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METTL7B在初诊急性髓系白血病患者中的表达及其对预后的影响
1
作者 张文邦 郭树霞 +2 位作者 张晓娟 刘焕君 刘梦瑶 《中国实验血液学杂志》 北大核心 2025年第5期1287-1292,共6页
目的:检测甲基转移酶样蛋白7B(METTL7B)在急性髓系白血病(AML)患者骨髓标本中的表达情况,并研究分析其对于AML患者临床诊疗以及预后的影响和意义。方法:收集60例初诊的AML患者的骨髓标本作为观察组、20例缺铁性贫血(IDA)患者的骨髓标本... 目的:检测甲基转移酶样蛋白7B(METTL7B)在急性髓系白血病(AML)患者骨髓标本中的表达情况,并研究分析其对于AML患者临床诊疗以及预后的影响和意义。方法:收集60例初诊的AML患者的骨髓标本作为观察组、20例缺铁性贫血(IDA)患者的骨髓标本作为对照组,并收集AML患者的临床病理特征资料。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测METTL7B在AML患者与IDA患者之间的表达情况,并对AML患者中METTL7B表达水平高低与临床病理特征的关系以及对疗效的影响进行统计学分析。使用Kaplan-Meier法分析METTL7B表达水平对AML患者的总体生存时间(OS)的影响,同时构建Cox比例风险回归模型,分析可能对AML患者预后产生影响的因素。结果:与对照组相比,METTL7B在AML患者中的表达水平显著升高(P<0.05)。与METTL7B低表达组相比,METTL7B高表达组中高白细胞计数、预后不良及治疗无效患者占比更高,差异具有统计学意义(P<0.05)。METTL7B高表达组患者的OS较低表达组明显缩短(P<0.05)。多因素Cox回归结果显示,高白细胞计数、预后不良以及METTL7B高表达是影响AML预后的独立危险因素(P<0.05)。结论:在AML患者中METTL7B表现为高表达,且METTL7B高表达患者生存期短、预后较差。METTL7B有望作为评估AML患者预后的新指标,并在今后发展为靶向治疗AML的潜在靶标。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 mettl7b 临床意义
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基于基因加权共表达与机器学习算法筛选脓毒症预后相关的焦亡基因METTL7B及其表达验证
2
作者 黄美玲 陈辉 +6 位作者 杨馨怡 方扬 陶文强 卢院华 刘芬 钱克俭 李祺 《南昌大学学报（医学版）》 2024年第6期16-26,共11页
目的利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)与机器学习算法筛选脓毒症预后焦亡相关基因,并验证其在脓毒症模型中的表达。方法从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE95233基因数据集作为训练集,GSE65624基因数据集、GSE167363单细胞转录测序数... 目的利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)与机器学习算法筛选脓毒症预后焦亡相关基因,并验证其在脓毒症模型中的表达。方法从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE95233基因数据集作为训练集,GSE65624基因数据集、GSE167363单细胞转录测序数据集作为验证集,筛选脓毒症组与正常对照组差异表达基因(DEGs)。利用焦亡相关基因,采用ConsensusClusterPlus R包进行无监督聚类,根据聚类分组在数据集中筛选焦亡相关差异基因。利用WGCNA筛选与脓毒症预后最相关的模块特征基因。脓毒症差异基因、焦亡相关差异基因结合模块特征基因,通过韦恩图(Venn diagram)得到与脓毒症预后相关的候选基因。采用最小绝对收缩与选择算子(Lasso)回归、随机森林(RF)及支持向量机(SVM)分析筛选出脓毒症预后焦亡关键基因METTL7B。对训练集GSE95233及验证集GSE65624中的关键基因METTL7B进行诊断和预后受试者工作特征(ROC)曲线及生存曲线分析。最后基于数据集GSE167363高通量测序数据分析展示METTL7B在脓毒症巨噬细胞的表达情况,并通过RT-PCR技术验证METTL7B在脓毒症造模巨噬细胞中的表达。结果筛选出脓毒症差异表达基因203个、焦亡相关差异基因689个及模块特征基因891个,通过韦恩图得到14个脓毒症预后相关候选基因。随后利用Lasso回归、支持向量机及随机森林分析对上述14个重叠基因进行筛选。Lasso回归模型中保留了6个非零系数的特征基因。随机森林算法显示当特征基因数为5时,模型准确度最高。SVM显示当特征基因数为4时,10折交叉验证误差最小。最后通过韦恩图筛选出脓毒症预后潜在焦亡关键基因METTL7B。在训练集GSE95233中METTL7B诊断及预后的AUC分别为0.990、0.702,验证集GSE65624中诊断AUC为0.939,且在该数据集,高表达METTL7B的脓毒症患者有更高的生存率。通过对GSE167363单细胞转录测序分析发现METTL7B在巨噬细胞中表达,进一步在体外实验验证了脓毒症造模巨噬细胞中METTL7B的表达升高(P<0.05)。结论通过WGCNA与机器学习算法筛选的脓毒症预后相关焦亡关键基因METTL7B,可能成为脓毒症预后标志物。 展开更多
关键词 脓毒症 加权基因共表达网络 机器学习算法 mettl7b 焦亡基因
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基于生物信息学分析METTL7B在胶质瘤组织中的表达及其临床意义 被引量：3
3
作者 周杰 徐聃 +3 位作者 李波 王首超 李欢 徐海波 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期55-62,共8页
目的:探讨甲基转移酶样蛋白7B(METTL7B)在胶质瘤组织中的表达及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:基于CGGA数据库胶质瘤数据和GTEx数据库正常脑组织数据,分析METTL7B基因在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异,并用GEPIA数据库数... 目的:探讨甲基转移酶样蛋白7B(METTL7B)在胶质瘤组织中的表达及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:基于CGGA数据库胶质瘤数据和GTEx数据库正常脑组织数据,分析METTL7B基因在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异,并用GEPIA数据库数据和免疫组织化学染色法进行验证。用Kaplan-Meier生存分析、单因素Cox分析、多因素Cox分析及ROC曲线分析等评估METTL7B在胶质瘤患者预后中的价值,用CGGA数据库数据分析METTL7B表达与胶质瘤患者临床病理特征的相关性,用CIBERSORT及TIMER数据库进行肿瘤免疫细胞浸润分析,进行KEGG通路富集分析及GO功能富集分析,通过基因共表达分析确定与METTL7B相关的基因。结果:METTL7B在胶质瘤组织中明显上调(均P<0.05),METTL7B表达是胶质瘤患者独立的不良预后因素。METTL7B高表达与高龄(>41岁)、肿瘤分级增加、肿瘤复发或继发性肿瘤、IDH野生型、1p19q非共缺失以及肿瘤的恶性病理学有关联(均P<0.01);METTL7B表达与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、单核细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、活化肥大细胞等免疫细胞有关联(均P<0.05)。KEGG通路富集及GO功能分析结果显示,肿瘤相关信号通路及多种免疫反应在METTL7B高表达表型中显著富集。基因共表达分析结果表明,METTL7B与TNFRSF12A、CHI3L1、EMP3表达呈正相关(r=0.807、0.804、0.783,均P<0.01),与ELFN2、REPS2、SHANK2表达呈负相关(r=-0.642、-0.627、-0.602,均P<0.01)。结论:METTL7B在胶质瘤组织中的表达上调是预后不良的指标,且与肿瘤免疫浸润相关。 展开更多
关键词 胶质瘤 甲基转移酶样蛋白7B 免疫浸润 生物标志物 预后
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