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Verification of gene expression profiles for colorectal cancer using 12 internet public microarray datasets
1
作者 Yu-Tien Chang Chung-Tay Yao +10 位作者 Sui-Lung Su Yu-Ching Chou Chi-Ming Chu Chi-Shuan Huang Harn-Jing Terng Hsiu-Ling Chou Thomas Wetter Kang-Hua Chen Chi-Wen Chang Yun-Wen Shih Ching-Huang Lai 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2014年第46期17476-17482,共7页
AIM: To verify gene expression profiles for colorectal cancer using 12 internet public microarray datasets.
关键词 Gene expression profiles Colorectal cancer microarRAY Gene Expression Omnibus Gene Expression Omnibus Gene Expression Omnibus series
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毒理基因组学与DNA微阵列技术的应用 被引量:8
2
作者 曹佳 周紫垣 +3 位作者 方福德 杨梦更生 胡绍火火火木 游力 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期336-340,共5页
近几年来 DNA微阵列和 DNA芯片技术得到了迅速发展 ,并开始应用于毒理学研究 ,本文介绍了微阵列技术如何与毒理学研究相结合并应用于危险度评估 。
关键词 毒理基因组学 DNA微阵列 DNA芯片
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藏药红景天对大鼠肺纤维化保护作用及机制探讨 被引量:12
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作者 胡晓波 程德云 +3 位作者 穆茂 聂莉 方洵 杨礼腾 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期2772-2774,共3页
目的观察红景天对肺纤维化大鼠肺组织I型胶原、转化生长因子β1(TGF-β1)及其信号通路分子Smad4表达的影响,探讨红景天对大鼠肺纤维化的防治作用与机制。方法健康SD大鼠40只随机分为4组:模型组(A组),正常对照组(B组),红景天14d治疗组(C... 目的观察红景天对肺纤维化大鼠肺组织I型胶原、转化生长因子β1(TGF-β1)及其信号通路分子Smad4表达的影响,探讨红景天对大鼠肺纤维化的防治作用与机制。方法健康SD大鼠40只随机分为4组:模型组(A组),正常对照组(B组),红景天14d治疗组(C组),红景天28d治疗组(D组)各10只。博莱霉素(BLM)气管内滴入建立大鼠肺纤维化模型,正常对照组气管内滴入生理盐水。在造模的第2日治疗组予红景天0.21g/kg灌胃干预,于第14,28日取肺组织,运用组织芯片结合图象分析技术,通过苏木素-伊红(HE)染色观察肺组织病理学改变,用免疫组化检测I型胶原蛋白和TGF-β1的表达,实时荧光定量RT-PCR检测I型胶原和TGF-β1的mRNA表达,原位杂交技术对Smad4 mRNA进行定位定量分析。结果红景天在两时相皆抑制I型胶原,TGF-β1的表达。C组I型胶原蛋白的IOD值为(0.362±0.241),D组I型胶原蛋白IOD值为(0.334±0.122),与A组(0.513±0.384)相比有统计学意义(P均<0.05)。C组TGF-β1蛋白的IOD值为(0.062±0.013),D组TGF-β1蛋白IOD值为(0.058±0.011),与A组(0.100±0.005)相比有统计学意义(P均<0.05)。C组I型胶原mRNA相对表达量为(0.041±0.017),D组I型胶原mRNA相对表达量为0.040±0.021,与A组0.071±0.054相比有统计学意义(P均<0.05)。C组TGF-β1 mRNA相对表达量为(0.0025±0.0013),D组TGF-β1 mRNA相对表达量为(0.0030±0.0005),与A组(0.0170±0.0157)相比有统计学意义(P均<0.05)。肺组织Smad4 mRNA表达呈局灶性,在炎症和胶原沉积部位表达较明显,而治疗组和模型组比较无统计学意义(P均>0.05);治疗组Smad4 mRNA表达量与正常对照组(0.165±0.099)比较亦无统计学意义(P>0.05)。结论红景天对大鼠肺纤维化具有一定治疗作用,其机制可能是通过抑制I型胶原及TGF-β1表达,从而干扰TGF-β-Smads信号通路对基因表达、蛋白合成的调节而实现的。 展开更多
关键词 红景天 肺纤维化 Ⅰ型胶原 转化生长因子Β1 组织芯片 实时荧光定量PCR
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慢病毒介导的Annexin A2基因沉默对胃癌AGS细胞基因表达谱的影响 被引量:5
4
作者 谢蕊 刘娇 +2 位作者 吴日娜 白玉贤 朱久新 《现代肿瘤医学》 CAS 2017年第3期362-367,共6页
目的:探讨膜联蛋白A2(Annexin A2,ANXA2)基因沉默对AGS胃癌细胞基因表达谱的改变。方法:通过慢病毒干扰AGS细胞ANXA2的表达,用人基因表达谱芯片筛选ANXA2调控的下游基因。结果:通过基因表达谱芯片筛选出ANXA2沉默后的共同差异表达基因10... 目的:探讨膜联蛋白A2(Annexin A2,ANXA2)基因沉默对AGS胃癌细胞基因表达谱的改变。方法:通过慢病毒干扰AGS细胞ANXA2的表达,用人基因表达谱芯片筛选ANXA2调控的下游基因。结果:通过基因表达谱芯片筛选出ANXA2沉默后的共同差异表达基因100个,其中58个上调的基因,42个下调的基因。根据KEGG与BIOCARTA中所有Pathway的基因信息,将差异基因进行富集分析。筛选到的ANXA2调控的重要相关基因包括FGA、FGB、SERPINB2、CD55、PLAUR、MET、RAP1A和ETS1。Western blot进一步验证结果显示,沉默ANXA2后,AGS细胞中RAP1A表达水平降低,MAP2K1的蛋白表达亦降低。结论:p GC-LVANXA2 siRNA可以有效地下调胃癌AGS细胞ANXA2基因的表达。RAP1A和MAP2K1可能是AGS胃癌细胞中ANXA2参与MAPK信号通路的潜在下游调控基因。 展开更多
关键词 ANXA2 胃癌 基因芯片 基因表达谱
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钛基底表面处理对钛-树脂粘接强度的影响 被引量:3
5
作者 马志玲 刘杰 《国际口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期45-49,共5页
目的 探讨不同钛基底表面处理对钛与树脂粘接强度的影响。方法 将纯钛试件随机平均分组:光滑组(A组)、酸蚀组(B组)、喷砂组(C组)、喷砂+酸蚀组(D组)、微弧氧化组(E组)、氮化钛涂层组(F组)。根据以上分组,对试件进行相应的表面处理,用... 目的 探讨不同钛基底表面处理对钛与树脂粘接强度的影响。方法 将纯钛试件随机平均分组:光滑组(A组)、酸蚀组(B组)、喷砂组(C组)、喷砂+酸蚀组(D组)、微弧氧化组(E组)、氮化钛涂层组(F组)。根据以上分组,对试件进行相应的表面处理,用粗糙度仪进行钛表面粗糙度测量,后与Cemerage冠桥树脂结合,扫描电子显微镜(SEM)观察试件表面形貌,能谱分析仪(EDS)对表面元素进行分析,万能试验机检测试件与Cemerage冠桥树脂的粘接强度。结果 各组的粗糙度分别为A组(0.370±0.039)μm;B组(1.456±0.044)μm;C组(2.044±0.019)μm;D组(1.970±0.047)μm,E组(0.683±0.023)μm;F组(2.195±0.066)μm。各组的剪切强度分别为A组(5.84±0.30)MPa;B组(10.22±0.63)MPa;C组(10.78±0.45)MPa;D组(12.24±0.46)MPa;E组(13.82±0.61)MPa;F组(16.81±0.74)MPa。结论 钛基底表面喷砂结合酸蚀,微弧氧化及氮化钛涂层处理均可有效提高树脂与钛的粘接强度。 展开更多
关键词 树脂 微弧氧化 粘接强度
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预先热处理对ZAlSi12Cu2Mg1铝合金微弧氧化层的影响 被引量:1
6
作者 王晓军 刘向东 +3 位作者 刘永珍 韩春霞 刘彩文 杜月和 《材料热处理学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第1期133-136,共4页
对ZAlSi12Cu2Mg1铝合金分别按T1和T6进行预先热处理,然后在NaOH-Na2SiO3电解液体系下进行表面微弧氧化,并对微弧氧化层的结构及性能进行分析。利用电涡流测厚仪测量氧化层的厚度,用显微硬度计测量氧化层截面的显微硬度,并进行截面形貌观... 对ZAlSi12Cu2Mg1铝合金分别按T1和T6进行预先热处理,然后在NaOH-Na2SiO3电解液体系下进行表面微弧氧化,并对微弧氧化层的结构及性能进行分析。利用电涡流测厚仪测量氧化层的厚度,用显微硬度计测量氧化层截面的显微硬度,并进行截面形貌观察,用XRD分析氧化层相组成。结果表明:在微弧氧化前,该合金进行的预先热处理对后续的微弧氧化影响很显著;在合金表面获得了较厚的微弧氧化层,氧化层与基体互相镶嵌,并结合良好。氧化层主要由α-Al2O3、γ-Al2O3、Al、Al2SiO5及非晶相组成。经T6处理合金所获得的微弧氧化层的结构和性能优于经T1处理的。 展开更多
关键词 微弧氧化层 预先热处理 ZALSI12CU2MG1
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酵母SOD1基因缺失突变体应答真菌细胞壁抑制剂CFW的转录组学分析 被引量:1
7
作者 张小华 刘向勇 +2 位作者 卞伟华 徐岩艳 许聪 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2016年第1期76-79,共4页
以酿酒酵母为研究材料,采用酵母全基因组表达谱芯片,分析超氧化物歧化酶SOD1基因缺失(sod1Δ)对酵母细胞应答真菌细胞壁抑制剂钙荧光白(CFW)全基因组转录表达谱的影响,为揭示植物病原真菌细胞壁调控机制以及植物抗真菌基因工程改造提供... 以酿酒酵母为研究材料,采用酵母全基因组表达谱芯片,分析超氧化物歧化酶SOD1基因缺失(sod1Δ)对酵母细胞应答真菌细胞壁抑制剂钙荧光白(CFW)全基因组转录表达谱的影响,为揭示植物病原真菌细胞壁调控机制以及植物抗真菌基因工程改造提供新的理论基础。结果表明:CFW(10μg/m L)处理1 h后,与野生型酵母细胞相比,sod1Δ酵母细胞中211个基因发生了显著差异表达(97个基因表达上调、114个基因表达下调)。随机选取5个差异表达基因采用定量PCR验证,结果与芯片分析结果一致。差异表达基因功能主要涉及细胞壁、细胞代谢、蛋白质合成、细胞防御以及大量功能未知蛋白。以上结果表明,SOD1基因缺失可显著改变酵母细胞应答真菌细胞壁抑制剂CFW胁迫的全基因组转录表达谱。 展开更多
关键词 真菌细胞壁抑制剂 钙荧光白 酿酒酵母 DNA芯片 细胞壁 超氧化物歧化酶
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工艺参数对镁合金微弧氧化陶瓷膜色度的影响 被引量:6
8
作者 王卫锋 蒋百灵 +1 位作者 李均明 时惠英 《新技术新工艺》 2006年第3期87-89,共3页
通过正交试验获得适合于镁合金表面微弧氧化深色陶瓷膜处理的新型溶液配方,进而研究了不同工艺参数对陶瓷膜色度的影响;利用XES,XPS对陶瓷膜成分、结构进行分析,探讨了不同色度陶瓷膜层显色机理。结果表明,在N1N2CN3体系中膜层色度随浓... 通过正交试验获得适合于镁合金表面微弧氧化深色陶瓷膜处理的新型溶液配方,进而研究了不同工艺参数对陶瓷膜色度的影响;利用XES,XPS对陶瓷膜成分、结构进行分析,探讨了不同色度陶瓷膜层显色机理。结果表明,在N1N2CN3体系中膜层色度随浓度、电压、电流密度、温度增加而变深。当浓度比为50∶15∶3∶5,55∶30∶4∶20时可获绿色和棕色系列膜层。电压在350~450V,电流密度2.7~8A/dm2,温度35~45℃时可获得色度均匀、光滑的深色理想膜层,但电压、电流密度过大、温度过高会导致膜层质量不高。膜层色度变化主要是由膜层中钒的氧化物含量不同所致。 展开更多
关键词 镁合金微弧氧化 工艺参数 陶瓷膜色度
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醋酸处理对微弧氧化TiO_2膜光催化大红染料的影响 被引量:1
9
作者 苏会东 邵忠财 +1 位作者 翟玉春 李晓丹 《有色矿冶》 2006年第2期34-36,共3页
以磷酸钠为电解液,采用微弧氧化技术在钛网上直接制备TiO2膜,利用醋酸浸渍方法对该膜表面进行修饰处理,利用XRD、SEM、EDX对微弧氧化膜表面形貌和成分进行分析.结果表明:在300~320 V电压下微弧氧化TiO2膜主要由钛和锐钛矿TiO2组成,在... 以磷酸钠为电解液,采用微弧氧化技术在钛网上直接制备TiO2膜,利用醋酸浸渍方法对该膜表面进行修饰处理,利用XRD、SEM、EDX对微弧氧化膜表面形貌和成分进行分析.结果表明:在300~320 V电压下微弧氧化TiO2膜主要由钛和锐钛矿TiO2组成,在电解时TiO2膜表面有钠离子的沉积,形成光生电子-空穴复合中心,微弧氧化TiO2膜的光催化性能较差;醋酸浸渍可以减少微弧氧化TiO2膜表面钠的含量,改善膜的光催化性能,大红染料废水的光催化降解率由15%提高到33.6%. 展开更多
关键词 微弧氧化 二氧化钛 表面酸处理 光催化
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Effects of La(NO_3)_3 Treatment on Photocattalytic Activity of TiO_2 Films Prepared by Micro-Arc Oxidation
10
作者 Su Huidong Zhai Yuchun +1 位作者 Shao Zhongcai Li Xiaodan 《Journal of Rare Earths》 SCIE EI CAS CSCD 2005年第4期432-432,共1页
Titamum oxide coatings were formed on me titanium net surface by micro-arc oxidation (MAO) in Na3PO4 solution using an AC power supply. Then the titanium oxide coatings were treated by La (NO3)3 soaking to improve... Titamum oxide coatings were formed on me titanium net surface by micro-arc oxidation (MAO) in Na3PO4 solution using an AC power supply. Then the titanium oxide coatings were treated by La (NO3)3 soaking to improve the activity. The structures and photocatalytic ability of titanium oxide coatings before and after surface La (NO3)3 treatment were characterized and evaluated by XRD, SEM, EDX and photocatalytic decoloration of acid brilliant scarlet dye aqueous solution, respectively. The results show that the titanium oxide film is mainly consisted of anatase. After the La(NO3)3 treatment, the sodium ions on TiO2/ Ti film surface are replaced by lanthanum. It is found that the photocatalytic activity of the titanium oxide coatings is enhanced after La(NO3)3 treatment. When La(NO3)3 aqueous concenuration is 0.1 mol·L^-1 and soak time is 12 h, the TiO2/Ti films photocatalytic decoloration rate increases from 15% to 34.8%. 展开更多
关键词 microare oxidation titanium oxide La(NO3)3 surface treatment PHOTOCATALYSIS rare earths
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三种微弧氧化镁合金高温油润滑条件下的摩擦学性能 被引量:7
11
作者 郭洁 梁军 +1 位作者 阎逢元 薛群基 《化学研究》 CAS 2009年第3期59-63,共5页
选择三种常用的基础电解液:硅酸盐、磷酸盐、铝酸盐制备了镁合金微弧氧化(MAO)膜,研究了这三种氧化膜在高温油润滑条件下的摩擦学性能.利用SRV摩擦实验机,使样品在20 N的外加载荷,振幅3 mm,频率5 Hz的条件下,与直径10 mm的CCr15钢球分... 选择三种常用的基础电解液:硅酸盐、磷酸盐、铝酸盐制备了镁合金微弧氧化(MAO)膜,研究了这三种氧化膜在高温油润滑条件下的摩擦学性能.利用SRV摩擦实验机,使样品在20 N的外加载荷,振幅3 mm,频率5 Hz的条件下,与直径10 mm的CCr15钢球分别在室温、80℃、100℃和120℃四个温度,油润滑条件下对磨,结果表明硅酸盐膜层具有最好的摩擦性能,另外两种膜层不仅没有起到抗磨损的作用,反而使磨损加剧. 展开更多
关键词 镁合金 微弧氧化 油润滑 高温
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三种不同表面处理的种植体对成骨细胞增殖的比较研究 被引量:3
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作者 张丽娜 丁明超 +2 位作者 李慕勤 张爱琴 李德超 《口腔颌面外科杂志》 CAS 2010年第5期358-363,共6页
目的:探讨钛合金表面3种生物陶瓷涂层对成骨细胞黏附、生长、增殖的影响。方法:在钛合金(TLM)基体表面进行喷砂酸蚀和微弧氧化(MAO)技术处理,制备出喷砂酸蚀(SLA)、载银(MAO-Ag)和非载银(MAO)3种不同材料的表面生物陶瓷涂层;扫描电镜(S... 目的:探讨钛合金表面3种生物陶瓷涂层对成骨细胞黏附、生长、增殖的影响。方法:在钛合金(TLM)基体表面进行喷砂酸蚀和微弧氧化(MAO)技术处理,制备出喷砂酸蚀(SLA)、载银(MAO-Ag)和非载银(MAO)3种不同材料的表面生物陶瓷涂层;扫描电镜(SEM)和X射线能谱(EDX)仪观察分析膜层的表面形貌及元素构成;观察不同材料表面成骨细胞生长状况,通过碱性磷酸酶(ALP)活性测定法和四氮唑盐(MTT)法检测不同材料对细胞增殖的影响。结果:微弧氧化制备的涂层表面多孔,能谱分析证实MAO-Ag涂层表面含有银元素;SLA、MAO和MAO-Ag 3种材料均能促进成骨细胞的增殖,并随着时间延长,ALP含量及吸光度(A)值均逐渐升高。MAO组优于SLA组,MAO-Ag组优于MAO组和SLA组,均具有统计学意义。结论:3种表面生物陶瓷涂层均能促进成骨细胞的增殖,MAO-Ag组效果最佳。 展开更多
关键词 成骨细胞 细胞培养 钛合金 微弧氧化 银离子 喷砂酸蚀
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铝合金微弧氧化过程中电学参量的特性研究 被引量:29
13
作者 吴汉华 龙北红 +2 位作者 吕宪义 汪剑波 金曾孙 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第4期1697-1701,共5页
利用自制的数据采集系统研究了恒定电压下铝合金微弧氧化过程中有关电学参量随时间的变化规律 .结果表明 :通电回路中的阴极和阳极峰值电流随处理时间的变化明显分为 5个阶段 ;陶瓷膜的动态正向电阻和电阻率随处理时间分阶段变化 ,而动... 利用自制的数据采集系统研究了恒定电压下铝合金微弧氧化过程中有关电学参量随时间的变化规律 .结果表明 :通电回路中的阴极和阳极峰值电流随处理时间的变化明显分为 5个阶段 ;陶瓷膜的动态正向电阻和电阻率随处理时间分阶段变化 ,而动态的反向电阻和电阻率随时间的变化不大 .在微弧氧化过程中 ,各时刻的动态正、反向电阻值不同 ,一般情况下 ,动态正向电阻远大于反向电阻 .对不同处理时间样品的扫描电子显微镜分析表明 ,陶瓷膜呈多孔结构并随处理时间分阶段变化 . 展开更多
关键词 铝合金 微弧氧化 电学参量 陶瓷膜
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溃疡性结肠炎相关性结肠癌差异表达的miRNA的筛选研究 被引量:10
14
作者 张永锋 郭长军 +2 位作者 谭永港 杨敏 陈嫚茵 《中国中西医结合消化杂志》 CAS 2014年第2期65-68,共4页
[目的]分析结肠癌与正常结肠黏膜、结肠炎肠黏膜的微小RNA(miRNA)表达谱差异。[方法]通过建立溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)及UC相关性结肠癌(ulcerative colitis related colorectal cancer,UCRCC)小鼠模型,抽提、纯化RNA,加入... [目的]分析结肠癌与正常结肠黏膜、结肠炎肠黏膜的微小RNA(miRNA)表达谱差异。[方法]通过建立溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)及UC相关性结肠癌(ulcerative colitis related colorectal cancer,UCRCC)小鼠模型,抽提、纯化RNA,加入荧光标记后与miRNA寡核甘酸基因芯片(Affymetrix公司)杂交,应用SAM软件进行数据分析,对有显著差异的miRNA进行实时荧光定量PCR验证,采用靶基因分析软件分析miRNA功能。[结果]has-miR-194、has-miR-215、has-miR-93、has-miR-192、has-miR-92a、has-miR-29b、has-miR-20a等7个miRNA在肿瘤组织中显著上调〔中位假基因验出率(FDR)<5%〕,has-miR-1231、has-miR-195、has-miR-143、has-miR-145等4个miRNA显著下调(FDR<5%)。[结论]UCRCC与正常结肠黏膜、UC肠黏膜之间存在明显的miRNA差异表达,这些miRNA的差异性表达可能与UCRCC的发病有关。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 溃疡性结肠炎相关性结肠癌 小鼠模型 miRNA微阵列芯片
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显著性分析(SAM)方法在乳腺癌基因芯片数据分析中的应用 被引量:2
15
作者 罗亚玲 蒋峥 张世强 《数学的实践与认识》 北大核心 2015年第1期112-118,共7页
对乳腺癌基因芯片试验结果进行数据分析,寻找在正常组织与癌组织中呈现差异表达的基因.运用微阵列芯片显著性分析(SAM)方法进行差异表达基因的筛选,并使用permutation算法计算错误发现率(FDR).一些呈现差异表达的基因被筛选出来,其中一... 对乳腺癌基因芯片试验结果进行数据分析,寻找在正常组织与癌组织中呈现差异表达的基因.运用微阵列芯片显著性分析(SAM)方法进行差异表达基因的筛选,并使用permutation算法计算错误发现率(FDR).一些呈现差异表达的基因被筛选出来,其中一部分基因已被数篇文献报道过,认为它与乳腺癌发病相关.SAM方法比较适用于对基因芯片实验的结果进行相关基因的初步筛选,筛选出的基因可用于为进一步的研究提供候选基因. 展开更多
关键词 基因芯片 乳腺癌 permutation检验 显著性分析 SAM
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食管癌表达上调基因NADH氧化还原酶MLRQ亚基的研究及临床意义
16
作者 王涛 刘芝华 +5 位作者 李泽坚 张立勇 刘煜 孙国斌 王秀琴 吴旻 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期590-592,共3页
目的研究在食管癌中差异表达明显的NADH氧化还原酶MLRQ亚基基因在食管癌中的表达,并探讨它在食管癌发生发展过程中的可能机制。方法利用微陈列技术方法获得一个在食管癌中的表达显著上调的NADH氧化还原酶MLRQ亚基基因,用RT PCR及Norther... 目的研究在食管癌中差异表达明显的NADH氧化还原酶MLRQ亚基基因在食管癌中的表达,并探讨它在食管癌发生发展过程中的可能机制。方法利用微陈列技术方法获得一个在食管癌中的表达显著上调的NADH氧化还原酶MLRQ亚基基因,用RT PCR及Northern印迹从mRNA水平检测其在38对食管癌、7对贲门癌、14对胃癌、11对结肠癌和7对肝癌等消化系统肿瘤中的表达情况。结果(1)MLRQ基因在食管癌、贲门癌、胃癌、结肠癌和肝癌中显著上调者,分别为81.6%(31/38)、57.1%(4/7)、85.7%(12/14)、65.6%(7/11)、57.1%(4/7)。用X2检验,各组之间差异无统计学意义(P>0.05)。(2)在38对食管癌配对组织中,MLRQ基因上调与临床分期、肿瘤浸润程度、淋巴结转移及分化程度无相关性(均P>0.05)。结论MLRQ亚基基因在消化道肿瘤中表达上调。 展开更多
关键词 食管癌 NADH 表达 上调基因 上调 肝癌 胃癌 氧化还原酶 MRNA水平 印迹
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线粒体DNA定量和缺失检测及其与肿瘤发生的关系 被引量:12
17
作者 韩波 赵雨杰 +3 位作者 李凡 何群 马佳明 辛彦 《中华肿瘤杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期10-13,共4页
目的 研究线粒体DNA(mtDNA)与肿瘤发生的关系 ,提供一种可以对mtDNA进行快速、准确的定量和缺失检测的方法。方法 利用改进的PCR方法对 2例正常人外周血白细胞及 5例胃癌患者癌组织进行线粒体基因组的全序列 (16569bp)扩增 ,同时标记... 目的 研究线粒体DNA(mtDNA)与肿瘤发生的关系 ,提供一种可以对mtDNA进行快速、准确的定量和缺失检测的方法。方法 利用改进的PCR方法对 2例正常人外周血白细胞及 5例胃癌患者癌组织进行线粒体基因组的全序列 (16569bp)扩增 ,同时标记荧光素 ;然后用聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染加以证实。设计出 17对叠加引物扩增mtDNA探针 ,用芯片点样仪将其点到经过氨基化的玻片上 ,制成芯片 ,杂交。GeneTACTM激光扫描仪扫描芯片得出扫描图像 ,最后用ScanAnalyzer得出阵列数据 ,对mtDNA拷贝量准确定量。结果 扩增的 17对探针经聚丙烯酰胺凝胶电泳银染显示 ,设计合理 ,特异性高。改进的PCR方法对线粒体全基因组的扩增效率高 ,银染后结果显示 ,杂带少 ,特异性强 ,产量丰富。芯片杂交后扫描图像清晰、背景低 ;阴性探针信号接近背景信号 ,两者间差异无显著性 (P >0 .0 5)。实验结果与设计的实验完全符合 ,对同一血白细胞和胃癌组织样本的多次杂交后数据分析得出 ,同一样本同一阳性探针数据间差异无显著性 (P >0 .0 5) ,而两种样本间数据差异显著(P <0 .0 1)。杂交信号稳定 ,数据分布集中 (均值两侧一倍标准差范围内 ) ,显示了非常好的可重复性。结论 已知mtDNA的大片段或整个基因组的缺失 ,以及拷贝数量的改变与肿瘤发生? 展开更多
关键词 线粒体DNA 检测 肿瘤 微阵列技术
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电针对慢性应激抑郁模型大鼠海马CXCR4和IP-10蛋白表达的影响 被引量:5
18
作者 梁星辰 姜会梨 +9 位作者 张丹妹 史榕荇 王瑜 李晶 杨昕婧 赵冰骢 俞秋云 李想 冯世醒 图娅 《北京中医药大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期872-875,共4页
目的基于抗体蛋白芯片技术观察电针对慢性应激抑郁模型大鼠海马组织趋化因子受体-4(CXCR4)和趋化因子10(IP-10)表达的影响,探究电针抗抑郁的机制。方法将40只SD大鼠随机平均分为正常组、模型组、电针组和氟西汀组。电针组于每日给予应激... 目的基于抗体蛋白芯片技术观察电针对慢性应激抑郁模型大鼠海马组织趋化因子受体-4(CXCR4)和趋化因子10(IP-10)表达的影响,探究电针抗抑郁的机制。方法将40只SD大鼠随机平均分为正常组、模型组、电针组和氟西汀组。电针组于每日给予应激前1 h电针"百会"和"印堂"穴,氟西汀组于每日给予应激前1 h药物灌胃,均连续28 d。应用抗体蛋白芯片技术检测大鼠海马CXCR4和IP-10蛋白表达的变化,以倍数变化(fold change)来判断蛋白的差异表达。结果与正常组比较,慢性不可预知性温和应激可使模型组大鼠海马CXCR4和趋化因子IP-10表达上调(fold change分别为1.21、1.50);电针和氟西汀可逆转模型大鼠海马CXCR4和IP-10的上调表达(电针组fold change分别为0.65、0.72;氟西汀组fold change分为0.57、0.62)。结论电针对慢性应激抑郁状态的改善作用可能是通过调节海马CXCR4和IP-10的表达来实现的。 展开更多
关键词 电针 抑郁症 慢性应激 趋化因子受体-4 趋化因子10 抗体蛋白芯片 大鼠
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