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紫花苜蓿MsNAP基因克隆及烟草转化
被引量:
22
1
作者
晁跃辉
李珊珊
+4 位作者
滕珂
许立新
肖国增
郭涛
韩烈保
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2016年第2期13-19,共7页
NAP转录因子是植物体内特有的转录因子,在调控植物生长发育、衰老速度以及响应生物、非生物胁迫等方面有重要作用。采用RT-PCR方法克隆紫花苜蓿NAP转录因子基因,将其命名为MsNAP(GenBank登录号:KM211498.1),MsNAP编码区长822bp,编码274...
NAP转录因子是植物体内特有的转录因子,在调控植物生长发育、衰老速度以及响应生物、非生物胁迫等方面有重要作用。采用RT-PCR方法克隆紫花苜蓿NAP转录因子基因,将其命名为MsNAP(GenBank登录号:KM211498.1),MsNAP编码区长822bp,编码274个氨基酸。生物信息学分析显示:其与其他物种NAP蛋白具有较高的同源性,与蒺藜苜蓿同源性最高。荧光定量技术分析结果显示:MsNAP基因在花中表达量最高,衰老叶片中的表达水平远远高于未衰老叶片。利用DNA重组技术将MsNAP基因完整编码区连接至植物表达载体pBI121,成功构建植物表达载体pBI-MsNAP,通过农杆菌介导方法转化烟草,PCR和RT-PCR检测结果显示,成功获得了转MsNAP基因的转基因烟草,初步证明在转基因烟草中外源基因MsNAP能够转录表达,为研究MsNAP基因功能奠定了基础。
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关键词
紫花苜蓿
msnap
基因
烟草
转基因
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职称材料
紫花苜蓿MsNAP启动子克隆及转基因分析
2
作者
穆致远
谢利娟
+3 位作者
郭涛
袁建波
李殷睿智
晁跃辉
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第20期6688-6694,共7页
启动子位于基因上游,起着调控基因转录的作用,是研究基因表达特征和功能的重要元件。为了研究MsNAP启动子活性,探究MsNAP基因功能,进而研究高产优质的紫花苜蓿,造福畜牧业,本试验利用染色体步移法,成功获得了紫花苜蓿MsNAP基因翻译起始...
启动子位于基因上游,起着调控基因转录的作用,是研究基因表达特征和功能的重要元件。为了研究MsNAP启动子活性,探究MsNAP基因功能,进而研究高产优质的紫花苜蓿,造福畜牧业,本试验利用染色体步移法,成功获得了紫花苜蓿MsNAP基因翻译起始位点上游1 390 bp序列,通过生物信息学分析,发现该区域存在一个完整的启动子,含有多种顺式作用元件。利用DNA重组技术,成功构建了MsNAP启动子表达载体,通过农杆菌介导技术成功转入到烟草中。选取衰老与未衰老的烟草叶片,进行葡萄糖苷酸酶(glucuronidase, GUS)染色分析,结果显示,在衰老叶片中GUS活性远远高于未衰老叶片,表明MsNAP启动子在衰老的叶片中具有较高的转录调控活性,从而为深入研究MsNAP启动子活性和分析MsNAP基因的功能提供了基础。
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关键词
msnap
启动子
紫花苜蓿
衰老
转基因
原文传递
高能效CNN加速器设计
3
作者
喇超
李淼
+1 位作者
张峰
张翠婷
《计算机科学与探索》
北大核心
2025年第9期2520-2531,共12页
当前,卷积神经网络(CNN)被广泛应用于图片分类、目标检测与识别以及自然语言理解等领域。随着卷积神经网络的复杂度和规模不断增加,对硬件部署带来了极大的挑战,尤其是面对嵌入式应用领域的低功耗、低时延需求,大多数现有平台存在高功...
当前,卷积神经网络(CNN)被广泛应用于图片分类、目标检测与识别以及自然语言理解等领域。随着卷积神经网络的复杂度和规模不断增加,对硬件部署带来了极大的挑战,尤其是面对嵌入式应用领域的低功耗、低时延需求,大多数现有平台存在高功耗、控制复杂的问题。为此,以优化加速器能效为目标,对决定系统能效的关键因素进行分析,以缩放计算精度和降低系统频率为主要出发点,研究极低比特下全网络统一量化方法,设计一种高能效CNN加速器MSNAP。该加速器以1比特权重和4比特激活值的轻量化计算单元为基础,构建了128×128空间并行加速阵列结构,由于空间并行度高,整个系统采用低运行频率。同时,采用权重固定、特征图广播的数据传播方式,有效减少权重、特征图的数据搬移次数,达到降低功耗、提高系统能效比的目的。通过22 nm工艺流片验证,结果表明,在20 MHz频率下,峰值算力达到10.54 TOPS,能效比达到64.317 TOPS/W,相较同类型加速器在采用CIFAR-10数据集的分类网络中,该加速器能效比有5倍的提升。部署的目标检测网络YOLO能够达到60 FPS的检测速率,完全满足嵌入式应用需求。
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关键词
加速器
卷积神经网络(CNN)
轻量化神经元计算单元(NCU)
msnap
分支卷积量化(BCQ)
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职称材料
紫花苜蓿NAP转录因子植物表达载体构建及转化
被引量:
5
4
作者
袁建波
李俊
+2 位作者
刘凤歧
韩烈保
晁跃辉
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2017年第3期103-108,共6页
采用PCR技术在紫花苜蓿中克隆MsNAP基因,构建3302Y-MsNAP植物表达载体,并通过农杆菌介导技术转入到紫花苜蓿中,PCR和RT-PCR检测显示,共获得了10株MsNAP转基因紫花苜蓿植株,为研究MsNAP基因功能提供了基础材料。
关键词
NAC转录因子
msnap
基因
紫花苜蓿
植物表达载体
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职称材料
题名
紫花苜蓿MsNAP基因克隆及烟草转化
被引量:
22
1
作者
晁跃辉
李珊珊
滕珂
许立新
肖国增
郭涛
韩烈保
机构
北京林业大学林学院草坪研究所
出处
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2016年第2期13-19,共7页
基金
奥林高尔夫教育与研究基金项目"高尔夫球场草坪锈病的病原鉴定及微生物防治"(AL2015003)
中国林学会-青年人才托举工程项目资助
文摘
NAP转录因子是植物体内特有的转录因子,在调控植物生长发育、衰老速度以及响应生物、非生物胁迫等方面有重要作用。采用RT-PCR方法克隆紫花苜蓿NAP转录因子基因,将其命名为MsNAP(GenBank登录号:KM211498.1),MsNAP编码区长822bp,编码274个氨基酸。生物信息学分析显示:其与其他物种NAP蛋白具有较高的同源性,与蒺藜苜蓿同源性最高。荧光定量技术分析结果显示:MsNAP基因在花中表达量最高,衰老叶片中的表达水平远远高于未衰老叶片。利用DNA重组技术将MsNAP基因完整编码区连接至植物表达载体pBI121,成功构建植物表达载体pBI-MsNAP,通过农杆菌介导方法转化烟草,PCR和RT-PCR检测结果显示,成功获得了转MsNAP基因的转基因烟草,初步证明在转基因烟草中外源基因MsNAP能够转录表达,为研究MsNAP基因功能奠定了基础。
关键词
紫花苜蓿
msnap
基因
烟草
转基因
Keywords
Alfalfa
msnap
gene
Tobacco
Transgene
分类号
S541.1 [农业科学—作物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
在线阅读
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职称材料
题名
紫花苜蓿MsNAP启动子克隆及转基因分析
2
作者
穆致远
谢利娟
郭涛
袁建波
李殷睿智
晁跃辉
机构
北京林业大学林学院草坪研究所
深圳职业技术学院应用化学与生物技术学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第20期6688-6694,共7页
基金
北京林业大学科技创新计划项目(2017ZY16)
深圳市科技计划项目(JCYJ20160331151245672)共同资助
文摘
启动子位于基因上游,起着调控基因转录的作用,是研究基因表达特征和功能的重要元件。为了研究MsNAP启动子活性,探究MsNAP基因功能,进而研究高产优质的紫花苜蓿,造福畜牧业,本试验利用染色体步移法,成功获得了紫花苜蓿MsNAP基因翻译起始位点上游1 390 bp序列,通过生物信息学分析,发现该区域存在一个完整的启动子,含有多种顺式作用元件。利用DNA重组技术,成功构建了MsNAP启动子表达载体,通过农杆菌介导技术成功转入到烟草中。选取衰老与未衰老的烟草叶片,进行葡萄糖苷酸酶(glucuronidase, GUS)染色分析,结果显示,在衰老叶片中GUS活性远远高于未衰老叶片,表明MsNAP启动子在衰老的叶片中具有较高的转录调控活性,从而为深入研究MsNAP启动子活性和分析MsNAP基因的功能提供了基础。
关键词
msnap
启动子
紫花苜蓿
衰老
转基因
Keywords
msnap
Promoter
Medicago sativa
Senescence
Transgene
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S541.9 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
高能效CNN加速器设计
3
作者
喇超
李淼
张峰
张翠婷
机构
北京中科格励微科技有限公司
中国科学院自动化研究所国家专用集成电路设计工程技术研究中心
出处
《计算机科学与探索》
北大核心
2025年第9期2520-2531,共12页
文摘
当前,卷积神经网络(CNN)被广泛应用于图片分类、目标检测与识别以及自然语言理解等领域。随着卷积神经网络的复杂度和规模不断增加,对硬件部署带来了极大的挑战,尤其是面对嵌入式应用领域的低功耗、低时延需求,大多数现有平台存在高功耗、控制复杂的问题。为此,以优化加速器能效为目标,对决定系统能效的关键因素进行分析,以缩放计算精度和降低系统频率为主要出发点,研究极低比特下全网络统一量化方法,设计一种高能效CNN加速器MSNAP。该加速器以1比特权重和4比特激活值的轻量化计算单元为基础,构建了128×128空间并行加速阵列结构,由于空间并行度高,整个系统采用低运行频率。同时,采用权重固定、特征图广播的数据传播方式,有效减少权重、特征图的数据搬移次数,达到降低功耗、提高系统能效比的目的。通过22 nm工艺流片验证,结果表明,在20 MHz频率下,峰值算力达到10.54 TOPS,能效比达到64.317 TOPS/W,相较同类型加速器在采用CIFAR-10数据集的分类网络中,该加速器能效比有5倍的提升。部署的目标检测网络YOLO能够达到60 FPS的检测速率,完全满足嵌入式应用需求。
关键词
加速器
卷积神经网络(CNN)
轻量化神经元计算单元(NCU)
msnap
分支卷积量化(BCQ)
Keywords
accelerator
convolutional neural network(CNN)
lightweight computation neuron(NCU)
modified simple neural acceleration processor(
msnap
)
branch convolution quantization(BCQ)
分类号
TP183 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
TN492 [电子电信—微电子学与固体电子学]
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职称材料
题名
紫花苜蓿NAP转录因子植物表达载体构建及转化
被引量:
5
4
作者
袁建波
李俊
刘凤歧
韩烈保
晁跃辉
机构
北京林业大学林学院草坪研究所
中国农业科学院草原研究所
黑龙江省农业科学院草业研究所
出处
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2017年第3期103-108,共6页
基金
深圳市科技计划项目(JSGG20160229155434792和JCYJ20160331151245672)
文摘
采用PCR技术在紫花苜蓿中克隆MsNAP基因,构建3302Y-MsNAP植物表达载体,并通过农杆菌介导技术转入到紫花苜蓿中,PCR和RT-PCR检测显示,共获得了10株MsNAP转基因紫花苜蓿植株,为研究MsNAP基因功能提供了基础材料。
关键词
NAC转录因子
msnap
基因
紫花苜蓿
植物表达载体
Keywords
NAC transcription
msnap
gene
alfalfa
plant expression vector
分类号
S541.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
紫花苜蓿MsNAP基因克隆及烟草转化
晁跃辉
李珊珊
滕珂
许立新
肖国增
郭涛
韩烈保
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2016
22
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
紫花苜蓿MsNAP启动子克隆及转基因分析
穆致远
谢利娟
郭涛
袁建波
李殷睿智
晁跃辉
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
原文传递
3
高能效CNN加速器设计
喇超
李淼
张峰
张翠婷
《计算机科学与探索》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
紫花苜蓿NAP转录因子植物表达载体构建及转化
袁建波
李俊
刘凤歧
韩烈保
晁跃辉
《中国草地学报》
CSCD
北大核心
2017
5
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职称材料
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