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MLST、特异基因扩增与传统沙门氏菌分型方法的比较
1
作者 李莹 《疾病预防控制通报》 2025年第4期92-94,共3页
目的 了解沙门氏菌传统玻片凝集法、多位点序列分型(multi locus sequence typing,MLST)和特异基因扩增方法分型的差异。方法 从2024年洛阳从事食品等行业人员健康体检粪便样本分离沙门氏菌48株,比较玻片凝集法等3种方法在血清分型成功... 目的 了解沙门氏菌传统玻片凝集法、多位点序列分型(multi locus sequence typing,MLST)和特异基因扩增方法分型的差异。方法 从2024年洛阳从事食品等行业人员健康体检粪便样本分离沙门氏菌48株,比较玻片凝集法等3种方法在血清分型成功率、手工操作时间(hands on time,HOT)、总周转时间(total turnaround time,TAT)、操作难度和成本方面的差异。结果 玻片凝集法分型成功率83.33%,HOT为1 h、TAT为3~6 d,分型成本160元/株,对操作技术和抗血清质量要求高;MLST分型成功率97.92%,HOT为0.5 h、TAT为3~5 d,分型成本430元/株,操作仅需要细菌DNA提取技术;特异基因扩增法分型成功率79.17%,HOT为0.5 h、TAT为1.44 h,分型成本100元/株,要求操作熟悉PCR操作技术。结论 玻片凝集法对技术和抗血清质量要求较高、操作流程长;MLST法分型成功率高、技术要求低、成本较高;特异基因扩增技术要求低、操作流程短、成本低。 展开更多
关键词 沙门氏菌 血清分型 mlst 成功率
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多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用 被引量：13
2
作者 刘祥 许彦梅 +6 位作者 王斌 邓建平 肖波 孙松松 周阳 熊衍文 王红 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1033-1036,共4页
目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等... 目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。 展开更多
关键词 多位点序列分型技术(mlst) 艾伯特埃希菌 新病原
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利用MLST技术对浙江省大肠杆菌O157的分子流行病学研究 被引量：7
3
作者 叶菊莲 占利 +3 位作者 梅玲玲 罗芸 姚苹苹 姜理平 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期901-904,共4页
目的对浙江省2005-2010年大肠杆菌O157分离株进行分子分型研究,了解菌株间的遗传进化关系,为浙江省大肠杆菌O157监测及爆发疫情的控制提供基础。方法选择Pasteur大肠杆菌多位点序列分型(Multilocus SequenceTyping,MLST)方案,对大肠杆菌... 目的对浙江省2005-2010年大肠杆菌O157分离株进行分子分型研究,了解菌株间的遗传进化关系,为浙江省大肠杆菌O157监测及爆发疫情的控制提供基础。方法选择Pasteur大肠杆菌多位点序列分型(Multilocus SequenceTyping,MLST)方案,对大肠杆菌O157分离株及882364菌株进行MLST分型,确定菌株序列型(Sequence type,ST);采用DNAsp、eBURST、START2等软件进行分析。结果 30株菌中,27株O157∶H7菌株具备相同序列型(ST-284),占90%(27/30),其他3株菌序列型分别为ST-367、ST-125、ST-296。8个管家基因核苷酸多态性(Pi)范围为0.00119(polB)～0.00648(uidA),putP基因多态性位点比例最高(4.6%),trpA基因多态性位点比例最低(0.4%)。进化分析结果显示,这些序列型分别属于Group 1及Group 11群。结论浙江省动物源性大肠杆菌O157∶H7的主要序列型为ST-284,与江苏省病人株882364(ST-296)具有同一个进化祖先,提示应加强浙江省大肠杆菌O157病原学监测。 展开更多
关键词 大肠杆菌O157 多位点序列分型(mlst) 管家基因 分子流行病学
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2005年广东省临床分离猪链球菌的MLST分子分型研究 被引量：14
4
作者 王洪敏 柯昌文 +7 位作者 潘武滨 柯碧霞 陈经雕 邓小玲 刘美真 陈国仁 杨杏芬 朱振宇 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1438-1441,1445,共5页
在2005年四川发生猪链球菌人间感染疫情期间,广东省也加强了监测,并发现了5个散发感染病例。从这5个住院临床病例中,分别分离了5个致病性SS2。通过测定猪链球菌基因组上的7个看家基因dpr、thrA、cpn60、recA、gki、aroA和mutS的部分片段... 在2005年四川发生猪链球菌人间感染疫情期间,广东省也加强了监测,并发现了5个散发感染病例。从这5个住院临床病例中,分别分离了5个致病性SS2。通过测定猪链球菌基因组上的7个看家基因dpr、thrA、cpn60、recA、gki、aroA和mutS的部分片段,对这5个猪链球菌进行了多位点测序分型。通过对上述测序片段进行比对分析发现,5个菌株的dpr、cpn60、recA、gki、aroA和mutS等6个基因片段完全相同;而thrA基因片段存在两个等位基因型即thrA-c和thrA-h,在该等位基因片段的360位的亮氨酸密码子第三位发生了一个中性突变(TTA→TTG)。MLST分析结果显示,广东省的临床猪链球菌分离株L-SS002、L-SS003和L-SS005菌株,与四川疫情株相同,属于ST7型;而L-SS004和L-SS006,与香港地区发现的猪链球菌相同,属于ST1克隆;但这5个菌株亲缘关系极近,都属于ST1克隆复合物;这一点与四川省暴发的人间猪链疫情明显不同,后者仅由单一的ST7猪链球菌克隆引起。属于ST7的克隆菌株很可能来源于四川;而其余两个ST1克隆系菌株的来源尚待鉴定。 展开更多
关键词 猪链球菌 分子分型 DNA测序 mlst
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辽宁省市售禽肉中沙门氏菌的污染状况及其MLST分型与耐药性分析 被引量：13
5
作者 于淼 耿英芝 +2 位作者 张铭琰 刘海霞 张眉眉 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2486-2493,共8页
【背景】沙门氏菌(Salmonella)是重要的人畜共患病原菌,可通过禽类及其产品传播给人类,对人类健康造成威胁。了解市售禽肉中沙门氏菌病原学特征及耐药情况,对公共卫生具有重要意义。【目的】了解2022年辽宁省市售禽肉中沙门氏菌的污染... 【背景】沙门氏菌(Salmonella)是重要的人畜共患病原菌,可通过禽类及其产品传播给人类,对人类健康造成威胁。了解市售禽肉中沙门氏菌病原学特征及耐药情况,对公共卫生具有重要意义。【目的】了解2022年辽宁省市售禽肉中沙门氏菌的污染状况、血清型分布、药物敏感性及分子流行特征情况,探讨不同血清型与多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、耐药性之间的关系。【方法】依据GB4789.4―2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》检验方法对收集的样品进行检测及生化实验鉴定,采用玻片凝集法进行血清学实验,用微量肉汤法对菌株进行药物敏感性试验,使用BioNumerics7.6软件对药敏结果、MLST分型结果进行分析。【结果】53株沙门氏菌包含11种血清型,以肠炎沙门氏菌(Salmonella enteritidis)为主。药物敏感性分析中,沙门氏菌对萘啶酸(nalidixic acid,NAL)的耐药率最高,为92.5%(49/53),共发现有25种多重耐药谱,总耐药率为66.0%(35/53),在耐药基因分析中,四环素类耐药基因tetC携带率最高为45.3%(24/53)。根据7种管家基因的序列沙门氏菌被分为10个ST型别和1个未分型型别。【结论】辽宁省市售禽肉沙门氏菌的污染率较为严重,血清型多样化,整体耐药水平较高,多重耐药情况严重,应加强对禽类规范化养殖。 展开更多
关键词 禽肉 沙门氏菌 mlst 耐药性 耐药基因
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鸡滑液囊支原体的分离鉴定及全基因组特征分析
6
作者 李琪 方焕新 +5 位作者 胡俊 温家明 顾嘉运 王占新 覃健萍 蔺文成 《中国家禽》 北大核心 2026年第1期79-88,共10页
研究旨在解析鸡滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae,MS)全基因组特征及其功能。试验对广东地区疑似感染MS的鸡进行病原分离,对病原进行致病性试验和药物敏感性试验,并进一步解析其基因组特征。结果显示:成功分离一株MS,命名为H12株;肌肉... 研究旨在解析鸡滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae,MS)全基因组特征及其功能。试验对广东地区疑似感染MS的鸡进行病原分离,对病原进行致病性试验和药物敏感性试验,并进一步解析其基因组特征。结果显示:成功分离一株MS,命名为H12株;肌肉攻毒10~8 CCU/mL H12株能引起30日龄SPF鸡跛行、肿腿的临床症状;H12株对截短侧耳素类药物高度敏感,但对四环素类耐药性强;H12株基因组存在多个毒力因子,有助于MS感染宿主,其携带CRISPR-Cas系统及高保守DNA修复基因(如recA),表明其对不同环境具有适应潜力;在KEGG、COG、GO数据库分别注释到381、1 410、48个基因;多位点序列分型(MLST)为ST34,与我国主要流行株遗传谱系一致。研究表明,分离株H12属于国内主要流行的ST34型,携带CRISPR-Cas系统、多个毒力因子(adh、ef-tu、pdhb等)及耐药基因(parC、gyrB),具备较强环境适应性与致病性,并对四环素类耐药。 展开更多
关键词 鸡滑液囊支原体 全基因组测序 微量稀释法 mlst分型 毒力因子
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四川部分地区禽源空肠弯曲菌MLST分型及遗传进化分析 被引量：4
7
作者 姚学萍 张博 +6 位作者 王寒 邬旭龙 周丽军 曹随忠 王印 杨泽晓 德西措姆 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期5-10,共6页
目的为了解四川部分地区分离到的48株禽源空肠弯曲菌间的分子特征,以对来源不同的空肠弯曲菌进行分子分型及遗传进化分析。方法本研究参照MLST数据库,选取了空肠弯曲菌MLST分型7个管家基因aspA,glnA,glyA,gltA,tkt,pgm和uncA作为目的基... 目的为了解四川部分地区分离到的48株禽源空肠弯曲菌间的分子特征,以对来源不同的空肠弯曲菌进行分子分型及遗传进化分析。方法本研究参照MLST数据库,选取了空肠弯曲菌MLST分型7个管家基因aspA,glnA,glyA,gltA,tkt,pgm和uncA作为目的基因分别扩增及测序,并将所得序列经比对后进行遗传进化分析。结果 48株分离株中共含24种不同的序列型分属于9种不同的克隆系及11种独特型,其中22株分离株含有新序列型,占分离株的45.83%(22/48);9种不同的克隆系中以CC-21、CC-353、CC-464克隆系所含菌株相对较多,而克隆系CC-45、CC-48最少,均为1株分离株;11种独特型共存于21株分离株中,其中以ST-8675序列型最多,为8株。遗传进化树显示,属同一克隆系的不同型别间的分离株亲缘关系较近,如同属于CC-21克隆系的ST-298与ST-760型别分离株处于同一小分支、亲缘关系较近,但不同克隆系的分离株间遗传进化关系较远,鹌鹑源分离株(V13-20)单独处于一大分支与其余禽源分离株间的亲缘关系最远。总体而言,不同地区、宿主来源的分离株呈现遗传多样性。结论本研究中分离株间具有基因多样性,MLST分型为了解该地区空肠弯曲菌的遗传特性和分布特点提供了参考依据。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 mlst分型 管家基因 遗传进化
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乡村医疗机构与城市医院来源的艰难梭菌MLST分型对比研究 被引量：3
8
作者 李文革 靳会娟 +3 位作者 岑瑞琦 程颖 卢金星 曹波 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期2699-2701,共3页
目的初步了解农村社区艰难梭菌流行状况及分子生物学特征。方法对河南省济源市某乡村医疗机构送检的7株艰难梭菌进行生化鉴定和分子生物学方法鉴定,并进行MLST分型分析,同时与北京某三甲医院的84株艰难梭菌进行对比,用eBURST软件聚类分... 目的初步了解农村社区艰难梭菌流行状况及分子生物学特征。方法对河南省济源市某乡村医疗机构送检的7株艰难梭菌进行生化鉴定和分子生物学方法鉴定,并进行MLST分型分析,同时与北京某三甲医院的84株艰难梭菌进行对比,用eBURST软件聚类分析,寻找其中可能的关联。结果源自河南济源市某乡村医院的7株菌均属艰难梭菌,PCR毒素基因鉴定结果显示,其中两株为A-B+菌株,其MLST分型结果是ST37;5株为A+B+菌株,其中4株对应ST35,1株对应ST3;两重来源的菌株中均是毒素基因A+B+菌株占优势;乡村医疗机构的7株艰难梭菌中未发现新的与David MLST数据库中不同的ST型别,未发现不同于北京城市医院的ST型别。结论 David方案适合种群结构和全球流行病学研究,且其数据库全球共享,便于数据交换;该次研究中未发现新的ST型别,所有菌株ST呈散在分布。 展开更多
关键词 艰难梭菌 mlst分型 城市医院 农村社区
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社区和医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MLST联合SCCmec基因分型及耐药性比较 被引量：14
9
作者 纪冰 王凤霞 +6 位作者 赵红梅 孙吉花 王涛 刘永云 李娜 孟玮 张玉梅 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期52-55,共4页
目的了解社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)和医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(HAMRSA)分离株的耐药性及遗传背景。方法对CA-MRSA和HA-MRSA进行多位点序列分型(MLST)检测,应用多重聚合酶链式反应(PCR)技术对CA-MRSA和HA-... 目的了解社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)和医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(HAMRSA)分离株的耐药性及遗传背景。方法对CA-MRSA和HA-MRSA进行多位点序列分型(MLST)检测,应用多重聚合酶链式反应(PCR)技术对CA-MRSA和HA-MRSA进行SCCmec基因分型;采用Walk WAY96PLUS PC33药敏板联合K-B纸片扩散法检测CA-MRSA和HA-MRSA抗菌药物敏感性。结果 63株HA-MRSA共检测出2个基因型,4株CA-MRSA共检测出4个基因型,二者遗传背景完全不同。HA-MRSA对红霉素、克林霉素、四环素、庆大霉素、左氧氟沙星和环丙沙星耐药率显著高于CAMRSA(均P<0.05)。结论滨州医学院附属医院CA-MRSA和HA-MRSA分型及主要流行株存在差异,CA-MSSA药物敏感性明显高于HA-MRSA;MLST联合SCCmec基因分型方法是MRSA分子流行病学分析的有效方法。 展开更多
关键词 社区获得性 医院获得性 金黄色葡萄球菌 多位点序列分型 葡萄球菌mec盒式染色体
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北京市西城区食源性与临床感染性单核细胞增生李斯特菌PFGE和MLST分型研究 被引量：9
10
作者 霍哲 王晨 +2 位作者 徐俊 高波 曹玮 《中国预防医学杂志》 CAS CSCD 2017年第9期675-679,共5页
目的研究北京市西城区食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌(listeria monocytogenes,Lm)的脉冲场凝胶电泳(plused-field gel electrophoresis,PFGE)和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)分型特征,分析两种分型方法的... 目的研究北京市西城区食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌(listeria monocytogenes,Lm)的脉冲场凝胶电泳(plused-field gel electrophoresis,PFGE)和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)分型特征,分析两种分型方法的应用价值。方法采用PFGE和MLST两种方法对2012-2015年50株食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌进行分型研究。结果 50株单核细胞增生李斯特菌PFGE分型得到23种型别,GX6A16.CN0004为优势带型。MLST分析获得12个型别,ST9为优势型别。其中5组数据是ST型别只对应一种PFGE型别,3种PFGE型别同时存在食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌,并且其ST型别进化关系比较远。结论北京市西城区不同来源单核细胞增生李斯特菌污染长期存在,出现致病型别,并且致病性单核细胞增生李斯特菌的遗传关系呈多元化。两种分子分型方法的结合,从基因水平上解释了单核细胞增生李斯特菌的变化趋势及流行特征。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 PFGE分型 mlst分型 进化树 分子分型 食源性致病菌 人源性
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上海市动物源性食品中单增李斯特菌的MLST分析 被引量：9
11
作者 刘萍萍 王少辉 +5 位作者 赵秋华 李蓓蓓 邵东华 史子学 魏建超 马志永 《中国动物传染病学报》 CAS 2013年第4期18-22,共5页
为了解上海市动物性食品中单增李斯特菌的进化情况和群体遗传学特征,本研究采用MLST法和eBURST软件对33株分离株进行分子分型及进化树分析。结果共分成8个型别,并且33株单增李斯特菌之间遗传相关性不是很大。分为4个进化谱系:ST11和ST19... 为了解上海市动物性食品中单增李斯特菌的进化情况和群体遗传学特征,本研究采用MLST法和eBURST软件对33株分离株进行分子分型及进化树分析。结果共分成8个型别,并且33株单增李斯特菌之间遗传相关性不是很大。分为4个进化谱系:ST11和ST196为一个进化谱系,ST9、ST8和ST155为一个进化谱系,ST87和ST277/589为一个进化谱系,所占比例最多的ST121单独一个进化谱系。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 mlst分型 管家基因 进化树
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浙江省三地区冷鲜鸡中大肠埃希菌耐药谱测定及MLST分子分型分析 被引量：2
12
作者 杨华 何祥祥 +3 位作者 肖英平 钱鸣蓉 张巧艳 唐标 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期888-893,共6页
大肠埃希菌是食品中普遍污染的条件致病菌,其耐药性非常严重,耐药基因具有极大的传播风险。为了解浙江省地区禽源大肠埃希菌耐药性特点及分布规律,试验从浙江省3个地区市售冷鲜鸡中分离了59株大肠埃希菌并测定了耐药谱,发现有24种耐药谱... 大肠埃希菌是食品中普遍污染的条件致病菌,其耐药性非常严重,耐药基因具有极大的传播风险。为了解浙江省地区禽源大肠埃希菌耐药性特点及分布规律,试验从浙江省3个地区市售冷鲜鸡中分离了59株大肠埃希菌并测定了耐药谱,发现有24种耐药谱,显示了分离株耐药类型的多样性。同时对分离株进行了Multilocus sequence typing(MLST)分子分型,获得38个已知ST型,并发现2个新的ST型。在此基础上,针对7个看家基因进行了系统发育分析,分离株显示了一定的地区差异性。该试验结果可为浙江省禽源大肠埃希菌的耐药性评价和溯源分析提供参考依据。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 细菌耐药性 多位点序列分型(mlst) 系统发育树
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广州市两例B群流脑病例分离株的MLST分型研究 被引量：2
13
作者 张欣强 李孝权 +2 位作者 夏丹 张晶 崔敏 《中国预防医学杂志》 CAS 2013年第6期462-464,共3页
目的对从广州市报告的两例B群流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例中分离的4株脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)进行多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)研究。方法分纯并提取菌株DNA、运用MLST分析对7个管家基因进行扩... 目的对从广州市报告的两例B群流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例中分离的4株脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)进行多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)研究。方法分纯并提取菌株DNA、运用MLST分析对7个管家基因进行扩增并测序,确定菌株的序列型,对其相关性进行分析。结果两例病例分离株7个管家基因位点序列均不相同,第一例病例分离株的序列型为ST-7型,属高致病性ST-5complex/subgroup III克隆系;第二例病例分离株的序列型为新发现的ST-9804型。结论广州两例B群流脑病例虽然发生时间相近,但分属不同的序列型,无同源性。MLST分型技术对研究不同流脑病例间的流行病学关系有重要意义。 展开更多
关键词 流行性脑脊髓膜炎 脑膜炎奈瑟菌 多位点序列分型(mlst)
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江苏省225株鸡源弯曲杆菌分离株的MLST分析 被引量：4
14
作者 陈文芳 唐梦君 +3 位作者 周倩 张小燕 唐修君 陆俊贤 《中国家禽》 北大核心 2022年第5期47-54,共8页
为了解江苏地区鸡源弯曲杆菌的分子特征,应用多位点序列分型方法(Multilocus squence typing,MLST)对2016—2018年分离的225株鸡源弯曲杆菌进行分子分型,采用BURST和BioNumerics软件进行聚类分析。结果显示:225株弯曲杆菌共获得89种序列... 为了解江苏地区鸡源弯曲杆菌的分子特征,应用多位点序列分型方法(Multilocus squence typing,MLST)对2016—2018年分离的225株鸡源弯曲杆菌进行分子分型,采用BURST和BioNumerics软件进行聚类分析。结果显示:225株弯曲杆菌共获得89种序列型,包括32种新序列型,57种已知序列型,其中38种已知序列型归属12种同源复合体(CC-828、CC464、CC-21、CC-45、CC-1150、CC-443、CC-460、CC-354、CC-52、CC-353、CC-179和CC-574),其中结肠弯曲杆菌和空肠弯曲杆菌分别以同源复合体CC-828和CC-464为主;BURST分析结果显示,179株57种已知序列型共分为2个克隆复合体和7个克隆群以及18个克隆单体;聚类分析结果显示,结肠弯曲杆菌主要聚为两个分支,菌株之间在进化上相对比较保守,而空肠弯曲杆菌分支比较复杂,具有丰富的遗传多样性。表明江苏省鸡源弯曲杆菌具有丰富的ST型,结肠弯曲杆菌和空肠弯曲杆菌流行具有明显的优势复合体,存在克隆传播,该结果为了解江苏省鸡源弯曲杆菌遗传特性提供了参考依据。 展开更多
关键词 鸡 空肠弯曲杆菌 结肠弯曲杆菌 多位点序列分型 分子特征
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副猪嗜血杆菌的MLST分析及数据库建立 被引量：4
15
作者 朱必凤 杨旭夫 +1 位作者 彭凌 韦昭玉 《南昌大学学报（理科版）》 CAS 北大核心 2011年第3期284-287,295,共5页
对副猪嗜血杆菌86个分离株的7个看家基因，包括ATP合成酶J9链（atpD）、翻译起始因子IF-2（in-fB）、核糖体蛋白口亚基（rpoB）、苹果酸脱氢酶（mdh）、6-磷酸葡萄糖脱氢酶（6pgd）、3-磷酸甘油醛脱氢酶（g3pd）和延胡索酸还原酶B（frd... 对副猪嗜血杆菌86个分离株的7个看家基因，包括ATP合成酶J9链（atpD）、翻译起始因子IF-2（in-fB）、核糖体蛋白口亚基（rpoB）、苹果酸脱氢酶（mdh）、6-磷酸葡萄糖脱氢酶（6pgd）、3-磷酸甘油醛脱氢酶（g3pd）和延胡索酸还原酶B（frdB）进行了PCR扩增；对扩增产物进行了测序；对序列编辑、队列比对、建立MI．ST定义、等位基因序列文件等，与牛津大学动物系KeithJolley合作建立了副猪嗜血杆菌86个分离株的MI。ST数据库。经MLST分析发现所研究的分离株有高度的遗传异源性，86个菌株被分成74个序列类型。基因平均距离为0．674，h-0．804。每个基因位点存在64～76不等数目的等位基因。基因序列多态性位点最大（fedB）达325和（6pgd）219，最小（in，-B）为77；用UPGMA分析确定了5个菌群。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 看家基因 多基因位点分析 序列分型
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不同毒力差异基因型的新生隐球菌MLST分型及交配型鉴定研究 被引量：2
16
作者 康颖倩 陈玉如 +4 位作者 王梅竹 赵亮 李小玲 金方 刘涛华 《中国真菌学杂志》 CSCD 2014年第5期264-267,共4页
目的了解及比较两组毒力差异明显的新生隐球菌格鲁比变种的多位点序列分型(MLST)的特点并进行交配型鉴定。方法采用多位点序列分型(MLST)的方法,设计7个看家基因(CAP59,GPD1,LAC1,PLB1,SOD1,URA5和IGS1)的引物,扩增并分析来源分别为环... 目的了解及比较两组毒力差异明显的新生隐球菌格鲁比变种的多位点序列分型(MLST)的特点并进行交配型鉴定。方法采用多位点序列分型(MLST)的方法,设计7个看家基因(CAP59,GPD1,LAC1,PLB1,SOD1,URA5和IGS1)的引物,扩增并分析来源分别为环境和临床的各10株新生隐球菌格鲁比变种的基因型,并鉴定实验菌株交配型,与多位点微卫星分型(MLMT)结果对比,比较不同基因分型方法在分类中的稳定性和可靠性。结果在微卫星分型中为MLMT-36的10株环境分离株,MLST分型为ST-15,而在微卫星分型中为MLMT-13型的10株临床分离株,MLST分型为ST-32,所有菌株交配型均为MAT-α。结论 MLST分型结果与MLMT分型结果高度一致,提示以上两种分子分型技术在真菌分类鉴定研究中可显示对于其分离背景及进化来源的高分辨率及稳定性。 展开更多
关键词 新生隐球菌 mlst分型 MLMT分型 交配型鉴定
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MLST分型技术在链球菌属中的相关参数 被引量：3
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作者 张颖 王卓林 +4 位作者 张志美 王艳萍 徐倩倩 郭时金 沈志强 《家畜生态学报》 北大核心 2013年第12期76-81,共6页
MLST分型技术是一种基于核酸序列测定的基因分型方法 ,该方法对多个管家基因进行序列分析,通过不同管家基因的分型来确定最终的序列分型。论文介绍了MLST技术在无乳链球菌、停乳链球菌似马亚种、肺炎链球菌、化脓性链球菌和猪链球菌中... MLST分型技术是一种基于核酸序列测定的基因分型方法 ,该方法对多个管家基因进行序列分析,通过不同管家基因的分型来确定最终的序列分型。论文介绍了MLST技术在无乳链球菌、停乳链球菌似马亚种、肺炎链球菌、化脓性链球菌和猪链球菌中的管家基因数目,引物序列和扩增片段大小,以期为微生物的分型奠定基础。 展开更多
关键词 mlst 链球菌 相关参数 管家基因
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MLST联合SCCmec基因分型与耐药性分析 被引量：6
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作者 纪冰 王凯凯 +4 位作者 赵红梅 董艳 孟玮 邢敏 孙吉花 《中国现代医学杂志》 CAS 2018年第10期32-36,共5页
目的了解滨州医学院附属医院MRSA菌株多位点序列分型(MLST)联合SCCmec基因型分布和各种基因型的耐药特征。方法采用聚合酶链反应(PCR)对MRSA菌株进行MLST联合SCCmec基因分型;采用Walk WAY96PLUS PC33药敏板检测MRSA抗菌药物敏感性。结果... 目的了解滨州医学院附属医院MRSA菌株多位点序列分型(MLST)联合SCCmec基因型分布和各种基因型的耐药特征。方法采用聚合酶链反应(PCR)对MRSA菌株进行MLST联合SCCmec基因分型;采用Walk WAY96PLUS PC33药敏板检测MRSA抗菌药物敏感性。结果 SCCmec基因分型结果以Ⅲ型为主(63/67株,占94.03%),MLST分型共检测出6种基因型:ST88、ST121、ST221、ST82、ST239及ST399,其中以ST239(61/67,91.04%)为主,耐药性分析显示SCCmecⅢ型MRSA菌株表现为多重耐药。结论ST239-MRSA-SCCmecⅢ型菌株为鲁北地区MRSA主要流行菌株,该型菌株对多种抗生素呈多重耐药;MLST联合SCCmec基因分型方法是MRSA遗传背景研究简便快速的方法。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 多位点序列分型 葡萄球菌mec盒式染色体 耐药
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奶牛临床型乳房炎MRSA新疆流行株耐药基因的检测及MLST分型研究 被引量：2
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作者 孟丹 孟庆玲 +4 位作者 乔军 彭叶龙 李重阳 才学鹏 陈创夫 《家畜生态学报》 北大核心 2018年第2期66-70,共5页
为了解新疆地区奶牛临床型乳房炎MRSA流行株耐药表型、耐药基因分布及分子分型特征,采用纸片扩散法检测了临床分离的71株金黄色葡萄球菌的耐药表型,并对MRSA进行判定;应用多重PCR方法对MRSA流行株进行耐药基因的检测及MLST分型。结果显... 为了解新疆地区奶牛临床型乳房炎MRSA流行株耐药表型、耐药基因分布及分子分型特征,采用纸片扩散法检测了临床分离的71株金黄色葡萄球菌的耐药表型,并对MRSA进行判定;应用多重PCR方法对MRSA流行株进行耐药基因的检测及MLST分型。结果显示,71株金黄色葡萄球菌中共检出13株MRSA,检出率为18.3%。13株MRSA流行株均检出mecA和linA耐药基因,检出率为100.0%;7株检出tetm耐药基因,检出率为53.8%;4株检出msrB耐药基因,检出率为30.8%;4株检出AacA-Da耐药基因,检出率为30.8%;MLST分型结果发现,13株MRSA可分为6种ST型,分别为ST188、ST9、ST63、ST2700、ST968、ST2373,其中ST9型流行较为广泛。本研究为新疆地区奶牛MRSA流行株的耐药特性及分子特征提供了理论基础,为兽医临床合理用药提供了科学依据。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 耐药基因 mlst分型
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禽源结肠弯曲杆菌的耐药性分析与MLST分型 被引量：3
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作者 王新 周婷 孟江洪 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期234-239,共6页
为了解禽肉结肠弯曲杆菌的耐药表型和分子型,采用琼脂平板稀释法和多位点序列分型(Multilocus Se-quence Typing,MLST)技术分别对54株禽肉结肠弯曲杆菌进行耐药性及分子分型研究。耐药性试验结果得到单重耐药菌株有41株(75.9%),分别是... 为了解禽肉结肠弯曲杆菌的耐药表型和分子型,采用琼脂平板稀释法和多位点序列分型(Multilocus Se-quence Typing,MLST)技术分别对54株禽肉结肠弯曲杆菌进行耐药性及分子分型研究。耐药性试验结果得到单重耐药菌株有41株(75.9%),分别是对环丙沙星耐药有9株(16.7%)、对强力霉素耐药有23株(42.6%)和对红霉素耐药有9株(16.7%);多重耐药菌株有10株(18.5%),其中4株(7.4%)对环丙沙星和强力霉素耐药,1株(1.9%)对环丙沙星和红霉素耐药,4株(7.4%)对红霉素和强力霉素耐药,1株(1.9%)对环丙沙星、红霉素和强力霉素耐药;所有菌株对硫酸庆大霉素敏感。MLST得到了38个(含1个新的)等位基因(allele);26个(含8个新的)序列型(Sequence type,ST);2个已知序列型克隆系(ST clonal complexes),ST-828克隆系(45株,83.3%)和ST-1150克隆系(3株,5.6%),以及5个(6株,11.1%)没有序列型克隆系。耐药性与序列型和序列克隆系相关性比较,相关性不大。结果提示,禽肉结肠弯曲杆菌出现了对环丙沙星、红霉素和强力霉素的单重及多重耐药菌株;禽肉中结肠弯曲杆菌主要流行ST-828克隆系;耐药性与序列型及序列克隆系相关性差,揭示耐药菌株来源广泛。 展开更多
关键词 结肠弯曲杆菌 耐药性 多位点序列分型 基因型
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