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MOPAC的输入文件格式及其输入输出文件管理系统的开发
1
作者 刘祥 《安徽工业大学学报(自然科学版)》 CAS 2001年第3期239-241,共3页
简介了广为使用的计算化学程序 MOPAC的输入文件格式及其产生文件的种类,用事例阐述了 MOPAC输入文件中各部分代码的含义。指出并纠正了著名的 ChemOffice中的组件 Chem3D在图形显示方面的错误,从使用的方便性和实用性方面考虑,开发... 简介了广为使用的计算化学程序 MOPAC的输入文件格式及其产生文件的种类,用事例阐述了 MOPAC输入文件中各部分代码的含义。指出并纠正了著名的 ChemOffice中的组件 Chem3D在图形显示方面的错误,从使用的方便性和实用性方面考虑,开发了一个 MOPAC输入输出文件管理系统,提高了工作效率和计算结果的可靠性。 展开更多
关键词 mopac 输入文件格式 输入输出文件管理系统 ChemOffice Chem3D
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MOPAC及Gaussian94输出文件管理程序的设计 被引量:1
2
作者 刘祥 《太原理工大学学报》 CAS 2001年第3期299-300,304,共3页
利用计算化学程序 MOPAC、Gaussian94的输出文件自动产生空间构型优化以后的MOP文件和 MOL文件 ,再利用一些免费的共享软件使优化后的化学结构可视化。同时 ,指出并纠正了著名的 Chem Office中的组件 Chem3D在图形显示方面的错误 ,从使... 利用计算化学程序 MOPAC、Gaussian94的输出文件自动产生空间构型优化以后的MOP文件和 MOL文件 ,再利用一些免费的共享软件使优化后的化学结构可视化。同时 ,指出并纠正了著名的 Chem Office中的组件 Chem3D在图形显示方面的错误 ,从使用的实用性和方便性方面考虑 ,开发了一个它们的输入输出文件管理系统 。 展开更多
关键词 mopac Gaussian94 文件格式 计算化学 Chem3D 程序设计
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NMR titration and molecular model MOPAC calculation of protonation processes of two MRI ligands
3
作者 张善荣 李欣宇 +1 位作者 刘卫东 裴奉奎 《Chinese Journal of Chemistry》 SCIE CAS CSCD 1998年第4期330-335,共6页
The protonation process of two DTPA bis(amide) derivatives, DTPA-BDMA and DTPA-BDEA, was studied by using 1H NMR titration and MOPAC calculation. Their protonation process was proposed in the order of the central amin... The protonation process of two DTPA bis(amide) derivatives, DTPA-BDMA and DTPA-BDEA, was studied by using 1H NMR titration and MOPAC calculation. Their protonation process was proposed in the order of the central amine, the terminal amines, the central carboxyl, the terminal carboxyl, the other terminal carboxyl and central amine. During the protonation of the terminal amine, them existed a large fraction of proton transfer from the central amine to the other terminal amine. 展开更多
关键词 DTPA-BDMA DTPA-BDEA protonation process NMR and mopac
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金表面不同链长烷基硫醇自组装单分子膜表面电势的变化规律 被引量:3
4
作者 高源 徐国华 安越 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第8期2211-2216,共6页
从Helmholtz模型出发,对生长在金表面不同链长烷基硫醇自组装单分子膜(SAM)表面电势的变化规律进行了理论研究.利用量子化学软件Gaussian03和MOPAC,讨论了分子偶极矩、相对介电常数以及分子的倾斜角对SAM表面电势的影响.研究表明,不同... 从Helmholtz模型出发,对生长在金表面不同链长烷基硫醇自组装单分子膜(SAM)表面电势的变化规律进行了理论研究.利用量子化学软件Gaussian03和MOPAC,讨论了分子偶极矩、相对介电常数以及分子的倾斜角对SAM表面电势的影响.研究表明,不同链长烷基硫醇SAM中分子的倾斜角随烷基链长度的规律性变化是引起SAM表面电势变化的主要原因.从SAM形成机制出发,对金表面不同链长烷基硫醇SAM表面电势的变化规律及其成因提出了新的解释. 展开更多
关键词 烷基硫醇 SAM 表面电势 GAUSSIAN03 mopac
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5,6-O-苯亚甲基-L-抗坏血酸和5,6-O-苯亚甲基-D-异抗坏血酸的合成 被引量:2
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作者 郑大贵 余衍文 +1 位作者 肖竹平 余明辉 《化学试剂》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期1-4,共4页
采用N,N-二甲基乙酰胺(DMAc)为溶剂、对甲苯磺酸(TsOH)为催化剂、环己烷为带水剂,苯甲醛与L-抗坏血酸反应生成(顺)-5,6-O-苯亚甲基-L-抗坏血酸和(反)-5,6-O-苯亚甲基-L-抗坏血酸,与D-异抗坏血酸反应生成(顺)-5,6-O-苯亚甲基-D-异抗坏血... 采用N,N-二甲基乙酰胺(DMAc)为溶剂、对甲苯磺酸(TsOH)为催化剂、环己烷为带水剂,苯甲醛与L-抗坏血酸反应生成(顺)-5,6-O-苯亚甲基-L-抗坏血酸和(反)-5,6-O-苯亚甲基-L-抗坏血酸,与D-异抗坏血酸反应生成(顺)-5,6-O-苯亚甲基-D-异抗坏血酸和(反)-5,6-O-苯亚甲基-D-异抗坏血酸。1HNMR数据表明,两个反应所得到的顺反异构体均为不等量。应用Chemoffice 9.0的3D模块中半经验分子轨道(MOPAC)程序计算的结果表明,两个反应顺式异构体最稳定构象的能量均比反式异构体最稳定构象的能量低,优势产物均可能以顺式异构体为主。以5,6-O-苯亚甲基-D-异抗坏血酸合成为例,用正交实验法优化了合成反应条件。 展开更多
关键词 5 6-O-苯亚甲基L抗坏血酸 5 6-O-苯亚甲基-D-异抗坏血酸 半经验分子轨道(mopac)法
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带有分子轨道能量的3D-QSAR对N-氨基咪唑的研究(英文)
6
作者 乔颖欣 周家驹 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第2期209-214,共6页
N-氨基咪唑(NAIMs)能通过三种不同的作用方式抑制HIV-1的复制.用比较分子场(CoMFA)方法对一系列有共同骨架的NAIM分子建立3D-QSAR模型.与以往模型不同的是,在偏最小二乘(PLS)分析中尝试引入分子轨道能量的信息来研究生物活性与分子轨道... N-氨基咪唑(NAIMs)能通过三种不同的作用方式抑制HIV-1的复制.用比较分子场(CoMFA)方法对一系列有共同骨架的NAIM分子建立3D-QSAR模型.与以往模型不同的是,在偏最小二乘(PLS)分析中尝试引入分子轨道能量的信息来研究生物活性与分子轨道能量的关系.结果得到了几个模型,分子轨道能量对模型的贡献能为21.7%,轨道HOMO5对模型的贡献最大. 展开更多
关键词 N-氨基咪唑 抑制HIV-1复制 三维定量构效关系 分子轨道能量 比较分子场方法 mopac6/PM3
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纳米TiO_2光催化降解茜素黄R的反应机理与动力学 被引量:7
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作者 陈强 王芳 +1 位作者 宋俊密 袁九毅 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期175-180,共6页
以纳米TiO2(P25)粉末作为催化剂光降解茜素黄R.GC-MS和LC-MS检测结果表明,有3种可能的降解途径:①茜素黄R(C13H8N3O5Na)水解生成的C13H8N3O5-(H)与光催化产生的.OH自由基发生取代反应生成C13H8N3O6-(I)和C13H8N3O7-(J),进一步脱羧分别生... 以纳米TiO2(P25)粉末作为催化剂光降解茜素黄R.GC-MS和LC-MS检测结果表明,有3种可能的降解途径:①茜素黄R(C13H8N3O5Na)水解生成的C13H8N3O5-(H)与光催化产生的.OH自由基发生取代反应生成C13H8N3O6-(I)和C13H8N3O7-(J),进一步脱羧分别生成C12H9N3O4(L)和C12H9N3O5(M);②H分子发生脱羧反应生成C12H9N3O3(K),进一步反应生成C12H11N3(C)和C12H12N2(D);③H分子中氮氮键发生断裂而生成C6H6N2O2(A)、C6H4N2O4(B)、C6H8N2(E)、C6H6O(F)和C7H7NO3(G).所有生成的中间产物被继续降解,最终矿化为CO2和H2O等无机小分子物质.利用Molecular Orbital PACkage中的PM3半经验方法对茜素黄R分子构型优化计算,结果表明,茜素黄R的羧基净电荷密度为-0.680,在实验条件下(pH为2.86)羧基易吸附在TiO2表面,而成为.OH进攻的最有利位置,实验检测到羟基化的产物(J和I).茜素黄R的羧基和苯环相连的C—C键长最长,反应过程中易发生脱羧反应,实验检测到脱羧后的产物(K);—N N—键长较长,易断裂生成芳胺类化合物(A,E,G等).茜素黄R带羧基和羟基的苯环电荷密度为-0.160,带硝基苯环电荷为-0.165,易吸附在催化剂表面而被自由基进攻,生成羟基化产物.计算结果和实验检测结果一致.动力学研究表明,茜素黄R光催化降解的动力学符合Langmuir-Hinshelwood模型计算的结果. 展开更多
关键词 TIO2 茜素黄R 反应机理 PM3算法 紫外-可见光谱 L-H模型
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4-氨基联苯系的致癌活性研究
8
作者 徐义生 周志刚 戴乾圜 《北京工业大学学报》 CAS CSCD 1998年第4期119-122,共4页
在SGI工作站上运用MOPAC程序的PM3方法对4-氨基联苯系的几组化合物进行了计算,借用氨基亚氮阳离子与环上环氧化物的双官能团烷化作用观点,得出了该组化合物致癌活性的机理,与实验依据较为符合,从而建立了良好的量化构效关系.
关键词 mopac 氨基联苯 致癌活性 职业病
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Molecular modeling of the octacoordinated tetracarbonato-Nd(III), [Nd(CO_3)_4]^(5-), complex and its nonacoordinated fluoro- and aquo-adducts
9
作者 S. P. Sinha Alfredo M. Simas Gustavo L. C. Moura 《Journal of Rare Earths》 SCIE EI CAS CSCD 2010年第6期847-853,共7页
Theoretical investigation on the structures of the octacoordinated [Nd(CO3)4]5-and the nonacoordinated [Nd(CO3)4.OH2]5-complexes, using the SPARKLE parameters of the lanthanides within MOPAC, revealed that they posses... Theoretical investigation on the structures of the octacoordinated [Nd(CO3)4]5-and the nonacoordinated [Nd(CO3)4.OH2]5-complexes, using the SPARKLE parameters of the lanthanides within MOPAC, revealed that they possessed dodecahedral and square antiprismatic structures respectively with an average Nd-O distance of 0.249 nm. These structures and the Nd-O distances agreed well with those experimentally found in the crystal structures. Replacing the water molecule with a fluoride ion or a mondentatecarbonato ligand resulted in a nonacoordinated distorted square antiprismatic structures where the trans-carbonato groups were twisted. The corresponding decacoordinated structures with two fluoride ions or a bidentatecarbonato group, [Nd(CO3)4·F2]7-and [Nd(CO3)5]7-, were also investigated. In both cases considerable twisting of the transcarbonato groups was observed. 展开更多
关键词 LANTHANIDES theoretical molecular models octacoordination carbonato complexes ADDUCTS mopac SPARKLE rare earths
原文传递
Comparison between the theoretical models and experimental structures of some oc tacoordinated Ln(Ⅲ)-bis-dipyridyl-bis-dichloroacetato-diaquo complexes and their phenanthroline analogues
10
作者 S. P. SINHA Alfredo M. SIMAS Gustavo L. C. MOURA 《Journal of Rare Earths》 SCIE EI CAS CSCD 2010年第S1期83-85,共3页
The title complexes were modeled using the semiempirical MOPAC and the newly developed SPARKLE paramerters of the lanthanides. The calculated bond dis tances and angles agreed well with those found from crystal struct... The title complexes were modeled using the semiempirical MOPAC and the newly developed SPARKLE paramerters of the lanthanides. The calculated bond dis tances and angles agreed well with those found from crystal structure measuremen ts. This technique allows us to screen a large number of molecules and get struc tural information within a very short time. 展开更多
关键词 lanthanide complex theoretical models octacoordination dipyridyl p henanthroline mopac SPARKLE rare earths
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染料分子结构与颜色关系的量子化学分析 被引量:2
11
作者 张伟杰 《广东化工》 CAS 2014年第3期41-42,共2页
文章运用MOPAC半经验量化程序,对部分染料分子结构进行计算,然后将结果和事实相对照与比较,从而分析染料分子结构与颜色的关系,并从中总结出一些规律。
关键词 染料分子结构 染料颜色 PM3
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对量子化学计算软件性能的分析及对比 被引量:7
12
作者 鲁萍 谭振江 《吉林师范大学学报(自然科学版)》 2011年第2期107-109,共3页
量子化学计算软件是将量子化学复杂的计算过程程序化,从而便于人们的使用及提高量化计算的效率.文中概括的介绍了三种量子化学计算软件的具体功能及其所适用的研究领域,并对其做了分析对比.希望能够让更多的该领域研究者认识并了解量子... 量子化学计算软件是将量子化学复杂的计算过程程序化,从而便于人们的使用及提高量化计算的效率.文中概括的介绍了三种量子化学计算软件的具体功能及其所适用的研究领域,并对其做了分析对比.希望能够让更多的该领域研究者认识并了解量子化学计算软件,从而使用这些软件来辅助科学研究. 展开更多
关键词 量子化学计算软件 Hyperchem GAUSSIAN mopac
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Evaluation on The Structural as Selective Elective For Removing Trace Metal Ions by Some Compounds as Selective Sensors With Using Semi-empirical Calculations
13
作者 Iran Sheikhshoaie 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期866-,共1页
1 Results We have recently reported the successful use of some new ionophores in construction of PVC-based membrane selective sensors for Fe3+,Ni2+,Co2+,Hg2+ and Cd2+ ions by some Schiff base ligands. Schiff bases are... 1 Results We have recently reported the successful use of some new ionophores in construction of PVC-based membrane selective sensors for Fe3+,Ni2+,Co2+,Hg2+ and Cd2+ ions by some Schiff base ligands. Schiff bases are one of the most important classes of ligand in coordination chemistry. In this work we reported the optimized structures of four tetra dentate mono azo Schiff base compounds.Using AM1,PM3 and MNDO semi-empirical methods for the optimization of the compounds,then we compared all of theoreti... 展开更多
关键词 IONOPHORE Imine AM1 PM3 MNDO mopac HOMO LUMO
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Kayword Index to Votumne 16(1998)
14
作者 Keyword Index to Volume 16 (1998) 《Chinese Journal of Chemistry》 SCIE CAS CSCD 1998年第6期571-575,共5页
Ab mitio,decomposition,reaction mechanism 213Ab initio methods,trimethylaluminium,Density Functional Theory(DFT)209l,4-Addition,photolysis,radical,C60 478AdinaⅢbella.Rubiaceae.sapouins 442Aggregating tendency, kineti... Ab mitio,decomposition,reaction mechanism 213Ab initio methods,trimethylaluminium,Density Functional Theory(DFT)209l,4-Addition,photolysis,radical,C60 478AdinaⅢbella.Rubiaceae.sapouins 442Aggregating tendency, kinetic probe,phos- phatidylcholine,hydrophobic—lipophilic inter— actions 250Aggregation,hydrophobic—lipophilic interactions, deuteroporphyrin IX diesters 404Alkanes, multivariate modeling, novel atomic distance-edge vector fADEl,carbon. 13 nuclear magnetic resonance spectrometry, structure-spectra correlation 展开更多
关键词 cage mopac HPLC QSAR ALS II EXAFS Kayword Index to Votumne 16 DTPA QSRR
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