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MHC-Ⅰ和MHC-Ⅱ在弥漫大B细胞淋巴瘤中的表达与临床病理特征关系及预后的影响
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作者 李君娜 于靖雯 +6 位作者 王小树 马文梅 庞雪莲 马明福 薛晶 张巍 崔文丽 《诊断病理学杂志》 2025年第6期635-642,共8页
目的本研究旨在探讨弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ、Ⅱ表达及其与临床病理特征及预后的相关性。方法收集新疆医科大学第一附属医院病理科DLBCL 130例,采用免疫组化EnVision法检测MHC-Ⅰ、MHC-Ⅱ蛋白表达情况,... 目的本研究旨在探讨弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ、Ⅱ表达及其与临床病理特征及预后的相关性。方法收集新疆医科大学第一附属医院病理科DLBCL 130例,采用免疫组化EnVision法检测MHC-Ⅰ、MHC-Ⅱ蛋白表达情况,分析二者相关性及其与DLBCL临床病理特征和预后的关系。结果(1)免疫组化染色结果显示,DLBCL肿瘤细胞中MHC-Ⅰ、MHC-Ⅱ低表达率分别为57.6%(68/118)和40.3%(48/119)。(2)MHC-Ⅰ低表达与Ann-Arbor分期、PS评分、发生部位相关(P<0.05),MHC-Ⅱ低表达与年龄、结外受累病灶相关(P<0.05),MHC-Ⅰ/MHC-Ⅱ共高表达与骨髓不易受累相关(P<0.05)。(3)Kaplan-Meier单因素生存结果显示MHC-Ⅱ低表达组预后差(P<0.05),MHC-Ⅰ对生存无显著影响(P>0.05),多因素COX回归分析显示LDH、PS评分、IPI评分是影响DLBCL患者的独立危险因素。结论MHC-Ⅰ和MHC-Ⅱ在DLBCL中低表达,与Ann-Arbor分期、PS评分、发生部位、年龄、结外受累病灶相关。MHC-Ⅱ低表达的DLBCL患者预后较差。 展开更多
关键词 弥漫大B细胞淋巴瘤 主要组织相容性复合体 MHCⅠ类分子 MHCⅡ类分子 临床病理特征
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载脂蛋白APOL特异性结合拟杆菌目细菌并调控黏膜稳态
2
作者 杨涛 胡孝虎 钱友存 《中国细胞生物学学报》 2025年第7期1477-1484,共8页
肠道微生物群与宿主的共生关系是维持机体健康的核心。作为共栖者,这些微生物除了辅助吸收营养物质外,也能积极通过分泌代谢产物(如短链脂肪酸、胆汁酸)和结构分子(如多糖A、α-半乳糖神经酰胺)调控宿主免疫,例如诱导调节性T细胞(Treg)... 肠道微生物群与宿主的共生关系是维持机体健康的核心。作为共栖者,这些微生物除了辅助吸收营养物质外,也能积极通过分泌代谢产物(如短链脂肪酸、胆汁酸)和结构分子(如多糖A、α-半乳糖神经酰胺)调控宿主免疫,例如诱导调节性T细胞(Treg)分化或调节自然杀伤T细胞活性。然而,宿主如何精准识别特定共生菌并建立互惠机制仍不明确。已知的肠道防御因子(如抗菌肽、分泌型IgA、补体C3)虽能清除病原体,但其作用缺乏菌群特异性。针对肠道中数量众多的共生菌,在长期共进化过程中宿主是否发展出精准识别和调控这些微生物的能力,仍待深入探索。针对该问题,该团队通过多重蛋白组学技术鉴定发现小鼠肠上皮细胞可分泌产生一类新型载脂蛋白APOL9a/b(APOL9),其具有共生细菌结合能力。结合流式细胞术与微生物组测序技术,团队意外发现APOL9及其人类同源蛋白APOL2能特异性结合一类常见的拟杆菌目(Bacteroidales)肠道细菌。进一步研究表明APOL9可以特异性结合细菌表面特殊的脂质分子——神经酰胺-1-磷酸(Cer1P),结合目标细菌后,可以诱导其释放外膜囊泡(OMVs),外膜囊泡可以激活树突状细胞,促进T细胞分泌干扰素γ,进而诱导上皮细胞MHC-Ⅱ表达,最终推动一类CD4^(+)CD8αα^(+)肠上皮内淋巴细胞(IELs)的发育,从而提升肠道对外来病原微生物(如沙门氏菌)的抗感染能力。 展开更多
关键词 肠道微生物群 拟杆菌 APOL9 外膜囊泡 MHC-Ⅱ 上皮内淋巴细胞
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IL-2基因转染对人卵巢癌细胞增殖、凋亡和MHC-Ⅱ的影响
3
作者 叶大风 谢幸 +2 位作者 陈怀增 吕卫国 程蓓 《浙江医学》 CAS 2001年第2期67-68,共2页
目的 研究白介素 -2(IL-2)基因转染对人卵巢癌细胞增殖、凋亡和主要组织相容性复合体 -Ⅱ(MHC -Ⅱ )的影响。方法 将IL-2基因质粒DNA导入人卵巢癌细胞系 (3AO) ,用逆转录PCR(RT-PCR)观察转染后3AO细胞IL-2mRNA表达、细胞免疫化学SP法观... 目的 研究白介素 -2(IL-2)基因转染对人卵巢癌细胞增殖、凋亡和主要组织相容性复合体 -Ⅱ(MHC -Ⅱ )的影响。方法 将IL-2基因质粒DNA导入人卵巢癌细胞系 (3AO) ,用逆转录PCR(RT-PCR)观察转染后3AO细胞IL-2mRNA表达、细胞免疫化学SP法观察细胞增殖和MHC -Ⅱ表达、原位末端标志法观察凋亡。结果 显示3AO细胞转染60h后可表达IL -2mRNA ,增殖细胞核抗原表达减弱 ,MHC -Ⅱ抗原表达增强 ,未观察到凋亡改变。结论 IL -2基因导入3AO细胞可通过抑制瘤细胞增殖 。 展开更多
关键词 白细胞介素-2 基因转梁 卵巢肿瘤 细胞增殖 细胞凋亡 mhc-ii
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中国东北汉族人群变应性鼻炎患者HLA-DRB1基因多态性分析 被引量:24
4
作者 杨玲 张庆瑞 +2 位作者 张平 叶晶 尹璐 《中华耳鼻咽喉科杂志》 CSCD 1999年第3期147-149,共3页
目的分析中国东北地区汉族人变应性鼻炎(alergicrhinitis,AR)患者与HLA(humanleukocyteAsystem)DRB1等位基因的关联。方法采用聚合酶链反应序列特异性引物技术对35例东北汉族... 目的分析中国东北地区汉族人变应性鼻炎(alergicrhinitis,AR)患者与HLA(humanleukocyteAsystem)DRB1等位基因的关联。方法采用聚合酶链反应序列特异性引物技术对35例东北汉族变应性鼻炎患者的HLADRB1等位基因进行检测,对照组为同地区94例健康者。结果统计学分析结果显示患者组HLADRB10101.2和0302等位基因比正常对照组明显增高,基因频率分别为12.86%(相对危险性为15.92,校正P值<0.0004)和5.71%(相对危险性为12.00,校正P值<0.05),其它等位基因频率在实验组和对照组之间差异无显著性。结论提示HLADRB10101.2和DRB10302等位基因与AR关联。 展开更多
关键词 鼻炎 变应性 常年性 MHCⅡ类基因 PCR
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鸡MHC Ⅱ基因实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:3
5
作者 金元昌 李玉峰 袁志栋 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1912-1915,共4页
为了建立鸡主要组织相容性复合体Ⅱ类(major histocompatibility complex class II,MHC II)基因实时荧光定量PCR(real-time FQ-PCR)的检测方法。本研究应用RT-PCR方法扩增鸡外周血淋巴白细胞(peripheral blood leukocytes,PBLs)的MHC I... 为了建立鸡主要组织相容性复合体Ⅱ类(major histocompatibility complex class II,MHC II)基因实时荧光定量PCR(real-time FQ-PCR)的检测方法。本研究应用RT-PCR方法扩增鸡外周血淋巴白细胞(peripheral blood leukocytes,PBLs)的MHC II基因片断,将得到的目标片断克隆至pGM-T载体上,然后对重组质粒进行双酶切、PCR及测序鉴定;利用浓度梯度MHC II基因的重组标准品质粒DNA进行Real-time FQ-PCR,建立MHC II基因的标准曲线。经双酶切、PCR及测序分析显示,成功构建重组克隆质粒pGM-T-MHC II;对标准曲线进行分析表明,Ct值与其标准品浓度的对数值之间有良好的线性关系,为下一步应用Real-time FQ-PCR技术检测MHC II基因的转录水平奠定了基础。 展开更多
关键词 MHC II REAL-TIME FQ-PCR 标准曲线
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捻转血矛线虫海藻糖酶特性研究
6
作者 文兆海 卡力比夏提·艾木拉江 +5 位作者 张朝莹 陆明敏 徐立新 宋小凯 李祥瑞 严若峰 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期1034-1039,共6页
对捻转血矛线虫海藻糖酶(HcTre)基因进行了克隆表达,得到了纯化的重组HcTre蛋白(rHcTre蛋白)。通过qPCR技术分析了HcTre基因在虫体不同发育阶段的转录水平。将rHcTre蛋白与山羊外周血单个核细胞(PBMCs)共孵育,探究其对PBMCs功能的影响... 对捻转血矛线虫海藻糖酶(HcTre)基因进行了克隆表达,得到了纯化的重组HcTre蛋白(rHcTre蛋白)。通过qPCR技术分析了HcTre基因在虫体不同发育阶段的转录水平。将rHcTre蛋白与山羊外周血单个核细胞(PBMCs)共孵育,探究其对PBMCs功能的影响。结果显示,HcTre基因在捻转血矛线虫不同发育阶段均有转录,且在虫卵阶段的转录水平最高。qPCR结果显示,rHcTre蛋白抑制了PBMCs中MHC-Ⅱ分子的转录水平,促进了IFN-γ、IL-17的转录水平。本研究分析了rHcTre蛋白的功能特性,有助于进一步了解寄生性线虫与宿主之间的相互作用机制。 展开更多
关键词 捻转血矛线虫 海藻糖酶 外周血单个核细胞 mhc-ii IFN-Γ IL-17
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中国正常人及类风湿关节炎病人MHC-Ⅱ类DR_4亚型基因核苷酸序列初步分析 被引量:2
7
作者 朱乃硕 王亚新 陈诗书 《中国免疫学杂志》 CSCD 北大核心 1994年第2期92-97,共6页
对中国人群正常人及类风湿关节炎病人DR_4亚型基因决定型别特异性的第二个外显子进行体外扩增、克隆及序列分析显示,6例正常人及3例类风湿关节炎病人存在三种DR_4亚型(DRBl0402,DRBl0405,DRBl.04... 对中国人群正常人及类风湿关节炎病人DR_4亚型基因决定型别特异性的第二个外显子进行体外扩增、克隆及序列分析显示,6例正常人及3例类风湿关节炎病人存在三种DR_4亚型(DRBl0402,DRBl0405,DRBl.0406),中国人这三种亚型第二个外显子核苷酸序列与白种人一致。序列分析结果为进一步应用常规PCR-SSO法及PCR-RFLP法进行中国人DR_4基因定型提供了依据。此外,还将序列分析结果与PCR-SSO杂交分析结果进行了比较,具备较全面的覆盖各亚型多态性区域的探针可以减少等位基因同源性干扰。 展开更多
关键词 DR 基因 DNA 类风湿性 关节炎
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MHC II类分子表达调控的研究进展 被引量:4
8
作者 孙泉红 彭景楩 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期25-29,共5页
MHCII类分子提呈经过加工的抗原给CD4 + T淋巴细胞 ,在诱发免疫反应中起重要作用。MHCII类分子不正常表达会引起严重的免疫缺陷疾病 ,如裸淋巴细胞综合征 (BLS)等。目前已识别出四种不同的MHCII调控基因。这些基因分别编码RFXANK、RFX5... MHCII类分子提呈经过加工的抗原给CD4 + T淋巴细胞 ,在诱发免疫反应中起重要作用。MHCII类分子不正常表达会引起严重的免疫缺陷疾病 ,如裸淋巴细胞综合征 (BLS)等。目前已识别出四种不同的MHCII调控基因。这些基因分别编码RFXANK、RFX5、RFXAP和CIITA。其中 ,前三个是RFX复合物的亚基 ,RFX是一种结合于所有MHCII类基因启动子上的泛式表达的因子。CIITA是MHCII类分子表达的主要调控因子 ,其严密调控的表达模式决定了MHCII类分子表达的细胞特异性 ,及能否被诱导且在何种水平上表达。 展开更多
关键词 MHCⅡ类分子 表达调控 研究进展 调控因子 免疫反应
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探索miR-145介导的黑青斑河鲀IFN-γ对MHC II的精细调控
9
作者 易诗白 卢丹琪 +3 位作者 彭弯 汪婷 张勇 林浩然 《中国科技论文》 CAS 北大核心 2015年第6期695-699,共5页
哺乳类miR-145通过作用于MHC II的反式作用因子CIITA对MHC II的表达进行调控。为探讨在黑青斑河鲀中miR-145是否对CIITA基因存在直接调控作用,进而间接调控MHC II的表达,将黑青斑河鲀CIITA的3′非编码区(3′UTR)序列亚克隆至pMIR-Repor... 哺乳类miR-145通过作用于MHC II的反式作用因子CIITA对MHC II的表达进行调控。为探讨在黑青斑河鲀中miR-145是否对CIITA基因存在直接调控作用,进而间接调控MHC II的表达,将黑青斑河鲀CIITA的3′非编码区(3′UTR)序列亚克隆至pMIR-Report载体中,通过双荧光素酶报告系统研究两者是否存在直接的靶标作用。结果表明:将miR-145类似物和构建的CIITA3′UTR载体共转染至Hela细胞后,荧光素酶活性没有出现预期的下调,反而出现上调;增大或减少miR-145的转染量,荧光素酶活性的变化幅度也会随之改变。将miR-145类似物和构建的CIITA3′UTR载体共转染至COS-7细胞,荧光素酶的活性没有改变。离体转染miR-145到河鲀原代脾细胞中,检测MHC II基因的表达水平也没有变化,表明miR-145确实对河鲀CIITA没有靶标作用。 展开更多
关键词 水生生物学 小分子RNA 干扰素Γ MHC II 免疫应答 黑青斑河鲀
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MHC Ⅱ类基因瘤体内直接注射治疗小鼠肿瘤的研究
10
作者 隋拥君 唐佩弦 +1 位作者 侯春梅 毛宁 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 1999年第2期117-120,共4页
目的:许多基因治疗方案可以诱导产生抗肿瘤免疫反应,但是ex vivo的操作方式限制了其应用.本研究采用瘤体内直接注射MHC Ⅱ类基因的方法来诱导抗肿瘤免疫反应.方法:针对具有弱免疫原性的小鼠肥大细胞瘤P815和非免疫原性的小鼠黑色素瘤B16... 目的:许多基因治疗方案可以诱导产生抗肿瘤免疫反应,但是ex vivo的操作方式限制了其应用.本研究采用瘤体内直接注射MHC Ⅱ类基因的方法来诱导抗肿瘤免疫反应.方法:针对具有弱免疫原性的小鼠肥大细胞瘤P815和非免疫原性的小鼠黑色素瘤B16,在瘤体的原位注射MHC Ⅱ类基因,观察肿瘤的生长情况.结果:直接注射MHC Ⅱ类基因,使P815肿瘤的致瘤性明显下降,并且对第二次接种P815细胞具有抵抗能力;虽然对B16而言,仅注射MHC Ⅱ类基因无治疗效果,但与B7基因共同注射,却能够显著地抑制B16肿瘤的生长.结论:瘤体内直接注射MHC Ⅱ类基因可以用来进行肿瘤治疗. 展开更多
关键词 直接基因转移 MHCⅡ类基因 肿瘤免疫治疗
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主要组织相容性抗原(MHC)在母胎界面免疫调控的研究进展
11
作者 李明 史远刚 彭景楩 《现代生物医学进展》 CAS 2007年第12期1899-1902,共4页
母胎界面生物学与多种细胞形成的复合物及维持妊娠所必需的调节因子有关。目前被公认的调节因子是胎盘中的主要组织相容性复合体蛋白(MHC)。MHC抗原在生殖过程中起到双重作用:首先,MHC在一些生物物种中可影响其杂交选择,对父母双方MHC... 母胎界面生物学与多种细胞形成的复合物及维持妊娠所必需的调节因子有关。目前被公认的调节因子是胎盘中的主要组织相容性复合体蛋白(MHC)。MHC抗原在生殖过程中起到双重作用:首先,MHC在一些生物物种中可影响其杂交选择,对父母双方MHC抗原的匹配有一定的影响;其次MHC影响植入前期已经受精的卵子发育情况。MHC抗原表达对于胎儿逃避母体免疫排斥作用从而维持妊娠顺利进行是有利的。本文综述了MHC在母胎界面免疫调控的最新研究进展。 展开更多
关键词 母胎界面 免疫调节 MHC—Ⅰ Ⅱ类抗原
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异基因型和同基因型MHCⅡ类基因转染对小鼠肥大细胞瘤免疫原性的影响
12
作者 隋拥君 唐佩弦 +1 位作者 侯春梅 毛宁 《中国免疫学杂志》 CSCD 北大核心 2000年第3期128-130,134,共4页
目的 :提高肿瘤细胞的免疫原性。方法 :将异基因型或同基因型的MHCⅡ类基因转染至小鼠肥大细胞瘤P815中 ,用此细胞接种同系小鼠 ,1个月后给不成瘤的小鼠再接种野生型P815细胞 ,观察小鼠的存活情况。结果 :转同基因型MHCⅡ基因的P815细... 目的 :提高肿瘤细胞的免疫原性。方法 :将异基因型或同基因型的MHCⅡ类基因转染至小鼠肥大细胞瘤P815中 ,用此细胞接种同系小鼠 ,1个月后给不成瘤的小鼠再接种野生型P815细胞 ,观察小鼠的存活情况。结果 :转同基因型MHCⅡ基因的P815细胞接种同系小鼠后 ,4/ 10不成瘤 ,而异基因型MHCⅡ基因转染组 ,10 / 10不成瘤。 1个月后给不成瘤的小鼠再接种野生型的P815细胞 ,同基因型转染组 2 / 4不成瘤 ,异基因型转染组 7/ 10不成瘤。结论 :研究说明MHCⅡ基因转染具有使肿瘤细胞的致瘤性下降、免疫保护能力提高的作用 ;并且异基因型比同基因型MHCⅡ类基因转染的效果更佳。 展开更多
关键词 小鼠 肥大细胞瘤 MHCⅡ类基因 免疫原性
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Cell-type specific regulation of MARCH1 E3 ubiquitin ligase by the anti-inflammatory cytokine IL-10
13
作者 Tristan Galbas Jacques Thibodeau 《Open Journal of Immunology》 2012年第4期161-167,共7页
Membrane-associated RING-CH-1 (MARCH1) is an E3 ubiquitin ligase which targets MHC-II, CD86 and various other molecules for degradation. It is one of the most efficient post-translational regulators of antigen present... Membrane-associated RING-CH-1 (MARCH1) is an E3 ubiquitin ligase which targets MHC-II, CD86 and various other molecules for degradation. It is one of the most efficient post-translational regulators of antigen presentation. MARCH1 is expressed in resting immature dendritic cells and B cells but can be induced in other cell types. While activation of most immune cells results in a reduction in MARCH1 gene expression, its anti-inflammatory properties are highlighted by its induction in response to IL-10. Here, we review what is known about the regulation of MARCH1 gene expression in response to IL-10 by various immune cells. We speculate on the role of MARCH1 ininfection, its differential expression pattern and the promise that this E3 ubiquitin ligase holds to influence immune responses and mitigate immune pathologies. 展开更多
关键词 MARCH1 INTERLEUKIN-10 mhc-ii UBIQUITIN Antigen-Presenting Cells
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黄颡鱼MHC classⅡ基因全长的克隆及饲料维生素D3对其组织表达的影响 被引量:5
14
作者 冯美惠 陈沛 +2 位作者 雷文 李大鹏 王春芳 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期992-999,共8页
为进一步丰富鱼类MHC class Ⅱ基因的研究,同时也为进一步探讨低磷饲料中添加维生素D3对鱼类免疫功能可能的影响,实验利用RACE(Rapid-amplification of c DNA ends)即c DNA末端快速扩增技术,成功克隆出黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)... 为进一步丰富鱼类MHC class Ⅱ基因的研究,同时也为进一步探讨低磷饲料中添加维生素D3对鱼类免疫功能可能的影响,实验利用RACE(Rapid-amplification of c DNA ends)即c DNA末端快速扩增技术,成功克隆出黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)class Ⅱ抗原基因,全长1074 bp,其中ORF(Open reading frame)708 bp,编码236个氨基酸,5′UTR(5′端非翻译区)78 bp,3′UTR(3′端非翻译区)259 bp。进行氨基酸序列比对分析得到:黄颡鱼MHC class Ⅱ基因ORF氨基酸序列与长吻逘(Leiocassis longirostris)的氨基酸序列相似度最高为69.5%,与锦鲤(Cyprinus carpio)的氨基酸序列相似度最低为50.4%。利用q PCR对黄颡鱼MHC class Ⅱ基因进行组织表达分析,结果表明MHC class Ⅱ在小肠、肝脏、鳃中表达较高;在肌肉、鳍条中表达较低;而在肾、脾脏、脑、头肾中表达量极低(几乎检测不到)。在低磷饲料中添加维生素D3显著诱导了该基因的上调表达。研究结果展示了黄颡鱼MHC class Ⅱ抗原基因的分子结构、组织表达以及维生素D3的作用,在降低磷排放的同时,为今后黄颡鱼免疫抗病及分子选育等方向的深入研究及免疫型饲料的使用奠定了基础。 展开更多
关键词 黄颡鱼 MHCclassII 饲料维生素D3 基因表达
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腺病毒介导CIITA突变体基因转移抑制MHC II类分子表达的体外研究 被引量:2
15
作者 管政 张军 沈茜 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期872-877,882,共7页
目的:构建携带小鼠MHCII类分子反式激活因子(MHC class II molecule transactivator,CIITA)突变体基因的腺病毒,并观察腺病毒介导该基因的表达情况以及表达产物的体外功能。方法:采用常规分子生物学方法从IFN-γ诱导后的BALB/c小鼠腹腔... 目的:构建携带小鼠MHCII类分子反式激活因子(MHC class II molecule transactivator,CIITA)突变体基因的腺病毒,并观察腺病毒介导该基因的表达情况以及表达产物的体外功能。方法:采用常规分子生物学方法从IFN-γ诱导后的BALB/c小鼠腹腔巨噬细胞中获得IV型CIITA cDNA;利用重叠延伸PCR法构建CIITA突变体基因,并克隆入表达载体pIRES;采用pAdEasy-1系统获得具有感染能力的、携带CIITA突变体基因的缺陷型重组腺病毒(Ad-CIITAm)和空载对照病毒(Ad-GFP),并经大量扩增、纯化及滴度测定;将Ad-CIITAm和Ad-GFP分别感染HeLa细胞和Raji细胞,流式细胞术观察对诱导型和组成型HLA-DR分子表达的影响。结果:成功克隆了小鼠CIITA突变体基因,并构建了携带小鼠CIITA突变体基因的重组腺病毒Ad-CIITAm;经流式细胞术证实感染Ad-CIITAm的Hela和Raji细胞较感染Ad-GFP的细胞,其表面HLA-DR分子的表达均受到明显的抑制。结论:本实验证实了重组腺病毒介导表达的小鼠CIITA突变体在体外能够有效地抑制MHCII类分子的表达。 展开更多
关键词 CⅡTA 突变体 MHCⅡ类分子 腺病毒
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凹耳蛙MHCII类B基因第二外显子多态性分析 被引量:4
16
作者 李方 疏义林 吴海龙 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期184-192,共9页
两栖类正经历全球范围内的种群衰退,很多两栖动物集群灭绝事件与环境病原体(如壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis)的侵扰有关。MHC基因的表达产物在有颌脊椎动物免疫应答过程中起关键作用,其多态性通常与动物对疾病的抗性或易感性密... 两栖类正经历全球范围内的种群衰退,很多两栖动物集群灭绝事件与环境病原体(如壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis)的侵扰有关。MHC基因的表达产物在有颌脊椎动物免疫应答过程中起关键作用,其多态性通常与动物对疾病的抗性或易感性密切相关,因而被认为是研究动物适应性进化的最佳候选基因之一。本文对中国特有的无尾两栖动物凹耳蛙(Odorrana tormota)MHC II类B基因多态性进行初步研究。首先,利用1对通用引物扩增出凹耳蛙MHC II类B基因exon2长约180bp的DNA片段。在此基础上,利用ligation-mediated PCR进一步获取侧翼未知序列,序列拼接后长2,030bp,包含exon2以及intron1和intron2的部分序列。基于上述序列设计出凹耳蛙B基因exon2特异性引物(IIQ1BU/IIQ1BD),对该物种黄山种群32个样品进行PCR扩增和克隆测序,共获得34个不同的等位基因,等位基因序列核苷酸和氨基酸变异位点的比例分别为16.17%(33/204)和26.87%(18/67),大多数氨基酸变异位点位于推测的抗原结合位点(antigen binding sites,ABS)。每个样品包含2-5个等位基因,结合等位基因序列特征以及cDNA表达分析结果,推测凹耳蛙至少拥有3个可表达的B基因座位。与文献报道的蛙科其他物种比较后发现,尽管凹耳蛙目前的分布区非常狭窄,但其MHC II类B基因多态性明显高于蛙科其他动物。等位基因碱基替换模式提示凹耳蛙MHC II类B基因曾经历过强烈的正选择作用,ABS区的dN值显著大于dS(P<0.05),PAML软件包CODEML程序中不同模型的似然比检测(likelihood rate test)结果同样支持上述推论,贝叶斯经验贝叶斯路径(Bayesian Em-pirical Bayes)共检测出5个显著受正选择作用的氨基酸位点。贝叶斯系统树的拓扑结构显示,无尾两栖类不同科的等位基因分别形成单系群,但蛙科不同属的等位基因未能形成单系群,蛙属绿池蛙(Rana clamitans)的1个等位基因与臭蛙属凹耳蛙的部分等位基因享有共同的谱系关系,提示蛙科不同属间的B基因存在跨种多态性。 展开更多
关键词 ODORRANA tormota MHC B基因 两栖类 正向选择 跨物种进化
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基于ISC-SVR方法预测Th细胞表位 被引量:1
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作者 于畅宇 刘伟 +2 位作者 刘涛 宋哲 朱鸣华 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第4期670-678,共9页
外源性抗原蛋白被抗原提呈细胞(APC)摄取送入溶酶体中被降解为长度不一的肽段.在HLA-DM分子辅助下,MHC II类分子相关恒定链多肽(class II-associated invariant chain peptide,CLIP)从MHC II类分子的肽结合槽解离,使得外源性抗原降解的... 外源性抗原蛋白被抗原提呈细胞(APC)摄取送入溶酶体中被降解为长度不一的肽段.在HLA-DM分子辅助下,MHC II类分子相关恒定链多肽(class II-associated invariant chain peptide,CLIP)从MHC II类分子的肽结合槽解离,使得外源性抗原降解的肽段进入MHC II类分子空的肽结合槽中,形成稳定的抗原肽-MHC II类分子复合物.之后再被提呈到APC细胞表面供CD4+Th细胞的TCR识别,激活Th细胞分泌细胞因子,促进CTL细胞特异性杀伤靶细胞或辅助B细胞产生抗体.Th细胞的活化对机体的细胞免疫和体液免疫功能都有重要的辅助作用.本工作基于迭代自洽策略与支持向量回归机(ISC-SVR)方法建立了MHC II类分子与外源性抗原肽结合亲合力预测模型,采用13mer扩展核心结合序列可以提高预测模型的性能,分别按照均值法、最大值法、结合法、加权平均值法4种方法计算MHC II类分子与抗原肽的结合亲合力值.对17种MHC II类分子配型进行了回归分析,与其他预测模型相比较,本工作模型都得到了最佳AUC值.最后,以HLA DRB1*0101分子为例,分析讨论了MHC II类分子与抗原肽的结合特异性. 展开更多
关键词 T细胞 表位 外源性抗原 MHCII类分子 支持向量回归机
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两种基于恒定链活性片段载体在增强抗体分泌中作用的比较 被引量:5
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作者 孟凡涛 陈芳芳 余为一 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期728-732,共5页
目的:比较基于恒定链片段的两种载体的免疫效果和作用机理。方法:分别构建了含新城疫病毒抗原表位F306和Ii不同片段的三个嵌合体(Ii-key/F306、Ii-key/F306/ND(两个氨基酸残基)和用抗原表位取代Ii-CLIP的Ii/F306),经纯化后的融合蛋白免... 目的:比较基于恒定链片段的两种载体的免疫效果和作用机理。方法:分别构建了含新城疫病毒抗原表位F306和Ii不同片段的三个嵌合体(Ii-key/F306、Ii-key/F306/ND(两个氨基酸残基)和用抗原表位取代Ii-CLIP的Ii/F306),经纯化后的融合蛋白免疫小鼠,并用ELISA检测其抗体效价。同时嵌合体与Mhc共转染COS7细胞,观察两者的细胞定位与结合。结果:Ii-key/F306免疫组比单独F306抗原肽免疫组的抗体效价提高2倍,Ii-key/F306/ND免疫组增至4倍,而Ii-F306免疫组只增强2.5倍。在与Mhc共转染的COS7细胞和免疫共沉淀中,Ii-key/F306和Ii-key/F306/ND既没有与MHCⅡ分子的膜共定位作用,也不能与后者结合;而Ii-F306却能与MHCⅡ分子在浆膜共定位,并与后者结合。结论:这些结果表明,嵌合体都具有增强免疫效果的作用,并提示Ii片段促进了抗原肽与MHCⅡ分子结合。 展开更多
关键词 恒定链 抗体 共定位 MHCⅡ类分子
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结核分枝杆菌pepA蛋白的生物信息学分析 被引量:1
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作者 包嘉佳 徐蕾 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2020年第6期642-648,共7页
目的通过生物信息学方法分析结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)pepA蛋白的结构和功能。方法采用Protparam、ProtScaleon Expasy、TMHMM、SingalP5.0、PSORT、NetPHOS3.1、BLAST、SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred、SYFPEITHI等... 目的通过生物信息学方法分析结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)pepA蛋白的结构和功能。方法采用Protparam、ProtScaleon Expasy、TMHMM、SingalP5.0、PSORT、NetPHOS3.1、BLAST、SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred、SYFPEITHI等生物信息学软件分析Mtb H37Rv菌株pepA蛋白的生物学特性。结果pepA蛋白的编码基因Rv0125全长1068 bp,该蛋白由355个氨基酸组成,等电点5.04,为疏水性蛋白,有1个的信号肽和1个丝氨酸蛋白酶结构域,含有19个磷酸丝氨酸位点;蛋白二级结构中无规则卷曲占44.79%,为稳定蛋白;该蛋白预测含多个B细胞和T细胞表位,其中MHC-I型和MHC-II型表位集中在蛋白N端的前60个氨基酸区域。结论该蛋白预测含多个B细胞和T细胞表位,其中MHC-I型和MHC-II型表位集中在蛋白N端的前60个氨基酸区域,该区域可激活Mtb特异性CTL和Th免疫应答,可作为抗结核肽疫苗的候选。 展开更多
关键词 PEPA 结核分枝杆菌 MHC-I 肽疫苗
原文传递
基于AUC Optimized Gibbs方法的MHCⅡ-短肽配体结合特异性预测(英文)
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作者 盛浩 卢玉峰 张屹 《大连理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第1期28-36,共9页
在以短肽定义的或以抗原定义的疫苗设计中,识别哪个来自病原体的蛋白质片段会结合MHCⅡ分子是个重要问题.多数MHCⅡ表位预测的研究很少给出结合特异性的定量分析,所以这些模型的精确度仍然需要进一步提高.AUC Optimized Gibbs(AOG)使用... 在以短肽定义的或以抗原定义的疫苗设计中,识别哪个来自病原体的蛋白质片段会结合MHCⅡ分子是个重要问题.多数MHCⅡ表位预测的研究很少给出结合特异性的定量分析,所以这些模型的精确度仍然需要进一步提高.AUC Optimized Gibbs(AOG)使用约化同源性的AUC值而不是相对熵来引导采样,使得正样本和负样本的信息都被用于模型的训练.在10个HLA-DR4(B1*0401)原测试集和约化同源性测试集的测试中,AOG得到的平均AUC值分别是0.771和0.713,优于Gibbs的0.744和0.673.在定量IEDB的MHCⅡ测试集中,AOG得到的平均AUC值是0.766,而TEPITOPE得到的平均AUC值是0.718.从HLA-DR4(B1*0401)数据提取的信息可以识别某些有明显特异性的位置,即P1、P4、P6和P9位置,其对MHC-短肽结合有明显的影响. 展开更多
关键词 Gibbs采样方法 表位 MHCⅡ分子 约化同源性
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