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Mutator转座子及MULE在植物基因与基因组进化中的作用(英文) 被引量:4
1
作者 刁现民 Damon Lisch 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第6期477-487,共11页
Mutator(Mu)转座子是植物中已发现的转座最活跃的转座子,其高的转座频率及趋向于单拷贝功能基因转座的特性,使该转座子成为玉米功能基因克隆的主要方法。Mu转座子的同源类似因子广泛存在于被子植物基因组中,而且同一基因组中往往具有多... Mutator(Mu)转座子是植物中已发现的转座最活跃的转座子,其高的转座频率及趋向于单拷贝功能基因转座的特性,使该转座子成为玉米功能基因克隆的主要方法。Mu转座子的同源类似因子广泛存在于被子植物基因组中,而且同一基因组中往往具有多种变异类型。它不仅具有其他DNA转座子在基因和基因组进化中的普遍作用,而且具有能够承载基因组内功能基因和基因片段的载体功能,这种载体Mu转座子(Pack-MuLEs)能够在基因组内移动众多的基因片段,从而对基因和基因组进化产生作用。Mu转座子的同源序列发生在水稻与狗尾草之间的水平转移提供了高等植物核基因水平转移的首个例证。对Mu转座子的了解促进了我们对动态基因组概念的认识。文章对Mutator转座子的发现、转座特征、基因标签应用等的研究进展进行了综述,对Mu转座子家族的同源序列进行了分类,讨论了该转座子在基因组进化中的作用,分析了应加强研究的问题。 展开更多
关键词 Mutator 转座子 基因组进化 mule 载体Mu转座子
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一种基于Mule-Transport机制的防空指挥系统软件服务交互方法
2
作者 赵晓莲 王珩 《中国电子科学研究院学报》 北大核心 2017年第1期85-89,共5页
面向服务的防空指挥系统软件开发与集成已成为防空指挥系统建设中的关键问题之一。针对高时效性和安全性条件下的软件服务交互问题,本文提出了一种基于Mule-Transport机制的防空指挥系统软件服务交互方法。该方法在基于开源Mule的服务... 面向服务的防空指挥系统软件开发与集成已成为防空指挥系统建设中的关键问题之一。针对高时效性和安全性条件下的软件服务交互问题,本文提出了一种基于Mule-Transport机制的防空指挥系统软件服务交互方法。该方法在基于开源Mule的服务运行环境基础上,利用Transport消息机制,以插件方式动态绑定军用传输协议,实现服务间交互。该方法采用Java语言实现,具有良好的可扩展性和移植性;服务交互试验表明该方法有效、可行,较好地满足了防空指挥系统环境时效性和安全性的要求。 展开更多
关键词 服务交互 Transport消息机制 mule 防空指挥系统 面向服务
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基于ESB和Mule的数字化校园应用集成设计 被引量:1
3
作者 曹文继 邵燕琳 《内蒙古财经学院学报(综合版)》 2010年第2期79-83,共5页
数字化校园是校园信息化建设的重要内容,针对高校信息化建设的现状,分析数字化校园建设的重点解决的问题,提出了具有高开放性和扩展性的数字化校园建设模型,即以企业服务总线ESB为框架,集成高校现有应用系统,整合信息资源,构建校园数据... 数字化校园是校园信息化建设的重要内容,针对高校信息化建设的现状,分析数字化校园建设的重点解决的问题,提出了具有高开放性和扩展性的数字化校园建设模型,即以企业服务总线ESB为框架,集成高校现有应用系统,整合信息资源,构建校园数据中心、统一身份认证和信息门户,并以数据中心为核心,建立数据交换和共享机制。以此模型为基础,结合ESB和Mule开源框架,给出了应用系统间实现用户数据同步的消息处理流程设计实例。 展开更多
关键词 数字化校园 企业服务总线 mule 模型 用户数据同步 流程设计
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基于Mule的数字校园数据交换系统设计与实现
4
作者 胡晨光 《现代电子技术》 2013年第6期45-47,52,共4页
现阶段高校信息化建设的主题是集成,数据集成是集成的重要方面。ESB中间件技术是实现SOA架构的一个关键技术,开源的Mule能很好地实现SOA服务集成。在此分析数字校园的数据交换所遇到的困难,阐述了使用ESB建设数据交换平台的优势;介绍了M... 现阶段高校信息化建设的主题是集成,数据集成是集成的重要方面。ESB中间件技术是实现SOA架构的一个关键技术,开源的Mule能很好地实现SOA服务集成。在此分析数字校园的数据交换所遇到的困难,阐述了使用ESB建设数据交换平台的优势;介绍了Mule开源系统的特点、结构和服务处理流程;针对数字校园的数据交换,提出了基于Mule的数字校园数据交换和共享的体系结构;介绍了数据交换平台的系统设计和信息交换流程设计,给出了Mule的具体配置方案。 展开更多
关键词 数字校园 数据交换 SOA mule
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Mule car线束故障排查一例 被引量:1
5
作者 马惠芳 陈文科 《科技创新与应用》 2015年第23期85-85,共1页
在现代汽车上,汽车线束设计的使用较频繁,电子控制系统与线束有着密切的关系,有人曾形象的比喻线束就是汽车的神经和血管。而汽车线束作为汽车电路的网络主体,连接着汽车的电气电子部件并使之发挥功能,没有线束也就不存在汽车电路。文... 在现代汽车上,汽车线束设计的使用较频繁,电子控制系统与线束有着密切的关系,有人曾形象的比喻线束就是汽车的神经和血管。而汽车线束作为汽车电路的网络主体,连接着汽车的电气电子部件并使之发挥功能,没有线束也就不存在汽车电路。文章结合作者自身工作经历,就Mule car在试验过程中遇见的线束故障问题排查方法做以分享。 展开更多
关键词 mule CAR 线束 故障排查
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Mule在区域性现代物流信息公共服务平台的应用研究 被引量:1
6
作者 庞光垚 廖新菊 陆科达 《梧州学院学报》 2014年第3期7-13,共7页
针对当前物流信息平台建设存在的系统间低效互通、高耦合、高成本和低拓展性的问题,该文使用SOA思想的ESB技术解决方案,以西江物流信息公共服务平台建设的实际需求为背景,提出了基于ESB开源框架Mule技术的数据交换与共享中心集成框架,... 针对当前物流信息平台建设存在的系统间低效互通、高耦合、高成本和低拓展性的问题,该文使用SOA思想的ESB技术解决方案,以西江物流信息公共服务平台建设的实际需求为背景,提出了基于ESB开源框架Mule技术的数据交换与共享中心集成框架,并对该框架进行了技术实现,取得了较好结果,为系统集成提供了可参考的实施方案。 展开更多
关键词 SOA技术 系统总线 Web服务 mule框架 西江物流平台
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Human activity affects the perception of risk by mule deer 被引量:3
7
作者 Mary V. PRICE Evelyn H. STROMBOM Daniel T. BLUMSTEIN 《Current Zoology》 SCIE CAS CSCD 2014年第6期693-699,共7页
Human activity has been shown to influence how animals assess the risk of predation, but we know little about the spatial scale of such impacts. We quantified how vigilance and flight behavior in mule deer Odocoileus ... Human activity has been shown to influence how animals assess the risk of predation, but we know little about the spatial scale of such impacts. We quantified how vigilance and flight behavior in mule deer Odocoileus hemionus varied with distance from an area of concentrated human activity--a subalpine field station. An observer walked trails at various distances away from the station looking for deer. Upon encounter, the observer walked toward the focal animal and noted the distance at which it alerted and directed its attention to the approaching human (Alert Distance; AD), and the distance at which it fled (Flight Initiation Distance;. FID). AD and FID both increased nonlinearly with distance from the center of the field station, reaching pla- teaus around 250 m and 750 m, respectively. Deer also tended to flee by stotting or running, rather than by walking, when far from the station but they walked away when near the station. These results indicate that deer perceive lower risk near a focused area of human activity, and that vigilance and flight behaviors respond on somewhat different spatial scales. The concept of a spatial "human footprint" on behavior may be useful for understanding how human activities affect wildlife 展开更多
关键词 Flight initiation distance Alert distance Predation risk assessment Human disturbance mule deer Odocoileushemionus VIGILANCE
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Mule ESB在DICOM协议上的扩展研究
8
作者 吴倩 蔡建平 《微计算机信息》 2010年第33期36-38,89,共4页
传统的医疗软件大多为点对点架构,这种结构会大大降低软件的可重用性和可扩展性。为了改进传统医疗软件点对点的架构,消除不同应用之间的技术差异,将企业服务总线引入到DICOM协议中,提出了Mule企业服务总线在DICOM网络协议上的扩展方法... 传统的医疗软件大多为点对点架构,这种结构会大大降低软件的可重用性和可扩展性。为了改进传统医疗软件点对点的架构,消除不同应用之间的技术差异,将企业服务总线引入到DICOM协议中,提出了Mule企业服务总线在DICOM网络协议上的扩展方法。主要利用Mule企业服务总线的可扩展的接口Transport模型,对其进行改写,通过它来实现DICOM网络协议,进而消除DICOM不同应用之间的技术差异,让不同的应用服务器协调运作,实现了不同服务之间的通信与整合。最后介绍了DICOM网络协议在Mule Transport上的应用。 展开更多
关键词 企业服务总线 mule DICOM 传送器 DICOM通信
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基于Mule的IEC61968信息交互总线的研究与应用
9
作者 许稳堂 闫红漫 张弘 《智能计算机与应用》 2016年第1期91-96,共6页
针对目前配电网领域信息交互、信息共享问题,提出了一个基于Mule的IEC61968信息交互总线的功能架构,深入分析了信息交互总线的基本功能,并实现了一个总线服务原型系统。最后,通过对总线上发布模型数据场景的集成分析,解决了因数据模型... 针对目前配电网领域信息交互、信息共享问题,提出了一个基于Mule的IEC61968信息交互总线的功能架构,深入分析了信息交互总线的基本功能,并实现了一个总线服务原型系统。最后,通过对总线上发布模型数据场景的集成分析,解决了因数据模型不一致导致的信息交互问题,验证了所提出的功能框架的实用性。 展开更多
关键词 IEC 61968 mule 信息交互总线 模型验证
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基于Mule ESB的企业应用集成与实现 被引量:2
10
作者 赵佳峰 《智能计算机与应用》 2018年第3期140-142,147,共4页
本文分析了某中小企业的实际应用集成需求,并选择基于Mule ESB服务总线作为基础框架设计实现企业应用的集成。根据应用集成平台各应用的运行状态需要监控和管理的需求,本文设计实现了单独的服务监控模块,借助JMX提供的对服务监控管理的... 本文分析了某中小企业的实际应用集成需求,并选择基于Mule ESB服务总线作为基础框架设计实现企业应用的集成。根据应用集成平台各应用的运行状态需要监控和管理的需求,本文设计实现了单独的服务监控模块,借助JMX提供的对服务监控管理的功能以及Mule ESB提供的API接口,将JMX与Mule ESB进行整合,实现了对服务信息的监控和实时展示,包括应用对服务的调用、系统资源占用状态等。按照Mule ESB的内部机制,本文设计开发了一个常见的模块,单点登录功能,将其按照JAX-WS规范封装为Web Service服务,注册在应用集成平台上,为相关的应用提供服务。企业已有的应用可依据此模式将需要开放的功能封装为服务,注册在此平台上。 展开更多
关键词 企业服务总线 mule JMX 服务注册 服务监控 单点登陆
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开源中间件Mule的研究
11
作者 彭政 《科技广场》 2010年第5期17-19,共3页
SOA即面向服务架构,是当前信息集成领域最先进的体系结构,而ESB(企业服务总线)中间件技术是实现SOA架构的一个关键技术。开源社区推出了众多的ESB产品,如:ServiceMix、Mule等,这些开源ESB能很好地实现SOA服务集成,以及实现消息路由、数... SOA即面向服务架构,是当前信息集成领域最先进的体系结构,而ESB(企业服务总线)中间件技术是实现SOA架构的一个关键技术。开源社区推出了众多的ESB产品,如:ServiceMix、Mule等,这些开源ESB能很好地实现SOA服务集成,以及实现消息路由、数据转换等功能。本文重点介绍了开源ESBMule,主要介绍了它的技术架构和工作原理,并提供了相应的简单试验示例。 展开更多
关键词 面向服务架构 企业服务总线 开源中间件mule
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Traditional mule logging method in Hyrcanian Forest: a study of the impact on forest stand and soil
12
作者 Meghdad Jourgholami Baris Majnounian 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2013年第4期755-758,共4页
We inventoried plant regeneration and soil compaction along mule trails to evaluate damage to forest stands and regeneration follow- ing mule hauling before and after operations in Kheyrud Forest in the Hyrcanian Fore... We inventoried plant regeneration and soil compaction along mule trails to evaluate damage to forest stands and regeneration follow- ing mule hauling before and after operations in Kheyrud Forest in the Hyrcanian Forest in northern Iran. About 22% of regenerating plants on mule trails were damaged following mule logging, and damage to trees was observed. In harvested units after timber extraction, 4.3% of the total area (12 ha) was covered with mule trails. Mule passes and slope gradi- ent, and twofold interactions between mule passes x slope gradient had no significant effect on soil bulk density (p 〈 0,05). Mule iogging had a statistically significant effect on soil bulk density along the mule trails before and after mule passes. Soil bulk density increased Significantly as mule passes increased in number. The degree and level of compaction did not differ with trail slope. With respect to damage to residual stands and seedlings, soil compaction and disturbance to soil, traditional mule log- ging is the preferred skidding method in the steep terrain conditions in the Hyrcanian Forest in northern Iran. 展开更多
关键词 mule logging stand damage SEEDLING soil compaction
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基于Mule ESB的IOT系统集成平台
13
作者 韩丽霞 张占营 《电子技术与软件工程》 2020年第16期187-189,共3页
本文在面向服务的体系架构理念下,设计与实现了一个可用于智慧消防系统的集成平台,该平台基于Mule,将服务、硬件、数据集成管理,提供可插拔的Web服务,使得各种功能都以服务的形式提供给最终用户或者其他服务,可扩展性强,而且最大程度的... 本文在面向服务的体系架构理念下,设计与实现了一个可用于智慧消防系统的集成平台,该平台基于Mule,将服务、硬件、数据集成管理,提供可插拔的Web服务,使得各种功能都以服务的形式提供给最终用户或者其他服务,可扩展性强,而且最大程度的减少了系统之间的耦合,提高可重用性,并便捷的共享系统之间的数据。本文首先介绍该平台系统的架构和设计思想以及平台实现的功能。然后,深入分析该系统平台技术的创新性以及对解决实际问题的关键性。 展开更多
关键词 面向服务体系结构 mule ESB
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Mule通过Wnt通路调节肠道干细胞微环境并靶向EphB3的蛋白酶体和溶酶体降解
14
作者 范冲竹 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2124-2124,共1页
E3泛素连接酶Mule通常在人结直肠癌组织中过表达,但其在肠道肿瘤发生中的作用尚不清楚。Dominguez-Brauer等通过体内实验发现,Mule可以通过c-Myc对Wnt信号通路进行调控,从而调节小鼠肠道干细胞和祖细胞的增殖。Mule还可以通过靶向性调... E3泛素连接酶Mule通常在人结直肠癌组织中过表达,但其在肠道肿瘤发生中的作用尚不清楚。Dominguez-Brauer等通过体内实验发现,Mule可以通过c-Myc对Wnt信号通路进行调控,从而调节小鼠肠道干细胞和祖细胞的增殖。Mule还可以通过靶向性调控受体酪氨酸激酶EphB3的蛋白酶体和溶酶体降解来调节其受体蛋白水平。 展开更多
关键词 肠道干细胞 EphB3 mule WNT通路 溶酶体 蛋白酶体 结直肠癌组织 肠道肿瘤 祖细胞 微环境
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On the Imaginary of Mule in Their Eyes Were Watching God
15
作者 李娜 《海外英语》 2011年第7X期236-236,247,共2页
In Their Eyes Were Watching God,Hurston made a sharp contrast to Janie's development and change psychologically through the description of the mule.The imaginary of mule conveys the theme that the oppression the b... In Their Eyes Were Watching God,Hurston made a sharp contrast to Janie's development and change psychologically through the description of the mule.The imaginary of mule conveys the theme that the oppression the black women suffered and the resistance they made represented by Janie. 展开更多
关键词 mule IMAGE PSYCHOLOGY CONTRAST
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Mule车零部件改制方案应用
16
作者 吴焱杰 《汽车实用技术》 2022年第16期65-68,共4页
为加快新产品开发进程,一般在新产品开发初期,通过制作Mule车来实现相关设计方案验证。因零部件还处于数据设计阶段,为实现相关设计方案验证,此时需要通过对相关零部件进行适应性改制以满足Mule车装配。Mule车零部件的改制精度和强度直... 为加快新产品开发进程,一般在新产品开发初期,通过制作Mule车来实现相关设计方案验证。因零部件还处于数据设计阶段,为实现相关设计方案验证,此时需要通过对相关零部件进行适应性改制以满足Mule车装配。Mule车零部件的改制精度和强度直接影响产品设计方案验证有效性。Mule车零部件改制强度和精度主要由结构、材料、工艺、工装等因素决定。文章主要通过对Mule车零部件改制流程、方案设计、结构、工艺及工装进行研究,以实现其精度及强度的保证,从而实现对相关设计方案的验证。 展开更多
关键词 mule 零部件改制 焊接精度 双内衬改制 功能尺寸 改制失效
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陆相含煤盆地油页岩富集特征及对勘探开发的指示意义——以黑龙江省老黑山盆地为例
17
作者 徐银波 方石 +7 位作者 张培震 宋宇 毕彩芹 孙平昌 姚树青 李耀华 孙凡星 唐跃 《地质学报》 北大核心 2025年第8期2848-2863,共16页
我国的小型陆相含煤盆地往往同时发育油页岩,这些共伴生的油页岩资源通常无法单独开发利用,为了促进这类油页岩资源的利用,以黑龙江省老黑山盆地油页岩为例,基于油页岩钻井资料和测试分析,开展了油页岩的富集与分布特征研究,并分析了两... 我国的小型陆相含煤盆地往往同时发育油页岩,这些共伴生的油页岩资源通常无法单独开发利用,为了促进这类油页岩资源的利用,以黑龙江省老黑山盆地油页岩为例,基于油页岩钻井资料和测试分析,开展了油页岩的富集与分布特征研究,并分析了两者对勘探开发的指示意义。研究结果表明,老黑山盆地油页岩有机质丰度高(总有机碳:16.05%~42.05%),为Ⅱ型干酪根,处于未成熟阶段,属于低灰分、高发热量、特低硫、中等品质油页岩,主要组成矿物为黏土矿物(以高岭石为主),主要组成元素为SiO_(2)和Al_(2)O_(3)。油页岩形成于温暖湿润气候背景下贫氧的半咸水环境,低湖泊生产力提供的内源有机质和稳定陆源输入携带的外源有机质共同组成了油页岩形成的物质基础。研究区油页岩主要分布于盆地西部,埋藏深度浅,其厚度和含油率具有中间高四周低的特点。其中老黑山镇—永盛—九佛沟一带为油页岩主要富集区和有利目标区。N7油页岩与全区可采煤层8号煤层伴生发育,为开发有利层位。根据N7油页岩的含油率、厚度和埋深以及8号煤层的厚度进一步将有利目标区划分为Ⅰ~Ⅴ五类,其中Ⅰ类区的8号煤层和N7油页岩层厚度大,埋藏深度浅,油页岩含油率高,为最有利区。研究结果为老黑山盆地油页岩以及与煤伴生油页岩未来的勘探、开发和利用提供了依据。 展开更多
关键词 下白垩统 穆棱组 油页岩 陆相含煤盆地 老黑山盆地
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复合脂肪酸对骡鸭原代肝细胞脂质沉积及AMPK信号通路的影响 被引量:1
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作者 赵婉芯 陈超 +5 位作者 黄彩云 王梦诗 胡映秀 于暄慈 罗儒唐 李昂 《中国家禽》 北大核心 2025年第5期1-9,共9页
试验旨在探究复合脂肪酸对骡鸭原代肝细胞超微结构、脂质沉积、氧化应激及AMPK信号通路相关基因表达的影响。试验使用不同浓度的复合酸(油酸+棕榈酸)进行处理:500μmol/L+250μmol/L、1000μmol/L+500μmol/L、1500μmol/L+750μmol/L和... 试验旨在探究复合脂肪酸对骡鸭原代肝细胞超微结构、脂质沉积、氧化应激及AMPK信号通路相关基因表达的影响。试验使用不同浓度的复合酸(油酸+棕榈酸)进行处理:500μmol/L+250μmol/L、1000μmol/L+500μmol/L、1500μmol/L+750μmol/L和2000μmol/L+1000μmol/L,并持续处理36 h构建原代骡鸭肝细胞脂质沉积模型。结果显示:(1)分离的骡鸭原代肝细胞有丰富糖原颗粒和脂滴的存在。(2)与对照组相比,油酸+棕榈酸浓度为1500μmol/L+750μmol/L时,培养骡鸭原代肝细胞36 h,细胞活力没有显著差异(P>0.05),脂滴数量显著增加(P<0.05)。(3)透射电镜结果显示,复合脂肪酸处理的骡鸭原代肝细胞和线粒体均出现明显水肿,脂滴出现聚合,并且膜和嵴的结构受损。此外,与对照组相比,肝细胞脂滴含量、谷丙转氨酶和谷草转氨酶活性、丙二醛和活性氧水平显著上升(P<0.05)。(4)与对照组相比,复合脂肪酸处理的骡鸭原代肝细胞中AMP活化蛋白激酶(AMPK)、脂蛋白脂肪酶(LPL)和肉碱棕榈转移酶-1A(CPT-1A)mRNA表达量以及AMPK蛋白表达量显著降低(P<0.05),而白细胞分化抗原36(CD36)、乙酰辅酶A羧化酶1(ACC1)mRNA及白细胞分化抗原36(CD36)、胆固醇调节元件结合蛋白1(SREBP1)蛋白表达量显著提高(P<0.05)。因此,油酸+棕榈酸浓度为1500μmol/L+750μmol/L处理骡鸭原代肝细胞36 h能通过调控AMPK信号通路,有效增加肝细胞脂质沉积,但同时易诱导肝细胞氧化应激。 展开更多
关键词 脂肪肝细胞模型 脂质沉积与氧化应激 AMPK信号通路 骡鸭原代肝细胞
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穆棱河上游溶解性有机质的光谱特征及对水质的影响
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作者 熊鑫佩 孟凡生 +4 位作者 王璐 张铃松 秦亚强 梁朱明 董鑫淼 《环境科学与技术》 北大核心 2025年第2期119-127,共9页
为探究黑龙江省穆棱河上游溶解性有机质(DOM)分布特征和对水质的影响,该文通过野外调查和实验室分析,利用荧光参数和平行因子分析(PARAFAC-EEM)解析DOM的组成和来源,利用主成分分析和线性回归分析说明DOM对水质的影响。研究表明:穆棱河... 为探究黑龙江省穆棱河上游溶解性有机质(DOM)分布特征和对水质的影响,该文通过野外调查和实验室分析,利用荧光参数和平行因子分析(PARAFAC-EEM)解析DOM的组成和来源,利用主成分分析和线性回归分析说明DOM对水质的影响。研究表明:穆棱河上游化学需氧量(COD)、高锰酸盐指数、五日生化需氧量(BOD_(5))、溶解性有机碳(DOC)浓度平均为(36.00±14.00)、(14.58±5.68)、(2.45±0.75)、(45.32±36.67)mg/L,总体上,9月丰水期和11月平水期的污染物浓度较1月冰封期和6月平水期高。比吸收系数(SUVA_(254))、腐质化指数(HIX)、荧光指数(FI)、生物指数(BIX)表明,穆棱河上游水体DOM来源为陆源与自生源相结合,且自生源组分较少,腐质化程度和芳香碳含量较高。相较于冰封期,丰水期和秋季平水期在光化学和微生物共同作用下,自生源组分升高。PARAFAC-EEM共提取出3个组分,陆源类腐殖质占比均高于80%,且冰封期占比更高。11个荧光参数的主成分分析共提取出3个主成分,主成分与水质指标间回归方程的建立表明,穆棱河上游水体DOM对水质指标COD、高锰酸盐指数有较为显著的影响。 展开更多
关键词 DOM 荧光特征 平行因子分析 主成分分析 水质指标 穆棱河
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基于转录组测序筛选半番鸭性腺分化候选基因
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作者 杨宇 叶胜强 +5 位作者 翟明丽 李雪莲 童新红 李中心 徐小娟 龚萍 《中国家禽》 北大核心 2025年第5期17-24,共8页
为筛选到更多与禽类性腺分化相关的候选基因,研究收集半番鸭、金定鸭和番鸭在1/2胚胎期雌性和雄性性腺组织样品进行RNA-seq测序,通过转录组测序分析半番鸭和亲本性腺分化过程中SNP、Indel位点以及可变剪接事件,对获取的SNP和InDel位点... 为筛选到更多与禽类性腺分化相关的候选基因,研究收集半番鸭、金定鸭和番鸭在1/2胚胎期雌性和雄性性腺组织样品进行RNA-seq测序,通过转录组测序分析半番鸭和亲本性腺分化过程中SNP、Indel位点以及可变剪接事件,对获取的SNP和InDel位点在外显子(Exonic)、UTR5以及内含子(Intronic)等8种功能元件上的分布进行统计。结果显示:共获得798216036条cleanreads,9471个差异基因(Differentially expressed genes,DEGs)和691个蛋白质网络互作对(Protein-protein interaction,PPI)。突变位点在外显子上发生的比率占整体的21.26%。共筛选出非同义单核苷酸突变(Non-synonymous SNP,nsSNPs)引起的ATP2C2、GTF2A1L和HHIPL2等8个雌性特异表达基因和STK10、GDF7和SLC5A8等6个雄性特异表达基因,Indel位点引起的NTN4、RAB5A、SHPRH等12个雄性特异表达基因。DEGs可变剪接分析显示,半番鸭雌性和雄性比较组发生的差异可变剪接事件最少(17793次)。分析各比较组外显子使用(Exonusage)差异,发现雌雄性腺之间的外显子使用差异数量总体要少于不同鸭种同种性别之间的数量。研究表明,ATP2C2、GTF2A1L、HHIPL2、STK10、GDF7和SLC5A8等基因外显子SNP位点非同义突变以及NTN4、RAB5A、SHPRH等基因外显子Indel位点移码突变在雌雄性腺分化中发挥着重要作用;性腺分化和发育以及半番鸭的不育与DEGs中发生的可变剪接是密不可分的;位于Z染色体上的STARD6、STARD4、SPEF2、HSD17B3和25号染色体HSD17B1基因发生了可变剪接并参与了性腺性别分化等生物学过程。 展开更多
关键词 转录组 番鸭 性别分化 性腺 可变剪接 SNP/Indel
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