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基于Transformer的促炎肽预测 被引量:1
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作者 孙一平 《计算机时代》 2025年第4期11-14,19,共5页
提出了一种基于改进Transformer架构的深度学习模型,用于预测促炎肽,以解决传统实验方法周期长及特征表征不足的问题。模型通过整合多维度3-mer特征编码,构建改进的Transformer深度学习框架,基于去冗余数据集的五折交叉验证表明,改进模... 提出了一种基于改进Transformer架构的深度学习模型,用于预测促炎肽,以解决传统实验方法周期长及特征表征不足的问题。模型通过整合多维度3-mer特征编码,构建改进的Transformer深度学习框架,基于去冗余数据集的五折交叉验证表明,改进模型在关键性能指标上显著优于基准方法MultiFeatVotPIP:准确率(ACC)提升11.4%至76.9%,曲线下面积(AUC)提高12.2%至80.8%。特征分析验证了3-mer特征在捕捉局部残基模式和跨域相互作用中的优势,为高通量促炎肽筛选和炎症疾病机制研究提供了新工具和新思路。 展开更多
关键词 TRANSFORmer 促炎肽 深度学习 3-mer 特征编码
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基于k-mer特征集合的非比对算法研究进展
2
作者 杨振华 《河北北方学院学报(自然科学版)》 2025年第1期30-36,共7页
随着高通量测序技术的发展,产生了大量全基因组序列数据。为提升非比对算法在构建全基因组序列进化关系方面的灵敏度和准确性,选择合适的k-mer模体数目十分重要。综述了4类基于k-mer特征集的非比对计算方法:k-mer频率、k-mer间隔分布、k... 随着高通量测序技术的发展,产生了大量全基因组序列数据。为提升非比对算法在构建全基因组序列进化关系方面的灵敏度和准确性,选择合适的k-mer模体数目十分重要。综述了4类基于k-mer特征集的非比对计算方法:k-mer频率、k-mer间隔分布、k-mer与机器学习结合以及k-mer频谱。这些非比对算法在选择k-mer模体数目时具有一定的随意性,从而降低了其作为物种分类标准的可靠性。基于k-mer频谱特征的方法,能够筛选出与基因组进化密切相关的k-mer客观特征集合,这为更加客观表征物种进化关系提供了有效方法。 展开更多
关键词 非比对算法 全基因组序列 k-mer特征集合 进化关系
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Mer受体酪氨酸激酶与SD大鼠糖尿病周围神经病变的相关性
3
作者 苏晓杨 陈文婷 +3 位作者 付怡丹 赵燕 兰丹凤 杨秋萍 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第8期1593-1599,共7页
背景:糖尿病周围神经病变的发病机制目前尚未明确,TAM(Tyro3、Axl和MerTK)受体酪氨酸激酶具有控制中枢神经系统凋亡细胞和抑制炎症反应的作用。目的:探讨2型糖尿病及其周围神经病变SD大鼠血浆及坐骨神经组织Mer受体酪氨酸激酶水平的差异... 背景:糖尿病周围神经病变的发病机制目前尚未明确,TAM(Tyro3、Axl和MerTK)受体酪氨酸激酶具有控制中枢神经系统凋亡细胞和抑制炎症反应的作用。目的:探讨2型糖尿病及其周围神经病变SD大鼠血浆及坐骨神经组织Mer受体酪氨酸激酶水平的差异,研究Mer受体酪氨酸激酶与糖尿病周围神经病变的关联性。方法:40只雄性SD大鼠随机分为对照组15只、2型糖尿病组10只及2型糖尿病周围神经病变组15只。对照组大鼠喂普通饲料,实验组大鼠行高脂高糖饮食6周,并腹腔内注射单剂量小剂量链脲佐菌素35 mg/kg,14 d尾静脉取血检测血糖≥16.7 mmol/L为2型糖尿病造模成功。周围神经病变组大鼠动物继续高糖、高脂喂养8周。麻醉后活体分离检测大鼠坐骨神经传导速度,腹主动脉取血,取坐骨神经组织。光镜下观察各组神经纤维组织学改变,确认糖尿病周围神经病变造模成功。ELISA检测大鼠外周血血糖、血脂及血清MerTK水平,苏木精-伊红染色观察坐骨神经组织学改变;免疫荧光、免疫组化及免疫蛋白印迹检测坐骨神经组织中MerTK的表达。结果与结论:①实验成功构建SD大鼠2型糖尿病及2型糖尿病周围神经病变大鼠模型,糖尿病周围神经病变成模率80%;与对照组比较,2型糖尿病及糖尿病周围神经病变组大鼠血糖水平显著升高(P<0.0001),糖尿病周围神经病变组高于2型糖尿病组;坐骨神经传导速度明显下降(P<0.05),糖尿病周围神经病变组低于2型糖尿病组。②组织学检查:与对照组相比,2型糖尿病组大鼠坐骨神经核减少,有部分空泡变性,出现吞噬细胞;糖尿病周围神经病变组胞体肿胀,核间距增大,出现空泡变性,髓鞘周围出现隔断、不平滑,轴索变为网格状。③血清中MerTK水平:糖尿病周围神经病变组显著高于对照组(P<0.05)。④坐骨神经组织中MerTK的表达:与对照组比较,糖尿病周围神经病变组中明显上调(P<0.05)。⑤结论:糖尿病周围神经病变大鼠血浆及坐骨神经组织中Mer受体酪氨酸激酶水平升高,推测与其抗炎及免疫调节作用有关。 展开更多
关键词 mer受体酪氨酸激酶 糖尿病周围神经病变 生物学标记物 2型糖尿病 SD大鼠
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针刺对佐剂性关节炎小鼠Mer受体酪氨酸激酶相关胞葬途径的影响
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作者 赵季宇 苑功名 +5 位作者 李佩云 王新梦 刘子瑄 徐媛 郭永明 李媛 《针刺研究》 北大核心 2025年第9期1021-1028,共8页
目的:观察针刺“足三里”对完全弗氏佐剂(CFA)诱导的佐剂性关节炎小鼠Mer受体酪氨酸激酶(MerTK)相关胞葬调节分子表达的影响,探讨针刺对佐剂性关节炎胞葬的潜在作用机制。方法:将C57BL/6J小鼠随机分为盐水组、模型组和针刺组,每组10只... 目的:观察针刺“足三里”对完全弗氏佐剂(CFA)诱导的佐剂性关节炎小鼠Mer受体酪氨酸激酶(MerTK)相关胞葬调节分子表达的影响,探讨针刺对佐剂性关节炎胞葬的潜在作用机制。方法:将C57BL/6J小鼠随机分为盐水组、模型组和针刺组,每组10只。盐水组右后足底注射0.9%氯化钠溶液,模型组和针刺组右后足底注射CFA造模。针刺组选取双侧“足三里”针刺,1次/d,共7次,盐水组与模型组同等固定。于造模前、造模当天(D0)及针刺第1、3、5、7天(D1、D3、D5、D7)检测小鼠足爪肿胀度和热刺激缩足潜伏期(PWTL)评估各组小鼠足爪肿胀及疼痛情况;采用实时荧光定量PCR法检测脊髓组织肿瘤坏死因子(TNF)α、白细胞介素(IL)-6及IL-1β的mRNA表达;采用Western blot法检测足垫和脊髓组织MerTK、磷酸化(p)-信号传导及转录激活因子3(STAT3)、STAT3、细胞程序性死亡-配体1(PD-L1)的蛋白表达。结果:造模后,与盐水组相比,模型组小鼠D0~D7 PWTL降低(P<0.01),足爪肿胀程度增加(P<0.01),脊髓组织TNF-α、IL-6及IL-1β的mRNA表达上升(P<0.05),脊髓PD-L1及足垫MerTK、PD-L1蛋白表达下降(P<0.01),脊髓及足垫STAT3磷酸化水平下降(P<0.01)。针刺干预后,与模型组相比,针刺组D1~D7 PWTL升高(P<0.01),D7时足爪肿胀程度降低(P<0.01),脊髓组织TNF-α、IL-6及IL-1β的mRNA表达明显下降(P<0.05),脊髓及足垫MerTK、PD-L1蛋白表达水平及STAT3磷酸化水平升高(P<0.01)。结论:针刺能够改善佐剂性关节炎小鼠关节炎症状,可能与促进MerTK介导的胞葬进而发挥抗炎作用有关。 展开更多
关键词 针刺 佐剂性关节炎 胞葬 mer受体酪氨酸激酶
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磷酸MER值对磷酸二铵产品质量影响分析
5
作者 马银堂 金兆杰 《山西化工》 2025年第10期76-78,共3页
通过实验,探究磷酸MER参数与磷酸二铵成品质量的相关性。结果表明:磷酸MER数值与产品质量呈负相关关系,当MER值降至0.102以下时,所得磷酸二铵的各项指标均能符合GB 10205—2009规定的优等品标准。通过精确调节磷酸MER参数,并配合硫酸等... 通过实验,探究磷酸MER参数与磷酸二铵成品质量的相关性。结果表明:磷酸MER数值与产品质量呈负相关关系,当MER值降至0.102以下时,所得磷酸二铵的各项指标均能符合GB 10205—2009规定的优等品标准。通过精确调节磷酸MER参数,并配合硫酸等辅料的投加比例,可有效提升成品中的氮元素质量分数,从而实现对产品综合养分的优化控制。 展开更多
关键词 磷酸 mer 磷酸二铵 品质
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非小细胞肺癌组织中KPNB1,MERTK的表达水平与临床病理特征的相关性及无进展生存预后的研究
6
作者 刘素荣 权阳 +3 位作者 朱娇 刘娟 刘静静 刘艳 《现代检验医学杂志》 2025年第1期53-58,共6页
目的 研究非小细胞肺癌(NSCLC)组织中核转运蛋白β1(KPNB1)、Mer受体酪氨酸激酶(MERTK)的表达水平与临床病理特征的相关性及无进展生存预后的研究。方法 选取2018年2月~2020年2月在兵器工业五二一医院就诊的118例NSCLC患者。采用免疫组... 目的 研究非小细胞肺癌(NSCLC)组织中核转运蛋白β1(KPNB1)、Mer受体酪氨酸激酶(MERTK)的表达水平与临床病理特征的相关性及无进展生存预后的研究。方法 选取2018年2月~2020年2月在兵器工业五二一医院就诊的118例NSCLC患者。采用免疫组织化学法(IHC)检测NSCLC癌组织和癌旁组织中KPNB1,MERTK的表达。使用Kaplan-Meier法评估KPNB1,MERTK表达与患者无进展生存的关系;COX回归分析影响患者无进展生存的因素。结果 癌组织KPNB1(61.02%),MERTK(62.71%)阳性率高于癌旁组织(8.48%,6.78%),差异具有统计学意义(χ^(2)=69.945,81.408,均P<0.001)。癌组织中KPNB1与MERTK表达呈显著正相关(r=0.744,P<0.001)。淋巴结转移、TNM分期ⅢA期NSCLC癌组织KPNB1(84.21%,82.50%),MERTK(84.21%,85.00%)阳性率高于无淋巴结转移(50.00%,52.50%),TNM分期Ⅰ~Ⅱ期(50.00%,51.28%),差异具有统计学意义(χ^(2)=11.078~12.855,均P<0.001)。KPNB1和MERTK阳性、阴性组三年无进展生存率分别为26.39%(19/72)和56.52%(26/46),27.03%(20/74)和56.82%(25/44),差异具有统计学意义(Log-Rankχ^(2)=10.980,8.463,P=0.001,0.004)。KPNB1阳性、MERTK阳性、淋巴结转移、TNM分期ⅢA期是NSCLC患者无进展生存预后的危险因素(waldχ^(2)=7.810~10.906,均P<0.001)。结论 NSCLC中KPNB1,MERTK表达升高,两者与TNM分期及淋巴结转移有关,是新的评估NSCLC无进展生存预后的标志物。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 核转运蛋白β1 mer受体酪氨酸激酶 无进展生存
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糖尿病视网膜病变中Gas6/MerTK/GPX4信号通路参与铁诱导的细胞死亡的作用研究 被引量:1
7
作者 邓里 李灵 +3 位作者 岳江 刘政群 银娟萍 蔡小丽 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第10期1777-1784,共8页
目的探讨糖尿病视网膜病变(DR)中配体生长停滞特异性蛋白6(Gas6)/Mer酪氨酸激酶(MerTK)信号通路参与铁诱导的细胞死亡的作用。方法人视网膜色素上皮细胞(ARPE-19)分为对照组、HG组、HG+sh-Gas6组和HG+Gas6组。将细胞暴露于25 mmol/L D-... 目的探讨糖尿病视网膜病变(DR)中配体生长停滞特异性蛋白6(Gas6)/Mer酪氨酸激酶(MerTK)信号通路参与铁诱导的细胞死亡的作用。方法人视网膜色素上皮细胞(ARPE-19)分为对照组、HG组、HG+sh-Gas6组和HG+Gas6组。将细胞暴露于25 mmol/L D-葡萄糖用于模拟体外高血糖(HG)环境。对照组暴露于20 mmol/L甘露醇+5.5 mmol/L葡萄糖环境。将大鼠随机分为正常对照组、DR组、DR+Gas6组,每组20只。通过腹膜内注射STZ溶液建立DR模型。通过细胞计数检测试剂盒-8(CCK-8)评估细胞增殖。通过流式细胞术测量脂质活性氧(ROS)水平,并通过生化测定丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)水平来评估铁死亡。通过Western blot法分析Gas6、MerTK蛋白表达情况。结果与HG组相比,HG+Gas6组细胞活力、SOD、GSH-Px水平显著增加(P<0.05),脂质-ROS、MDA水平显著降低(P<0.05);HG+sh-Gas6组细胞活力、SOD、GSH-Px水平显著降低(P<0.05),脂质-ROS、MDA水平显著增加(P<0.05)。此外,HG+Gas6组细胞中谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)蛋白表达较HG组显著增加(P<0.05),HG+sh-Gas6组细胞中GPX4蛋白表达较HG组显著减少(P<0.05)。与对照组相比,DR组大鼠的平均视网膜神经纤维层厚度显著降低(P<0.05),DR+Gas6组则较DR组显著增加(P<0.05)。此外,DR+Gas6组视网膜色素上皮(RPE)组织中MDA、铁水平显著降低(P<0.05),GSH水平和Gas6、MerTK、GPX4蛋白表达显著增加(P<0.05)。结论HG处理通过抑制Gas6/MerTK信号通路,加速GPX4的清除,诱导ARPE-19细胞的铁死亡和细胞生长抑制。此外,通过上调DR大鼠视网膜组织中Gas6/MerTK信号表达,减轻RPE组织中铁死亡和氧化应激,并有助于恢复视网膜平均视网膜神经纤维层厚度。 展开更多
关键词 糖尿病视网膜病变 配体生长停滞特异性蛋白6 mer酪氨酸激酶 铁死亡 大鼠
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针灸通过mER信号通路干预雌性大鼠乳房发育的作用机制研究
8
作者 何国珍 刘晓 +2 位作者 员晓云 梁桂枝 彭红华 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2024年第13期3101-3104,共4页
目的 研究针灸通过膜性雌激素受体(mER)信号通路对雌性大鼠乳房发育的影响及作用机制。方法 30只4周龄雌性SD大鼠随机分为空白对照组、针灸治疗组以及雌二醇组。针灸治疗组取发育特定组合穴包括乳中四穴(膻中、乳根、天溪、膺窗)及足三... 目的 研究针灸通过膜性雌激素受体(mER)信号通路对雌性大鼠乳房发育的影响及作用机制。方法 30只4周龄雌性SD大鼠随机分为空白对照组、针灸治疗组以及雌二醇组。针灸治疗组取发育特定组合穴包括乳中四穴(膻中、乳根、天溪、膺窗)及足三里、三阴交、少泽、太冲行针灸治疗,雌二醇组肌注苯甲酸雌二醇0.5mg/kg,每两天干预1次,持续30d。苏木素-依红染色法(HE)检测乳腺组织结构变化;蛋白免疫印迹法(WB)检测乳腺组织中氨基末端激酶(JNK)、雌激素受体α(Erα)、催乳素受体(PRLR)、生长激素受体(GHR)、孕激素受体(PR)、细胞外信号调节蛋白激酶(ERK)、蛋白激酶A(PKA)、蛋白激酶B(Akt)蛋白的表达水平;采用酶联免疫吸附测定法(ELISA)监测血清中雌二醇(E_(2))、催乳素(PRL)、生长激素(GH)、孕酮(P)、胰岛素样生长因子1(IGF-1)的表达水平。结果 乳腺组织形态变化:空白对照组乳腺组织中成熟腺泡数量少,腺体大小比较均匀。与空白对照组相比,针灸治疗组与雌二醇组成熟腺泡数量明显增加,细胞排列较密集,乳头腔隙明显增大(P<0.05);与针灸治疗组相比,雌二醇组乳头腔隙增大更为显著(P<0.05)。乳腺组织各蛋白表达水平比较:与空白对照组相比,针灸治疗组与雌二醇组乳腺组织中JNK、ERα、PRLR、GHR、PR、ERK、PKA、Akt蛋白的表达水平显著升高(P<0.05);与针灸治疗组相比,雌二醇组各蛋白的表达水平升高更为显著(P<0.05)。血清性激素表达水平比较:与空白对照组相比,针灸治疗组与雌二醇组血清中E_(2)、PRL、GH、P、IGF-1的表达水平显著升高(P<0.05);与针灸治疗组相比,雌二醇组各激素表达水平升高更为显著(P<0.05)。结论 针灸能够有效促进大鼠乳房发育,其作用机制可能是通过调控mER信号通路来实现的。 展开更多
关键词 针灸 乳房发育 mer信号通路 JNK E_(2)
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高等生物中基因组序列8-mer频谱分布模式及其在物种进化研究中的应用
9
作者 杨振华 王丽 郑燕 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期228-240,共13页
基因组序列的8-mer频谱具有物种特异性,解读8-mer频谱内在规律,对于揭示基因组序列的结构组成和进化模式具有重要的意义。本研究统计了66个物种的8-mer频谱分布,发现高等哺乳动物8-mer频谱分布以三峰为主,鸟类和爬行类动物频谱分布以双... 基因组序列的8-mer频谱具有物种特异性,解读8-mer频谱内在规律,对于揭示基因组序列的结构组成和进化模式具有重要的意义。本研究统计了66个物种的8-mer频谱分布,发现高等哺乳动物8-mer频谱分布以三峰为主,鸟类和爬行类动物频谱分布以双峰为主,而鱼类和非脊椎类动物频谱分布以单峰为主。为了进一步研究基因组8-mer频谱的构成,使用16种XY二核苷分类方法。研究结果表明,只有在CG分类下具有以下两个特征:(1)CG0、CG1和CG2子集的8-mer频谱呈现单峰分布,并且3个峰彼此分离;(2)相对随机中心位置,CG1和CG2子集频谱分布远离随机中心,CG0子集频谱分布在随机中心周围。为了进一步验证CG0、CG1和CG2子集频谱分布与物种进化的关系,使用3个CG子集频谱的分离性指标构建了66个物种的系统发育树,该系统发育树将物种分为4个簇,分别为高等哺乳类、鸟类与爬行类、鱼类和非脊椎类。研究结果表明3个CG子集频谱分布与物种基因组进化信息密切相关。 展开更多
关键词 基因组序列 8-mer频谱 分离性 系统发育树
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磷酸中MER值对磷酸氢钙反应过程的影响与研究 被引量:1
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作者 沈海龙 张灿 +4 位作者 何宾宾 杨军 李雪 朱桂华 侯屹东 《山东化工》 CAS 2024年第2期21-23,共3页
磷酸氢钙反应是制备磷酸盐产品的重要工艺步骤之一。MER值(Magnesium to Extractable Phosphorus Ratio)作为一个衡量磷酸氢钙反应过程中杂质含量的指标,对反应过程的影响引起了广泛的关注。通过研究液相中的反应物扩散过程、杂质产物... 磷酸氢钙反应是制备磷酸盐产品的重要工艺步骤之一。MER值(Magnesium to Extractable Phosphorus Ratio)作为一个衡量磷酸氢钙反应过程中杂质含量的指标,对反应过程的影响引起了广泛的关注。通过研究液相中的反应物扩散过程、杂质产物对固体膜和液体膜的影响、磷酸电离与氢离子活度变化的关系以及镁离子对反应速率和能耗的影响,探讨了MER值对磷酸氢钙反应过程的影响机制。实验结果表明,较高的MER值会导致反应物扩散受阻、杂质产物影响反应进行、磷酸电离减弱以及反应速率降低。因此,在工业生产中,需要控制和优化MER值,以提高反应过程的效果和产物的纯度。这些研究结果对于磷酸氢钙反应的工艺改进和优化具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 磷酸 mer 磷酸氢钙
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受体酪氨酸激酶Mer对高糖环境培养的大鼠雪旺细胞系RSC96增殖调控作用观察
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作者 付怡丹 陈文婷 +3 位作者 苏晓杨 赵燕 兰丹凤 杨秋萍 《山东医药》 CAS 2024年第6期29-33,共5页
目的观察受体酪氨酸激酶Mer(MER tyrosine kinase,Mertk)在高糖环境培养条件下的大鼠雪旺细胞系RSC96增殖的调控作用。方法取RSC96分为一、二、三、四、五组,分别置于含25(正常葡萄糖浓度)、50、75、100及125 mmol/L葡萄糖的培养基中培... 目的观察受体酪氨酸激酶Mer(MER tyrosine kinase,Mertk)在高糖环境培养条件下的大鼠雪旺细胞系RSC96增殖的调控作用。方法取RSC96分为一、二、三、四、五组,分别置于含25(正常葡萄糖浓度)、50、75、100及125 mmol/L葡萄糖的培养基中培养,培养48 h时采用Western Blotting法检测各组细胞Mertk,筛选Mertk蛋白相对表达量最高浓度为后续研究的高糖浓度。取RSC96细胞先饥饿处理4 h,置入含100 mmol/L的葡萄糖培养基中,分别于培养0、24、36、48、60 h时取各组细胞,采用Western Blotting法检测各组细胞Mertk,最终筛选Mertk蛋白相对表达量高的时间为后续研究培养时间。取RSC96细胞,分为对照组、高糖组、高糖敲降组及敲降组:高糖组细胞饥饿处理4 h,置于含100 mmol/L葡萄糖的培养基中培养;高糖敲降组细胞饥饿处理4 h,置于含100 mmol/L葡萄糖的培养基中,后加入5μL的敲降Mertk基因表达siRNA溶液;敲降组细胞饥饿处理4 h,加入5μL的敲降Mertk基因表达siRNA溶液;对照组细胞用正常培养基培养。培养48 h时取各组细胞,采用Edu法测算各组细胞增殖活力,采用Western Blotting法检测各组细胞Mertk、磷酸化核转录因子κB、P65及肿瘤坏死因子α(TNF-α)。结果与一组相比,四、五组细胞Mertk蛋白相对表达量高(P均<0.05);与培养0 h相比,培养48、60 h时RSC96细胞Mertk相对表达量高(P均<0.05)。与对照组相比,高糖组细胞增殖活力低(P<0.05),敲降组细胞增殖活力高(P<0.05);与对照组相比,高糖敲降组细胞P65、TNF-α相对表达量高(P均<0.05),敲降组细胞Mertk相对表达量低、P65及TNF-α相对表达量高(P均<0.05),高糖组细胞Mertk、P65及TNF-α相对表达量高(P均<0.05)。结论敲降Mertk基因表达的高糖环境培养RSC96细胞的增殖能力高,细胞P65、TNF-α表达高。Mertk可能通过促进细胞P65、TNF-α表达,促进高糖环境培养RSC96细胞的增殖。 展开更多
关键词 受体酪氨酸激酶 受体酪氨酸激酶mer 葡萄糖 雪旺细胞 细胞增殖 核转录因子κB P65基因 肿瘤坏死因子α
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MER联合Lead-DBS在帕金森病患者术后程控中的应用研究
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作者 刘明辉 杨新超 +2 位作者 路小奇 田海港 郭效东 《临床研究》 2024年第7期11-14,共4页
目的探讨微电极记录(MER)联合多模态影像融合技术(Lead-DBS)多模态影像融合技术在帕金森病患者术后程控中的应用效果。方法选取中国人民解放军联勤保障部队第九八八医院2018年10月至2023年8月期间收治的60例帕金森病患者,随机将其分为... 目的探讨微电极记录(MER)联合多模态影像融合技术(Lead-DBS)多模态影像融合技术在帕金森病患者术后程控中的应用效果。方法选取中国人民解放军联勤保障部队第九八八医院2018年10月至2023年8月期间收治的60例帕金森病患者,随机将其分为对照组和观察组。对照组患者根据脑深部电刺激术(DBS)专家程控共识逐个触点程控,观察组患者根据MER联合术后Lead-DBS多模态影像融合技术进行程控。比较两组术中操作时间、术后症状改善情况、生活质量评分、不良情绪及并发症发生率。结果观察组术中操作时间少于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05);干预前两组帕金森症状评分、帕金森病生活质量评分、不良情绪评分、并发症发生率差异均无统计学意义(P>0.05),干预后观察组帕金森症状评分、帕金森病生活质量评分、不良情绪评分、并发症发生率均低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论术中MER联合术后Lead-DBS多模态影像融合技术,结合患者症状针对性选择开机触点方法具有较高的可行性,可提高手术效率、改善患者预后,安全性良好。 展开更多
关键词 mer Lead-DBS 帕金森病 术后程控
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化湿败毒方抗COVID-19和MERS、SARS作用机制分析:基于网络药理学和分子对接技术
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作者 王高举 焦红军 《亚太传统医药》 2024年第8期155-162,共8页
目的:采用网络药理学和分子对接技术探讨化湿败毒方发挥对新型冠状病毒感染(COVID-19)和中东呼吸综合征(MERS)、严重急性呼吸综合征(SARS)治疗作用的主要成分、作用靶点和信号通路,阐释其共性作用机制。方法:采用TCMSP数据库和UniProt... 目的:采用网络药理学和分子对接技术探讨化湿败毒方发挥对新型冠状病毒感染(COVID-19)和中东呼吸综合征(MERS)、严重急性呼吸综合征(SARS)治疗作用的主要成分、作用靶点和信号通路,阐释其共性作用机制。方法:采用TCMSP数据库和UniProt数据库筛选化湿败毒方的主要成分及其作用靶点,使用Cytoscape 3.8.2构建“化合物-靶点(基因)”网络图;在GeneCards数据库中搜集“COVID-19”和“MERS”“SARS”相关靶点,通过Venny 2.1.0数据库映射筛选出COVID-19和MERS、SARS的共有靶点;将上述共有靶点与化湿败毒方中的化合物靶点取交集筛选出共同靶点作为研究靶点;将共同靶点导入STRING数据库获取数据后,使用Cytoscape 3.8.2构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;采用R语言进行GO生物学功能富集分析及KEGG信号通路富集分析,绘制柱状图及气泡图进行可视化分析,并构建“药物-成分-靶点-通路”网络图;选取“药物-成分-靶点-通路”网络中的关键化合物及阳性对照药分别与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶、血管紧张素转化酶II(ACE2)进行分子对接。结果:通过对化湿败毒方进行筛选得到120个活性化合物,125个作用靶点;COVID-19相关靶点4585个,MERS相关靶点2145个,SARS相关靶点4556个,三者共有靶点1210个,与化湿败毒方的共同靶点27个,其中10个核心靶点为AKT1、VEGFA、HIF1A、STAT3、CASP8、JUN、TP53、CASP3、AR、IL1B。GO功能富集分析得到生物进程(BP)1864个,分子功能(MF)113种,细胞组分(CC)32种;KEGG富集分析共得到137条信号通路(P<0.05),主要有甲型流感(Influenza A)、人巨细胞病毒感染(Human cytomegalovirus infection)、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染(Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection)等病毒感染通路以及核苷酸寡聚结构域样受体(NOD-like receptor signaling pathway)、白介素-17(IL-17 signaling pathway)、肿瘤坏死因子(TNF signaling pathway)等炎症信号通路。分子对接结果显示化湿败毒方中β-谷固醇、黄芩素、汉黄芩素、芒柄花黄素4种核心活性化合物与SARS-CoV-23CL水解酶及ACE2具有较好的结合活性,并且结合体构象稳定。结论:化湿败毒方对SARS、MERS和COVID-19具有潜在共性作用,该作用可能与活性化合物β-谷固醇、黄芩素、汉黄芩素、芒柄花黄素等作用于AKT1、CASP8、JUN、TP53、CASP3、IL1B等靶点,调节AGE-RAGE、IL-17、TNF、NOD-样受体等多种信号通路发挥抑制炎症风暴、调节免疫功能、抗病毒等作用。 展开更多
关键词 化湿败毒方 严重急性呼吸综合征 中东呼吸综合征 新型冠状病毒感染 β-谷固醇 黄芩素
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Self-assembly of block copolymers grafted onto a flat substrate:Recent progress in theory and simulations
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作者 王铮 李宝会 《Chinese Physics B》 SCIE EI CAS CSCD 2016年第1期270-281,共12页
Block copolymers are a class of soft matter that self-assemble to form ordered morphologies on the scale of nanome- ters, making them ideal materials for various applications. These applications directly depend on the... Block copolymers are a class of soft matter that self-assemble to form ordered morphologies on the scale of nanome- ters, making them ideal materials for various applications. These applications directly depend on the shape and size of the self-assembled morphologies, and hence, a high degree of control over the self-assembly is desired. Grafting block copolymer chains onto a substrate to form copolymer brushes is a versatile method to fabricate functional surfaces. Such surfaces demonstrate a response to their environment, i.e., they change their surface topography in response to different external conditions. Furthermore, such surfaces may possess nanoscale patterns, which are important for some applica- tions; however, such patterns may not form with spun-cast films under the same condition. In this review, we summarize the recent progress of the self-assembly of block copolymers grafted onto a flat substrate. We mainly concentrate on the self-assembled morphologies of end-grafted AB dibloek eopolymers, junction p0int-grafted AB diblock copolymers (i.e., Y-shaped brushes), and end-grafted ABA triblock copolymers. Special emphasis is placed on theoretical and simulation progress. 展开更多
关键词 grafted AB diblock copolymers grafted ABA triblock copolymers SELF-ASSEMBLY block copoly-mer brushes
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基于流式细胞术和K-mer分析的好好芭基因组大小估测 被引量:7
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作者 马鹏举 周佳熠 +4 位作者 孙会改 马丹丹 高飞 周宜君 张根发 《北京师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期733-737,共5页
好好芭是一种重要的特种油料植物,具有极高的经济价值.由于好好芭基因组数据缺乏,导致其分子生物学研究进展相对缓慢.本研究以黄瓜和大豆作为内标,用流式细胞仪测定经碘化丙啶(PI)染色的内标细胞核和好好芭细胞核混合样品的PI荧光强度,... 好好芭是一种重要的特种油料植物,具有极高的经济价值.由于好好芭基因组数据缺乏,导致其分子生物学研究进展相对缓慢.本研究以黄瓜和大豆作为内标,用流式细胞仪测定经碘化丙啶(PI)染色的内标细胞核和好好芭细胞核混合样品的PI荧光强度,通过比较好好芭与内标细胞DNA含量峰值的倍数关系,计算好好芭的基因组大小.同时使用基于生物信息学的K-mer分析来估测好好芭的基因组大小.采用流式细胞术测得好好芭基因组大小约为774 Mb.Kmer分析表明,当K值分别为17、19、21时,相应的DNA峰值出现在128、125和123,因此估测jojoba基因组大小为777~794Mb.K-mer分布曲线有明显的杂合峰,说明jojoba基因组杂合度较高.本研究完成了对好好芭基因组大小的估测,可为好好芭基因组学研究提供参考. 展开更多
关键词 好好芭 流式细胞术 K-mer分析 基因组大小
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基于流式细胞术和K-mer分析的银缕梅属(Parrotia C.A.Mey.)植物基因组大小测定 被引量:11
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作者 张云燕 安宇 +5 位作者 林峰 马秋月 周翔宇 金亮 李朋富 王中生 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期561-570,共10页
金缕梅科(Hamamelidaceae)银缕梅属(Parrotia C.A.Mey.)仅包含银缕梅(Parrotia subaequalis(H.T.Chang)R.M.Hao&H.T.Wei)和波斯铁木(Parrotia persica(DC.)C.A.Mey.)两种落叶阔叶乔木,其中银缕梅是我国华东地区特有的Ⅰ级濒危珍稀... 金缕梅科(Hamamelidaceae)银缕梅属(Parrotia C.A.Mey.)仅包含银缕梅(Parrotia subaequalis(H.T.Chang)R.M.Hao&H.T.Wei)和波斯铁木(Parrotia persica(DC.)C.A.Mey.)两种落叶阔叶乔木,其中银缕梅是我国华东地区特有的Ⅰ级濒危珍稀保护植物,属东亚第三纪孑遗成分;其姊妹种波斯铁木则间断分布于伊朗北部,属北极第三纪孑遗植物类群。本研究首次利用流式细胞术和K-mer分析方法对银缕梅属两姊妹种的基因组大小进行了测定,建立和优化了以萝卜(Raphanus sativus L.‘Saxa’)为内标、WPB(Woody plant buffer)为细胞核解离液的两种植物单倍体基因组的DNA含量(DNA C值)流式测定的适宜体系,旨在为金缕梅科银缕梅属植物的全基因组测序、基因组学研究、种质资源开发和利用以及物种保育等提供前期基础数据参考;同时也可为金缕梅科其他属、种的基因组大小测定提供借鉴。主要研究结果如下:(1)通过流式测定银缕梅基因组大小约为971.45±13.91 Mb,波斯铁木基因组大小约为890.52±24.69 Mb;(2)K-mer分析估测银缕梅基因组大小为951.70 Mb,杂合率为1.740%,重复序列比例为77.50%;波斯铁木基因组大小为858.50 Mb,杂合率为0.695%,重复序列占74.30%;(3)银缕梅属于高杂合和高重复基因组,波斯铁木则属于微杂合和高重复基因组。本研究的结果为银缕梅属植物后续基于DNA三代高通量测序技术的全基因组测序、组装及去冗余处理等工作提供了重要的数据参考。 展开更多
关键词 银缕梅 波斯铁木 基因组大小 流式细胞术 K-mer分析 基因组去冗余
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MER型沸石的结构、合成及应用进展 被引量:3
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作者 石勤 王建强 +1 位作者 席静 张富民 《石油化工》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1004-1011,共8页
MER型沸石是一种稀有的三维八元环小孔沸石,因其特殊的孔道结构和良好的物化性质,在海水卤水提钾、工业催化、气体吸附分离以及工业脱水等领域展现出了潜在的应用前景。对MER型沸石的结构、合成和应用的研究现状进行了较为全面的综述,... MER型沸石是一种稀有的三维八元环小孔沸石,因其特殊的孔道结构和良好的物化性质,在海水卤水提钾、工业催化、气体吸附分离以及工业脱水等领域展现出了潜在的应用前景。对MER型沸石的结构、合成和应用的研究现状进行了较为全面的综述,并对其研究方向进行了展望,为进一步研究MER型沸石并对其进行推广应用提供了参考。 展开更多
关键词 mer型沸石 沸石W 提钾 分离 催化 脱水
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三相对称系统中SVC-MERS注入谐波电流分析 被引量:5
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作者 程苗苗 包跃跃 +2 位作者 涂春鸣 张忠杰 刘治国 《电源学报》 CSCD 2016年第1期18-26,共9页
磁能恢复开关MERS(magnetic energy recovery switch)是一种新型的无功补偿装置,它相较于其他无功补偿装置,具有结构简单、易于控制和损耗低等诸多优点,但在进行无功功率补偿的过程中会产生谐波电流。首先,在对MERS的结构和控制方法阐... 磁能恢复开关MERS(magnetic energy recovery switch)是一种新型的无功补偿装置,它相较于其他无功补偿装置,具有结构简单、易于控制和损耗低等诸多优点,但在进行无功功率补偿的过程中会产生谐波电流。首先,在对MERS的结构和控制方法阐述的基础上建立了三相对称系统中SVC-MERS的数学模型,讨论分析了控制参数对三相对称系统中线电流谐波特性的影响;进而提出了控制参数的优化设计方法。仿真和实验结果表明,通过控制参数的优化设计可以有效地减小三相对称系统中线电流的谐波含量,所提控制参数的优化设计方法是可行的。 展开更多
关键词 三相对称系统 并联无功补偿 磁能恢复开关(merS) 谐波电流
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Mer免疫球蛋白样区原核蛋白表达和单克隆抗体制备 被引量:3
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作者 范磊 沈飞 +2 位作者 谢丽倩 周梦云 阮长耿(指导) 《苏州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2007年第1期4-7,共4页
目的利用原核蛋白表达载体,体外表达Mer的IgG样区,并利用此重组蛋白制备抗Mer的单克隆抗体。方法从K562细胞中抽提总RNA,利用RT-PCR扩增Mer的IgG样区片断。经过测序将所得片断与PQE30原核表达载体连接并转化到大肠杆菌M15中,挑选阳性克... 目的利用原核蛋白表达载体,体外表达Mer的IgG样区,并利用此重组蛋白制备抗Mer的单克隆抗体。方法从K562细胞中抽提总RNA,利用RT-PCR扩增Mer的IgG样区片断。经过测序将所得片断与PQE30原核表达载体连接并转化到大肠杆菌M15中,挑选阳性克隆,经诱导和纯化后获得原核蛋白。利用所得的重组蛋白免疫Balb/c小鼠,取其脾脏和小鼠杂交瘤细胞融合制备针对Mer的IgG样区的特异性抗体。利用ELISA方法筛选阳性克隆,Westernblot方法进行验证。结果体外成功表达MerIgG样区的原核蛋白,片断大小经修饰后约为26kd,表达量占菌体总蛋白的15%,经Ni-NTAagrose柱纯化后得到纯化蛋白并免疫Balb/c小鼠。将小鼠脾脏细胞和杂交瘤细胞融合后得到1株特异性抗MerIgG样区的单克隆抗体——SZ-128,Westernblot显示此单抗可以和表达的重组蛋白和Mer胞外区真核蛋白反应。结论成功制备1株抗MerIgG样区的特异性单克隆抗体,为研究Mer的功能提供了有力的工具。 展开更多
关键词 mer IgG样区 原核表达 单克隆抗体
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基于流式细胞术和K-mer分析的黄芪基因组大小估测 被引量:6
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作者 孙会改 韦春香 +2 位作者 杨旻啸 高飞 周宜君 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1448-1452,共5页
目的使用流式细胞术与K-mer分析估测黄芪基因组的大小及复杂程度,为黄芪基因组测序奠定基础。方法以番茄为内标,用流式细胞仪测定经碘化丙啶(PI)染色的番茄细胞核和黄芪细胞核混合样品的PI荧光强度,通过比较黄芪与番茄细胞DNA含量峰值... 目的使用流式细胞术与K-mer分析估测黄芪基因组的大小及复杂程度,为黄芪基因组测序奠定基础。方法以番茄为内标,用流式细胞仪测定经碘化丙啶(PI)染色的番茄细胞核和黄芪细胞核混合样品的PI荧光强度,通过比较黄芪与番茄细胞DNA含量峰值的倍数关系,计算黄芪的基因组大小。采用高通量测序技术进行黄芪基因组调查测序,利用生物信息学方法估计黄芪杂合率、重复序列和GC含量等信息。结果采用流式细胞术测得黄芪基因组大小约为1 426 Mb。通过基因组调查测序,获得了95 Gb黄芪基因组DNA测序数据,K-mer分析表明黄芪基因组约为1 456 Mb,测序深度为39×。K-mer分布曲线有明显的杂合峰,基因组杂合率为2.1%。结论黄芪基因组大小为1.45 Gb左右,杂合率较高。这一结果可为黄芪基因组学研究提供参考。 展开更多
关键词 黄芪 流式细胞术 基因组大小 K-mer分析 杂合率
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