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MNP分子标记在食用菌品种精准鉴定中的应用与前景分析 被引量：1
1
作者 刘飞 张明晢 +2 位作者 曹槟 凌云燕 赵瑞琳 《菌物研究》 2025年第3期247-253,共7页
食用菌品种的精准鉴定在食用菌生产和种质创新中占有重要地位。食用菌不同品种间存在亲缘关系密切、同质化严重的问题,而现有的食用菌品种鉴定方法工作量大、精确性和重复性不足,怎样实现食用菌品种的精准鉴定是产业中的痛点问题。多核... 食用菌品种的精准鉴定在食用菌生产和种质创新中占有重要地位。食用菌不同品种间存在亲缘关系密切、同质化严重的问题,而现有的食用菌品种鉴定方法工作量大、精确性和重复性不足,怎样实现食用菌品种的精准鉴定是产业中的痛点问题。多核苷酸多态性(MNP)分子标记是一种能够同时检测DNA序列中多个核苷酸变异的方法,可提供高分辨率的遗传信息,从而更准确地区分食用菌不同品种之间的差异,并具有较高的重复性和精确性。文中分析了该技术在食用菌品种鉴定中的优势,回顾了2022—2023年MNP分子标记首次在香菇和金针菇等品种的精准鉴定中的应用。此外通过分析MNP标记的变异模式,除了品种的精准鉴定外,还可以实现品种溯源,具有巨大的应用潜力。通过进一步研究,尤其是和表型组的紧密结合,MNP分子标记还将为食用菌种质资源的保护、育种改良和产品质量控制提供更多的支持和解决方案。 展开更多
关键词 mnp分子标记 食用菌 谱系 精准鉴定
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基于MNP标记的莲品种纯度鉴定技术
2
作者 孙亚林 王直新 +5 位作者 匡晶 刘正位 李双梅 周凯 朱红莲 柯卫东 《中国蔬菜》 北大核心 2025年第11期150-158,共9页
品种纯度是莲种苗质量的重要指标之一,是影响产品产量和品质的关键因素。为保障莲种苗质量,拟建立一套快捷、准确、高通量的种苗纯度鉴定方法。本研究基于115份不同类型莲重测序数据,筛选检出率高、多态性好的MNP标记,并利用199份莲种... 品种纯度是莲种苗质量的重要指标之一,是影响产品产量和品质的关键因素。为保障莲种苗质量,拟建立一套快捷、准确、高通量的种苗纯度鉴定方法。本研究基于115份不同类型莲重测序数据,筛选检出率高、多态性好的MNP标记,并利用199份莲种质资源验证标记的可靠性。利用筛选出的标记对湖北、江西、福建的3个子莲品种和3个藕莲品种进行纯度鉴定,结果表明,筛选出的20对MNP标记多态性高、区分能力强,实现了莲种苗纯度的高通量检测。基于MNP标记的莲品种纯度检测技术建立,对良种繁育和大田生产具有指导作用。 展开更多
关键词 莲 mnp标记 纯度鉴定
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棉花MNP标记位点开发及其在DNA指纹图谱构建中的应用 被引量：1
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作者 艾莎 李莎 +11 位作者 方治伟 李论 李甜甜 高利芬 陈利红 肖华锋 万人静 闫多子 武星廷 彭海 韩瑞玺 周俊飞 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期2267-2278,共12页
棉花是重要的经济作物,棉属植物基因组复杂,分子标记开发困难且滞后于其他二倍体农作物。本研究利用多态性好、准确性高的MNP (multiple nucleotide polymorphisms, MNP)标记法,构建我国棉花主栽品种指纹图谱,为品种鉴定、遗传多样性分... 棉花是重要的经济作物,棉属植物基因组复杂,分子标记开发困难且滞后于其他二倍体农作物。本研究利用多态性好、准确性高的MNP (multiple nucleotide polymorphisms, MNP)标记法,构建我国棉花主栽品种指纹图谱,为品种鉴定、遗传多样性分析、分子育种等提供技术指导和数据支撑。本研究根据现有棉花基因组数据开发了940个MNP位点,对98份棉花样品进行多重PCR扩增,构建文库并测序,提取每个样品中940个MNP标记的基因型,构建棉花品种指纹图谱。对98个样品进行两两比对,获得每2个样品之间的遗传差异。利用遗传差异比例对98个棉花样品绘制系统发育树。940个MNP位点在98份棉花样品中均获得有效扩增产物,扩增产物长度分布在163~274 bp,平均长度270 bp。在98份样品中平均区分度(discriminative power, DP)为0.46,任意2个品种间两两比较遗传差异,平均有410.26个MNP位点存在差异,平均差异为44.84%。从98份棉花品种的系统发育树可以看出,利用MNP标记可以依据地理分布将其分为3个类群,大致分布于黄河流域、长江流域和新疆地区。本研究开发的940个MNP标记可以对棉花品种进行精准分型,利用940个棉花MNP标记构建的98份棉花品种DNA指纹图谱,可为品种鉴定、品种权保护及种质创新提供技术支撑。 展开更多
关键词 棉花 分子标记 mnp 指纹图谱 品种鉴定
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多核苷酸多态性分子标记在中药材质量控制中的应用现状与前景
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作者 官容丽 陈毫 +10 位作者 李甜甜 何恬 方治伟 冯顺 周俊飞 陈利红 李论 朱召禄 肖紫兰 宋会银 彭海 《中草药》 北大核心 2025年第18期6864-6872,共9页
中药材作为传统医药的核心,其质量直接影响临床疗效与用药安全。然而,当前市场存在的物种混淆、掺假掺杂及产地不明等问题,严重制约了产业发展。传统鉴定方法(如性状鉴定、显微鉴定等)及早期分子标记技术在操作便捷性、准确性、特异性... 中药材作为传统医药的核心,其质量直接影响临床疗效与用药安全。然而,当前市场存在的物种混淆、掺假掺杂及产地不明等问题,严重制约了产业发展。传统鉴定方法(如性状鉴定、显微鉴定等)及早期分子标记技术在操作便捷性、准确性、特异性和稳定性等方面存在明显局限。近年来,多核苷酸多态性(multiple nucleotide polymorphism,MNP)分子标记技术凭借其高特异性、高灵敏度、高通量和稳定性好等优势,已展现出作为中药材全产业链质量监控突破性工具的潜力。本文系统综述了MNP分子标记技术的原理,并重点探讨了其在中药材鉴定、掺假检测、产地溯源等方面的研究进展和应用前景。结合国家标准《植物品种鉴定—MNP标记法》(GB/T 38551-2020),本文进一步提出了构建中药材MNP标记技术鉴定标准化体系的思考与建议,以期为提升中药材质量、推动中药现代化与国际化进程提供技术支持和参考依据。 展开更多
关键词 分子鉴定 mnp分子标记 中药材 质量控制 品种鉴定
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木薯MNP标记在品种鉴定中的应用 被引量：3
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作者 万人静 李琼 +7 位作者 周新成 李论 李甜甜 周俊飞 李莎 彭海 章伟雄 方治伟 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第12期2417-2423,共7页
MNP(multiple nucleotide polymorphism,MNP)是随着分子标记技术的发展而产生的一种新型分子标记技术。靶向测序基因型技术(genotyping by target sequencing,GBTS)在一个扩增子内仅扩增一个SNP位点,MNP基于GBTS可在一个扩增子内同时扩... MNP(multiple nucleotide polymorphism,MNP)是随着分子标记技术的发展而产生的一种新型分子标记技术。靶向测序基因型技术(genotyping by target sequencing,GBTS)在一个扩增子内仅扩增一个SNP位点,MNP基于GBTS可在一个扩增子内同时扩增多个SNP位点。该技术具有成本低、检测效率高、应用灵活、适应性广等特点,MNP标记可用于育种过程的鉴定。为了建立快速、精准、高效的木薯品种鉴定方法,筛选适用于木薯品种鉴定的MNP分子标记,本研究在全基因组范围内筛选高多态性区域并设计引物,最终在全基因范围内获得623个木薯MNP标记位点,并利用28个木薯品种对木薯MNP标记进行评价。结果表明,MNP标记分型重现性高达100%。MNP标记位点在28个木薯品种中检出(4.07±1.68)种等位基因型,最多具有12种等位基因型。对所有木薯品种进行两两比较时,99.47%(376/378)的品种对间的差异大于46%,比例在0.3%~81.0%之间,均值为71.78%。相较于SNP,MNP具有更好的品种区分能力。综上所述,本研究所开发的木薯MNP分子标记具有较高的重现性、多态性和品种区分能力,可广泛用于木薯的种质资源多样性、新品种培育及品种鉴定等研究。 展开更多
关键词 木薯 分子标记 mnp 品种鉴定
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木蹄层孔菌不同居群间生长特性、木质素降解酶与SRAP标记遗传多样性 被引量：6
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作者 曹宇 徐晔 王秋玉 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第22期7061-7071,共11页
以帽儿山、长白山、凉水、本溪木蹄层孔菌(Fomes fomentarius)4个居群为研究对象,采用菌丝长度测量法比较4个地点木蹄层孔菌菌株在PDA固体培养基上的生长速度,采用菌丝体干重法比较4个地点木蹄层孔菌菌株在PDA液体培养基中生物量的变化... 以帽儿山、长白山、凉水、本溪木蹄层孔菌(Fomes fomentarius)4个居群为研究对象,采用菌丝长度测量法比较4个地点木蹄层孔菌菌株在PDA固体培养基上的生长速度,采用菌丝体干重法比较4个地点木蹄层孔菌菌株在PDA液体培养基中生物量的变化,结果显示木蹄层孔菌在23℃下生长速度显著高于28℃,说明木蹄层孔菌的生长对温度较敏感,23℃更适合木蹄层孔菌的生长。在同一温度下培养,4个地点的木蹄层孔菌生长速度无显著差异。通过比色法检测4个地点的木蹄层孔菌木质素降解相关酶(木质素过氧化物酶,锰过氧化物酶,漆酶)活性差异,结果显示同一种酶酶活性在4个地点间没有显著差异;在不同培养基上培养时,3种酶在PDA培养基上的活性均显著高于完全培养基。同时,采用序列相关扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)技术初探了木蹄层孔菌4个居群的遗传多样性和遗传分化,结果表明木蹄层孔菌4个居群中多态位点比率最高的是本溪,其次是帽儿山和凉水,而长白山最低;AMOVA分析结果显示,居群间的遗传分化为24.74%,居群内的遗传分化为75.26%,木蹄层孔菌的遗传分化主要发生在居群内部。根据Nei's遗传距离对木蹄层孔菌4个居群进行UPGMA聚类分析,结果显示帽儿山和本溪居群最先聚类,其次聚类的是长白山居群,最后是凉水居群。 展开更多
关键词 白腐菌 木质素过氧化物酶 锰过氧化物酶 漆酶 分子标记 遗传分化
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