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MOLMAP指数及其在变异性预测中的应用
被引量：
1
1
作者
张庆友
龙海林
+5 位作者
冯秀林
索净洁
张丹丹
李静亚
许力壮
许禄
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期541-546,共6页
分子映射(MOLMAP)指数是以分子的化学键描述符为基础,通过Kohonen自组织映射依据一定的算法而衍生.化学键描述符是由化学键的物理化学性质,如两端原子的电荷差和拓扑性质,键连杂原子数量等所组成.本文将分子映射指数应用于4075个有机物...
分子映射(MOLMAP)指数是以分子的化学键描述符为基础,通过Kohonen自组织映射依据一定的算法而衍生.化学键描述符是由化学键的物理化学性质,如两端原子的电荷差和拓扑性质,键连杂原子数量等所组成.本文将分子映射指数应用于4075个有机物质(Ames实验结果:2305个结构有诱变性,1770个结构无诱变性)的变异性预测.通过随机森林,分别采用三种类型的指数建立模型:(1)采用不同维数的分子映射指数;(2)采用全局分子描述符;(3)将分子映射指数与全局分子描述符相结合.整个数据集的集外(out-of-bag)交叉验证的正确预测率达到85.4%.为了检验模型的稳定性,采用所建模型预测源于另一数据库的472个化合物,正确预测率为86.7%,与此前的研究相比,两个预测结果均有所提高.
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关键词
分子映射指数
Kohonen自组织映射
随机森林
诱变性
结构-活性关系
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职称材料
基于MOLMAP指数的光化学反应分类预测
被引量：
1
2
作者
张庆友
冯秀林
+4 位作者
龙海林
索净洁
张丹丹
许力壮
许禄
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012年第8期989-994,共6页
由反应物和产物的结构衍生了反应物、产物和化学反应的MOLMAP指数,其中化合物的结构由化学键的物理化学性质和拓扑性质所表征.将前述MOLMAP指数应用于一个含七类光化学反应的数据集,通过随机森林建立了三种类型的模型:(1)预测反应物可...
由反应物和产物的结构衍生了反应物、产物和化学反应的MOLMAP指数,其中化合物的结构由化学键的物理化学性质和拓扑性质所表征.将前述MOLMAP指数应用于一个含七类光化学反应的数据集,通过随机森林建立了三种类型的模型:(1)预测反应物可能发生的反应类型;(2)预测可能合成产物的反应类型;(3)预测整个化学反应的类型.由于无需指定数据集中参与反应的化学键,所以,MOLMAP指数能够得到广泛的应用.所得分类预测结果好于我们此前对同一数据集的研究,表明改进化学键的描述有助于提高MOLMAP指数的预测能力.
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关键词
光化学反应分类
molmap
指数
Kohonen自组织映射
随机森林
原文传递
题名
MOLMAP指数及其在变异性预测中的应用
被引量：
1
1
作者
张庆友
龙海林
冯秀林
索净洁
张丹丹
李静亚
许力壮
许禄
机构
河南大学化学化工学院环境与分析科学研究所
深圳市人民医院
中国科学院长春应用化学研究所
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期541-546,共6页
基金
国家自然科学基金(20875022)
教育部留学回国人员科研启动基金(2009(1001))
河南省国际科技合作项目(114300510009)资助~~
文摘
分子映射(MOLMAP)指数是以分子的化学键描述符为基础,通过Kohonen自组织映射依据一定的算法而衍生.化学键描述符是由化学键的物理化学性质,如两端原子的电荷差和拓扑性质,键连杂原子数量等所组成.本文将分子映射指数应用于4075个有机物质(Ames实验结果:2305个结构有诱变性,1770个结构无诱变性)的变异性预测.通过随机森林,分别采用三种类型的指数建立模型:(1)采用不同维数的分子映射指数;(2)采用全局分子描述符;(3)将分子映射指数与全局分子描述符相结合.整个数据集的集外(out-of-bag)交叉验证的正确预测率达到85.4%.为了检验模型的稳定性,采用所建模型预测源于另一数据库的472个化合物,正确预测率为86.7%,与此前的研究相比,两个预测结果均有所提高.
关键词
分子映射指数
Kohonen自组织映射
随机森林
诱变性
结构-活性关系
Keywords
molmap descriptor
Kohonen self-organizing map
Random forest
Mutagenicity
Structure-activity relationship
分类号
O641.1 [理学—物理化学]
在线阅读
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职称材料
题名
基于MOLMAP指数的光化学反应分类预测
被引量：
1
2
作者
张庆友
冯秀林
龙海林
索净洁
张丹丹
许力壮
许禄
机构
河南大学化学化工学院环境与分析科学研究所
深圳市人民医院
中国科学院长春应用化学研究所
出处
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012年第8期989-994,共6页
基金
国家自然科学基金(No.20875022)
教育部留学回国人员科研启动基金
河南省国际科技合作项目(No.114300510009)资助项目~~
文摘
由反应物和产物的结构衍生了反应物、产物和化学反应的MOLMAP指数,其中化合物的结构由化学键的物理化学性质和拓扑性质所表征.将前述MOLMAP指数应用于一个含七类光化学反应的数据集,通过随机森林建立了三种类型的模型:(1)预测反应物可能发生的反应类型;(2)预测可能合成产物的反应类型;(3)预测整个化学反应的类型.由于无需指定数据集中参与反应的化学键,所以,MOLMAP指数能够得到广泛的应用.所得分类预测结果好于我们此前对同一数据集的研究,表明改进化学键的描述有助于提高MOLMAP指数的预测能力.
关键词
光化学反应分类
molmap
指数
Kohonen自组织映射
随机森林
Keywords
photochemical reaction classification
molmap descriptor
Kohonen SOM
random forest
分类号
O644 [理学—物理化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
MOLMAP指数及其在变异性预测中的应用
张庆友
龙海林
冯秀林
索净洁
张丹丹
李静亚
许力壮
许禄
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于MOLMAP指数的光化学反应分类预测
张庆友
冯秀林
龙海林
索净洁
张丹丹
许力壮
许禄
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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