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木里柠檬叶绿体基因组特征与系统进化研究
1
作者 王小柯 杨雯 +3 位作者 周嘉 罗怿 杜致辉 李文云 《贵州农业科学》 2025年第10期72-82,共11页
【目的】探明木里柠檬[Citrus liilion(L.)Burm.f.]叶绿体基因组特征及遗传差异,为进一步研究柑橘种质资源的遗传进化理论和开发利用提供参考。【方法】通过高通量测序技术获取木里柠檬叶绿体基因组完整序列,并进行结构注释,同时开展重... 【目的】探明木里柠檬[Citrus liilion(L.)Burm.f.]叶绿体基因组特征及遗传差异,为进一步研究柑橘种质资源的遗传进化理论和开发利用提供参考。【方法】通过高通量测序技术获取木里柠檬叶绿体基因组完整序列,并进行结构注释,同时开展重复序列分析、变异检测及系统进化分析。【结果】木里柠檬叶绿体基因组全长160122 bp,GC含量为38.48%,SSC区(小单拷贝区)、LSC区(大单拷贝区)和IRs区(反向重复区)长度分别为18393 bp、87733 bp和26998 bp,共注释到133个功能基因,含88个蛋白质编码基因、8个核糖体RNA基因和37个tRNA基因。密码子偏好性分析显示,木里柠檬叶绿体基因密码子第3位碱基偏好A和U。SSR分析共检测到493个SSR位点,大部分碱基组成偏向A/T和AA/TT。检测到963个SNP位点,其中,发生碱基转换(A↔G、T↔C)的概率为66.56%,发生碱基颠换(A↔C、A↔T、T↔G、C↔G)的概率为33.44%。全长序列核苷酸变异分析显示,与甜橙(Citrus sinensis)、柚(Citrus maxima)、柠檬(Citrus limon)、酸橙(Citrus aurantium)相比,木里柠檬叶绿体基因序列相似度较高,共检测到15个高突变区域,大部分位于基因间隔区,SC区变异程度高于IR区。聚类结果表明,木里柠檬与甜橙、柚、柠檬、酸橙遗传距离较近。【结论】研究获得木里柠檬叶绿体基因组完整序列,筛选出493个SSR位点和963个SNP标记位点,可用于后续分子标记的开发应用。木里柠檬与甜橙、柚、柠檬、酸橙有一定亲缘关系。 展开更多
关键词 木里柠檬 叶绿体基因组 基因注释 偏好性 亲缘关系 碱基 密码子 系统进化树
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木里柠檬种子油的脂肪酸组成和果实主要营养成分的研究
2
作者 肖顺昌 伍岳宗 +3 位作者 温鸣章 任维俭 庄浔 陈佩卿 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 1990年第1期63-66,共4页
本文报道,采用气相色谱(GC)分析新发现的野生木里柠檬,和栽培的尤力克柠檬种子油的8种脂肪酸成分,和用常规化学方法对比测定两种柠檬果实中的糖,有机酸和维生素C的含量。研究结果表明,木里柠檬的脂肪酸及其它营养成分与尤力克柠檬相近。
关键词 木里柠檬 脂肪酸 种子油 营养成分
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