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海南黑山羊MBL2基因的转录调控元件的筛选与分析
被引量:
2
1
作者
王雪梅
翟哲
+9 位作者
陈巧玲
吴艳茹
吴昊天
黄惠娴
刘志勇
李崇瑞
满初日嘎
王凤阳
杜丽
陈思
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1795-1806,共12页
甘露聚糖结合凝集素C(mannose binding lectin C,MBL-C)是C型(Ca^(2+)依赖型)凝集素超家族的成员,其作为一种急性期蛋白,具有抗细菌感染的功能,参与机体的天然免疫反应。为鉴定出结合在MBL2基因启动子区(1009 bp)的重要转录因子,探寻该...
甘露聚糖结合凝集素C(mannose binding lectin C,MBL-C)是C型(Ca^(2+)依赖型)凝集素超家族的成员,其作为一种急性期蛋白,具有抗细菌感染的功能,参与机体的天然免疫反应。为鉴定出结合在MBL2基因启动子区(1009 bp)的重要转录因子,探寻该基因的转录调控机制,本研究选取海南黑山羊MBL2基因的启动子序列1009 bp,采用DNA重组技术克隆6个转录起始位点上游1009 bp的启动子5′端侧翼缺失序列,克隆片段经双酶切后连接至pGL3-Basic载体。重组质粒转染至293T细胞中,结合双荧光素酶活性检测系统筛选MBL2基因的核心启动子区域。通过在线生物信息学软件预测山羊MBL2基因的核心启动子区域的转录因子结合位点,利用点突变技术构建转录因子结合位点缺失的载体,转染293T细胞后结合双荧光素酶活性检测系统分析其转录活性。结果表明,海南黑山羊MBL2基因的核心启动子区域位于转录起始位点上游-304~-45 bp范围内,在线软件分析该区域存在RELA、NF-κB2、MZF1等3种转录因子结合位点。双荧光素酶报告分析结果表明,RELA和NF-κB2的结合位点缺失后均使山羊MBL2基因的转录活性极显著下降(P<0.01)。结果提示,RELA和NF-κB2对山羊MBL2基因的转录活性可能具有重要的正调控作用。该研究为进一步探寻海南黑山羊MBL2基因的功能提供理论依据。
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关键词
海南黑山羊
mbl2
基因
转录调控
双荧光素酶
核心启动子
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职称材料
猪MBL2基因序列特征分析
2
作者
马越
彭帅
+2 位作者
陈朗
王馨敏
刘丽霞
《猪业科学》
2020年第1期104-107,共4页
研究采用生物信息学方法分析了猪MBL2基因,进一步获得猪MBL2基因序列特征及编码蛋白的结构和功能,并且对CDS区里的编码蛋白的理化性质进行了预测。除此之外还对这些编码蛋白是亲水还是疏水、它们的糖基化位点、信号肽、二级结构以及三...
研究采用生物信息学方法分析了猪MBL2基因,进一步获得猪MBL2基因序列特征及编码蛋白的结构和功能,并且对CDS区里的编码蛋白的理化性质进行了预测。除此之外还对这些编码蛋白是亲水还是疏水、它们的糖基化位点、信号肽、二级结构以及三级结构进行了预测。实验结果表明,猪的MBL2基因的大小是723 bp,编码的氨基酸共有240个,蛋白质的相对分子质量为25522.83 KDa,理论等电点PI为4.97。MBL2基因的二级结构是无规则的卷曲型,蛋白结构预测结果是一种可溶性蛋白,具有4个外显子;在第20-21位氨基酸之间存在信号肽,表现为亲水性。研究结果为进一步研究猪MBL2基因的功能提供了理论基础。
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关键词
猪
mbl2
基因
序列特征
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职称材料
题名
海南黑山羊MBL2基因的转录调控元件的筛选与分析
被引量:
2
1
作者
王雪梅
翟哲
陈巧玲
吴艳茹
吴昊天
黄惠娴
刘志勇
李崇瑞
满初日嘎
王凤阳
杜丽
陈思
机构
海南大学动物科技学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1795-1806,共12页
基金
海南省自然科学基金项目(2019RC123)
国家现代农业产业技术体系项目(财政部和农业农村部-CARS38)
+1 种基金
海南省院士创新平台科研专项(YSPTZX202153)
海南省院士团队创新平台资金项目。
文摘
甘露聚糖结合凝集素C(mannose binding lectin C,MBL-C)是C型(Ca^(2+)依赖型)凝集素超家族的成员,其作为一种急性期蛋白,具有抗细菌感染的功能,参与机体的天然免疫反应。为鉴定出结合在MBL2基因启动子区(1009 bp)的重要转录因子,探寻该基因的转录调控机制,本研究选取海南黑山羊MBL2基因的启动子序列1009 bp,采用DNA重组技术克隆6个转录起始位点上游1009 bp的启动子5′端侧翼缺失序列,克隆片段经双酶切后连接至pGL3-Basic载体。重组质粒转染至293T细胞中,结合双荧光素酶活性检测系统筛选MBL2基因的核心启动子区域。通过在线生物信息学软件预测山羊MBL2基因的核心启动子区域的转录因子结合位点,利用点突变技术构建转录因子结合位点缺失的载体,转染293T细胞后结合双荧光素酶活性检测系统分析其转录活性。结果表明,海南黑山羊MBL2基因的核心启动子区域位于转录起始位点上游-304~-45 bp范围内,在线软件分析该区域存在RELA、NF-κB2、MZF1等3种转录因子结合位点。双荧光素酶报告分析结果表明,RELA和NF-κB2的结合位点缺失后均使山羊MBL2基因的转录活性极显著下降(P<0.01)。结果提示,RELA和NF-κB2对山羊MBL2基因的转录活性可能具有重要的正调控作用。该研究为进一步探寻海南黑山羊MBL2基因的功能提供理论依据。
关键词
海南黑山羊
mbl2
基因
转录调控
双荧光素酶
核心启动子
Keywords
Hainan black goat
mbl2 gene
transcriptional regulation
dual-luciferase
core promoter
分类号
S827.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
猪MBL2基因序列特征分析
2
作者
马越
彭帅
陈朗
王馨敏
刘丽霞
机构
西北民族大学生命科学与工程学院
出处
《猪业科学》
2020年第1期104-107,共4页
基金
西北民族大学2019年本科生科研创新项目(中央高校基本科研业务资金资助项目)(XBMU-BYL19117)
文摘
研究采用生物信息学方法分析了猪MBL2基因,进一步获得猪MBL2基因序列特征及编码蛋白的结构和功能,并且对CDS区里的编码蛋白的理化性质进行了预测。除此之外还对这些编码蛋白是亲水还是疏水、它们的糖基化位点、信号肽、二级结构以及三级结构进行了预测。实验结果表明,猪的MBL2基因的大小是723 bp,编码的氨基酸共有240个,蛋白质的相对分子质量为25522.83 KDa,理论等电点PI为4.97。MBL2基因的二级结构是无规则的卷曲型,蛋白结构预测结果是一种可溶性蛋白,具有4个外显子;在第20-21位氨基酸之间存在信号肽,表现为亲水性。研究结果为进一步研究猪MBL2基因的功能提供了理论基础。
关键词
猪
mbl2
基因
序列特征
Keywords
Pig
mbl2 gene
Sequence characteristics
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海南黑山羊MBL2基因的转录调控元件的筛选与分析
王雪梅
翟哲
陈巧玲
吴艳茹
吴昊天
黄惠娴
刘志勇
李崇瑞
满初日嘎
王凤阳
杜丽
陈思
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
猪MBL2基因序列特征分析
马越
彭帅
陈朗
王馨敏
刘丽霞
《猪业科学》
2020
0
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职称材料
已选择
0
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