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miR-635靶向调控MYL6B抑制非小细胞肺癌转移
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作者 夏炳辉 张振山 +3 位作者 姚天宇 葛凤月 鄢凤梅 孙金鹏 《生物技术》 2025年第3期358-363,370,共7页
[目的]探究miR-635与MYL6B对非小细胞肺癌H1650细胞转移活性的影响。[方法]采用实时荧光定量PCR方法检测miR-635的表达水平,通过蛋白免疫印迹方法检测非小细胞肺癌组织中MYL6B的表达情况。将H1650细胞株随机分为4组:miR NC组、miR-635 m... [目的]探究miR-635与MYL6B对非小细胞肺癌H1650细胞转移活性的影响。[方法]采用实时荧光定量PCR方法检测miR-635的表达水平,通过蛋白免疫印迹方法检测非小细胞肺癌组织中MYL6B的表达情况。将H1650细胞株随机分为4组:miR NC组、miR-635 mimic组、si NC组与si MYL6B组。蛋白免疫印迹检测MYL6B蛋白的表达水平,采用EdU染色分析H1650细胞的增殖能力,细胞划痕实验分析H1650细胞的侵袭能力,流式细胞仪检测H1650细胞凋亡率,生物信息学方法预测miR-635与MYL6B在H1650细胞中的结合区域,双荧光素酶报告基因实验分析miR-635与MYL6B在H1650细胞中的的靶向关系。[结果]非小细胞肺癌组织中miR-635表达水平降低(0.79±0.05 vs 0.31±0.07),MYL6B表达增加(0.18±0.02 vs 0.82±0.09);miR-635能够靶向抑制MYL6B的活性(0.98±0.08 vs 0.27±0.03);miR-635 mimic或si MYL6B均能抑制H1650细胞的生长与迁移能力,并能促进H1650细胞凋亡(8.08%±1.72%vs 33.97%±2.08%vs 7.92%±1.27%vs 33.11%±2.17%,P<0.05)。[结论]MYL6B在非小细胞肺癌组织高表达,而miR-635低表达。MYL6B是miR-635的直接靶点,miR-635对非小细胞肺癌H1650细胞转移活性的抑制作用与调控MYL6B相关。 展开更多
关键词 miR-635 非小细胞肺癌 myl6B 转移 侵袭 H1650 增殖 凋亡
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帕米尔牦牛MYL2基因克隆及其在不同组织中的表达分析
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作者 于沁冉 王佟 +4 位作者 邓婧瑛 包鹏甲 李宁 阎萍 贾建磊 《华北农学报》 北大核心 2025年第4期210-218,共9页
为揭示MYL2基因在牦牛肌肉发育与高原适应性中的作用机制,探索其对牦牛肉品质和生产性能的潜在影响,对帕米尔牦牛MYL2基因进行了克隆与组织表达分析。通过克隆其编码区(CDS)并进行生物学功能预测和不同组织表达谱分析,进一步明确MYL2基... 为揭示MYL2基因在牦牛肌肉发育与高原适应性中的作用机制,探索其对牦牛肉品质和生产性能的潜在影响,对帕米尔牦牛MYL2基因进行了克隆与组织表达分析。通过克隆其编码区(CDS)并进行生物学功能预测和不同组织表达谱分析,进一步明确MYL2基因的功能特征。采用实时荧光定量PCR(RT-qRCR)技术,对帕米尔牦牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胰腺以及背最长肌进行MYL2基因表达水平的定量。结果表明,帕米尔牦牛MYL2基因CDS区的长度为501 bp,编码166个氨基酸。同源性比对发现,帕米尔牦牛MYL2基因与野牦牛的亲缘关系最近,相似度可达到100%,与鸡的亲缘关系最远。蛋白分析结果发现,其蛋白分子式C_(842)H_(1313)N_(219)O_(261)S_(7),分子质量为18.90442 ku,理论等电点为4.831;不稳定系数为28.3,表明该蛋白属于稳定蛋白;该蛋白存在1个N-糖基化潜在位点和15处潜在磷酸化位点;此外,该蛋白结构中不包含跨膜结构和信号肽,主要定位于细胞质膜和细胞壁上;二级结构主要由93个α-螺旋(占比56.02%)、60个无规则卷曲(占比7.83%)和13个β-折叠(占比36.14%)构成。RT-qPCR结果表明,MYL2基因在帕米尔牦牛心脏和背最长肌组织中表达量极显著高于其他组织,提示该基因可能在心肌功能维持与骨骼肌生长过程中发挥关键调控作用。结合蛋白功能预测结果推测,MYL2基因可能通过调控肌肉结构蛋白的表达,参与牦牛心肌与骨骼肌的发育,有助于牦牛在高寒低氧环境中维持良好的运动与产热能力,增强高原适应性。 展开更多
关键词 帕米尔牦牛 myl2基因 基因克隆 生物信息学
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藏猪与大约克猪MYL3基因多态性与表达差异分析
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作者 张健 张非凡 +3 位作者 王向东 强巴央宗 商鹏 谭占坤 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第5期198-203,共6页
为探究肌球蛋白轻链3(Myosin Light Chain 3,MYL3)基因在猪肌肉生长发育中发挥的作用,本研究采用Sanger测序法对藏猪和大约克猪MYL3基因5'侧翼区进行了单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)的筛选与基因分型;同时应... 为探究肌球蛋白轻链3(Myosin Light Chain 3,MYL3)基因在猪肌肉生长发育中发挥的作用,本研究采用Sanger测序法对藏猪和大约克猪MYL3基因5'侧翼区进行了单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)的筛选与基因分型;同时应用实时荧光定量PCR(qPCR)技术对不同生长阶段藏猪及大约克猪背最长肌组织中MYL3基因的mRNA表达量进行检测。结果表明:MYL3基因的5'侧翼区,存在C-351T、A-405G、A-466G与A-1413G4个突变位点,结合转录因子预测发现,A-1413G位点可能是MYL3基因调控猪肌肉生长发育相关的重要位点;30日龄,藏猪MYL3 mRNA表达量显著高于大约克猪;90日龄,藏猪MYL3mRNA表达差异不显著;180日龄,藏猪MYL3mRNA表达量显著低于大约克猪,推测MYL3基因在促进猪肌肉生长发育过程中发挥重要作用。本研究为进一步探究MYL3基因在猪肌肉中的分子调控机理提供了理论参考。 展开更多
关键词 藏猪 myl3基因 MRNA表达 基因多态性
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非小细胞肺癌组织MYLK和MYL9表达临床意义探讨 被引量:5
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作者 谭翔 陈铭伍 +4 位作者 王永勇 冼磊 郭建极 阳诺 郭钦明 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2014年第6期433-438,共6页
目的:探讨肌球蛋白轻链激酶(myosin light chain kinase,MYLK)和肌球蛋白轻链(myosin regulatory light chain9,MYL9)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)组织的表达情况及临床意义。方法:采用qRT-PCR及蛋白质印迹法检测2... 目的:探讨肌球蛋白轻链激酶(myosin light chain kinase,MYLK)和肌球蛋白轻链(myosin regulatory light chain9,MYL9)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)组织的表达情况及临床意义。方法:采用qRT-PCR及蛋白质印迹法检测2012-08-20-2013-02-01广西医科大学第一附属医院胸外科30例NSCLC组织和对应的癌旁组织及30例正常肺组织中MYLK和MYL9mRNA及蛋白的表达情况。进一步对影响MYLK和MYL9表达的临床特征进行Logistic回归分析。结果:NSCLC癌组织MYLK基因相对表达量为0.50±0.19,癌旁组织为0.97±0.22,正常组织为1,癌组织低于癌旁(P=0.001)及正常组织(P<0.001);MYLK蛋白在肺癌组织、癌旁组织及正常组织中表达分别为0.54±0.18、0.72±0.21和0.84±0.23,癌组织低于癌旁(P=0.008)及正常组织(P=0.003);MYL9基因在肺癌组织、癌旁组织及正常组织相对表达量分别为0.37±0.12、0.95±0.19和1,癌组织低于癌旁(P<0.001)及正常组织(P<0.001);MYL9蛋白在肺癌组织、癌旁组织及正常组织中蛋白相对表达量分别为0.56±0.14、0.74±0.20和0.78±0.19,癌组织低于癌旁(P=0.001)及正常组织(P<0.001)。MYLK和MYL9的mRNA及蛋白相对表达量与病理类型、分化程度和临床分期无关。癌组织淋巴结转移组MYLK的mRNA(P=0.04)和蛋白(P=0.04)及MYL9的mRNA(P<0.001)和蛋白(P=0.024)相对表达量明显高于无淋巴结转移组;吸烟组MYLK的mRNA(P<0.001)和蛋白(P=0.038)及MYL9的mRNA(P=0.001)及蛋白(P=0.01)相对表达量低于无吸烟组;男性MYLK的mRNA(P<0.001)和蛋白(P=0.03)及MYL9的mRNA(P=0.001)和蛋白(P<0.001)相对表达量低于女性组。多因素分析显示,女性、无吸烟及淋巴结转移增加MYLK及MYL9的表达。结论:NSCLC中MYLK和MYL9mRNA及蛋白表达均明显低于癌旁及正常组织,且在淋巴结转移的癌组织中表达均高于无淋巴结转移组。女性、无吸烟及淋巴结转移是MYLK及MYL9表达量增高的主要影响因素。 展开更多
关键词 非小细胞肺 mylK myl9 实时荧光定量PCR 蛋白质印迹 基因表达
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猪MYL1和MYL2基因的mRNA在不同组织中的表达分析 被引量:8
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作者 杨沛方 陈伟 +4 位作者 覃海 周萍 秦媛 许厚强 陈祥 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期2989-2994,共6页
为研究MYL1、MYL2基因在猪的不同组织中的mRNA的表达水平。本试验以大白猪为实验动物,首先,提取其心脏、肝脏、背最长肌、脂肪等组织的总RNA;其次,扩增MYL1、MYL2基因的cDNA序列;最后,以GAPDH基因作为内参,应用实时荧光定量PCR技术检测M... 为研究MYL1、MYL2基因在猪的不同组织中的mRNA的表达水平。本试验以大白猪为实验动物,首先,提取其心脏、肝脏、背最长肌、脂肪等组织的总RNA;其次,扩增MYL1、MYL2基因的cDNA序列;最后,以GAPDH基因作为内参,应用实时荧光定量PCR技术检测MYL1、MYL2基因在不同组织中mRNA的表达水平。结果表明:MYL1基因在背最长肌中表达量最高,MYL2基因在心肌和背最长肌表达量最高,在其它器官表达量很少甚至几乎不表达,说明MYL2基因可能对骨骼肌生长和发育起调节作用。本研究表明MYL1和MYL2基因的mRNA在同一猪种不同组织器官间表达量呈现显著性差异,可能与不同组织器官的功能相适应,可为进一步研究猪的肌肉生长发育机理提供理论基础。 展开更多
关键词 大白猪 myl1基因 myl2基因 实时荧光定量PCR
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鹅MYL1基因的克隆及胚胎期表达特征分析 被引量:5
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作者 顾志良 邵芳 +1 位作者 石亦静 吴小娟 《常熟理工学院学报》 2014年第2期7-12,共6页
肌球蛋白是肌纤维的主要组成成分,在肌肉生长和收缩过程中具有重要作用.本研究以鹅(Anser anser)肌肉总RNA为模板,采用RACE的方法,克隆肌球蛋白轻链1(MYL1)基因全长cDNA序列,并进行生物信息学分析.运用实时荧光定量PCR检测MYL1基因在鹅... 肌球蛋白是肌纤维的主要组成成分,在肌肉生长和收缩过程中具有重要作用.本研究以鹅(Anser anser)肌肉总RNA为模板,采用RACE的方法,克隆肌球蛋白轻链1(MYL1)基因全长cDNA序列,并进行生物信息学分析.运用实时荧光定量PCR检测MYL1基因在鹅胚胎期的表达特征.结果表明,鹅MYL1基因全长cDNA为1542 bp,编码193个氨基酸残基的肽链.预测鹅MYL1蛋白等电点5.12,分子量21.75 KD,具有典型的EFh和FRQ1结构域,且不同物种间EFh氨基酸序列高度同源.荧光定量PCR结果显示鹅胚胎期MYL1基因mRNA表达量总体呈现上升后下降的趋势,该基因在胚胎期E7就有表达,E7以后表达量逐渐上升,在E18表达量达到高峰后下降.研究结果首次提供了鹅肌肉组织主要结构基因MYL1的全序列和蛋白特征信息,并揭示该基因在鹅肌肉组织发生和发育的功能. 展开更多
关键词 myl1 CDNA序列 胚胎期 基因表达
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MYL9在非小细胞肺癌淋巴结和外周血中的表达及其临床意义 被引量:1
7
作者 王永勇 谭翔 +4 位作者 戴磊 阳诺 欧进 崔亚威 陈铭伍 《广西医科大学学报》 CAS 2017年第9期1303-1306,共4页
目的:研究肌球蛋白轻链(MYL9)在非小细胞肺癌(NSCLC)患者的淋巴结和外周血中的表达及其与临床病理特征的关系。方法:选取在2015年4月至2016年10月广西医科大学第一附属医院胸外科,并行肺叶切除+系统性淋巴结清扫手术治疗的60例NSCLC患... 目的:研究肌球蛋白轻链(MYL9)在非小细胞肺癌(NSCLC)患者的淋巴结和外周血中的表达及其与临床病理特征的关系。方法:选取在2015年4月至2016年10月广西医科大学第一附属医院胸外科,并行肺叶切除+系统性淋巴结清扫手术治疗的60例NSCLC患者作为研究组,同期选取60例无恶性肿瘤病史的健康体检者为对照组。采用实时荧光定量PCR(q PCR)及western blotting法检测MYL9在淋巴结和外周血中m RNA和蛋白表达水平;多因素Logistic回归模型分析MYL9m RNA及蛋白表达的影响因素。结果:研究组外周血MYL9 m RNA及蛋白表达量均高于对照组(均P<0.05);MYL9 m RNA和蛋白在淋巴结转移阳性患者的表达量均高于淋巴结转移阴性患者的表达量,差异有统计学意义(均P<0.05);经多因素Logistic回归分析,肿瘤分化程度和淋巴结分期是影响NSCLC患者MYL9表达的独立危险因素(P<0.05)。结论:NSCLC患者肿瘤分化程度越差,淋巴结分期越晚,MYL9 m RNA和蛋白表达上调越明显;MYL9可能参与了NSCLC的转移过程,是一个潜在的预后预测指标。 展开更多
关键词 myl9 非小细胞肺癌 淋巴结 外周血 转移
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不同羊毛纤维直径细毛羊MYL6基因克隆及差异表达研究 被引量:1
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作者 付雪峰 黄锡霞 +6 位作者 刘春洁 徐新明 张艳花 吴伟伟 于丽娟 石刚 田可川 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2016年第13期5-11,共7页
试验以苏博美利奴羊为研究对象,探讨肌球蛋白轻链6(MYL6)基因在不同羊毛纤维直径的苏博美利奴羊中的表达模式。通过克隆肌球蛋白轻链6(MYL6)基因,结合生物信息学方法对其进行遗传进化和理化性质分析,且预测其二级蛋白结构,又通过RT-PCR... 试验以苏博美利奴羊为研究对象,探讨肌球蛋白轻链6(MYL6)基因在不同羊毛纤维直径的苏博美利奴羊中的表达模式。通过克隆肌球蛋白轻链6(MYL6)基因,结合生物信息学方法对其进行遗传进化和理化性质分析,且预测其二级蛋白结构,又通过RT-PCR相对定量方法以2^(-△△ct)值检测MYL6基因在苏博美利奴羊上的表达规律。结果表明:苏博美利奴羊MYL6基因大小为152036915 bp,MYL6基因的CDS全长序列为696 bp,共编码了105个氨基酸,与绵羊、山羊、牛、猪、老鼠、兔子、鸡、狗和斑马鱼的CDS同源分别为96%、95%、40%、40%、40%、40%、0%、60%、0%。分别在1、220~336、415~864 bp位点上有3个开放式阅读框(ORF)。遗传理化性质研究显示MYL6蛋白含有1个信号肽,在苏氨酸上有5个磷酸化位点、6个N-糖基化位点和3个O-糖基化位点,可能是一种非分泌性蛋白;MYL6蛋白的二级结构以无规则卷曲为主,β-折叠区域占-2.00%;扭曲度占-0.16%;等电荷在-1.60~0.05。研究结果表明,苏博美利奴羊MYL6基因在超细型细毛羊皮肤组织表达量显著高于细型细毛羊的表达量(P<0.01,差异倍数为2.048)。本研究将为开展肌球蛋白轻链基因在细毛羊皮肤转录水平上的研究提供数据理论基础。 展开更多
关键词 苏博美利奴羊 myl6基因 生物信息学 RT-PCR 转录水平
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小尾寒羊MYL1基因启动子区的克隆、分析及蛋白表达 被引量:1
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作者 张春兰 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第2期150-152,共3页
为研究绵羊肌球蛋白轻链1(Myosin Light Chain 1,MYL1)基因在骨骼肌中的表达调控和功能,本实验选择3只11月龄小尾寒羊,对其启动子区域进行了克隆和序列特征分析;利用Western blotting法对其编码蛋白在小尾寒羊不同组织(肝、胃、心、肺... 为研究绵羊肌球蛋白轻链1(Myosin Light Chain 1,MYL1)基因在骨骼肌中的表达调控和功能,本实验选择3只11月龄小尾寒羊,对其启动子区域进行了克隆和序列特征分析;利用Western blotting法对其编码蛋白在小尾寒羊不同组织(肝、胃、心、肺、背最长肌、脾、卵巢)中的表达进行比较分析。结果表明:MYL1基因含有多个启动子,其最佳启动子可能位于2102~2152 bp处,并且可结合有AP-2、TFIID等多种转录因子;其编码蛋白的分子量约21 ku;该蛋白只在小尾寒羊骨骼肌中表达,在其他组织中均不表达。本研究认为MYL1基因具有多个启动子,虽然其转录后存在多个可变剪接体,但翻译蛋白只有1种,属于绵羊骨骼肌组织特异性表达的基因。 展开更多
关键词 绵羊 myl1 启动子 克隆 表达
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肌球蛋白轻链家族基因MYL2和MYL3在鸡皮肤组织中的表达研究
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作者 魏莹晖 葛莹 +4 位作者 刘航 王欢欢 李庆海 章学东 范京辉 《浙江畜牧兽医》 2024年第1期1-4,共4页
本研究旨在探究肌球蛋白轻链家族2(MYL 2)和肌球蛋白轻链家族3(MYL 3)基因与鸡皮肤组织黑色素沉着过程的关系,为鸡皮肤组织颜色差异的分子机制提供理论依据。分别取白肤和黑肤鸡的皮肤样品比较它们的肤色,同时通过荧光定量PCR和蛋白质... 本研究旨在探究肌球蛋白轻链家族2(MYL 2)和肌球蛋白轻链家族3(MYL 3)基因与鸡皮肤组织黑色素沉着过程的关系,为鸡皮肤组织颜色差异的分子机制提供理论依据。分别取白肤和黑肤鸡的皮肤样品比较它们的肤色,同时通过荧光定量PCR和蛋白质印迹法测定白肤和黑肤鸡皮肤组织中MYL 2和MYL 3的mRNA和蛋白水平的表达。黑皮肤组与白皮肤组相比,L*值和b*极显著低于白皮肤组(P<0.01);MYL 2和MYL 3的mRNA表达极显著下降(P<0.01);MYL 2蛋白水平的表达显著下降(P<0.05)且MYL 3极显著下降(P<0.01)。结果表明MYL 2和MYL 3可能参与鸡皮肤组织颜色的生成,其表达量的下降可能使得鸡的皮肤颜色加深。 展开更多
关键词 皮肤 myl 2 myl 3 肌球蛋白 黑色素
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绵羊Myl3基因启动子区的克隆、分析及蛋白表达 被引量:1
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作者 张春兰 《潍坊学院学报》 2022年第2期25-28,共4页
为探索肌球蛋白轻链3基因(Myl3)在绵羊中的表达调控和功能,以小尾寒羊为试验动物,对该基因的启动子区序列进行了克隆、测序和生物信息学分析;并对其编码蛋白在不同组织中的表达进行了比较。结果表明:该基因有1个基础启动子和1个CpG岛;... 为探索肌球蛋白轻链3基因(Myl3)在绵羊中的表达调控和功能,以小尾寒羊为试验动物,对该基因的启动子区序列进行了克隆、测序和生物信息学分析;并对其编码蛋白在不同组织中的表达进行了比较。结果表明:该基因有1个基础启动子和1个CpG岛;其编码蛋白的分子量约为22kD,主要在心肌和骨骼肌组织中表达。该基因的表达受到Sp1、MyoD等转录因子的调控。 展开更多
关键词 绵羊 myl3 启动子 蛋白表达
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陆川猪MYL9基因克隆及其表达差异分析 被引量:6
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作者 焦迪 谢婉 +6 位作者 潘鹏丞 陈宝剑 关志惠 杨秀荣 兰干球 郭亚芬 谢炳坤 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期454-460,共7页
【目的】克隆陆川猪肌球蛋白调节轻链9基因(MYL9),并进行生物信息学分析及检测其在不同猪种中的表达差异,为明确陆川猪骨骼肌生长规律及研究MYL9的生理功能打下基础。【方法】根据NCBI上的家猪MYL9基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR克... 【目的】克隆陆川猪肌球蛋白调节轻链9基因(MYL9),并进行生物信息学分析及检测其在不同猪种中的表达差异,为明确陆川猪骨骼肌生长规律及研究MYL9的生理功能打下基础。【方法】根据NCBI上的家猪MYL9基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR克隆陆川猪MYL9基因,利用在线软件对其进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测陆川猪和杜洛克猪背最长肌中MYL9基因的表达情况。【结果】陆川猪MYL9基因编码区(CDS)序列长519bp,共编码172个氨基酸;与NCBI上已公布的家猪MYL9基因(NM_001244472.1)CDS序列比对,陆川猪MYL9基因存在2处碱基突变,分别是195 bp处C→A和498 bp处T→C,均为同义突变;陆川猪MYL9基因推导氨基酸序列与家猪MYL9基因推导氨基酸序列的同源性最高,为99.6%,与鸡的同源性最低,为88.4%。陆川猪MYL9蛋白存在3个N糖基化位点和15个磷酸化位点,不存在跨膜结构域和信号肽,符合一般EFh-PEF超家族的结构特征。陆川猪MYL9蛋白二级结构中α-螺旋占54.65%,无规则卷曲占35.47%,β-转角占8.14%,延伸链占1.74%。MYL9基因在杜洛克猪背最长肌中的相对表达量极显著高于陆川猪背最长肌(P<0.01)。【结论】MYL9基因序列在不同物种中具有较高的保守性,其在10周龄陆川猪背最长肌中的相对表达量极显著低于杜洛克猪,与其在不同猪种背最长肌中的磷酸化程度有关,也说明MYL9基因对猪肌肉生长速度有一定影响。 展开更多
关键词 陆川猪 肌球蛋白轻链9基因(myl9) 克隆 生物信息学分析 肌肉 磷酸化
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绵羊MYL基因家族的鉴定与组织表达分析 被引量:2
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作者 杨杨 余乾 +6 位作者 刘昱成 杨华 赵卓 王立民 周平 杨庆勇 代蓉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1551-1564,共14页
为了解肌球蛋白轻链(myosin light chain,MYL)基因家族在绵羊中的分子进化关系及表达变化,本研究利用生物信息学方法对绵羊MYL基因家族进行鉴定和系统分析。各选取了3只军垦白肉羊、新疆细毛羊和湖羊成年公羊各组织样品,采用qRT-PCR方... 为了解肌球蛋白轻链(myosin light chain,MYL)基因家族在绵羊中的分子进化关系及表达变化,本研究利用生物信息学方法对绵羊MYL基因家族进行鉴定和系统分析。各选取了3只军垦白肉羊、新疆细毛羊和湖羊成年公羊各组织样品,采用qRT-PCR方法验证家族成员MYL1、MYL6B和MYLPF基因的表达情况。结果显示,12个MYL基因分布在9条染色体上,编码由147~211氨基酸组成的亲水性蛋白质,无信号肽和跨膜结构域,二级结构以α-螺旋为主。根据基因结构、保守结构域和基序分布等特征,可以将这些基因家族成员分为3个组。共线性分析结果表明,MYL2和MYL10、MYL2和MYLPF存在片段复制,且这些片段受到较强的选择压力。蛋白互作网络显示MYH10与绵羊MYL家族成员均存在互作关系。MYLs的组织表达模式差异较大,其中MYL1、MYL2、MYL6B和MYLPF在骨骼肌组织中高水平表达。基因克隆测序结果显示,扩增得到目的基因的CDS全长,qRT-PCR结果表明,MYL1、MYL6B和MYLPF在军垦白肉羊肌肉组织中的表达水平显著高于其他组织(P<0.0001),并且在军垦白肉羊骨骼肌中的表达水平显著高于湖羊和细毛羊(P<0.0001)。以上结果为深入研究绵羊MYL基因家族的功能以及优化绵羊肉用性能提供了线索。 展开更多
关键词 绵羊 myl 基因家族 生物信息学分析 基因表达
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家兔MYL12B基因的克隆及生物信息学分析 被引量:1
14
作者 潘蕾 刘燕 +4 位作者 韦强 肖琛闻 季权安 鲍国连 吴信生 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第6期927-932,共6页
克隆家兔MYL12B基因的CDS序列并对其进行生物信息学分析。结果表明,家兔与其他动物MYL12B基因在CDS和氨基酸序列上的相似性较高。对家兔MYL12B蛋白的软件预测分析表明,该蛋白是一个无二硫键和信号肽的稳定的亲水性结构蛋白,含11个磷酸... 克隆家兔MYL12B基因的CDS序列并对其进行生物信息学分析。结果表明,家兔与其他动物MYL12B基因在CDS和氨基酸序列上的相似性较高。对家兔MYL12B蛋白的软件预测分析表明,该蛋白是一个无二硫键和信号肽的稳定的亲水性结构蛋白,含11个磷酸化位点和3个糖基化位点。研究结果可为该基因的进一步研究以及探明其作用机制和网络调控机理提供依据。 展开更多
关键词 myl12B基因 相似性 生物信息学分析
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从江香猪MYL2基因CDS区克隆及序列分析 被引量:3
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作者 申勇 陈伟 +2 位作者 代振新 吴国文 熊元松 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第13期95-97,243,244,共5页
为了克隆贵州从江香猪MYL2基因CDS区,并进行序列分析,为后续MYL2基因功能研究奠定基础,试验采集从江香猪背最长肌组织,进行RNA的提取和c DNA合成,对MYL2基因的CDS区进行克隆、构建重组载体,并进行生物信息学分析。结果表明:从江香猪MYL... 为了克隆贵州从江香猪MYL2基因CDS区,并进行序列分析,为后续MYL2基因功能研究奠定基础,试验采集从江香猪背最长肌组织,进行RNA的提取和c DNA合成,对MYL2基因的CDS区进行克隆、构建重组载体,并进行生物信息学分析。结果表明:从江香猪MYL2基因的CDS区全长510 bp,编码166个氨基酸,为稳定蛋白,属于亲水性蛋白,无跨膜螺旋区域,不存在信号肽;MYL2蛋白亚细胞有8.7%存在于细胞核内,56.5%存在于细胞质中,21.7%存在于细胞骨架中。 展开更多
关键词 从江香猪 myl2基因 RT-PCR CDS区 序列分析
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北京鸭MYL3基因的生物信息学分析及其原核表达 被引量:2
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作者 李茹 马心如 +3 位作者 肖健 刘语嫣 胡志刚 刘小林 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期155-163,共9页
肌球蛋白轻链3(Myosin Light Chain 3,MYL3)属于MYLs家族,能够维持细胞结构及功能、保持肌球蛋白构型。本研究扩增了北京鸭胸肌组织MYL3基因的CDS区序列,在此基础上使用生物信息学分析网站进行序列分析,下一步构建MYL3原核表达载体,将... 肌球蛋白轻链3(Myosin Light Chain 3,MYL3)属于MYLs家族,能够维持细胞结构及功能、保持肌球蛋白构型。本研究扩增了北京鸭胸肌组织MYL3基因的CDS区序列,在此基础上使用生物信息学分析网站进行序列分析,下一步构建MYL3原核表达载体,将重组质粒导入E.coli BL21(DE3),利用IPTG诱导表达,最后使用SDS-PAGE凝胶电泳技术检测MYL3原核表达蛋白。结果表明:鸭MYL3基因开放阅读框大小为582 bp,编码193个氨基酸,日本鹌鹑、雉鸡和鸡的氨基酸序列与鸭亲缘关系最近,其次是鸵鸟,最后是人和猪。MYL3蛋白的相对分子质量为21800.01u,等电点为5.13,不稳定性系数为42.5,是一种不稳定且呈酸性的蛋白,总体平均亲水系数高达-0.727,不属于疏水性蛋白。另外,此蛋白是细胞质蛋白,无信号肽和跨膜结构,存在14个磷酸位点和2个N-糖基化位点;该蛋白具有的二级结构中比例最高的是α-螺旋,最低的是β-转角。本实验完成了大小为664 bp的MYL3基因片段的扩增,pET-32a(+)-MYL3重组质粒通过BamH I和Sac I双酶切后,分别形成了664 bp和5 894 bp两条带,诱导表达出了大小约21 ku的重组蛋白,且该蛋白具有可溶性。本实验克隆了北京鸭MYL3基因,并进行了生物信息学分析和原核表达,为进一步深入研究MYL3基因在北京鸭肌肉生长发育过程中的作用及对相关分子机制的调控提供了理论基础,为提高北京鸭肌肉发育水平提供参考依据。 展开更多
关键词 北京鸭 myl3基因 生物信息学分析 原核表达 功能
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猪MYL2基因多态性及其在肌肉组织中的差异表达 被引量:1
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作者 叶幼荣 张健 +4 位作者 赵舜旺 徐士军 刘振东 强巴央宗 商鹏 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第24期131-135,共5页
肌球蛋白轻链-2(myosin light chain 2,MYL2)是哺乳动物横纹肌中的一种主要肌小节蛋白,对动物正常生长发育起重要调控作用,为探究猪MYL2基因的多态性及其在横纹肌中mRNA表达规律,以藏猪(TP)和大约克猪(YY)作为试验动物,采用Sanger测序法... 肌球蛋白轻链-2(myosin light chain 2,MYL2)是哺乳动物横纹肌中的一种主要肌小节蛋白,对动物正常生长发育起重要调控作用,为探究猪MYL2基因的多态性及其在横纹肌中mRNA表达规律,以藏猪(TP)和大约克猪(YY)作为试验动物,采用Sanger测序法对MYL2基因5′非翻译区(5′UTR)进行单核苷酸多态性(SNP)的筛选与基因分型,并预测分析MYL2基因SNPs位点突变前后转录因子功能特性;同时,采用RT-qPCR技术检测MYL2基因在30、90、180日龄时TP和YY的心肌和背最长肌组织中的mRNA相对表达量。结果显示,MYL2基因启动子区域存在2个SNPs且2个品种间基因频率差异极显著(P<0.01),产生4个新增转录因子结合位点,这些位点调控横纹肌的收缩、肌纤维类型的维持、肌肉细胞的增殖分化等过程;MYL2基因的mRNA水平随日龄增长而升高,且3个日龄TP心肌和背最长肌组织中的表达量均极显著高于YY(P<0.01)。综上表明,猪MYL2基因SNPs位点与心肌和背最长肌mRNA的差异表达相关,研究结果可为研究藏猪生长发育的分子调控机制提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 myl2基因 SNP 藏猪 转录因子 相对表达量
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MYL9在间质中的表达下调与前列腺癌患者的不良临床预后 被引量:3
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作者 徐文锋 余定宇 +6 位作者 张友強 陈雁如 黄亚强 陈佳鸿 何慧婵 钟惟德 江福能 《岭南现代临床外科》 2014年第4期358-361,共4页
目的研究MYL9在前列腺癌组织中的表达水平与前列腺癌临床预后的相关性。方法采用免疫组织化学检测80例前列腺癌根治术患者前列腺癌及61例癌旁良性前列腺组织中的MYL9的表达水平,并与前列腺癌(PCa)患者的临床特征相比较。结果在良性和前... 目的研究MYL9在前列腺癌组织中的表达水平与前列腺癌临床预后的相关性。方法采用免疫组织化学检测80例前列腺癌根治术患者前列腺癌及61例癌旁良性前列腺组织中的MYL9的表达水平,并与前列腺癌(PCa)患者的临床特征相比较。结果在良性和前列腺癌组织中,MYL9均主要在前列腺间质而不是在前列腺上皮细胞表达,前列腺癌样本中的MYL9表达水平相对于良性前列腺组织显著下调(PCa=3.21±1.46 vs.Benign=4.63±0.97,P<0.001)并伴有肿瘤间质容积的明显减少。MYL9的下调表达与前列腺癌的Gleason评分(P<0.001)明显相关。结论表明MYL9表达下调越明显,则前列腺癌患者临床预后越差。该研究为MYL9在前列腺癌组织中的下调表达可作为预测人类前列腺癌患者的不良临床预后的指标提供了证据。 展开更多
关键词 肌球蛋白轻链(myl9) 前列腺癌 肿瘤间质
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牦牛MYL3基因的克隆及组织表达分析 被引量:2
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作者 张梦帆 路建卫 +2 位作者 扎老 赵雪 梁春年 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2024年第4期1-9,共9页
【目的】研究牦牛MYL3基因的结构和表达特征,探究其生物学功能及影响牦牛肌肉生长发育的机制。【方法】以美仁牦牛cDNA为模板,PCR扩增MYL3基因编码区序列(CDS),利用MEGA11软件构建系统进化树,利用生物信息学软件对其编码蛋白进行分析。... 【目的】研究牦牛MYL3基因的结构和表达特征,探究其生物学功能及影响牦牛肌肉生长发育的机制。【方法】以美仁牦牛cDNA为模板,PCR扩增MYL3基因编码区序列(CDS),利用MEGA11软件构建系统进化树,利用生物信息学软件对其编码蛋白进行分析。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测MYL3基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏(参照)、睾丸、肌肉和脂肪组织中的相对表达量。【结果】牦牛MYL3基因CDS区长600 bp,共编码199个氨基酸,存在1个碱基突变位点,位于第165位(A>T)。系统进化分析结果显示,牦牛与普通牛的亲缘关系最近,与单峰驼的亲缘关系最远。生物信息学分析结果显示,牦牛MYL3蛋白为不稳定的亲水性蛋白,无信号肽,不存在跨膜结构,主要存在于细胞质内,有8个磷酸化位点和2个N-糖基化位点,蛋白的二级结构以α-螺旋为主,主要与调控肌肉生长发育的相关蛋白相互作用。RT-qPCR结果表明,MYL3基因在心脏中的表达量最高,极显著高于其他组织;肌肉中次之,与除心脏外的其他组织存在极显著差异。【结论】MYL3基因可能与牦牛心脏发育有关,对肌肉的生长发育和肉质有一定影响。 展开更多
关键词 牦牛 myl3基因 肌肉生长发育 肌肉品质
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美仁牦牛MYL 9基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究
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作者 马荣 喇永福 +6 位作者 包鹏甲 郭宪 路建卫 扎老 赵雪 梁春年 成述儒 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1410-1419,共10页
【目的】克隆美仁牦牛肌球蛋白轻链9(myosin light chain 9,MYL9)基因CDS区并对其进行生物信息学分析,检测MYL 9基因的组织表达特征,为探究该基因功能提供一定理论依据。【方法】以美仁牦牛肌肉组织cDNA为模板,利用PCR扩增并克隆美仁牦... 【目的】克隆美仁牦牛肌球蛋白轻链9(myosin light chain 9,MYL9)基因CDS区并对其进行生物信息学分析,检测MYL 9基因的组织表达特征,为探究该基因功能提供一定理论依据。【方法】以美仁牦牛肌肉组织cDNA为模板,利用PCR扩增并克隆美仁牦牛CDS区序列,与其他物种进行相似性比对及系统进化树构建;通过在线软件对MYL9蛋白进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR检测MYL 9基因在美仁牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中表达情况。【结果】美仁牦牛MYL 9基因CDS区长516 bp,共编码171个氨基酸。系统进化树结果显示,美仁牦牛与野牦牛、普通牛亲缘关系最近,与高山倭蛙亲缘关系最远。MYL9蛋白分子式为C 858 H 1324 N 234 O 274 S 12,原子数为2702,理论等电点为4.85,不稳定系数和总平均亲水性分别为37.22和―0.772,属于稳定亲水性蛋白。MYL9蛋白无信号肽和跨膜螺旋结构,属于非分泌性蛋白;主要定位于线粒体、细胞核、细胞质中,具有17个特异性磷酸化位点。MYL9蛋白二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲、β-折叠和延伸链构成,三级结构预测结果与二级结构一致。实时荧光定量PCR结果显示,MYL 9基因在美仁牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中均表达,且肝脏和肌肉组织中表达量显著高于其他组织(P<0.05)。【结论】本研究成功克隆美仁牦牛MYL 9基因CDS区,探究了MYL 9基因的生物学功能及组织表达特征,研究结果为进一步探究牦牛MYL 9基因功能特征提供了参考。 展开更多
关键词 美仁牦牛 myl 9基因 克隆 生物信息学 组织表达
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