MYC类转录因子,是植物激素茉莉酸信号路径中起重要作用的核心转录因子,在植物生长、发育、免疫和响应非生物胁迫等方面调节作用显著。MYC2转录因子是MYC家族中非常重要的成员。本研究根据多刺绿绒蒿全长转录组注释的MYC2基因信息设计扩...MYC类转录因子,是植物激素茉莉酸信号路径中起重要作用的核心转录因子,在植物生长、发育、免疫和响应非生物胁迫等方面调节作用显著。MYC2转录因子是MYC家族中非常重要的成员。本研究根据多刺绿绒蒿全长转录组注释的MYC2基因信息设计扩增引物,利用PCR克隆获得MhMYC2基因,并对其编码的蛋白质进行相关生物信息学分析。结果显示:全长转录组注释MhMYC2全长序列大小为1980 bp,其开放阅读框(ORF)为1233 bp,编码410个氨基酸。MhMYC2编码的蛋白分子式和分子量分别是C1991H3064N538O652S9和45.26 k D,总原子数量是6254;该蛋白带正电荷和负电荷的残基总数分别是29和44,其理论等电点为4.91;该蛋白定位于细胞核内,稳定性较差,属于亲水性非分泌蛋白,不存在跨膜结构域;该蛋白二级结构主要包括延伸链、无规则卷曲和α-螺旋,其比例分别为15.37%、60.24%和22.68%。系统进化树分析发现MhMYC2蛋白与罂粟亲缘关系最近。以上研究结果在一定程度上为研究MhMYC2基因的功能及其调控作用奠定了理论基础。展开更多
文摘MYC类转录因子,是植物激素茉莉酸信号路径中起重要作用的核心转录因子,在植物生长、发育、免疫和响应非生物胁迫等方面调节作用显著。MYC2转录因子是MYC家族中非常重要的成员。本研究根据多刺绿绒蒿全长转录组注释的MYC2基因信息设计扩增引物,利用PCR克隆获得MhMYC2基因,并对其编码的蛋白质进行相关生物信息学分析。结果显示:全长转录组注释MhMYC2全长序列大小为1980 bp,其开放阅读框(ORF)为1233 bp,编码410个氨基酸。MhMYC2编码的蛋白分子式和分子量分别是C1991H3064N538O652S9和45.26 k D,总原子数量是6254;该蛋白带正电荷和负电荷的残基总数分别是29和44,其理论等电点为4.91;该蛋白定位于细胞核内,稳定性较差,属于亲水性非分泌蛋白,不存在跨膜结构域;该蛋白二级结构主要包括延伸链、无规则卷曲和α-螺旋,其比例分别为15.37%、60.24%和22.68%。系统进化树分析发现MhMYC2蛋白与罂粟亲缘关系最近。以上研究结果在一定程度上为研究MhMYC2基因的功能及其调控作用奠定了理论基础。
