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用网络方法识别生物序列motif
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作者 许诗蓉 汪四水 《生物信息学》 2008年第4期183-186,共4页
生物序列motif的识别是后基因组时代的一个核心问题。本文首先回顾了识别motif的几种主要算法,然后根据motif的重要性和随机性介绍了利用网络识别motif的两种具有代表性的方法:一种是建立一个随机网络混合模型,利用EM算法识别其中随机... 生物序列motif的识别是后基因组时代的一个核心问题。本文首先回顾了识别motif的几种主要算法,然后根据motif的重要性和随机性介绍了利用网络识别motif的两种具有代表性的方法:一种是建立一个随机网络混合模型,利用EM算法识别其中随机的网络motif;另一种用修正的参数流算法过滤出其中的最大密度子图,即为生物序列motif,并指出这两种方法的优劣,最后还对今后研究方向给出了讨论。 展开更多
关键词 生物序列motif 随机网络 motifcut
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