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高度近视人群METTL4基因的单核苷酸多态分析 被引量：3
1
作者 易军晖 郭向明 +6 位作者 肖学珊 贾小云 黎仕强 李家璋 张丰生 李鸵 张清炯 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期1035-1037,共3页
目的 :分析位于 18p11.31的METTL4基因的单核苷酸多态 (SNPs) ,探讨它们与高度近视发病的关系。方法 :收集正常对照人群 71例及高度近视患者 177例 ,其中常染色体显性遗传家系先证者 (AD组 ) 5 9例、常染色体隐性遗传家系先证者 (AR组 )... 目的 :分析位于 18p11.31的METTL4基因的单核苷酸多态 (SNPs) ,探讨它们与高度近视发病的关系。方法 :收集正常对照人群 71例及高度近视患者 177例 ,其中常染色体显性遗传家系先证者 (AD组 ) 5 9例、常染色体隐性遗传家系先证者 (AR组 ) 4 6例、无明显家系的散发患者 (SF组 ) 5 2例。制备外周血基因组DNA ,PCR扩增METTL4基因的外显子序列 ,应用异源双链 -单链构象多态性 (HA -SSCP)方法分析PCR产物 ,对存在差异条带的PCR产物进行测序分析。结果 :在METTL4基因的编码区发现 2个SNPs位点 :SNP74 38A→C位于第 2外显子 ,Glu 2 30Asp ,在GenBank未见报道 ;SNP131C→A位于第 4外显子 ,Gln310Lys。正常人与高度近视各组SNP74 38A→C的基因型分布无明显差异 ;AR高度近视组、SF高度近视组的SNP131C→A基因型分布与对照人群无显著差异 ,而AD高度近视与对照组差异显著 (P <0 0 5 )。结论 :SNP74 38A→C与高度近视的发病无关。SNP131C→A与AD高度近视发病的关系需要进一步研究。 展开更多
关键词 近视 基因 mettl4 多态性 单核苷酸
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N7-甲基鸟嘌呤表观遗传修饰参与恶性肿瘤发生发展的研究进展
2
作者 张苗 吴锐 +2 位作者 刘悦 刘瑶 赵攀 《成都医学院学报》 CAS 2024年第3期547-551,共5页
RNA修饰作为调控RNA功能的一种高度特异性和高效率的方法,近年来已成为表观遗传学领域主要研究方向之一。目前已有100多种不同类型的RNA修饰被发现,包括RNA编辑、剪接、5-帽子和转录内修饰等不可逆修饰及甲基化、羟基化等可逆修饰,二者... RNA修饰作为调控RNA功能的一种高度特异性和高效率的方法,近年来已成为表观遗传学领域主要研究方向之一。目前已有100多种不同类型的RNA修饰被发现,包括RNA编辑、剪接、5-帽子和转录内修饰等不可逆修饰及甲基化、羟基化等可逆修饰,二者均在调节RNA功能中起着关键作用。 展开更多
关键词 N7-甲基鸟嘌呤 RNA修饰 METTL1/WDR4 恶性肿瘤
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人胃食管交界处腺癌mRNA m7G修饰情况的初步分析
3
作者 刘滋验 王晓燕 +3 位作者 胡滨滨 张诗琪 郎亚昆 范钰 《中华医学遗传学杂志》 2025年第2期187-197,共11页
目的探讨mRNA m7G修饰在人胃食管交界处腺癌(AEG)发生发展中的潜在作用。方法选取2018年至2019年就诊于江苏大学附属人民医院的4例接受手术治疗的AEG患者病理组织标本为研究对象。收集患者AEG组织与癌旁正常组织,提取RNA样品后进行m7G... 目的探讨mRNA m7G修饰在人胃食管交界处腺癌(AEG)发生发展中的潜在作用。方法选取2018年至2019年就诊于江苏大学附属人民医院的4例接受手术治疗的AEG患者病理组织标本为研究对象。收集患者AEG组织与癌旁正常组织,提取RNA样品后进行m7G甲基化RNA免疫共沉淀测序(m7G-MeRIP-seq),分析2组m7G修饰模式、m7G修饰差异位点特征、差异表达mRNA特征、差异m7G修饰与mRNA表达量的相关性。应用甲基化RNA免疫共沉淀实时荧光定量PCR(MeRIP-qPCR)对差异m7G修饰位点基因(MSH6、BRCA1、SOX9)进行验证。应用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析METTL1与WDR4基因在2组间的表达情况。本研究已通过江苏省大学附属人民医院医学伦理委员会的审查(批准号:伦研批第20150083号)。结果①m7G-MeRIP-seq分析结果显示,AEG组织与癌旁正常组织的m7G修饰主要位于mRNA内部起始密码子GC富集区,2组间m7G修饰差异位点基因与癌症密切相关。②mRNA文库分析结果显示,2组间差异表达mRNA在AEG组织中主要呈上调趋势,在癌旁正常组织中主要呈下调趋势。③交叉分析结果显示,AEG组织中超甲基化修饰基因倾向于表达上调,低甲基化修饰基因倾向于表达下调。④MeRIP-qPCR验证结果显示,AEG组织中MSH6、BRCA1和SOX9基因mRNA表达量均上调(AEG组织比癌旁正常组织,P<0.05)。⑤RT-qPCR检测结果显示,AEG组织中METTL1与WDR4基因mRNA表达量均上调(AEG组织比癌旁正常组织,P<0.0005)。结论上述研究成果揭示mRNA m7G修饰可能在AEG的发生与发展中发挥重要作用,METTL1和WDR4蛋白可能通过调节mRNA m7G修饰进而促进AEG的进程,为AEG的分子机制研究与治疗提供相关依据。 展开更多
关键词 m7G修饰 胃食管交界处腺癌 mRNA甲基化 甲基化RNA免疫共沉淀 METTL1/WDR4蛋白复合体
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海马神经元线粒体DNA 6mA在血管性认知障碍中的作用研究 被引量：1
4
作者 陈子怡 杨凌飞 +3 位作者 王开昕 李庆生 贾延劼 龚哲 《中华神经医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期757-768,共12页
目的探讨海马神经元线粒体DNA N6-脱氧腺苷甲基化(6mA)在血管性认知障碍中的作用及相关机制。方法(1)体内实验:采用随机数字表法将SPF级健康雄性大鼠分为假手术组及慢性脑低灌注(CCH)组,每组12只。CCH组大鼠结扎双侧颈总动脉建立CCH模型... 目的探讨海马神经元线粒体DNA N6-脱氧腺苷甲基化(6mA)在血管性认知障碍中的作用及相关机制。方法(1)体内实验:采用随机数字表法将SPF级健康雄性大鼠分为假手术组及慢性脑低灌注(CCH)组,每组12只。CCH组大鼠结扎双侧颈总动脉建立CCH模型;假手术组大鼠仅分离双侧颈总动脉,不结扎。2组大鼠于造模后第50天采用旷场实验检测探索能力,第51~53天采用新物体识别试验进行认知功能评估,第54~59天采用Morris水迷宫法检测学习记忆能力。随后处死大鼠检测海马组织ATP浓度及活性氧(ROS)荧光强度并通过TUNEL染色检测海马CA1区神经元凋亡情况。(2)体外实验:HT-22细胞分为正常对照(NC)组、氧糖剥夺(OGD)组、OGD+siControl组、OGD+siMETTL4组。其中NC组正常培养细胞,OGD组给予低糖低氧处理12 h,OGD+siControl组及OGD+siMETTL4组分别给予NC-siRNA、METTL4-siRNA转染细胞后低糖低氧处理12 h。通过透射电镜观察细胞线粒体形态,采用流式细胞术检测细胞ROS荧光强度,通过JC-1荧光染色检测细胞线粒体膜电位,使用试剂盒检测线粒体复合物Ⅰ、Ⅲ活性。(3)体内及体外实验:采用免疫荧光染色实验及Western blotting实验检测大鼠海马组织神经元线粒体及HT-22细胞线粒体中METTL4及DNA 6mA表达。结果(1)体内实验:与假手术组比较,CCH组大鼠出现认知障碍表现,表现为旷场实验中进入中心区域次数明显增多,探索新物体时间明显减少,水迷宫实验中穿越平台次数明显减少,逃避潜伏期明显延长,差异均有统计学意义(P<0.05)。与假手术组大鼠比较,CCH组大鼠海马ATP浓度明显下降[(18.820±1.177)nmol/Lvs.(10.190±0.519)nmol/L],ROS荧光强度明显增加[(4488.00±255.70)AUvs.(11644.00±530.20)AU],差异均有统计学意义(P<0.05)。TUNEL染色实验结果显示CCH组大鼠海马神经CA1区凋亡神经元数量较假手术组大鼠明显增多。免疫荧光染色结果显示CCH组大鼠海马神经元中6mA及METTL4分布以线粒体为主,表达较假手术组大鼠均明显增加。Western blotting实验结果显示CCH组大鼠海马组织线粒体中METTL4表达较假手术组大鼠明显升高(1.729±0.168vs.1.000±0.000),差异有统计学意义(P<0.05)。(2)体外实验:透射电镜下,与NC组比较,OGD组细胞表现为线粒体嵴消失、膜断裂、空泡化明显。与OGD组细胞比较,OGD+siMETTL4组细胞ATP生成明显增加,ROS生成明显减少,线粒体膜电位明显升高,线粒体复合物Ⅰ和Ⅲ活性明显增加,差异均有统计学意义(P<0.05)。细胞免疫荧光染色实验结果显示,OGD组细胞mtDNA 6mA及METTL4表达较NC组明显增加,且两者以在线粒体中表达为著;OGD+siMETTL4组细胞线粒体DNA(mtDNA)6mA及METTL4表达较OGD组细胞均明显降低。Western blotting实验结果显示,OGD+siMETTL4组细胞中METTL4表达较OGD组明显降低(1.578±0.261vs.2.970±0.280),差异有统计学意义(P<0.05)。结论CCH后认知障碍大鼠海马组织神经元线粒体特异性高表达的甲基化酶METTL4促使mtDNA 6mA表达增加,进而导致线粒体能量代谢障碍及ROS升高,可能为血管性认知障碍的机制之一。 展开更多
关键词 血管性认知障碍 慢性脑低灌注 线粒体DNA 6mA mettl4
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