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题名Mapmaker3.0和作图软件使用
被引量：9
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作者
王竹林
杨睿
杨兴圣
刘曙东
胡甘
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机构
西北农林科技大学农学院
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出处
《实验室研究与探索》
CAS
北大核心
2012年第11期62-65,共4页
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基金
国家自然科学基金项目(30971768)
西北农林科技大学唐仲英育种基金资助
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文摘
构建各种生物体的遗传连锁图谱成为分子遗传学和作物育种领域QTL定位的热点。Mapmaker3.0是当前普遍用于遗传连锁距离计算的软件。Mapmaker3.0的使用首先要准备标记数据文件,然后用Sequence命令输入欲分析的标记座位,接着键入Group命令指导程序将Sequence中的标记分为不同的连锁群,接下来,程序在一个连锁群内部决定最有可能的标记排列次序,计算一个连锁群中所有的标记每一个可能的次序最大似然图谱,比较这些图谱的可能性并找出最合适图谱,这部分工作用Compare命令完成,再用sequence和map命令得到标记之间的连锁数据。之后,将这些数据按Genemap或MapDraw分析软件所要求的数据格式输入,通过对这2个软件的正确使用,就可得到需要的遗传连锁图谱图形文件。
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关键词
mapmaker3
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Genemap
MapDraw
遗传连锁图谱
连锁距离
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Keywords
mapmaker3.0
Genemap
MapDraw
genetic linkage map
linkage distance
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分类号
Q-31
[生物学]
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