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人脑胶质瘤组织中MTERF3的表达及其预后意义 被引量:1
1
作者 林亚茹 刘如爱 +5 位作者 自加吉 普元倩 陈莹 戴莉萍 余敏 熊伟 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第3期443-450,共8页
目的:研究线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)基因在人脑胶质瘤组织中的表达情况,并探讨MTERF3基因表达量与患者临床病理特征及预后的相关性。方法:采用RT-PCR、Western blot和免疫组化SP... 目的:研究线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)基因在人脑胶质瘤组织中的表达情况,并探讨MTERF3基因表达量与患者临床病理特征及预后的相关性。方法:采用RT-PCR、Western blot和免疫组化SP法检测28例人脑胶质瘤组织及10例非肿瘤脑组织中MTERF3mRNA和蛋白质的表达水平。利用R语言软件从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载522例胶质瘤组织及10例非肿瘤脑组织中MTERF3基因mRNA表达量、临床病理参数及预后资料,探讨人脑胶质瘤患者临床病理参数与MTERF3 mRNA表达量之间的联系。采用Kaplan-Meier法分析MTERF3 mRNA表达量与人脑胶质瘤患者累积生存时间(overall survival, OS)和无疾病进展生存时间(disease-free survival, DFS)的关系。采用Cox回归多因素分析探讨影响脑胶质瘤患者预后的因素。采用cBioportal分析脑胶质瘤中MTERF3基因与脑胶质瘤分子标志物基因mRNA表达量的相关性。结果:免疫组织化学结果显示,MTERF3蛋白主要表达于细胞质,人脑胶质瘤中的阳性表达率为64.29%,且在高级别的脑胶质瘤中MTERF3阳性表达率(81.25%)高于其低级别的阳性表达率(41.67%)。RT-PCR和Western blot结果显示,与非瘤脑组织相比,MTERF3 mRNA和蛋白质在不同级别人脑胶质瘤中的表达水平均显著增高,差异有统计学意义(P<0.05)。TCGA数据集分析表明,在脑胶质瘤组织中MTERF3 mRNA的表达水平明显高于非瘤脑组织(P<0.01),且MTERF3 mRNA表达量与病理类型、患者年龄、WHO分级有关(均P<0.05),而与性别、发病部位、样本类型无关。Kaplan-Meier分析发现,MTERF3高表达患者的OS和DFS均显著低于MTERF3低表达的患者(Log-rank P<0.01)。Cox多因素分析表明,患者年龄和病理类型均是导致脑胶质瘤患者预后不良的独立影响因素(均P<0.05)。脑胶质瘤中MTERF3基因与IDH1、 TP53、MKI67基因mRNA的表达量呈显著正相关性(均P<0.01,r>0),而与PTEN、RBFOX3、BRAF基因mRNA的表达量呈显著负相关性(均P<0.01,r<0)。结论:MTERF3蛋白在人脑胶质瘤中的表达增高,且与恶性程度及其预后相关,提示其可成为胶质瘤患者临床治疗和预后判断的潜在靶点。 展开更多
关键词 线粒体转录终止因子3 脑胶质瘤 免疫组化 TCGA数据集 预后意义
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基于ONCOMINE和TCGA数据库分析人MTERF3在子宫颈癌中的表达及预后意义 被引量:10
2
作者 梅雯 自加吉 +4 位作者 孙美涛 杨勇琴 张晓娟 余敏 熊伟 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2018年第1期43-47,共5页
为了探讨人线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)在子宫颈癌中的表达及预后意义,检索ONCOMINE数据库中关于人MTERF3的信息,并对目前数据库中资料进行2次分析,对人MTERF3在子宫颈癌中转录水平... 为了探讨人线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)在子宫颈癌中的表达及预后意义,检索ONCOMINE数据库中关于人MTERF3的信息,并对目前数据库中资料进行2次分析,对人MTERF3在子宫颈癌中转录水平的表达进行荟萃分析ONCOMINE数据库中共收集了344个不同类型的研究结果。关于MTERF3表达有统计学差异的研究结果总计20项,其中MTERF3表达显著性增高的研究有19项,表达降低的显著性研究有1项(P<0.05)。数据库中共有10个不同的研究涉及MTERF3在子宫颈癌组织中和正常组织中的表达,包括310例临床样本,与对照组相比,MTERF3在子宫颈癌中高表达,且差异具有统计学意义(P=0.036)。通过c Bioportal工具分析TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中的研究发现,MTERF3高表达的子宫颈癌患者与MTERF3低表达的子宫颈癌患者的总生存率(OS)和无病生存率(DFS)均无显著相关性(P>0.05)。通过数据挖掘,揭示人MTERF3在子宫颈癌组织中高表达,但其表达水平与子宫颈癌的预后无明显关联。 展开更多
关键词 mterf3 子宫颈癌 ONCOMINE 数据库
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基于数据挖掘分析MTERF3基因在肝细胞癌的表达及预后意义 被引量:3
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作者 自加吉 李彬 +4 位作者 王唯斯 孙美涛 梅雯 严长宝 熊伟 《生物技术》 CAS 2018年第5期484-491,共8页
[目的]线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)是线粒体基因复制和转录的负调控因子,但目前尚未见其在肝细胞癌中的系统研究。该研究基于数据挖掘分析MTERF3基因在肝细胞癌(hepatocellular carc... [目的]线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)是线粒体基因复制和转录的负调控因子,但目前尚未见其在肝细胞癌中的系统研究。该研究基于数据挖掘分析MTERF3基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)及正常肝组织中的表达情况,并进一步探讨MTERF3基因对肝细胞癌患者预后的影响。[方法]利用Oncomine数据库分析MTERF3基因mRNA在正常肝组织和肝细胞癌组织中的表达变化。通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)人体正常组织和其相应的肿瘤组织中MTERF3基因的表达差异。通过c Bioportal分析MTERF3基因在肝细胞癌组织中的突变情况。经MethHC数据库分析肝细胞癌和正常肝组织中MTERF3基因DNA启动子区甲基化水平的差异。利用Onco Lnc数据库对MTERF3基因的表达水平与肝细胞癌患者生存率作Kaplan-Meier生存分析和Log-rank检验。在String-DB数据库中探索在线粒体DNA表达调控过程中与MTERF3基因关系密切的相关基因。[结果]与正常肝组织相比,肝细胞癌组织中MTERF3基因在mRNA水平呈显著高表达(P≤0. 05),MTERF3基因DNA启动子区甲基化水平显著降低(P≤0. 05)。肝细胞癌组织中MTERF3基因存在错义突变,导致其编码蛋白质的243位甲硫氨酸突变为缬氨酸(M243V)。MTERF3基因的表达水平与肝细胞癌患者的总生存时间存在相关性(Logrank P≤0. 05),MTERF3基因高表达的肝细胞癌患者总生存时间显著缩短。MFN1、MFN2、VDAC1、ATG12、UBA52、UBB、UBC、PINK1、SQSTM1、RPS27A等基因与MTERF3基因有明显的相互作用。[结论]大样本数据挖掘能迅速地获取肝细胞癌组织中MTERF3基因表达的相关信息,为深入研究MTERF3基因在肝细胞癌发生发展中的作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 肝细胞癌 mterf3 数据挖掘 预后
原文传递
利用Oncomine和TCGA数据集分析MTERF3在大肠腺癌的表达及预后作用 被引量:7
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作者 梅雯 孙美涛 +4 位作者 王唯斯 张态 柴蓓蓓 张若鹏 熊伟 《齐齐哈尔医学院学报》 2018年第8期869-873,共5页
目的基于数据挖掘探讨人线粒体转录终止因子3在正常肠组织和大肠腺癌中的表达水平,并探讨MTERF3 mRNA表达量与大肠腺癌患者临床病理参数的相关性及其预后作用。方法从Oncomine基因芯片数据库和美国癌症基因组图谱中下载关于大肠腺癌患者... 目的基于数据挖掘探讨人线粒体转录终止因子3在正常肠组织和大肠腺癌中的表达水平,并探讨MTERF3 mRNA表达量与大肠腺癌患者临床病理参数的相关性及其预后作用。方法从Oncomine基因芯片数据库和美国癌症基因组图谱中下载关于大肠腺癌患者MTERF3 mRNA二代测序数据及临床病理资料,使用R 3.3.0软件分析MTERF3表达量与临床病理参数的相关性及其预后价值。结果Oncomine数据库中共收集了344个不同类型的肿瘤研究结果,关于MTERF3表达有统计学差异的研究结果共20项,其中MTERF3高表达的研究有19项,低表达的研究有1项(P<0.05)。数据库中共有7个不同的研究涉及MTERF3在大肠腺癌组织中和正常大肠组织中的表达,与正常肠组织相比,MTERF3在大肠腺癌中呈高表达,且差异具有统计学意义(P=1.56×10^(-23))。分析发现,349例大肠腺癌患者MTERF3表达水平与年龄、性别、肿瘤部位、浸润深度、淋巴转移、远处转移无关(P>0.05),与病理类型相关(P<0.05);Kaplan-Meier分析发现,大肠腺癌患者MTERF3的表达水平与总生存率(OS)和无病生存率(DFS)均无显著相关性(P>0.05)。结论人MTERF3在大肠腺癌组织中高表达,但MTERF3 mRNA表达量与大肠腺癌患者的预后无显著的相关性。 展开更多
关键词 mterf3 大肠腺癌 Oncomine TCGA
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利用TCGA数据集分析人MTERF3基因在子宫颈癌的表达及意义 被引量:2
5
作者 梅雯 王唯斯 +4 位作者 孙美涛 张态 柴蓓蓓 张若鹏 熊伟 《大理大学学报》 CAS 2019年第2期38-43,共6页
目的:基于TCGA数据集探讨人MTERF3基因mRNA在子宫颈癌的表达及其临床价值。方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载关于子宫颈癌患者MTERF3 mRNA二代测序数据及临床病理资料。基因表达谱动态分析(GEPIA)正常宫颈组织和宫颈癌组织中MTERF... 目的:基于TCGA数据集探讨人MTERF3基因mRNA在子宫颈癌的表达及其临床价值。方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载关于子宫颈癌患者MTERF3 mRNA二代测序数据及临床病理资料。基因表达谱动态分析(GEPIA)正常宫颈组织和宫颈癌组织中MTERF3 mRNA表达差异。使用R 3.3.0软件分析MTERF3 mRNA表达量与临床病理参数的相关性;使用生存分析和Log-rank P检验。结果:与正常宫颈组织相比,子宫颈癌组织中MTERF3 mRNA呈现高表达。子宫颈癌患者MTERF3 mRNA表达量与年龄、T分期、N分期、M分期差异均无统计学意义(P>0.05);而与AJCC临床分期、病理分级差异有统计学意义(P<0.05);Kaplan-Meier生存分析显示,MTERF3 mRNA0.05);单因素分析显示,T分期、N分期、M分期、临床分期均能影响患者的预后(P<0.05),年龄、病理分级、病理类型、MTERF3mRNA表达与子宫颈癌患者预后无相关性(P>0.05);COX多因素回归分析显示,N分期是影响子宫颈癌患者预后的独立因素(P<0.05)。结论:人MTERF3 mRNA表达量与子宫颈癌患者AJCC临床分期和病理分级有显著相关性,提示MTERF3基因可能参与子宫颈癌发展的病理进程;MTERF3 mRNA表达量与子宫颈癌患者的预后无显著相关性。 展开更多
关键词 TCGA数据集 mterf3 子宫颈癌
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MTERF3过表达对脑胶质瘤U251细胞线粒体基因表达及细胞增殖和迁移的影响 被引量:6
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作者 孙美涛 梅雯 +4 位作者 王唯斯 李素芬 自加吉 张晓娟 熊伟 《实用医药杂志》 2019年第5期454-459,共6页
目的探讨MTERF3基因过表达对脑胶质瘤U251细胞线粒体基因表达及细胞增殖和迁移的影响。方法以U251细胞作为实验对象,构建MTERF3过表达的U251细胞稳定转染株。实验分为3组:空白对照组(无转染的野生型U251细胞)、阴性对照组(转染EGFP-Fla... 目的探讨MTERF3基因过表达对脑胶质瘤U251细胞线粒体基因表达及细胞增殖和迁移的影响。方法以U251细胞作为实验对象,构建MTERF3过表达的U251细胞稳定转染株。实验分为3组:空白对照组(无转染的野生型U251细胞)、阴性对照组(转染EGFP-Flag质粒的U251细胞)、实验组(转染MTERF3-Flag质粒的U251细胞)。采用半定量PCR和Western blot分别检测MTERF3过表达对U251细胞线粒体DNA拷贝量及线粒体编码蛋白的表达水平的影响;采用流式细胞术和XTT法分别检测MTERF3过表达对U251细胞周期及细胞增殖的影响;采用细胞划痕和Transwell小室迁移实验检测U251细胞迁移能力的变化。结果半定量PCR结果显示,与对照组比较,MTERF3过表达显著抑制U251细胞线粒体DNA的拷贝量(P<0.05);Western blot结果显示,与对照组比较,MTERF3过表达显著降低线粒体DNA编码ND1、ND6和CYB蛋白表达水平(P<0.05);XTT结果显示,与对照组比较,MTERF3过表达明显促进U251细胞的增殖(P<0.05);流式细胞术结果显示,与对照组比较,MTERF3过表达能促进U251细胞G1/S转换,未出现细胞周期阻滞和细胞凋亡。Transwell小室迁移实验结果显示,实验组在每个视野下迁移的细胞数[(435.00±42.26)个]显著多于空白对照组[(259.00±30.22)个]和阴性对照组[(252.00±27.58)个],组间差异极显著(P<0.01)。结论 MTERF3过表达对人脑胶质瘤U251细胞的线粒体DNA拷贝量和线粒体蛋白质表达有负调控作用,且上调U251细胞MTERF3的表达使细胞增殖和迁移能力显著提高,并且未出现细胞周期阻滞和细胞凋亡。 展开更多
关键词 脑胶质瘤 U251细胞 mterf3 细胞增殖 细胞迁移
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人MTERF3基因启动子的克隆及其荧光素酶报告基因载体的构建
7
作者 张晓娟 孙美涛 +3 位作者 梅雯 自加吉 杨勇琴 熊伟 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2017年第1期40-44,共5页
人MTERF3基因编码线粒体基因转录和能量代谢的负调控因子。采用PCR技术对人MTERF3基因5'侧翼上游1251 bp启动子序列进行扩增,并将其克隆至荧光素酶表达载体p GL6-TA,构建人MTERF3基因启动子荧光素酶报告基因质粒。经酶切、测序鉴定... 人MTERF3基因编码线粒体基因转录和能量代谢的负调控因子。采用PCR技术对人MTERF3基因5'侧翼上游1251 bp启动子序列进行扩增,并将其克隆至荧光素酶表达载体p GL6-TA,构建人MTERF3基因启动子荧光素酶报告基因质粒。经酶切、测序鉴定后,将其用脂质体转染体外培养的HEK293细胞株,利用双荧光素酶测定系统检测其表达活性。研究结果表明,克隆获得的1251 bp DNA序列与Gen Bank报道的一致,且插入方向正确。含人MTERF3基因启动子的报告基因荧光素酶的表达活性显著提高(P<0.05),约为对照组(空载体p GL6-TA)的9.8倍。本研究通过对人MTERF3基因启动子的克隆及其荧光素酶表达载体构建与表达活性的测定,为进一步阐明人MTERF3基因表达的调控机制奠定实验基础。 展开更多
关键词 mterf3 启动子 报告基因 荧光素酶 载体
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hMTERF3基因在卵巢癌组织的表达及其对预后的影响 被引量:4
8
作者 熊伟 杨勇琴 +4 位作者 李彬 梅雯 严长宝 戴莉萍 余敏 《实用医药杂志》 2018年第5期428-433,439,共7页
目的探究人线粒体转录终止因子3(human mitochondrial transcription termination factor 3,hMTERF3)在正常卵巢上皮组织和卵巢癌组织中的表达水平及其与卵巢癌患者预后的关系。方法利用Oncomine基因芯片数据库中关于hMTERF3的信息,对... 目的探究人线粒体转录终止因子3(human mitochondrial transcription termination factor 3,hMTERF3)在正常卵巢上皮组织和卵巢癌组织中的表达水平及其与卵巢癌患者预后的关系。方法利用Oncomine基因芯片数据库中关于hMTERF3的信息,对比分析正常卵巢上皮组织和卵巢癌组织中hMTERF3基因转录水平的表达数据;提取30例配对卵巢癌组织和正常卵巢上皮组织总蛋白质,Western blot检测hMTERF3蛋白在各组织中的表达水平;利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析hMTERF3表达对卵巢癌患者预后的影响。结果 Oncomine数据库中共收集了756个不同类型的研究结果,其中关于hMTERF3表达有统计学差异的研究结果有104个,hMTERF3表达增高的研究有76个,表达降低的研究仅有28个。共有11项研究涉及hMTERF3在卵巢癌组织和正常卵巢上皮组织中的表达,包括995例临床样本,与对照组相比,hMTERF3在卵巢癌组织中高表达,且差异具有统计学意义(P=0.020)。提取30对卵巢癌及其配对的正常卵巢上皮组织总蛋白质,Western blot检测发现,其中28例(93.33%)卵巢癌组织中hMTERF3蛋白表达水平显著增高(P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库分析发现,hMTERF3的转录水平表达量与卵巢癌患者生存期存在显著相关性,无论是无进展生存期(PFS)或总生存期(OS),hMTERF3 m RNA表达量越高,患者的总体生存期越差(HR>1.0,P<0.05)。结论通过整合Oncomine基因芯片数据和临床试验检测数据,提示hMTERF3基因在卵巢癌组织中高表达,且与卵巢癌患者的预后不良具有显著的相关性,hMTERF3基因有可能成为卵巢癌预后判断和抗肿瘤药物开发的潜在靶点。 展开更多
关键词 人线粒体转录终止因子3 卵巢癌 Oncomine数据库 数据挖掘 预后
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hMTERF3基因真核表达载体的构建与鉴定
9
作者 孙美涛 梅雯 +4 位作者 杨泽芳 丁小倩 张若鹏 张晓娟 熊伟 《大理大学学报》 CAS 2017年第8期18-22,共5页
目的:构建和鉴定带3×Flag标签的人线粒体转录终止因子3基因(hMTERF3)真核表达载体。方法:根据NCBI数据库中hMTERF3基因序列设计引物,采用聚合酶链式反应从pGEM-hMTERF3重组克隆载体中扩增出hMTERF3基因开放阅读框序列,经HindⅢ和Ba... 目的:构建和鉴定带3×Flag标签的人线粒体转录终止因子3基因(hMTERF3)真核表达载体。方法:根据NCBI数据库中hMTERF3基因序列设计引物,采用聚合酶链式反应从pGEM-hMTERF3重组克隆载体中扩增出hMTERF3基因开放阅读框序列,经HindⅢ和Bam HⅠ双酶切后,连接入真核表达载体p3×FLAG-CMV-14的多克隆位点中,构建重组质粒p3×FLAGCMV-hMTERF3,分别用菌落PCR、限制性核酸内切酶分析和DNA序列分析3种方法鉴定重组子。结果:重组质粒p3×FLAGCMV-hMTERF3经双酶切鉴定和菌落PCR鉴定均获得大小为1 254 bp的目的条带,DNA序列分析和Blast序列比对结果表明该序列与Gen Bank中hMTERF3基因序列的同源性达到100%,插入基因的大小和方向均正确。结论:成功构建了hMTERF3基因的真核表达载体,为进一步研究hMTERF3基因在恶性肿瘤发生发展中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 人线粒体转录终止因子3 真核表达载体 鉴定
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人线粒体转录终止因子3基因RNA干扰表达载体的构建筛选与干扰效果评价 被引量:1
10
作者 梅雯 孙美涛 +4 位作者 自加吉 王唯斯 杨勇琴 余敏 熊伟 《生物技术通讯》 CAS 2018年第1期64-70,共7页
目的:构建人线粒体转录终止因子3(MTERF3)基因的短发夹RNA(shRNA)干扰表达载体,并在mRNA和蛋白质水平对其干扰效率进行验证,以检测和筛选出干扰效率最优的shRNA表达载体。方法:根据人MTERF3基因全长cDNA序列,利用Oligoengine在线软件设... 目的:构建人线粒体转录终止因子3(MTERF3)基因的短发夹RNA(shRNA)干扰表达载体,并在mRNA和蛋白质水平对其干扰效率进行验证,以检测和筛选出干扰效率最优的shRNA表达载体。方法:根据人MTERF3基因全长cDNA序列,利用Oligoengine在线软件设计4个shRNA序列,合成4条互补寡核苷酸链,退火成双链后克隆至psiU6.1载体,得到4个重组干扰质粒psi-MTERF3-1~psi-MTERF3-4,并通过PCR和DNA测序对其进行鉴定;将重组干扰质粒利用脂质体介导瞬时转染He La细胞,转染48 h后采用real time RT-PCR检测4个干扰质粒对MTERF3 mRNA表达水平的影响,采用Western印迹检测其对MTERF3蛋白表达水平的情况,并筛选出最有效的shRNA干扰质粒。结果:PCR鉴定和DNA测序鉴定证实重组质粒中已插入目的DNA序列;real time RT-PCR和Western印迹结果表明4个重组载体均可以显著降低人MTERF3基因mRNA和蛋白质的表达水平(P<0.05),其中以pSi-MTERF3-4的干扰效率最优,对MTERF3 mRNA表达的抑制率为70.1%,对MTERF3蛋白表达的抑制率为72.2%。结论:在人宫颈癌He La细胞系筛选出有效干扰MTERF3基因表达的shRNA序列,构建了针对MTERF3基因的RNA干扰真核表达载体且能够有效抑制目的基因的表达,为进一步研究人MTERF3在宫颈癌发生发展中的作用机制提供了实验基础。 展开更多
关键词 RNA干扰 线粒体转录终止因子3 载体构建 HELA细胞
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