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MMP1、MMP9基因与慢性牙周炎的因果关系:基于两样本孟德尔随机化研究
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作者 杨春桃 左玉 《山东大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第11期87-97,共11页
目的采用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探索MMP1/MMP8/MMP9基因与慢性牙周炎是否存在因果关系。方法使用FinnGen R10(于2023年12月公开发布)慢性牙周炎(K11_PERIODON_CHRON)全基因组关联研究(genome-wide associa... 目的采用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探索MMP1/MMP8/MMP9基因与慢性牙周炎是否存在因果关系。方法使用FinnGen R10(于2023年12月公开发布)慢性牙周炎(K11_PERIODON_CHRON)全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)汇总数据,选择与暴露基因(MMP1/MMP8/MMP9)显著相关且符合标准的单核苷酸多态性作为工具变量,以MMP1/MMP8/MMP9基因作为暴露变量,慢性牙周炎作为结局变量。采用MR-Egger回归、加权中位数、逆方差加权、简单模式、加权模式进行MR分析。用Cochranʼs Q检验和MR-Egger回归进行异质性检测。用MR-Egger截距和MR-PRESSO分析方法评估水平多效性。并用leave-one-out分析方法评估MR分析结果的整体稳定性。使用比值比(odds ratio,OR)和95%置信区间(confidence interval,CI)来量化MMP1/MMP8/MMP9基因对慢性牙周炎的因果关系。结果在数据集ebi-a-GCST90012033(P=0.005,OR=0.955,95%CI=0.924~0.986)和数据集eqtl-a-ENSG00000196611(P=0.048,OR=0.912,95%CI=0.832~0.999)中,基于逆方差加权分析的结果提示MMP1基因预测的表达水平与慢性牙周炎风险之间存在显著的因果关系。在数据集prot-a-1920(P=0.087,OR=0.993,95%CI=0.985~1.001)和数据集eqtl-a-ENSG00000118113(P=0.883,OR=0.992,95%CI=0.887~1.109)中,基于逆方差加权分析的结果提示MMP8基因预测的表达水平与慢性牙周炎风险之间不存在显著的因果关系。在数据集prot-a-1921(P=0.450,OR=0.985,95%CI=0.948~1.024)中,基于逆方差加权分析的结果提示MMP9基因预测的表达水平与慢性牙周炎风险之间不存在显著的因果关系。但在数据集eqtl-a-ENSG00000100985(P=2.405×10^(-5),OR=1.123,95%CI=1.064~1.184)中,基于逆方差加权分析的结果提示MMP9基因预测的表达水平与慢性牙周炎风险之间存在显著的因果关系。结论从遗传学层面,MR分析结果支持MMP1、MMP9基因在慢性牙周炎发病机制中可能发挥致病作用。从病因学层面,MMP1、MMP9基因只是慢性牙周炎的致病因素之一。 展开更多
关键词 MMP1基因 mmp8基因 MMP9基因 慢性牙周炎 孟德尔随机化 单核苷酸多态性 因果关系
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