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滇水金凤花距发育相关基因MADS-EJ2和MADS2的克隆及表达分析
1
作者 王天野 杨梦情 +3 位作者 马慧 梁光容 黄美娟 黄海泉 《山东农业科学》 北大核心 2025年第9期1-8,共8页
E类MADS-box转录因子基因SEPALLATA(SEP)-like在花器官发育方面发挥着重要作用。为了探究基因SEP-like在滇水金凤(Impatiens uliginosa)花距发育中的功能,本研究成功克隆出基因MADS-EJ2和MADS2,分别命名为IuMADS-EJ2和IuMADS2,其cDNA全... E类MADS-box转录因子基因SEPALLATA(SEP)-like在花器官发育方面发挥着重要作用。为了探究基因SEP-like在滇水金凤(Impatiens uliginosa)花距发育中的功能,本研究成功克隆出基因MADS-EJ2和MADS2,分别命名为IuMADS-EJ2和IuMADS2,其cDNA全长均为762 bp,编码253 aa。生物信息学分析表明,IuMADS-EJ2为亲水性稳定蛋白,IuMADS2为亲水性不稳定蛋白,二者均含MIKC结构,在C-端都有其亚家族特异的SEPⅠ和SEPⅡ基序,均为E类基因;亚细胞定位预测IuMADS-EJ2和IuMADS2均定位在细胞核。IuMADS-EJ2和IuMADS2的氨基酸序列与喜马拉雅凤仙花的同源序列相似性分别为98.03%和95.26%。qRT-PCR分析表明,两基因在滇水金凤花距发育的3个时期及2个不同部位均有表达,IuMADS-EJ2在花苞期距部的表达量最高,IuMADS2在花苞期檐部的表达量最高,推测两基因调控花距发育且主要在花距发育初期发挥作用。本研究结果可为凤仙花花距发育分子机制解析、花形改良和新品种培育提供一定的基础数据和理论依据。 展开更多
关键词 滇水金凤 花距发育 mads-EJ2基因 mads2基因 生物信息学分析 表达分析
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薄壳山核桃MADS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
2
作者 方欣妍 何秀琼 +3 位作者 黄丹 彭兵阳 孙佳雯 吕佳斌 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第6期1080-1094,共15页
MADS基因是一类重要的转录调控因子,具有广泛的生物学功能,参与多个物种的生长发育和信号传导,在多个物种中的生物学特性已被鉴定。本研究通过生物信息学方法对薄壳山核桃的MADS基因家族成员进行鉴定分析,最终鉴定出81个MADS基因家族成... MADS基因是一类重要的转录调控因子,具有广泛的生物学功能,参与多个物种的生长发育和信号传导,在多个物种中的生物学特性已被鉴定。本研究通过生物信息学方法对薄壳山核桃的MADS基因家族成员进行鉴定分析,最终鉴定出81个MADS基因家族成员,不均匀分布在16条染色体上,根据系统进化树分析结果MADS蛋白分为type-Ⅰ型(20个)和type-Ⅱ型(61个)。薄壳山核桃该家族基因具有较多顺式作用元件,植物激素响应元件、逆境胁迫响应元件和光响应元件等,研究发现这些作用元件广泛存在于MADS基因的启动子区域,表明MADS基因在薄壳山核桃适应环境变化及生长发育过程中充当重要角色。不同薄壳山核桃MADS家族基因在不同组织中和不同时期的表达量差异较大,如CiMADS46在茎、CiMADS7在果实具有较高表达量,CiMADS11的表达量随着时间推移递减。MADS基因具有不同的组织特异性表达模式,推测MADS基因家族可能在成花及果实发育过程中发挥重要作用,在不同发育阶段具有一定程度的功能多样性。本研究结果为进一步研究CiMADS基因功能与特性奠定了基础,并为其他物种的MADS基因家族成员的鉴定和表征提供参考。 展开更多
关键词 薄壳山核桃 mads基因家族 生物信息学 表达分析
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金钗石斛花发育和胁迫的转录模式及MADS家族表达分析
3
作者 陈宏宇 于莹 桑思宏 《安徽农学通报》 2025年第20期104-109,共6页
本研究以金钗石斛花为试验材料,利用转录组学对该植物的3个发育阶段[小花苞期(Ⅰ期)、大花苞期(Ⅱ期)、开放期(Ⅲ期)]和3种胁迫(低温、高温和机械损伤,均以Ⅲ期样本为材料)的样本进行测序,分析其发育(Ⅰ期vsⅡ期、Ⅱ期vsⅢ期和Ⅰ期vsⅢ... 本研究以金钗石斛花为试验材料,利用转录组学对该植物的3个发育阶段[小花苞期(Ⅰ期)、大花苞期(Ⅱ期)、开放期(Ⅲ期)]和3种胁迫(低温、高温和机械损伤,均以Ⅲ期样本为材料)的样本进行测序,分析其发育(Ⅰ期vsⅡ期、Ⅱ期vsⅢ期和Ⅰ期vsⅢ期)和胁迫(Ⅲ期胁迫vsⅢ期)的转录模式及MADS转录因子的差异表达特征。结果表明,Ⅰ期vsⅡ期、Ⅱ期vsⅢ期和Ⅰ期vsⅢ期、低温、高温和机械损伤分别识别了26 598、29 680、30 263、7 495、13 713和8 764个差异表达基因。GO功能聚类表明,差异表达基因主要聚集在生物过程、细胞组分和分子功能;KEGG调控通路分析表明,差异表达基因主要与植物激素信号转导、氨基糖和核苷酸糖代谢、植物病原体相互作用及植物MAPK信号通路等过程有关。金钗石斛花不同发育阶段和胁迫下差异表达的MADS转录因子共有74个,Ⅰ期vsⅡ期、Ⅱ期vsⅢ期和Ⅰ期vsⅢ期、低温、高温、机械损伤分别有40、34、40、17、25、16个。研究结果为解析金钗石斛花发育和胁迫应答分子机制提供参考。 展开更多
关键词 金钗石斛花 转录模式 发育 胁迫 mads家族
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无核荔枝MADS box基因LMADS1的表达与转化拟南芥分析 被引量：3
4
作者 禤维言 郑学勤 《热带作物学报》 CSCD 2006年第4期60-63,共4页
根据多种植物MADSbox蛋白的MADS域的保守序列设计一对简并引物,采用RT-PCR和3′-RACE的方法,从无核荔枝(Litchi chinensis Sonn cv.Seedless)花蕾中分离出1个687bp的基因,该基因的cDNA序列包含有完整的MADSbox保守区与半保守的K区,是典... 根据多种植物MADSbox蛋白的MADS域的保守序列设计一对简并引物,采用RT-PCR和3′-RACE的方法,从无核荔枝(Litchi chinensis Sonn cv.Seedless)花蕾中分离出1个687bp的基因,该基因的cDNA序列包含有完整的MADSbox保守区与半保守的K区,是典型的MADSbox家族基因,命名为LMADS1,在Genbank上的登录号为AY705793。Southernblot和Northernblot检测结果表明,LMADS1在无核荔枝基因组中以单拷贝形式存在,并在雌花和雄花中表达。对该基因转化拟南芥的T1代植株检测分析,转化植株未见有生育进程与花器官的改变。 展开更多
关键词 无核荔枝 mads BOX Lmads1
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基于TGF-β1/Smads信号通路研究消痰通腑方防治放射性肺损伤的作用机制
5
作者 石变 褚俊峰 +2 位作者 李秋荐 王歌 刘怀民 《中医研究》 2025年第2期73-78,共6页
目的:研究消痰通腑方通过转化生长因子(transforming growth factor,TGF)-β1/Sma和Mad相关蛋白(Sma and Mad related proteins Smads)通路治疗放射性肺损伤(radiation-induced lung injury,RILI)的作用机制。方法:将24只雄性SD大鼠随... 目的:研究消痰通腑方通过转化生长因子(transforming growth factor,TGF)-β1/Sma和Mad相关蛋白(Sma and Mad related proteins Smads)通路治疗放射性肺损伤(radiation-induced lung injury,RILI)的作用机制。方法:将24只雄性SD大鼠随机分为空白组、模型组和消痰通腑方组,每组8只。空白组予佯装照射,其余各组均采用6 MeV的X射线20 Gy单次照射全肺建立RILI大鼠模型。消痰通腑方组自造模前两周灌胃消痰通腑方,空白组和模型组分别灌胃等量生理盐水,1次/d,连续4周。苏木素-伊红染色法观察肺组织病理形态改变;酶联免疫吸附法检测血清白细胞介素(interleukin,IL)-1β、IL-6、IL-10、高迁移率族蛋白(high mobility group protein,HMG)B1、转化生长因子(transforming growth factor,TGF)-β1含量;实时定量聚合酶链反应检测肺组织中IL-1β、IL-6、IL-10、HMGB1、TGF-β1、Smad2、Smad3 mRNA表达水平;Western blot法检测肺组织中TGF-β1、Smad2、Smad3蛋白表达水平。结果:与空白组对比,模型组大鼠肺组织颜色晦暗伴肿胀充血、肠组织表面粗糙伴肠长缩短与肠重增加,肺组织病理发生炎性浸润及纤维化改变,血清IL-1β、IL-6、IL-10、HMGB1、TGF-β1含量增加(P<0.01),肺组织IL-1β、IL-6、IL-10、HMGB1 mRNA表达水平升高(P<0.05或P<0.01),TGF-β1、Smad2和Smad3的mRNA、蛋白表达水平均升高(P<0.01);与模型组对比,消痰通腑方组大鼠肺组织仅有轻微充血并伴整体病理损伤减轻、肠组织表明粗糙水肿程度减轻并伴肠长增加与肠重减轻,血清IL-1β、IL-6、IL-10、HMGB1、TGF-β1含量降低(P<0.01),肺组织IL-1β、IL-6、IL-10、HMGB1 mRNA表达水平下降(P<0.05或P<0.01),TGF-β1、Smad2和Smad3的mRNA、蛋白表达水平下降(P<0.05或P<0.01)。结论:消痰通腑方对放射性肺损伤大鼠具有防治作用,其机制可能与抑制TGF-β1/Smads信号通路活化、减轻炎症反应有关。 展开更多
关键词 放射性肺损伤 消痰通腑方 转化生长因子-Β1 Sma和Mad相关蛋白 TGF-β1/Smads通路 炎症
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矮牵牛pMADS4基因的克隆及序列分析(英文)
6
作者 郭伟 樊金会 +2 位作者 董秀春 李青 束怀瑞 《分子植物育种》 CAS CSCD 2008年第2期347-354,共8页
利用RT-PCR方法从矮牵牛(Petunia hybrida)中克隆了MADS盒基因pMADS4,进行了全序列测定。测序结果显示,所得到的基因与发表的序列同源率为100%。该基因长度为910bp,含有一个开放阅读框,编码253个氨基酸残基组成的蛋白,具有典型的植物MAD... 利用RT-PCR方法从矮牵牛(Petunia hybrida)中克隆了MADS盒基因pMADS4,进行了全序列测定。测序结果显示,所得到的基因与发表的序列同源率为100%。该基因长度为910bp,含有一个开放阅读框,编码253个氨基酸残基组成的蛋白,具有典型的植物MADS盒基因的结构,该蛋白序列与玉米(Zeamays)ZAG3、麻竹(Dendrocalamus latiflorus)DlMADS18和拟南芥(Arabidopsis thaliana)AGL6的同源性分别为64%、64%和61%,说明pMADS4是AGL6在矮牵牛中的同源基因,推测它们具有相似的功能,都促进开花并且调节花器官形成。进化树分析显示,AP1/AGL9亚家族分为SEP、AGL6和AP1三个分枝,且AGL6分枝又进一步分为三组,分别与裸子植物、单子叶植物和双子叶植物类群相对应,预测通过分离植物的AGL6同源基因可以准确的判断植物所属类群。通过蛋白预测说明pMADS4蛋白以同源或异源二聚体的形式存在,具有结合DNA的功能。 展开更多
关键词 矮牵牛(Petunia hybrida) pmads4 mads盒 AGL6同源基因
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玉米CMS-C不育系和保持系mads3基因克隆与表达分析(英文)
7
作者 王继玥 汪生庆 曹墨菊 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期675-680,共6页
MADS-box基因参与植物多种发育过程,尤其在花发育过程中发挥着重要的调控作用。该研究以玉米不育系C48-2及保持系N48-2为材料,采用RT-PCR克隆mads3基因。序列分析发现,在不育系C48-2中该基因编码区发生单碱基突变,导致其推定的蛋白质中... MADS-box基因参与植物多种发育过程,尤其在花发育过程中发挥着重要的调控作用。该研究以玉米不育系C48-2及保持系N48-2为材料,采用RT-PCR克隆mads3基因。序列分析发现,在不育系C48-2中该基因编码区发生单碱基突变,导致其推定的蛋白质中5个氨基酸序列发生改变。荧光定量PCR显示,相对于保持系,花粉母细胞时期和四分体时期mads3基因在C48-2下调表达,而单核期和双核期上调表达。这些结果为进一步了解玉米C型细胞质雄性不育的发生机制提供参考。 展开更多
关键词 玉米 花药 mads3基因 mads3
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毛白杨PtMADS1基因的反义表达 被引量：2
8
作者 刘程 苏文龙 +3 位作者 王晓霞 岳彩云 苏哲 樊金会 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期386-390,共5页
为明确毛白杨(Populus tomentosa)的MADS盒基因Pt MADS1的功能,本研究对Pt MADS1在毛白杨植株不同部位的表达进行了RT-PCR分析。本研究对毛白杨进行了Pt MADS1基因的反义转化,将35S::Pt MADS1反义转基因芽体接种于不同类型培养基上。结... 为明确毛白杨(Populus tomentosa)的MADS盒基因Pt MADS1的功能,本研究对Pt MADS1在毛白杨植株不同部位的表达进行了RT-PCR分析。本研究对毛白杨进行了Pt MADS1基因的反义转化,将35S::Pt MADS1反义转基因芽体接种于不同类型培养基上。结果表明Pt MADS1有可能参与了茎尖的形态发育,并能够影响植物营养器官的形态。因此本研究认为Pt MADS1对生长素的合成具有促进作用。 展开更多
关键词 毛白杨 PT mads1 反义表达 mads盒基因
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桃中两个MADS box基因的克隆与表达分析 被引量：12
9
作者 吴凡 徐勇 +2 位作者 常凤启 李学东 马荣才 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第9期908-918,共11页
为研究李属 (Prunussp .)果树生殖调控的相关基因 ,对国际公共数据库中的李属植物的EST(expressedse quencetags)序列进行了电子拼接 ,获得了 8个MADSbox基因的cDNA序列 ,并利用PCR技术从桃中克隆出其中的两个cDNA ,分别命名为PpMADS4和... 为研究李属 (Prunussp .)果树生殖调控的相关基因 ,对国际公共数据库中的李属植物的EST(expressedse quencetags)序列进行了电子拼接 ,获得了 8个MADSbox基因的cDNA序列 ,并利用PCR技术从桃中克隆出其中的两个cDNA ,分别命名为PpMADS4和PpMADS6 ,在GenBank中的登录号为AY70 5 972和AY70 5 973。PpMADS4基因长85 0bp ,包含一个 732bp的开放阅读框 ,编码 2 4 3个氨基酸。PpMADS6基因长 1190bp ,包含 1个 76 8bp的开放阅读框 ,编码 2 5 6个氨基酸。PpMADS4和PpMADS6在序列上分别与拟南芥中的AGAMOUS基因和矮牵牛中的PFG基因高度同源。RT PCR分析表明 ,PpMADS4基因在桃的花瓣、心皮、果实及果仁中表达 ,应属于控制花器官发育的C类MADSbox基因。PpMADS6基因在桃的叶、萼片、花瓣、心皮及果实中表达 ,应属于调控植物由营养生长向生殖生长过渡的A类MADSbox基因。 展开更多
关键词 桃 花发育 mads BOX 幼年期 成熟期
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朵丽蝶兰MADS-box基因DtpsMADS1的克隆与表达特性 被引量：11
10
作者 袁秀云 田云芳 +3 位作者 蒋素华 王默霏 马杰 崔波 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期53-61,共9页
植物MADS-box基因家族编码高度保守的转录因子,参与了包括花器官发育和开花在内的多种发育进程。为阐释兰科植物成花的分子调控机制,根据MADS-box基因保守序列设计简并引物,用RACE方法从朵丽蝶兰花葶中克隆到1个MADS-box家族基因,该基因... 植物MADS-box基因家族编码高度保守的转录因子,参与了包括花器官发育和开花在内的多种发育进程。为阐释兰科植物成花的分子调控机制,根据MADS-box基因保守序列设计简并引物,用RACE方法从朵丽蝶兰花葶中克隆到1个MADS-box家族基因,该基因cDNA全长960 bp,包含37 bp 5'UTR,一个738 bp的开放阅读框(ORF)和185 bp 3'UTR,共编码245个氨基酸。序列和系统进化树分析表明,该基因与其他植物的MADS-box基因具有很高的同源性,属于AP1/FUL-like亚家族,命名为DtpsMADS1,GeneBank登录号为JQ065097。实时荧光定量PCR检测结果显示:DtpsMADS1具有明显的组织表达特异性;在根和叶中,DtpsMADS1在花前期和花后期表达量较高;苗期和盛花期表达量较低;DtpsMADS1在花葶中的表达趋势与根和叶相似;而在花器官中,DtpsMADS1只有痕量表达。由此推断,DtpsMADS1可能参与开花进程调控,而不参与花器官的形态建成。 展开更多
关键词 mads—box基因 开花进程 RACE 系统树 朵丽蝶兰
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大花蕙兰MADS-box基因ChMADS1的克隆及表达分析 被引量：9
11
作者 陈小强 王春国 +2 位作者 李秀兰 宋文芹 陈瑞阳 《南开大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期1-7,共7页
根据MADS-box基因保守区结构,设计简并性引物,从大花蕙兰(Cymbidium hybridium)子房中分离和克隆到一个MADS-box基因全序列cDNA(ChMADS1),序列分析表明该基因长871 bp,含一个编码228个氨基酸的完整开放读码框,具有典型的植物MADS-box蛋... 根据MADS-box基因保守区结构,设计简并性引物,从大花蕙兰(Cymbidium hybridium)子房中分离和克隆到一个MADS-box基因全序列cDNA(ChMADS1),序列分析表明该基因长871 bp,含一个编码228个氨基酸的完整开放读码框,具有典型的植物MADS-box蛋白结构,由MADS盒、I、K、C区四部分组成.该基因编码的蛋白质与另两种兰花的AP3类MADS盒基因蛋白质PeAP3(89%/94%)和DcOAP3A(89%/95%)同源性较高,属于B组AP3基因家族中的paleoAP3基因.RT-PCR和反Northern杂交分析进一步证实其在子房以及花的各个器官中表达,是B组AP3基因家族中具特殊表达功能的一个新成员. 展开更多
关键词 AP3基因 mads—box基因 大花蕙兰(Cymbidium hybridium) 花发育 子房
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百合花发育相关MADS box基因的克隆 被引量：9
12
作者 张云 刘青林 +1 位作者 欧阳青 蔡文启 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期332-336,共5页
利用RT PCR的方法 ,从百合中克隆得到了 3个接近全长的花发育相关MADSbox基因片段Lf MADS1～ 3。其中LfMADS1和LfMADS3以往未见报道 ,分别与多种作物的AG、SEP同源基因具有较高的同源性 ;LfMADS2与已发表的LMADS2对应区段的氨基酸同源... 利用RT PCR的方法 ,从百合中克隆得到了 3个接近全长的花发育相关MADSbox基因片段Lf MADS1～ 3。其中LfMADS1和LfMADS3以往未见报道 ,分别与多种作物的AG、SEP同源基因具有较高的同源性 ;LfMADS2与已发表的LMADS2对应区段的氨基酸同源性高达 98 99% 。 展开更多
关键词 百合 花发育 mads BOX基因 克隆
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葡萄SVP类MADS-box基因的克隆及表达分析 被引量：17
13
作者 杨堃 张朝红 +2 位作者 李树秀 张旭彤 王跃进 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2012年第4期117-123,共7页
从无核白葡萄(Vitis vinifera cv.Thompson seedless)中克隆获得一个胚珠发育相关MADS-box基因。该基因cDNA全长1 248bp,ORF为729bp,编码一个含有243个氨基酸的蛋白。氨基酸多序列比对和系统发育分析显示,该基因属于SVP类MADS-box基因... 从无核白葡萄(Vitis vinifera cv.Thompson seedless)中克隆获得一个胚珠发育相关MADS-box基因。该基因cDNA全长1 248bp,ORF为729bp,编码一个含有243个氨基酸的蛋白。氨基酸多序列比对和系统发育分析显示,该基因属于SVP类MADS-box基因。采用半定量技术进行表达分析表明,该基因在葡萄的根、茎、叶、花蕾、盛花和胚珠中均有表达,但是有强弱差异。实时定量PCR技术分析表明在无核葡萄品种无核白胚珠发育过程中基因表达量先升后降,而在有核葡萄品种黑比诺胚珠发育过程中表达量一直呈下降趋势。 展开更多
关键词 葡萄 SVP类mads—Box基因 表达分析
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大豆MIKC型MADS-box基因家族分析 被引量：16
14
作者 胡瑞波 范成明 +2 位作者 李宏宇 林辰涛 傅永福 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第3期429-436,共8页
根据拟南芥的MIKC型MADS—box蛋白序列构建HMM（hidden markov model）模型，在大豆基因组中确定了57个MIKC型MADS-box同源基因。分子进化树分析表明，57个大豆MIKC型MADS-box基因分为14个亚类，而MIKC^＋型基因又分为两个进化支。控制... 根据拟南芥的MIKC型MADS—box蛋白序列构建HMM（hidden markov model）模型，在大豆基因组中确定了57个MIKC型MADS-box同源基因。分子进化树分析表明，57个大豆MIKC型MADS-box基因分为14个亚类，而MIKC^＋型基因又分为两个进化支。控制花形态建成的ABCDE同源异型基因（如AP1，AG，AP3和PI等）和重要的控制开花时间的基因（如SVP和SOCl）在大豆基因组中表现出多拷贝的特征。MEME和SMART分析表明，大豆和拟南芥MIKC型MADS—box基因具有保守的MADS和K-box基序，还有一些亚类具有特异的基序。MIKC型MADS—box基因结构较为保守，多数基因具有7～8个外显子。本研究得到的MIKC型MADS—box基因为下一步研究大豆花形态建成和开花时间调控的分子机制提供了重要参考依据。 展开更多
关键词 大豆 MIKC型mads—box 保守基序
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一个中国水仙MADS-box基因的克隆与分析 被引量：7
15
作者 高志民 陈段芬 +2 位作者 李雪平 蔡春菊 彭镇华 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期295-300,共6页
采用RT-PCR技术从中国水仙(Narcissus tazetta var.chinensis Roem.)幼嫩花蕾中分离到一个新的水仙花发育相关MADS-box基因,命名为NTMADS1(GenBank登录号:EF421828)。该基因长879bp,编码区共编码230个氨基酸,具有典型的植物MADS-box基... 采用RT-PCR技术从中国水仙(Narcissus tazetta var.chinensis Roem.)幼嫩花蕾中分离到一个新的水仙花发育相关MADS-box基因,命名为NTMADS1(GenBank登录号:EF421828)。该基因长879bp,编码区共编码230个氨基酸,具有典型的植物MADS-box基因结构,由MADS区、I区、K区和C末端组成。序列分析结果表明,NTMADS1编码的蛋白与其它植物的MADS-box蛋白有着较高的一致性,其中与扫状天门冬(Asparagus virgatus Baker)的AVAG1的一致性高达89%。系统进化树分析表明NTMADS1属于AG亚族。 展开更多
关键词 中国水仙 mads—box基因 克隆 系统进化树分析
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黄瓜全基因组转录因子MADS-box家族基因的序列特征分析 被引量：12
16
作者 甘德芳 丁飞 +1 位作者 庄丹 梁丹迪 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期1249-1256,共8页
MADS-box家族基因是一类编码转录因子的基因,因其在调控植物生长发育方面的重要功能而成为作物遗传育种研究的热点。采用生物信息学方法,对黄瓜全基因组MADS-box基因进行序列特征分析,包括CsMADS基因的数量、染色体定位、保守基序的分... MADS-box家族基因是一类编码转录因子的基因,因其在调控植物生长发育方面的重要功能而成为作物遗传育种研究的热点。采用生物信息学方法,对黄瓜全基因组MADS-box基因进行序列特征分析,包括CsMADS基因的数量、染色体定位、保守基序的分布及系统进化树分析。结果表明,黄瓜基因组中共有41个CsMADSs基因,除7个分布于Scaffold外,其他34个CsMADSs基因分布于黄瓜7条染色体上,但在染色体上的分布不是均匀的;41个CsMADSs都具有保守的MADS结构域,分布于9个MADS亚家族,而且大部分的CsMADSs基因属于SEP和MEF2-like分支。该研究结果不仅有助于MADS-box转录因子信号转导途径的解析,而且可为进一步研究该家族基因的功能提供信息参考。 展开更多
关键词 黄瓜 mads—box 转录因子 生物信息学
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甜樱桃MADS box基因的克隆与表达分析 被引量：5
17
作者 林苗苗 赵长竹 +3 位作者 姜建福 顾红 陈锦永 方金豹 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1462-1468,共7页
以甜樱桃'拉宾斯'(Prunus avium L.'Lapins')为试材,采用RT-PCR结合RACE技术,克隆获得1个与花发育相关的MADS box基因,命名为PaMADS3,其在GenBank中的登录号为HQ229605。PaMADS3基因全长1095bp,包含1个723bp的开放阅读... 以甜樱桃'拉宾斯'(Prunus avium L.'Lapins')为试材,采用RT-PCR结合RACE技术,克隆获得1个与花发育相关的MADS box基因,命名为PaMADS3,其在GenBank中的登录号为HQ229605。PaMADS3基因全长1095bp,包含1个723bp的开放阅读框,推断其编码240个氨基酸。序列分析表明:PaMADS3蛋白与拟南芥中的SEP蛋白高度同源。组织特异性表达显示PaMADS3基因在花瓣、雄蕊、心皮中表达。实时定量RT-PCR分析表明,花芽露绿期的离体枝条经过15和25℃处理后,其雌蕊中PaMADS3基因在25℃的表达量高于在15℃的表达量。 展开更多
关键词 甜樱桃 花发育 mads BOX 克隆 表达
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香蕉MADS-Box基因家族的生物信息学分析 被引量：10
18
作者 张远森 秦晓萌 +2 位作者 严金平 张昆林 杨恩 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1030-1040,共11页
MADS-box基因家族是具有多种生物功能的转录因子,广泛参与植物的生长发育过程以及逆境应答。为了探索MADS-box基因家族在香蕉果实发育到后熟衰老过程中的功能,本文对71个香蕉MADS-box基因家族基因结构、蛋白的基本理化性质、二级结构预... MADS-box基因家族是具有多种生物功能的转录因子,广泛参与植物的生长发育过程以及逆境应答。为了探索MADS-box基因家族在香蕉果实发育到后熟衰老过程中的功能,本文对71个香蕉MADS-box基因家族基因结构、蛋白的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、保守基序等方面进行初步生物信息学分析,结果显示:13个香蕉MADS-box基因没有内含子,5个有较长的上游序列;71个香蕉MADS-box蛋白中有52个偏碱性或者强碱性,8个显中性,11个偏酸性;除5个以无规则卷曲为主要构成元件外,香蕉MADS-box蛋白主要以α-螺旋为主要构成元件;大多数MADS-box蛋白定位于细胞核和线粒体基质,少许分布在其他细胞器;基序1(MADS domain)是该家族的保守基序;此外,进化分析发现,香蕉MADS-box基因家族基因主要是II型,I型仅有6个。另外,现有香蕉MADS-box基因家族中,只有37个可查EST序列。 展开更多
关键词 香蕉 mads—box基因家族 生物信息学
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薄壳山核桃MADS-box基因CiMADS9的克隆与功能分析 被引量：6
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作者 张计育 莫正海 +4 位作者 李永荣 王刚 宣继萍 贾晓东 郭忠仁 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1049-1056,共8页
以薄壳山核桃(Carya illinoinensis)‘马罕’雄花为材料,利用获得的MADS-box基因保守片段设计特异引物,通过RACE技术克隆MADS-box家族基因的c DNA序列,命名为Ci MADS9。该基因长为1 077 bp,开放阅读框(ORF)768 bp,编码255个氨基酸残基... 以薄壳山核桃(Carya illinoinensis)‘马罕’雄花为材料,利用获得的MADS-box基因保守片段设计特异引物,通过RACE技术克隆MADS-box家族基因的c DNA序列,命名为Ci MADS9。该基因长为1 077 bp,开放阅读框(ORF)768 bp,编码255个氨基酸残基。生物信息学分析表明该基因具有典型的MADS-box结构域和半保守的K区,是MIKC型MADS-box基因。聚类分析分析表明该基因属于AGL15亚家族。实时荧光定量PCR结果表明,Ci MADS9在生殖器官(雄花、雌花、幼果)中的表达量高于营养器官(叶、枝条)中的,并且在雄花中的表达量最大。将目的基因通过农杆菌介导法转化拟南芥,获得了转基因植株。与对照相比,转基因拟南芥中过量表达该基因使植株开花延期,基生叶增加。 展开更多
关键词 薄壳山核桃 花器官发育 CI mads9 基因表达 功能分析
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基于GA-MADS混合算法的既有铁路平面线形自动重构 被引量：9
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作者 李伟 张振亚 +4 位作者 赵璐 蒲浩 彭先宝 王杰 王建西 《铁道工程学报》 EI 北大核心 2021年第1期19-24,83,共7页
研究目的:既有铁路平面线形重构是铁路养护维修与增改建设计的重要基础,重构结果对列车运行安全、养护改建工程量将产生重要影响。既有方法通常先识别确定交点坐标,再逐交点优化半径缓长,属局部重构,难以实现全局优化;同时对约束的处理... 研究目的:既有铁路平面线形重构是铁路养护维修与增改建设计的重要基础,重构结果对列车运行安全、养护改建工程量将产生重要影响。既有方法通常先识别确定交点坐标,再逐交点优化半径缓长,属局部重构,难以实现全局优化;同时对约束的处理还不全面,重构的线形需要经过大量人工调整方可应用。对此,本文提出一种遗传算法混合网格自适应直接搜索(GA-MADS)的既有线路平面重构方法,实现线路平面整体自动优化重构。研究结论:(1)在遗传算法中融入MADS,有效克服了遗传算法在优化中随机性大、早熟收敛的缺点,实现平面线形整体重构;(2)各类约束在优化过程中被自动处理,无需人工后续调整;(3)研究成果已在各大铁路设计院6 000余公里的既有线增改建设计中成功应用,结果表明该方法可以自动产生满足工程约束的优化重构线形,大幅提高效率和质量。 展开更多
关键词 铁路 既有线 重构 优化计算 网格自适应直接搜索(mads)
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