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水稻microRNA1876功能验证与生物信息学分析
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作者 蔡俊 陈信波 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期2102-2107,共6页
MicroRNA (miRNA)是一类由内源基因组转录的有基因调控功能的非编码短序列RNA,在动植物中参与转录后基因表达调控。为了研究Osa-miRNA1876基因功能,本研究对Osa-miRNA1876进行生物信息学分析,分析出启动子区间有与逆境相关的主要顺式作... MicroRNA (miRNA)是一类由内源基因组转录的有基因调控功能的非编码短序列RNA,在动植物中参与转录后基因表达调控。为了研究Osa-miRNA1876基因功能,本研究对Osa-miRNA1876进行生物信息学分析,分析出启动子区间有与逆境相关的主要顺式作用元件ARE、GC-motif、GT1-motif、Sp1和LTR,并预测到了靶基因Os02t0476700-01。通过茎环法q RT-PCR,以水稻U6基因为内参基因,对Osa-miRNA1876在水稻分蘖期进行了相对定量。在水稻基因组中,克隆得到Osa-miRNA1876的前体基因,并根据Osa-miRNA1876序列设计了短串联靶标模拟物(short tandem target mimic, STTM)功能片段;将二者整合到植物表达载体pCAMIBA1390,分别获得了过表达载体pOsa-miRNA1876-OE和干扰载体pOsa-miRNA1876-STTM。用于后续的Osa-miRNA1876基因功能研究。 展开更多
关键词 microrna1876 生物信息学 QRT-PCR 短串联靶标模拟物
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