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MLST、特异基因扩增与传统沙门氏菌分型方法的比较
1
作者 李莹 《疾病预防控制通报》 2025年第4期92-94,共3页
目的 了解沙门氏菌传统玻片凝集法、多位点序列分型(multi locus sequence typing,MLST)和特异基因扩增方法分型的差异。方法 从2024年洛阳从事食品等行业人员健康体检粪便样本分离沙门氏菌48株,比较玻片凝集法等3种方法在血清分型成功... 目的 了解沙门氏菌传统玻片凝集法、多位点序列分型(multi locus sequence typing,MLST)和特异基因扩增方法分型的差异。方法 从2024年洛阳从事食品等行业人员健康体检粪便样本分离沙门氏菌48株,比较玻片凝集法等3种方法在血清分型成功率、手工操作时间(hands on time,HOT)、总周转时间(total turnaround time,TAT)、操作难度和成本方面的差异。结果 玻片凝集法分型成功率83.33%,HOT为1 h、TAT为3~6 d,分型成本160元/株,对操作技术和抗血清质量要求高;MLST分型成功率97.92%,HOT为0.5 h、TAT为3~5 d,分型成本430元/株,操作仅需要细菌DNA提取技术;特异基因扩增法分型成功率79.17%,HOT为0.5 h、TAT为1.44 h,分型成本100元/株,要求操作熟悉PCR操作技术。结论 玻片凝集法对技术和抗血清质量要求较高、操作流程长;MLST法分型成功率高、技术要求低、成本较高;特异基因扩增技术要求低、操作流程短、成本低。 展开更多
关键词 沙门氏菌 血清分型 mlst 成功率
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辽宁省市售禽肉中沙门氏菌的污染状况及其MLST分型与耐药性分析 被引量：8
2
作者 于淼 耿英芝 +2 位作者 张铭琰 刘海霞 张眉眉 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2486-2493,共8页
【背景】沙门氏菌(Salmonella)是重要的人畜共患病原菌,可通过禽类及其产品传播给人类,对人类健康造成威胁。了解市售禽肉中沙门氏菌病原学特征及耐药情况,对公共卫生具有重要意义。【目的】了解2022年辽宁省市售禽肉中沙门氏菌的污染... 【背景】沙门氏菌(Salmonella)是重要的人畜共患病原菌,可通过禽类及其产品传播给人类,对人类健康造成威胁。了解市售禽肉中沙门氏菌病原学特征及耐药情况,对公共卫生具有重要意义。【目的】了解2022年辽宁省市售禽肉中沙门氏菌的污染状况、血清型分布、药物敏感性及分子流行特征情况,探讨不同血清型与多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、耐药性之间的关系。【方法】依据GB4789.4―2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》检验方法对收集的样品进行检测及生化实验鉴定,采用玻片凝集法进行血清学实验,用微量肉汤法对菌株进行药物敏感性试验,使用BioNumerics7.6软件对药敏结果、MLST分型结果进行分析。【结果】53株沙门氏菌包含11种血清型,以肠炎沙门氏菌(Salmonella enteritidis)为主。药物敏感性分析中,沙门氏菌对萘啶酸(nalidixic acid,NAL)的耐药率最高,为92.5%(49/53),共发现有25种多重耐药谱,总耐药率为66.0%(35/53),在耐药基因分析中,四环素类耐药基因tetC携带率最高为45.3%(24/53)。根据7种管家基因的序列沙门氏菌被分为10个ST型别和1个未分型型别。【结论】辽宁省市售禽肉沙门氏菌的污染率较为严重,血清型多样化,整体耐药水平较高,多重耐药情况严重,应加强对禽类规范化养殖。 展开更多
关键词 禽肉 沙门氏菌 mlst 耐药性 耐药基因
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生鲜蔬菜来源的蜡样芽胞杆菌毒力基因分布与MLST分析 被引量：1
3
作者 瞿洋 杨正阳 +2 位作者 周昌艳 林婷 索玉娟 《上海农业学报》 2024年第3期79-85,共7页
为了解生鲜蔬菜来源蜡样芽胞杆菌的分子流行病学特征,采用PCR技术对来自5种生鲜蔬菜的37株蜡样芽胞杆菌分离株进行了毒力基因(nheA、nheB、nheC、hblA、hblC、hblD、entFM、cytK、ces)检测和多位点序列分型(MLST)分析。结果表明:37株分... 为了解生鲜蔬菜来源蜡样芽胞杆菌的分子流行病学特征,采用PCR技术对来自5种生鲜蔬菜的37株蜡样芽胞杆菌分离株进行了毒力基因(nheA、nheB、nheC、hblA、hblC、hblD、entFM、cytK、ces)检测和多位点序列分型(MLST)分析。结果表明:37株分离株除呕吐毒素基因ces未检出外,其他8个毒力基因均有检出,其中溶血性肠毒素基因nheB的检出率最高,为94.6%,其次为溶血素基因hblC、hblD、hblA和肠毒素基因entFM,检出率均超过80%,溶血性肠毒素基因nheA和nheC检出率较低,分别为78.4%和64.9%;细胞毒素基因cytK的检出率最低,为29.7%。根据毒力基因携带模式,将37株分离菌株分成14个型别,II型携带率最高,携带Hbl和Nhe两种基因的型别有I型、II型和IV型。MLST分析则发现,37株分离菌株可分为30个ST型和5个CC群。ST4和ST378为主要ST型;CC142分布最广泛,不仅包含的ST型最多,而且携带5种毒力型别。以上结果表明,上海市蔬菜中蜡样芽胞杆菌具有潜在肠毒性危害并在遗传上呈现出多样性。该结果对蔬菜中蜡样芽胞杆菌引起食物的监控、预警和爆发后感染源追踪具有指导意义。 展开更多
关键词 蜡样芽胞杆菌 蔬菜 毒力基因 mlst
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养殖环境及贝源溶藻弧菌MLST分型及其毒力基因、耐药性分析 被引量：8
4
作者 郑玉东 张翔 +6 位作者 姚梦丽 谷莉 黄博闻 辛鲁生 白昌明 王崇明 唐小千 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2024年第1期211-223,共13页
溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)是近年来贝类病害中最常见的细菌性病原之一,对贝类养殖产业的健康发展构成严重威胁。本研究旨在分析不同养殖环境水体和贝类组织中,溶藻弧菌的基因变异、毒力基因、耐药性及其分布规律。对12株溶藻弧菌... 溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)是近年来贝类病害中最常见的细菌性病原之一,对贝类养殖产业的健康发展构成严重威胁。本研究旨在分析不同养殖环境水体和贝类组织中,溶藻弧菌的基因变异、毒力基因、耐药性及其分布规律。对12株溶藻弧菌分离株开展多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、毒力因子以及菌株耐药性分析,结果显示,12株溶藻弧菌的序列型(sequence typing,ST)分型互不相同,7株为Pub MLST数据库已经收录的ST型,5株因管家基因的等位基因位点变化而形成新的ST型,贝类养殖环境中的溶藻弧菌具有较高的遗传多样性。12株溶藻弧菌都携带tlh、fur和collagenase三种毒力基因,但均未检测到tdh、trh、toxR和tcpA毒力基因。溶藻弧菌携带毒力因子的种类和数量受地区分布等因素的影响。不同来源的溶藻弧菌均具有多重耐药特征,对青霉素和氨苄西林产生抗性。本研究表明,贝类养殖环境中的溶藻弧菌具有种群复杂、遗传多样性高的特点;不同来源菌株在毒力基因携带和耐药性方面存在较大差异。本研究通过探究不同区域内不同来源的溶藻弧菌遗传变异及耐药性差异,对贝源溶藻弧菌的有效防控提供一定理论参考。 展开更多
关键词 溶藻弧菌 mlst 毒力基因 耐药性分析
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新疆维吾尔自治区阿克苏地区某屠宰场羊源大肠杆菌MLST分型、耐药性分析和毒力基因检测 被引量：1
5
作者 李广西 韩婷婷 +1 位作者 吴自豪 吴静 《畜牧与饲料科学》 2024年第2期95-102,共8页
[目的]了解新疆维吾尔自治区阿克苏地区屠宰场羊源大肠杆菌的流行情况以及耐药性和毒力基因分布特征。[方法]从阿克苏地区某屠宰场采集健康羊的淋巴结、胴体拭子、粪便样本共30份,使用选择性培养基分离大肠杆菌,然后采用大肠杆菌特异性p... [目的]了解新疆维吾尔自治区阿克苏地区屠宰场羊源大肠杆菌的流行情况以及耐药性和毒力基因分布特征。[方法]从阿克苏地区某屠宰场采集健康羊的淋巴结、胴体拭子、粪便样本共30份,使用选择性培养基分离大肠杆菌,然后采用大肠杆菌特异性phoA基因对其进行分子生物学鉴定;利用PCR扩增及测序技术对大肠杆菌分离株进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST);采用K-B纸片扩散法开展分离菌株对抗菌药物的敏感性试验;应用PCR技术检测分离菌株的耐药基因和毒力基因携带情况;使用96孔板微量肉汤法测定分离菌株的生物被膜形成能力。[结果]从30份样本中分离得到14株大肠杆菌,分离率为46.67%;14株分离株分属于10个MLST型别;对复方新诺明(100%)、青霉素(85.71%)和四环素(50.00%)耐药率较高,9株菌具有多重耐药表型(64.29%);在14株大肠杆菌中检测到blaTEM(85.71%)、aph(3′)(71.43%)、tetA(64.29%)、sul1(57.14%)和sul2(57.14%)等12种耐药基因,并且8株菌携带Ⅰ型整合子int-Ⅰ基因(57.14%);在14株大肠杆菌中检测到fimH(100%)、yijP(92.86%)、mat(92.86%)、sheA(92.86%)、stx1(35.71%)和ibeB(28.57%)等10种毒力基因;10株大肠杆菌具有生物被膜形成能力(71.43%)。[结论]该屠宰场羊源大肠杆菌种内分型丰富,具有较强的耐药性,还可形成生物被膜,并且携带多种耐药基因和毒力基因,对动物性食品安全可能存在潜在威胁。 展开更多
关键词 大肠杆菌 mlst分型 耐药性 毒力基因 生物被膜
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新疆驼乳源金黄色葡萄球菌MLST分型与毒力基因检测 被引量：2
6
作者 吴自豪 蔡依龙 +1 位作者 池昊明 陈伟 《塔里木大学学报》 2024年第2期12-18,共7页
为了解驼乳源金黄色葡萄球菌多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLST)与毒力基因携带情况,本试验对新疆驼乳源分离得到的金黄色葡萄球菌进行MLST、药物敏感性检测、生物被膜形成能力和溶血性检测以及毒力基因检测。结果表明,... 为了解驼乳源金黄色葡萄球菌多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLST)与毒力基因携带情况,本试验对新疆驼乳源分离得到的金黄色葡萄球菌进行MLST、药物敏感性检测、生物被膜形成能力和溶血性检测以及毒力基因检测。结果表明,金黄色葡萄球菌在健康生驼乳中的分离率为5%(4/80);4株金黄色葡萄球菌分别属于ST8114、ST8119、ST2073和ST130(其中ST8114和ST8119为新的序列型),对12种抗菌药物全部敏感;在4株驼乳源金黄色葡萄球菌中可检测到sei、hla、hlb、clfA和clfB等毒力基因,并且均具有生物被膜形成能力和溶血活性。说明新疆驼乳源金黄色葡萄球菌分型丰富,在宿主致病和食品生产安全等方面存在隐患。本研究可为新疆驼乳源金黄色葡萄球菌的相关研究提供基础试验数据。 展开更多
关键词 驼乳 金黄色葡萄球菌 mlst分型 毒力基因 生物被膜
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新疆库车市和皮山县驴乳源金黄色葡萄球菌的MLST分型、毒力基因和耐药性检测
7
作者 吴自豪 刘英杰 +1 位作者 蔡依龙 陈伟 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第11期78-83,共6页
为了了解驴乳源金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的流行情况,试验对从新疆驴乳中分离得到的金黄色葡萄球菌进行多位点序列分型(MLST分型)、药敏试验,以及生物被膜形成能力、毒力基因和溶血活性检测。结果表明:金黄色葡萄球菌在健... 为了了解驴乳源金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的流行情况,试验对从新疆驴乳中分离得到的金黄色葡萄球菌进行多位点序列分型(MLST分型)、药敏试验,以及生物被膜形成能力、毒力基因和溶血活性检测。结果表明:金黄色葡萄球菌在健康驴乳中的分离率为8%(6/75),6株金黄色葡萄球菌分别属于5个MLST分型(STs),即ST6238、ST8115、ST8116、ST8126和ST1660(其中ST8115、ST8116和ST8126为新发现的STs)。所有分离株对青霉素、克林霉素、红霉素和利福平等有不同程度的耐受,其中4株为耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌(MRSA),并且有2株MRSA对利奈唑胺耐药;4株金黄色葡萄球菌具有生物被膜形成能力。在驴乳金黄色葡萄球菌中检测到11种毒力基因,分别为sea、sec、seh、sei、tsst-1、hla、hlb、eta、clfA、clfB和cna基因,并且均具有溶血活性。说明驴乳源金黄色葡萄球菌具有较强的耐药性,而且在宿主致病和食品生产安全等方面具有潜在威胁。 展开更多
关键词 驴乳 mlst分型 耐药性 MRSA 毒力基因
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B族链球菌耐药性、耐药基因及MLST分型分析
8
作者 杨琰琰 王晓伟 +1 位作者 王泽华 杜慧贞 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第11期2077-2081,共5页
目的调查青岛地区孕晚期妇女B族链球菌(GBS)耐药性、耐药基因及MLST分型特点,为临床提供参考。方法收集2021年1月至12月山东大学齐鲁医院(青岛)的孕晚期妇女阴道⁃直肠拭子1573份,分离培养后进行菌株鉴定和药敏试验,然后对其耐药基因和... 目的调查青岛地区孕晚期妇女B族链球菌(GBS)耐药性、耐药基因及MLST分型特点,为临床提供参考。方法收集2021年1月至12月山东大学齐鲁医院(青岛)的孕晚期妇女阴道⁃直肠拭子1573份,分离培养后进行菌株鉴定和药敏试验,然后对其耐药基因和管家基因进行扩增、测序,与MLST官网数据库进行比对获得ST分型。结果分离鉴定出GBS菌株63株,定植率为4.01%,对青霉素、氨苄西林、利奈唑胺、万古霉素均为敏感;红霉素耐药菌株中ermB检出率最高,为80.00%,克林霉素耐药菌株中linB被检出,为6.38%;MLST分型鉴定出16种ST型,其中ST10占比最高,为33.33%,且不同MLST分型菌株对四环素、左氧氟沙星、莫西沙星的耐药率比较差异有统计学意义(χ^(2)=33.221、49.137、49.137,P<0.05),不同MLST分型菌株对耐药基因ermB、ermC的携带率比较差异有统计学意义(χ^(2)=16.504、25.705,P<0.05),不同MLST分型菌株之间的多重耐药率比较差异具有统计学意义(χ^(2)=18.858、31.819、26.706,P<0.05)。结论青岛地区孕晚期妇女GBS的定植率在全国处于偏低水平,但GBS菌株多重耐药比例较高。青霉素、氨苄西林仍然可作为防治孕晚期妇女GBS感染的一线药物,对青岛地区临床GBS合理用药具有重要的借鉴意义。 展开更多
关键词 B族链球菌 耐药性 耐药基因 mlst分型
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多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用 被引量：13
9
作者 刘祥 许彦梅 +6 位作者 王斌 邓建平 肖波 孙松松 周阳 熊衍文 王红 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1033-1036,共4页
目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等... 目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。 展开更多
关键词 多位点序列分型技术(mlst) 艾伯特埃希菌 新病原
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利用MLST技术对浙江省大肠杆菌O157的分子流行病学研究 被引量：7
10
作者 叶菊莲 占利 +3 位作者 梅玲玲 罗芸 姚苹苹 姜理平 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期901-904,共4页
目的对浙江省2005-2010年大肠杆菌O157分离株进行分子分型研究,了解菌株间的遗传进化关系,为浙江省大肠杆菌O157监测及爆发疫情的控制提供基础。方法选择Pasteur大肠杆菌多位点序列分型(Multilocus SequenceTyping,MLST)方案,对大肠杆菌... 目的对浙江省2005-2010年大肠杆菌O157分离株进行分子分型研究,了解菌株间的遗传进化关系,为浙江省大肠杆菌O157监测及爆发疫情的控制提供基础。方法选择Pasteur大肠杆菌多位点序列分型(Multilocus SequenceTyping,MLST)方案,对大肠杆菌O157分离株及882364菌株进行MLST分型,确定菌株序列型(Sequence type,ST);采用DNAsp、eBURST、START2等软件进行分析。结果 30株菌中,27株O157∶H7菌株具备相同序列型(ST-284),占90%(27/30),其他3株菌序列型分别为ST-367、ST-125、ST-296。8个管家基因核苷酸多态性(Pi)范围为0.00119(polB)～0.00648(uidA),putP基因多态性位点比例最高(4.6%),trpA基因多态性位点比例最低(0.4%)。进化分析结果显示,这些序列型分别属于Group 1及Group 11群。结论浙江省动物源性大肠杆菌O157∶H7的主要序列型为ST-284,与江苏省病人株882364(ST-296)具有同一个进化祖先,提示应加强浙江省大肠杆菌O157病原学监测。 展开更多
关键词 大肠杆菌O157 多位点序列分型(mlst) 管家基因 分子流行病学
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2005年广东省临床分离猪链球菌的MLST分子分型研究 被引量：14
11
作者 王洪敏 柯昌文 +7 位作者 潘武滨 柯碧霞 陈经雕 邓小玲 刘美真 陈国仁 杨杏芬 朱振宇 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1438-1441,1445,共5页
在2005年四川发生猪链球菌人间感染疫情期间,广东省也加强了监测,并发现了5个散发感染病例。从这5个住院临床病例中,分别分离了5个致病性SS2。通过测定猪链球菌基因组上的7个看家基因dpr、thrA、cpn60、recA、gki、aroA和mutS的部分片段... 在2005年四川发生猪链球菌人间感染疫情期间,广东省也加强了监测,并发现了5个散发感染病例。从这5个住院临床病例中,分别分离了5个致病性SS2。通过测定猪链球菌基因组上的7个看家基因dpr、thrA、cpn60、recA、gki、aroA和mutS的部分片段,对这5个猪链球菌进行了多位点测序分型。通过对上述测序片段进行比对分析发现,5个菌株的dpr、cpn60、recA、gki、aroA和mutS等6个基因片段完全相同;而thrA基因片段存在两个等位基因型即thrA-c和thrA-h,在该等位基因片段的360位的亮氨酸密码子第三位发生了一个中性突变(TTA→TTG)。MLST分析结果显示,广东省的临床猪链球菌分离株L-SS002、L-SS003和L-SS005菌株,与四川疫情株相同,属于ST7型;而L-SS004和L-SS006,与香港地区发现的猪链球菌相同,属于ST1克隆;但这5个菌株亲缘关系极近,都属于ST1克隆复合物;这一点与四川省暴发的人间猪链疫情明显不同,后者仅由单一的ST7猪链球菌克隆引起。属于ST7的克隆菌株很可能来源于四川;而其余两个ST1克隆系菌株的来源尚待鉴定。 展开更多
关键词 猪链球菌 分子分型 DNA测序 mlst
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四川部分地区禽源空肠弯曲菌MLST分型及遗传进化分析 被引量：4
12
作者 姚学萍 张博 +6 位作者 王寒 邬旭龙 周丽军 曹随忠 王印 杨泽晓 德西措姆 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期5-10,共6页
目的为了解四川部分地区分离到的48株禽源空肠弯曲菌间的分子特征,以对来源不同的空肠弯曲菌进行分子分型及遗传进化分析。方法本研究参照MLST数据库,选取了空肠弯曲菌MLST分型7个管家基因aspA,glnA,glyA,gltA,tkt,pgm和uncA作为目的基... 目的为了解四川部分地区分离到的48株禽源空肠弯曲菌间的分子特征,以对来源不同的空肠弯曲菌进行分子分型及遗传进化分析。方法本研究参照MLST数据库,选取了空肠弯曲菌MLST分型7个管家基因aspA,glnA,glyA,gltA,tkt,pgm和uncA作为目的基因分别扩增及测序,并将所得序列经比对后进行遗传进化分析。结果 48株分离株中共含24种不同的序列型分属于9种不同的克隆系及11种独特型,其中22株分离株含有新序列型,占分离株的45.83%(22/48);9种不同的克隆系中以CC-21、CC-353、CC-464克隆系所含菌株相对较多,而克隆系CC-45、CC-48最少,均为1株分离株;11种独特型共存于21株分离株中,其中以ST-8675序列型最多,为8株。遗传进化树显示,属同一克隆系的不同型别间的分离株亲缘关系较近,如同属于CC-21克隆系的ST-298与ST-760型别分离株处于同一小分支、亲缘关系较近,但不同克隆系的分离株间遗传进化关系较远,鹌鹑源分离株(V13-20)单独处于一大分支与其余禽源分离株间的亲缘关系最远。总体而言,不同地区、宿主来源的分离株呈现遗传多样性。结论本研究中分离株间具有基因多样性,MLST分型为了解该地区空肠弯曲菌的遗传特性和分布特点提供了参考依据。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 mlst分型 管家基因 遗传进化
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乡村医疗机构与城市医院来源的艰难梭菌MLST分型对比研究 被引量：3
13
作者 李文革 靳会娟 +3 位作者 岑瑞琦 程颖 卢金星 曹波 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期2699-2701,共3页
目的初步了解农村社区艰难梭菌流行状况及分子生物学特征。方法对河南省济源市某乡村医疗机构送检的7株艰难梭菌进行生化鉴定和分子生物学方法鉴定,并进行MLST分型分析,同时与北京某三甲医院的84株艰难梭菌进行对比,用eBURST软件聚类分... 目的初步了解农村社区艰难梭菌流行状况及分子生物学特征。方法对河南省济源市某乡村医疗机构送检的7株艰难梭菌进行生化鉴定和分子生物学方法鉴定,并进行MLST分型分析,同时与北京某三甲医院的84株艰难梭菌进行对比,用eBURST软件聚类分析,寻找其中可能的关联。结果源自河南济源市某乡村医院的7株菌均属艰难梭菌,PCR毒素基因鉴定结果显示,其中两株为A-B+菌株,其MLST分型结果是ST37;5株为A+B+菌株,其中4株对应ST35,1株对应ST3;两重来源的菌株中均是毒素基因A+B+菌株占优势;乡村医疗机构的7株艰难梭菌中未发现新的与David MLST数据库中不同的ST型别,未发现不同于北京城市医院的ST型别。结论 David方案适合种群结构和全球流行病学研究,且其数据库全球共享,便于数据交换;该次研究中未发现新的ST型别,所有菌株ST呈散在分布。 展开更多
关键词 艰难梭菌 mlst分型 城市医院 农村社区
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北京市西城区食源性与临床感染性单核细胞增生李斯特菌PFGE和MLST分型研究 被引量：9
14
作者 霍哲 王晨 +2 位作者 徐俊 高波 曹玮 《中国预防医学杂志》 CAS CSCD 2017年第9期675-679,共5页
目的研究北京市西城区食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌(listeria monocytogenes,Lm)的脉冲场凝胶电泳(plused-field gel electrophoresis,PFGE)和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)分型特征,分析两种分型方法的... 目的研究北京市西城区食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌(listeria monocytogenes,Lm)的脉冲场凝胶电泳(plused-field gel electrophoresis,PFGE)和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)分型特征,分析两种分型方法的应用价值。方法采用PFGE和MLST两种方法对2012-2015年50株食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌进行分型研究。结果 50株单核细胞增生李斯特菌PFGE分型得到23种型别,GX6A16.CN0004为优势带型。MLST分析获得12个型别,ST9为优势型别。其中5组数据是ST型别只对应一种PFGE型别,3种PFGE型别同时存在食源性和临床感染性单核细胞增生李斯特菌,并且其ST型别进化关系比较远。结论北京市西城区不同来源单核细胞增生李斯特菌污染长期存在,出现致病型别,并且致病性单核细胞增生李斯特菌的遗传关系呈多元化。两种分子分型方法的结合,从基因水平上解释了单核细胞增生李斯特菌的变化趋势及流行特征。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 PFGE分型 mlst分型 进化树 分子分型 食源性致病菌 人源性
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上海市动物源性食品中单增李斯特菌的MLST分析 被引量：9
15
作者 刘萍萍 王少辉 +5 位作者 赵秋华 李蓓蓓 邵东华 史子学 魏建超 马志永 《中国动物传染病学报》 CAS 2013年第4期18-22,共5页
为了解上海市动物性食品中单增李斯特菌的进化情况和群体遗传学特征,本研究采用MLST法和eBURST软件对33株分离株进行分子分型及进化树分析。结果共分成8个型别,并且33株单增李斯特菌之间遗传相关性不是很大。分为4个进化谱系:ST11和ST19... 为了解上海市动物性食品中单增李斯特菌的进化情况和群体遗传学特征,本研究采用MLST法和eBURST软件对33株分离株进行分子分型及进化树分析。结果共分成8个型别,并且33株单增李斯特菌之间遗传相关性不是很大。分为4个进化谱系:ST11和ST196为一个进化谱系,ST9、ST8和ST155为一个进化谱系,ST87和ST277/589为一个进化谱系,所占比例最多的ST121单独一个进化谱系。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 mlst分型 管家基因 进化树
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浙江省三地区冷鲜鸡中大肠埃希菌耐药谱测定及MLST分子分型分析 被引量：2
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作者 杨华 何祥祥 +3 位作者 肖英平 钱鸣蓉 张巧艳 唐标 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期888-893,共6页
大肠埃希菌是食品中普遍污染的条件致病菌,其耐药性非常严重,耐药基因具有极大的传播风险。为了解浙江省地区禽源大肠埃希菌耐药性特点及分布规律,试验从浙江省3个地区市售冷鲜鸡中分离了59株大肠埃希菌并测定了耐药谱,发现有24种耐药谱... 大肠埃希菌是食品中普遍污染的条件致病菌,其耐药性非常严重,耐药基因具有极大的传播风险。为了解浙江省地区禽源大肠埃希菌耐药性特点及分布规律,试验从浙江省3个地区市售冷鲜鸡中分离了59株大肠埃希菌并测定了耐药谱,发现有24种耐药谱,显示了分离株耐药类型的多样性。同时对分离株进行了Multilocus sequence typing(MLST)分子分型,获得38个已知ST型,并发现2个新的ST型。在此基础上,针对7个看家基因进行了系统发育分析,分离株显示了一定的地区差异性。该试验结果可为浙江省禽源大肠埃希菌的耐药性评价和溯源分析提供参考依据。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 细菌耐药性 多位点序列分型(mlst) 系统发育树
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广州市两例B群流脑病例分离株的MLST分型研究 被引量：2
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作者 张欣强 李孝权 +2 位作者 夏丹 张晶 崔敏 《中国预防医学杂志》 CAS 2013年第6期462-464,共3页
目的对从广州市报告的两例B群流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例中分离的4株脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)进行多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)研究。方法分纯并提取菌株DNA、运用MLST分析对7个管家基因进行扩... 目的对从广州市报告的两例B群流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例中分离的4株脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)进行多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)研究。方法分纯并提取菌株DNA、运用MLST分析对7个管家基因进行扩增并测序,确定菌株的序列型,对其相关性进行分析。结果两例病例分离株7个管家基因位点序列均不相同,第一例病例分离株的序列型为ST-7型,属高致病性ST-5complex/subgroup III克隆系;第二例病例分离株的序列型为新发现的ST-9804型。结论广州两例B群流脑病例虽然发生时间相近,但分属不同的序列型,无同源性。MLST分型技术对研究不同流脑病例间的流行病学关系有重要意义。 展开更多
关键词 流行性脑脊髓膜炎 脑膜炎奈瑟菌 多位点序列分型(mlst)
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不同毒力差异基因型的新生隐球菌MLST分型及交配型鉴定研究 被引量：2
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作者 康颖倩 陈玉如 +4 位作者 王梅竹 赵亮 李小玲 金方 刘涛华 《中国真菌学杂志》 CSCD 2014年第5期264-267,共4页
目的了解及比较两组毒力差异明显的新生隐球菌格鲁比变种的多位点序列分型(MLST)的特点并进行交配型鉴定。方法采用多位点序列分型(MLST)的方法,设计7个看家基因(CAP59,GPD1,LAC1,PLB1,SOD1,URA5和IGS1)的引物,扩增并分析来源分别为环... 目的了解及比较两组毒力差异明显的新生隐球菌格鲁比变种的多位点序列分型(MLST)的特点并进行交配型鉴定。方法采用多位点序列分型(MLST)的方法,设计7个看家基因(CAP59,GPD1,LAC1,PLB1,SOD1,URA5和IGS1)的引物,扩增并分析来源分别为环境和临床的各10株新生隐球菌格鲁比变种的基因型,并鉴定实验菌株交配型,与多位点微卫星分型(MLMT)结果对比,比较不同基因分型方法在分类中的稳定性和可靠性。结果在微卫星分型中为MLMT-36的10株环境分离株,MLST分型为ST-15,而在微卫星分型中为MLMT-13型的10株临床分离株,MLST分型为ST-32,所有菌株交配型均为MAT-α。结论 MLST分型结果与MLMT分型结果高度一致,提示以上两种分子分型技术在真菌分类鉴定研究中可显示对于其分离背景及进化来源的高分辨率及稳定性。 展开更多
关键词 新生隐球菌 mlst分型 MLMT分型 交配型鉴定
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MLST分型技术在链球菌属中的相关参数 被引量：3
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作者 张颖 王卓林 +4 位作者 张志美 王艳萍 徐倩倩 郭时金 沈志强 《家畜生态学报》 北大核心 2013年第12期76-81,共6页
MLST分型技术是一种基于核酸序列测定的基因分型方法 ,该方法对多个管家基因进行序列分析,通过不同管家基因的分型来确定最终的序列分型。论文介绍了MLST技术在无乳链球菌、停乳链球菌似马亚种、肺炎链球菌、化脓性链球菌和猪链球菌中... MLST分型技术是一种基于核酸序列测定的基因分型方法 ,该方法对多个管家基因进行序列分析,通过不同管家基因的分型来确定最终的序列分型。论文介绍了MLST技术在无乳链球菌、停乳链球菌似马亚种、肺炎链球菌、化脓性链球菌和猪链球菌中的管家基因数目,引物序列和扩增片段大小,以期为微生物的分型奠定基础。 展开更多
关键词 mlst 链球菌 相关参数 管家基因
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奶牛临床型乳房炎MRSA新疆流行株耐药基因的检测及MLST分型研究 被引量：2
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作者 孟丹 孟庆玲 +4 位作者 乔军 彭叶龙 李重阳 才学鹏 陈创夫 《家畜生态学报》 北大核心 2018年第2期66-70,共5页
为了解新疆地区奶牛临床型乳房炎MRSA流行株耐药表型、耐药基因分布及分子分型特征,采用纸片扩散法检测了临床分离的71株金黄色葡萄球菌的耐药表型,并对MRSA进行判定;应用多重PCR方法对MRSA流行株进行耐药基因的检测及MLST分型。结果显... 为了解新疆地区奶牛临床型乳房炎MRSA流行株耐药表型、耐药基因分布及分子分型特征,采用纸片扩散法检测了临床分离的71株金黄色葡萄球菌的耐药表型,并对MRSA进行判定;应用多重PCR方法对MRSA流行株进行耐药基因的检测及MLST分型。结果显示,71株金黄色葡萄球菌中共检出13株MRSA,检出率为18.3%。13株MRSA流行株均检出mecA和linA耐药基因,检出率为100.0%;7株检出tetm耐药基因,检出率为53.8%;4株检出msrB耐药基因,检出率为30.8%;4株检出AacA-Da耐药基因,检出率为30.8%;MLST分型结果发现,13株MRSA可分为6种ST型,分别为ST188、ST9、ST63、ST2700、ST968、ST2373,其中ST9型流行较为广泛。本研究为新疆地区奶牛MRSA流行株的耐药特性及分子特征提供了理论基础,为兽医临床合理用药提供了科学依据。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 耐药基因 mlst分型
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