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MED8表达与肝癌临床病理特征及其预后的相关性分析
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作者 吴爽 张涛元 +3 位作者 李俏 曹三成 王增国 祝撷英 《实用癌症杂志》 2024年第3期411-416,共6页
目的检测中介体复合物亚基8(mediator complex subunit 8,MED8)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达情况,探讨MED8对HCC的诊断、预后价值及其调控HCC的可能机制。方法从TCGA数据库下载HCC RNAseq数据以及临床数据,比较HC... 目的检测中介体复合物亚基8(mediator complex subunit 8,MED8)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达情况,探讨MED8对HCC的诊断、预后价值及其调控HCC的可能机制。方法从TCGA数据库下载HCC RNAseq数据以及临床数据,比较HCC癌旁组织和癌组织中MED8的表达差异;Western blot检测肝癌细胞HepG2及正常肝细胞QSG-7701中MED8的表达情况;通过DESeq2包和clusterProfiler包对含有MED8高、低表达组的数据进行表达差异分析及gene ontology(GO)富集分析;免疫组化检测补体经典途径相关蛋白C1qc的表达情况及其与MED8的关系。生存曲线、ROC曲线分析MED8表达与肝癌临床病理特征的相关性与预后价值。结果MED8在HCC癌组织及肝癌细胞中呈高表达。富集分析显示与MED8相互作用的蛋白主要参与补体的激活和离子反应等生物过程;而补体经典途径相关蛋白C1qc在肝癌组织中上调且与MED8表达呈正相关。临床相关性分析显示:MED8高表达与HCCT分期、病理分期、组织学分级密切相关;生存曲线结果显示:HCC高表达MED8患者总生存率及疾病相关存活率低;ROC曲线结果标明MED8的曲线下面积为0.817,提示MED8可能作为HCC潜在的诊断分子标志物。结论MED8与肝癌患者的临床分期及预后密切相关,其可能通过补体激活途径影响患者预后。 展开更多
关键词 肝细胞肝癌 med8 C1qc 生物信息分析 预后
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MED8基因在脑胶质瘤中的表达及预后意义
2
作者 刘援援 李邦安 +2 位作者 陈光贵 吴永晖 周劲旭 《中国微侵袭神经外科杂志》 CAS 2023年第12期40-45,共6页
目的通过CGGA和TCGA数据库,研究MED8基因在脑胶质瘤组织的表达与预后作用。方法通过TIMER2.0在线分析工具对TCGA数据库内胶质瘤及正常组织MED8基因表达差异进行研究,并进一步利用HPA数据库比较胶质瘤与正常组织中MED8蛋白的表达差异情... 目的通过CGGA和TCGA数据库,研究MED8基因在脑胶质瘤组织的表达与预后作用。方法通过TIMER2.0在线分析工具对TCGA数据库内胶质瘤及正常组织MED8基因表达差异进行研究,并进一步利用HPA数据库比较胶质瘤与正常组织中MED8蛋白的表达差异情况。通过CGGA数据库获取胶质瘤患者样本的mRNAseq_693和mRNAseq_325测序数据及其临床数据,利用R软件进行临床相关分析,预后生存分析以及单、多因素COX回归分析,同时绘制ROC曲线评价MED8在胶质瘤患者预后的作用;运用GSEA富集分析MED8在脑胶质瘤中的功能,然后进行基因共表达相关性分析。结果相较于正常组织,MED8在胶质瘤组织表达明显上调,同时,在胶质瘤组织中表达水平越高,胶质瘤患者预后越差,差异具有统计学意义(P<0.001)。此外,本研究发现MED8可作为独立生物标志物预测胶质瘤患者预后。结论在胶质瘤组织中MED8可能发挥促癌作用,MED8有望成为预测胶质瘤患者预后的新的生物标志物。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 med8基因 预后 生信分析
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