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辣椒MADS-box转录因子基因CaAGL61的耐热功能分析
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作者 王梦园 魏倩睿 +4 位作者 李海艳 杨巧敏 宇军 黄炜 逯明辉 《中国农业科学》 北大核心 2025年第8期1604-1616,共13页
【目的】MADS-box转录因子是植物最大的转录因子家族之一,在植物生长发育和胁迫响应中均发挥重要功能。前期通过转录组数据获得一个辣椒热响应基因,该基因编码MADS-box转录因子家族成员CaAGL61(Agamous-like MADS-box protein AGL61)。... 【目的】MADS-box转录因子是植物最大的转录因子家族之一,在植物生长发育和胁迫响应中均发挥重要功能。前期通过转录组数据获得一个辣椒热响应基因,该基因编码MADS-box转录因子家族成员CaAGL61(Agamous-like MADS-box protein AGL61)。在此基础上,进一步研究CaAGL61在辣椒耐热性调控中的功能,为深入了解辣椒耐热分子机制提供理论参考,为辣椒耐热性的遗传改良提供基因位点。【方法】通过SMART在线工具预测CaAGL61保守结构域,使用MEGA7构建辣椒和其他植物物种AGL61蛋白的系统发育树,利用实时荧光定量PCR技术探究CaAGL61在辣椒中的表达模式,运用烟草亚细胞定位技术和酵母双杂交自激活系统检测CaAGL61的转录因子特性,利用病毒诱导的基因沉默技术和基因瞬时过表达技术探究CaAGL61表达对辣椒耐热性的影响。【结果】CaAGL61编码179个氨基酸,包含一个MADS结构域,在系统进化方面高度保守。CaAGL61在辣椒花器官中的表达量最高、其次是茎和果实,根中的表达量最低;进一步分析发现CaAGL61的表达量随着花器官的成熟而增加,尤其在授粉坐果期的花药中表达量最高;45℃高温处理显著上调了CaAGL61的表达水平。亚细胞定位显示,CaAGL61定位于细胞核中;酵母转录激活分析表明,CaAGL61具有转录激活活性。CaAGL61沉默植株的耐热性显著增强,热胁迫处理后,与对照相比,CaAGL61沉默植株生长点萎蔫程度减轻,叶片相对电导率降低,丙二醛含量、死细胞和活性氧积累减少,而叶绿素含量升高。相反,CaAGL61瞬时过表达降低了辣椒的耐热性,与对照相比,表现为植株受热胁迫损伤程度更严重,叶片相对电导率升高,丙二醛含量、死细胞和活性氧积累增多,叶绿素含量下降。【结论】鉴定了一个辣椒热响应MADS-box转录因子基因CaAGL61,该基因通过加剧氧化胁迫而负调控辣椒耐热性。 展开更多
关键词 辣椒 耐热 mads-box转录因子 CaAGL61 负调控
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水稻MADS-box家族基因研究进展
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作者 王晓清 王航 +3 位作者 张泽霖 胡霞菲 贺浩华 胡丽芳 《福建农业学报》 北大核心 2025年第7期743-750,共8页
MADS-box家族是序列较为保守的一类蛋白家族,其可通过结合CarG[CC(A/T)_(6)GG]元件调控下游基因的表达来参与一系列植物发育过程。水稻中共存在76个MADS-box基因,本文对参与调控水稻花器官发育、开花时间、营养生长和胁迫响应的相关MADS... MADS-box家族是序列较为保守的一类蛋白家族,其可通过结合CarG[CC(A/T)_(6)GG]元件调控下游基因的表达来参与一系列植物发育过程。水稻中共存在76个MADS-box基因,本文对参与调控水稻花器官发育、开花时间、营养生长和胁迫响应的相关MADS-box基因的功能及作用机理进行了综述,将有助于加深对水稻MADS-box家族基因的认知,为后续研究其分子调控网络并为其它物种MADS-box基因家族的研究提供理论参考。 展开更多
关键词 水稻 mads-box基因 功能
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Ⅰ型MADS-box基因SlMADS79调控番茄株型的功能研究
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作者 郭绪虎 李灵芝 +2 位作者 李凤 马博岩 贾晓宇 《作物学报》 北大核心 2025年第4期982-991,共10页
MADS-box基因在植物生长发育全过程中具有重要调控功能。目前,关于番茄Ⅱ型MADS-box基因的功能研究较多,而Ⅰ型MADS-box基因却鲜有报道。本研究克隆了Ⅰ型MADS-box基因SlMADS79,该基因在番茄根、叶和侧芽中表达水平相对较高,推测其可能... MADS-box基因在植物生长发育全过程中具有重要调控功能。目前,关于番茄Ⅱ型MADS-box基因的功能研究较多,而Ⅰ型MADS-box基因却鲜有报道。本研究克隆了Ⅰ型MADS-box基因SlMADS79,该基因在番茄根、叶和侧芽中表达水平相对较高,推测其可能参与番茄营养器官生长调控。本研究以经典番茄栽培品种Ailsa Craig(AC^(++))为背景材料,采用RNA干扰技术沉默SlMADS79基因。与野生型相比,SlMADS79基因沉默株系顶端优势度降低、植株矮小;叶片的长度、宽度、周长以及面积均小于野生型植株;根系总长度、总表面积、总投影面积、根系体积、分叉数、根尖数均显著减少。解剖学研究表明,沉默植株茎秆的纵切面细胞较小,然而其平均数量明显增加。在激素水平上,SlMADS79沉默株系中IAA(吲哚-3-乙酸)、TZR(转玉米素核糖苷)以及CS(栗木甾酮)含量降低。在分子水平上,生长素应答基因IAA3和赤霉素合成基因GA3ox1在SlMADS79沉默株系中显著下调,而细胞周期基因CyCA3;1在沉默株系中显著上调。本研究从形态、解剖、激素和分子水平上进一步解析了SlMADS79基因的生物学功能,丰富了番茄Ⅰ型MADS-box基因家族的研究,为番茄株型调控研究提供了可靠的理论依据。 展开更多
关键词 番茄 mads-box SlMADS79 株高 叶片形态 根系
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绿豆MADS-box基因家族鉴定及表达分析
4
作者 姚晓琳 张晓芳 +4 位作者 李昆洛 郝俊莹 隋梦宇 张沿政 李帅 《山东农业科学》 北大核心 2025年第5期11-28,共18页
为了解绿豆MADS-box基因的进化过程,本研究通过全基因组分析鉴定出77个VrMADS-box基因,分布在11条染色体上,其中7号染色体上最多,共有18个。VrMADS-box基因主要分为Ⅰ型和Ⅱ型,Ⅰ型VrMADS-box基因又划分为Mα(15)、Mβ(4)和Mγ(11)三个... 为了解绿豆MADS-box基因的进化过程,本研究通过全基因组分析鉴定出77个VrMADS-box基因,分布在11条染色体上,其中7号染色体上最多,共有18个。VrMADS-box基因主要分为Ⅰ型和Ⅱ型,Ⅰ型VrMADS-box基因又划分为Mα(15)、Mβ(4)和Mγ(11)三个亚支;Ⅱ型VrMADS-box基因则划分为MIKCc(44)和MIKC∗(3)两个亚支。MIKCc可划分为12个亚家族,绿豆缺少开花位点C(FLC)亚家族。绿豆MADS-box基因种内存在18个重复基因对,种间共线性分析表明绿豆和拟南芥(Arabidopsis thaliana)、大豆(Glycine max)MADS-box基因间分别存在39个和171个同源基因对。不同亚家族VrMADS-box基因在结构和表达模式等方面存在显著差异,表明它们在绿豆生长发育过程中可能发挥不同作用。本研究揭示了VrMADS-box基因家族的信息和表达模式,有助于进一步研究绿豆VrMADS-box家族基因的功能及分子机制。 展开更多
关键词 mads-box 绿豆 基因家族分析 基因表达
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珙桐MADS-box基因家族的鉴定、表达及调控分析
5
作者 刘晋芸 胡小盼 +3 位作者 朱大海 叶天意 李培瑶 魏炜 《四川大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期215-227,共13页
为了对珙桐MADS-box基因家族进行全面系统的研究,了解其对珙桐花器官特性和苞片发育的影响,本研究在珙桐全基因组范围内对MADS-box基因家族进行鉴定和分类,并与近缘物种进行同源性分析.通过物种内共线性基因计算珙桐MADS-box基因家族的... 为了对珙桐MADS-box基因家族进行全面系统的研究,了解其对珙桐花器官特性和苞片发育的影响,本研究在珙桐全基因组范围内对MADS-box基因家族进行鉴定和分类,并与近缘物种进行同源性分析.通过物种内共线性基因计算珙桐MADS-box基因家族的选择压力.成功鉴定了103个珙桐MADS-box基因家族成员,其中MIKCC类基因受到更为强烈的纯化选择.通过与近缘物种的MADS-box基因家族的同源性分析发现珙桐AGL2/SEP亚家族和SQUA亚家族的MADS-box基因数目存在明显的扩张.利用转录组测序技术以及qRTPCR检测了MADS-box基因家族在3个发育阶段的苞片和叶片中的表达模式,并利用转录因子结合位点对部分关键差异表达基因所编码的转录因子进行了靶基因的初步预测,发现珙桐花瓣状苞片的形成可能是花器官特征决定基因AP1-like、AP3-like和SEP-like的同源基因在苞片中的异位表达所导致. 展开更多
关键词 珙桐 mads-box基因家族 花瓣状苞片 基因异位表达
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紫玉兰‘红元宝’MIKC型MADS-box家族鉴定及其在多季成花中的作用探析
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作者 陈小珺 朱森宇 +4 位作者 田丰 王晶晶 吴超 申亚梅 马晶晶 《热带亚热带植物学报》 北大核心 2025年第3期269-281,共13页
为了解紫玉兰(Yulania liliiflora) MADS-box基因家族成员的功能和表达模式,基于‘红元宝’(‘Hongyuanbao’)转录组数据,对其MIKC型MADS-box基因家族成员进行鉴定、理化性质、系统进化和保守结构域分析。结果表明,共鉴定出19个MIKC型MA... 为了解紫玉兰(Yulania liliiflora) MADS-box基因家族成员的功能和表达模式,基于‘红元宝’(‘Hongyuanbao’)转录组数据,对其MIKC型MADS-box基因家族成员进行鉴定、理化性质、系统进化和保守结构域分析。结果表明,共鉴定出19个MIKC型MADS-box基因家族成员,均定位于细胞核中且拥有共同的MADS或K-box保守结构域。大部分MlMADSs在花器官建成中发挥功能,且MlAGL6和MlAGL12-c作为蛋白质互作网络的中心节点可能发挥关键作用。Ml MADS-box成员在雄蕊、花芽和茎等组织中均有较高的表达水平,在花器官形成和花发育过程中发挥重要作用,并筛选到调控紫玉兰‘红元宝’2次成花的候选关键基因Ml AGL6。这为探索MIKC型MADS-box基因在紫玉兰‘红元宝’生殖发育过程的功能提供数据支持。 展开更多
关键词 紫玉兰 MIKC型mads-box基因家族 花发育 基因表达
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MADS-box转录因子家族基因对植物非生物胁迫的响应研究进展
7
作者 田诗 金钏 +3 位作者 刘亚杰 王雪松 张军保 刘丽杰 《高师理科学刊》 2025年第3期80-85,共6页
植物生长发育过程中会遇到多种逆境因素的影响,包括生物胁迫和非生物胁迫.研究表明,MADS-box转录因子可参与调控植物的非生物胁迫反应,对植物的生长发育起到重要作用.综述了MADS-box转录因子响应干旱胁迫、温度胁迫、盐胁迫以及其它非... 植物生长发育过程中会遇到多种逆境因素的影响,包括生物胁迫和非生物胁迫.研究表明,MADS-box转录因子可参与调控植物的非生物胁迫反应,对植物的生长发育起到重要作用.综述了MADS-box转录因子响应干旱胁迫、温度胁迫、盐胁迫以及其它非生物胁迫的研究进展,进一步分析了MADS-box转录因子家族基因的研究前景,即MADS-box基因应对非生物胁迫的信号通路,对各种胁迫之间相关基因的关系进行深入分析,从而更好地阐释各基因的功能,为作物抗逆新品种的培育奠定基础. 展开更多
关键词 mads-box转录因子 非生物胁迫 植物
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辣椒MADS-box转录因子CaRIN基因克隆、表达与功能分析 被引量:1
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作者 段敏杰 杨小苗 +3 位作者 李怡斐 黄任中 黄启中 张世才 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1239-1249,共11页
【目的】探究MADS-box家族基因RIN的表达特征和功能,解析其对辣椒类胡萝卜素代谢的影响。【方法】基于辣椒果实发育转录组,通过RT-PCR克隆辣椒MADS-box转录因子CaRIN基因CDS全长,分析其生物信息学、表达模式、亚细胞定位、转录活性等,... 【目的】探究MADS-box家族基因RIN的表达特征和功能,解析其对辣椒类胡萝卜素代谢的影响。【方法】基于辣椒果实发育转录组,通过RT-PCR克隆辣椒MADS-box转录因子CaRIN基因CDS全长,分析其生物信息学、表达模式、亚细胞定位、转录活性等,并探讨VIGS诱导CaRIN基因沉默对类胡萝卜素代谢的影响。【结果】(1)CaRIN基因CDS全长732 bp,编码243个氨基酸,蛋白分子质量为27.95 kD,等电点(pI)为7.06,其编码蛋白具有典型的MEF2_like MADS结构域,属MICK型转录因子。(2)CaRIN基因主要在花和果实中表达,具有组织特异性;CaRIN定位在细胞核,并且具有转录激活活性。(3)CaRIN基因启动子具有ABRE等多个激素应答元件,外源脱落酸和乙烯利均能加速果实转红,诱导CaRIN及相关基因高表达。(4)VIGS诱导沉默CaRIN基因后,类胡萝卜素代谢途径基因PSY1、CCS、PDS、CRTZ、LCYB和NCED1表达水平降低为对照组的0.27~0.59倍,且果实总类胡萝卜素含量(0.379 mg/g)较对照(0.650 mg/g)显著降低。【结论】CaRIN是辣椒果实类胡萝卜素代谢过程的重要调控因子。 展开更多
关键词 辣椒 mads-box转录因子 CaRIN VIGS 类胡萝卜素
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灰毡毛忍冬MADS-box基因家族鉴定与CMB1基因克隆 被引量:5
9
作者 付学森 刘紫璇 +4 位作者 王玲 龙雨青 曾娟 周日宝 刘湘丹 《湖南中医药大学学报》 CAS 2024年第3期383-394,共12页
目的鉴定灰毡毛忍冬Lonicera macranthoides MADS-box家族基因并进行生物信息学分析与表达模式验证,克隆湘蕾型和野生型灰毡毛忍冬MADS-box家族成员CMB1全长。方法基于转录组数据,利用在线工具对灰毡毛忍冬MADS-box进行生物信息学分析,... 目的鉴定灰毡毛忍冬Lonicera macranthoides MADS-box家族基因并进行生物信息学分析与表达模式验证,克隆湘蕾型和野生型灰毡毛忍冬MADS-box家族成员CMB1全长。方法基于转录组数据,利用在线工具对灰毡毛忍冬MADS-box进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR验证MADS-box基因在不同品种中的表达模式,通过RT-PCR、RACE技术克隆湘蕾型和野生型灰毡毛忍冬CMB1基因全长。结果28个灰毡毛忍冬MADS-box蛋白长度为89~359 aa,碱性蛋白占比85.7%,不稳定蛋白占比96.4%,亲水性蛋白占比96.4%,均定位于细胞核,均为无跨膜结构的非分泌蛋白。转录组显示,与野生型比较,湘蕾型中28个MADS-box基因有17.86%表达下调,MIKCC型基因中有18.75%表达下调。克隆得到在两个品种的灰毡毛忍冬花中高度特异性表达的CMB1基因全长,均包含一个738 bp的ORF,编码245个氨基酸。CMB1基因在两个品种的花中表达量存在显著差异(P<0.01),且与茎、叶相比,在花中高度特异性表达(P<0.01)。结论基于灰毡毛忍冬转录组数据,鉴定了28个MADS-box家族基因,克隆得到湘蕾型与野生型灰毡毛忍冬CMB1基因全长,为进一步研究灰毡毛忍冬花发育、优良表型形成的分子机制提供研究基础与理论依据。 展开更多
关键词 灰毡毛忍冬 mads-box基因家族 表达分析 CMB1基因 基因克隆 表型变异
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大豆MADS-box基因功能研究进展 被引量:6
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作者 姚晓琳 张晓芳 +4 位作者 王铮 郝俊莹 郑荣繁 张沿政 李帅 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期909-918,共10页
MADS-box是植物体内一种重要的转录因子,其家族成员具有典型的MIKC结构、高度保守的N端MADS以及保守性较低的I域和C端。MADS-box基因广泛表达于植物的根、茎、叶、花、芽等组织部位,并参与调控花期、花器官发育、种子发育及非生物胁迫... MADS-box是植物体内一种重要的转录因子,其家族成员具有典型的MIKC结构、高度保守的N端MADS以及保守性较低的I域和C端。MADS-box基因广泛表达于植物的根、茎、叶、花、芽等组织部位,并参与调控花期、花器官发育、种子发育及非生物胁迫响应等过程。近年来的研究报道显示,不同MADS-box基因的表达模式不尽相同,其功能也存在较大差异。本文概述了大豆MADS-box基因家族的结构及分类,总结了大豆MADS-box基因家族花发育ABCDE模型中相关成员及SVP、SOC1、FLC等基因的研究进展。最后对大豆MADS-box的研究提出了展望,为今后进一步挖掘和利用该类转录因子基因进行大豆遗传改良和种质创新提供参考依据。 展开更多
关键词 大豆 mads-box ABCDE模型 转录因子
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柳属植物花发育相关的MADS-box基因家族成员鉴定与表达分析 被引量:3
11
作者 王媛 翁慧莹 +3 位作者 曾思文 王苑 李煜 何理 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期355-363,共9页
【目的】利用基因组和转录组数据鉴定分析花发育相关的MADS-box基因家族成员的结构特征及表达模式,为柳属花被缺失的分子机制研究提供理论依据。【方法】通过生物信息学方法鉴定柳属的长梗柳(Salix dunnii)、欧蒿柳(S.viminalis)、红皮... 【目的】利用基因组和转录组数据鉴定分析花发育相关的MADS-box基因家族成员的结构特征及表达模式,为柳属花被缺失的分子机制研究提供理论依据。【方法】通过生物信息学方法鉴定柳属的长梗柳(Salix dunnii)、欧蒿柳(S.viminalis)、红皮柳(S.purpurea)的MADS-box基因家族成员,并对3种柳树花发育相关的MADS-box基因系统发育关系、基因复制和丢失、基因结构和理化性质进行分析。根据雌雄花芽的转录组数据分析长梗柳花发育相关基因在花芽不同发育阶段的表达模式。【结果】在长梗柳、欧蒿柳和红皮柳中分别鉴定出82、82和98个MADS-box家族基因。3种柳树的花发育相关基因经历了基因复制和丢失,相同亚类基因结构和保守结构域相似,但部分A、B、C和E亚类基因的K-box结构域缺失。长梗柳花发育相关基因的表达结果显示,在雌花和雄花中具有不同的表达模式。其中,B亚类SdMADS26和SdMADS4基因表达量均偏低。【结论】柳属植物花发育相关基因中部分成员的基因结构和表达模式发生了变化,推测这些变化可能与柳属花被缺失相关。 展开更多
关键词 柳属 花被 mads-box基因家族 基因组 转录组
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甜瓜MADS-box基因家族的鉴定及系统进化分析 被引量:2
12
作者 秦玉杰 任辉 祝建波 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第5期1430-1443,共14页
中国是甜瓜的主要生产国家,种植面积和产量都位于世界首位。本研究通过全基因组分析鉴定了甜瓜MADS-box基因家族成员,分析甜瓜MADS-box基因家族成员的染色体定位、多重序列比对、motif分布和外显子-内含子结构分布,以及对其成员进行进... 中国是甜瓜的主要生产国家,种植面积和产量都位于世界首位。本研究通过全基因组分析鉴定了甜瓜MADS-box基因家族成员,分析甜瓜MADS-box基因家族成员的染色体定位、多重序列比对、motif分布和外显子-内含子结构分布,以及对其成员进行进化及表达分析,并分析启动子区的顺式作用元件分布。结果显示,从甜瓜全基因组数据库中共鉴定了45个甜瓜MADS-box基因,其中Ⅰ型基因11个,Ⅱ型基因34个;通过系统发育分析,Ⅰ型基因主要分布于Mβ和Mγ亚家族中;Ⅱ型基因则分布于13个亚家族;Ⅰ型基因与Ⅱ型基因的motif分布和外显子个数区别明显,但同型基因区别不大;对CmMADS-box基因家族全生理期表达量进行可视化分析并进行了共线性分析;根据启动子区的顺式作用元件分布情况,推测CmMADS-box基因可能响应多种外界胁迫,即具有功能多样性。该研究结果为探究甜瓜MADS-box基因家族生物学功能提供参考。 展开更多
关键词 mads-box 甜瓜 基因家族 进化分析 表达分析
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辣椒MIKC型MADS-box基因家族鉴定及胁迫响应 被引量:2
13
作者 罗希榕 祝晓云 +4 位作者 杨仕梅 李唐燕 李靖 陀海燕 覃成 《种子》 北大核心 2024年第1期59-67,113,共10页
MADS-box家族在花的诱导和发育中作用广泛,有些基因在明显不相关的发育阶段具有多种功能。本研究通过生物信息学对辣椒MIKC型MADS-box家族系统发育树、保守结构、基因特征、GO和KEGG富集分析、时空表达等进行系统分析。在辣椒中共鉴定... MADS-box家族在花的诱导和发育中作用广泛,有些基因在明显不相关的发育阶段具有多种功能。本研究通过生物信息学对辣椒MIKC型MADS-box家族系统发育树、保守结构、基因特征、GO和KEGG富集分析、时空表达等进行系统分析。在辣椒中共鉴定到25条MIKC_MADS基因,均具有MIKC_MADS的N端SRF-TF和C端K-box保守结构域,氨基酸数为122~278 aa,为两性亲水性蛋白。Motif分析发现,25条CaMADS-box基因均含有Motif1、Motif2、Motif4共3个保守基序。染色体定位发现,25条基因不均匀地分布在12条染色体上,其中染色体Chr02定位基因最多,共计5条基因。共线性分析发现MIKC_MADS在野生种Chiltepin中存在多个共线性区块。GO富集分析发现,MIKC_MADS主要参与植物生长初期发育过程,主要是花器官、胚乳发育过程,KEGG富集到甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢(ko00260),乙醛酸盐和二羧酸盐代谢(ko00630),碳代谢(ko01200)。顺式作用元件发现,与光响应元件、水杨酸、胚乳等元件相关。在时空表达过程中,MIKC_MADS在茎、叶、芽和花过程表达呈现上调表达趋势。 展开更多
关键词 辣椒 mads-box基因 基因特征 时空表达特性
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朱红大杜鹃MADS-box基因家族的全基因组鉴定与特征分析 被引量:1
14
作者 柳文 马永鹏 +3 位作者 应支萍 杨琳祥 谢孟 马宏 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期624-633,共10页
MADS-box是在植物生长发育过程中扮演重要角色的一类转录因子,特别是花器官形成、开花时间控制及果实发育与成熟等过程。本研究基于朱红大杜鹃(Rhododendron griersonianum Balf.f.et Forrest)全基因组测序数据,利用生物信息学方法从中... MADS-box是在植物生长发育过程中扮演重要角色的一类转录因子,特别是花器官形成、开花时间控制及果实发育与成熟等过程。本研究基于朱红大杜鹃(Rhododendron griersonianum Balf.f.et Forrest)全基因组测序数据,利用生物信息学方法从中鉴定出81个MADS-box基因,并进行了分析。根据系统发育关系和蛋白结构将MADS-box分为两类:Type-Ⅰ型包含24个基因,Type-Ⅱ型包含57个基因,这些基因不均匀地分布于12条染色体上;81个MADS-box基因中,存在6对片段复制和1对串联复制基因,且它们经历了纯化选择作用;同时,基因启动子区域含有光响应、植物生长、激素反应和胁迫响应等顺式作用元件。综上,本研究鉴定了朱红大杜鹃的MADS-box家族转录因子,为深入研究其MADS-box蛋白的生物学功能提供了基础。 展开更多
关键词 朱红大杜鹃 mads-box基因家族 生物信息学 基因结构
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玉米MADS-box基因家族的鉴定及表达模式分析 被引量:1
15
作者 刘泓畅 马恩慧 +3 位作者 王翠玲 张严玲 陈钰姝 刘青青 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2024年第6期10-21,共12页
利用生物信息学方法对玉米(Zea mays)骨干自交系黄早四及玉米自交系B73全基因组中的MADS-box基因家族成员进行鉴定并依据转录组数据分析其表达模式。结果显示:黄早四基因组中有87个MADS-box家族成员,B73基因组中该家族成员有84个;2个自... 利用生物信息学方法对玉米(Zea mays)骨干自交系黄早四及玉米自交系B73全基因组中的MADS-box基因家族成员进行鉴定并依据转录组数据分析其表达模式。结果显示:黄早四基因组中有87个MADS-box家族成员,B73基因组中该家族成员有84个;2个自交系间的MADS-box成员共存在113个共线基因对,表明MADS-box家族在2个自交系间进化较为保守;在花粉粒和双核雄性配子体组织中显著表达的MADS-box家族成员数量最少,穗原基中显著表达的成员数量最多;非生物胁迫下,在冷、热、紫外线逆境胁迫处理下,相比于对照组,MADS-box家族成员中多为下调表达,而在盐、干旱、干旱及盐复合逆境胁迫下多为上调表达,提示MADS-box家族成员通过不同的调节方式和途径参与玉米生长发育和逆境胁迫响应。 展开更多
关键词 玉米 黄早四 mads-box基因家族 全基因组鉴定
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基于转录组信息的辣椒MADS-box转录因子家族分析
16
作者 丁楚琦 吴鹏 +3 位作者 郭茜茜 王丽 郭展新 冯柏龙 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期52-62,共11页
MADS-box转录因子广泛存在于植物中,在生长发育和次生代谢过程中发挥重要作用。为探究MADS-box转录因子家族在辣椒素不同积累时期的表达情况。利用辣椒素不同积累时期转录组数据,鉴定辣椒MADS-box转录因子家族成员,并进行亚细胞定位、... MADS-box转录因子广泛存在于植物中,在生长发育和次生代谢过程中发挥重要作用。为探究MADS-box转录因子家族在辣椒素不同积累时期的表达情况。利用辣椒素不同积累时期转录组数据,鉴定辣椒MADS-box转录因子家族成员,并进行亚细胞定位、保守基序、系统进化树和染色体定位分析,对其功能进行初步分析。结果表明,在辣椒转录组数据中共鉴定出95个MADS-box转录因子;含有105~395个氨基酸;分子质量为11.55~44.46 ku;理论等电点为5.16~10.01;主要在细胞核表达,均含有MADS保守结构域,系统发育分析表明,MADS蛋白可分为8个亚家族。有73条CaMADS家族成员定位到12条染色体上。差异表达的MADS-box基因有26个,其中6个基因在C1 vs C2时期上调,在C2 vs C3时期下调。基于KEGG富集和蛋白互作预测到CaMADS13可能参与辣椒中木质素的合成。CaMADS24可能参与辣椒素和木质素合成前体香豆酰辅酶A的合成。利用生物信息学分析,鉴定了辣椒MADS-box家族转录因子,为深入研究辣椒素次生代谢中的分子调控机制提供理论基础。 展开更多
关键词 辣椒 mads-box 转录因子 次生代谢
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长寿与短命:十字花科植物中MADS-box基因的长袖善舞 被引量:1
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作者 廉小平 Getachew Melaku +1 位作者 张石来 胡凤益 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期351-354,共4页
开花基因决定植物的一年生或多年生开花习性。已在不同植物中鉴定到多个开花基因,然而关于开花基因如何驱动十字花科植物一年生与多年生生活史策略转变的进化机制仍不清楚。最近一项研究聚焦十字花科不同属的自然变异,发现3个亲缘关系... 开花基因决定植物的一年生或多年生开花习性。已在不同植物中鉴定到多个开花基因,然而关于开花基因如何驱动十字花科植物一年生与多年生生活史策略转变的进化机制仍不清楚。最近一项研究聚焦十字花科不同属的自然变异,发现3个亲缘关系密切的MADS-box类转录因子编码基因(即FLC、FLM和MAF)与其一年生/多年生习性转变相关,并解析了其分子机制,提出十字花科植物生活史策略(即多年生/二年生/一年生之间的转换)是由FLC类MADS-box基因剂量叠加所决定的连续过程。研究结果初步明确了十字花科植物一年生与多年生生活史策略转换的进化机制和轨迹,为培育多年生油菜品种奠定了理论基础,也为其它十字花科作物的多年生化遗传改良提供借鉴。 展开更多
关键词 十字花科 生活史策略 mads-box 多年生 一年生 转换
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水稻MADS-box家族研究进展
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作者 侯鹰翔 费思恬 +2 位作者 宋松泉 罗勇 张超 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期103-112,共10页
植物MADS-box转录因子是一类含有MADS-box结构域的蛋白,在调控植物生长发育和逆境响应中发挥重要作用。水稻MADS-box转录因子的生物学功能广受关注,取得了诸多研究进展,在已知的75个水稻MADS-box家族成员中至少有33个成员的功能已被研... 植物MADS-box转录因子是一类含有MADS-box结构域的蛋白,在调控植物生长发育和逆境响应中发挥重要作用。水稻MADS-box转录因子的生物学功能广受关注,取得了诸多研究进展,在已知的75个水稻MADS-box家族成员中至少有33个成员的功能已被研究报道,它们在花器官发育、穗发育、开花习性、种子发育、株高形态建成、根系发育,以及干旱、盐分、高温、低温、稻瘟病等生物与非生物胁迫响应等方面扮演了重要角色。研究表明,MADS-box成员通过相互间的作用或与其他转录因子互作形成了一个复杂的调控网络,主要涉及植物激素信号转导、活性氧平衡、渗透调节、泛素化、DNA甲基化等途径及其之间的协同作用。研究发现,绝大多数MADS-box家族成员参与生长发育调控,尤其是花器官发育,部分成员生物学功能存在冗余性,但其可能在不同的发育阶段、组织类型或环境条件下发挥作用,未来需要更深入地解析这些基因的功能特异性和冗余性,以揭示它们在水稻生长发育中的独特作用。然而,水稻MADS-box家族仍然有众多成员的功能尚不清楚,需要更多研究去揭示它们的作用。值得注意的是,部分水稻MADS-box成员展示了潜在的应用价值,通过引导编辑技术和重离子辐射诱变等方法,高效利用这些基因资源去改良水稻的产量、品质和抗逆性等性状,是未来研究的重要方向。本文综述水稻MADS-box转录因子生物学功能,以期为水稻分子育种提供策略。 展开更多
关键词 水稻 mads-box家族 生长发育 逆境胁迫 基因功能
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MADS-box基因家族调控毛茛目植物花器官发育的研究进展 被引量:1
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作者 韩凝 李甜 +2 位作者 李凤娇 唐彩彩 张铮 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期42-54,共13页
毛茛目植物花器官具有复杂多样的特点,是研究花器官形态与遗传进化相关问题的理想植物类群。通过综述毛茛目植物花器官形态的多样性,结合毛茛目基因组、转录组以及芸香唐松草(Thalictrum thalictroides)、蓝花耧斗菜(Aquilegia coulela... 毛茛目植物花器官具有复杂多样的特点,是研究花器官形态与遗传进化相关问题的理想植物类群。通过综述毛茛目植物花器官形态的多样性,结合毛茛目基因组、转录组以及芸香唐松草(Thalictrum thalictroides)、蓝花耧斗菜(Aquilegia coulela)、黑种草(Nigella damascena)、花菱草(Eschscholzia californica)等几个代表物种的花发育研究现状,阐述了当前MADS-box基因家族A、B、C、D、E类基因的功能及其下游靶基因的研究成果,并对未来毛茛目植物花发育的研究切入点和可能面临的挑战进行展望,旨在丰富对基部真双子叶植物花器官发育分子调控途径的理解。 展开更多
关键词 毛茛目 花器官发育 mads-box基因家族 基部真双子叶植物
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枇杷MIKCC型MADS-box全基因组鉴定及表达分析
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作者 汪红霞 牛洁 +5 位作者 唐孝富 杜莹 王苗 蒲靖 邓群仙 张慧芬 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1203-1211,共9页
【目的】鉴定并分析枇杷中MADS-box基因家族成员,探明MADS-box基因在枇杷花芽发育中的表达模式。【方法】基于‘大五星’枇杷基因组数据库,利用生物信息学的方法鉴定出枇杷中的MADS-box基因,分析家族成员的保守基序,顺式作用元件和系统... 【目的】鉴定并分析枇杷中MADS-box基因家族成员,探明MADS-box基因在枇杷花芽发育中的表达模式。【方法】基于‘大五星’枇杷基因组数据库,利用生物信息学的方法鉴定出枇杷中的MADS-box基因,分析家族成员的保守基序,顺式作用元件和系统进化关系,并对其在‘春花1号’和‘果真好3号’2个品种花芽发育中的表达模式进行分析。【结果】在枇杷中共鉴定得到63个MIKC^(C)型MADS-box基因,63个MIKC^(C)型MADS-box基因被分为13个亚家族,不均匀地分布在14条染色体上。在基因家族成员上游启动子区域发现植物生长发育、胁迫反应、光响应和激素反应等相关的顺式作用元件。‘春花1号’和‘果真好3号’对应的MADS-box基因表现出相同的趋势且趋势主要分为表达量持续升高和持续降低,推测MADS-box基因在花芽发育过程中起重要作用。【结论】初步鉴定并分析了枇杷MIKC^(C)型MADS-box基因成员,及其在花芽发育过程中的表达模式。结果为研究MADS-box基因参与枇杷花芽发育提供一定的参考。 展开更多
关键词 枇杷 mads-box 基因家族 花发育
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