48个ST型菌株共获得了76种耐药谱。我国各地健康鸡群隐性携带相对较高比例的高致病菌株,且耐药程度相对严重,耐药谱较广。鸡源大肠杆菌菌株分布具有多态性和地域性,ST型与耐药谱之间无相关性。 展开更多
关键词 鸡源大肠杆菌 致病性 系统进化群 耐药性 多位点序列分型
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副猪嗜血杆菌的MLST分析及数据库建立 被引量：4
12
作者 朱必凤 杨旭夫 +1 位作者 彭凌 韦昭玉 《南昌大学学报（理科版）》 CAS 北大核心 2011年第3期284-287,295,共5页
对副猪嗜血杆菌86个分离株的7个看家基因，包括ATP合成酶J9链（atpD）、翻译起始因子IF-2（in-fB）、核糖体蛋白口亚基（rpoB）、苹果酸脱氢酶（mdh）、6-磷酸葡萄糖脱氢酶（6pgd）、3-磷酸甘油醛脱氢酶（g3pd）和延胡索酸还原酶B（frd... 对副猪嗜血杆菌86个分离株的7个看家基因，包括ATP合成酶J9链（atpD）、翻译起始因子IF-2（in-fB）、核糖体蛋白口亚基（rpoB）、苹果酸脱氢酶（mdh）、6-磷酸葡萄糖脱氢酶（6pgd）、3-磷酸甘油醛脱氢酶（g3pd）和延胡索酸还原酶B（frdB）进行了PCR扩增；对扩增产物进行了测序；对序列编辑、队列比对、建立MI．ST定义、等位基因序列文件等，与牛津大学动物系KeithJolley合作建立了副猪嗜血杆菌86个分离株的MI。ST数据库。经MLST分析发现所研究的分离株有高度的遗传异源性，86个菌株被分成74个序列类型。基因平均距离为0．674，h-0．804。每个基因位点存在64～76不等数目的等位基因。基因序列多态性位点最大（fedB）达325和（6pgd）219，最小（in，-B）为77；用UPGMA分析确定了5个菌群。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 看家基因 多基因位点分析 序列分型
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两株布鲁菌MLST新序列型(ST)的鉴定 被引量：2
13
作者 吕燕宁 郭潇潇 +6 位作者 陈丽娟 吕冰 常建华 华文浩 王慧珠 黎新宇 王全意 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期434-440,446,共8页
目的对北京地区分离自布病患者血液的2株布鲁菌进行多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)及其遗传学特征进行研究,为布病的预防和控制提供科学依据。方法应用布鲁菌属特异性PCR(BCSP31-PCR)和种/型特异性PCR(AMOS-PCR)对分... 目的对北京地区分离自布病患者血液的2株布鲁菌进行多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)及其遗传学特征进行研究,为布病的预防和控制提供科学依据。方法应用布鲁菌属特异性PCR(BCSP31-PCR)和种/型特异性PCR(AMOS-PCR)对分离的2株布鲁菌进行鉴定,采用MLST技术对2株布鲁菌分离株的19个管家基因、1个外膜蛋白基因及1个基因间区的序列进行测定,与MLST数据库中的等位基因序列进行比对,确定菌株的等位基因谱及9位点和21位点序列型(sequence type,ST)。采用聚类分析法研究2株菌ST型与各种布鲁菌已知ST型的遗传进化关系。结果 2株分离株经BCSP31-PCR鉴定为布鲁菌属细菌,AMOS-PCR鉴定为非羊种、非牛种1、2、4型、非猪种1型、非绵羊附睾种布鲁菌;MLST分析显示,2株菌的等位基因编号(gap/aroA/glk/dnaK/gyrB/trpE/cobQ/int-hyp/omp25/prpE/caiA/csdB/soxA/leuA/mviM/fumC/fbaA/ddlA/putA/mutL/acnA)分别为2、1、2、2、1、3、1、4、1、13、2、2、2、2、1、1、3、7、6、2、3和2、1、2、2、1、3、1、4、29、13、2、2、2、2、1、1、3、7、6、2、3,比对MLST数据库,结果显示这2株细菌的等位基因编号组合未见报道,为新ST型。聚类分析显示这2种新的ST型与牛种布鲁菌ST型处于同一分支。结论北京地区分离的2株布鲁菌为新ST型牛种布鲁菌,已被MLST数据库确认,分别命名为ST74和ST75(9位点序列型)与ST108和ST109(21位点序列型)。与同属牛种布鲁菌的ST型遗传关系最近,该结果为北京地区布病的预防和控制提供了科学依据。 展开更多
关键词 布鲁菌 多位点序列分型 序列型 基因分型
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浙江省三地区冷鲜鸡中大肠埃希菌耐药谱测定及MLST分子分型分析 被引量：2
14
作者 杨华 何祥祥 +3 位作者 肖英平 钱鸣蓉 张巧艳 唐标 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期888-893,共6页
大肠埃希菌是食品中普遍污染的条件致病菌,其耐药性非常严重,耐药基因具有极大的传播风险。为了解浙江省地区禽源大肠埃希菌耐药性特点及分布规律,试验从浙江省3个地区市售冷鲜鸡中分离了59株大肠埃希菌并测定了耐药谱,发现有24种耐药谱... 大肠埃希菌是食品中普遍污染的条件致病菌,其耐药性非常严重,耐药基因具有极大的传播风险。为了解浙江省地区禽源大肠埃希菌耐药性特点及分布规律,试验从浙江省3个地区市售冷鲜鸡中分离了59株大肠埃希菌并测定了耐药谱,发现有24种耐药谱,显示了分离株耐药类型的多样性。同时对分离株进行了Multilocus sequence typing(MLST)分子分型,获得38个已知ST型,并发现2个新的ST型。在此基础上,针对7个看家基因进行了系统发育分析,分离株显示了一定的地区差异性。该试验结果可为浙江省禽源大肠埃希菌的耐药性评价和溯源分析提供参考依据。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 细菌耐药性 多位点序列分型(mlst) 系统发育树
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上海市动物源性食品中单增李斯特菌的MLST分析 被引量：9
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作者 刘萍萍 王少辉 +5 位作者 赵秋华 李蓓蓓 邵东华 史子学 魏建超 马志永 《中国动物传染病学报》 CAS 2013年第4期18-22,共5页
为了解上海市动物性食品中单增李斯特菌的进化情况和群体遗传学特征,本研究采用MLST法和eBURST软件对33株分离株进行分子分型及进化树分析。结果共分成8个型别,并且33株单增李斯特菌之间遗传相关性不是很大。分为4个进化谱系:ST11和ST19... 为了解上海市动物性食品中单增李斯特菌的进化情况和群体遗传学特征,本研究采用MLST法和eBURST软件对33株分离株进行分子分型及进化树分析。结果共分成8个型别,并且33株单增李斯特菌之间遗传相关性不是很大。分为4个进化谱系:ST11和ST196为一个进化谱系,ST9、ST8和ST155为一个进化谱系,ST87和ST277/589为一个进化谱系,所占比例最多的ST121单独一个进化谱系。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 mlst分型 管家基因 进化树
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MLST分型技术应用于脑膜炎奈瑟菌的分子流行病学研究 被引量：12
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作者 邓小玲 管大伟 +5 位作者 黎薇 刘美真 张万里 柯碧霞 柯昌文 杨杏芬 《华南预防医学》 2008年第3期10-14,共5页
目的对广东省1967-2007年自流行性脑脊髓膜炎(流脑)病人中分离的脑膜炎奈瑟菌(neisseria meningitidis,N.meningitidis)进行分子流行病学研究,了解菌株间的遗传进化关系。方法采用多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)技术... 目的对广东省1967-2007年自流行性脑脊髓膜炎(流脑)病人中分离的脑膜炎奈瑟菌(neisseria meningitidis,N.meningitidis)进行分子流行病学研究,了解菌株间的遗传进化关系。方法采用多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)技术,分别对1967-2007年分离的16株N.meningitidis菌株的7个看家基因的序列进行测定,并将序列与PubMLST数据库中储存的序列比对,确定其等位基因谱型及菌株序列型(Sequencetype,ST),并采用Splits Tree在线软件分析菌株之间的进化关系。结果16株N.meningitidis菌株分为13株A群、2株C群和1株W135群,分属5大克隆系,分别为ST-5、ST-1、ST-4821、ST-11克隆系和未知克隆系的ST-254序列型,其中ST-5克隆系所占比例最多,占68.75%(11/16)。1967-2006年的13株A群分离株中,11株属ST-5克隆系,占84.61%(11/13),另有1977年的1株分离株为ST-1克隆系和1株1984年的分离株为未知克隆系的ST-254序列型;2004和2006年的C群分离株属新出现的高致病性克隆系ST-4821;2007年首次分离的1株W135群菌株为ST-2960,属高致病性的ST-11/ET-37克隆系的子克隆。结论分离于不同年代病人的广东N.meningitidis分离株呈多克隆系并存,但近期以高致病性克隆系为主,特别是广东省首次出现高致病性ST-11/ET-37克隆系的W135群,提示应加强流脑的病原学监测。应用MLST分子分型技术,初步揭示了广东省脑膜炎奈瑟菌的遗传进化关系,基于等位基因图谱的MLST基因分型技术具有较高的分辨率,并通过互联网实现了序列数据库信息的全球共享。 展开更多
关键词 奈瑟球菌 脑膜炎 多位点序列分型技术 分子流行病学
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应用MLST方法对宜昌地区肺炎克雷伯菌分型及主要流行株的鉴定 被引量：4
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作者 雷志强 李佳 +1 位作者 韩莉 王德成 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第1期51-54,共4页
目的应用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)对肺炎克雷伯菌进行基因分析,以了解其流行病学特征。方法收集2014年10月~12月三峡大学医学院附属医院分离并鉴定的肺炎克雷伯菌30株。用MLST方法进行分类,利用PCR和测序方法检... 目的应用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)对肺炎克雷伯菌进行基因分析,以了解其流行病学特征。方法收集2014年10月~12月三峡大学医学院附属医院分离并鉴定的肺炎克雷伯菌30株。用MLST方法进行分类,利用PCR和测序方法检测7个管家基因gapA、infB、mdh、pgi、phoE、rpoB和tonB,用eBURST3.0和MEGA6.06软件对MLST结果进行分析。结果 MLST法将30个肺炎克雷伯菌株分为17个ST,其中ST23 5株,占16.7%;ST412及ST753各3株,各占10.0%;ST60、ST895、ST340、ST392及ST25各2株,各占6.7%;ST1049、ST268、ST722、ST173、ST307、ST86、ST65、ST660及ST395各1株,各占3.3%。经eBURST3.0分析,17个ST分为2个克隆群(ST340、ST895;ST65、ST25)和1个CC23克隆复合体(ST23、ST25、ST60、ST65、ST86、ST268、ST340、ST395、ST412、ST660、ST722及ST895),其中ST173、ST307、ST392、ST753及ST1049为单个型;MEGA6.06软件分析发现30株肺炎克雷菌在系统发育树上形成3个主要分支,即ST23、ST412及ST753。结论宜昌地区肺炎克雷伯菌分布呈现一定多态性,其中ST23为主要流行菌株。 展开更多
关键词 炎克雷伯菌 多位点序列分型 ST23
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鸡滑液囊支原体的分离鉴定及全基因组特征分析
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作者 李琪 方焕新 +5 位作者 胡俊 温家明 顾嘉运 王占新 覃健萍 蔺文成 《中国家禽》 北大核心 2026年第1期79-88,共10页
研究旨在解析鸡滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae,MS)全基因组特征及其功能。试验对广东地区疑似感染MS的鸡进行病原分离,对病原进行致病性试验和药物敏感性试验,并进一步解析其基因组特征。结果显示:成功分离一株MS,命名为H12株;肌肉... 研究旨在解析鸡滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae,MS)全基因组特征及其功能。试验对广东地区疑似感染MS的鸡进行病原分离,对病原进行致病性试验和药物敏感性试验,并进一步解析其基因组特征。结果显示:成功分离一株MS,命名为H12株;肌肉攻毒10~8 CCU/mL H12株能引起30日龄SPF鸡跛行、肿腿的临床症状;H12株对截短侧耳素类药物高度敏感,但对四环素类耐药性强;H12株基因组存在多个毒力因子,有助于MS感染宿主,其携带CRISPR-Cas系统及高保守DNA修复基因(如recA),表明其对不同环境具有适应潜力;在KEGG、COG、GO数据库分别注释到381、1 410、48个基因;多位点序列分型(MLST)为ST34,与我国主要流行株遗传谱系一致。研究表明,分离株H12属于国内主要流行的ST34型,携带CRISPR-Cas系统、多个毒力因子(adh、ef-tu、pdhb等)及耐药基因(parC、gyrB),具备较强环境适应性与致病性,并对四环素类耐药。 展开更多
关键词 鸡滑液囊支原体 全基因组测序 微量稀释法 mlst分型 毒力因子
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的MLST分型及耐药性分析 被引量：6
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作者 黄东红 范春梅 +2 位作者 朱炎 陈文标 潘少敏 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第23期5312-5314,共3页
目的对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行多位点序列分析(MLST),初步了解泉州地区MRSA的MLST分型、MRSA的耐药性与ST及ST克隆系的相关性方法收集2013-2015年本地区分离47株MRSA,采用MLST对受试菌的7个等位基因进行序列分析,同时进行... 目的对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行多位点序列分析(MLST),初步了解泉州地区MRSA的MLST分型、MRSA的耐药性与ST及ST克隆系的相关性方法收集2013-2015年本地区分离47株MRSA,采用MLST对受试菌的7个等位基因进行序列分析,同时进行网上数据库比对,得到每个菌株相应的等位基因号。结果 47株菌分为14个ST型,2个型别为新的型别(已提交未反馈)。每个型别包含1-17株菌。ST59是优势型别(36.2%),包含17株菌;其次为ST239(17.0%),包含8株菌;ST59分布于2013年、2014年、2015年,表示该型别菌株在本地区长期存在;ST59分布于3所医院,表示该型别菌株本地区广泛分布。结论本地区MRSA分离株基因多态性大,ST59和ST239是本地区MRSA分离株的优势ST型。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 多位点序列分析 耐药分析
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一起学校流行性脑脊髓膜炎暴发疫情的病原学鉴定及其MLST分型分析 被引量：3
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作者 贾肇一 黄亮 +6 位作者 王颖童 何宝花 王茜 马洪生 姜霞 刘晓丽 孙印旗 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2013年第12期1106-1108,共3页
目的报告一起学校流行性脑脊髓膜炎(流脑)暴发疫情的病原学鉴定及病原学特征。方法对疑似流脑病例进行流行病学调查;采集患者血和脑脊液标本,进行实时荧光定量PCR检测,对分离菌株进行生化鉴定并进行E-test法药敏试验和多位点序列分型(mu... 目的报告一起学校流行性脑脊髓膜炎(流脑)暴发疫情的病原学鉴定及病原学特征。方法对疑似流脑病例进行流行病学调查;采集患者血和脑脊液标本,进行实时荧光定量PCR检测,对分离菌株进行生化鉴定并进行E-test法药敏试验和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)分析。结果此疫情由C群脑膜炎奈瑟菌引起,分离菌株对磺胺甲基异噁唑、环丙沙星、萘啶酸耐药。MLST分析该菌为ST-9792型,属于ST-4821高致病克隆群。结论该起流脑疫情由C群脑膜炎奈瑟菌ST-9792型引起,确诊病例数多。提示应加强对当地流脑的监测,在流行季节开展人群C群流脑疫苗接种。 展开更多
关键词 脑膜炎奈瑟菌 C群 病原学 多位点序列分型
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