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应用MALDITOF-MS技术对创伤口标本分离的人型支原体快速鉴定及药敏结果分析 被引量:4
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作者 吴开进 熊利巧 《临床检验杂志(电子版)》 2019年第2期1-3,共3页
目的探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDITOF-MS)技术准确鉴定人型支原体的应用,并分析支原体药敏结果,为临床治疗提供依据。方法回顾2017年12月-2018年8月应用MALDITOF-MS技术鉴定的微生物中生殖道外感染人型支原体鉴定病例临... 目的探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDITOF-MS)技术准确鉴定人型支原体的应用,并分析支原体药敏结果,为临床治疗提供依据。方法回顾2017年12月-2018年8月应用MALDITOF-MS技术鉴定的微生物中生殖道外感染人型支原体鉴定病例临床资料、病原菌的检验方法及药敏试验结果。结果从351份伤口、切口或创伤分泌物标本培养48h后无菌生长,继续培养至96 h后分离出5株可疑人型支原体,阳性率为1.4%,经MALDITOF-MS技术和PCR技术鉴定均为人型支原体,置信度大于99.2%。人型支原体对强力霉素、交沙霉素、加替沙星、米诺环素均有良好敏感性,而对红霉素、罗红霉素、环脂红霉素、阿奇霉素、克拉霉素均耐药。结论应用MALDITOF-MS技术能够快速鉴定从伤口、切口等部位分离的人型支原体,可指导实验室进行正确选择药敏试验,为临床提供准确感染诊断和药敏治疗具有重要意义。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 人型支原体 分离鉴定 药敏
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基质辅助激光解吸-飞行时间质谱结合随机森林融合模型用于白术的产地溯源分析
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作者 王颖琦 赵汉卿 +1 位作者 方焕 王童 《分析测试学报》 北大核心 2025年第6期1147-1153,共7页
该研究利用基质辅助激光解吸-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分析技术结合两种改进的随机森林融合算法对白术进行产地溯源分析。首先通过MALDI-TOF MS获取了来自3个省份白术样本的质谱数据,每个样本的数据大小为1×234154。鉴于样本数... 该研究利用基质辅助激光解吸-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分析技术结合两种改进的随机森林融合算法对白术进行产地溯源分析。首先通过MALDI-TOF MS获取了来自3个省份白术样本的质谱数据,每个样本的数据大小为1×234154。鉴于样本数据量庞大,故采用数据分箱策略进行初步简化(1×6600)。然后通过设定的累计方差贡献率阈值进行主成分分析,对数据进行降维。利用降维后的数据构建自适应增强极端随机森林模型(AERF)和自适应增强平衡随机森林模型(ABRF),最终通过模型融合策略获得AERF-ABRF模型对白术进行产地溯源。结果表明,所提出的基于降维数据构建的AERF-ABRF能够准确区分来自3个省份的白术样本,其对测试集和预测集的分类准确率均达到100%。同时,与单一判别模型相比,模型融合策略具有更高的分类准确率。 展开更多
关键词 随机森林 模型融合 白术 产地溯源 基质辅助激光解吸-飞行时间质谱(MALDI-TOF ms)
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快速分离与鉴定天山堇菜中的天然环肽 被引量:8
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作者 项斌 杜国华 +6 位作者 王煦辰 张书香 秦咸蕴 孔建强 程克棣 李永吉 王伟 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1402-1409,共8页
为快速准确地分离鉴定天山堇菜的天然环肽分子,采用50%乙醇浸提、不同极性溶剂萃取,利用Sephadex LH-20对含有环肽的正丁醇部分进行色谱分离,然后直接利用DTT还原分离的组分,结合反相高效液相色谱(RP-HPLC)和质谱跟踪确定含有环肽的组... 为快速准确地分离鉴定天山堇菜的天然环肽分子,采用50%乙醇浸提、不同极性溶剂萃取,利用Sephadex LH-20对含有环肽的正丁醇部分进行色谱分离,然后直接利用DTT还原分离的组分,结合反相高效液相色谱(RP-HPLC)和质谱跟踪确定含有环肽的组分差异洗脱峰,进而分离纯化获得单体分子;利用DTT还原二硫键、碘乙酰胺烷基化保护被还原产生的巯基、蛋白酶Endo-Glu-C、Endo-Lys-C和胰蛋白酶酶解、结合RP-HPLC分离获得肽段;用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI TOF/TOF MS)进行质谱分析,鉴定了2个环肽分子,其中一个新的环肽分子命名为cycloviolacin T1,另一个为已知结构的varv E。通过此研究建立了一套直接利用DTT还原色谱分离组分、结合MALDI TOF/TOF MS检测进而鉴定天然环肽分子的解析方法。 展开更多
关键词 天山堇菜 植物环肽 malditof/TOF质谱鉴定
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牙周炎与慢性阻塞性肺疾病患者的唾液多肽组学分析 被引量:1
4
作者 王蕾 李雪芬 +3 位作者 张天翼 李威 王左敏 林梅 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期91-96,共6页
目的分析牙周炎(periodontitis,PD)与慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)患者唾液中与疾病相关的差异性表达多肽,寻找具有潜在诊断意义的生物标志物,为探讨COPD的早期防治开辟新视角。方法筛选PD患者10例(PD... 目的分析牙周炎(periodontitis,PD)与慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)患者唾液中与疾病相关的差异性表达多肽,寻找具有潜在诊断意义的生物标志物,为探讨COPD的早期防治开辟新视角。方法筛选PD患者10例(PD组)、PD伴COPD患者10例(PD伴COPD组)及健康对照人群8例(对照组),收集各组临床资料及唾液样本。应用弱阳离子交换磁珠(weak-cation-exchange magnetic beads,WCX-MB)分离纯化唾液上清样本,应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOFMS)系统获取样本生物学信息,进行多肽差异性质谱分析,筛选出组间差异性多肽,并通过液相色谱-质谱/质谱联用技术(liquid chromatography tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)对差异性多肽进行鉴定。结果三组样本共检测出77个差异多肽峰,其中PD伴COPD组和PD组间显著性差异多肽峰10个,PD伴COPD组有8个多肽峰(1193.5、1836.2、1735.1、1321.3、1356.8、2086.8、1863.6、2230.9)表达增高,2个多肽峰(1067.3、1124.4)表达减低。其中1193.5、1356.8多肽峰被鉴定为富组蛋白1、颌下腺激素调节蛋白3B及唾液酸性富脯磷蛋白1/2。结论本研究通过WCX-MB和MALDI-TOF-MS分析出PD伴COPD患者唾液中存在与疾病相关的差异性表达多肽,筛选出的差异性表达多肽有望成为早期诊断COPD的辅助指标。 展开更多
关键词 牙周炎 慢性阻塞性肺疾病 唾液多肽 基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱 液相色谱-质谱/质谱联用
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MALDI-TOF质谱技术筛选Ⅰ期肺鳞癌血清肿瘤标记物 被引量:1
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作者 李新举 贺大林 梁景仁 《第四军医大学学报》 CAS 北大核心 2009年第12期1131-1133,共3页
目的:MALDI-TOF-MS技术筛选肺鳞癌特异性肿瘤标记物,以提高肺鳞癌早期诊断水平.方法:采集19例Ⅰ期肺鳞癌患者和19例年龄、性别、吸烟量等与之匹配的健康对照者血清,应用MALDI-TOF-MS技术结合MB-WCX蛋白芯片和AutoflexII-C质谱分析仪检... 目的:MALDI-TOF-MS技术筛选肺鳞癌特异性肿瘤标记物,以提高肺鳞癌早期诊断水平.方法:采集19例Ⅰ期肺鳞癌患者和19例年龄、性别、吸烟量等与之匹配的健康对照者血清,应用MALDI-TOF-MS技术结合MB-WCX蛋白芯片和AutoflexII-C质谱分析仪检测各血清标本,经计算机软件数据处理以筛选肺鳞癌血清差异蛋白质波峰.结果:与正常人比较发现肺鳞癌显著异常表达的潜在标记物3个,Mr分别为3261.69,3192.07和2556.92(P<0.01),并据此建立了肺鳞癌分子诊断模型.另采集22例肺鳞癌和19例健康者血清盲检验证该诊断模型具有95.5%的敏感性和94.7%的特异性.结论:MALDI-TOF质谱技术是一种快速、简便易行且高通量的分析方法,不仅能直接筛选出肺鳞癌患者血清中相对特异的潜在肿瘤标记物,而且可能具有较好的临床应用前景,同时为临床寻找新的肺鳞癌血清肿瘤标记物提供理论依据. 展开更多
关键词 肺肿瘤 鳞状细胞 肿瘤标记 生物学 malditofms 蛋白质组学
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Establishment and Preliminary Application of Two dimensional Electrophoresis and Mass Spectrometry in Ovary Study 被引量:1
6
作者 XiangMA Ye-feiZHU +2 位作者 Jia-haoSHA Zuo-minZHOU Jia-yinLIU 《Journal of Reproduction and Contraception》 CAS 2003年第4期209-216,共8页
Objective To apply two-dimensional electrophoresis and mass spectrometry in the ovary proteome researchMethods Protein extractions from mouse ovaries were run in IPGphor isoelectric focus system with 11 cm and 24 cm I... Objective To apply two-dimensional electrophoresis and mass spectrometry in the ovary proteome researchMethods Protein extractions from mouse ovaries were run in IPGphor isoelectric focus system with 11 cm and 24 cm IPG strips respectively (pH 3~10, 0.3 mm thick), then the protein spots were identified by mass spectrometry.Results The ovary protein exactions separated by two-dimensional electrophoresis have got high resolution, and identifing protein by mass spectrometry was highly efficient and facilitly. These two techniques should facilitate further investigation of female reproduction proteome research.Conclusion These two rapid high resolutions and efficient techniques have a variety of applications foreground in female reproduction proteome pattern research. 展开更多
关键词 PROTEOME two-dimensional electrophoresis matrix assisted laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry (malditof ms) OVARY
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原发性与复发性骨肉瘤差异蛋白质组学研究 被引量:1
7
作者 卿海辉 贺茂林 +1 位作者 葛洪亮 王哲 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期53-57,共5页
目的比较原发性与复发性骨肉瘤差异蛋白质,为寻找骨肉瘤复发的特异标记物提供依据。方法分别对5例骨肉瘤标本和4例复发性骨肉瘤提取总蛋白,然后双向凝胶电泳,重复3次,银染后扫描用Image2Master 2DE软件分析寻找差异蛋白,切除差异蛋白质... 目的比较原发性与复发性骨肉瘤差异蛋白质,为寻找骨肉瘤复发的特异标记物提供依据。方法分别对5例骨肉瘤标本和4例复发性骨肉瘤提取总蛋白,然后双向凝胶电泳,重复3次,银染后扫描用Image2Master 2DE软件分析寻找差异蛋白,切除差异蛋白质点进行MS+MS/MS质谱鉴定,获取肽质指纹图谱并查询NCBI数据库寻找匹配蛋白质。结果获得重复性较好的双向电泳银染图谱,原发性与复发性骨肉瘤组织蛋白质点数分别为(1 206±161)和(1 387±185),找到明显差异的蛋白质点42个,并成功鉴定出13个。与原发性骨肉瘤相比,5个蛋白质在复发性骨肉瘤中表达下降;8个蛋白质在复发性骨肉瘤表达水平升高,其中β2微球蛋白在原发性骨肉瘤中表达缺失。结论原发性骨肉瘤与复发性骨肉瘤存在明显差异蛋白质,β2微球蛋白有可能成为诊断复发性骨肉瘤的分子标记物及检测指标。 展开更多
关键词 骨肉瘤 蛋白质组学 双向凝胶电泳 malditof TOF
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应用蛋白质组学技术筛选胃癌SGC-7901细胞中的let-7a功能相关蛋白 被引量:6
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作者 朱益民 徐其 +1 位作者 董来荣 刘志明 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第5期441-448,共8页
为探讨let-7a表达下调在胃癌发病中的机制,高通量地检测了与let-7a功能相关的蛋白质.首先采用基因克隆技术稳定过表达SGC-7901细胞系的let-7a基因,然后用蛋白质组学技术研究稳定过表达该基因对SGC-7901细胞蛋白质表达谱的影响.通过对SGC... 为探讨let-7a表达下调在胃癌发病中的机制,高通量地检测了与let-7a功能相关的蛋白质.首先采用基因克隆技术稳定过表达SGC-7901细胞系的let-7a基因,然后用蛋白质组学技术研究稳定过表达该基因对SGC-7901细胞蛋白质表达谱的影响.通过对SGC-7901/let-7a细胞的蛋白质表达谱改变的研究,并用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析鉴定了10个差异表达蛋白质.这些差异表达蛋白质可能是let-7a功能相关蛋白质,其中抗氧化蛋白2、胰岛素样生长因子结合蛋白2、二硫化蛋白异构酶A2、四氢叶酸合成酶、细胞周期素依赖性激酶抑制蛋白1、Rho-GTPsae激活蛋白4表达上调,Skp2蛋白、血小板黏附蛋白CD41、纤维连接蛋白、Cks1蛋白表达下调.部分差异表达蛋白质如细胞周期素依赖性激酶抑制蛋白1、Skp2蛋白和纤维连接蛋白经蛋白质印迹分析进行了验证.在SGC-7901/let-7a中鉴定的10个差异表达蛋白质涉及到细胞周期的调控、分子基因表达调控、细胞黏附、细胞代谢等众多事件,它们可能作为let-7a功能相关蛋白质,为阐明let-7a表达下调在胃癌发病中的机制提供了重要线索. 展开更多
关键词 miRNA 胃癌 蛋白质组学 双向电泳 MALDI—TOF—ms
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分子生物学技术在药品微生物鉴定溯源中的应用 被引量:6
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作者 王淑娟 朱冉 +5 位作者 蒋波 杨燕 宋明辉 张宁 范一灵 杨美成 《中国药品标准》 2023年第6期579-584,共6页
目的:为满足基于风险评估的微生物控制体系及药品质量全过程控制的要求,建立更加完善的药品微生物鉴定溯源标准化分子生物学技术体系。方法:总结各国药典中分子生物学标准体系的构成,并分析《中国药典》中收载的分子生物学技术及该技术... 目的:为满足基于风险评估的微生物控制体系及药品质量全过程控制的要求,建立更加完善的药品微生物鉴定溯源标准化分子生物学技术体系。方法:总结各国药典中分子生物学标准体系的构成,并分析《中国药典》中收载的分子生物学技术及该技术在药品微生物鉴定溯源中的应用。结果与结论:分子生物学技术是进行药品微生物鉴定溯源的重要标准,不同的分子生物学鉴定方法都有其优势和局限性,需要根据需求选择最合适的方法,以期达到最佳效果。 展开更多
关键词 分子生物学技术 核酸扩增技术 16S rRNA 全基因组测序 MALDI-TOF ms 药品微生物 鉴定溯源
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