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食管癌高表达抗原HLA-A2/A3限制性细胞毒性T淋巴细胞表位预测
被引量:
2
1
作者
孙战强
李永欣
+3 位作者
娄慧萍
李静静
陈鲤翔
祁元明
《肿瘤防治研究》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期412-415,共4页
目的预测食管癌普遍高表达蛋白COX-2和MAGE-4的HLA-A2/A3限制性CTL表位。方法运用生物信息学的方法,SYFPEITHI初步预测,结合三维构效定量关系和蛋白酶体酶切位点分析。结果对SYFPEITHI预测>20的九肽用MHCPred和NetChop3.0作进一步分...
目的预测食管癌普遍高表达蛋白COX-2和MAGE-4的HLA-A2/A3限制性CTL表位。方法运用生物信息学的方法,SYFPEITHI初步预测,结合三维构效定量关系和蛋白酶体酶切位点分析。结果对SYFPEITHI预测>20的九肽用MHCPred和NetChop3.0作进一步分析,并与已报道抗原肽进行比对,初步筛选出了42个潜在的CTL表位。结论这42个九肽均未见文献报道,进一步鉴定将为CTL表位疫苗的研究提供更多的线索。其中,MAGE-422-30、202-210、286-294及COX-2479-4874个九肽具有与HLA-A2和HLA-A3超型潜在的交叉免疫活性,将为研制简约的高效广谱食管癌疫苗提供候选肽。
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关键词
食管癌
HLA
环氧合酶-2
maga-4
CTL表位
暂未订购
题名
食管癌高表达抗原HLA-A2/A3限制性细胞毒性T淋巴细胞表位预测
被引量:
2
1
作者
孙战强
李永欣
娄慧萍
李静静
陈鲤翔
祁元明
机构
郑州大学生物工程系
出处
《肿瘤防治研究》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期412-415,共4页
基金
河南省医学创新人才基金资助项目(200311201)
文摘
目的预测食管癌普遍高表达蛋白COX-2和MAGE-4的HLA-A2/A3限制性CTL表位。方法运用生物信息学的方法,SYFPEITHI初步预测,结合三维构效定量关系和蛋白酶体酶切位点分析。结果对SYFPEITHI预测>20的九肽用MHCPred和NetChop3.0作进一步分析,并与已报道抗原肽进行比对,初步筛选出了42个潜在的CTL表位。结论这42个九肽均未见文献报道,进一步鉴定将为CTL表位疫苗的研究提供更多的线索。其中,MAGE-422-30、202-210、286-294及COX-2479-4874个九肽具有与HLA-A2和HLA-A3超型潜在的交叉免疫活性,将为研制简约的高效广谱食管癌疫苗提供候选肽。
关键词
食管癌
HLA
环氧合酶-2
maga-4
CTL表位
Keywords
Esophageal carcinoma
HLA
COX-2
MAGE-
4
CTL epitopes
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
食管癌高表达抗原HLA-A2/A3限制性细胞毒性T淋巴细胞表位预测
孙战强
李永欣
娄慧萍
李静静
陈鲤翔
祁元明
《肿瘤防治研究》
CAS
CSCD
北大核心
2007
2
暂未订购
已选择
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参考文献
引证文献
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