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题名桑树MaGte4基因的克隆、表达及序列特征分析
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作者
杨金宏
孔卫青
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机构
安康学院陕西省蚕桑重点实验室
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出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期121-128,共8页
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基金
陕西省青年科技新星项目(No.2013KJXX-96)
陕西省教育厅重点实验室科研计划项目(No.13JS003)共同资助
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文摘
Virp1基因是第一个被报道可以结合RNA的Bromodomain(BRD)蛋白,在马铃薯纺锤块茎类病毒(potato spindle tuber viroid,PSTVd)对宿主的感染及其复制中起重要作用。本研究根据NCBI登录的virp1基因序列和桑树基因组数据库设计引物,进行RT-PCR扩增和克隆测序,获得桑树的同源MaGte4基因长1 771 bp的序列。生物信息学分析表明,基因有3个外显子,CDS长1 683 bp,编码560个氨基酸,有与乙酰化组蛋白赖氨酸具有特异相互作用的BRD及其extra-terminal(BET)结构域,且该结构及其氨基酸组成在各物种间比较保守,桑树MaGte4具有和virp1蛋白非常相似的C-末端区域,RT-PCR分析基因在正常和花叶型萎缩病桑树叶片、叶柄和叶脉中均有表达,推测MaGte4的功能可能和Virp1相类似。
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关键词
桑树
magte4
BROMODOMAIN
序列分析
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Keywords
Mulberry
magte4
Bromodomain
Sequence analysis
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分类号
S888.2
[农业科学—特种经济动物饲养]
Q943.2
[生物学—植物学]
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