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iTRAQ结合MALDI-TOF/MS检测涂阴肺结核患者血清差异蛋白 被引量:4
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作者 胡水秀 李翠萍 +5 位作者 何晓 李洪涛 周怡 臧宁 郑艳燕 何敏 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第24期5524-5526,共3页
目的利用差异蛋白质组学方法检测涂阳和涂阴肺结核患者血清差异表达蛋白,以发现涂阴肺结核相关的潜在标志物,为临床治疗提供参考依据。方法分析2011年医院的住院患者39例临床资料,采用iTRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选30例痰涂片阴性和9... 目的利用差异蛋白质组学方法检测涂阳和涂阴肺结核患者血清差异表达蛋白,以发现涂阴肺结核相关的潜在标志物,为临床治疗提供参考依据。方法分析2011年医院的住院患者39例临床资料,采用iTRAQ标记结合MALDI-TOF/MS筛选30例痰涂片阴性和9例痰涂片阳性的肺结核患者血清的差异表达蛋白,并进行生物信息学分析,数据采用SPSS 17.0软件进行统计分析。结果 3次独立重复试验一共筛选和鉴定到344种蛋白质,其中置信度在>95.0%有271种蛋白质;与涂阳肺结核患者血清蛋白多肽图谱相比,涂阴肺结核患者血清中11种蛋白表达水平显著增高,7种蛋白表达降低(P<0.05);生物信息学分析发现差异蛋白主要定位在细胞外,参与酶抑制剂活性和应激反应过程。结论涂阴和涂阳肺结核患者血清蛋白多肽图谱存在明显差异;处于关键节点上的6个蛋白可能与涂阴结核病的发生发展有密切联系。 展开更多
关键词 肺结核 maldi-tof/ms 差异蛋白
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交叉酶切联合MALDI-TOF/MS分析重组蛋白二硫键分布的方法建立 被引量:2
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作者 徐祖敏 程锐 +5 位作者 杨霞 杨中汉 刘少军 黎明涛 蔡卫斌 高国全 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期93-99,共7页
以Kringle环为分子模型,应用MALDI-TOF/MS联合特异性蛋白酶酶切技术,探讨建立蛋白质二硫键分布和定位分析的研究方法。采用pET22b(+)原核表达体系诱导表达重组人纤溶酶原K5蛋白(rhK5),经Ni2+-NTA resin亲和层析纯化,并通过SDS-PAGE和Wes... 以Kringle环为分子模型,应用MALDI-TOF/MS联合特异性蛋白酶酶切技术,探讨建立蛋白质二硫键分布和定位分析的研究方法。采用pET22b(+)原核表达体系诱导表达重组人纤溶酶原K5蛋白(rhK5),经Ni2+-NTA resin亲和层析纯化,并通过SDS-PAGE和Western-blot进行初步鉴定;采用MTT法分析rhK5对微血管内皮细胞的抑制活性;联合应用交叉酶切(Trypsin Gold单切或Trypsin Gold及Endoproteinase ASP-N双酶切)和基质辅助激光解析-飞行时间质谱(MALDI-TOF/MS)分析rhK5的二硫键分布;并应用生物信息学方法和圆二色谱法进一步验证rhK5二级结构。应用原核体系高效表达具有生物活性的rhK5蛋白,经交叉酶切联合MAL-DI-TOF/MS证实rhK5中的6个半胱氨酸正确配对形成了3对二硫键(Cys462:541,Cys483:524和Cys512:536),圆二色谱法测定发现rhK5为典型的β折叠型结构。上述研究结果为分析基因工程重组蛋白质中半胱氨酸配对及二硫键分布提供了方法学基础。 展开更多
关键词 基因工程 重组蛋白 蛋白质结构 二硫键 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱
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聚山黎酯80的MALDI-TOF/MS和色谱分析(英文) 被引量:1
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作者 张琪 孟杨 +1 位作者 杨华新 李晓东 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期255-258,共4页
目的:建立聚山梨酯80(又名吐温80)的检测分析方法。方法:使用岛津公司的AMIX Performance基体辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF/MS)和分子排阻色谱对市售的聚山梨酯80进行研究。参数为正离子电离光谱,反射模式,加速电压20.0 kV,氮激... 目的:建立聚山梨酯80(又名吐温80)的检测分析方法。方法:使用岛津公司的AMIX Performance基体辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF/MS)和分子排阻色谱对市售的聚山梨酯80进行研究。参数为正离子电离光谱,反射模式,加速电压20.0 kV,氮激光,质量阀为m/z 500,基质为肉桂酸(CHCA)。结果:发现聚山梨酯80为复杂的混合物,包括聚乙二醇、聚乙二醇酯、单硝酸异山梨聚乙氧基化物、脱水山梨糖醇聚乙氧基化物、聚山梨酯的单酯/二酯、山梨糖醇聚乙氧基化物酯等。分子排阻色谱方法成功分离聚山梨酯80的低分子量和高分子量成分,并用MALDI-TOF/MS证明。结论:本方法操作简便,结果准确,未来可以用于聚山梨酯80的质量控制。 展开更多
关键词 聚山梨酯80 吐温 基体辅助激光解吸飞行时间质谱 分子排阻色谱 基质
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MALDI-TOF MS快速鉴定肠杆菌对β-内酰胺类抗菌药物的药敏及耐药性研究
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作者 李丽 焦满静 +2 位作者 王凤 崔晶晶 安然 《国际检验医学杂志》 2025年第11期1375-1382,共8页
目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对不同肠杆菌药敏及耐药性的鉴定效果,以指导临床合理用药。方法收集13株肠杆菌科耐药菌株和2株敏感质控菌株进行预实验,分别以头孢噻肟、氨苄西林、美罗培南、头孢吡肟、哌拉... 目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对不同肠杆菌药敏及耐药性的鉴定效果,以指导临床合理用药。方法收集13株肠杆菌科耐药菌株和2株敏感质控菌株进行预实验,分别以头孢噻肟、氨苄西林、美罗培南、头孢吡肟、哌拉西林孵育各耐药和敏感菌株,以获得MALDI-TOF MS中各β-内酰胺类抗菌药物的检测特征峰。随后采用预实验的实验条件,分别使用MALDI-TOF MS和传统药敏方法(微量肉汤稀释法)对临床分离的119株肠杆菌科菌株进行批量检测(大肠埃希菌89株,肺炎克雷伯菌30株),评估MALDI-TOF MS检测结果与传统药敏方法的符合率。结果预实验发现,MALDI-TOF MS中相对分子质量410、491处峰是头孢噻肟的特征峰,386、394、726处峰是氨苄西林的特征峰,402处峰是美罗培南的特征峰,481、499处峰是头孢吡肟的特征峰,哌拉西林空白对照中518处[M+H]+分子峰出现自身水解现象,无意义,故后续实验未继续考察。批量检测比对中,头孢噻肟鉴定总符合率为95.7%(111/116),氨苄西林总符合率为90.0%(99/110),美罗培南总符合率为94.6%(105/111),头孢吡肟总符合率为93.8%(90/96)。结论MALDI-TOF MS与传统药敏方法检测肠杆菌对4种β-内酰胺类抗菌药物药敏及耐药性的符合率均大于90.0%,可用于临床β-内酰胺类抗菌药物细菌耐药性的检测,以指导临床的合理用药。 展开更多
关键词 maldi-tof MS 肠杆菌 Β-内酰胺类抗菌药物 耐药性 符合率
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MALDI-TOF MS在碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌同源性分析中的应用
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作者 高芳琳 阮海涛 詹文芳 《国际医药卫生导报》 2025年第14期2402-2407,共6页
目的探讨基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)检测耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)同源性的... 目的探讨基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)检测耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)同源性的应用价值。方法收集2024年5月至6月福建中医药大学附属人民医院ICU同一患者痰、尿、血分离的3株CRKP,分别采用MALDI-TOF MS与单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)差异位点变异检测对3株CRKP进行同源性分析。结果MALDI-TOF MS同源性分析结果显示,3株CRKP中分离自痰和血的CRKP1与CRKP3同源性更高,表明该患者血液检出的CRKP3可能来源于呼吸道,该结果与SNP差异位点变异检测的同源性分析结果一致。结论MALDI-TOF MS能够对同一患者不同来源菌株进行同源性分析,实现菌株溯源,对临床实现快速诊断具有重要意义。 展开更多
关键词 CRKP maldi-tof MS 单核苷酸多态性检测 同源性分析
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基于MALDI-TOF MS肽指纹图谱技术的中药鹿血晶掺伪鉴别研究
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作者 王慎兴 曹玲 +6 位作者 黄青 马聪玉 潘建斌 赵浩东 施海蔚 狄斌 陈洪渊 《质谱学报》 北大核心 2025年第1期115-122,共8页
本研究应用基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术,构建了具有物种特异性的白蛋白和血红蛋白特征肽指纹图谱,用于中药鹿血晶的掺伪鉴别。以鹿血晶真品(梅花鹿、马鹿)和常见掺伪品(猪、牛、羊、驴)共6个物种的血晶制品作... 本研究应用基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术,构建了具有物种特异性的白蛋白和血红蛋白特征肽指纹图谱,用于中药鹿血晶的掺伪鉴别。以鹿血晶真品(梅花鹿、马鹿)和常见掺伪品(猪、牛、羊、驴)共6个物种的血晶制品作为研究对象,通过理论肽段预测并结合高分辨质谱,筛选出1组能够反映物种差异的特征肽段。采集不同物种来源血晶制品以及不同来源市售中药鹿血晶的特征肽指纹图谱,并结合化学计量学分析,实现了不同来源血晶制品的快速准确区分。该方法能够实现复杂基质样品中目标特征肽段的灵敏、特异检测,具有高专属性、快速、便捷的优势,为鹿血晶及血晶类中药制品的掺伪鉴别提供了准确的分析手段,也为其他复杂蛋白类制品的快速鉴别提供了有价值的参考。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(maldi-tof MS) 中药鹿血晶 肽指纹图谱 掺伪鉴别
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基于MALDI-TOF MS与机器学习算法的高毒力肺炎克雷伯菌快速鉴定模型效果评价
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作者 麦东媚 蓝嘉娜 +2 位作者 何宇巍 李冉 黄小玲 《中华医院感染学杂志》 北大核心 2025年第11期1684-1689,共6页
目的通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)结合EX-Smartspec软件,筛选高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)的特征峰,建立快速检测hvKP的模型。方法基于peg-344、iroB、iucA、rmpA、prmpA2基因任一阳性或铁载体产量>30μg/ml的... 目的通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)结合EX-Smartspec软件,筛选高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)的特征峰,建立快速检测hvKP的模型。方法基于peg-344、iroB、iucA、rmpA、prmpA2基因任一阳性或铁载体产量>30μg/ml的鉴定标准,前期收集了89株hvKP和72株经典肺炎克雷伯菌(cKP)菌株,并通过大蜡螟实验验证毒力。利用EX-Smartspec软件和卷积神经网络算法,结合特征峰和聚类分析,构建hvKP和cKP的鉴定模型,为临床提供快速准确的诊断工具。结果通过MALDI-TOF MS分析,在(3835±100)ppm处发现hvKP的特征峰。受试者工作特征(ROC)曲线分析表明,曲线下面积(AUC)=0.741在鉴别hvKP中表现最佳。当AUC≥0.089时,模型在区分hvKP与cKP时展现出较高的敏感性(86.41%)(质量分数)、特异性(69.90%)、准确度(78.16%)、阳性预测值(74.17%)和阴性预测值(83.72%)。聚类分析进一步验证了模型的分类准确性。此外,分型训练模型在训练和验证阶段均展现高准确率(约0.95和0.90)和低损失值(约0.18和0.30)。随机挑取6株hvKP和5株cKP进行验证,通过率100.00%。结论建立了hvKP和cKP的鉴定模型,为临床提供了一种快速而准确的诊断工具,从而及时治疗由hvKP引起的感染。 展开更多
关键词 高毒力肺炎克雷伯菌 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 特征峰 分型训练 鉴定模型
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MALDI-TOF MS在佩戴过的口罩细菌污染情况研究中的应用
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作者 丁国涛 杨国兴 +3 位作者 赵艳 方彦飞 高腾 李伟昊 《医学动物防制》 2025年第1期35-39,共5页
目的应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)分析不同佩戴时长口罩的细菌污染情况。为相关部门提出合理的口罩佩戴时长提供依据。方法于2... 目的应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)分析不同佩戴时长口罩的细菌污染情况。为相关部门提出合理的口罩佩戴时长提供依据。方法于2022年7月招募志愿者在日常工作环境中佩戴口罩,佩戴时长为0.5h、1.0h、2.0h、4.0h、5.0h;使用倾注平板法测定不同佩戴时长口罩内外表面的细菌总数;使用MALDI-TOF MS方法鉴定并分析口罩内外表面细菌丰度。统计学分析采用校正的F检验方法。结果佩戴5.0h口罩内表面与外表面的细菌总数差异有统计学意义[平均值差值(mean deviation,MD)=380.9,P<0.001];佩戴0.5h、1.0h、2.0h和4.0h口罩内表面与外表面的细菌总数差异无统计学意义(MD=9.2,P=0.704;MD=9.3,P=0.701;MD=40.2,P=0.099;MD=19.0,P=0.433)。整个研究共分离320个单菌落。佩戴4.0h的口罩内外表面同时检出的菌属数为2,穿透率最高为33.3%。佩戴5.0h的口罩内外表面同时检出的菌属数为5,穿透率为25.0%~100.0%。结论随佩戴时间延长,口罩内外表面细菌总数增加。同一佩戴时长,口罩内表面的细菌数量高于口罩外表面;同一佩戴时长,口罩内表面的细菌种类低于口罩外表面。建议佩戴时长超过4.0h更换口罩。 展开更多
关键词 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 佩戴时长 细菌污染 细菌丰度 细菌穿透率
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MALDI-TOF MS分析联合16S rRNA基因测序鉴定人型支原体菌血症
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作者 徐承 王姝 +2 位作者 蒋璐 谢文婷 许英 《国外医药(抗生素分册)》 2025年第4期253-258,共6页
目的对本院一位患者产后发热的血培养标本进行基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)分析和16S rRNA基因测序,以明确产后发热的原因,为临床... 目的对本院一位患者产后发热的血培养标本进行基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)分析和16S rRNA基因测序,以明确产后发热的原因,为临床诊治提供参考。方法对血培养瓶内阳性培养物转种于哥伦比亚血琼脂平板和巧克力琼脂平板,置于35℃、5%CO_(2)培养箱中孵育,同时直接涂片革兰染色镜检;对培养基上的目标菌株补充瑞氏染色,利用MALDI-TOF MS分析技术对目标菌株进行鉴定;根据质谱鉴定结果对目标菌株进行抗菌药物敏感性试验,采用16S rRNA基因测序技术对目标菌株进行验证确认。结果血培养瓶内阳性培养物直接涂片革兰染色镜检未见菌体结构。哥伦比亚血琼脂平板培养48 h可见针尖样透明小菌落,巧克力琼脂平板无细菌生长。哥伦比亚血琼脂上的目标菌株质谱鉴定结果为人型支原体,置信度为99.9%。抗菌药物敏感性试验结果显示该菌对米诺环素、多西环素、交沙霉素和克林霉素敏感,对其他药物耐药。目标菌株的16S rRNA基因序列结果与人型支原体标准菌株ATCC23114的核苷酸同源性为99.71%。结论患者产后发热的原因为人型支原体菌血症,MALDI-TOF MS分析技术对人型支原体的鉴定结果可靠,MALDI-TOF MS分析联合16S rRNA基因测序技术能提高少见病原体的诊断效率和准确性。 展开更多
关键词 人型支原体 血流感染 maldi-tof MS 16S rRNA基因测序
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MALDI-TOF MS与TB-SAT联合检测在非结核分枝杆菌病诊断中的应用
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作者 任哲 冯建纯 +2 位作者 谢炯 田二朋 马伟立 《河北医学》 2025年第9期1563-1568,共6页
目的:探讨基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)与RNA恒温扩增实时荧光检测(TB-SAT)联合检测在非结核分枝杆菌(NTM)肺病诊断中的应用。方法:选取2020年1月至2024年12月河北省胸科医院收治的疑似152例NTM肺病患者,对支气管肺... 目的:探讨基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)与RNA恒温扩增实时荧光检测(TB-SAT)联合检测在非结核分枝杆菌(NTM)肺病诊断中的应用。方法:选取2020年1月至2024年12月河北省胸科医院收治的疑似152例NTM肺病患者,对支气管肺泡灌洗液(BALF)标本进行MALDI-TOF MS、TB-SAT检查,以NTM肺病诊断标准为金标准,分析MALDI-TOF MS、TB-SAT单一筛查NTM肺病的效能及与金标准的一致性,分析MALDI-TOF MS、TB-SAT联合诊断NTM肺病、NTM肺病菌种分布的效能。结果:以NTM肺病诊断标准为准,最终确诊80例(53.63%),其中46.51%胞内分枝杆菌为主;MALDI-TOF MS、TB-SAT检测NTM肺病阳性率81.25%、78.75%,2种检测技术与金标准的一致性Kappa值分别为0.533(95%CI:0.376~0.691)、0.538(95%CI:0.378~0.697);MALDI-TOF MS、TB-SAT联合诊断敏感性、特异性、准确性、阳性预测值、阴性预测值均高于单一筛查(P<0.05);MALDI-TOF MS、TB-SAT联合诊断NTM肺病菌种分布与金标准的一致性Kappa值为0.882(95%CI:0.757~1.007)。结论:MALDI-TOF MS、TB-SAT联合检测在NTM肺病中具有良好的诊断价值,可提高诊断准确性,为临床准确诊断NTM提供有力支持。 展开更多
关键词 maldi-tof MS TB-SAT 非结核分枝杆菌病 诊断
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基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)在病毒鉴定与分型中的应用
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作者 王瑞雪 邹粤 +1 位作者 裴晓方 陈嘉熠 《病毒学报》 北大核心 2025年第5期1664-1671,共8页
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)是一种新型软电离有机质谱。近年来,MALDI-TOF MS技术凭借操作简单、检测速度快、灵敏度高等优点,在... 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)是一种新型软电离有机质谱。近年来,MALDI-TOF MS技术凭借操作简单、检测速度快、灵敏度高等优点,在微生物检测方面展现出巨大的应用潜力。然而,相较于MALDI-TOF MS应用于细菌和真菌检测的报道,该技术在病毒检测方面的报道相对较少。因此,本文就MALDI-TOF MS在病毒鉴定、分型、耐药基因检测中的应用进行综述,以期为该技术的后续应用提供思路。 展开更多
关键词 maldi-tof MS 蛋白指纹图谱 核酸质量图谱 病毒 鉴定与分型
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利用MALDI-TOF MS分析寡核苷酸钠盐组分分布
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作者 黄骏齐 陈尚坤 刘巧霞 《分析测试学报》 北大核心 2025年第4期620-627,共8页
建立了基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分析寡核苷酸钠盐分布的方法。单链寡核苷酸引物样品(长度为20 bp,理论分子量6071.02 Da)经纯水溶解后,分别采用高效液相色谱-质谱(HPLC-MS)与MALDI-TOF MS进行检验;样液经乙酸钠... 建立了基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分析寡核苷酸钠盐分布的方法。单链寡核苷酸引物样品(长度为20 bp,理论分子量6071.02 Da)经纯水溶解后,分别采用高效液相色谱-质谱(HPLC-MS)与MALDI-TOF MS进行检验;样液经乙酸钠加钠、醇沉、复溶后再次以HPLC-MS与MALDITOF MS进行检验,检验模式均为正离子。加钠前后,HPLC-MS在解卷积后均仅显示未加盐的单一组分(对应分子量6069.9 Da与6069.8 Da);MALDI-TOF MS对加盐前样品显示单一组分(对应分子量6071.09 Da),而对加盐后样品显示了不同加钠数分子的组分分布:各组分从未加钠分子开始(对应分子量6071 Da左右),含量呈现先上升后下降的趋势,加钠个数范围从0~4到0~19不等,且分布随加盐条件的不同而变化。该结果显示MALDI-TOF MS具有检测寡核苷酸钠盐组分分布的能力,同时其具有检测一系列不同加盐程度寡核苷酸分子的广泛适应性与灵敏性。以反义寡核苷酸药物福米韦森钠为样本,采用MALDI-TOF MS分别检测了福米韦森钠纯品以及含聚乙二醇和吐温等辅料的福米韦森钠动物注射液模型。结果显示,福米韦森钠的主体加钠形态为加0个钠到加3个钠,整体含量呈现递减趋势,在加入基质前后未发生改变;同时福米韦森钠组分的误差也处于±0.5 Da范围内,精确性未受基质影响。另外,基质中的其他若干组分(包括聚乙二醇300与吐温-80)也独立显示在质谱图中,对福米韦森钠组分没有干扰。该法简单快速、灵敏度高,适用于一系列寡核苷酸钠盐分布的定性鉴定,且检验实际药物时不受药物基质影响,对反义寡核苷酸(ASO)药物的研发与检验有重要意义。 展开更多
关键词 maldi-tof MS 寡核苷酸 寡核苷酸钠盐分布 定性分析
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动物源大肠杆菌MALDI-TOF MS质谱库的建立及在北京地区区域性差异应用分析
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作者 张启龙 钱云开 +9 位作者 刘利勤 傅彩霞 贾宏丽 刘海莹 栗云鹏 杨逸舟 田辉 董志军 朱家强 周德刚 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第2期117-123,共7页
为比较不同区域大肠杆菌是否具有差异性,本研究针对自北京市怀柔区收集分离的11株大肠杆菌和延庆区收集分离的22株大肠杆菌进行了鉴定,分别采用常规生化法、16S rRNA测序和基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)的鉴定方... 为比较不同区域大肠杆菌是否具有差异性,本研究针对自北京市怀柔区收集分离的11株大肠杆菌和延庆区收集分离的22株大肠杆菌进行了鉴定,分别采用常规生化法、16S rRNA测序和基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)的鉴定方法进行鉴定,比较了3种方法鉴定的准确率,并对获得的细菌肽质量指纹谱数据进行分析。结果显示:两地采集的大肠杆菌用3种方法鉴定,其准确性都在95%以上,其中MALDI-TOF MS鉴定采用多点点靶时准确率可达99%以上,多点点靶下MALDI-TOF MS鉴定重复性强、准确高、时间快;不同区域的大肠杆菌虽具有相似的肽质量指纹谱特征,但聚类分析和主成分分析显示所有数据可清晰地按地区聚成两簇,其中怀柔一簇、延庆一簇,两簇之间区分明显。表明自怀柔和延庆采集的大肠杆菌的肽质量指纹谱具有区域性差异,可为基于MALDI-TOF MS的大肠杆菌溯源性分析提供技术依据。 展开更多
关键词 大肠杆菌 maldi-tof MS 肽质量指纹谱 北京
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基于改进鲸鱼优化算法的MALDI-TOF MS参数优化研究
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作者 张宇鹏 党玉功 +2 位作者 杨慧远 周志刚 姜杲航 《质谱学报》 北大核心 2025年第3期325-333,共9页
为了对基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)进行优化设计,提高仪器的分辨率,用Matlab建立双场加速延时引出的直线式TOF MS数学理论模型,列举了离子在空间和速度上可能出现的4种分布。针对鲸鱼优化算法收敛速度慢、精度... 为了对基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)进行优化设计,提高仪器的分辨率,用Matlab建立双场加速延时引出的直线式TOF MS数学理论模型,列举了离子在空间和速度上可能出现的4种分布。针对鲸鱼优化算法收敛速度慢、精度低和易陷入局部最优等缺点,改进收敛因子、惯性权重和位置更新策略,并以分辨率为目标,对仪器参数进行优化计算。经优化分析,分别得到萃取区长度与无场飞行管长度和萃取电压与延时时间对分辨率的影响规律,合理的萃取区长度、加速区长度和无场飞行管长度分别为3 mm、12 mm和0.95 m。对于相对分子质量在2 000~20 000 u范围内的任意离子,选择分布4下相应的萃取电压和延时时间的优化参数组合,可以获得较高的分辨率。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(maldi-tof MS) 分辨率 鲸鱼优化算法 参数优化
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基于MALDI-TOF核酸质谱的11种牛源病毒检测方法的建立
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作者 帅江冰 张泽林 +6 位作者 宋士琦 韩笑 曾若雪 陈吴健 郭悠然 郭惠民 张晓峰 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第1期39-47,共9页
为建立能高效同步鉴定牛腺病毒3型(BAV-3)、牛细小病毒1、2和3型(BPV-1、BPV-2、BPV-3)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、狂犬病毒(RV)、呼肠孤病毒3型(REO-3)、牛副流感病毒3型(BPIV-3)、蓝舌病毒(BTV)、牛呼吸道合胞体病毒(BRSV)以及牛多瘤... 为建立能高效同步鉴定牛腺病毒3型(BAV-3)、牛细小病毒1、2和3型(BPV-1、BPV-2、BPV-3)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、狂犬病毒(RV)、呼肠孤病毒3型(REO-3)、牛副流感病毒3型(BPIV-3)、蓝舌病毒(BTV)、牛呼吸道合胞体病毒(BRSV)以及牛多瘤病毒(BPyV)等牛源病毒的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)高通量多目标检测技术,本研究根据上述11种病原基因组的高保守区,分别设计多重PCR引物及对应的单碱基延伸探针,采用方阵法优化反应体系后初步建立牛源病毒的MALDI-TOF核酸质谱检测体系。利用该方法以靶标病毒质粒标准品混合物及非靶标病毒核酸为模板进行特异性试验,利用50拷贝/µL、25拷贝/µL、12.5拷贝/µL、6.3拷贝/µL、3.1拷贝/µL、1.6拷贝/µL靶标病毒核酸质粒标准品进行敏感性试验,利用106拷贝/µL、104拷贝/µL、102拷贝/µL靶标病毒核酸重组质粒标准品于同一时间和不同时间进行了稳定性试验。特异性试验结果显示,该方法仅对11种靶标病毒产生阳性信号峰,而与其他病原体无交叉反应,表明该方法特异性较强。敏感性试验结果通过probit模型进行概率回归检测,结果显示每种病毒最低检测限在8.69拷贝/µL~38.04拷贝/µL(99%概率),表明该方法敏感性较高。重复性试验结果显示,体系中每种靶标在高、中、低质粒浓度时的批内及批间重复性试验结果的符合率均达100%,表明该方法的稳定性较高。利用该MALDI-TOF核酸质谱检测体系对血液类生物制品及临床样品进行检测,同时采用各病毒的荧光定量PCR(qPCR)检测,结果显示130份样品中总计检出58份阳性,其中包括43份BPV-3、33份BPV-2、16份BPyV、6份BVDV阳性,总阳性率分别为44.0%、33.1%、25.4%、12.3%和4.6%,与各病毒qPCR结果的符合率均达100%。本研究基于MALDI-TOF核酸质谱技术首次建立了11种牛病毒的多重检测方法,为牛源病毒的快速检测及相关生物制品安全控制提供了一种新的检测技术。 展开更多
关键词 maldi-tof核酸质谱 牛血液制品 病毒
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基于MALDI-TOF MS技术检测CYP2D6、CYP2C19和HTR1A基因多态性方法的建立
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作者 吴文慧 蒋析文 《分子诊断与治疗杂志》 2025年第4期683-687,共5页
目的基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术开发一种CYP2D6、CYP2C19和HTR1A基因多态性检测的新方法。方法针对本次选取的CYP2D6*10、CYP2C19*2、HTR1A rs6295序列设计特异性质谱引物和测序引物,利用结合MALDI-TOF M... 目的基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术开发一种CYP2D6、CYP2C19和HTR1A基因多态性检测的新方法。方法针对本次选取的CYP2D6*10、CYP2C19*2、HTR1A rs6295序列设计特异性质谱引物和测序引物,利用结合MALDI-TOF MS技术建立检测方法并对准确性、检测限、特异性和重复性做性能分析与验证。采用一代测序作为对比方法,对81例未知型别的临床外周血样本,对三个基因多态性检测结果一致性进行分析。结果该方法可准确区分出CYP2D6*10、CYP2C19*2和HTR1A rs6295位点所有型别。检测上下限分别为90 ng/μL和5ng/μL,该方法具有良好的准确性、特异性和重复性。质谱结果与测序结果突变型别一致率达到100%。结论本研究开发的方法能够准确地检测CYP2D6*10、CYP2C19*2和HTR1A rs6295的基因型,适用于临床推广。 展开更多
关键词 maldi-tof MS CYP2D6*10 CYP2C19*2 HTR1A 基因多态性
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Efficient serum lipids profiling by TiO_(2)-dopamin-assisted MALDI-TOF MS for breast cancer detection
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作者 Xinyue Han Yunhan Yang +4 位作者 Jiayin Lu Yuxiang Lin Dongxue Zhang Ling Lin Liang Qiao 《Chinese Chemical Letters》 2025年第5期651-657,共7页
Lipids serve as fundamental constituents of cell membranes and organelles.Recent studies have highlighted the significance of lipids as biomarkers in the diagnosis of breast cancer.Although liquid chromatography coupl... Lipids serve as fundamental constituents of cell membranes and organelles.Recent studies have highlighted the significance of lipids as biomarkers in the diagnosis of breast cancer.Although liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry(LC-MS/MS)is widely employed for lipid analysis in complex samples,it suffers from limitations such as complexity and time-consuming procedures.In this study,we have developed dopamine-modified TiO_(2)nanoparticles(TiO_(2)-DA)and applied the materials to assist the analysis of lipids by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry(MALDI-TOF MS).The TiO_(2)-DA can provide large specific surface area and acidic environment,well suited for lipid analysis.The method was initially validated using standard lipid molecules.Good sensitivity,reproducibility and quantification performance was observed.Then,the method was applied to the analysis of 90 serum samples from 30 patients with breast cancer,30 patients with benign breast disease and 30 healthy controls.Five lipid molecules were identified as potential biomarkers for breast cancer.We constructed a classification model based on the MALDI-TOF MS signal of the 5 lipid molecules,and achieved high sensitivity,specificity and accuracy for the differentiation of breast cancer from benign breast disease and healthy control.We further collected another 60 serum samples from 20 healthy controls,20 patients with benign breast disease and 20 patients with breast cancer for MALDITOF MS analysis to verify the accuracy of the classification model.This advancement holds great promise for the development of diagnostic models for other lipid metabolism-related diseases. 展开更多
关键词 LIPID maldi-tof MS Breast cancer Machine learning TiO_(2)
原文传递
基于MALDI-TOF MS快速鉴定临床尿液标本中病原菌的方法比较
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作者 吴志妹 陆静芬 王淑玲 《分子诊断与治疗杂志》 2025年第2期217-220,225,共5页
目的本研究旨在通过对比分析基于离心法的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)与短时细菌培养法结合MALDI-TOF MS这两种技术,评估其在直接鉴定尿液标本中病原菌的效能,以期找到一种快速、准确且可靠的替代传统尿液培养的方... 目的本研究旨在通过对比分析基于离心法的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)与短时细菌培养法结合MALDI-TOF MS这两种技术,评估其在直接鉴定尿液标本中病原菌的效能,以期找到一种快速、准确且可靠的替代传统尿液培养的方法。方法选取2023年1月至3月在苏州市第九人民医院收集的947份来自疑似尿路感染(UTI)患者的尿液标本,并采用了两种方法进行病原菌的鉴定:一是直接基于离心处理的尿液样本使用MALDI-TOF MS进行鉴定;二是先将尿液进行短时细菌培养,随后利用MALDI-TOF MS进行鉴定。同时,以常规尿液培养作为参照标准,对两种方法的结果进行了比较。结果在常规培养阳性211例中,革兰氏阴性菌占80.6%,阳性菌占19.4%,主要病原菌为大肠杆菌和肺炎克雷伯菌。离心MALDI-TOF MS与短期培养联合MALDI-TOF MS检测准确率分别为82.4%/46.3%和91.2%/65.9%,三者间差异无统计意义(P>0.05)。两种MALDI-TOF方法总体识别得分的差异有统计学意义(P<0.05)。菌落计数与MALDI-TOF MS检出率相关性分析显示,革兰氏阴性菌鉴定差异显著,低菌落计数时短期培养结合MALDI-TOF MS检测能力更高。结论MALDI-TOF MS技术,无论是单独基于离心法还是与短时细菌培养相结合都各有优势,未来可根据临床实际需求灵活选择,以优化尿路感染病原菌的快速鉴定流程。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱分析(maldi-tof MS) 尿路感染(UTI)
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MALDI-TOF MS技术识别白酒酿造微生物的可行性探讨
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作者 董雪 姜利 +2 位作者 岳涛 王鹏 汤有宏 《酿酒》 2025年第1期132-135,共4页
随着现代微生物检测技术的日益成熟,白酒相关领域的微生物信息研究发展迅速。白酒的酿造过程与微生物的新陈代谢密不可分,因此识别并建立白酒酿造微生物菌种数据库是探索白酒酿造过程的基础。浅析了几种微生物的检测方法并介绍一种新型... 随着现代微生物检测技术的日益成熟,白酒相关领域的微生物信息研究发展迅速。白酒的酿造过程与微生物的新陈代谢密不可分,因此识别并建立白酒酿造微生物菌种数据库是探索白酒酿造过程的基础。浅析了几种微生物的检测方法并介绍一种新型微生物识别技术-基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS),旨在为白酒酿造微生物的识别鉴定和菌种数据库的建立提供简单高效的手段。 展开更多
关键词 白酒酿造微生物 maldi-tof MS 指纹图谱
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MALDI-TOF MS技术在食品微生物检测与鉴定中的应用
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作者 于河 王超 《中外食品工业》 2025年第13期104-107,共4页
食品微生物检测与鉴定是确保食品安全和质量控制的关键环节。传统的检测方法因耗时长和操作复杂使效率受到限制,而基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术在食品微生物检测与鉴定中展现出显著的高效化优势。文章阐述了MALD... 食品微生物检测与鉴定是确保食品安全和质量控制的关键环节。传统的检测方法因耗时长和操作复杂使效率受到限制,而基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术在食品微生物检测与鉴定中展现出显著的高效化优势。文章阐述了MALDI-TOF MS技术的原理与特点,着重探讨了该技术在食品微生物检测与鉴定中的应用,分析了其在实际应用中面临的挑战及未来发展方向,为食品安全监管的现代化提供理论依据和技术支持。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(maldi-tof MS) 食品微生物 检测与鉴定 微生物数据库 食品安全
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