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丹江口水库2-甲基异莰醇来源解析及产嗅潜力评估
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作者 赵媛 刘畅 +3 位作者 雷欢 高广斌 陈威 马沛明 《人民长江》 北大核心 2026年第3期8-15,共8页
近年来,由2-甲基异莰醇(2-MIB)引起的嗅味问题屡有报道,已成为全球水质安全管理中的突出挑战。监测显示,2025年8月中下旬,南水北调中线工程干渠陶岔断面2-MIB浓度均值达到29.0 ng/L。为揭示2-MIB的生物来源及产嗅潜力,综合采用显微镜形... 近年来,由2-甲基异莰醇(2-MIB)引起的嗅味问题屡有报道,已成为全球水质安全管理中的突出挑战。监测显示,2025年8月中下旬,南水北调中线工程干渠陶岔断面2-MIB浓度均值达到29.0 ng/L。为揭示2-MIB的生物来源及产嗅潜力,综合采用显微镜形态学鉴定、mic基因高通量测序、定量PCR,对丹江口水库藻类异常增殖期蓝藻群落结构、潜在产嗅类群及mic基因丰度的时空分布特征进行了系统分析。形态学鉴定显示,蓝藻群落以隐球藻(Aphanocapsa)、尖头藻(Raphidiopsis)和细鞘丝藻(Leptolyngbya)为优势属,分子生物学方法揭示了更多生态功能显著的低丰度类群。拟浮丝藻(Planktothricoides)和假鱼腥藻(Pseudanabaena)为主要潜在产嗅类群,前者在携带mic基因的群落中占比达64.2%~93.3%,并与mic基因丰度呈显著正相关,推断为2-MIB的主要贡献者。mic基因拷贝数为3.14×10^(5)~2.00×10^(7) copies/L,呈现显著的空间差异与垂向分层特征,以陶岔次表层水体中丰度为最高。研究证实,形态学与分子生物学方法相结合能够有效提升产嗅藻类识别与风险评估的准确性,从而为饮用水水源地2-MIB风险早期预警与控制提供科学依据。 展开更多
关键词 2-甲基异莰醇 嗅味物质 定量PCR 16S rRNA测序 mic基因 丹江口水库
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mic2/CD99在经典型霍奇金淋巴瘤H/RS细胞中的表达及与Eber-1/LMP-1相关性的研究 被引量:9
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作者 沈丽佳 何滢 +3 位作者 蒋会勇 谢思明 朱梅刚 赵彤 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期776-780,共5页
目的:检测mic2基因与CD99蛋白和Eber-1基因与潜伏膜蛋白-1(LMP1)在经典型霍奇金淋巴瘤(cHL)H/RS细胞中的表达,探讨mic2/CD99表达与Eber-1/LMP-1的相关性。方法:采用分子原位杂交和免疫组化技术并结合组织芯片技术检测59例石蜡包埋淋巴... 目的:检测mic2基因与CD99蛋白和Eber-1基因与潜伏膜蛋白-1(LMP1)在经典型霍奇金淋巴瘤(cHL)H/RS细胞中的表达,探讨mic2/CD99表达与Eber-1/LMP-1的相关性。方法:采用分子原位杂交和免疫组化技术并结合组织芯片技术检测59例石蜡包埋淋巴瘤组织标本[43例cHL,16例非霍奇金淋巴瘤(NHL)]mic2/CD99和Eber-1/LMP-1的表达,比较分析mic2/CD99在两组中的表达及与Eber-1/LMP-1的关系。结果:cHL组CD99蛋白表达阳性率为2·3%,mic2基因表达为55·8%,LMP1表达为58·1%,Eber-1表达为53·5%;NHL组CD99蛋白与mic2基因表达高于cHL组(P<0·05);LMP1和Eber-1的表达低于cHL组(P<0·05);mic2基因的表达高于CD99蛋白的表达(P<0·05);Eber-1与LMP1的表达无统计学意义(P>0·05)。CD99蛋白与LMP1的表达呈负相关(P<0·05),各项指标的表达与性别无关。CD99蛋白与LMP1的表达与年龄呈负相关(P<0·05),mic2与Eber-1的表达与年龄无关(P>0·05)。结论:CD99蛋白在cHL H/RS细胞中低表达,并与LMP1的表达呈负相关。 展开更多
关键词 霍奇金淋巴瘤 基因 mic2 基因 Eber-1 蛋白质CD99 潜伏膜蛋白质1
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mic2/CD99基因克隆及在霍奇金淋巴瘤L428细胞株中表达 被引量:3
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作者 黄作平 何滢 +5 位作者 周新华 韩西群 吴自勍 张艳 温宗华 赵彤 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期2407-2409,共3页
目的克隆mic2/CD99基因并表达于L428细胞株。方法通过PCR及双酶切方法,从Jurkat细胞基因组RNA中获得mic2/CD99全长基因编码序列,克隆到pcDNA3.1(+)质粒载体上,构建包含mic2/CD99全长基因载体;用脂质体转染法将mic2/CD99全长基因载体转染... 目的克隆mic2/CD99基因并表达于L428细胞株。方法通过PCR及双酶切方法,从Jurkat细胞基因组RNA中获得mic2/CD99全长基因编码序列,克隆到pcDNA3.1(+)质粒载体上,构建包含mic2/CD99全长基因载体;用脂质体转染法将mic2/CD99全长基因载体转染至L428细胞系;并从分子水平验证其存在。结果RT-PCR方法扩增出大小为558bp片段,序列测定其编码序列正确,酶切鉴定亚克隆序列正确。结论成功构建了mic2/CD99全长基因载体,并稳定转染于L428细胞株中。 展开更多
关键词 mic2/CD99 载体构建 L428细胞株
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弓形虫ROP18-MIC2重组真核质粒的构建与表达 被引量:3
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作者 陈琳 何深一 +5 位作者 石娜 周怀瑜 丛华 白杨 赵广会 赵群力 《山东大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2012年第8期62-67,共6页
目的构建弓形虫棒状体蛋白18(ROP18)和微线体蛋白2(MIC2)的基因融合的重组真核表达质粒,并在转录和翻译水平进行鉴定。方法利用分子克隆技术构建重组真核表达质粒pBudCE4.1-ROP18-MIC2,经PCR、酶切及测序鉴定正确后,体外转染人包皮成纤... 目的构建弓形虫棒状体蛋白18(ROP18)和微线体蛋白2(MIC2)的基因融合的重组真核表达质粒,并在转录和翻译水平进行鉴定。方法利用分子克隆技术构建重组真核表达质粒pBudCE4.1-ROP18-MIC2,经PCR、酶切及测序鉴定正确后,体外转染人包皮成纤维细胞(HFF),采用RT-PCR在48 h时检测转录水平,SDS-PAGE在72 h时检测蛋白表达。结果重组真核表达质粒pBudCE4.1-ROP18-MIC2构建正确,经RT-PCR、SDS-PAGE鉴定,弓形虫ROP18、MIC2可在HFF细胞中瞬时表达。结论成功获得重组真核表达质粒pBudCE4.1-ROP18-MIC2,为进一步研究弓形虫疫苗的免疫保护性奠定基础。 展开更多
关键词 弓形虫属 基因 ROP18 基因 mic2 克隆 分子 真核细胞
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刚地弓形虫MIC2与醛缩酶作用位点的鉴定 被引量:1
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作者 郑斌 尹志奎 +3 位作者 姚志军 张海珠 任红斌 詹希美 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期698-700,708,共4页
目的确定刚地弓形虫微线体蛋白2(MIC2)与醛缩酶的作用位点。方法利用定点突变技术,将MIC2羧基端(MIC2C)的767位色氨酸(W767)突变为丙氨酸(A)。PCR扩增MIC2CW/A突变体基因片段;构建MIC2CW/A/pGEX-4T-1重组原核表达系统,IPTG诱导表达GST-M... 目的确定刚地弓形虫微线体蛋白2(MIC2)与醛缩酶的作用位点。方法利用定点突变技术,将MIC2羧基端(MIC2C)的767位色氨酸(W767)突变为丙氨酸(A)。PCR扩增MIC2CW/A突变体基因片段;构建MIC2CW/A/pGEX-4T-1重组原核表达系统,IPTG诱导表达GST-MIC2CW/A突变体蛋白。分别以该蛋白和GST-MIC2C蛋白(对照蛋白)作为探针蛋白与弓形虫速殖子裂解液进行GST pull-down实验,SDS-PAGE及Western blot分析。结果获得了MIC2CW/A突变体基因片段,制备了GST-MIC2CW/A突变体蛋白;GST-MIC2C蛋白的pull-down产物中有一蛋白条带,而且可以被醛缩酶抗体识别,而GST-MIC2CW/A蛋白的pull-down产物中未见蛋白条带。结论将MIC2的W767突变为A后,MIC2失去与醛缩酶的作用,即MIC2与醛缩酶的作用位点为色氨酸(W)。 展开更多
关键词 刚地弓形虫 微线体蛋白2 醛缩酶 点突变 GST pull—down
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鸡球虫微线基因mic2-7h在大肠杆菌中的表达 被引量:4
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作者 蒋建林 蒋金书 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 1999年第1期67-70,共4页
本文在大肠杆菌中表达了鸡球虫孢子化7h微线基因mic2-7h.质粒pmic2-7h经AatⅡ酶切线化,用Sl核酸酶切平DNA分子,再用NotⅠ切出mic2-7h片段,插入表达质粒pET28-a(+)的6xHis下游NheⅠ处构建成表达载体pET28-mic2-7h.IPTG诱导表达后,经SDS-P... 本文在大肠杆菌中表达了鸡球虫孢子化7h微线基因mic2-7h.质粒pmic2-7h经AatⅡ酶切线化,用Sl核酸酶切平DNA分子,再用NotⅠ切出mic2-7h片段,插入表达质粒pET28-a(+)的6xHis下游NheⅠ处构建成表达载体pET28-mic2-7h.IPTG诱导表达后,经SDS-PAGE分析表明表达的重组蛋白大小为45kD,约比理论推算值(37kD)小,但Western-blotting杂交表明重组蛋白能与兔抗Etmic-2抗体反应.这进一步说明了Mic2-7h可能是Etmic-2的一种蛋白异形体. 展开更多
关键词 柔嫩艾美耳球虫 微线基因mic2-7h 大肠杆菌 基因表达
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mic2/CD_(99)基因克隆和测序
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作者 黄作平 何莹 +5 位作者 周新华 李锋 韩西群 张艳 温宗华 赵彤 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第19期2927-2930,共4页
目的构建mic2/CD99基因表达载体。方法通过PCR及双酶切方法,从Jurkat细胞基因组RNA中获得mic2/CD99全长基因编码序列,克隆到pcDNA3.1(+)质粒载体上,构建包含mic2/CD99全长基因载体,并从分子水平检测及验证。结果经PCR方法扩增出大小为58... 目的构建mic2/CD99基因表达载体。方法通过PCR及双酶切方法,从Jurkat细胞基因组RNA中获得mic2/CD99全长基因编码序列,克隆到pcDNA3.1(+)质粒载体上,构建包含mic2/CD99全长基因载体,并从分子水平检测及验证。结果经PCR方法扩增出大小为585bp片段,序列测定其编码序列正确,酶切鉴定亚克隆序列正确。结论成功构建了mic2/CD99全长基因载体,为后续研究打下基础。 展开更多
关键词 mic2/CD99 载体构建
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刚地弓形虫MIC2突变体的构建及其特性分析
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作者 郑斌 尹志奎 许娜 《医学动物防制》 2016年第2期126-128,共3页
目的利用基因定点突变的方法将刚地弓形虫微线体蛋白2(MIC2)的767位氨基酸的碱基定点突变,蛋白相互作用技术分析突变体的特性。方法利用基因定点突变的方法,将MIC2蛋白羧基端(MIC2C)的767位色氨酸(tryptophan,W)的碱基突变为丙氨酸(alan... 目的利用基因定点突变的方法将刚地弓形虫微线体蛋白2(MIC2)的767位氨基酸的碱基定点突变,蛋白相互作用技术分析突变体的特性。方法利用基因定点突变的方法,将MIC2蛋白羧基端(MIC2C)的767位色氨酸(tryptophan,W)的碱基突变为丙氨酸(alanine,A)的碱基,PCR扩增MIC2C W/A突变体基因片段;构建MIC2C W/A/p GEX-4T-1重组原核表达系统,IPTG诱导表达GST-MIC2C W/A突变体蛋白。以该蛋白和MIC2C蛋白(未突变蛋白)为探针蛋白与弓形虫裂解液进行GST pull-down实验,SDS-PAGE及Western blot分析。结果获得了MIC2C W/A突变体基因片段,制备了GST-MIC2C W/A突变体蛋白;GST pull-down实验产物分析显示GST-MIC2C W/A蛋白的产物中未见蛋白条带,而未突变蛋白的产物中有一蛋白条带,且能被抗醛缩酶抗体识别。结论在体外获得了MIC2突变体;MIC2突变体不能沉降弓形虫裂解液中的醛缩酶,即MIC2突变体失去了与醛缩酶作用的特性。 展开更多
关键词 刚地弓形虫 微线体蛋白2 点突变 GST pull-down
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MRSA表面标志物PBP2a的检出与苯唑西林MIC的相关性分析
9
作者 艾辉 徐小平 《中国现代医药杂志》 2005年第3期48-49,共2页
目的研究MRSA表面标志物PBP2a与苯唑西林MIC的相关性。方法收集62株金黄色葡萄球菌临床分离株,通过乳胶凝集试验和全自动细菌分析仪分别检测青霉素结合蛋白2a(PBP2a)和苯唑西林MIC值。结果62株金葡中32株PBP2a检测阳性,30株PBP2a检测阴... 目的研究MRSA表面标志物PBP2a与苯唑西林MIC的相关性。方法收集62株金黄色葡萄球菌临床分离株,通过乳胶凝集试验和全自动细菌分析仪分别检测青霉素结合蛋白2a(PBP2a)和苯唑西林MIC值。结果62株金葡中32株PBP2a检测阳性,30株PBP2a检测阴性。苯唑西林MIC≥4μg/ml31株,苯唑西林MIC≤2μg/ml31株。在苯唑西林MIC≥4μg/ml的31株MRSA中30株PBP2a检测均为阳性。结论金黄色葡萄球菌耐苯唑西林的耐药水平与PBA2a的检出有较好的相关性。 展开更多
关键词 青霉素结合蛋白2a(PBP2a) 金黄色葡萄球菌 苯唑西林 耐苯唑西林 PBP2A mic 表面标志物 MRSA 相关性分析 检出
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基于MIC的RAN2并行化设计与实现
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作者 蔡晓龙 《赤峰学院学报(自然科学版)》 2015年第17期22-25,共4页
RAN2是线性同余随机数发生器中的一种,因其周期长且随机性好广为人们应用.为了提升RAN2的产生速度,本文在研究RAN2串行算法的基础上,利用Simple skip ahead方法对其进行并行化.实验结果显示,并行化后的RAN2通过了Test U01的455项测试,... RAN2是线性同余随机数发生器中的一种,因其周期长且随机性好广为人们应用.为了提升RAN2的产生速度,本文在研究RAN2串行算法的基础上,利用Simple skip ahead方法对其进行并行化.实验结果显示,并行化后的RAN2通过了Test U01的455项测试,与串行结果相同.相对于CPU单线程,MIC平台下的最高加速比为17.25. 展开更多
关键词 随机数发生器 RAN2 并行化 mic
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弓形虫微线体蛋白MIC2和M2AP真核表达载体的构建
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作者 谢彬彬 章庆伟 +4 位作者 陈亲芬 白炳君 林季 刘文权 梁韶晖 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2014年第9期820-823,共4页
目的构建弓形虫RH株微线体蛋白M2AP和MIC2的真核表达载pGAPZαA-mic2和pGAPZαA-m2ap,为建立同时表达MIC2和M2AP蛋白的重组毕赤酵母表达系统,制备重组粘附蛋白复合体MIC2-M2AP奠定基础。方法提取弓形虫RH株速殖子总RNA,用Oligo dT-Adap... 目的构建弓形虫RH株微线体蛋白M2AP和MIC2的真核表达载pGAPZαA-mic2和pGAPZαA-m2ap,为建立同时表达MIC2和M2AP蛋白的重组毕赤酵母表达系统,制备重组粘附蛋白复合体MIC2-M2AP奠定基础。方法提取弓形虫RH株速殖子总RNA,用Oligo dT-Adaptor引物逆转录合成cDNA。根据已知的弓形虫mic2和m2ap基因序列,采用引物设计软件Primer premier5.0自行设计并合成引物,以cDNA为模板,PCR扩增mic2和m2ap基因,克隆入pMD-19-simple-T载体,经酶切和测序鉴定后回收目的片段,分别插入至pGAPZαA内,构建重组毕赤酵母表达载体pGAPZαA-mic2和pGAPZαA-m2ap,转化入E.coli DH5α。提取转化菌质粒,进行酶切和测序鉴定。结果 PCR扩增得到的mic2和m2ap基因分别为2 200bp和1 000bp,与预期大小一致。T-A克隆重组质粒pMD19-T-mic2、pMD19-T-m2ap和重组酵母表达质粒pGAPZαA-mic2、pGAPZαA-m2ap经测序鉴定,与GenBank收录的弓形虫mic2基因和m2ap基因序列同源性为100%,重组毕赤酵母表达载体pGAPZαA-mic2和pGAPZαA-m2ap构建成功。结论成功构建弓形虫重组毕赤酵母表达载体pGAPZαA-mic2和pGAPZαA-m2ap,为进一步研究MIC2和M2AP相互作用机制及其免疫保护效应奠定了基础。 展开更多
关键词 刚地弓形虫 mic2 M2AP 真核表达
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小鼠MIC及其受体mNKG2D的结构、表达和功能
12
作者 叶子峥 李幼平 《华西医学》 CAS 2007年第1期204-205,共2页
关键词 mic 小鼠 受体 结构 人类白细胞抗原 NKG2D 组织相容性复合体 特异性免疫反应
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Antimicrobial Property of 2-Hydroxypropane-1,2,3-Tricarboxylic Acid Isolated from Citrus microcarpa Extract
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作者 Seong Wei Lee Musa Najiah 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2009年第7期880-886,共7页
This article described antimicrobial property and structure analysis of 2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylic acid isolated from the crude extract of Citrus microcarpa. Presently, there was no report on compound from C... This article described antimicrobial property and structure analysis of 2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylic acid isolated from the crude extract of Citrus microcarpa. Presently, there was no report on compound from C. microcarpa that possessed antimicrobial property against fish pathogenic bacteria. Therefore, in this study, the bioactive principle in C. microcarpa extract was isolated using thin layer chromatography. It's structure was elucidated based on nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopic data, such as proton NMR (1HNMR), correlation spectroscopy, carbon 13 NMR, and heteronuclear multiple bond correlation data. This study showed that the bioactive compound isolated from C. microcarpa was 2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylic acid monohydrate. The minimum inhibitory concentration (MIC) values of crude C. microcarpa extract and its bioactive component, 2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylic acid as well as commercially available synthetic 2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylic acid, were determined against 18 isolates of Edwardsiella tarda and 7 bacterial reference strains, namely, Escherichia coli (ATCC 25922), Citrobacter freundii (ATCC 8090), Aeromonas hydrophila (ATCC 49140), Pseudomonas aeruginosa (ATCC 35032), Streptococcus agalatiae (ATCC 13813), E. tarda (ATCC 15947), and Yersinia enterocolitica (ATCC 23715), using two-fold microdilution method. The MIC values for both the natural 2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylic acid and the synthetic one were ranging from 15.6 to 62.5 mg mL-1, whereas that of the crude extract was ranging from 7.8 to 31.3 mg mL-1. These findings showed that both the crude extract and its bioactive component might have potential as antimicrobial agent for aquaculture use. 展开更多
关键词 antimicrobial property 2-hydroxypropane-1 2 3-tricarboxylic acid Citrus microcarpa NMR mic
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血浆VEGF MIC-1联合尿LAP在2型糖尿病肾病检测中的临床意义 被引量:3
14
作者 曲良卓 《医药论坛杂志》 2017年第4期25-26,29,共3页
目的分析血浆VEGF MIC-1联合尿LAP在2型糖尿病肾病检测中的临床意义,为2型糖尿病肾病患者的早期诊断提供新的思路及理论支持。方法选取2013年4月—2015年6月接收的41例2型糖尿病肾病患者作为实验组,另选取41例同期体检健康者作为健康组... 目的分析血浆VEGF MIC-1联合尿LAP在2型糖尿病肾病检测中的临床意义,为2型糖尿病肾病患者的早期诊断提供新的思路及理论支持。方法选取2013年4月—2015年6月接收的41例2型糖尿病肾病患者作为实验组,另选取41例同期体检健康者作为健康组,对两组研究对象血液样本及尿液进行检测,对比观察两组研究对象血浆VEGF、MIC-1、尿LAP、肌酐、葡萄糖、尿素、CIM-1及GHb Alc水平。结果实验组血浆VEGF、MIC-1、尿LAP水平分别为(257.11±53.71)pg/ml、(3039.31±1027.12)pg/ml、(53.04±4.53)U/g Gr,而健康组各项指标水平分别为(18.89±5.51)pg/ml、(711.77±311.23)pg/ml、(32.23±5.22)U/g Gr,两组对比差异有统计学意义(P<0.05);实验组肌酐、葡萄糖、尿素、CIM-1及GHb Alc水平均明显高于健康组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论可将血浆VEGF MIC-1及尿LAP作为诊断2型糖尿病肾病的检测指标,具有重要临床价值,值得推广运用。 展开更多
关键词 血浆VEGF mic-1 尿LAP 2型糖尿病肾病
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MIC 2009年全球资讯通信产业发展趋势
15
《电子与电脑》 2009年第1期23-25,共3页
2009年将成为各方势力争夺未来4G主导权的关键年,主要有IEEE主导的WiMAX技术、3GPP的LTE技术与3GPP2的UMB等技术参与角逐,观察各技术的发展情形,还是以LTE与WiMAX两项技术较具发展优势:而就市场规模观察各重要无线技术的发展状况,... 2009年将成为各方势力争夺未来4G主导权的关键年,主要有IEEE主导的WiMAX技术、3GPP的LTE技术与3GPP2的UMB等技术参与角逐,观察各技术的发展情形,还是以LTE与WiMAX两项技术较具发展优势:而就市场规模观察各重要无线技术的发展状况,资策会MIC预估2015年的全球无线市场(包括服务及设备市场)商机将会超过1,900亿美金。 展开更多
关键词 mic 发展趋势 通信产业 WIMAX技术 3GPP2 资讯 IEEE 无线技术
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蒸汽喷射跨临界CO_(2)制冷系统的能效分析
16
作者 王奇 张晶 毕耜海 《制冷与空调》 2025年第12期44-49,共6页
跨临界CO_(2)制冷系统由于其压力损失较高和制冷性能较差,严重制约了自然工质CO_(2)在制冷空调领域中的应用。为提高系统能效,将蒸汽喷射技术引入CO_(2)制冷系统中,通过热力学第一定律构建带过冷却器的蒸气压缩制冷循环(SVIC)和带闪蒸... 跨临界CO_(2)制冷系统由于其压力损失较高和制冷性能较差,严重制约了自然工质CO_(2)在制冷空调领域中的应用。为提高系统能效,将蒸汽喷射技术引入CO_(2)制冷系统中,通过热力学第一定律构建带过冷却器的蒸气压缩制冷循环(SVIC)和带闪蒸罐的蒸气压缩制冷循环(FVIC)的数学模型,分析在不同工况下2系统的性能和运行特性。结果表明,当蒸发温度为-10℃和环境温度为32℃时,SVIC和FVIC系统的压缩机功耗分别为3.129 kW和2.852 kW,制冷量分别为6.635 kW和6.749 kW,相比于SVIC,FVIC的压缩机功耗降低8.88%,制冷量提升1.72%。研究为蒸汽喷射技术在跨临界CO_(2)制冷系统中的应用提供参考。 展开更多
关键词 跨临界CO_(2) 蒸汽喷射 闪蒸罐 过冷却器 热力学分析
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高阶精度CFD应用在天河2系统上的异构并行模拟与性能优化 被引量:5
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作者 王勇献 张理论 +3 位作者 车永刚 徐传福 刘巍 程兴华 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2015年第4期833-842,共10页
在当前主流的众核异构高性能计算机平台上开展超大规模计算流体力学(computational fluid dynamics,CFD)应用的高效并行数值模拟仍然面临着一系列挑战性技术问题,也是该领域的热点研究问题之一.面向天河2高性能异构并行计算平台,针对高... 在当前主流的众核异构高性能计算机平台上开展超大规模计算流体力学(computational fluid dynamics,CFD)应用的高效并行数值模拟仍然面临着一系列挑战性技术问题,也是该领域的热点研究问题之一.面向天河2高性能异构并行计算平台,针对高阶精度CFD流场数值模拟程序的高效并行进行了探索,重点讨论了CFD应用特点与众核异构高性能计算机平台特征相适应的性能优化策略,从任务分解、并行度挖掘、多线程优化、SIMD向量化、CPU与加速器协同优化等方面,提出一系列性能提升技术.通过在天河2高性能异构并行计算平台上进行了多个算例的数值模拟,模拟的最大CFD规模达到1 228亿个网格点,共使用约59万CPU+MIC处理器核,测试结果表明移植优化后的程序性能提高2.6倍左右,且具有良好的可扩展性. 展开更多
关键词 计算流体动力学 高阶精度格式 并行计算 CPU+mic异构协同并行 性能优化 天河2超级 计算机
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康宁木霉(Trichoderma koningii)SMF2分泌的peptaibols类抗菌肽Trichokonins抑菌活性研究 被引量:10
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作者 解树涛 宋晓妍 +3 位作者 石梅 陈秀兰 孙彩云 张玉忠 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期140-144,共5页
Peptaibols是一类来源于土壤微生物,由非核糖体合成酶(nonribosomal peptide synthetase,NRPS)合成的富含α-氨基异丁酸(-αaminoisobutyric acid,Aib)的抗菌肽的总称.Trichokonins属于长链peptaibols第一亚家族,其对普通金黄色葡萄球菌... Peptaibols是一类来源于土壤微生物,由非核糖体合成酶(nonribosomal peptide synthetase,NRPS)合成的富含α-氨基异丁酸(-αaminoisobutyric acid,Aib)的抗菌肽的总称.Trichokonins属于长链peptaibols第一亚家族,其对普通金黄色葡萄球菌和1株临床分离的多抗金黄色葡萄球菌的最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)均为50μg/mL,但时间杀菌曲线表明后者对MIC浓度的Trichokonins耐受性明显大于前者.在含50μg/mL浓度Tri-chokonins的培养基中连续转接20次后普通金黄色葡萄球菌和多抗金黄色葡萄球菌对Trichokonins的敏感性都明显降低,MIC值均提高到200μg/mL以上,表明金黄色葡萄球菌对Trichokonins产生了明显的抗性.这与目前普遍认为的抗菌肽不易产生抗性的观点不一致,其抗性产生的具体机制有待于进一步的研究. 展开更多
关键词 康宁木霉SMF2 PEPTAIBOLS Trichokonins mic 时间杀菌曲线
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铜绿假单胞菌对碳青霉烯类抗生素的耐药性及其耐药表型与外膜蛋白OprD2的关系 被引量:9
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作者 刘永芳 吕晓菊 +6 位作者 俞汝佳 宗志勇 高燕渝 陈慧莉 李晓芳 蒋胜 韩乾国 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期564-568,共5页
目的 了解铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,Pa)临床分离株对几种常用抗铜绿假单胞菌药物的敏感性;探索铜绿假单胞菌临床分离株对亚胺培南和美罗培南耐药性差异与其膜孔蛋白0prD2变化的关系。方法琼脂对倍稀释法测定142株Pa对... 目的 了解铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,Pa)临床分离株对几种常用抗铜绿假单胞菌药物的敏感性;探索铜绿假单胞菌临床分离株对亚胺培南和美罗培南耐药性差异与其膜孔蛋白0prD2变化的关系。方法琼脂对倍稀释法测定142株Pa对亚胺培南、美罗培南等8种常用抗假单胞菌药物的最低抑菌浓度,从中筛出32株对亚胺培南和美罗培南不同耐药表型的Pa,提取外膜蛋白并采用十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)法分离,检测OprD2相对含量。结果耐药率最高的是亚胺培南(54.23%),其次是环丙沙星(45.07%)、美罗培南(28,87%)、氨曲南(19.72%)、阿米卡星(17.61%)、哌拉西林/三唑巴坦(14.08%)和头孢他啶(11.97%),头孢哌酮/舒巴坦耐药率最低(9.86%)。呈现多重耐药的菌株占38.73%(55/142),交叉耐药率高达40.84%(58/142)。在对亚胺培南耐药的菌株中,合并有其他肛内酰胺类抗生素耐药的菌株达到62.34%(48/77)。32株Pa外膜蛋白电泳结果显示OprD2相对含量在耐药组为0~3.5%(其中有一株为8.70%),敏感组为6.20%~10.20%。在碳青霉烯类耐药组与敏感组之间统计分析P〈0.05,耐碳青霉烯类组低于敏感组,但是在亚胺培南耐药、美罗培南敏感组与亚胺培南、美罗培南均耐药组之间差异无统计学意义。结论铜绿假单胞菌耐药菌株常见,且常呈多重耐药和交叉耐药。亚胺培南耐药率高于美罗培南。膜孔蛋白OprD2减少或缺失是我院Pa对亚胺培南耐药的主要原因之一。但在美罗培南耐药中所起的作用,有待进一步研究。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 mic 耐药性 亚胺培南 美罗培南 OPRD2
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淡水藻种库(FACHB)库藏产2-MIB蓝藻的鉴定及其产嗅特征研究 被引量:10
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作者 张琪 夏逸若 +3 位作者 李林 李天丽 郑凌凌 宋立荣 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1115-1128,共14页
为认识产二甲基异莰醇(2-MIB)蓝藻的形态和产嗅特征,从国家水生生物种质资源库淡水藻种库中筛选出24株可产2-MIB藻株,描述了这些藻株的形态特征和生境分布。结合形态和16S rRNA基因分析对藻株进行物种鉴定复核,修订了部分库藏藻株物种名... 为认识产二甲基异莰醇(2-MIB)蓝藻的形态和产嗅特征,从国家水生生物种质资源库淡水藻种库中筛选出24株可产2-MIB藻株,描述了这些藻株的形态特征和生境分布。结合形态和16S rRNA基因分析对藻株进行物种鉴定复核,修订了部分库藏藻株物种名称,例如发现库藏产2-MIB的浮丝藻属种类应当被重新鉴定为拉氏拟浮丝藻或索状气丝藻。基于mic基因系统发育树分析,显示蓝藻mic基因形成5个分支。通过2-MIB含量检测发现,不同藻株间单个细胞总2-MIB含量为6—2549 fg/cell,其含量通常为拉氏拟浮丝藻>索状气丝藻>灰假鱼腥藻。研究提供了产2-MIB蓝藻的形态、分子、生态和产嗅特性等的基础数据,首次报道气丝藻、沙丝藻、苏打丝藻种类可产2-MIB,并在国内首次报道了产2-MIB的微鞘藻,为进一步研究产2-MIB蓝藻生理生态特性提供重要的实验材料和科学依据。 展开更多
关键词 二甲基异莰醇 丝状蓝藻 嗅味 形态特征 MIB环化酶基因
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