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多浪羊MHC-DRB3基因座的PCR-RFLP多态性分析 被引量:21
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作者 刘云芳 剡根强 王新峰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期59-62,共4页
主要组织相容性复合体(MHC)是由紧密连锁的高度多态的基因位点所组成的染色体上的一个遗传区域,它在动物机体的免疫系统中发挥着非常重要的作用。应用PCR RFLP技术首次对多浪羊的MHC DRB3的外显子2进行分子遗传多态性检测与分析。结果显... 主要组织相容性复合体(MHC)是由紧密连锁的高度多态的基因位点所组成的染色体上的一个遗传区域,它在动物机体的免疫系统中发挥着非常重要的作用。应用PCR RFLP技术首次对多浪羊的MHC DRB3的外显子2进行分子遗传多态性检测与分析。结果显示,多浪羊MHC DRB3基因的外显子2在TaqⅠ、PstⅠ和HaeⅢ酶切位点存在多态,其酶切位点分别由2、2和6种共显性等位基因控制。综合3种酶切结果,本实验研究在多浪羊中检测到了DRB3基因的24种等位基因。 展开更多
关键词 多浪羊 分子遗传多态性 PCR-RFLP mhc-drb3基因座
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4个绵羊品种MHC-DRB3基因外显子2的多态性分析 被引量:9
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作者 魏丽君 石国庆 +4 位作者 王晓申 柳楠 管峰 代荣 任航行 《中国畜牧兽医》 CAS 2007年第7期63-66,共4页
采用PCR-RFLP方法分析4个绵羊品种(阿勒泰羊、中国美利奴肉用多胎品系、湖羊和陶塞特羊)MHC-DRB3基因第2外显子的多态性,并进行聚类分析以及基因杂合度和多态信息含量的计算。结果表明:在绵羊MHC-DRB3基因第2外显子第122、154、168、... 采用PCR-RFLP方法分析4个绵羊品种(阿勒泰羊、中国美利奴肉用多胎品系、湖羊和陶塞特羊)MHC-DRB3基因第2外显子的多态性,并进行聚类分析以及基因杂合度和多态信息含量的计算。结果表明:在绵羊MHC-DRB3基因第2外显子第122、154、168、220和241 bp碱基处表现出多态性;χ^2适合性检验结果表明,4个绵羊群体MHC-DRB3基因的第2外显子的PstⅠ酶切位点达到了Hardy-Weinberg平衡状态,TaqⅠ和HaeⅢ酶切位点多态性均未达到Hardy-Weinberg平衡状态;4个绵羊群体基因杂合度和多态信息含量值分别在0.693-0.774和0.662-0.738之间,表明4个绵羊品种具有丰富的遗传多样性;聚类结果表明,中国美利奴肉用多胎羊和湖羊亲缘关系最近,阿勒泰羊和陶塞特羊关系较远,与实际选育过程一致,MHC-DRB3多态性可作为绵羊育种标记进一步研究。 展开更多
关键词 绵羊 mhc-drb3 PCR-RFLP 遗传多态性
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新疆军垦型细毛羊MHC-DRB3基因第2外显子的多态性分析 被引量:3
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作者 李谨 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第1期33-35,共3页
为了对新疆军垦型细毛羊MHC-DRB3基因第2外显子扩增产物进行多态性分析,试验采用PCR-RFLP方法,检测内切酶PstⅠ的基因型和等位基因。结果表明:基因型BB和等位基因B是军垦型细毛羊的优势基因型和优势基因;经X2适合性检验,新疆军垦型细毛... 为了对新疆军垦型细毛羊MHC-DRB3基因第2外显子扩增产物进行多态性分析,试验采用PCR-RFLP方法,检测内切酶PstⅠ的基因型和等位基因。结果表明:基因型BB和等位基因B是军垦型细毛羊的优势基因型和优势基因;经X2适合性检验,新疆军垦型细毛羊MHC-DRB3基因第2外显子的PstⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg平衡状态。 展开更多
关键词 新疆军垦型细毛羊 mhc-drb3 PCR-RFLP
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多浪羊MHC-DRB3基因第二外显子序列分析 被引量:1
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作者 方翟 马小龙 高庆华 《生物化工》 2019年第3期26-28,共3页
主要组织相容性复合体(Major Histocompitibility Complex,MHC)广泛存在于脊椎动物中,由于高度多态性在遗传育种和抗病性方面成为人们关注的热点。本实验用直接测序技术(DR)对23 只多浪羊DRB3 基因进行核酸序列分析。并用DNAMAN 分析序... 主要组织相容性复合体(Major Histocompitibility Complex,MHC)广泛存在于脊椎动物中,由于高度多态性在遗传育种和抗病性方面成为人们关注的热点。本实验用直接测序技术(DR)对23 只多浪羊DRB3 基因进行核酸序列分析。并用DNAMAN 分析序列共检测出46 个突变位点。结果表明,MHC-DRB3 基因在多浪羊中具有较高的多态性。 展开更多
关键词 mhc-drb3基因第二外显子 多浪羊 多样性 PCR
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MHC-DRB3基因PCR-RFLP反应体系在新疆地方绵羊品种中的优化
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作者 李谨 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第12期54-55,共2页
为了探讨影响新疆地方绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLP扩增的因素,试验对影响扩增结果的各个因素和反应程序进行了研究,建立了绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLP的最佳反应体系和反应程序。结果表明:抗凝剂,模板的浓度、纯度,Mg2+的浓度,引物的浓度,... 为了探讨影响新疆地方绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLP扩增的因素,试验对影响扩增结果的各个因素和反应程序进行了研究,建立了绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLP的最佳反应体系和反应程序。结果表明:抗凝剂,模板的浓度、纯度,Mg2+的浓度,引物的浓度,变性温度,Taq聚合酶,退火温度等因素对扩增结果均会产生影响。 展开更多
关键词 绵羊 mhc-drb3基因 PCR-RFLP 反应体系 影响因素
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小尾寒羊MHC-DRB3基因外显子2的多态性分析 被引量:3
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作者 尚友国 宋美玲 +2 位作者 李建平 于艳 王建民 《中国畜牧兽医》 CAS 2006年第2期36-38,共3页
采用PCR-RFLP方法对小尾寒羊MHC-DRB 3基因第二外显子285 bp的扩增产物进行多态性分析,结果共检测到内切酶P stⅠ的3种基因型,由2个等位基因控制,通过酶切图谱分析结果表明:小尾寒羊的MHC-DRB 3基因第二外显子的第241位的碱基表现出多态... 采用PCR-RFLP方法对小尾寒羊MHC-DRB 3基因第二外显子285 bp的扩增产物进行多态性分析,结果共检测到内切酶P stⅠ的3种基因型,由2个等位基因控制,通过酶切图谱分析结果表明:小尾寒羊的MHC-DRB 3基因第二外显子的第241位的碱基表现出多态性,等位基因B的基因频率为0.81879。x2适合性检验结果表明:小尾寒的MHC-DRB 3基因的第2外显子的P stⅠ酶切位点达到了H ardy-W e inberg平衡状态。 展开更多
关键词 小尾寒羊 mhc-drb3 PCR-RFLP
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山东地方绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLPs反应体系的优化 被引量:5
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作者 尚友国 宋美玲 王建民 《草食家畜》 2005年第2期17-19,共3页
本文探讨了影响山东地方绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLPs扩增的因素,实验结果表明:抗凝剂、模板的浓度、纯度、Mg2+的浓度、引物的浓度、变性温度、Taq聚合酶、退火温度等因素对扩增结果的影响,为此我们对影响扩增结果的各个因素和反应程序... 本文探讨了影响山东地方绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLPs扩增的因素,实验结果表明:抗凝剂、模板的浓度、纯度、Mg2+的浓度、引物的浓度、变性温度、Taq聚合酶、退火温度等因素对扩增结果的影响,为此我们对影响扩增结果的各个因素和反应程序进行了研究和浓度梯度的对比试验,建立了绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLPs的最佳反应体系和反应程序。 展开更多
关键词 MHC 基因 绵羊 山东 PCR-RFLPS 优化 最佳反应体系 反应程序 MG^2+ 变性温度 退火温度 对比试验 浓度梯度 抗凝剂 聚合酶 TAQ
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马可·波罗盘羊和5种家养绵羊MHC-DRB3基因第2外显子遗传多态性分析 被引量:2
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作者 张永浩 肖逸 +2 位作者 郭丽君 阿布都热合曼·吐尔逊 王玉涛 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第3期962-972,共11页
【目的】分析马可·波罗盘羊MHC-DRB3基因第2外显子多态性,确定其等位基因数及核苷酸、氨基酸多态位点,以及与家养绵羊的遗传进化关系。【方法】采用PCR-SSCP方法对39只马可·波罗盘羊、159只塔什库尔干羊、72只藏绵羊、76只宁... 【目的】分析马可·波罗盘羊MHC-DRB3基因第2外显子多态性,确定其等位基因数及核苷酸、氨基酸多态位点,以及与家养绵羊的遗传进化关系。【方法】采用PCR-SSCP方法对39只马可·波罗盘羊、159只塔什库尔干羊、72只藏绵羊、76只宁夏滩羊、36只柯尔克孜羊和26只多浪羊MHC-DRB3基因第2外显子的等位基因进行检测,对不同绵羊品种产生的差异等位基因进行克隆及测序,并对等位基因单倍型序列进行分析;利用生物信息学在线软件分析马可·波罗盘羊MHC-DRB3基因第2外显子编码蛋白的理化性质、结构和功能。【结果】试验共获得66个MHC-DRB3等位基因,马可·波罗盘羊、塔什库尔干羊、藏绵羊、宁夏滩羊、柯尔克孜羊和多浪羊的等位基因数分别为23、14、12、12、4和1个。马可·波罗盘羊、塔什库尔干羊、藏绵羊、宁夏滩羊和柯尔克孜羊MHC-DRB3基因第2外显子等位基因序列中的核苷酸多态位点分别为74、76、45、49和25个,表明相较于藏绵羊、宁夏滩羊和柯尔克孜羊,马可·波罗盘羊和塔什库尔干羊的多态性更高。系统发育分析表明,马可·波罗盘羊和塔什库尔干羊MHC-DRB3基因均呈两支分化;马可·波罗盘羊、塔什库尔干羊和藏绵羊MHC-DRB3基因单倍型的相似性较高。马可·波罗盘羊MHC-DRB3基因第2外显子编码产物为不稳定亲水性蛋白,二级结构主要以无规则卷曲和α-螺旋为主,其生物学作用主要在细胞质中体现。【结论】本试验确定了马可·波罗盘羊和5种家养绵羊MHC-DRB3基因第2外显子的等位基因数及核苷酸、氨基酸多态位点,为进一步探究绵羊MHC-DRB3基因的调控机理及进化意义提供材料。 展开更多
关键词 马可·波罗盘羊 家养绵羊 mhc-drb3基因 PCR-SSCP 遗传多态性
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卡拉库尔羊MHC-DRB3基因的遗传多样性研究 被引量:1
9
作者 买热帕提.帕拉提 马合木提.哈力克 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期35-39,共5页
目的:实验通过MCH-DRB3基因来探讨卡拉库尔羊的遗传多态性,为绵羊遗传资源的合理利用及保护提供理论基础和科学依据。方法:采用PCR-Clone测序方法首次对卡拉库尔羊的MHC-DRB3基因的第二外显子进行分子遗传多态性检测与分析。结果:总共... 目的:实验通过MCH-DRB3基因来探讨卡拉库尔羊的遗传多态性,为绵羊遗传资源的合理利用及保护提供理论基础和科学依据。方法:采用PCR-Clone测序方法首次对卡拉库尔羊的MHC-DRB3基因的第二外显子进行分子遗传多态性检测与分析。结果:总共检测出35种单倍型,总的单倍型多样度(Hd)为0.958,核苷酸多样性(Pi)为0.05786,平均核苷酸差异数(k)为16.49062,简约信息多态位点数为54。卡拉库尔羊MHC-DRB3基因的氨基酸序列的氨基酸组成进行分析可知含量最多的氨基酸是精氨酸(Arg),平均含量为12.9%,含量最低的氨基酸是蛋氨酸(Met),平均含量为0.018%。结论:从以上参数可以看出卡拉库尔羊具有很高的遗传多样性。 展开更多
关键词 卡拉库尔羊 主要组织相容性复合(MHC) mhc-drb3 遗传多样性 PCR克隆测序
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自贡黑山羊MHC-DRB_3基因的多态性研究 被引量:2
10
作者 王杰 郑玉才 +2 位作者 杨易 王永 欧阳熙 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2006年第7期7-9,共3页
本实验研究了自贡黑山羊、金堂黑山羊、乐至黑山羊和成都麻羊MHC-DRB3基因的多态性。MHC-DRB3第2外显子的PCR扩增产物分别经限制性核酸内切酶TaqⅠ、PstⅠ、HaeⅢ消化,结果在第122、154、168、220、241位碱基显示出多态性;4个山羊群体... 本实验研究了自贡黑山羊、金堂黑山羊、乐至黑山羊和成都麻羊MHC-DRB3基因的多态性。MHC-DRB3第2外显子的PCR扩增产物分别经限制性核酸内切酶TaqⅠ、PstⅠ、HaeⅢ消化,结果在第122、154、168、220、241位碱基显示出多态性;4个山羊群体分别检测到9、10、7个和8个等位基因;聚类分析表明:金堂黑山羊和成都麻羊亲缘关系最近,首先聚为一类,再与乐至黑山羊聚为一类,最后自贡黑山羊与其他3个山羊品种聚为一类。 展开更多
关键词 畜牧 兽医科学基础学科 mhc-drb3 遗传多态性 山羊
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阿拉善驼与苏尼特驼MHC-DRB_3 exon2基因克隆及序列分析 被引量:1
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作者 亢孝珍 姜建强 +4 位作者 包花尔 王瑞 王秀珍 李盈 额尔敦木图 《内蒙古农业大学学报(自然科学版)》 CAS 2015年第5期5-11,共7页
通过DNA测序,分别对两个品种双峰驼MHC-II类基因DRB_3外显子2的基因序列进行分析。通过序列比对,发现阿拉善双峰驼有83个突变位点,79个多态位点,苏尼特双峰驼有47个突变位点和43个多态位点;两个品种双峰驼共检测到DRB_3 exon2的等位基... 通过DNA测序,分别对两个品种双峰驼MHC-II类基因DRB_3外显子2的基因序列进行分析。通过序列比对,发现阿拉善双峰驼有83个突变位点,79个多态位点,苏尼特双峰驼有47个突变位点和43个多态位点;两个品种双峰驼共检测到DRB_3 exon2的等位基因34种,等位基因的分布具有品种特异性,各等位基因之间存在大量的多态位点。在氨基酸序列中,阿拉善双峰驼共检测到44个变异位点,苏尼特双峰驼检测到25个变异位点;在阿拉善双峰驼氨基酸序列中有11个抗原结合位点,苏尼特双峰驼氨基酸序列中有9个抗原结合位点。 展开更多
关键词 双峰驼 mhc-drb3外显子2 等位基因 多态性 系统发育树
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中国荷斯坦牛BoLA-DRB3基因的mRNA表达研究 被引量:1
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作者 王学清 李魁英 +6 位作者 裴翠娟 张峰 吴占军 刘小虎 马书林 张新同 王昆 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2013年第4期19-22,共4页
为揭示牛MHC-DRB3上游调控区多态对其表达调控作用,利用PCR-SSCP和DNA序列测定技术分析并建立BoLA-DRB3*exon2和BoLA-DRB3 URR之间的连锁关系。结合不同近端调控区与转录因子结合模式预测结果,选择3种不同上游调控序列的连锁组合,应用... 为揭示牛MHC-DRB3上游调控区多态对其表达调控作用,利用PCR-SSCP和DNA序列测定技术分析并建立BoLA-DRB3*exon2和BoLA-DRB3 URR之间的连锁关系。结合不同近端调控区与转录因子结合模式预测结果,选择3种不同上游调控序列的连锁组合,应用实时定量RT-PCR技术对牛MHC-DRB3基因mRNA相对表达量进行了验证分析。结果表明,上游调控区基因型为H17H17的BoLA-DRB3基因mRNA相对表达量显著高于(P<0.01)基因型H1H1及H5H6。初步证明上游调控区中的多态会引起结构基因表达量的变化。 展开更多
关键词 mhc-drb3基因 上游调控区多态性 实时定量RT-PCR
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荷斯坦牛BoLA-DRB_3基因多态性及其与乳房炎抗性关系分析 被引量:20
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作者 张夫千 郑小敏 +2 位作者 唐大伟 赵鹏 史远刚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期115-119,共5页
以PCR-RFLP方法检测了BoLA-DRB3基因在荷斯坦奶牛中的多态性,并统计分析了产犊年季和BoLA-DRB3基因分别被RsaⅠ和HaeⅢ酶切后的不同基因型对SCS及其它产乳性状的影响。结果表明:RsaⅠAD型的SCS显著高于RsaⅠEG型(P<0.05)。另外,年季... 以PCR-RFLP方法检测了BoLA-DRB3基因在荷斯坦奶牛中的多态性,并统计分析了产犊年季和BoLA-DRB3基因分别被RsaⅠ和HaeⅢ酶切后的不同基因型对SCS及其它产乳性状的影响。结果表明:RsaⅠAD型的SCS显著高于RsaⅠEG型(P<0.05)。另外,年季和BoLA-DRB3被RsaⅠ酶切后的不同基因型对蛋白率和乳脂率的影响均达到了显著水平(P<0.05)。HaeⅢAB型个体的蛋白率显著高于HaeⅢAA型(P<0.05)。 展开更多
关键词 奶牛乳房炎 抗性 MHC BOLA-DRB3 SCS
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